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multimolecule
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Text Generation
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Text
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parquet
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rna
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1K - 10K
Tags:
Biology
RNA
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pandas
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16S_rRNA-A.fulgidus
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16S_rRNA
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16S_rRNA
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16S_rRNA
16S_rRNA-A.fulgidus_domain3
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16S_rRNA
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16S_rRNA
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16S_rRNA
16S_rRNA-A.pyrophilus_domain3
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16S_rRNA
16S_rRNA-A.pyrophilus_domain4
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16S_rRNA
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16S_rRNA
16S_rRNA-B.subtilis
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16S_rRNA
16S_rRNA-B.subtilis_domain1
UUUAUCGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGACGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAUACAUGCAAGUCGAGCGGACAGGUGGGAGCUUGCUCCCGAUGUUAGCGGCGGACGGGUGAGUAACACGUGGGUAACCUGCCUGUAAGACUGGGAUAACUCCGGGAAACCGGGGCUAAUACCGGAUGGUUGUUUGAACCGCAUGGUUCAAACAUAAAAGGUGGCUUCGGCUACCACUUACAGAUGGACCCGCGGCGCAUUAGCUAGUUGGUGAGGUAACGGCUCACCAAGGCAACGAUGCGUAGCCGACCUGAGAGGGUGAUCGGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUAGGGAAUCUUCCGCAAUGGACGAAAGUCUGACGGAGCAACGCCGCGUGAGUGAUGAAGGUUUUCGGAUCGUAAAGCUCUGUUGUUAGGGAAGAACAAGUACCGUUCGAAUAGGGCGGUACCUUGACGGUACCUAACCAGAAAGCCACGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAGGUGGCAAGCGUUGUCCGGA
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16S_rRNA
16S_rRNA-B.subtilis_domain2
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16S_rRNA
16S_rRNA-B.subtilis_domain3
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16S_rRNA
16S_rRNA-B.subtilis_domain4
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.elegans
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.elegans_domain1
AAUAGGUUUGGUCCUAGCCUUUCUAUUAACUCUUAGUAGGAUUACACAUGCAAGCAUCCCCGCCCCAGUGAGUCACCCUCUAAAUCACCACGAUCAAAAGGAACAAGCAUCAAGUACGCAGAAAUGCAGCUCAAAACGCUUAGCCUAGCCACACCCCCACGGGAGACAGCAGU
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.elegans_domain2
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.elegans_domain3
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.elegans_domain4
ACCCUGACGAAGGCCACAAAGUAAGCACAAGUACCCACGUAAAGACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCCAUGAGGU
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.psittaci
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.psittaci_domain1
UUUUCUGAGAAUUUGAUCUUGGUUCAGAUUGAACGCUGGCGGCGUGGAUGAGGCAUGCAAGUCGAACGGAAUAAUGACUUCGGUUGUUAUUUAGUGGCGGAAGGGUUAGUAAUACAUAGAUAAUCUGUCCUCAACUUGGGAAUAACGGUUGGAAACGACCGCUAAUACCGAAUGUGGUAUGUUUAGGCAUCUAAAACAUAUUAAAGAAGGGGAUCUUCGGACCUUUCGGUUGAGGGAGAGUCUAUGGGAUAUCAGCUUGUUGGUGGGGUAAUGGCCUACCAAGGCUUUGACGUCUAGGCGGAUUGAGAGAUUGACCGCCAACACUGGGACUGAGACACUGCCCAGACUUCUACGGAAGGCUGCAGUCGAGAAUCUUUCGCAAUGGACGAAAGUCUGACGAAGCGACGCCGCGUGUGUGAUGAAGGCUCUAGGGUUGUAAAGCACUUUCGCUUGGGAAUAAGAGAGAUUGGCUAAUAUCCAAUCGAUUUGAGCGUACCAGGUAAAGAAGCACCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCUGCGGUAAUACGGAGGGUGCUAGCGUUAAUCGGA
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.psittaci_domain2
UUUAUUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGAAAGGAAAGUUAGAUGUUAAAUCUUGGGGCUCAACCCCAAGCCAGCAUCUAAUACUAUCUUUCUAGAGGGUAGAUGGAGAAAAGGGAAUUCCACGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAUAUGUGGAAGAACACCAGUGGCGAAGGCGCUUUUCUAAUUUACACCUGACGCUAAGGCGCGAAAGCAAGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCUUGCCGUAAACGAUGCAUACUUGAUGUGGAUAGUCUCAACCCUAUCCGUGUCGUAGCUAACGCGUUAAGUAUGCCGCCUGAGGAGUACACUCGCAAGGGUGAAACUCA
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.psittaci_domain3
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.psittaci_domain4
ACCGCCCGUCACAUCAUGGGAGUUGGUUUUGCCUUAAGUCGUUGACUCAACCUGCAAAGGAGAGAGGCGCCCAAGGUGAGGCUGAUGACUGGGAUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCCUACCGGAAGGUGGGGCUGGAUCACCUCCUUU
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.reinhardtii.chloro
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.reinhardtii.chloro_domain1
AUCCAUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGACGAACGCUGGCGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGAGCAAAGCAAUUUGUGUAGUGGCGAACGGGUGCGUAACGCGUAAGAACCUACCUAUCGGAGGGGGAUAACAUUGGGAAACUGUUGCUAAUACCCCAUACAGCUGAGGAGUGAAAGGUGAAAAACCGCCGAUAGAGGGGCUUGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGGGGGUAACGGCCUCCCAAGGCCACGAGCAGUAGCUGGUCUGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGAGGAAUUUUUCGCAAUGGGCGCAAGCGACGGAGCAAUGCCGCGUGCAGGAAGAAGGCCUGUGGGUCGUAAACUGCUUUUCUCAGAGAAGAAGUUCUGACGGUAUCUGAGGAAUAAGCACCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACAGAGGGUGCAAGCGUUGUCCGGA
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.reinhardtii.chloro_domain2
AUGAUUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUGGCUCGUAAAGUCUAAUGUCAAAUACCAGGGCUCAACCUUGGACCGGCAUUGGAGUACUCACGAGCUUGAGUACGGUAGGGGCAGAGGGAAUUCCAUGUGGAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUAUGGAGGAACACCAGUGGCGAAGGCGCUCUGCUGGGCCGAAACUGACACUGAGAGACGAAAGCUGGGGGAGCGAAUAGGAUUAGAUACCCUAGUAGUCCCAGCCGUAAACUAUGGAGACUAAGUGCUGCCGCAAGCAGUGCUGUAGCUAACGCGUUAAGUCUCCCGCCUGGGGAGUAUGCUCGCAAGAGUGAAACUCA
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.reinhardtii.chloro_domain3
AAGGAAUUGACGGGACCGCACAAGCGGUGGAUUAUGUGGAUUAAUUCGAUACAACGCGAAGAACCUUACCAGGGUUUGACAUGUCAAGAACCUCUCAGAAAUGGGAGGGUGCCCUAACGGACUUGAACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGCUGUGAAGUGUAUAGUUAAGUCUCAUAACGAGCGCAACCCUCGUCUUUAGUUGCCAUUUGGUUCUCUAAAGAGACUGCCAGUGUAAGCUGGAGGAAGGUGAGGAUGACGUCAAGUCAGCAUGCCCCUUACAUCCUGGGCUUCACACGUAAUACAAUGGUUGGGACAAUCAGAAGCGACUCGUGAGAGCUAGCGGCUCUGUUAAACCCAACCUCAGUUCGGAUUGUAGGCUGCAACUCGCCUACAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCCAGUCAGCUAUAUGGCGGUGAAUACGUUCCCGGGUCUUGUACAC
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.reinhardtii.chloro_domain4
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.reinhardtii.mito
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.reinhardtii.mito_domain1
AAAUUAGAGUUUGGUGCUGGCUCAGCUUUCAUGCGCCGAGCGGUGGUUUAUACAUGCGAGCUUAAAAGAUUAAGGCCACGAGUGCGUAAUACGCGAGUUUAAAUUUAUUAUACAAAAGUUGCUAGGUGACCCAAUACGGGCAUCGGGCAAAACUCGCGUAGGAUUAGCGAGCUGGGUCGCGACGCCAAUACAGCGGCCCAUGGCUUAUCCUUAGCCUGUCUUAACGGUACUAGGCCACGGUGGCACUGAAAAGGGGCCACGGUUCUUAUGAACCCAGCAGUGUUGAAUUUUGGACAAUCGCUUGAACGGCGGAUCCAGAUGCUGCUUACAAAAUUGUUUGUGAACAC
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.reinhardtii.mito_domain2
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.reinhardtii.mito_domain3
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16S_rRNA
16S_rRNA-C.reinhardtii.mito_domain4
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16S_rRNA
16S_rRNA-D.melanogaster
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16S_rRNA
16S_rRNA-D.melanogaster_domain1
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16S_rRNA
16S_rRNA-D.melanogaster_domain2
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16S_rRNA
16S_rRNA-D.melanogaster_domain3
AAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUUACCAGGUCGAACAUAAGUGUGUAAGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUCGAAUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUCGUGGAGUGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACUCAAAUAUAUUAAAUAGAUAUCUUCAGGAUUAUGGUGCUGAAGCUUAUGUAGCCUUCAUUCAUGUUGGCAGUAAAAUGCUUAUUGUGUUUGAAUGUGUUUAUGUAAGUGGAGCCGUACCUGUUGGUUUGUCCCAUUAUAAGGACACUAGCUUCUUAAAUGGACAAAUUGCGUCUAGCAAUAAUGAGAUUGAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUCCUGGGCUGCACGCGCGCUACAAUGAAAGUAUCAACGUGUAUUUCCUAGACCGAGAGGUCCGGGUAAACCGCUGAACCACUUUCAUGCUUGGGAUUGUGAACUGAAACUGUUCACGAUGAACUUGGAAUUCCCAGUAAGUGUGAGUCAUUAACUCGCAUUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACAC
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16S_rRNA
16S_rRNA-D.melanogaster_domain4
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16S_rRNA
16S_rRNA-E.coli
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16S_rRNA
16S_rRNA-E.coli_domain1
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16S_rRNA
16S_rRNA-E.coli_domain2
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16S_rRNA
16S_rRNA-E.coli_domain3
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16S_rRNA
16S_rRNA-E.coli_domain4
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16S_rRNA
16S_rRNA-F.ananassa
UACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUGUAAGUAUGAACUAAUUCAGACUGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUAGUUUGUUUGAUGGUAUCUACUACUCGGAUAACCGUAGUAAUUCUAGAGCUAAUACGUGCAACAAAUCCCGACUUCUGAGAAGGGAUGCAUUUAUUAGAUAAAAGGUCAACGCGGGCUCUGCUCGCAUUGAUGAUUCAUGAUAACUCGACGGAUCGCACAGCCUUUGUGCUGGCGACGCAUCAUUCAAAUAUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUAGGAUAGUGGCCUACCAUGGUGGUGACGGGUGACGGAGAAUUAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCUGACACGGGGAGGUAGUGACAAUAAAUAACAAUACCGGGCUCUUUGAGUCUGGUAAUUGGAAUGAGUACAAUCUAAAUCCCUUAACGAGGAUCCAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUUAAGUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGACCUUGGGUUGGGUCGACCGGUCCGCCUUAUGGUGUGCACCGGUCGGCUCGUCCCUUCUACCGGCGAUACGCUCCUGGCCUUAACUGGCCGGGUCGUGCCUCCGGUGCUGUUACUUUGAAGAAAUUAGAGUGCUCAAAGCAAGCCUACGCUCUGGAUACAUUAGCAUGGGAUAACAUCAUAGGAUUUCGGUCCUAUUCUGUUGGCCUUCGGGAUCGGAGUAAUGAUUAACAGGGACAGUCGGGGGCAUUCGUAUUUCAUAGUCAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUUAUGAAAGACGAACAACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUGGGGGCUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCCUAGUCUCAACCAUAAACGAUGCCGACCAGGGAUCGGCGGAUGUUACUUUUAGGACUCCGCCGGCACCUUAUGAGAAAUCAAAGUUUUUGGGUUCCGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUUACCAGGUCCAGACAUAGUAAGGAUUGACAGACUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAACGAGACCUCAGCCUGCUAACUAGCUAUCGGGAGGUCUCCUCGGGCCAGCUUCUUAGAGGGACUAUGGCCGCUUAGCGAACCAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUCAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGAUGUAUUCAACGAGUCUAUAGCCUUGGCCGACCACGGGGUAAUCUUUGAAAUUUCAUCGUGAUGGGGAUAGAUCAUUGCAAUUGUUGGUCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGCGAGUCAUCAGCUCGCGUUGACUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAAUGGUCCGGUGAAGUUGUUCGGAUCGCGGCGACGGGGGGCCGGUUCGCUGCCCGCGACGUCGCGAGAAGUUCCACUGAACCUUAUCAUUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUG
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16S_rRNA
16S_rRNA-F.ananassa_domain1
UACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUGUAAGUAUGAACUAAUUCAGACUGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUAGUUUGUUUGAUGGUAUCUACUACUCGGAUAACCGUAGUAAUUCUAGAGCUAAUACGUGCAACAAAUCCCGACUUCUGAGAAGGGAUGCAUUUAUUAGAUAAAAGGUCAACGCGGGCUCUGCUCGCAUUGAUGAUUCAUGAUAACUCGACGGAUCGCACAGCCUUUGUGCUGGCGACGCAUCAUUCAAAUAUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUAGGAUAGUGGCCUACCAUGGUGGUGACGGGUGACGGAGAAUUAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCUGACACGGGGAGGUAGUGACAAUAAAUAACAAUACCGGGCUCUUUGAGUCUGGUAAUUGGAAUGAGUACAAUCUAAAUCCCUUAACGAGGAUCCAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUUAA
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16S_rRNA
16S_rRNA-F.ananassa_domain2
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16S_rRNA
16S_rRNA-F.ananassa_domain3
AAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUUACCAGGUCCAGACAUAGUAAGGAUUGACAGACUGAGAGCUCUUUCUUGAUUCUAUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGUUAACGAACGAGACCUCAGCCUGCUAACUAGCUAUCGGGAGGUCUCCUCGGGCCAGCUUCUUAGAGGGACUAUGGCCGCUUAGCGAACCAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUCAUGCCCUUAGAUGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGAUGUAUUCAACGAGUCUAUAGCCUUGGCCGACCACGGGGUAAUCUUUGAAAUUUCAUCGUGAUGGGGAUAGAUCAUUGCAAUUGUUGGUCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGCGAGUCAUCAGCUCGCGUUGACUACGUCCCUGCCCUUUGUACAC
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16S_rRNA
16S_rRNA-F.ananassa_domain4
ACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAAUGGUCCGGUGAAGUUGUUCGGAUCGCGGCGACGGGGGGCCGGUUCGCUGCCCGCGACGUCGCGAGAAGUUCCACUGAACCUUAUCAUUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUG
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16S_rRNA
16S_rRNA-G.intestinalis
CAUCCGGUCGAUCCUGCCGGAGCGCGACGCUCUCCCCAAGGACGAAGCCAUGCAUGCCCGCUCACCCGGGACGCGGCGGACGGCUCAGGACAACGGUUGCACCCCCCGCGGCGGUCCCUGCUAGCCGGACACCGCUGGCAACCCGGCGCCAAGACGUGCGCGCAAGGGCGGGCGCCCGCGGGCGAGCAGCGUGACGCAGCGACGGCCCGCCCGGGCUUCCGGGGCAUCACCCGGUCGGCGCGGUCGCGGCGCGCCGAGGGCCCGACGCCUGGCGGAGAAUCAGGGUUCGACUCCGGAGAGCGGGCCUGCGAGACGGCCCGCACAUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGGAACUUGCCCAAUGCGCGGCGCGCGAGGCAGCGACGGGGAGCGCGCGAGCGAGGCGGGCCCACAGCCCCCGCCGCGGAGCCGAGGGCAAGGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCGGCGAGCGUCGCGCGGCGCUGCUGCAGUUGAAACGCCCGUAGUUGGCCCCCCGCCGCCACGAGGAAACGGGAGCGCUCCAGGCAGGCCCGUUGGACCCGCCGCGUGGGACCGCGCAGCGGGCCGGCGCGCCGCGGCAGCCCCGAGGAGAGCGGGCGGGGGCACCGGUACCGGCCGGGGACGGGUGAAACAGGAUGAUCCCGCCGAGACCGCCGGCCGCGCAGGCGCCUGCCAAGACCGCCUCUGUCAAUCAAGGGCGAAGGCCGGGGGCUAGAAGGCGAUCAGACACCACCGUAUUCCCGGCCGUAAACGGUGCCGCCCCGCGGCCGGCGCGCGCGUCCCGCCGGCCGCCCAGGGAAACCGGGAGGCUCCGGGCUCUGGGGGGAGUAUGGCCGCAAGGCUGAAACUUGAAGGCAUUGACGGAGGGGUACCACCAGACGUGGAGUCUGCGGCUCAAUCUGACUCAACGCGCGCACCUCACCAGGCCCGGACGCGCGGAGGACCGACAGCCGGGCGCGCUUUCGCGAUCGCGCGGGCGGUGGUGCAUGGCCGCUCCCAGCCCGUGGCGCGAGCCGUCUGCUCCAUUGCGACAACGAGCGAGACCCCGGCCGCGGGCGCCGCGGGACGGCCCGCGCGAGCGGGAGGACGGCGGGGCGAUAGCAGGUCUGUGAUGCCCUCAGACGCCCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGGCGGGGCCAGCCGGCGCGCGCGAGGACGCGCGGAGCCCCCGCCGUGGCCGGGACCGCGGGCUGGAACGCCCCCGCGCACCAGGAAUGUCUUGUAGGCGCCCGCCCCCACCGCGCGCCGGACGCGUCCCUGCCCCUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGACUGGGCGCGGCGGCGAGCGCCCCGGACGCGCGAAGGGCCGCGAGCCCCCGCGCCUGGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUAUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAUGGAUCCCUC
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16S_rRNA
16S_rRNA-G.intestinalis_domain1
CAUCCGGUCGAUCCUGCCGGAGCGCGACGCUCUCCCCAAGGACGAAGCCAUGCAUGCCCGCUCACCCGGGACGCGGCGGACGGCUCAGGACAACGGUUGCACCCCCCGCGGCGGUCCCUGCUAGCCGGACACCGCUGGCAACCCGGCGCCAAGACGUGCGCGCAAGGGCGGGCGCCCGCGGGCGAGCAGCGUGACGCAGCGACGGCCCGCCCGGGCUUCCGGGGCAUCACCCGGUCGGCGCGGUCGCGGCGCGCCGAGGGCCCGACGCCUGGCGGAGAAUCAGGGUUCGACUCCGGAGAGCGGGCCUGCGAGACGGCCCGCACAUCCAAGGACGGCAGCAGGCGCGGAACUUGCCCAAUGCGCGGCGCGCGAGGCAGCGACGGGGAGCGCGCGAGCGAGGCGGGCCCACAGCCCCCGCCGCGGAGCCGAGGGCAAGGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCGGCGAGCGUCGCGCGG
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16S_rRNA
16S_rRNA-G.intestinalis_domain2
CGCUGCUGCAGUUGAAACGCCCGUAGUUGGCCCCCCGCCGCCACGAGGAAACGGGAGCGCUCCAGGCAGGCCCGUUGGACCCGCCGCGUGGGACCGCGCAGCGGGCCGGCGCGCCGCGGCAGCCCCGAGGAGAGCGGGCGGGGGCACCGGUACCGGCCGGGGACGGGUGAAACAGGAUGAUCCCGCCGAGACCGCCGGCCGCGCAGGCGCCUGCCAAGACCGCCUCUGUCAAUCAAGGGCGAAGGCCGGGGGCUAGAAGGCGAUCAGACACCACCGUAUUCCCGGCCGUAAACGGUGCCGCCCCGCGGCCGGCGCGCGCGUCCCGCCGGCCGCCCAGGGAAACCGGGAGGCUCCGGGCUCUGGGGGGAGUAUGGCCGCAAGGCUGAAACUUG
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16S_rRNA
16S_rRNA-G.intestinalis_domain3
AAGGCAUUGACGGAGGGGUACCACCAGACGUGGAGUCUGCGGCUCAAUCUGACUCAACGCGCGCACCUCACCAGGCCCGGACGCGCGGAGGACCGACAGCCGGGCGCGCUUUCGCGAUCGCGCGGGCGGUGGUGCAUGGCCGCUCCCAGCCCGUGGCGCGAGCCGUCUGCUCCAUUGCGACAACGAGCGAGACCCCGGCCGCGGGCGCCGCGGGACGGCCCGCGCGAGCGGGAGGACGGCGGGGCGAUAGCAGGUCUGUGAUGCCCUCAGACGCCCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGGCGGGGCCAGCCGGCGCGCGCGAGGACGCGCGGAGCCCCCGCCGUGGCCGGGACCGCGGGCUGGAACGCCCCCGCGCACCAGGAAUGUCUUGUAGGCGCCCGCCCCCACCGCGCGCCGGACGCGUCCCUGCCCCUUGUACAC
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16S_rRNA
16S_rRNA-G.intestinalis_domain4
ACCGCCCGUCGCUCCUACCGACUGGGCGCGGCGGCGAGCGCCCCGGACGCGCGAAGGGCCGCGAGCCCCCGCGCCUGGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUAUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAUGGAUCCCUC
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16S_rRNA
16S_rRNA-H.sapiens
UACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUACGCACGGCCGGUACAGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUGGUUCCUUUGGUCGCUCGCUCCUCUCCUACUUGGAUAACUGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCCGACGGGCGCUGACCCCCUUCGCGGGGGGGAUGCGUGCAUUUAUCAGAUCAAAACCAACCCGGUCAGCCCCUCUCCGGCCCCGGCCGGGGGGCGGGCGCCGGCGGCUUUGGUGACUCUAGAUAACCUCGGGCCGAUCGCACGCCCCCCGUGGCGGCGACGACCCAUUCGAACGUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUAGUCGCCGUGCCUACCAUGGUGACCACGGGUGACGGGGAAUCAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCACUCCCGACCCGGGGAGGUAGUGACGAAAAAUAACAAUACAGGACUCUUUCGAGGCCCUGUAAUUGGAAUGAGUCCACUUUAAAUCCUUUAACGAGGAUCCAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGCUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGAUCUUGGGAGCGGGCGGGCGGUCCGCCGCGAGGCGAGCCACCGCCCGUCCCCGCCCCUUGCCUCUCGGCGCCCCCUCGAUGCUCUUAGCUGAGUGUCCCGCGGGGCCCGAAGCGUUUACUUUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCCCGAGCCGCCUGGAUACCGCAGCUAGGAAUAAUGGAAUAGGACCGCGGUUCUAUUUUGUUGGUUUUCGGAACUGAGGCCAUGAUUAAGAGGGACGGCCGGGGGCAUUCGUAUUGCGCCGCUAGAGGUGAAAUUCCUUGGACCGGCGCAAGACGGACCAGAGCGAAAGCAUUUGCCAAGAAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUCGGAGGUUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUUCCGACCAUAAACGAUGCCGACCGGCGAUGCGGCGGCGUUAUUCCCAUGACCCGCCGGGCAGCUUCCGGGAAACCAAAGUCUUUGGGUUCCGGGGGGAGUAUGGUUGCAAAGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAACCUCACCCGGCCCGGACACGGACAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUCGAUUCCGUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACUCUGGCAUGCUAACUAGUUACGCGACCCCCGAGCGGUCGGCGUCCCCCAACUUCUUAGAGGGACAAGUGGCGUUCAGCCACCCGAGAUUGAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUCCGGGGCUGCACGCGCGCUACACUGACUGGCUCAGCGUGUGCCUACCCUACGCCGGCAGGCGCGGGUAACCCGUUGAACCCCAUUCGUGAUGGGGAUCGGGGAUUGCAAUUAUUCCCCAUGAACGAGGAAUUCCCAGUAAGUGCGGGUCAUAAGCUUGCGUUGAUUAAGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGGAUGGUUUAGUGAGGCCCUCGGAUCGGCCCCGCCGGGGUCGGCCCACGGCCCUGGCGGAGCGCUGAGAAGACGGUCGAACUUGACUAUCUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA
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16S_rRNA
16S_rRNA-H.sapiens.mito
