Search is not available for this dataset
id
stringlengths 9
65
| sequence
stringlengths 28
2.97k
| secondary_structure
stringlengths 28
2.97k
| family
stringclasses 10
values |
|---|---|---|---|
16S_rRNA-T.maritima | UAUAUGGAGGGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAACACAUGCAAGUCGAGCGGGGGAAACUCCCUUCGGGGAGGAGUACCCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACACGUGGGUAACCUGCCCUCCGGAGGGGGAUAACCAGGGGAAACCCUGGCUAAUACCCCAUACGCUCCAUCAACGCAAGUUGGUGGAGGAAAGGGGCGUUUGCCCCGCCGGAGGAGGGGCCCGCGGCCCAUCAGGUAGUUGGUGGGGUAACGGCCCACCAAGCCGACGACGGGUAGCCGGCCUGAGAGGGUGGUCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUCUUGGACAAUGGGGGAAACCCUGAUCCAGCGACGCCGCGUGCGGGACGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACCGCUGUGGCGGGGGAAGAAUAAGGUAGGGAGGAAAUGCCCUACCGAUGACGGUACCCCGCUAGAAAGCCCCGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAGGGGGCAAGCGUUACCCGGAUUUACUGGGCGUAAAGGGGGCGUAGGCGGCCUGGUGUGUCGGAUGUGAAAUCCCACGGCUCAACCGUGGGGCUGCAUCCGAAACUACCAGGCUUGGGGGCGGUAGAGGGAGACGGAACUGCCGGUGUAGGGGUGAAAUCCGUAGAUAUCGGCAGGAACGCCGGUGGGGAAGCCGGUCUCCUGGGCCGACCCCGACGCUGAGGCCCGAAAGCCAGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUGGCUGUAAACGAUGCCCACUAGGUGUGGGGGGGUAAUCCCUCCGUGCUGAAGCUAACGCGUUAAGUGGGCCGCCUGGGGAGUACGCCCGCAAGGGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCGUGUGGUUUAAUUGGAUGCUAAGCCAAGAACCUUACCAGGGCUUGACAUGCCGGUGGUACCUCCCCGAAAGGGGUAGGGACCCAGUCCUUCGGGACUGGGAGCCGGCACAGGUGGUGCACGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCUGCCCCUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAGGGGGACUGCCGGCGACGAGCCGGAGGAAGGAGGGGAUGACGUCAGGUACUCGUGCCCCUUAUGCCCUGGGCGACACACGCGCUACAAUGGGCGGUACAAUGGGUUGCGACCCCGCGAGGGGGAGCCAAUCCCCAAAGCCGCCCUCAGUUCGGAUCGCAGGCUGCAACCCGCCUGCGUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCACCCGAGUCGGGGGCUCCCGAAGACACCUACCCCAACCCGAAAGGGAGGGGGGGUGUCGAGGGAGAACCUGGCGAGGGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU | ........(((((...(((.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((.(((....(((((....))))).....))).)))))......(((.......(((((((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....((((((((((....))))))))))....(((((....))))).)))))))..))))))))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....))))....((((((...(.....(((((((........))))))).....)....))))))......((((((((...(((((.....((.))))).......)))))))))).))))))))))..........(((((...(.((((.(.(((.(((((((..((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..).)))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..)))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((((...))))))))))))...((..)))).....)))))))))).(((......((((....))))....)))...)))..(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......(((((((....(((((((....)))).)))..((((((((....)))))))).)))))))..((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((.....)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......(....(((((((........)))))))....).....))))).....(((((((..........)))))))......))...)))))))))).))..(.(..((...((((.(((..((((((..((((....(((((((.((((..(((....))).)))))))))))...))))..))))))..))).))))....))...)..).((((((((((....))))))))))............... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-T.maritima_domain1 | UAUAUGGAGGGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAACACAUGCAAGUCGAGCGGGGGAAACUCCCUUCGGGGAGGAGUACCCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACACGUGGGUAACCUGCCCUCCGGAGGGGGAUAACCAGGGGAAACCCUGGCUAAUACCCCAUACGCUCCAUCAACGCAAGUUGGUGGAGGAAAGGGGCGUUUGCCCCGCCGGAGGAGGGGCCCGCGGCCCAUCAGGUAGUUGGUGGGGUAACGGCCCACCAAGCCGACGACGGGUAGCCGGCCUGAGAGGGUGGUCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUCUUGGACAAUGGGGGAAACCCUGAUCCAGCGACGCCGCGUGCGGGACGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACCGCUGUGGCGGGGGAAGAAUAAGGUAGGGAGGAAAUGCCCUACCGAUGACGGUACCCCGCUAGAAAGCCCCGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAGGGGGCAAGCGUUACCCGGA | ........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((.(((....(((((....))))).....))).)))))......(((.......(((((((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......)))).....((((((((((....))))))))))....(((((....))))).)))))))..))))))))).(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....))))....((((((...(.....(((((((........))))))).....)....))))))......((((((((...(((((.....((.))))).......)))))))))).))))))))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-T.maritima_domain2 | UUUACUGGGCGUAAAGGGGGCGUAGGCGGCCUGGUGUGUCGGAUGUGAAAUCCCACGGCUCAACCGUGGGGCUGCAUCCGAAACUACCAGGCUUGGGGGCGGUAGAGGGAGACGGAACUGCCGGUGUAGGGGUGAAAUCCGUAGAUAUCGGCAGGAACGCCGGUGGGGAAGCCGGUCUCCUGGGCCGACCCCGACGCUGAGGCCCGAAAGCCAGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCUGGCUGUAAACGAUGCCCACUAGGUGUGGGGGGGUAAUCCCUCCGUGCUGAAGCUAACGCGUUAAGUGGGCCGCCUGGGGAGUACGCCCGCAAGGGUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCGUGUGGUUUAAUUGGAUGCUAAGCCAAGAACCUUACCAGGGCUUGACAUGCCGGU | .......(((((...(.((((.(.(((.(((((((..((((((((((....(((((((.....)))))))..)))))))))..).)))))))...((((((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..)))).))))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..((((((((((((...))))))))))))...((..)))).....)))))))))).(((......((((....))))....)))...............................................((((........))))............................ | 16S_rRNA |
16S_rRNA-T.maritima_domain3 | GGUACCUCCCCGAAAGGGGUAGGGACCCAGUCCUUCGGGACUGGGAGCCGGCACAGGUGGUGCACGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCUGCCCCUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAGGGGGACUGCCGGCGACGAGCCGGAGGAAGGAGGGGAUGACGUCAGGUACUCGUGCCCCUUAUGCCCUGGGCGACACACGCGCUACAAUGGGCGGUACAAUGGGUUGCGACCCCGCGAGGGGGAGCCAAUCCCCAAAGCCGCCCUCAGUUCGGAUCGCAGGCUGCAACCCGCCUGCGUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACAC | ....(((((((....)))).)))..((((((((....))))))))..........((.((((..((((((.((...(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...((..(((.....)))))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....))))....)).).)))...))))))))..............................(((((((.....(((..((...(((....)))...))....)))....)))))))......(....(((((((........)))))))....)...............(((((((..........)))))))......................... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-T.maritima_domain4 | ACCGCCCGUCACGCCACCCGAGUCGGGGGCUCCCGAAGACACCUACCCCAACCCGAAAGGGAGGGGGGGUGUCGAGGGAGAACCUGGCGAGGGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU | .(.(..((...((((.(((..((((((..((((....(((((((.((((..(((....))).)))))))))))...))))..))))))..))).))))....))...)..).((((((((((....))))))))))............... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-Z.mays | CUCAUGGAGAGUUCGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGGGAAGUGGUGUUUCCAGUGGCGAACGGGUGAGUAACGCGUAAGAACCUGCCCUUGGGAGGGGAACAACAACUGGAAACGGUUGCUAAUACCCCGUAGGCUGAGGAGCAAAAGGAGAAAUCCGCCCAAGGAGGGGCUCGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGAGGCAAUAGCUUACCAAGGCGAUGAUCAGUAGCUGGUCCGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCAAUGCCGCGUGGAGGUGGAAGGCCUACGGGUCGUCAACUUCUUUUCUCGGAGAAGAAACAAUGACGGUAUCUGAGGAAUAAGCAUCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACAGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGAAUGAUUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUGGCUUUUCAAGUCCGCCGUCAAAUCCCAGGGCUCAACCCUGGACAGGCGGUGGAAACUACCAAGCUGGAGUACGGUAGGGGCAGAGGGAAUUUCCGGUGGAGCGGUGAAAUGCAUUGAGAUCGGAAAGAACACCAACGGCGAAAGCACUCUGCUGGGCCGACACUGACACUGAGAGACGAAAGCUAGGGGAGCAAAUGGGAUUAGAGACCCCAGUAGUCCUAGCCGUAAACGAUGGAUACUAGGUGCUGUGCGACUCGACCCGUGCAGUGCUGUAGCUAACGCGUUAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUACGUUCGCAAGAAUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAAGGCGAAGAACCUUACCAGGGCUUGACAUGCCGCGAAUCCUCUUGAAAGAGAGGGGUGCCCUCGGGAACGCGGACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGCCGUAAGGUGUUGGGUUAAGUCUCGCAACGAGCGCAACCCUCGUGUUUAGUUGCCACUAUGAGUUUGGAACCCUGAACAGACCGCCGGUGUUAAGCCGGAGGAAGGAGAGGAUGAGGCCAAGUCAUCAUGCCCCUUAUGCCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGGGCGGGACAAAGGGUCGCGAUCUCGCGAGGGUGAGCUAACUCCAAAAACCCGUCCUCAGUUCGGAUUGCAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGCAGGAAUCGCUAGUAAUCGCCGGUCAGCCAUACGGCGGCGAAUCCGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACUAUAGGAGCUGGCCAGGUUUGAAGUCAUUACCCUUAACCGUAAGGAGGGGGAUGCCUAAGGCUAGGCUUGCGACUGGAGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU | ........(((((...(((.))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((.(((((.....))))).)))))......(((......((((.((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))....(((....)))....(((....))).)))))))..)).)).))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.........)....))))))..)...((((((((...(((((.....((.))))).......)))))))))).))))))))))..........(((((.....((((.(.(((.((((....(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..))...))))...(((.((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..))))..)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..(((((((((((........)))))))))))...((..)))).....)))))).))).(((......((((....))))....)))...)))..(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......(((((((..(((((((....))))))).(.((....)).)))))).))..((.((((..((((((.(....(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...(((.........)))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....)))).....).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....).....)))))......((((((..........)))))).......))...)))))))))).))....(..((...((((.(((..((.((((.((((....(.((((.((((...((....)).)))))))).)...)))).)))).))..))).))))....))...)....((((((((((....))))))))))............. | 16S_rRNA |
16S_rRNA-Z.mays_domain1 | CUCAUGGAGAGUUCGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGCAUGCUUAACACAUGCAAGUCGAACGGGAAGUGGUGUUUCCAGUGGCGAACGGGUGAGUAACGCGUAAGAACCUGCCCUUGGGAGGGGAACAACAACUGGAAACGGUUGCUAAUACCCCGUAGGCUGAGGAGCAAAAGGAGAAAUCCGCCCAAGGAGGGGCUCGCGUCUGAUUAGCUAGUUGGUGAGGCAAUAGCUUACCAAGGCGAUGAUCAGUAGCUGGUCCGAGAGGAUGAUCAGCCACACUGGGACUGAGACACGGCCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUUUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCAAUGCCGCGUGGAGGUGGAAGGCCUACGGGUCGUCAACUUCUUUUCUCGGAGAAGAAACAAUGACGGUAUCUGAGGAAUAAGCAUCGGCUAACUCUGUGCCAGCAGCCGCGGUAAGACAGAGGAUGCAAGCGUUAUCCGGA | ........(((((.......))))).((((.((((((.(((((((((....(((.(((..(((..((.(((((.....))))).)))))......(((......((((.((..((...(((((((.((((.....((((((....))))))......))))....(((....)))....(((....))).)))))))..)).)).))))(((....(((..((((((((.......)))))))))))......)))..((((((((....))))...))))))).(((((............))))).((((....))))...)))))).).....(.(((...(((((....))))).)))).)).))))))..((((......((((....)))).....)))).(..((((((...(.........)....))))))..)...((((((((...(((((.....((.))))).......)))))))))).))))))))))... | 16S_rRNA |
