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annotations_creators: |
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- other |
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languages: |
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- ja,en |
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licenses: |
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- cc-by-4.0 |
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source_datasets: |
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- original |
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size_categories: |
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- 100K<n<1M |
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fungi_trait_circus_database |
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大菌輪「Trait Circus」データセット |
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最終更新日:2022/2/23 |
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### Languages |
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Japanese and English |
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Please do not use this dataset for academic purposes for the time being. (casual use only) |
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当面の間仮公開とします。学術目的での使用はご遠慮ください。 |
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# 概要 |
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Atsushi Nakajima(中島淳志)が個人で運営しているWebサイト[大菌輪](http://mycoscouter.coolblog.jp/daikinrin/) では、菌類の記載文を自然言語処理の手法を利用して半自動的に処理し、菌類の形態、生態などに関する様々な「形質」データを抽出して、集計や解析の便宜を図るために、あらかじめ設定された「統制語 (controlled term)」の形でまとめています。 |
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抽出手法については「ニッチェ・ライフ」雑の[こちらの記事](https://media.niche-life.com/series/008/Niche008_06.pdf)(査読なし)で報告しています。 |
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統制語は「要素 (element)」「属性(attribute)」「値(value)」の3つ組からなります。 |
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例えば「傘_色_黒」はそれぞれ「傘」「色」「黒」の要素/属性/値を持っています。一部の統制語では要素と属性が同一となっています(「生息環境」など) |
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参考までに、データ数上位3件は「要素」で「子実体」「傘」「胞子」、「属性」で「色」「形状」「表面性状」、「値」で「褐」「平滑」「黄」です。 |
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また、菌類分類学の学習および同定支援の目的で、そのデータを基にしたインタラクティブな可視化Webアプリ「[Trait Circus](https://tinyurl.com/nrhcfksu)」を提供しています。 |
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本データセットは、そのWebアプリの生データに相当し、容量の都合等でWebアプリに反映されていない情報も含まれています。 |
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## 関連データセット |
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「論文3行まとめ」 |
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[Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese](https://huggingface.co/datasets/Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese) |
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「識別形質まとめ」 |
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[Atsushi/fungi_diagnostic_chars_comparison_japanese](https://huggingface.co/datasets/Atsushi/fungi_diagnostic_chars_comparison_japanese) |
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## 各カラムの説明 |
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* source … 各情報の出典のURLです。多くは学術文献またはMycoBankの記載文データベースを参照しています。 |
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* hit_term … 抽出された形質の出典中における表現です。 |
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* current_name … その形質を有する菌の現行学名です。MycoBankを参照していますが、最新の情報ではない可能性があります。 |
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* element_j … 「要素」の日本語表記です。 |
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* attribute_j … 「属性」の日本語表記です。 |
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* value_j … 「値」の日本語表記です。 |
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* element … 「要素」の英語表記です。 |
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* attribute … 「属性」の英語表記です。 |
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* value … 「値」の英語表記です。 |