AAUAGGUUUGGUCCUAGCCUUUCUAUUAGCUCUUAGUAAGAUUACACAUGCAAGCAUCCCCGUUCCAGUGAGUUCACCCUCUAAAUCACCACGAUCAAAAGGAACAAGCAUCAAGCACGCAGCAAUGCAGCUCAAAACGCUUAGCCUAGCCACACCCCCACGGGAAACAGCAGUGAUUAACCUUUAGCAAUAAACGAAAGUUUAACUAAGCUAUACUAACCCCAGGGUUGGUCAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCACACGAUUAACCCAAGUCAAUAGAACCCGGCGUAAAGAGUGUUUUAGAUCACCCCCUCCCCAAUAAAGCUAAAACUCACCUGAGUUGUAAAAAACUCCAGUUGACACAAAAUAGACUACGAAAGUGGCUUUAACAUAUCUGAACACAGAAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACCUCAACAGUUAAAUCAACAAAACUGCUCGCCAGAACACUACGAGCCACAGCUUAAAACUCAAAGGACCUGGCGGUGCUUCAUAUCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUGUAAUCGAUAAACCCCGAUCAACCUCACCACCUCUUGCUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUGAUGAAGGCUACAAAGUAAGCGCAAGUACCCACGUAAAGACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCCAUGAGGUGGCAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUACCCCAGAAAACUACGAUAGCCCUUAUGAAACUUAAGGGUCGAAGGUGGAUUUAGCAGUAAACUAAGAGUAGAGUGCUUAGUUGAACAGGGCCCUGAAGCGCGUACACACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUAUACUUCAAAGGACAUUUAACUAAAACCCCUACGCAUUUAUAUAGAGGAGACAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACUGGAAAGUGCACUUGGACGAAC
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16S_rRNA
16S_rRNA-H.sapiens.mito_domain1
AAUAGGUUUGGUCCUAGCCUUUCUAUUAGCUCUUAGUAAGAUUACACAUGCAAGCAUCCCCGUUCCAGUGAGUUCACCCUCUAAAUCACCACGAUCAAAAGGAACAAGCAUCAAGCACGCAGCAAUGCAGCUCAAAACGCUUAGCCUAGCCACACCCCCACGGGAAACAGCAGUGAUUAACCUUUAGCAAUAAACGAAAGUUUAACUAAGCUAUACUAACCCCAGGGUUGGUCAAUUUCGUGCCAGCCACCGCGGUCACACGAUUAACCCAAGUCAAUAGAA
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16S_rRNA
16S_rRNA-H.sapiens.mito_domain2
CCCGGCGUAAAGAGUGUUUUAGAUCACCCCCUCCCCAAUAAAGCUAAAACUCACCUGAGUUGUAAAAAACUCCAGUUGACACAAAAUAGACUACGAAAGUGGCUUUAACAUAUCUGAACACAGAAUAGCUAAGACCCAAACUGGGAUUAGAUACCCCACUAUGCUUAGCCCUAAACCUCAACAGUUAAAUCAACAAAACUGCUCGCCAGAACACUACGAGCCACAGCUUAAAACUCA
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16S_rRNA
16S_rRNA-H.sapiens.mito_domain3
AAGGACCUGGCGGUGCUUCAUAUCCCUCUAGAGGAGCCUGUUCUGUAAUCGAUAAACCCCGAUCAACCUCACCACCUCUUGCUCAGCCUAUAUACCGCCAUCUUCAGCAAACCCUGAUGAAGGCUACAAAGUAAGCGCAAGUACCCACGUAAAGACGUUAGGUCAAGGUGUAGCCCAUGAGGUGGCAAGAAAUGGGCUACAUUUUCUACCCCAGAAAACUACGAUAGCCCUUAUGAAACUUAAGGGUCGAAGGUGGAUUUAGCAGUAAACUAAGAGUAGAGUGCUUAGUUGAACAGGGCCCUGAAGCGCGUACAC
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16S_rRNA
16S_rRNA-H.sapiens.mito_domain4
ACCGCCCGUCACCCUCCUCAAGUAUACUUCAAAGGACAUUUAACUAAAACCCCUACGCAUUUAUAUAGAGGAGACAAGUCGUAACAUGGUAAGUGUACUGGAAAGUGCACUUGGACGAAC
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16S_rRNA
16S_rRNA-H.sapiens_domain1
UACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUACGCACGGCCGGUACAGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUGGUUCCUUUGGUCGCUCGCUCCUCUCCUACUUGGAUAACUGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCCGACGGGCGCUGACCCCCUUCGCGGGGGGGAUGCGUGCAUUUAUCAGAUCAAAACCAACCCGGUCAGCCCCUCUCCGGCCCCGGCCGGGGGGCGGGCGCCGGCGGCUUUGGUGACUCUAGAUAACCUCGGGCCGAUCGCACGCCCCCCGUGGCGGCGACGACCCAUUCGAACGUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUAGUCGCCGUGCCUACCAUGGUGACCACGGGUGACGGGGAAUCAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCACUCCCGACCCGGGGAGGUAGUGACGAAAAAUAACAAUACAGGACUCUUUCGAGGCCCUGUAAUUGGAAUGAGUCCACUUUAAAUCCUUUAACGAGGAUCCAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAA
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16S_rRNA
16S_rRNA-H.sapiens_domain2
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16S_rRNA
16S_rRNA-H.sapiens_domain3
AAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAACCUCACCCGGCCCGGACACGGACAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUCGAUUCCGUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUUGUCUGGUUAAUUCCGAUAACGAACGAGACUCUGGCAUGCUAACUAGUUACGCGACCCCCGAGCGGUCGGCGUCCCCCAACUUCUUAGAGGGACAAGUGGCGUUCAGCCACCCGAGAUUGAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGAUGUCCGGGGCUGCACGCGCGCUACACUGACUGGCUCAGCGUGUGCCUACCCUACGCCGGCAGGCGCGGGUAACCCGUUGAACCCCAUUCGUGAUGGGGAUCGGGGAUUGCAAUUAUUCCCCAUGAACGAGGAAUUCCCAGUAAGUGCGGGUCAUAAGCUUGCGUUGAUUAAGUCCCUGCCCUUUGUACAC
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16S_rRNA
16S_rRNA-H.sapiens_domain4
ACCGCCCGUCGCUACUACCGAUUGGAUGGUUUAGUGAGGCCCUCGGAUCGGCCCCGCCGGGGUCGGCCCACGGCCCUGGCGGAGCGCUGAGAAGACGGUCGAACUUGACUAUCUAGAGGAAGUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA
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16S_rRNA
16S_rRNA-H.volcanii
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16S_rRNA
16S_rRNA-H.volcanii_domain1
AUUCCGGUUGAUCCUGCCGGAGGUCAUUGCUAUUGGGGUCCGAUUUAGCCAUGCUAGUUGCACGAGUUCAUACUCGUGGCGAAAAGCUCAGUAACACGUGGCCAAACUACCCUACAGAGAACGAUAACCUCGGGAAACUGAGGCUAAUAGUUCAUACGGGAGUCAUGCUGGAAUGCCGACUCCCCGAAACGCUCAGGCGCUGUAGGAUGUGGCUGCGGCCGAUUAGGUAGACGGUGGGGUAACGGCCCACCGUGCCGAUAAUCGGUACGGGUUGUGAGAGCAAGAGCCCGGAGACGGAAUCUGAGACAAGAUUCCGGGCCCUACGGGGCGCAGCAGGCGCGAAACCUUUACACUGCACGCAAGUGCGAUAAGGGGACCCCAAGUGCGAGGGCAUAUAGUCCUCGCUUUUCUCGACCGUAAGGCGGUCGAGGAAUAAGAGCUGGGCAAGACCGGUGCCAGCCGCCGCGGUAAUACCGGCAGCUCAAGUGAUGACCGAU