16S_rRNA-Z.mays_domain2 | AUGAUUGGGCGUAAAGCGUCUGUAGGUGGCUUUUCAAGUCCGCCGUCAAAUCCCAGGGCUCAACCCUGGACAGGCGGUGGAAACUACCAAGCUGGAGUACGGUAGGGGCAGAGGGAAUUUCCGGUGGAGCGGUGAAAUGCAUUGAGAUCGGAAAGAACACCAACGGCGAAAGCACUCUGCUGGGCCGACACUGACACUGAGAGACGAAAGCUAGGGGAGCAAAUGGGAUUAGAGACCCCAGUAGUCCUAGCCGUAAACGAUGGAUACUAGGUGCUGUGCGACUCGACCCGUGCAGUGCUGUAGCUAACGCGUUAAGUAUCCCGCCUGGGGAGUACGUUCGCAAGAAUGAAACUCA | .......(((((.....((((.(.(((.((((....(((((((((((.....((((((.....))))))...)))))))))..))...))))...(((.((((...((((((((...((((((((...(((......)))......))))))))...).......((....)).)))))))..))))..)))...))))..))))....((((((...((...((((.........))))...))))))))..........((((((..(((((((((((........)))))))))))...((..)))).....)))))).))).(((......((((....))))....))). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-Z.mays_domain3 | AAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAAGGCGAAGAACCUUACCAGGGCUUGACAUGCCGCGAAUCCUCUUGAAAGAGAGGGGUGCCCUCGGGAACGCGGACACAGGUGGUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGCCGUAAGGUGUUGGGUUAAGUCUCGCAACGAGCGCAACCCUCGUGUUUAGUUGCCACUAUGAGUUUGGAACCCUGAACAGACCGCCGGUGUUAAGCCGGAGGAAGGAGAGGAUGAGGCCAAGUCAUCAUGCCCCUUAUGCCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGGGCGGGACAAAGGGUCGCGAUCUCGCGAGGGUGAGCUAACUCCAAAAACCCGUCCUCAGUUCGGAUUGCAGGCUGCAACUCGCCUGCAUGAAGCAGGAAUCGCUAGUAAUCGCCGGUCAGCCAUACGGCGGCGAAUCCGUUCCCGGGCCUUGUACAC | .......(((((.(((((((.((..((((((.((((((((((....((((........))))........(((((((......(((((((..(((((((....))))))).(.((....)).)))))).))..((.((((..((((((.(....(((((((((....)))..((((......))))..)))))).....((((.(((((((...(((.........)))....)))))))..((.(((((.....))))).)).....)))).....).).)))...))))))))....)))))))...)).)))))))).)...(((((((.....(((..((...(((....)))...))....))).....)))))))......(....(((((((........)))))))....).....)))))......((((((..........)))))).......))...)))))))))).)). | 16S_rRNA |
16S_rRNA-Z.mays_domain4 | ACCGCCCGUCACACUAUAGGAGCUGGCCAGGUUUGAAGUCAUUACCCUUAACCGUAAGGAGGGGGAUGCCUAAGGCUAGGCUUGCGACUGGAGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUACUGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU | ...(..((...((((.(((..((.((((.((((....(.((((.((((...((....)).)))))))).)...)))).)))).))..))).))))....))...)....((((((((((....))))))))))............. | 16S_rRNA |
23S_rRNA-B.subtilis | GGUUAAGUUAGAAAGGGCGCACGGUGGAUGCCUUGGCACUAGGAGCCGAUGAAGGACGGGACGAACACCGAUAUGCUUCGGGGAGCUGUAAGCAAGCUUUGAUCCGGAGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCACCACUCGUAAUGGAGUGGUAUCCAUAUCUGAAUUCAUAGGAUAUGAGAAGGCAGACCCGGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCCGGAGAAGAGAAAGCAAAUGCGAUUCCCUGAGUAGCGGCGACGAACACGGGAUCAGCCCAAACCAAGAGGCUUGCCUCUGUGGUUGUAGGACACUCUGUACGGAGUUACAAAAGAACGAGGUAGAUGAAGAGGUCUGGAAAGGGCCCGCCAUAGGAGGUAACAGCCCUGUAGUCAAAACUUCGUUCUCUCCUGAGUGGAUCCUGAGUACGGCGGAACACGUGAAAUUCCGUCGGAAUCCGGGAGGACCAUCUCCCAAGGCUAAAUACUCCCUAGUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGCACCCCGGAAGGGGAGUGAAAGAGAUCCUGAAACCGUGUGCCUACAAGUAGUCAGAGCCCGUUAACGGUGAUGGCGUGCCUUUUGUAGAAUGAACCGGCGAGUUACGAUCCCGUGCAAGGUUAAGCAGAAGAUGCGGAGCCGCAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGCAUGAGUACGUGGUCGUAGACCCGAAACCAGGUGAUCUACCCAUGUCCAGGGUGAAGUUCAGGUAACACUGAAUGGAGGCCCGAACCCACGCACGUUGAAAAGUGCGGGGAUGAGGUGUGGGUAGGGGUGAAAUGCCAAUCGAACCUGGAGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGCUUUAGGGCUAGCCUCAAGGUAAGAGUCUUGGAGGUAGAGCACUGAUUGGACUAGGGGCCCUCACCGGGUUACCGAAUUCAGUCAAACUCCGAAUGCCAAUGACUUAUCCUUGGGAGUCAGACUGCGAGUGAUAAGAUCCGUAGUCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCAAAGUAUACGUUAAGUGGAAAAGGAUGUGGAGUUGCUUAGACAACCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCAUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGACUCUGCGCCGAAAAUGUACCGGGGCUAAACGUAUCACCGAAGCUGCGGACUGUUCUUCGAACAGUGGUAGGAGAGCGUUCUAAGGGCUGUGAAGCCAGACCGGAAGGACUGGUGGACGGCUUAGAAGUGAGAAUGCCGGUAUGAGUAGCGAAAAGAGGGGUGAGAAUCCCUCCACCGAAUGCCUAAGGGUUCCUGAGGAAGGCUCGUCCGCUCAGGGUUAGUCGGGACCUAAGCCGAGGCCGAAAGGCGUAGGCGAUGGACAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCACCUCCUCACCAUUUGAGCAAUGGGGGGUCGCAGGAGGAUAGGGUAAGCGCGGUAUUGGAUAUCCGCGUCCAAGCAGUUAGGCUGGGAAAUAGGCAAAUCCGUUUCCCAUAAGGCUGAGCUGUGAUGGCGAGCGAAAUAUAGUAGCGAAGUUCCUGAUUCCACACUGCCAAGAAAAGCCUCUAGCGAGGUGAGAGGUGCCCGUACCGCAAACCGUCACAGGUAGGCGAGGAGAGAAUCCUAAGGUGAUCGAGAGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUGUUAGGGUGCAAGCCCGAGAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAGGCGACUGUUUAGCAAAAACACAGGUCUCUGCGAAGCCGUAAGGCGAAGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGCGCUUAGCGUAAGCGAAGGUGCGAAUUGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGCAACGAUCUGGGCGCUGUCUCAACGAGAGACUCGGUGAAAUUAUAGUACCUGUGAAGAUGCAGGUUACCCGCGACAGGACGGAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGCAGCCUGAUAUUGAAUGUUGGUACAGCUUGUACAGGAUAGGUAGGAGCCUUGGAAACCGGAGCGCCAGCUUCGGUGGAGGCAUCGGUGGGAUACUACCCUGGCUGUAUUGACCUUCUAACCCCCCGCCCUUAUCGGGCGGGGAGACAGUGUCAGGUGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUUCCCUCAGAAUGGUUGGAAAUCAUUCGCAGAGUGUAAAGGCACAAGGGAGCUUGACUGCGAGACCUACAAGUCGAGCAGGGACGAAAGUCGGGCUUAGUGAUCCGGUGGUUCCGCAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGCUACCCCGGGGAUAACAGGCUUAUCUCCCCCAAGAGCUCCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGUAGUCGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCGUCGCGGGCGCUGGAAAUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACGCACCGCUGGUGUACCAGUUGUUCUGCCAAGGGCAUCGCUGGGUAGCUAUGUGCGGACGGGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCAUGAAGCCCCCCUCAAGAUGAGAUUUCCCAUUCCGCAAGGAAGUAAGAUCCCUGAAAGAUGAUCAGGUUGAUAGGUCUGAGGUGGAAGUGUGGCAACACAUGGAGCUGACAGAUACUAAUCGAUCGAGGACUUAACCAU | ((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((......((((((..(..((.))).....(((((((..((())..)..))).....)))))))...)))....(((....)))(((((((......))))))).(((((((((.........))))))).)).))....((((((.....((....))......))))).)........((....))..((((((.....(......)....).))))..((((.....((.((((....)))))).......(((((((((.....((((.......((((((((((.(((...(.((((.......)))))(((...).(((.....)))))...)))...)))))))))))))).)))))..)))).....((((((((.........))))))))......(((((..(((()))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).....(.((((..((.((....))))..))))...(.(........).).((((((....(((((((.(((((..((((..(((.....)))..))))...((....))..((((.....))))......))))).)))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..((((((((((...(.(((...((((((((...(((((((.....))))).))...))))))))..)).).)...)))).))))).)))))))).)...(((((((.((......)).)))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....(.((((((...........((..((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))).))............)).....))))))))))...)))))))(((((((...)))))))....))))))(.(((((((.........(((((.((....)).)))))......)))))))..).....))))))(......((.....((((((......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((.((((((......((...((((....((((..(((..(((.((((((((..........))))))((..((((...(((((((((((.((.....)))))))))....))))...))))...))...((.(.......).))....)))))...)))...)))).........))))..))..)))))))))))))))..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))(((((.((.((((....)))))).)))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((...(((((..((....))...)))))...))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).)))))).....))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..(((.((((((((((((.(..(...(..(((((..(((......((((((((....))))))))...)))........).).)))))).)))))))))))).)))....((.((((((.....))))))))......)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((((....((((((((.((((((.......))))))...))(()(.((())....))))))....((((..(((...(..)))..)))).(((....))).))))).).....(((((((.((..))))..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((........))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.(((((((....)))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...((((((((..((((..(((((((...............))))))).(((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).)))))...(((....(((((...........)))))....))).))))..)...))))))))..((((....)))).(..(((((((((.......)))))....((((((((.((.....(((((....)))))....))..))))).)))...)))).)..)))))))).. | 23S_rRNA |
23S_rRNA-B.subtilis_domain1 | AGGGCGCACGGUGGAUGCCUUGGCACUAGGAGCCGAUGAAGGACGGGACGAACACCGAUAUGCUUCGGGGAGCUGUAAGCAAGCUUUGAUCCGGAGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCACCACUCGUAAUGGAGUGGUAUCCAUAUCUGAAUUCAUAGGAUAUGAGAAGGCAGACCCGGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCCGGAGAAGAGAAAGCAAAUGCGAUUCCCUGAGUAGCGGCGACGAACACGGGAUCAGCCCAAACCAAGAGGCUUGCCUCUGUGGUUGUAGGACACUCUGUACGGAGUUACAAAAGAACGAGGUAGAUGAAGAGGUCUGGAAAGGGCCCGCCAUAGGAGGUAACAGCCCUGUAGUCAAAACUUCGUUCUCUCCUGAGUGGAUCCUGAGUACGGCGGAACACGUGAAAUUCCGUCGGAAUCCGGGAGGACCAUCUCCCAAGGCUAAAUACUCCCUAGUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGCACCCCGGAAGGGGAGUGAAAGAGAUCCUGAAACCGUGUGCCUA | .((((((((((.....(((..(((((((((((((......((((((..(..((.))).....(((((((..((())..)..))).....)))))))...)))....(((....)))(((((((......))))))).(((((((((.........))))))).)).))....((((((.....((....))......))))).)........((....))..((((((.....(......)....).))))..((((.....((.((((....)))))).......(((((((((.....((((.......((((((((((.(((...(.((((.......)))))(((...).(((.....)))))...)))...)))))))))))))).)))))..)))).....((((((((.........))))))))......(((((......)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-B.subtilis_domain2 | AACCGGCGAGUUACGAUCCCGUGCAAGGUUAAGCAGAAGAUGCGGAGCCGCAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGCAUGAGUACGUGGUCGUAGACCCGAAACCAGGUGAUCUACCCAUGUCCAGGGUGAAGUUCAGGUAACACUGAAUGGAGGCCCGAACCCACGCACGUUGAAAAGUGCGGGGAUGAGGUGUGGGUAGGGGUGAAAUGCCAAUCGAACCUGGAGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGCUUUAGGGCUAGCCUCAAGGUAAGAGUCUUGGAGGUAGAGCACUGAUUGGACUAGGGGCCCUCACCGGGUUACCGAAUUCAGUCAAACUCCGAAUGCCAAUGACUUAUCCUUGGGAGUCAGACUGCGAGUGAUAAGAUCCGUAGUCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCAAAGUAUACGUUAAGUGGAAAAGGAUGUGGAGUUGCUUAGACAACCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCACCAUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGACUCUGCGCCGAAAAUGUACCGGGGCUAAACGUAUCACCGAAGCUGCGGACUGUUCUUCGAACAGUGGUAGGAGAGCGUUCUAAGGGCUGUGAAGCCAGACCGGAAGGACUGGUGGACGGCUUAGAAGUGAGAAUGCCGGUA | .((((((....(((((((.(((((..((((..(((.....)))..))))...((....))..((((.....))))......))))).)))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..((((((((((...(.(((...((((((((...(((((((.....))))).))...))))))))..)).).)...)))).))))).)))))))).)...(((((((.((......)).)))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....(.((((((...........((..((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))).))............)).....))))))))))...)))))))(((((((...)))))))....))))))(.(((((((.........(((((.((....)).)))))......)))))))..).....)))))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-B.subtilis_domain3 | AGAGGGGUGAGAAUCCCUCCACCGAAUGCCUAAGGGUUCCUGAGGAAGGCUCGUCCGCUCAGGGUUAGUCGGGACCUAAGCCGAGGCCGAAAGGCGUAGGCGAUGGACAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCACCUCCUCACCAUUUGAGCAAUGGGGGGUCGCAGGAGGAUAGGGUAAGCGCGGUAUUGGAUAUCCGCGUCCAAGCAGUUAGGCUGGGAAAUAGGCAAAUCCGUUUCCCAUAAGGCUGAGCUGUGAUGGCGAGCGAAAUAUAGUAGCGAAGUUCCUGAUUCCACACUGCCAAGAAAAGCCUCUAGCGAGGUGAGAGGUGCCCGUACCGCAAACCGUCACAGGUAGGCGAGGAGAGAAUCCUAAGGUGA | .((((((......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((.((((((......((...((((....((((..(((..(((.((((((((..........))))))((..((((...(((((((((((.((.....)))))))))....))))...))))...))...((.(.......).))....)))))...)))...)))).........))))..))..)))))))))))))))..)).....((......)).)))).((((.....))))..)