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+ annotations_creators:
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+ - other
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+ languages:
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+ - ja,en
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+ licenses:
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+ - cc-by-4.0
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+ source_datasets:
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+ - original
10
+ size_categories:
11
+ - 100K<n<1M
12
+ ---
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+ fungi_trait_circus_database
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+ 大菌輪「Trait Circus」データセット
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+ 最終更新日:2022/2/23
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+ ====
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+ ### Languages
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+ Japanese and English
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+
20
+ Please do not use this dataset for academic purposes for the time being. (casual use only)
21
+ 当面の間仮公開とします。学術目的での使用はご遠慮ください。
22
+
23
+ # 概要
24
+
25
+ Atsushi Nakajima(中島淳志)が個人で運営しているWebサイト[大菌輪](http://mycoscouter.coolblog.jp/daikinrin/) では、菌類の記載文を自然言語処理の手法を利用して半自動的に処理し、菌類の形態、生態などに関する様々な「形質」データを抽出して、集計や解析の便宜を図るために、あらかじめ設定された「統制語 (controlled term)」の形でまとめています。
26
+ 抽出手法については「ニッチェ・ライフ」雑の[こちらの記事](https://media.niche-life.com/series/008/Niche008_06.pdf)(査読なし)で報告しています。
27
+
28
+ 統制語は「要素 (element)」「属性(attribute)」「値(value)」の3つ組からなります。
29
+ 例えば「傘_色_黒」はそれぞれ「傘」「色」「黒」の要素/属性/値を持っています。一部の統制語では要素と属性が同一となっています(「生息環境」など)
30
+ 参考までに、データ数上位3件は「要素」で「子実体」「傘」「胞子」、「属性」で「色」「形状」「表面性状」、「値」で「褐」「平滑」「黄」です。
31
+
32
+ また、菌類分類学の学習および同定支援の目的で、そのデータを基にしたインタラクティブな可視化Webアプリ「[Trait Circus](https://tinyurl.com/nrhcfksu)」を提供しています。
33
+ 本データセットは、そのWebアプリの生データに相当し、容量の都合等でWebアプリに反映されていない情報も含まれています。
34
+
35
+ ## 関連データセット
36
+ 「論文3行まとめ」
37
+ [Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese](https://huggingface.co/datasets/Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese)
38
+ 「識別形質まとめ」
39
+ [Atsushi/fungi_diagnostic_chars_comparison_japanese](https://huggingface.co/datasets/Atsushi/fungi_diagnostic_chars_comparison_japanese)
40
+
41
+ ## 各カラムの説明
42
+
43
+ * source … 各情報の出典のURLです。多くは学術文献またはMycoBankの記載文データベースを参照しています。
44
+ * hit_term … 抽出された形質の出典中における表現です。
45
+ * current_name … その形質を有する菌の現行学名です。MycoBankを参照していますが、最新の情報ではない可能性があります。
46
+ * element_j … 「要素」の日本語表記です。
47
+ * attribute_j … 「属性」の日本語表記です。
48
+ * value_j … 「値」の日本語表記です。
49
+ * element … 「要素」の英語表記です。
50
+ * attribute … 「属性」の英語表記です。
51
+ * value … 「値」の英語表記です。