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  - cc-by-4.0
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  - multi-class-classification
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  - 100K<n<1M

fungi_diagnostic_chars_comparison_japanese
大菌輪「識別形質まとめ」データセット
最終更新日:2022/9/19(R3-09891まで)
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Languages

Japanese

This dataset is available in Japanese only.

概要

Atsushi Nakajima(中島淳志)が個人で運営しているWebサイト大菌輪 では、数千件以上の菌類分類学論文を「論文3行まとめ」という形で要約および索引付け(インデキシング)した情報を提供しています。
その一環として、ある菌と別の菌の「共通する」あるいは「異なる」識別形質 (diagnostic characters) に関する記述を人手で抽出しています。
本データセットは、抽出された識別形質の一覧に、「色/color」、「形状/shape」などのカテゴリを半自動的に付与して集積したものです。
「論文3行まとめ」は毎日更新していますが、本データセットの更新はおおむね1ヶ月に一度とする予定です。

関連データセット

「論文3行まとめ」
Atsushi/fungi_indexed_mycological_papers_japanese
「Trait Circusデータセット」(統制形質) Atsushi/fungi_trait_circus_database

各カラムの説明

  • R3ID … 大菌輪「論文3行まとめ」のIDです。
  • No … 各識別文を一意のIDで区別するために、各R3IDにおいてナンバリングしたものです。
  • comparison_source … 比較元の分類群(学名)です。
  • comparison_target … 比較先の分類群(学名)です。
  • sentence … 識別文です。全て日本語です。
  • label …半自動的に付与されたカテゴリです(人手で修正していますが、ダブルチェックは行っていないので誤分類もあると思います)。以下の25のカテゴリが存在します。
    • サイズ/size
    • 分子系統解析/molecular_phylogenetic_analysis
    • 形状/shape
    • 色/color
    • 地理的分布/geographical_distribution
    • 生息環境/habitat
    • 表面性状/surface_characteristics
    • 構造/structure
    • 有無/presence
    • 形態全般/general_morphology
    • 位置/position
    • 二次代謝産物/secondary_metabolite
    • 呈色反応/chemical_reaction
    • 数量/amount
    • 発達/development
    • 生理学的形質/physiological_characters
    • 分類/classification
    • 資化・発酵能/assimilation_and_fermentation
    • 質感/texture
    • 味・臭い/taste_and_smell
    • 病害・病原性関連/disease_and_pathogenecity
    • 全般/general_characters
    • 耐性・感受性/resistance_and_susceptibility
    • 栄養摂取様式/nutrition_style
    • 未分類/unclassified
  • common_or_different … 共通する形質は「1」、異なる形質は「0」です。
  • data_source … 各情報の 出典(文献)のURLです。