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-B.subtilis_domain4 | UCGAGAGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUGUUAGGGUGCAAGCCCGAGAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAGGCGACUGUUUAGCAAAAACACAGGUCUCUGCGAAGCCGUAAGGCGAAGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGCGCUUAGCGUAAGCGAAGGUGCGAAUUGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGCAACGAUCUGGGCGCUGUCUCAACGAGAGACUCGG | .((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))(((((.((.((((....)))))).)))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((...(((((..((....))...)))))...))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-B.subtilis_domain5 | UACCUGUGAAGAUGCAGGUUACCCGCGACAGGACGGAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGCAGCCUGAUAUUGAAUGUUGGUACAGCUUGUACAGGAUAGGUAGGAGCCUUGGAAACCGGAGCGCCAGCUUCGGUGGAGGCAUCGGUGGGAUACUACCCUGGCUGUAUUGACCUUCUAACCCCCCGCCCUUAUCGGGCGGGGAGACAGUGUCAGGUGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUUCCCUCAGAAUGGUUGGAAAUCAUUCGCAGAGUGUAAAGGCACAAGGGAGCUUGACUGCGAGACCUACAAGUCGAGCAGGGACGAAAGUCGGGCUUAGUGAUCCGGUGGUUCCGCAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGCUACCCCGGGGAUAACAGGCUUAUCUCCCCCAAGAGCUCCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGUAGUCGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCGUCGCGGGC | .(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..(((.((((((((((((.(..(...(..(((((..(((......((((((((....))))))))...)))........).).)))))).)))))))))))).)))....((.((((((.....))))))))......)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((((....((((((((.((((((.......))))))...))(()(.((())....))))))....((((..(((...(..)))..)))).(((....))).))))).).....(((((((.((........))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((........))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.(((((((....)))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..))))))))))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-B.subtilis_domain6 | UGGAAAUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACGCACCGCUGGUGUACCAGUUGUUCUGCCAAGGGCAUCGCUGGGUAGCUAUGUGCGGACGGGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCAUGAAGCCCCCCUCAAGAUGAGAUUUCCCAUUCCGCAAGGAAGUAAGAUCCCUGAAAGAUGAUCAGGUUGAUAGGUCUGAGGUGGAAGUGUGGCAACACAUGGAGCUGACAGAUACUAAUCGAUCG | .((((((((..((((..(((((((...............))))))).(((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).)))))...(((....(((((...........)))))....))).))))......))))))))..((((....))))....(((((((((.......)))))....((((((((.((.....(((((....)))))....))..))))).)))...)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-E.coli | GGUUAAGCGACUAAGCGUACACGGUGGAUGCCCUGGCAGUCAGAGGCGAUGAAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCGGUAAGGUGAUAUGAACCGUUAUAACCGGCGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGUGUGUUUCGACACACUAUCAUUAACUGAAUCCAUAGGUUAAUGAGGCGAACCGGGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCCCGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCCCCAGUAGCGGCGAGCGAACGGGGAGCAGCCCAGAGCCUGAAUCAGUGUGUGUGUUAGUGGAAGCGUCUGGAAAGGCGCGCGAUACAGGGUGACAGCCCCGUACACAAAAAUGCACAUGCUGUGAGCUCGAUGAGUAGGGCGGGACACGUGGUAUCCUGUCUGAAUAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCCUGACUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCGGCGAGGGGAGUGAAAAAGAACCUGAAACCGUGUACGUACAAGCAGUGGGAGCACGCUUAGGCGUGUGACUGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAUAUUCUGUAGCAAGGUUAACCGAAUAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGUCUUAACUGGGCGUUAAGUUGCAGGGUAUAGACCCGAAACCCGGUGAUCUAGCCAUGGGCAGGUUGAAGGUUGGGUAACACUAACUGGAGGACCGAACCGACUAAUGUUGAAAAAUUAGCGGAUGACUUGUGGCUGGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACCGGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAGCUAUUUAGGUAGCGCCUCGUGAAUUCAUCUCCGGGGGUAGAGCACUGUUUCGGCAAGGGGGUCAUCCCGACUUACCAACCCGAUGCAAACUGCGAAUACCGGAGAAUGUUAUCACGGGAGACACACGGCGGGUGCUAACGUCCGUCGUGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCAAAGUCAUGGUUAAGUGGGAAACGAUGUGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUCGGCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUAAACCAUGCACCGAAGCUGCGGCAGCGACGCUUAUGCGUUGUUGGGUAGGGGAGCGUUCUGUAAGCCUGCGAAGGUGUGCUGUGAGGCAUGCUGGAGGUAUCAGAAGUGCGAAUGCUGACAUAAGUAACGAUAAAGCGGGUGAAAAGCCCGCUCGCCGGAAGACCAAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGAGUCGACCCCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUGGUGUUACUGCGAAGGGGGGACGGAGAAGGCUAUGUUGGCCGGGCGACGGUUGUCCCGGUUUAAGCGUGUAGGCUGGUUUUCCAGGCAAAUCCGGAAAAUCAAGGCUGAGGCGUGAUGACGAGGCACUACGGUGCUGAAGCAACAAAUGCCCUGCUUCCAGGAAAAGCCUCUAAGCAUCAGGUAACAUCAAAUCGUACCCCAAACCGACACAGGUGGUCAGGUAGAGAAUACCAAGGCGCUUGAGAGAACUCGGGUGAAGGAACUAGGCAAAAUGGUGCCGUAACUUCGGGAGAAGGCACGCUGAUAUGUAGGUGAGGUCCCUCGCGGAUGGAGCUGAAAUCAGUCGAAGAUACCAGCUGGCUGCAACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUGUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUACGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAAUGAUGGCCAGGCUGUCUCCACCCGAGACUCAGUGAAAUUGAACUCGCUGUGAAGAUGCAGUGUACCCGCGGCAAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUAUAGCUUGACACUGAACAUUGAGCCUUGAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUGUGGACGCCAGUCUGCAUGGAGCCGACCUUGAAAUACCACCCUUUAAUGUUUGAUGUUCUAACGUUGACCCGUAAUCCGGGUUGCGGACAGUGUCUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGAGCACGAAGGUUGGCUAAUCCUGGUCGGACAUCAGGAGGUUAGUGCAAUGGCAUAAGCCAGCUUGACUGCGAGCGUGACGGCGCGAGCAGGUGCGAAAGCAGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGAAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUGGGGCUGAAGUAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGUGGUACGCGAGCUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGCGCUGGAGAACUGAGGGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGCAUCACUGGUGUUCGGGUUGUCAUGCCAAUGGCACUGCCCGGUAGCUAAAUGCGGAAGAGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCACGAAACUUGCCCCGAGAUGAGUUCUCCCUGACCCUUUAAGGGUCCUGAAGGAACGUUGAAGACGACGACGUUGAUAGGCCGGGUGUGUAAGCGCAGCGAUGCGUUGAGCUAACCGGUACUAAUGAACCGUGAGGCUUAACCUU | ((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((......((((((.(..(((()))...).(((((((..((()))..).)))......)))))))...)))....(((....)))(((((((....))))))).(((((((((.........))))))))).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((..((((......(((((((((((((.(((...(((((......)))))(((...).(((.....)))))...)))...)))))))))))))...))))........((((((((.........))))))))......(((((..(((()))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............).....)))))))))).....(.((((..((((((....))))))..))))...(.(........).).((((((....(((((((((((((..((((..((.....))..))))...((....))..((((.....)))).....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..((((((((((.....(((...(((.((((...(((((((.....))))).))...)))).)))..)).).....)))))).)))..)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....(.((((((...........((..(((((..(((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))..))))).))............)).....))))))))))...)))))))(((((((((....)))))))))....))))))(.(((((...(((......((((((((....))))))))...)))..)))))..).....))))))(......((.....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....(((((..((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((((..(((((....((((..(((..(((((((((((..........))))))((..((((...((((((((((((.((.....))))))))))..))))...))))...))...(((((....)))))....)))))...)))...)))).........)))))..))....))))))))))).)))..)).....((......)).)))).((((.....))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))((((((...(((.....((((.....))))....)))..))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((........(((((..((....))...)))))........))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).)))))).....))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...((.((((..(((((((((((.((((.(..(...(..(((((..(((......((((((((....))))))))...)))........).).)))))).)))).)))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))).))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((((....((((((((.((((((.......))))))...))(()(.((())....))))))....((((..(((...(..)))..)))).(((....))).))))).).....(((((((.((..))))..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...((((((((..((((..(((((((...............))))))).(((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).)))))...(((....(((((...........)))))....))).))))..)...))))))))..((((((...))))))..(..((..(((((.......)))))....((((((((..(.....(((((....)))))....)...))))).))).....)).)...)))))))).. | 23S_rRNA |
23S_rRNA-E.coli_domain1 | AGCGUACACGGUGGAUGCCCUGGCAGUCAGAGGCGAUGAAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCGGUAAGGUGAUAUGAACCGUUAUAACCGGCGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGUGUGUUUCGACACACUAUCAUUAACUGAAUCCAUAGGUUAAUGAGGCGAACCGGGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCCCGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCCCCAGUAGCGGCGAGCGAACGGGGAGCAGCCCAGAGCCUGAAUCAGUGUGUGUGUUAGUGGAAGCGUCUGGAAAGGCGCGCGAUACAGGGUGACAGCCCCGUACACAAAAAUGCACAUGCUGUGAGCUCGAUGAGUAGGGCGGGACACGUGGUAUCCUGUCUGAAUAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCCUGACUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCGGCGAGGGGAGUGAAAAAGAACCUGAAACCGUGUACGUA | .((((((((((.....(((..(((((((((((((......((((((.(..(((()))...).(((((((..((()))..).)))......)))))))...)))....(((....)))(((((((....))))))).(((((((((.........))))))))).))...((((((.....((....))......))))).).........((....))..((((((.....((.....))....)))))..((((..((((......(((((((((((((.(((...(((((......)))))(((...).(((.....)))))...)))...)))))))))))))...))))........((((((((.........))))))))......(((((......)))))..))))..)..)).))))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............).....)))))))))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-E.coli_domain2 | GGUCAGCGACUUAUAUUCUGUAGCAAGGUUAACCGAAUAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGUCUUAACUGGGCGUUAAGUUGCAGGGUAUAGACCCGAAACCCGGUGAUCUAGCCAUGGGCAGGUUGAAGGUUGGGUAACACUAACUGGAGGACCGAACCGACUAAUGUUGAAAAAUUAGCGGAUGACUUGUGGCUGGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACCGGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAGCUAUUUAGGUAGCGCCUCGUGAAUUCAUCUCCGGGGGUAGAGCACUGUUUCGGCAAGGGGGUCAUCCCGACUUACCAACCCGAUGCAAACUGCGAAUACCGGAGAAUGUUAUCACGGGAGACACACGGCGGGUGCUAACGUCCGUCGUGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCAAAGUCAUGGUUAAGUGGGAAACGAUGUGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUCGGCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUAAACCAUGCACCGAAGCUGCGGCAGCGACGCUUAUGCGUUGUUGGGUAGGGGAGCGUUCUGUAAGCCUGCGAAGGUGUGCUGUGAGGCAUGCUGGAGGUAUCAGAAGUGCGAAUGCUGACA | .((((((....(((((((((((((..((((..((.....))..))))...((....))..((((.....)))).....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..((((((((((.....(((...(((.((((...(((((((.....))))).))...)))).)))..)).).....)))))).)))..)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....(.((((((...........((..(((((..(((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))..))))).))............)).....))))))))))...)))))))(((((((((....)))))))))....))))))(.(((((...(((......((((((((....))))))))...)))..)))))..).....)))))