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978-89-94555-16-4-96470
clavate
Abortiporus biennis
担子器
形状
先細/膨大
basidia
shape
tapering_or_swollen
978-89-94555-16-4-96470
clavate
Abortiporus biennis
担子器
形状
棍棒形
basidia
shape
clavate
978-89-94555-16-4-96470
hyaline
Abortiporus biennis
担子胞子
無色
basidiospore
color
hyaline
978-89-94555-16-4-96470
elliptical
Abortiporus biennis
担子胞子
形状
楕円
basidiospore
shape
ellipsoid
978-89-94555-16-4-96470
globose
Abortiporus biennis
担子胞子
形状
basidiospore
shape
globose_to_subglobose
978-89-94555-16-4-96470
thin-walled
Abortiporus biennis
担子胞子
サイズ
薄壁
basidiospore
size
thin_walled
978-89-94555-16-4-96470
buff (pileus)
Abortiporus biennis
子実体
fruitingbody
color
brownish
978-89-94555-16-4-96470
buff (pileus)
Abortiporus biennis
子実体
fruitingbody
color
yellow
978-89-94555-16-4-96470
annual
Abortiporus biennis
子実体
発達
一年生
fruitingbody
development
annual
978-89-94555-16-4-96470
dimidiate
Abortiporus biennis
子実体
形状
傘状
fruitingbody
shape
pileate
978-89-94555-16-4-96470
sessile
Abortiporus biennis
子実体
形状
無柄
fruitingbody
shape
sessile_to_subsessile
978-89-94555-16-4-96470
strigose (pileus)
Abortiporus biennis
子実体
表面性状
毛状
fruitingbody
surface
velutinous_to_hairy
978-89-94555-16-4-96470
tomentose (pileus)
Abortiporus biennis
子実体
表面性状
綿毛状
fruitingbody
surface
floccose_to_tomentose
978-89-94555-16-4-96470
自動追加 (generative hyphae)
Abortiporus biennis
生殖菌糸
有無
generative hyphae
presence
present
978-89-94555-16-4-96470
soil
Abortiporus biennis
生息環境
生息環境
土壌
habitat
habitat
soil
978-89-94555-16-4-96470
quercus
Abortiporus biennis
生息環境
生息環境
広葉樹林
habitat
habitat
broadleaf forest
978-89-94555-16-4-96470
single (fruiting body)
Abortiporus biennis
生息環境
位置
単生
habitat
position
solitary
978-89-94555-16-4-96470
imbricate (fruiting body)
Abortiporus biennis
生息環境
位置
重生
habitat
position
imbricate
978-89-94555-16-4-96470
gray
Abortiporus biennis
子実層托
hymenophore
color
greyish
978-89-94555-16-4-96470
white
Abortiporus biennis
子実層托
hymenophore
color
whitish_to_greyish_cream
978-89-94555-16-4-96470
dentate
Abortiporus biennis
子実層托
形状
小歯状
hymenophore
shape
denticulate
978-89-94555-16-4-96470
dentate
Abortiporus biennis
子実層托
形状
歯牙
hymenophore
shape
odontioid
978-89-94555-16-4-96470
thick-walled
Abortiporus biennis
菌糸
サイズ
厚壁
hyphae
size
thick_walled
978-89-94555-16-4-96470
monomitic
Abortiporus biennis
菌糸構成
構造
1菌糸型
hyphal system
structure
monomitic
978-89-94555-16-4-96470
buff
Abortiporus biennis
pileus
color
brownish
978-89-94555-16-4-96470
buff
Abortiporus biennis
pileus
color
yellow
978-89-94555-16-4-96470
strigose
Abortiporus biennis
表面性状
毛状
pileus
surface
velutinous_to_hairy
978-89-94555-16-4-96470
tomentose
Abortiporus biennis
表面性状
綿毛状
pileus
surface
floccose_to_tomentose
978-89-94555-16-4-96470
irregular
Abortiporus biennis
孔口
形状
不規則形
pore
shape
irregular
978-89-94555-16-4-96470
dentate
Abortiporus biennis
孔口
形状
歯牙状
pore
shape
dentate
978-89-94555-16-4-96470
hyaline
Abortiporus biennis
胞子
無色
spore
color
hyaline
978-89-94555-16-4-96470
elliptical
Abortiporus biennis
胞子
形状
楕円
spore
shape
ellipsoid
978-89-94555-16-4-96470
globose
Abortiporus biennis
胞子
形状
spore
shape
globose_to_subglobose
978-89-94555-16-4-96470
thin-walled
Abortiporus biennis
胞子
サイズ
薄壁
spore
size
thin_walled
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
4-sterigmate
Abortiporus biennis
担子器
数量
4胞子性
basidia
amount
4-spored
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
clavate
Abortiporus biennis
担子器
形状
先細/膨大
basidia
shape
tapering_or_swollen
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
clavate
Abortiporus biennis
担子器
形状
棍棒形
basidia
shape
clavate
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
hyaline
Abortiporus biennis
担子胞子
無色
basidiospore
color
hyaline
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
ovoid
Abortiporus biennis
担子胞子
形状
basidiospore
shape
oval
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
ellipsoid
Abortiporus biennis
担子胞子
形状
楕円
basidiospore
shape
ellipsoid
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
smooth
Abortiporus biennis
担子胞子
表面性状
平滑
basidiospore
surface
smooth
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
自動追加 (chlamydospore)
Abortiporus biennis
厚壁胞子
有無
chlamydospore
presence
present
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
自動追加 (clamp connection)
Abortiporus biennis
クランプ
有無
clamp connection
presence
present
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
cream
Abortiporus biennis
context
color
whitish_to_greyish_cream
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
buff
Abortiporus biennis
context
color
brownish
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
buff
Abortiporus biennis
context
color
yellow
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
cylindric
Abortiporus biennis
シスチジア
形状
円筒
cystidia
shape
cylindric
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
clavate
Abortiporus biennis
シスチジア
形状
棍棒形
cystidia
shape
clavate
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
encrusted
Abortiporus biennis
シスチジア
表面性状
結晶
cystidia
surface
crystal
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
cream (context)
Abortiporus biennis
子実体
fruitingbody
color
whitish_to_greyish_cream
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
brown (pileus)
Abortiporus biennis
子実体
fruitingbody
color
brownish
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
buff (context)
Abortiporus biennis
子実体
fruitingbody
color
yellow
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
annual
Abortiporus biennis
子実体
発達
一年生
fruitingbody
development
annual
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
tomentose (pileus)
Abortiporus biennis
子実体
表面性状
綿毛状
fruitingbody
surface
floccose_to_tomentose
