Search is not available for this dataset
image imagewidth (px) 900 1.32k |
|---|
YAML Metadata Warning:empty or missing yaml metadata in repo card
Check out the documentation for more information.
TCGA_Brain
1. Tổng quan
[CẦN ĐIỀN THỦ CÔNG: mục đích, ngữ cảnh tạo dataset]
- Tổng số bản ghi: 1704
- Repo HuggingFace:
okbro1234/TCGA_Brain
2. Cấu trúc lưu trữ tại đích
/
(Suy tự động từ hàm HfApi trong notebook gốc; PATH_PREFIX hiện tại = ``)
3. Manifest và các cột dữ liệu
| Cột | Dtype | Số giá trị thiếu (NaN) |
|---|---|---|
| file_id | object | 0 |
| file_name | object | 0 |
| slide_id | object | 0 |
| data_format | object | 0 |
| experimental_strategy | object | 0 |
| access | object | 0 |
| file_size | int64 | 0 |
| case_id | object | 0 |
| project_id | object | 0 |
| primary_diagnosis | object | 0 |
| label_raw | object | 0 |
| label_4class | object | 91 |
| label_3class | object | 293 |
| label_lgg_gbm | object | 0 |
4. Nhãn phân loại (Labels)
Nguồn dữ liệu phát hiện được:
- TCGA-GBM
- TCGA-LGG
primary_diagnosis
| class | count | pct |
|---|---|---|
| Glioblastoma | 829 | 48.65 |
| Mixed glioma | 202 | 11.85 |
| Oligodendroglioma, NOS | 198 | 11.62 |
| Oligodendroglioma, anaplastic | 147 | 8.63 |
| Astrocytoma, anaplastic | 142 | 8.33 |
| Astrocytoma, NOS | 95 | 5.58 |
| Not Reported | 55 | 3.23 |
| Unknown | 22 | 1.29 |
| Adenocarcinoma, NOS | 8 | 0.47 |
| Basal cell carcinoma, NOS | 5 | 0.29 |
| Papillary carcinoma, NOS | 1 | 0.06 |
Breakdown theo nguồn (project_id):
| primary_diagnosis | TCGA-GBM | TCGA-LGG |
|---|---|---|
| Adenocarcinoma, NOS | 8 | 0 |
| Astrocytoma, NOS | 0 | 95 |
| Astrocytoma, anaplastic | 0 | 142 |
| Basal cell carcinoma, NOS | 0 | 5 |
| Glioblastoma | 829 | 0 |
| Mixed glioma | 0 | 202 |
| Not Reported | 1 | 54 |
| Oligodendroglioma, NOS | 0 | 198 |
| Oligodendroglioma, anaplastic | 0 | 147 |
| Papillary carcinoma, NOS | 0 | 1 |
| Unknown | 22 | 0 |
label_raw
| class | count | pct |
|---|---|---|
| Glioblastoma | 829 | 48.65 |
| Mixed glioma | 202 | 11.85 |
| Oligodendroglioma, NOS | 198 | 11.62 |
| Oligodendroglioma, anaplastic | 147 | 8.63 |
| Astrocytoma, anaplastic | 142 | 8.33 |
| Astrocytoma, NOS | 95 | 5.58 |
| Not Reported | 55 | 3.23 |
| Unknown | 22 | 1.29 |
| Adenocarcinoma, NOS | 8 | 0.47 |
| Basal cell carcinoma, NOS | 5 | 0.29 |
| Papillary carcinoma, NOS | 1 | 0.06 |
Breakdown theo nguồn (project_id):
| label_raw | TCGA-GBM | TCGA-LGG |
|---|---|---|
| Adenocarcinoma, NOS | 8 | 0 |
| Astrocytoma, NOS | 0 | 95 |
| Astrocytoma, anaplastic | 0 | 142 |
| Basal cell carcinoma, NOS | 0 | 5 |
| Glioblastoma | 829 | 0 |
| Mixed glioma | 0 | 202 |
| Not Reported | 1 | 54 |
| Oligodendroglioma, NOS | 0 | 198 |
| Oligodendroglioma, anaplastic | 0 | 147 |
| Papillary carcinoma, NOS | 0 | 1 |
| Unknown | 22 | 0 |
label_4class
| class | count | pct |
|---|---|---|
| Glioblastoma | 829 | 51.39 |
| Oligodendroglioma | 345 | 21.39 |
| Astrocytoma | 237 | 14.69 |
| Oligoastrocytoma | 202 | 12.52 |
Breakdown theo nguồn (project_id):
| label_4class | TCGA-GBM | TCGA-LGG |
|---|---|---|
| Astrocytoma | 0 | 237 |
| Glioblastoma | 829 | 0 |
| Oligoastrocytoma | 0 | 202 |
| Oligodendroglioma | 0 | 345 |
label_3class
| class | count | pct |
|---|---|---|
| Glioblastoma | 829 | 58.75 |
| Oligodendroglioma | 345 | 24.45 |
| Astrocytoma | 237 | 16.8 |
Breakdown theo nguồn (project_id):
| label_3class | TCGA-GBM | TCGA-LGG |
|---|---|---|
| Astrocytoma | 0 | 237 |
| Glioblastoma | 829 | 0 |
| Oligodendroglioma | 0 | 345 |
label_lgg_gbm
| class | count | pct |
|---|---|---|
| GBM | 860 | 50.47 |
| LGG | 844 | 49.53 |
Breakdown theo nguồn (project_id):
| label_lgg_gbm | TCGA-GBM | TCGA-LGG |
|---|---|---|
| GBM | 860 | 0 |
| LGG | 0 | 844 |
5. Cách tải và sử dụng
[CẦN ĐIỀN THỦ CÔNG: hướng dẫn tải/sử dụng dataset, ví dụ code snippet]
6. Quy trình tái tạo (Reproducibility)
[CẦN ĐIỀN THỦ CÔNG: mô tả các bước chạy lại pipeline tải + upload]
7. Giới hạn và lưu ý
- label_4class: class 'Glioblastoma' chiếm 51.39% tổng số
- label_3class: class 'Glioblastoma' chiếm 58.75% tổng số
- label_lgg_gbm: class 'GBM' chiếm 50.47% tổng số
8. Trích dẫn / Nguồn tham khảo
[CẦN ĐIỀN THỦ CÔNG: paper/license/citation liên quan]
- Downloads last month
- 51