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-E.coli_domain3 | AAGCGGGUGAAAAGCCCGCUCGCCGGAAGACCAAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGAGUCGACCCCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUGGUGUUACUGCGAAGGGGGGACGGAGAAGGCUAUGUUGGCCGGGCGACGGUUGUCCCGGUUUAAGCGUGUAGGCUGGUUUUCCAGGCAAAUCCGGAAAAUCAAGGCUGAGGCGUGAUGACGAGGCACUACGGUGCUGAAGCAACAAAUGCCCUGCUUCCAGGAAAAGCCUCUAAGCAUCAGGUAACAUCAAAUCGUACCCCAAACCGACACAGGUGGUCAGGUAGAGAAUACCAAGGCGC | .((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....(((((..((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((((((((..(((((....((((..(((..(((((((((((..........))))))((..((((...((((((((((((.((.....))))))))))..))))...))))...))...(((((....)))))....)))))...)))...)))).........)))))..))....))))))))))).)))..)).....((......)).)))).((((.....))))..)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-E.coli_domain4 | UUGAGAGAACUCGGGUGAAGGAACUAGGCAAAAUGGUGCCGUAACUUCGGGAGAAGGCACGCUGAUAUGUAGGUGAGGUCCCUCGCGGAUGGAGCUGAAAUCAGUCGAAGAUACCAGCUGGCUGCAACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUGUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUACGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAAUGAUGGCCAGGCUGUCUCCACCCGAGACUCAG | .((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))((((((...(((.....((((.....))))....)))..))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((........(((((..((....))...)))))........))))))))..)))))((((((.......))))))(...).....(.........((((((.....))))))).........))))...)).)))))))....))).)))))))).)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-E.coli_domain5 | UCGCUGUGAAGAUGCAGUGUACCCGCGGCAAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUAUAGCUUGACACUGAACAUUGAGCCUUGAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUGUGGACGCCAGUCUGCAUGGAGCCGACCUUGAAAUACCACCCUUUAAUGUUUGAUGUUCUAACGUUGACCCGUAAUCCGGGUUGCGGACAGUGUCUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGAGCACGAAGGUUGGCUAAUCCUGGUCGGACAUCAGGAGGUUAGUGCAAUGGCAUAAGCCAGCUUGACUGCGAGCGUGACGGCGCGAGCAGGUGCGAAAGCAGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGAAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUGGGGCUGAAGUAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGUGGUACGCGAGCUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGC | .(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...((.((((..(((((((((((.((((.(..(...(..(((((..(((......((((((((....))))))))...)))........).).)))))).)))).)))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))).))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((((....((((((((.((((((.......))))))...))(()(.((())....))))))....((((..(((...(..)))..)))).(((....))).))))).).....(((((((.((........))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..))))))))))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-E.coli_domain6 | UGGAGAACUGAGGGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGCAUCACUGGUGUUCGGGUUGUCAUGCCAAUGGCACUGCCCGGUAGCUAAAUGCGGAAGAGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCACGAAACUUGCCCCGAGAUGAGUUCUCCCUGACCCUUUAAGGGUCCUGAAGGAACGUUGAAGACGACGACGUUGAUAGGCCGGGUGUGUAAGCGCAGCGAUGCGUUGAGCUAACCGGUACUAAUGAACCG | .((((((((..((((..(((((((...............))))))).(((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).)))))...(((....(((((...........)))))....))).))))......))))))))..((((((...)))))).....((..(((((.......)))))....((((((((..(.....(((((....)))))....)...))))).))).....)). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-H.pylori | UAAGGCAGUGGUAGCGCUGAAGAAUGUUCGUGCAAUUGUCGUUAUUCAUUAUAAAAGGGCGGGUUUUAAAGGAUAUUUUAAAAUUUAAAACAAGCUUUUAAGAGCAGAUGGCGGAUGCCUUGCCAAAGAGAGGCGAUGAAGGACGUACUAGACUGCGAUAAGCUAUGCGGAGCUGUCAAGGAGCUUUGAUGCGUAGAUGUCCGAAUGGGGCAACCCAACUAAUAGAGAUAUUAGUUACUCUAACAGAGAGCGAACCUAGUGAAGUGAAACAUCUCAGUAACUAGAGGAAAAGAAAUCAACGAGAUUCCCUAAGUAGUGGCGAGCGAACGGGGAAAAGGGCAAACCGAGUGCUUGCAUUCGGGGUUGAGGACUGCAACAUCCAAGAGAACGCUUUAGCAGAGUUACCUGGAAAGGUAAGCCAUAGAAAGUGAUAGCCUUGUAUGCGACAAGGCGUUUUUAGGUAGCAGUAUCCAGAGUAGGCCAGGACACGAGGAAUCCAGGUUGAAGCCGGGGAGACCACUCUCCAACUCUAAAUACUACUCUUUGAGCGAUAGCGAACAAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCGCAGUGAGCGGAGUGAAAUAGAACCUGAAACCAUCUGCUUACAAUCAUUCAGAGCCCUAUGAUUUAUCAGGGUGAUGGACUGCCUUUUGCAUAAUGAUCCUGCGAGUUGUGGUAUCUGGCAAGGUUAAGCGAAUGCGAAGCCGUAGCGAAACGAGUUCUUAAUAGGGCGAACAAGUCAGAUGCUGCAGACCCGAAGCUAAGUGAUCUAUCCAUGGCCAAGUUGAAACGCGUGUAAUAGCGCGUGGAGGACUGAACUCCUACCCAUUGAAACGGGUUGGGAUGAGCUGUGGAUAGGGGUGAAAGGCCAAACAAACUUAGUGAUAGCUGGUUCUCUUCGAAAUAUAUUUAGGUAUAGCCUCAAGUGAUAAUAAAAGGGGGUAGAGCGCUGAUUGGGCUAGGGCUGCUCGCCGCGGUACCAAACCCUAUCAAACUUCGAAUACCUUUUAUCGUAUCUUGGGAGUCAGGCGGUGGGUGAUAAAAUCAAUCGUCAAAAGGGGAACAACCCAGACUACCAAAUAAGGUCCCUAAGUUCUAUUCUGAGUGGAAAAAGAUGUGUGGCUACUAAAACAACCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAAAGCGUAACAGCUCACUGGUCUAGUGGUCAUGCGCUGAAAAUAUAACGGGGCUAAGAUAGACACCGAAUUUGUAGAUUGUGUUAAACACAGUGGUAGAAGAGCGUUCAUACCAGCGUUGAAGGUAUACCGGUAAGGAGUGCUGGAGCGGUAUGAAGUGAGCAUGCAGGAAUGAGUAACGAUAAGAUAUAUGAGAAUUGUAUCCGCCGUAAAUCUAAGGUUUCCUACGCGAUGGUCGUCAUCGUAGGGUUAGUCGGGUCCUAAGCCGAGUCCGAAAGGGGUAGGUGAUGGCAAAUUGGUUAAUAUUCCAAUACCGACUGUGGAGCGUGAUGGGGGGACGCAUAGGGUUAAGCGAGCUAGCUGAUGGAAGCGCUAGUCUAAGGGCGUAGAUUGGAGGGAAGGCAAAUCCACCUCUGUAUUUGAAACCCAAACAGGCUCUUUGAGUCCUUUUAGGACAAAGGGAGAAUCGCUGAUACCGUCGUGCCAAGAAAAGCCUCUAAGCAUAUCCAUAGUCGUCCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGAUGAGAUGAGUAUUCUAAGGCGCGUGAAAGAACUCUGGUUAAGGAACUCUGCAAACUAGCACCGUAAGUUCGCGAUAAGGUGUGCCACAGCGAUGUGGUCUCAGCAAAGAGUCCCUCCCGACUGUUUACCAAAAACACAGCACUUUGCCAACUCGUAAGAGGAAGUAUAAGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCUCGAAGGUUAAGAGGAUGCGUCAGUCGCAAGAUGAAGCGUUGAAUUGAAGCCCGAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGUUAAAUACCGACCUGCAUGAAUGGCGUAACGAGAUGGGAGCUGUCUCAACCAGAGAUUCAGUGAAAUUGUAGUGGAGGUGAAAAUUCCUCCUACCCGCGGCAAGACGGAAAGACCCCGUGGACCUUUACUACAACUUAGCACUGCUAAUGGGAAUAUCAUGCGCAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUAAGGGCUUUGGCUCUUAUGGAGUCAUCCUUGAGAUACCACCCUUGAUGUUUCUGUUAGCUAACUGGCCUGUGUUAUCCACAGGCAGGACAAUGCUUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCGCUCCUAAAAAGUAACGGAGGCUUGCAAAGGUUGGCUCAUUGCGGUUGGAAAUCGCAAGUUGAGUGUAAUGGCACAAGCCAGCCUGACUGUAAGACAUACAAGUCAAGCAGAGACGAAAGUCGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGUGUGGAAGGGCCAUCGCUCAAAGGAUAAAAGGUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCAAGAGCUCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGGAGCAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGCGUAGGAAAGUUGAGGAGAGCUGUCCCUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACGUGUCACUGGUGCACCAGUUGUCUGCCAAGAGCAUCGCUGGGUAGCACACACGGAUGUGAUAACUGCUGAAAGCAUCUAAGCAGGAACCAACUCCAAGAUAAACUUUCCCUGAAGCUCGCACAAAGACUAUGUGCUUGAUAGGGUAGAUGUGUGAGCGCAGUAAUGCGUUUAGCUGACUACUACUAAUAGAGCGUUUGGCUUGUUUUU | .......................................................................................((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((........(((((((......)))).....(((((((..(((.......))).....)))))))...)))....(((....)))((((((((....)))))))).((((...))))......((((((.....((....))......))))).).........((...))...(((((.....((.....))....)))))..((((....(((((((....)))))))......(((((((.........(((((((((((.(((...(((((......)))))..(...).(((.......)))...)))...))))))))))).....))))..)))......((((.(((.........))).))))......(((((......)))))..)))).....)).))))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............).....)))))))))).......((((..(((((..((....)))))))..))))...(.(........).).((((((....(((((((((((((..((((..((....))..))))...(.....)..((((......))))......)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...((((((......))))))....))))...(((..((((........)))).)))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....)))))..((((((.(.(.((((((((.....(((...((((.(((...(((((((.....))))).))...))).))))..)).).....))))))))...)))))))).....((((((.(((......))).))))))....(((......)))...((((.(((...(((......(.(((((.(...........((..((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))).))...................))))))))))...)))))))(((((((...)))))))....))))))(.((((((((.((......(((((.((.....)).)))))...))))))))))..).....))))))..............((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))......((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))..((((((((((..((...((((....((((..(((..(((((((((((..........))))))((..(((....(((....(((..((.....)).)))....))).....)))....)).((((((..(((((...)))))..))))))..)))))...)))...)))).........))))...))...))))))))))))))..)).....((......)).)))).(((.......)))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))((((((....))))))(...).......((((..(((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..((((..((....((((..(((....)))...))))....))..)))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)..))))....))).)))))))).)))).............(((((........)))))..((((((((.(((.((.....(((((.(((((((.((((...((.((((..((((((((((((((((.(.........(((((..(((......((((((((....))))))))...)))............)))))).))))))))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))).))....))))..((((.....))))(((((...........)))).)..((....((((((((.((((((.......))))))...))((......))....))))))....((((..(((......)))..)))).(((....))).))..........(((((((.((........)))))))))............)))))..))))))).......(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..(((((((((......)))))))..)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..)))))))))))....((((((((..((((..(((((((...(.(....).)..))))))).(((((...(.(....((((((((((....))).))..)))))....)).)))))....((....(((((...........)))))....)).))))......)))))))).....(((((((((.......)))))....((((((((..(.....(((((....)))))....)...))))).)))...)))).....)))))))).. | 23S_rRNA |
23S_rRNA-H.pylori_domain1 | AGAGCAGAUGGCGGAUGCCUUGCCAAAGAGAGGCGAUGAAGGACGUACUAGACUGCGAUAAGCUAUGCGGAGCUGUCAAGGAGCUUUGAUGCGUAGAUGUCCGAAUGGGGCAACCCAACUAAUAGAGAUAUUAGUUACUCUAACAGAGAGCGAACCUAGUGAAGUGAAACAUCUCAGUAACUAGAGGAAAAGAAAUCAACGAGAUUCCCUAAGUAGUGGCGAGCGAACGGGGAAAAGGGCAAACCGAGUGCUUGCAUUCGGGGUUGAGGACUGCAACAUCCAAGAGAACGCUUUAGCAGAGUUACCUGGAAAGGUAAGCCAUAGAAAGUGAUAGCCUUGUAUGCGACAAGGCGUUUUUAGGUAGCAGUAUCCAGAGUAGGCCAGGACACGAGGAAUCCAGGUUGAAGCCGGGGAGACCACUCUCCAACUCUAAAUACUACUCUUUGAGCGAUAGCGAACAAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCGCAGUGAGCGGAGUGAAAUAGAACCUGAAACCAUCUGCUUA | .((((((((((.....(((..(((((((((((........(((((((......)))).....(((((((..(((.......))).....)))))))...)))....(((....)))((((((((....)))))))).((((...))))......((((((.....((....))......))))).).........((...))...(((((.....((.....))....)))))..((((....(((((((....)))))))......(((((((.........(((((((((((.(((...(((((......)))))..(...).(((.......)))...)))...))))))))))).....))))..)))......((((.(((.........))).))))......(((((......)))))..)))).....)).))))))).))...............((....))....)).........((((.....)))).............).....)))))))))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-H.pylori_domain2 | AUCCUGCGAGUUGUGGUAUCUGGCAAGGUUAAGCGAAUGCGAAGCCGUAGCGAAACGAGUUCUUAAUAGGGCGAACAAGUCAGAUGCUGCAGACCCGAAGCUAAGUGAUCUAUCCAUGGCCAAGUUGAAACGCGUGUAAUAGCGCGUGGAGGACUGAACUCCUACCCAUUGAAACGGGUUGGGAUGAGCUGUGGAUAGGGGUGAAAGGCCAAACAAACUUAGUGAUAGCUGGUUCUCUUCGAAAUAUAUUUAGGUAUAGCCUCAAGUGAUAAUAAAAGGGGGUAGAGCGCUGAUUGGGCUAGGGCUGCUCGCCGCGGUACCAAACCCUAUCAAACUUCGAAUACCUUUUAUCGUAUCUUGGGAGUCAGGCGGUGGGUGAUAAAAUCAAUCGUCAAAAGGGGAACAACCCAGACUACCAAAUAAGGUCCCUAAGUUCUAUUCUGAGUGGAAAAAGAUGUGUGGCUACUAAAACAACCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAAAGCGUAACAGCUCACUGGUCUAGUGGUCAUGCGCUGAAAAUAUAACGGGGCUAAGAUAGACACCGAAUUUGUAGAUUGUGUUAAACACAGUGGUAGAAGAGCGUUCAUACCAGCGUUGAAGGUAUACCGGUAAGGAGUGCUGGAGCGGUAUGAAGUGAGCAUGCAGGAA | .