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
fibrillose (pileus)
Abortiporus biennis
子実体
表面性状
繊維状
fruitingbody
surface
radially_fibrillose
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
corky (context)
Abortiporus biennis
子実体
質感
コルク質
fruitingbody
texture
corky
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
自動追加 (generative hyphae)
Abortiporus biennis
生殖菌糸
有無
generative hyphae
presence
present
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
trunk
Abortiporus biennis
生息環境
生息環境
habitat
habitat
wood
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
buff
Abortiporus biennis
子実層托
hymenophore
color
brownish
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
buff
Abortiporus biennis
子実層托
hymenophore
color
yellow
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
lacerate
Abortiporus biennis
子実層托
形状
歯牙
hymenophore
shape
odontioid
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
thick-walled
Abortiporus biennis
菌糸
サイズ
厚壁
hyphae
size
thick_walled
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
thin-walled
Abortiporus biennis
菌糸
サイズ
薄壁
hyphae
size
thin_walled
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
monomitic
Abortiporus biennis
菌糸構成
構造
1菌糸型
hyphal system
structure
monomitic
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
whitish
Abortiporus biennis
pileus
color
whitish_to_greyish_cream
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
brown
Abortiporus biennis
pileus
color
brownish
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
circular
Abortiporus biennis
形状
pileus
shape
globose_to_subglobose
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
sulcate
Abortiporus biennis
表面性状
条線
pileus
surface
striate
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
tomentose
Abortiporus biennis
表面性状
綿毛状
pileus
surface
floccose_to_tomentose
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
fibrillose
Abortiporus biennis
表面性状
繊維状
pileus
surface
radially_fibrillose
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
entire
Abortiporus biennis
孔口
形状
全縁
pore
shape
entire
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
lacerate
Abortiporus biennis
孔口
形状
歯牙状
pore
shape
dentate
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
angular
Abortiporus biennis
孔口
形状
角形
pore
shape
angular
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
hyaline
Abortiporus biennis
胞子
無色
spore
color
hyaline
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
ovoid
Abortiporus biennis
胞子
形状
spore
shape
oval
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
ellipsoid
Abortiporus biennis
胞子
形状
楕円
spore
shape
ellipsoid
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
smooth
Abortiporus biennis
胞子
表面性状
平滑
spore
surface
smooth
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
buff
Abortiporus biennis
stipe
color
brownish
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
buff
Abortiporus biennis
stipe
color
yellow
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=43855&Fields=All
tomentose
Abortiporus biennis
表面性状
綿毛状
stipe
surface
floccose_to_tomentose
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
hyaline
Abortiporus biennis
担子胞子
無色
basidiospore
color
hyaline
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
yellowish
Abortiporus biennis
担子胞子
basidiospore
color
yellow
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
ellipsoid
Abortiporus biennis
担子胞子
形状
楕円
basidiospore
shape
ellipsoid
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
globose
Abortiporus biennis
担子胞子
形状
basidiospore
shape
globose_to_subglobose
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
thin-walled
Abortiporus biennis
担子胞子
サイズ
薄壁
basidiospore
size
thin_walled
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
自動追加 (chlamydospore)
Abortiporus biennis
厚壁胞子
有無
chlamydospore
presence
present
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
自動追加 (clamp connection)
Abortiporus biennis
クランプ
有無
clamp connection
presence
present
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
white
Abortiporus biennis
context
color
whitish_to_greyish_cream
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
hyaline
Abortiporus biennis
シスチジア
無色
cystidia
color
hyaline
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
cylindrical
Abortiporus biennis
シスチジア
形状
円筒
cystidia
shape
cylindric
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
fusiform
Abortiporus biennis
シスチジア
形状
紡錘
cystidia
shape
fusiform
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
white (pileus)
Abortiporus biennis
子実体
fruitingbody
color
whitish_to_greyish_cream
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
brownish (pileus)
Abortiporus biennis
子実体
fruitingbody
color
brownish
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
yellowish (pileus)
Abortiporus biennis
子実体
fruitingbody
color
yellow
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
annual
Abortiporus biennis
子実体
発達
一年生
fruitingbody
development
annual
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
dimidiate
Abortiporus biennis
子実体
形状
傘状
fruitingbody
shape
pileate
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
infundibuliform
Abortiporus biennis
子実体
形状
漏斗
fruitingbody
shape
funnel_shaped
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
sessile
Abortiporus biennis
子実体
形状
無柄
fruitingbody
shape
sessile_to_subsessile
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
resupinate
Abortiporus biennis
子実体
形状
背着生
fruitingbody
shape
resupinate
http://www.mycobank.org/BioloMICS.aspx?Table=Taxa%20descriptions&Rec=7012&Fields=All
dry (pileus)
Abortiporus biennis
子実体
表面性状
乾性
fruitingbody
surface
dry
End of preview (truncated to 100 rows)
YAML Metadata Warning: "licenses" is deprecated. Use "license" instead.