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16S_rRNA
16S_rRNA-H.volcanii_domain2
AUUAUUGGGCCUAAAGCGUCCGUAGCCGGCCACGAAGGUUCAUCGGGAAAUCCGCCAGCUCAACUGGCGGGCGUCCGGUGAAAACCACGUGGCUUGGGACCGGAAGGCUCGAGGGGUACGUCCGGGGUAGGAGUGAAAUCCCGUAAUCCUGGACGGACCACCGAUGGCGAAAGCACCUCGAGAAGACGGAUCCGACGGUGAGGGACGAAAGCUAGGGUCUCGAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUAGCUGUAAACGAUGCUCGCUAGGUGUGACACAGGCUACGAGCCUGUGUUGUGCCGUAGGGAAGCCGAGAAGCGAGCCGCCUGGGAAGUACGUCCGCAAGGAUGAAACUUA
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16S_rRNA
16S_rRNA-H.volcanii_domain3
AAGGAAUUGGCGGGGGAGCACUACAACCGGAGGAGCCUGCGGUUUAAUUGGACUCAACGCCGGACAUCUCACCAGCUCCGACUACAGUGAUGACGAUCAGGUUGAUGACCUUAUCACGACGCUGUAGAGAGGAGGUGCAUGGCCGCCGUCAGCUCGUACCGUGAGGCGUCCUGUUAAGUCAGGCAACGAGCGAGACCCGCACUUCUAAUUGCCAGCAGCAGUUUCGACUGGCUGGGUACAUUAGAAGGACUGCCGCUGCUAAAGCGGAGGAAGGAACGGGCAACGGUAGGUCAGUAUGCCCCGAAUGAGCUGGGCUACACGCGGGCUACAAUGGUCGAGACAAUGGGUUGCUAUCUCGAAAGAGAACGCUAAUCUCCUAAACUCGAUCGUAGUUCGGAUUGAGGGCUGAAACUCGCCCUCAUGAAGCUGGAUUCGGUAGUAAUCGCAUUUCAAUAGAGUGCGGUGAAUACGUCCCUGCUCCUUGCACACA
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16S_rRNA
16S_rRNA-H.volcanii_domain4
CCGCCCGUCAAAGCACCCGAGUGAGGUCCGGAUGAGGCCACCACACGGUGGUCGAAUCUGGGCUUCGCAAGGGGGCUUAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAAUCUGCGGCUGGAUCACCUCCUG
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16S_rRNA
16S_rRNA-M.polymorpha
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16S_rRNA
16S_rRNA-M.polymorpha_domain1
AUCAUACUCAAAAAAAAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGAAUGAACGCUAGCGAUAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGUUGUUUUCGUCCUUACGUGUUGAAGGUUGCAUUCGGAGAAGAAAACCUUUUUUCUUCUCUGAGCUGCUCAACUUUUAAUCAGUUGAGCCUGCGGCCUCCAAUCAACCGUGAGAAUCGUUGAAAACAAAGUGGCGAACGGGCGAGUAAUAUGUGGGAAUCUGCCAAACAGUUUGGGACAAAUCCCGAAUAAACGAAAGCUAAAAGGCGCUGUUUGAUGAGCCUACAAAGCAUCAGGUAGUUGGUUAGGUAAAGGCUGACCAAGCCAACGACGCUUAGCGGGUCUGUUAGGACGAUCCGCCGCACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCCACGGGAGGCUGCAGUGGGGAAUCUUGGACAAUGGGCGAAAGCCUGAUCCAGCAAUAUGGCGUGAGUGAAGAAGGGCAAUGCAGCUUGUAAAGCUCUUUCGUCGAGUA
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16S_rRNA
16S_rRNA-M.polymorpha_domain2
UGCGAUUAUGACAAGACUCGAAGAAGAAGCCCCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACGGGGGGGGCAAGUGUUAUUCGGAAUGACUAGGCGUAAAGGGCACGUAGGCGGUGAAUCCAGUUGAAAGUGAAAGUCGCCAGCUCAACUGGCGGAAUGCUUUCAAAACCAAUUUACUAGAGUAAGGCAUAGAGGAAAGCGGAAUUUCGUGUGUAGCGAUAAAAUGCAAAAAUAUACGAAGGAACGCCAAAAGCGAAGGCAGCUUUCUGGUUCUUUAACUGACGCUAAAGUGCGAAAGCAUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCAUGCUGUAAACGAUGA
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16S_rRNA
16S_rRNA-M.polymorpha_domain3
GUGUUCGUUCUUGGUCUACUGAUAUCGCACUCUUUUGGGCUGACUUAAGCUCGGCUUAAUGCUUAAAUUACUGCAAAGGUAGUGUGACUCGAUUGUUUUCUUCAAGUUCCAACAAUCGUGAAAAAUAUGUGAUGAUCAGGGGCUGAGCUAACGCGUUAAACACUCCGCCUGGGGAGUACGGUCGCAAGGCUGAAACUCAAAGAAUUGACGGGGGCCUGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUUCAACGCGCAAAACCUUACCAGCCCUUGACAUAUGAAUAAGUGUGCUUGUCCUUAACGGGAUGGUACGAAAAUUCAUACAGGUGUUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUCUUGAGACGUUGGGUUAAGUCCUAUAACGAGCGCAACCCUUGUUUUGUGUUGCUAAGACAUGCUUUGGUUCAAUCCUUGACCACUGGAGACUGACGAAGACUACGCCGUGAAAAUGGAGGAUACCGA
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16S_rRNA
16S_rRNA-M.polymorpha_domain4
CGAGCUAAGUUUUUGCAAACGCCGUGUGGCUCAUUCUGAAAAGAAUAUGACCAUACAAAGUUUUCAUACGGUAUUCUCCGACGAACGAAGCUCUCAGAGCAUUGUACACUUCACACUGAGGAACUCGAUCUUAGUCAAAAUGA
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16S_rRNA
16S_rRNA-P.occultum
ACUCCGGUUGAUCCUGCCGGGCCCGACCGCUAUCGGGGUGGGACUAAGCCAUGGGAGUCGUGCGCCCCCGGACGCGGGGGCGCGGCGGACGGCUGAGUAACACGUGGCCAACCUACCCUCGGGACGGGGAUAACCCCGGGAAACUGGGGCUAAUCCCCGAUAGGCGAGGGGGCCUGGAACGGGUCCCUCGCCGAAAGGGCGCGCGGAGCCUCCCCGCGCGCCGCCCGAGGAUGGGGCUGCGGCCCAUCAGGUAGUUGGCGGGGUAACGGCCCGCCAAGCCGAUAACGGGUAGGGGCCGUGAGAGCGGGAGCCCCCAGAUGGGCACUGAGACAAGGGCCCAGGCCCUACGGGGCGCACCAGGCGCGAAACCUCCGCAAUGCGGGCAACCGUGACGGGGUCACCCCGAGUGCCGCCGAUAAGGCGGCUGUUCCCCGCUGUAGGAAGGCGGGGGAGUAAGCGGGGGGCAAGUCUGGUGUCAGCCGCCGCGGUAAUACCAGCCCCGCGAGCGGUCGGGAUGAUUACUGGGCCUAAAGCGCCCGUAGCCGGCCCGGUAAGUCCCCCCCUAAAGCCCCGGGCUCAACCCGGGGAGUGGGGGGGAUACUGCCGGGCUAGGGGGCGGGAGAGGCCGAGGGUACUCCCGGGGUAGGGGCGAAAUCCGAUAAUCCCGGGAGGACCACCAGUGGCGAAGGCGCUCGGCUGGAACGCGCCCGACGGUGAGGGGCGAAAGCCGGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCCGGCUGUAAACGAUGCGGGCUAGGUGUUGGGCGGGCUUGGAGCCCGCCCAGUGCCGCAGGGAAGCCGUUAAGCCCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGGCGGGGGAGCACCACAAGGGGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUGGAGUCAACGCCGGGAAUCUUACCGGGGGCGACAGCAGGAUGACGGCCAGGCUGACGACCUUGCCCGACACGCUGAGAGGAGGUGCAUGGCCGUCGCCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUCCGGUUAAGUCCGGCAACGAGCGAGACCCCCACCCCUAGUUGCUACCCCGGGGCCACCCCGGGGGCACACUAGGGGGACUGCCGCCGUCCAAGGCGGAGGAAGGAGGGGGCCACGGCAGGUCAGCAUGCCCCGAAUCCCCCGGGCUGCACGCGGGCUACAAUGGCGGGGACAGCGGGAUCCGACCCCGAAAGGGGGAGGCAAUCCCUUAAACCCCGCCGCAGUUGGGAUCGAGGGCUGCAACUCGCCCUCGUGAACGCGGAAUCCCUAGUAACCGCGCGUUAGCAUCGCGCGGUGAAUACGUCCCUGCUCCUUGCACACACCGCCCGUCGCUCCACCCGAGCGGGGGAGGGGUGAGGCCCCGUCCCUCGCCAGGGCGGGGUCGAACCUCUCCCCCGCGAGGGGGGAGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAGGGGAACCUGCGGCUGGAUCACCUCCU