((((((....(((((((((((((..((((..((....))..))))...(.....)..((((......))))......)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...((((((......))))))....))))...(((..((((........)))).)))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....)))))..((((((.(.(.((((((((.....(((...((((.(((...(((((((.....))))).))...))).))))..)).).....))))))))...)))))))).....((((((.(((......))).))))))....(((......)))...((((.(((...(((......(.(((((.(...........((..((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))).))...................))))))))))...)))))))(((((((...)))))))....))))))(.((((((((.((......(((((.((.....)).)))))...))))))))))..).....)))))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-H.pylori_domain3 | AGAUAUAUGAGAAUUGUAUCCGCCGUAAAUCUAAGGUUUCCUACGCGAUGGUCGUCAUCGUAGGGUUAGUCGGGUCCUAAGCCGAGUCCGAAAGGGGUAGGUGAUGGCAAAUUGGUUAAUAUUCCAAUACCGACUGUGGAGCGUGAUGGGGGGACGCAUAGGGUUAAGCGAGCUAGCUGAUGGAAGCGCUAGUCUAAGGGCGUAGAUUGGAGGGAAGGCAAAUCCACCUCUGUAUUUGAAACCCAAACAGGCUCUUUGAGUCCUUUUAGGACAAAGGGAGAAUCGCUGAUACCGUCGUGCCAAGAAAAGCCUCUAAGCAUAUCCAUAGUCGUCCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGAUGAGAUGAGUAUUCUAAGGCGC | .((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))......((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))..((((((((((..((...((((....((((..(((..(((((((((((..........))))))((..(((....(((....(((..((.....)).)))....))).....)))....)).((((((..(((((...)))))..))))))..)))))...)))...)))).........))))...))...))))))))))))))..)).....((......)).)))).(((.......)))..)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-H.pylori_domain4 | GUGAAAGAACUCUGGUUAAGGAACUCUGCAAACUAGCACCGUAAGUUCGCGAUAAGGUGUGCCACAGCGAUGUGGUCUCAGCAAAGAGUCCCUCCCGACUGUUUACCAAAAACACAGCACUUUGCCAACUCGUAAGAGGAAGUAUAAGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCUCGAAGGUUAAGAGGAUGCGUCAGUCGCAAGAUGAAGCGUUGAAUUGAAGCCCGAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGUUAAAUACCGACCUGCAUGAAUGGCGUAACGAGAUGGGAGCUGUCUCAACCAGAGAUUCAG | .((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))((((((....))))))(...).......((((..(((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..((((..((....((((..(((....)))...))))....))..)))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)..))))....))).)))))))).)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-H.pylori_domain5 | UGGAGGUGAAAAUUCCUCCUACCCGCGGCAAGACGGAAAGACCCCGUGGACCUUUACUACAACUUAGCACUGCUAAUGGGAAUAUCAUGCGCAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUAAGGGCUUUGGCUCUUAUGGAGUCAUCCUUGAGAUACCACCCUUGAUGUUUCUGUUAGCUAACUGGCCUGUGUUAUCCACAGGCAGGACAAUGCUUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCGCUCCUAAAAAGUAACGGAGGCUUGCAAAGGUUGGCUCAUUGCGGUUGGAAAUCGCAAGUUGAGUGUAAUGGCACAAGCCAGCCUGACUGUAAGACAUACAAGUCAAGCAGAGACGAAAGUCGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGUGUGGAAGGGCCAUCGCUCAAAGGAUAAAAGGUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCAAGAGCUCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGGAGCAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGC | .(((((........)))))..((((((((.(((.((.....(((((.(((((((.((((...((.((((..((((((((((((((((.(.........(((((..(((......((((((((....))))))))...)))............)))))).))))))))))))))))...(((.((((((.....))))))))).....)))).))....))))..((((.....))))(((((...........)))).)..((....((((((((.((((((.......))))))...))((......))....))))))....((((..(((......)))..)))).(((....))).))..........(((((((.((........)))))))))............)))))..))))))).......(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..(((((((((......)))))))..)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..))))))))))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-H.pylori_domain6 | AGGAAAGUUGAGGAGAGCUGUCCCUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACGUGUCACUGGUGCACCAGUUGUCUGCCAAGAGCAUCGCUGGGUAGCACACACGGAUGUGAUAACUGCUGAAAGCAUCUAAGCAGGAACCAACUCCAAGAUAAACUUUCCCUGAAGCUCGCACAAAGACUAUGUGCUUGAUAGGGUAGAUGUGUGAGCGCAGUAAUGCGUUUAGCUGACUACUACUAAUAGAGCG | .((((((((..((((..(((((((...(.(....).)..))))))).(((((...(.(....((((((((((....))).))..)))))....)).)))))....((....(((((...........)))))....)).))))......)))))))).....(((((((((.......)))))....((((((((..(.....(((((....)))))....)...))))).)))...)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-S.aureus | GAUUAAGUUAUUAAGGGCGCACGGUGGAUGCCUUGGCACUAGAAGCCGAUGAAGGACGUUACUAACGACGAUAUGCUUUGGGGAGCUGUAAGUAAGCUUUGAUCCAGAGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGCAUGAGUUAUGUCAUGUUAUCGAUAUGUGAAUACAUAGCAUAUCAGAAGGCACACCCGGAGAACUGAAACAUCUUAGUACCCGGAGGAAGAGAAAGAAAAUUCGAUUCCCUUAGUAGCGGCGAGCGAAACGGGAAGAGCCCAAACCAACAAGCUUGCUUGUUGGGGUUGUAGGACACUCUAUACGGAGUUACAAAGGACGACAUUAGACGAAUCAUCUGGAAAGAUGAAUCAAAGAAGGUAAUAAUCCUGUAGUCGAAAAUGUUGUCUCUCUUGAGUGGAUCCUGAGUACGACGGAGCACGUGAAAUUCCGUCGGAAUCUGGGAGGACCAUCUCCUAAGGCUAAAUACUCUCUAGUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGCACCCCGGAAGGGGAGUGAAAUAGAACCUGAAACCGUGUGCUUACAAGUAGUCAGAGCCCGUUAAUGGGUGAUGGCGUGCCUUUUGUAGAAUGAACCGGCGAGUUACGAUUUGAUGCAAGGUUAAGCAGUAAAUGUGGAGCCGUAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGUUUAGUAUUUGGUCGUAGACCCGAAACCAGGUGAUCUACCCUUGGUCAGGUUGAAGUUCAGGUAACACUGAAUGGAGGACCGAACCGACUUACGUUGAAAAGUGAGCGGAUGAACUGAGGGUAGCGGAGAAAUUCCAAUCGAACCUGGAGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGCUUUAGGGCUAGCCUCAAGUGAUGAUUAUUGGAGGUAGAGCACUGUUUGGACGAGGGGCCCCUCUCGGGUUACCGAAUUCAGACAAACUCCGAAUGCCAAUUAAUUUAACUUGGGAGUCAGAACAUGGGUGAUAAGGUCCGUGUUCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCACCAGCUAAGGUCCCAAAAUAUAUGUUAAGUGGAAAAGGAUGUGGCGUUGCCCAGACAACUAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUAGUCGAGUGACACUGCGCCGAAAAUGUACCGGGGCUAAACAUAUUACCGAAGCUGUGGAUUGUCCUUUGGACAAUGGUAGGAGAGCGUUCUAAGGGCGUUGAAGCAUGAUCGUAAGGACAUGUGGAGCGCUUAGAAGUGAGAAUGCCGGUGUGAGUAGCGAAAGACGGGUGAGAAUCCCGUCCACCGAUUGACUAAGGUUUCCAGAGGAAGGCUCGUCCGCUCUGGGUUAGUCGGGUCCUAAGCUGAGGCCGACAGGCGUAGGCGAUGGAUAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCACCUAUAAUCGUUUUAAUCGAUGGGGGGACGCAGUAGGAUAGGCGAAGCGUGCGAUUGGAUUGCACGUCUAAGCAGUAAGGCUGAGUAUUAGGCAAAUCCGGUACUCGUUAAGGCUGAGCUGUGAUGGGGAGAAGACAUUGUGUCUUCGAGUCGUUGAUUUCACACUGCCGAGAAAAGCCUCUAGAUAGAAAAUAGGUGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGUCAAGAUGAGAAUUCUAAGGUGAGCGAGCGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUUUAGGGUUAACGCCCAGAAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAAGCGACUGUUUAUCAAAAACACAGGUCUCUGCUAAACCGUAAGGUGAUGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGUGGUUAGCUUCUGCGAAGCUACGAAUCGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGUAACGAUUUGGGCACUGUCUCAACGAGAGACUCGGUGAAAUCAUAGUACCUGUGAAGAUGCAGGUUACCCGCGACAGGACGGAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGUAGCCUGAUAUUGAAAUUCGGCACAGCUUGUACAGGAUAGGUAGGAGCCUUUGAAACGUGAGCGCUAGCUUACGUGGAGGCGCUGGUGGGAUACUACCCUAGCUGUGUUGGCUUUCUAACCCGCACCACUUAUCGUGGUGGGAGACAGUGUCAGGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCUCAAAGGUUCCCUCAGAAUGGUUGGAAAUCAUUCAUAGAGUGUAAAGGCAUAAGGGAGCUUGACUGCGAGACCUACAAGUCGAGCAGGGUCGAAAGACGGACUUAGUGAUCCGGUGGUUCCGCAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGCUACCCCGGGGAUAACAGGCUUAUCUCCCCCAAGAGUUCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGUAGUCGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCGUCGUGGGCGUAGGAAAUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACAUACCUCUGGUGUACCAGUUGUCGUGCCAACGGCAUAGCUGGGUAGCUAUGUGUGGACGGGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCAUGAAGCCCCCCUCAAGAUGAGAUUUCCCAACUUCGGUUAUAAGAUCCCUCAAAGAUGAUGAGGUUAAUAGGUUCGAGGUGGAAGCAUGGUGACAUGUGGAGCUGACGAAUACUAAUCGAUCGAAGACUUAAUCAA | ((((((((......((((((((((.....(((..(((((((((((((......((((((.((..((()))...).(((((((..((())..)).))).....)))))))...)))....(((....)))(((((((......))))))).(((((((((.........))))))).)).))....(((((......((....)).......)))).).........((....))...((((......((.....)).....))))..((((....((((((((....))))))))......(((((((((.....((((.......((((((((((.(((...(((((......)))))(((...).(((.....)))))...)))...)))))))))))))).)))))..)))).....((((((((.........))))))))......(((((..(((()))))..)))).....)).))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))).....(.((((..(((((....)))))..))))...(.(........).).((((((....(((((((.(((((..((((..(((.....)))..))))...((....))..((((.....)))).....))))).)))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..((((((((((.....(((...(((.((((...(((((((.....))))).))...)))).)))..)).).....))))).)))).)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....(.((((((...........((..((((.(((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...))))).)))).))............)).....))))))))))...)))))))(((((((...)))))))....))))))(.(((((((.((......(((((.((....)).)))))...)).)))))))..).....))))))(......((....((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((..((.......((...((((....((((..(((..(((((.((((((.........))))))((..((((...(((((((((((.((.....))))))))).....))))...))))...))...(((((((...)))))))...)))))...)))...)))).........))))..))..))..)))))))))))..)).....((......)).)))).(((.......)))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))(((((((.((((....)))).)))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((...(((((..((....))...)))))...))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).)))))).....))....(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((.(((((((((((.(..(...(..(((((..(((......((((((((....))))))))...)))........).).)))))).))))))))))).))))....((.((((((.....))))))))......)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((((....((((((((.((((((.......))))))...))(()(.((())....))))))....((((..(((...(..)))..)))).(((....))).))))).).....(((((((.((..))))..))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..)))))))))))(...((((((((..((((..(((((((...............))))))).(((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).)))))...(((....(((((...........)))))....))).))))..)...)))))))).(((....))).(..(((((((((.......)))))....((((((((.((.....(((((....)))))....))..))))).)))...)))).)..)))))))).. | 23S_rRNA |
