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- other
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- ja
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- cc-by-4.0
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- 100K<n<1M
fungi_diagnostic_chars_comparison_japanese
大菌輪「識別形質まとめ」データセット
最終更新日 / Last updated: 2024/9/28（R3-12108まで / up to R3-12108）
Languages
Japanese
This dataset is available in Japanese only.
概要 / Overview
Atsushi Nakajima（中島淳志）が個人で運営しているWebサイト大菌輪では、数千件以上の菌類分類学論文を「論文3行まとめ」という形で要約および索引付け（インデキシング）した情報を提供しています。その一環として、ある菌と別の菌の「共通する」あるいは「異なる」識別形質 (diagnostic characters) に関する記述を人手で抽出しています。
Daikinrin, a website personally operated by Atsushi Nakajima, provides summaries and indexing information for thousands of mycological taxonomy papers in the form of "Three-line Paper Summaries." As part of this process, descriptions of "common" or "different" diagnostic characters between fungi are manually extracted.
本データセットは、抽出された識別形質の一覧に、「色/color」、「形状/shape」などのカテゴリを半自動的に付与して集積したものです。
This dataset is a compilation of the extracted diagnostic characters, semi-automatically categorized with labels such as "color" and "shape."
「論文3行まとめ」は毎日更新していますが、本データセットの更新はおおむね1ヶ月に一度とする予定です。
While the "Three-line Paper Summaries" are updated daily, this dataset is planned to be updated approximately once a month.
関連データセット / Related Datasets
「論文3行まとめ」 / "Three-line Paper Summary"
Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese「Trait Circusデータセット」（統制形質） / "Trait Circus Dataset" (Controlled Traits)
Atsushi/fungi_trait_circus_database
各カラムの説明 / Column Descriptions
| カラム名 Column Name |
説明 Description |
|---|---|
| R3ID | 大菌輪「論文3行まとめ」のID ID for Daikinrin "Three-line Paper Summary" |
| No | 各識別文を一意のIDで区別するために、各R3IDにおいてナンバリングしたもの Numbering within each R3ID to uniquely identify each diagnostic sentence |
| comparison_source | 比較元の分類群（学名） Source taxon (scientific name) for comparison |
| comparison_target | 比較先の分類群（学名） Target taxon (scientific name) for comparison |
| sentence | 識別文（全て日本語） Diagnostic sentence (all in Japanese) |
| label | 半自動的に付与されたカテゴリ（人手で修正していますが、ダブルチェックは行っていないので誤分類もあると思います） Semi-automatically assigned category (manually corrected, but not double-checked, so there may be misclassifications) |
| common_or_different | 共通する形質は「1」、異なる形質は「0」 "1" for common traits, "0" for different traits |
| data_source | 各情報の出典（文献）のURL URL of the source (literature) for each piece of information |
ラベルのカテゴリ / Label Categories
- サイズ/size
- 分子系統解析/molecular_phylogenetic_analysis
- 形状/shape
- 色/color
- 地理的分布/geographical_distribution
- 生息環境/habitat
- 表面性状/surface_characteristics
- 構造/structure
- 有無/presence
- 形態全般/general_morphology
- 位置/position
- 二次代謝産物/secondary_metabolite
- 呈色反応/chemical_reaction
- 数量/amount
- 発達/development
- 生理学的形質/physiological_characters
- 分類/classification
- 資化・発酵能/assimilation_and_fermentation
- 質感/texture
- 味・臭い/taste_and_smell
- 病害・病原性関連/disease_and_pathogenecity
- 全般/general_characters
- 耐性・感受性/resistance_and_susceptibility
- 栄養摂取様式/nutrition_style
- 未分類/unclassified