fungi_trait_circus_database
大菌輪「Trait Circus」データセット(統制形質)
最終更新日:2022/5/2
====

Languages

Japanese and English

Please do not use this dataset for academic purposes for the time being. (casual use only)
当面の間仮公開とします。学術目的での使用はご遠慮ください。

概要

Atsushi Nakajima(中島淳志)が個人で運営しているWebサイト大菌輪 では、菌類の記載文を自然言語処理の手法を利用して半自動的に処理し、菌類の形態、生態などに関する様々な「形質 (traits)」データを抽出して、集計や解析の便宜を図るために、あらかじめ設定された「統制語 (controlled term)」の形でまとめています。
抽出手法については「ニッチェ・ライフ」誌のこちらの記事(査読なし)で報告しています。
自動抽出という性質上、ある程度の誤りが含まれる可能性があることをご承知おきください。

統制語は「要素 (element)」「属性(attribute)」「値(value)」の3つ組からなります。
例えば「傘_色_黒」はそれぞれ「傘」「色」「黒」の要素/属性/値を持っています。一部の統制語では要素と属性が同一となっています(「生息環境」など)
参考までに、データ数上位3件は「要素」で「子実体」「傘」「胞子」、「属性」で「色」「形状」「表面性状」、「値」で「褐」「平滑」「黄」です。

また、菌類分類学の学習および同定支援の目的で、そのデータを基にしたインタラクティブな可視化Webアプリ「Trait Circus」を提供しています。 本データセットは、そのWebアプリの生データに相当し、容量の都合等でWebアプリに反映されていない情報も含まれています。

関連データセット

「論文3行まとめ」
Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese
「識別形質まとめ」
Atsushi/fungi_diagnostic_chars_comparison_japanese

各カラムの説明

  • source … 各情報の出典のURLです。多くは学術文献またはMycoBankの記載文データベースを参照しています。
  • hit_term … 抽出された形質の出典中における表現です。
  • current_name … その形質を有する菌の現行学名です。MycoBankを参照していますが、最新の情報ではない可能性があります。
  • element_j … 「要素」の日本語表記です。
  • attribute_j … 「属性」の日本語表記です。
  • value_j … 「値」の日本語表記です。
  • element … 「要素」の英語表記です。
  • attribute … 「属性」の英語表記です。
  • value … 「値」の英語表記です。
Edit dataset card
Evaluate models HF Leaderboard