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16S_rRNA
16S_rRNA-P.occultum_domain1
ACUCCGGUUGAUCCUGCCGGGCCCGACCGCUAUCGGGGUGGGACUAAGCCAUGGGAGUCGUGCGCCCCCGGACGCGGGGGCGCGGCGGACGGCUGAGUAACACGUGGCCAACCUACCCUCGGGACGGGGAUAACCCCGGGAAACUGGGGCUAAUCCCCGAUAGGCGAGGGGGCCUGGAACGGGUCCCUCGCCGAAAGGGCGCGCGGAGCCUCCCCGCGCGCCGCCCGAGGAUGGGGCUGCGGCCCAUCAGGUAGUUGGCGGGGUAACGGCCCGCCAAGCCGAUAACGGGUAGGGGCCGUGAGAGCGGGAGCCCCCAGAUGGGCACUGAGACAAGGGCCCAGGCCCUACGGGGCGCACCAGGCGCGAAACCUCCGCAAUGCGGGCAACCGUGACGGGGUCACCCCGAGUGCCGCCGAUAAGGCGGCUGUUCCCCGCUGUAGGAAGGCGGGGGAGUAAGCGGGGGGCAAGUCUGGUGUCAGCCGCCGCGGUAAUACCAGCCCCGCGAGCGGUCGGGAUG
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16S_rRNA
16S_rRNA-P.occultum_domain2
AUUACUGGGCCUAAAGCGCCCGUAGCCGGCCCGGUAAGUCCCCCCCUAAAGCCCCGGGCUCAACCCGGGGAGUGGGGGGGAUACUGCCGGGCUAGGGGGCGGGAGAGGCCGAGGGUACUCCCGGGGUAGGGGCGAAAUCCGAUAAUCCCGGGAGGACCACCAGUGGCGAAGGCGCUCGGCUGGAACGCGCCCGACGGUGAGGGGCGAAAGCCGGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCCGGCUGUAAACGAUGCGGGCUAGGUGUUGGGCGGGCUUGGAGCCCGCCCAGUGCCGCAGGGAAGCCGUUAAGCCCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUUA
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16S_rRNA
16S_rRNA-P.occultum_domain3
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16S_rRNA
16S_rRNA-P.occultum_domain4
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16S_rRNA
16S_rRNA-P.staleyi
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16S_rRNA
16S_rRNA-P.staleyi_domain1
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16S_rRNA
16S_rRNA-P.staleyi_domain2
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16S_rRNA
16S_rRNA-P.staleyi_domain3
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16S_rRNA
16S_rRNA-P.staleyi_domain4
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16S_rRNA
16S_rRNA-S.cerevisiae
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16S_rRNA
16S_rRNA-S.cerevisiae_domain1
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16S_rRNA
16S_rRNA-S.cerevisiae_domain2
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16S_rRNA
16S_rRNA-S.cerevisiae_domain3
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16S_rRNA
16S_rRNA-S.cerevisiae_domain4
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16S_rRNA
16S_rRNA-T.gondii
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16S_rRNA
16S_rRNA-T.gondii_domain1
AACCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUUAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAGCUUUUAUACGGCUAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAACAGUUAUAGUUUAUUUGAUGGUCUUUACUACAUGGAUAACCGUGGUAAUUCUAUGGCUAAUACAUGCGCACAUGCCUCUUCCCCUGGAAGGCAGUGUUUAUUAGAUACAGAACCAACCCACCUUCCGGUGGUCCUCAGGUGAUUCAUAGUAACCGAACGGAUCGCGUUGACUUCGGUCUGCGACGGAUCAUUCAAGUUUCUGACCUAUCAGCUUUCGACGGUACUGUAUUGGACUACCGUGGCAGUGACGGGUAACGGGGAAUUAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCUAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCUGAUUCAGGGAGGUAGUGACAAGAAAUAACAACACUGGAAAUUUCAUUUCUAGUGAUUGGAAUGAUAGGAAUCCAAACCCCUUUCAGAGUAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAA
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16S_rRNA
16S_rRNA-T.gondii_domain2
GUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGAUUUCUGCUGGAAGCAGCCAGUCCGCCCUCAGGGGUGUGCACUUGGUGAAUUCUAGCAUCCUUCUGGAUUUCUCCACACUUCAUUGUGUGGAGUUUUUUCCAGGACUUUUACUUUGAGAAAAUUAGAGUGUUUCAAGCAGGCUUGUCGCCUUGAAUACUGCAGCAUGGAAUAAUAAGAUAGGAUUUCGGCCCUAUUUUGUUGGUUUCUAGGACUGAAGUAAUGAUUAAUAGGGACGGUUGGGGGCAUUCGUAUUUAACUGUCAGAGGUGAAAUUCUUAGAUUUGUUAAAGACGAACUACUGCGAAAGCAUUUGCCAAAGAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGGGGCUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUAACCAUAAACUAUGCCGACUAGAGAUAGGAAAACGUCAUGCUUGACUUCUCCUGCACCUUAUGAGAAACCAAAGUCUUUGGGUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUA
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16S_rRNA
16S_rRNA-T.gondii_domain3
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16S_rRNA
16S_rRNA-T.gondii_domain4
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16S_rRNA
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ArchiveII

