text stringlengths 2 13 |
|---|
AAAS |
AARS |
ABCB7 |
ABHD11 |
ACTR1B |
ACTR2 |
ACTR6 |
ACTR8 |
AIFM1 |
ALDOA |
ALG13 |
ALG2 |
ANAPC11 |
ANAPC13 |
ANKRD11 |
ANKS6 |
ARGLU1 |
ARL2 |
ARPC4 |
ASF1B |
ATP6V0D1 |
ATP6V1B2 |
ATP6V1G1 |
ATR |
BAP1 |
BCLAF1 |
BCS1L |
BET1 |
BRCA2 |
BRIP1 |
BRIX1 |
BTF3 |
BTF3L4 |
C17orf58 |
C19orf25 |
C7orf26 |
C9orf16 |
C9orf78 |
CBX1 |
CCAR1 |
CCDC115 |
CCDC59 |
CCNB1 |
CCNH |
CCP110 |
CD2BP2 |
CD3EAP |
CDC123 |
CDIPT |
CDK2 |
CEBPZ |
CENPJ |
CENPN |
CENPT |
CENPW |
CHCHD1 |
CHCHD2 |
CHCHD4 |
CHD4 |
CHMP6 |
CHMP7 |
CHORDC1 |
CHTOP |
CIAPIN1 |
CLASRP |
CMPK1 |
CMTR1 |
CNN2 |
COA5 |
COASY |
COG2 |
COG4 |
COG6 |
COPS2 |
COPS3 |
COPS8 |
COQ2 |
COQ4 |
COQ5 |
COX10 |
COX11 |
COX5A |
COX7C |
CPSF1 |
CPSF3 |
CPSF4 |
CS |
CSNK2B |
CSTF1 |
CSTF3 |
CTU2 |
CUL1 |
DAP3 |
DARS |
DBR1 |
DCAF6 |
DCTN1 |
DCTN2 |
DCTN3 |
DCTN4 |
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数据集目录
单细胞扰动与免疫治疗数据。
| 文件夹 | 内容 | 获取地址 |
|---|---|---|
| Tahoe-100M/ | 50 个细胞系的药物扰动 | Hugging Face / tahoebio |
| Parse_10M_PBMC/ | 多供体 PBMC 刺激 | Parse 官方数据页 |
| Replogle-Nadig/ | 多细胞系 CRISPRi（Arc 筛选版） | Arc 整理版 · Replogle 原始发布 · Nadig GEO |
| sci-Plex3/ | 多细胞系、多剂量药物扰动 | PerturBase · scPerturb / Zenodo |
| Jiang-Mixscale/ | 基因敲低 × 信号刺激 | 作者 Seurat 对象 / Zenodo |
| sci-Plex-GxE/ | 胶质瘤基因 × 药物扰动 | GEO / GSM7056149 |
| Orion/ | HCT116、HEK293T 全基因组 CRISPRi | Hugging Face / Xaira-Therapeutics |
| OP3/ | 多供体 PBMC 药物扰动 | GEO / GSE279945 |
| Dong/ | PBMC 单独及组合细胞因子刺激 | Dryad |
| several_datasets/ | 6 个药物与 CRISPR 扰动数据集 | scPerturb / Zenodo |
| Treatment_data/ | 肿瘤免疫治疗 | GEO · CELLxGENE |
| temp_test/ | 测试用临时数据 | 从本地数据集生成，详见目录内说明 |
上传示例
conda activate hf
hf repos create AlphaSlayer/Tahoe-100M --repo-type dataset
hf upload AlphaSlayer/Tahoe-100M . . --repo-type dataset
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