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annotations_creators:
- other
languages:
- ja,en
licenses:
- cc-by-4.0
source_datasets:
- original
size_categories:
- 100K<n<1M
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fungi_trait_circus_database  
大菌輪「Trait Circus」データセット  
最終更新日：2022/2/23
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### Languages
Japanese and English 
  
Please do not use this dataset for academic purposes for the time being. (casual use only)  
当面の間仮公開とします。学術目的での使用はご遠慮ください。  
  
# 概要
  
Atsushi Nakajima（中島淳志）が個人で運営しているWebサイト[大菌輪](http://mycoscouter.coolblog.jp/daikinrin/) では、菌類の記載文を自然言語処理の手法を利用して半自動的に処理し、菌類の形態、生態などに関する様々な「形質」データを抽出して、集計や解析の便宜を図るために、あらかじめ設定された「統制語 (controlled term)」の形でまとめています。  
抽出手法については「ニッチェ・ライフ」雑の[こちらの記事](https://media.niche-life.com/series/008/Niche008_06.pdf)（査読なし）で報告しています。  
  
統制語は「要素 (element）」「属性（attribute）」「値（value）」の3つ組からなります。  
例えば「傘_色_黒」はそれぞれ「傘」「色」「黒」の要素/属性/値を持っています。一部の統制語では要素と属性が同一となっています（「生息環境」など）  
参考までに、データ数上位3件は「要素」で「子実体」「傘」「胞子」、「属性」で「色」「形状」「表面性状」、「値」で「褐」「平滑」「黄」です。      
  
また、菌類分類学の学習および同定支援の目的で、そのデータを基にしたインタラクティブな可視化Webアプリ「[Trait Circus](https://tinyurl.com/nrhcfksu)」を提供しています。
本データセットは、そのWebアプリの生データに相当し、容量の都合等でWebアプリに反映されていない情報も含まれています。 

## 関連データセット 
「論文3行まとめ」  
[Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese](https://huggingface.co/datasets/Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese)   
「識別形質まとめ」  
[Atsushi/fungi_diagnostic_chars_comparison_japanese](https://huggingface.co/datasets/Atsushi/fungi_diagnostic_chars_comparison_japanese)     
  
## 各カラムの説明
  
* source … 各情報の出典のURLです。多くは学術文献またはMycoBankの記載文データベースを参照しています。
* hit_term … 抽出された形質の出典中における表現です。
* current_name … その形質を有する菌の現行学名です。MycoBankを参照していますが、最新の情報ではない可能性があります。
* element_j … 「要素」の日本語表記です。
* attribute_j … 「属性」の日本語表記です。
* value_j … 「値」の日本語表記です。
* element … 「要素」の英語表記です。
* attribute … 「属性」の英語表記です。
* value … 「値」の英語表記です。