23S_rRNA-S.aureus_domain1 | AGGGCGCACGGUGGAUGCCUUGGCACUAGAAGCCGAUGAAGGACGUUACUAACGACGAUAUGCUUUGGGGAGCUGUAAGUAAGCUUUGAUCCAGAGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGCAUGAGUUAUGUCAUGUUAUCGAUAUGUGAAUACAUAGCAUAUCAGAAGGCACACCCGGAGAACUGAAACAUCUUAGUACCCGGAGGAAGAGAAAGAAAAUUCGAUUCCCUUAGUAGCGGCGAGCGAAACGGGAAGAGCCCAAACCAACAAGCUUGCUUGUUGGGGUUGUAGGACACUCUAUACGGAGUUACAAAGGACGACAUUAGACGAAUCAUCUGGAAAGAUGAAUCAAAGAAGGUAAUAAUCCUGUAGUCGAAAAUGUUGUCUCUCUUGAGUGGAUCCUGAGUACGACGGAGCACGUGAAAUUCCGUCGGAAUCUGGGAGGACCAUCUCCUAAGGCUAAAUACUCUCUAGUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGCACCCCGGAAGGGGAGUGAAAUAGAACCUGAAACCGUGUGCUUA | .((((((((((.....(((..(((((((((((((......((((((.((..((()))...).(((((((..((())..)).))).....)))))))...)))....(((....)))(((((((......))))))).(((((((((.........))))))).)).))....(((((......((....)).......)))).).........((....))...((((......((.....)).....))))..((((....((((((((....))))))))......(((((((((.....((((.......((((((((((.(((...(((((......)))))(((...).(((.....)))))...)))...)))))))))))))).)))))..)))).....((((((((.........))))))))......(((((......)))))..)))).....)).))))))).))...............((....))....)).........((((....)))).............).....)))))))))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-S.aureus_domain2 | AACCGGCGAGUUACGAUUUGAUGCAAGGUUAAGCAGUAAAUGUGGAGCCGUAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGUUUAGUAUUUGGUCGUAGACCCGAAACCAGGUGAUCUACCCUUGGUCAGGUUGAAGUUCAGGUAACACUGAAUGGAGGACCGAACCGACUUACGUUGAAAAGUGAGCGGAUGAACUGAGGGUAGCGGAGAAAUUCCAAUCGAACCUGGAGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGCUUUAGGGCUAGCCUCAAGUGAUGAUUAUUGGAGGUAGAGCACUGUUUGGACGAGGGGCCCCUCUCGGGUUACCGAAUUCAGACAAACUCCGAAUGCCAAUUAAUUUAACUUGGGAGUCAGAACAUGGGUGAUAAGGUCCGUGUUCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCACCAGCUAAGGUCCCAAAAUAUAUGUUAAGUGGAAAAGGAUGUGGCGUUGCCCAGACAACUAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUAGUCGAGUGACACUGCGCCGAAAAUGUACCGGGGCUAAACAUAUUACCGAAGCUGUGGAUUGUCCUUUGGACAAUGGUAGGAGAGCGUUCUAAGGGCGUUGAAGCAUGAUCGUAAGGACAUGUGGAGCGCUUAGAAGUGAGAAUGCCGGUG | .((((((....(((((((.(((((..((((..(((.....)))..))))...((....))..((((.....)))).....))))).)))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...((((((......))))))....))))...(((.(((((........))))))))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..((((((((((.....(((...(((.((((...(((((((.....))))).))...)))).)))..)).).....))))).)))).)))))))).)...((((((((((......))))))))))....(((......)))...((((.(((...(((((....(.((((((...........((..((((.(((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...))))).)))).))............)).....))))))))))...)))))))(((((((...)))))))....))))))(.(((((((.((......(((((.((....)).)))))...)).)))))))..).....)))))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-S.aureus_domain3 | AGACGGGUGAGAAUCCCGUCCACCGAUUGACUAAGGUUUCCAGAGGAAGGCUCGUCCGCUCUGGGUUAGUCGGGUCCUAAGCUGAGGCCGACAGGCGUAGGCGAUGGAUAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCACCUAUAAUCGUUUUAAUCGAUGGGGGGACGCAGUAGGAUAGGCGAAGCGUGCGAUUGGAUUGCACGUCUAAGCAGUAAGGCUGAGUAUUAGGCAAAUCCGGUACUCGUUAAGGCUGAGCUGUGAUGGGGAGAAGACAUUGUGUCUUCGAGUCGUUGAUUUCACACUGCCGAGAAAAGCCUCUAGAUAGAAAAUAGGUGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGUCAAGAUGAGAAUUCUAAGGUGA | .((((((.......))))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))....((((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))))(((((((..((.......((...((((....((((..(((..(((((.((((((.........))))))((..((((...(((((((((((.((.....))))))))).....))))...))))...))...(((((((...)))))))...)))))...)))...)))).........))))..))..))..)))))))))))..)).....((......)).)))).(((.......)))..)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-S.aureus_domain4 | GCGAGCGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUUUAGGGUUAACGCCCAGAAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAAGCGACUGUUUAUCAAAAACACAGGUCUCUGCUAAACCGUAAGGUGAUGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGUGGUUAGCUUCUGCGAAGCUACGAAUCGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGUAACGAUUUGGGCACUGUCUCAACGAGAGACUCGG | .((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))(((((((.((((....)))).)))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((...(((((..((....))...)))))...))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-S.aureus_domain5 | UACCUGUGAAGAUGCAGGUUACCCGCGACAGGACGGAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGUAGCCUGAUAUUGAAAUUCGGCACAGCUUGUACAGGAUAGGUAGGAGCCUUUGAAACGUGAGCGCUAGCUUACGUGGAGGCGCUGGUGGGAUACUACCCUAGCUGUGUUGGCUUUCUAACCCGCACCACUUAUCGUGGUGGGAGACAGUGUCAGGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCUCAAAGGUUCCCUCAGAAUGGUUGGAAAUCAUUCAUAGAGUGUAAAGGCAUAAGGGAGCUUGACUGCGAGACCUACAAGUCGAGCAGGGUCGAAAGACGGACUUAGUGAUCCGGUGGUUCCGCAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGCUACCCCGGGGAUAACAGGCUUAUCUCCCCCAAGAGUUCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGUAGUCGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCGUCGUGGGC | .(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...(((((((..((((.(((((((((((.(..(...(..(((((..(((......((((((((....))))))))...)))........).).)))))).))))))))))).))))....((.((((((.....))))))))......)))))))....))))..((((.....))))((((((...........))))))((((....((((((((.((((((.......))))))...))(()(.((())....))))))....((((..(((...(..)))..)))).(((....))).))))).).....(((((((.((........))))))))).....)).....)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..))))))))))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-S.aureus_domain6 | AGGAAAUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACAUACCUCUGGUGUACCAGUUGUCGUGCCAACGGCAUAGCUGGGUAGCUAUGUGUGGACGGGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCAUGAAGCCCCCCUCAAGAUGAGAUUUCCCAACUUCGGUUAUAAGAUCCCUCAAAGAUGAUGAGGUUAAUAGGUUCGAGGUGGAAGCAUGGUGACAUGUGGAGCUGACGAAUACUAAUCGAUCG | .((((((((..((((..(((((((...............))))))).(((((...(((....(((((((((((....))))))..)))))....))).)))))...(((....(((((...........)))))....))).))))......)))))))).(((....)))....(((((((((.......)))))....((((((((.((.....(((((....)))))....))..))))).)))...)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-T.thermophilus | GGUCAAGAUGGUAAGGGCCCACGGUGGAUGCCUCGGCACCCGAGCCGAUGAAGGACGUGGCUACCUGCGAUAAGCCAGGGGGAGCCGGUAGCGGGCGUGGAUCCCUGGAUGUCCGAAUGGGGGAACCCGGCCGGCGGGAACGCCGGUCACCGCGCUUUUGCGCGGGGGGAACCUGGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCCAGAGGAGAGGAAAGAGAAAUCGACUCCCUGAGUAGCGGCGAGCGAAAGGGGACCAGCCUAAACCGUCCGGCUUGUCCGGGCGGGGUCGUGGGGCCCUCGGACACCGAAUCCCCAGCCUAGCCGAAGCUGUUGGGAAGCAGCGCCAGAGAGGGUGAAAGCCCCGUAGGCGAAAGGUGGGGGGAUAGGUGAGGGUACCCGAGUACCCCGUGGUUCGUGGAGCCAUGGGGGAAUCUGGGCGGACCACCGGCCUAAGGCUAAGUACUCCGGGUGACCGAUAGCGCACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGAGUGAAAUAGAGCCUGAAACCGUGGGCUUACAAGCAGUCACGGCCCCGCAAGGGGUUGUGGCGUGCCUAUUGAAGCAUGAGCCGGCGACUCACGGUCGUGGGCGAGCUUAAGCCGUUGAGGCGGAGGCGUAGGGAAACCGAGUCCGAACAGGGCGCAAGCGGGCCGCACGCGGCCCGCAAAGUCCGCGGCCGUGGACCCGAAACCGGGCGAGCUAGCCCUGGCCAGGGUGAAGCUGGGGUGAGACCCAGUGGAGGCCCGAACCGGUGGGGGAUGCAAACCCCUCGGAUGAGCUGGGGCUAGGAGUGAAAAGCUAACCGAGCCCGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGACUUUAGGGUCAGCCUCAGGCGCUGACUGGGGCCUGUAGAGCACUGAUAGGGCUAGGGGGCCCACCAGCCUACCAAACCCUGUCAAACUCCGAAGGGUCCCAGGUGGAGCCUGGGAGUGAGGGCGCGAGCGAUAACGUCCGCGUCCGAGCGCGGGAACAACCGAGACCGCCAGCUAAGGCCCCCAAGUCUGGGCUAAGUGGUAAAGGAUGUGGCGCCGCGAAGACAGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGGCGCCGCGCCGAAAAUGAUGCGGGGCUUAAGCCCAGCGCCGAAGCUGCGGGUCUGGGGGAUGACCCCAGGCGGUAGGGGAGCGUUCCCGAUGCCGAUGAAGGCCGACCCGCGAGGCGGCUGGAGGUAAGGGAAGUGCGAAUGCCGGCAUGAGUAACGAUAAAGAGGGUGAGAAUCCCUCUCGCCGUAAGCCCAAGGGUUCCUACGCAAUGGUCGUCAGCGUAGGGUUAGGCGGGACCUAAGGUGAAGCCGAAAGGCGUAGCCGAAGGGCAGCCGGUUAAUAUUCCGGCCCUUCCCGCAGGUGCGAUGGGGGGACGCUCUAGGCUAGGGGGACCGGAGCCAUGGACGAGCCCGGCCAGAAGCGCAGGGUGGGAGGUAGGCAAAUCCGCCUCCCAACAAGCUCUGCGUGGUGGGGAAGCCCGUACGGGUGACAACCCCCCGAAGCCAGGGAGCCAAGAAAAGCCUCUAAGCACAACCUGCGGGAACCCGUACCGCAAACCGACACAGGUGGGCGGGUGCAAGAGCACUCAGGCGCGCGGGAGAACCCUCGCCAAGGAACUCUGCAAGUUGGCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCCCUGGGGUGAUGAGCCCCGGGGAGCCGCAGUGAACAGGCUCUGGCGACUGUUUACCAAAAACACAGCUCUCUGCGAACUCGUAAGAGGAGGUAUAGGGAGCGACGCUUGCCCGGUGCCGGAAGGUCAAGGGGAGGGGUGCAAGCCCCGAACCGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAAGCGUAACGACCGGAGCGCUGUCUCGGCGAGGGACCCGGUGAAAUUGAACUGGCCGUGAAGAUGCGGCCUACCCGUGGCAGGACGAAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGCAGCCUGGUGUUGGCUCUUGGUCGCGCCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUGGCGCGGCUGGGGGCCUAACCCUCGGAUGGGGGGACAGCGCUUGGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUCCCCUCAGGCGGGACGGAAAUCCGCCGGAGAGCGCAAGGGUAGAAGGGGGCCUGACUGCGAGGCCUGCAAGCCGAGCAGGGGCGAAAGCCGGGCCUAGUGAACCGGUGGUCCCGUGUGGAAGGGCCAUCGAUCAACGGAUAAAAGUUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCGAGCGUCCACAGCGGCGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGAAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCCACGGGCGCAGGAGGCUUGAGGGGGGCUCUUCCUAGUACGAGAGGACCGGAAGGGACGCACCUCUGGUUUCCCAGCUGUCCCUCCAGGGGCAUAAGCUGGGUAGCCAUGUGCGGAAGGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCCGCCCCAAGAUGAGGCCUCCCACGGCGUCAAGCCGGUAAGGACCCGGGAAGACCACCCGGUGGAUGGGCCGGGGGUGUAAGCGCCGCGAGGCGUUGAGCCGACCGGUCCCAAUCGUCCGAGGUCUUGACCCCUC | ((((((((......((((((((((.....(((..((((((((((........((((((........))).....(((((((..(((.......))).....)))))))...)))....(((....)))((((((((....)))))))).((((((....))))))......((((((.....((....))......))))).).........((....))...(((((.....((.....))....)))))..((((.....(((((((.....))))))).......(((((((((....(((...(((((.((((.(((...(((((......)))))..(...).(((.......)))...)))...)))).)))))...))))))))).))).....(((((((((.......)))))))))......(((((......)).)))..)))).....)).)))))).))...............((....))....))..........(((....))).............).....)))))))))).......(((((((((((....)))))))))))...(.(........).).((((((....(((((((((((((..((((..(((.....)))..))))...((....))..((((.....)))).....(((((((....)))))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...((((((......))))))....))))...(((..((((........)))).)))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..(.(((((((((..(.(((...((((((((...((((((......)))).))...))))))))..)).).)..))))))).))..)))))))).)...(((((((.((......)).))))))).....(((......)))...((((.(((...(((......(.((((((...........((..((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))).))....................))))))))))...)))))))((((((((.....))))))))....))))))(.(((((..((((......(((((..((....)))))))...)))).)))))..).....))))))..............((((((......).)))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))......((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))..(((((((((((((...((((....((((..(((..(((((.((((..............))))......((((((((((((((((.((.....)))))))))).....)))))))).........((((....))))......)))))...)))...)))).........))))...))...)))))))))))))))..)).....((......)).)))).((((......))))..))))..((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))((((((((((((.....))))))))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((...(((((....)))))...))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).)))).............(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...((.((((..((((((((((((((((.(.........(((((..(((......((((((((....))))))))...)))............)))))).))))))))))))))))...(((((....))))).....)))).))....))))..((((.....))))((((((...........))))))..((....((((((((.((((((.......))))))...))((......))....))))))....((((..(((......)))..)))).(((....))).))..........(((((((.((........)))))))))............)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..)))))))))))....((((((((..((((..(((((((...............))))))).(((((...(((....(((((((((((....))))))...)))))....))).)))))...(((....(((((...........)))))....))).))))......))))))))..((((.....))))....(((((((((.......)))))....((((((((.((.....(((((....)))))....))..))))).)))...))))....)))))))).... | 23S_rRNA |
