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train	1A1VA	1A1VA.pdb	ALA	204	A	204	true	HIS	PRO	-0.288636	-0.957439	-0.335925	0.941889	-0.862147	-0.506658	-0.821774	0.569813	0.493112	-0.869966	-0.886254	0.4632	0.500152	-0.865938	1	0	0	0	-0.919335	0.393476	1	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0.858108	0.51347	1	0	0	0	0.720675	-0.693273	1	0	0	0	0	0	0	4.58445	-0.251142	-0.023315	1	-0.167726	0	0	0	0	0	2.576097	-0.532074	-0.864105	1	-1.011473	1.942259	-0.924967	-0.676044	1	-2.356296	0	0	0	0	0	0.821583	0.821295	0.759754	-2	0	1	-1	-3	0	0	-2	8	-3	-3	-1	-2	-1	-2	-1	-2	-2	2	-3	4	-1	-2	-2	0	-1	-1	0	-2	-1	-1	-1	-1	-2	-1	1	0	-3	-2	0	-1	-2	-2	-1	-3	-1	-1	-2	-2	-3	-3	-1	-2	-4	7	-1	-1	-4	-3	-2	175.9	50.5	18.1	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	8.19	4.62	1.4	1.4	1.4	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	125	null	null	null	9	20	0.380034	8	21	9	12	0.517606	13	8	4	15	0.574669	4	15	0.532609	115.043478	1	0	0	-0.6	-0.2	-0.2	-0.1	-106.8	109.6	0.198113	23.971698	0	0	1	-0.8	-0.1	-0.7	-0.1	-149.6	145.3	0.691176	106.441176	0	0	1	0	-2	0	-0.3	-60.5	152.4	-0.001661	-0.003712	-0.001027	-0.006121	-0.052069	-0.010554	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	-0.003709	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	-0.263685	0.074816	null	-0.154698	-0.126168	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	-0.217441	null	null	null	0	0	0	0	null	null	null	null	null	0	0	0	0	0	2.577388	-0.74428	-0.557139	1	-1.42695	3.041425	-0.27328	-0.042597	1	0.349495	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	9.363529	15.513	15.803571	7.4	null	49.515	20.445	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	8.39	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	null	127.84	null	null	null

End of preview. Expand in Data Studio

UCBShift refined split

This is a ready-to-use, dataset-level export of the frozen 678/75/200 protein split. Target cleaning is already materialized: a null atom cell is excluded from training and evaluation.

split	proteins	residue rows	eligible atom targets	rows with structural features
train	678	75974	476244	75974
validation	75	8738	53098	8738
test	200	22510	125088	21531

Files

train.parquet, validation.parquet, and test.parquet: identical wide schemas.
structures.tar.gz: exact selected PDB inputs under train/validation/test directories.

Target curation

Absolute chemical-shift targets are retained independently per atom only when abs(target - RC_<atom>) <= 6.0 ppm, inclusive with a 1e-5 representation tolerance.
Missing RC_* cells are filled from the canonical SPARTA+ random-coil table and only the audited aliases ALA HB2/HB3, VAL HG12/HG13, LEU HD21/HD22, and LYS HZ2/HZ3.
Targets without a valid random-coil baseline are null. In particular, PRO:N, PRO:H, and GLY:CB are never converted to zero targets.
NE is not part of the supported 47-atom random-coil contract and is omitted.
Missing or nonphysical pH values are replaced with the baseline default, pH 5.0.
Filtering one atom never removes another atom target from the same residue.

RES_NUM is always the authoritative target residue coordinate. FEATURE_RES_NUM is the structural feature coordinate, and FEATURE_AVAILABLE states whether that target residue mapped to a feature row. Unmapped test targets are therefore not silently discarded.

The corrected test split contains exactly 125,088 eligible atom targets.

import pandas as pd

train = pd.read_parquet("train.parquet")
test = pd.read_parquet("test.parquet")

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