ArchiveII is a dataset of RNA sequences and their secondary structures, widely used in RNA secondary structure prediction benchmarks.

ArchiveII contains 2975 RNA samples across 10 RNA families, with sequence lengths ranging from 28 to 2968 nucleotides. This dataset is frequently used to evaluate RNA secondary structure prediction methods, including those that handle both pseudoknotted and non-pseudoknotted structures.

It is considered complementary to the RNAStrAlign dataset.

Disclaimer

This is an UNOFFICIAL release of the ArchiveII by Mehdi Saman Booy, et al.

The team releasing ArchiveII did not write this dataset card for this dataset so this dataset card has been written by the MultiMolecule team.

Example Entry

id sequence secondary_structure family
16S_rRNA-A.fulgidus AUUCUGGUUGAUCCUGCCAGAGGCCGCUGCUA... ...(((((...(((.))))).((((((((((.... 16S_rRNA

Column Description

  • id: A unique identifier for each RNA entry. This ID is derived from the family and the original .sta file name, and serves as a reference to the specific RNA structure within the dataset.

  • sequence: The nucleotide sequence of the RNA molecule, represented using the standard RNA bases:

    • A: Adenine
    • C: Cytosine
    • G: Guanine
    • U: Uracil

  • secondary_structure: The secondary structure of the RNA represented in dot-bracket notation, using up to three types of symbols to indicate base pairing and unpaired regions, as per bpRNA's standard:

    • Dots (.): Represent unpaired nucleotides.
    • Parentheses (( and )): Represent base pairs in standard stems (page 1).

  • family: The RNA family to which the sequence belongs, such as 16S rRNA, 5S rRNA, etc.

Variations

This dataset is available in two additional variants:

  • archiveii: The main ArchiveII dataset.
  • archiveii.512: ArchiveII dataset with sequences no longer than 512 nucleotides.
  • archiveii.1024: ArchiveII dataset with sequences no longer than 1024 nucleotides.

Related Datasets

  • RNAStrAlign: A database of RNA secondary with the same families as ArchiveII, usually used for training.
  • bpRNA-spot: Another commonly used database in RNA secondary structures prediction.

License

This dataset is licensed under the AGPL-3.0 License.

SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0-or-later

Citation 

@article{samanbooy2022rna,
  author    = {Saman Booy, Mehdi and Ilin, Alexander and Orponen, Pekka},
  journal   = {BMC Bioinformatics},
  keywords  = {Deep learning; Pseudoknotted structures; RNA structure prediction},
  month     = feb,
  number    = 1,
  pages     = {58},
  publisher = {Springer Science and Business Media LLC},
  title     = {{RNA} secondary structure prediction with convolutional neural networks},
  volume    = 23,
  year      = 2022
}
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Homepage
multimolecule.danling.org
datasets
huggingface.co
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Mehdi Saman Booy
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283 kB
Size of the auto-converted Parquet files:
283 kB
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3,975