23S_rRNA-T.thermophilus_domain1 | AGGGCCCACGGUGGAUGCCUCGGCACCCGAGCCGAUGAAGGACGUGGCUACCUGCGAUAAGCCAGGGGGAGCCGGUAGCGGGCGUGGAUCCCUGGAUGUCCGAAUGGGGGAACCCGGCCGGCGGGAACGCCGGUCACCGCGCUUUUGCGCGGGGGGAACCUGGGGAACUGAAACAUCUCAGUACCCAGAGGAGAGGAAAGAGAAAUCGACUCCCUGAGUAGCGGCGAGCGAAAGGGGACCAGCCUAAACCGUCCGGCUUGUCCGGGCGGGGUCGUGGGGCCCUCGGACACCGAAUCCCCAGCCUAGCCGAAGCUGUUGGGAAGCAGCGCCAGAGAGGGUGAAAGCCCCGUAGGCGAAAGGUGGGGGGAUAGGUGAGGGUACCCGAGUACCCCGUGGUUCGUGGAGCCAUGGGGGAAUCUGGGCGGACCACCGGCCUAAGGCUAAGUACUCCGGGUGACCGAUAGCGCACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGAACCCCGGGAGGGAGUGAAAUAGAGCCUGAAACCGUGGGCUUA | .((((((((((.....(((..((((((((((........((((((........))).....(((((((..(((.......))).....)))))))...)))....(((....)))((((((((....)))))))).((((((....))))))......((((((.....((....))......))))).).........((....))...(((((.....((.....))....)))))..((((.....(((((((.....))))))).......(((((((((....(((...(((((.((((.(((...(((((......)))))..(...).(((.......)))...)))...)))).)))))...))))))))).))).....(((((((((.......)))))))))......(((((......)).)))..)))).....)).)))))).))...............((....))....))..........(((....))).............).....)))))))))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-T.thermophilus_domain2 | AGCCGGCGACUCACGGUCGUGGGCGAGCUUAAGCCGUUGAGGCGGAGGCGUAGGGAAACCGAGUCCGAACAGGGCGCAAGCGGGCCGCACGCGGCCCGCAAAGUCCGCGGCCGUGGACCCGAAACCGGGCGAGCUAGCCCUGGCCAGGGUGAAGCUGGGGUGAGACCCAGUGGAGGCCCGAACCGGUGGGGGAUGCAAACCCCUCGGAUGAGCUGGGGCUAGGAGUGAAAAGCUAACCGAGCCCGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAUGACUUUAGGGUCAGCCUCAGGCGCUGACUGGGGCCUGUAGAGCACUGAUAGGGCUAGGGGGCCCACCAGCCUACCAAACCCUGUCAAACUCCGAAGGGUCCCAGGUGGAGCCUGGGAGUGAGGGCGCGAGCGAUAACGUCCGCGUCCGAGCGCGGGAACAACCGAGACCGCCAGCUAAGGCCCCCAAGUCUGGGCUAAGUGGUAAAGGAUGUGGCGCCGCGAAGACAGCCAGGAGGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCCUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUGGCGCCGCGCCGAAAAUGAUGCGGGGCUUAAGCCCAGCGCCGAAGCUGCGGGUCUGGGGGAUGACCCCAGGCGGUAGGGGAGCGUUCCCGAUGCCGAUGAAGGCCGACCCGCGAGGCGGCUGGAGGUAAGGGAAGUGCGAAUGCCGGCA | .((((((....(((((((((((((..((((..(((.....)))..))))...((....))..((((.....)))).....(((((((....)))))))....)))))))))))))..((.(...((((((...((((((((((((.((((...((((((......))))))....))))...(((..((((........)))).)))..).))))))))))).(((.....)))......))))))......).))..((((((....(((((....))))).((((((((..(.(((((((((..(.(((...((((((((...((((((......)))).))...))))))))..)).).)..))))))).))..)))))))).)...(((((((.((......)).))))))).....(((......)))...((((.(((...(((......(.((((((...........((..((((((((((.......(((((.(((..(((.........)))..)))(...)(...((......)).).)))))...)))))))))).))....................))))))))))...)))))))((((((((.....))))))))....))))))(.(((((..((((......(((((..((....)))))))...)))).)))))..).....)))))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-T.thermophilus_domain3 | AAGAGGGUGAGAAUCCCUCUCGCCGUAAGCCCAAGGGUUCCUACGCAAUGGUCGUCAGCGUAGGGUUAGGCGGGACCUAAGGUGAAGCCGAAAGGCGUAGCCGAAGGGCAGCCGGUUAAUAUUCCGGCCCUUCCCGCAGGUGCGAUGGGGGGACGCUCUAGGCUAGGGGGACCGGAGCCAUGGACGAGCCCGGCCAGAAGCGCAGGGUGGGAGGUAGGCAAAUCCGCCUCCCAACAAGCUCUGCGUGGUGGGGAAGCCCGUACGGGUGACAACCCCCCGAAGCCAGGGAGCCAAGAAAAGCCUCUAAGCACAACCUGCGGGAACCCGUACCGCAAACCGACACAGGUGGGCGGGUGCAAGAGCACUCAGGCGC | .((((((......).)))))((((....((((..((...((((((...((.....)).))))))......((((.((...(((.(.(((....))).).)))...))...(((((........)))))..(((((((((((((...((((....((((..(((..(((((.((((..............))))......((((((((((((((((.((.....)))))))))).....)))))))).........((((....))))......)))))...)))...)))).........))))...))...)))))))))))))))..)).....((......)).)))).((((......))))..)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-T.thermophilus_domain4 | GCGGGAGAACCCUCGCCAAGGAACUCUGCAAGUUGGCCCCGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCCCUGGGGUGAUGAGCCCCGGGGAGCCGCAGUGAACAGGCUCUGGCGACUGUUUACCAAAAACACAGCUCUCUGCGAACUCGUAAGAGGAGGUAUAGGGAGCGACGCUUGCCCGGUGCCGGAAGGUCAAGGGGAGGGGUGCAAGCCCCGAACCGAAGCCCCGGUGAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAAAGCGUAACGACCGGAGCGCUGUCUCGGCGAGGGACCCGG | .((((....((((((((.(((..............(((((....(....).....)))))((((((((((((.....))))))))))))(...).......(((((((((..(((.........)))..(((((((((...(((....)))...)..))))))))..((((.(((..(((((((..(((...((...(((((....)))))...))...))))))))..)))))((((((.......))))))(...)...............((((((.....))))))..........))))...)).)))))))....))).)))))))).)))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-T.thermophilus_domain5 | UGGCCGUGAAGAUGCGGCCUACCCGUGGCAGGACGAAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGCAGCCUGGUGUUGGCUCUUGGUCGCGCCUGCGUAGGAUAGGUGGGAGCCUGUGAACCCCCGCCUCCGGGUGGGGGGGAGGCGCCGGUGAAAUACCACCCUGGCGCGGCUGGGGGCCUAACCCUCGGAUGGGGGGACAGCGCUUGGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCCCAAAGGUCCCCUCAGGCGGGACGGAAAUCCGCCGGAGAGCGCAAGGGUAGAAGGGGGCCUGACUGCGAGGCCUGCAAGCCGAGCAGGGGCGAAAGCCGGGCCUAGUGAACCGGUGGUCCCGUGUGGAAGGGCCAUCGAUCAACGGAUAAAAGUUACCCCGGGGAUAACAGGCUGAUCUCCCCCGAGCGUCCACAGCGGCGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCGUCGCAUCCUGGGGCUGAAGAAGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGCACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCUCUAUCCGCCACGGGC | .(((((........)))))..((((((((.(((.((......((((.(((((((.((((...((.((((..((((((((((((((((.(.........(((((..(((......((((((((....))))))))...)))............)))))).))))))))))))))))...(((((....))))).....)))).))....))))..((((.....))))((((((...........))))))..((....((((((((.((((((.......))))))...))((......))....))))))....((((..(((......)))..)))).(((....))).))..........(((((((.((........)))))))))............)))))..))))))........(((.((((((((...((.......))...)))))))..))))..........(((((((((((..((.((((((......))))))...)).(((((.....))))).....)))))..)..)))).).....(((((((....))).))))....))..))))))))))). | 23S_rRNA |
23S_rRNA-T.thermophilus_domain6 | AGGAGGCUUGAGGGGGGCUCUUCCUAGUACGAGAGGACCGGAAGGGACGCACCUCUGGUUUCCCAGCUGUCCCUCCAGGGGCAUAAGCUGGGUAGCCAUGUGCGGAAGGGAUAACCGCUGAAAGCAUCUAAGCGGGAAGCCCGCCCCAAGAUGAGGCCUCCCACGGCGUCAAGCCGGUAAGGACCCGGGAAGACCACCCGGUGGAUGGGCCGGGGGUGUAAGCGCCGCGAGGCGUUGAGCCGACCGGUCCCAAUCGUCCG | .((((((((..((((..(((((((...............))))))).(((((...(((....(((((((((((....))))))...)))))....))).)))))...(((....(((((...........)))))....))).))))......))))))))..((((.....))))....(((((((((.......)))))....((((((((.((.....(((((....)))))....))..))))).)))...)))). | 23S_rRNA |
5S_rRNA-Acanthamoeba-castellanii-1 | GGAUACGGCCAUACUGCGCAGAAAGCACCGCUUCCCAUCCGAACAGCGAAGUUAAGCUGCGCCAGGCGGUGUUAGUACUGGGGUGGGCGACCACCCGGGAAUCCACCGUGCCGUAUCCU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acanthamoeba-castellanii-2 | GGAUACGGCCAUACUGCGCAGAAAGCACCGCUUCCCAUCCGAACAGCGAAGUUAAGCUGCGCGAGGCGGUGUUAGUACUGGGGUGGGCGACCACCCGGGAAUCCACCGUGCCGUAUCCU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acetobacter-aceti-2 | GGACCUGGUGGCUAUGGCGGGAGAGAUCCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUGAAAACCCCCAGCGCCUAUGAUACUGCGGCUUAAGCCGUGGGAAAGUCGGUCGCCGCCAGGUCC | .((((((((((.....(((((.(......((((((.............))))..)).....).))).)).((.((....(((((((....)))))))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acetobacter-sp.-1 | GAUCUGGUGGCCAUGGCGGGGCGCAAUCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUCAAAUGCCCCAGCGCCCAUGAUACUCUGCCUCAAGGCACGGAAAAGUCGGUCGCCGCCAGAUCC | ((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acheta-domesticus-1 | GCCAACGUCCAUACCACGUUGAAAGCACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUUAAGCAGCGUCGGGCGCGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAACCCCGCGUGACGUUGGCAU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......((.((.(((....))))).)).....))))).))))))))).. | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acholeplasma-laidlawii-1 | UCUGGUGACGAUAGGUAAGAUGGUUCACCUGUUCCCAUCCCGAACACAGAAGUUAAGCAUCUUAGCGCCGACGAUAGUUAUUACAAUUAGCGAAAAUAGGACGUUGCCAGGC | ((((((((......((((((((....((((((.............))))..))....)))))).)).((.(.....((((.(...).)))).....).))...)))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acholeplasma-laidlawii-2 | UCUGGUGACGAUGGCAAGAUGUUCCACCUGUUCCCUACCCGAAUAUAGAAGUUAAGCAUCUUAGCGCCGACGAUAGUUAUUACAAUUAGCGAAAAUAGGACGUUGCCAGGC | ((((((((.....((((((((....((((((.............))))..))....)))))).)).((.(.....((((.(...).)))).....).))...)))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acholeplasma-laidlawii-3 | UCUGGUGACGAUGGCAAGAUGGUUCCACCUGUUCCCAUCCCGAACACAGAAGUUAAGCAUCUUAGCGCCGACGAUAGUUAUUACAAUUAGCGAAAAUAGGACGUUGCCAGGC | ((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.(.....((((.(...).)))).....).))...)))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Achromobacter-cycloclastes-1 | CGACCUGGUGGUUCUGGCGGGGUGGCUGCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGCCGUGAAACGCCCCAGCGCCGAUGGUACUUCGUCUUAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCU | .((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Achromobacter-denitrificans-1 | UGCCUGACGACCAUAGCGAGUUGGUCCCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACAGUGAAACGACUUUGCGCCGAUGAUAGUGGACGGACGUCUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAGGC | .(((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Achromobacter-xylosoxidans-1 | CCUGACGACCAUAGCAAGGUGGUACCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACAGUGAAACGCCUUUGCGCCGAUGAUAGUGGACGGACGUCUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAGGCU | ((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...)))))))).. | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidiphilium-acidophilum-1 | CGACCUGGUGGCCAUUGCGGGGGGCCCGCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUGAAAACCCCCAGCGCCCAUGGUACUGUGCCUCAAGGCACGGGAGAGUAGGUCGCCGCCAGGUCC | .((((((((((.....(((((((......((((((.............))))..)).....))))).)).((.((....(((((((....)))))))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidiphilium-cryptum-1 | CGACCUGGUGGCCAUUGCGGGGAGCCUGCACCCGAUCCCAUCCCGAACUCGGCCGUGAAAAUCCCCAGCGCCCAUGGUACUGUGCCUCAAGGCACGGGAGAGUAGGUCGCCGCCAGGUCCUC | .((((((((((.....(((((((......((((((.............))))..)).....))))).)).((.((....(((((((....)))))))....)).))...))))))))))... | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidithiobacillus-ferrooxidans-1 | UGUCUGGCGGCCAUAGCGCAGUGGAACCACCCCUUCCCAUCUCGAACAGGACCGUGAAACGCUGCAGCGCCUAUGAUAGUUGAGGGUCUCCCUCCGCGAAAGUCGGUCACCGCCAGAC | .(((((((((.....((((((((.....((.(((.............)))...))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidithiobacillus-ferrooxidans-2 | UGCCUGGUGGCCAUAGCGAGCGGGAACCACCCGAUCCCAUUCCGAACUCGGAAGUGAAAACGCUUAGCGCCGAUGAUAGUAUGGGGUCUCCCUAUGCGAAAGUAGGACACUGCCAGGCUU | .(((((((((.....(((((((......((((((.............))))..)).....))))).)).((.((....((((((((...))))))))....)).))...))))))))).. | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidithiobacillus-ferrooxidans-3 | UGUCUGGCGGCCAUAGCGCAGUGGAACCACCCCUUCCCAUCUCGAACAGGACCGUGAAACGCUGCAGCGCCUAUGAUAGUUGAGGGUCUCCCUCCGCGAAAGUCGGUCACCGCCAGACAC | ((((((((((.....((((((((.....((.(((.............)))...))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidithiobacillus-thiooxidans-1 | UUGUCUGGCGGCCAUAGCGCAGUGGAACCACCCCUUCCCAUCCCGAACAGGACCGUGAAACACUGCAGCGCCUAUGAUAGUUGAGGGCCUCCCUCCGCGAAAGUCGGUCACCGCCAGACAC | .((((((((((.....((((((((.....((.(((.............)))...))....)))))).)).((.((....((.(((((...))))).))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidovorax-delafieldii-1 | UGCCUGAUGACCAUAGCAAGUUGGUCCCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACAGUGAAACGACUUUGCGCCGAUGAUAGUGCGGGUUCCCGUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAGGC | .(((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidovorax-facilis-1 | UGCCUGAUGACCAUAGCAAGUUGGUACCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACAGUGAAACGACUUUGCGCCGAUGAUAGUGCGGGUUCCCGUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAGGC | .(((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acidovorax-temperans-1 | UGCCUGAUGACCAUAGCAAGUUGGUACCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACAGUGAAACGACUUUGCGCCGAUGAUAGUGCGGGUUCCCGUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAGGC | .(((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acinetobacter-sp.-1 | GCUGGCGACAAUAGCAAGAGUGAACCACCUGAUCCCUUCCCGAACUCAGAAGUGAAACCUCUUCGCGCUGAUGGUAGUGUGGCGUUAGCCAUGUGAGAGUAAGUCAUCGCCAGCUU | ((((((((.....(((((((......((((((.............))))..)).....))))).)).((.((....(((((((....)))))))....)).))...)))))))).. | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acinetospora-crinita-1 | AGGAACGGCCAUACCACGUCGAUCGCACCACAUCCCGUCCGCUCUGUGAAGUUAAGCGACGUCGGGCCAGGCUAGUACUACGGUGGGGGACCACGUGGGAAGCCCUGGUGCUGUUCCU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acremonium-chrysogenum-1 | ACAUACGACCAUACCUAGUGGAAAAUACGGGAUCCCGUCCGCUCUCCCAUAGUCAAGCCGCUAAGGGGCUGAUUAGUAGUUGGGUCGGUGACGACCAGCGAAUACCGGCUGUUGUAUGU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))...))....)))))).)).((((.(.....(((((.(((....))))))))....).)))).))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acremonium-persicinum-1 | ACAUACGACCAUAGCUCUCAGAGAACUCGGGAUCCCGUCUGCUCUCCUGUAGAUAAGCUGACAAGCGGCCGAUUAGUAGUUGGGUCGGUGACGACCAGCGAAUACCGGCUGUUGUAUGU | (((((((((....(((.((((.....((((((............))))...))....)))).).)).((((.(.....(((((.(((....))))))))....).)))).))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acremonium-persicinum-2 | ACAUACGACCAUAGACGCUAGAAAAUACGGGAUCCCGUCCGCUCUCCCAUAGUCAAGCUGGCGAUCGGCGGAUUAGUAGUUGGGUCGGUGACGACCAGCGAAUACCUGCUGUUGUAUGU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))...))....)))))).)).((((.(.....(((((.(((....))))))))....).)))).))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acremonium-persicinum-3 | ACAUACGACCAUAGGCGCUAGAAAAUACGGGAUCCCGUCCGCUCUCCCAUAGUCAAGCUGGCGACCGGCUGAUUAGUAGUUGGGUCGGUGACGACCAGCGAAUACCGGCUGUUGUAUGU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))...))....)))))).)).((((.(.....(((((.(((....))))))))....).)))).))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Actinia-equina-1 | GUCUACGGCCAUACCACCGGGAAAAUACCGGUUCUCGUCCGAUCACCGAAGUCAAGCCCGGUAGGGCCAGGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCCUGGGAAUACCUGGUGCUGUAGACUU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).))))))))).. | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Actinokineospora-riparia-1 | GUAACGGCGGUCAUAGCGGUGGGGAAACGCCCGGUCCCAUCCCGAACCCGGAAGCUAAGCCCACCAGCGCCGAUGGUACUGCACUCGUGAGGGUGUGGGAGAGUAGGACGCCGCCGGACU | ((..((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((((....))))))))....)).))...)))))).)). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Actinomadura-madurae-1 | CGUUCGGUGGUUUUGGCGAGGGGGAAACACCCGGUCCCAUUCCGAACCCGGAAGUUAAGCCUCUCAGCGCCGAUGGUACUGCAUGGGAGACUGUGUGGGAGAGUAGGACACCGCCGGACUU | .(((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((((....))))))))....)).))...))))))))).. | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Acyrthosiphon-magnoliae-1 | GGCAACGACCAUACCACGUUGAAUACACCAGUUCUCGUCCGAUCACUGAAGUUAAGCAACGUCGGGCGUAGUUAGUACUUGGAUGGGUGACCGCUUGGGAACACUACGUGCCGUUGGCAU | (.(((((.(....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((((.....((.((.(((....))))).))....)))))).).))))).).. | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Aeromonas-hydrophila-1 | UGCCUGGCGGCCAUAGCGCCGUGGAACCACCUGAUCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCGGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGCAUUUGCCAUGCGAGAGUAGGACACUGCCAGGCA | ((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....(((((((....)))))))....)).))...)))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Aeromonas-media-1 | UGCCUGGCGGCCAUAGCGCCGUGGAACCACCUGAUCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCGGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGCAUUUGCCAUGUGAGAGUAGGACACUGCCAGGCAU | ((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....(((((((....)))))))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Aeromonas-salmonicida-1 | UGCCUGGCGGCCAUAGCGCCGUGGAACCACCUGAUUCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCGGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGCAUUUGCCAUGUGAGAGUAGGACACUGCCAGGCAU | ((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....(((((((....)))))))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Agaricostilbum-pulcherrimum-1 | AAUUACGGCCAUAGCAACCCUAAAACAAUCUUUCCCGUUCGAUCAAGAAAUUUAAGGGGGUUAGCGAGCACUCAGUACUAUGGUCGGGGACGACAUGGGAAUCGUGACUUGCCGUAAUU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))).)).))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Agaricostilbum-pulcherrimum-2 | AAUUACGGCCACAGCAACCCCAAAACACUCUUUCCCGUUCGAUCAAGAAAGUUAAGGGGGUUAGCGAGCACUCAGUACCAUGGUCGGGGACGACAUGGGAAUCGUGACUUGCCGUAAUU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))).)).))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Agaricus-edulis-1 | AUCCACGGCCAUAGGACUGUGAAAGCACCGCAUCCCGUCUGAUCUGCGCAGUUAAACACAGUGCCGCCUAGUUAGUACCAUGGUGGGGGACCACAUGGGAAUCCUGGGUGCUGUGGUU | (.(((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))).) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Agrobacterium-tumefaciens-1 | GACCUGGUGGUUAUCGCGGGGCGGCUGCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGCCGUGAAACGCCCCAGCGCCAAUGGUACUCCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCUGCAAAAC | ((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...))))))))))........ | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Agrobacterium-tumefaciens-2 | GACCUGGUGGUUAUCGCGGGGCGGCUGCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGCCGUGAAACGCCCCAGCGCCAAUGGUACUCCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUC | ((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Agrobacterium-tumefaciens-3 | GACCUGGUGGUUAUCGCGGGGCGGCUGCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGCCGUGAAACGCCCCAGCGCCAAUGGUACUUCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUC | ((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Agrobacterium-tumefaciens-4 | GACCUGGUGGUUAUCGCGGGGCGGCUGCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGCCGUGAAACGCCCCAGCGCCAAUGGUACUCCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCUGCA | ((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))).... | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Agrobacterium-tumefaciens-6 | CGACCUGGUGGUCAUCGCGGGGCGGCUGCACCCGUUCCCUUUCCGAACACGGCCGUGAAACGCCCCAGCGCCAAUGGUACUUCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCU | .((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Agrobacterium-tumefaciens-7 | GACCUGGUGGUUAUCGCGGGGCGGCUGCACCCGUUCCCUUUCCGAACACGGCCGUGAAACGCCCCAGCGCCAAUGGUACUUCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCUGCAAAAC | ((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...))))))))))........ | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Agrobacterium-tumefaciens-8 | GACCUGGUGGUUAUCGCGGGGCGGCUGCACCCGUUCCCUUUCCGAACACGGCCGGAAACGCCCCAGCGCCAAUGGUACUUCGUCUCAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCUGCAAAAC | ((((((((((.....((((((((......(((((.............))))..)....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...))))))))))........ | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Agrobacterium-vitis-1 | GACCUGGUGGUCAUGGCGGGGCGGCCGCACCCGUUCCCAUUCCGAACACGGCCGUGAAACGCCCCUGCGCCAAUGGUACUUCGUCUUAAGACGCGGGAGAGUAGGUCGCUGCCAGGUCU | ((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.((((....)))).))....)).))...)))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Akkesiphycus-lubricum-1 | AGGAACGGCCAUACCACGCCGAUCGCACCACAUCCCGUCCGCUCUGUGAAGUUAAGCGGCGUCGGGCCAGGCUAGUACUACGGUGGGGGACCACGUGGGAAGCCCUGGUGCUGUUCCU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((((......(((((.(((....)))))))).....))))).))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Alcaligenes-faecalis-1 | UGCUUGACGACCAUAGCGAGGUGGUCCCACACCUUCCCAUCCCGAACAGGAUUGUGAAACGCCUUUGCGCCGAUGAUAGUGGACGGACGUCUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAAGC | .(((((((((.....((((((((.....((.(((.............)))...))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Alcaligenes-faecalis-2 | GCUUGACGACCAUAGCGAGGUGGUCCCACACCUUCCCAUCCCGAACAGGAUUGUGAAACGCCUUUGCGCCGAUGAUAGUGGACGGACGUCUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAAGCU | (((((((((.....((((((((.....((.(((.............)))...))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Alcaligenes-faecalis-3 | UGCUUGACGACCAUAGAGCGUUGGAACCACCUGAUCCCAUCCCGAACUCAGCAGUGAAACGACGCAUCGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGUGAGAGUAGGUCAUCGUCAAGCUU | .(((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....(((((((.....)))))))....)).))...))))))))).. | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Alcaligenes-sp.-1 | UUAGCCUGACGACCAUAGCAAGGUGGUACCACUCCUUCCCAUCCCGAACAGGACAGUGAAACGCCUUUGCGCCGAUGAUAGUGGACGGACGUCUGUGAAAGUAGGUCAUCGUCAGGCU | ..((((((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((....))))))....)).))...)))))))))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Ambystoma-salmoides-1 | GCCUACGGCCACACCACACUGAAUGCGCCUGAUCUCGUCUGAUCUCAGAAGCUAAGCAGUGUCGGGCCUAGUUAGUACCUGGAUGGGAGACCGCCUGGGAAUACCAGGUGUCGUAGGCU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).(((.((.....((.((.(((....))))).))....)).))).))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Amoebidium-parasiticum-1 | GGUUACGGCCAUACCUAGCAGAAAGCACCCCAUCUCGUCCGAUCUGGGAAGUUAAACUGCUAUGGGCGUGGUUAGUACUGCGGUGGGGGACCACGCGGGAAUACCACGUGCUGUAAUCU | (((((((((....((((((((.....((((((............))))..))....)))))).)).((((((.....(((((.(((....))))))))....)))))).))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Amphibacillus-xylanus-1 | CUUCGUGACAAUAGCGAAGAGGUCACACCUGUUCCCAUACCGAACACAGAAGUCAAGCUCUUCAGCGCCGAUGGUAGUUGGGGGUUUUCCCCCUGCGAGAGUAGGACGUCGCUAAG | (((.((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((.(((((....))))).))....)).))...)))).))) | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Amycolatopsis-lactamdurans-1 | GUUUCGGUGGUUAUAGCGGCGGGGAAACGCCCGGUCCCAUUCCGAACCCGGAAGCUAAGCCUGCCAGCGCCGAUGGUACUGCACUCGAAGGGGUGUGGGAGAGUAGGACGCCGCCGAACU | ((.(((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((((....))))))))....)).))...))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Amycolatopsis-mediterranei-1 | GUUUCGGUGGUUUUAGCGUCAGGGAAACGCCCGGUCCCAUUCCGAACCCGGAAGCUAAGCCUGACAGCGCCGAUGGUACUGCAACCGAAGGGUUGUGGGAGAGUAGGACACCGCCGAACU | ((.(((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((((....))))))))....)).))...))))))))). | 5S_rRNA |
5S_rRNA-Amycolatopsis-methanolica-1 | GUUUCGGUGGUUAUGGCGGUAGGGAAACGCCCGGUCCCAUUCCGAACCCGGAAGCUAAGCCUGCCAGCGCCGAUGGUACUGCACCCCCGCGGGUGUGGGAGAGUAGGACACCGCCGAACA | ((.(((((((.....((((((((.....((((((.............))))..))....)))))).)).((.((....((((((((....))))))))....)).))...))))))))). | 5S_rRNA |