processor/processor_config.json

{
  "single_size": 384,
  "token_feature_size": 449,
  "atom_feature_size": 385,
  "residue_vocabulary": [
    "ALA",
    "ARG",
    "ASN",
    "ASP",
    "CYS",
    "GLN",
    "GLU",
    "GLY",
    "HIS",
    "ILE",
    "LEU",
    "LYS",
    "MET",
    "PHE",
    "PRO",
    "SER",
    "THR",
    "TRP",
    "TYR",
    "VAL",
    "UNK",
    "A",
    "G",
    "C",
    "U",
    "N",
    "DA",
    "DG",
    "DC",
    "DT",
    "DN",
    "GAP"
  ],
  "element_vocabulary": [
    "H",
    "HE",
    "LI",
    "BE",
    "B",
    "C",
    "N",
    "O",
    "F",
    "NE",
    "NA",
    "MG",
    "AL",
    "SI",
    "P",
    "S",
    "CL",
    "AR",
    "K",
    "CA",
    "SC",
    "TI",
    "V",
    "CR",
    "MN",
    "FE",
    "CO",
    "NI",
    "CU",
    "ZN",
    "GA",
    "GE",
    "AS",
    "SE",
    "BR",
    "KR",
    "RB",
    "SR",
    "Y",
    "ZR",
    "NB",
    "MO",
    "TC",
    "RU",
    "RH",
    "PD",
    "AG",
    "CD",
    "IN",
    "SN",
    "SB",
    "TE",
    "I",
    "XE",
    "CS",
    "BA",
    "LA",
    "CE",
    "PR",
    "ND",
    "PM",
    "SM",
    "EU",
    "GD",
    "TB",
    "DY",
    "HO",
    "ER",
    "TM",
    "YB",
    "LU",
    "HF",
    "TA",
    "W",
    "RE",
    "OS",
    "IR",
    "PT",
    "AU",
    "HG",
    "TL",
    "PB",
    "BI",
    "PO",
    "AT",
    "RN",
    "FR",
    "RA",
    "AC",
    "TH",
    "PA",
    "U",
    "NP",
    "PU",
    "AM",
    "CM",
    "BK",
    "CF",
    "ES",
    "FM",
    "MD",
    "NO",
    "LR",
    "RF",
    "DB",
    "SG",
    "BH",
    "HS",
    "MT",
    "DS",
    "RG",
    "CN",
    "NH",
    "FL",
    "MC",
    "LV",
    "TS",
    "OG"
  ],
  "element_channels": 128,
  "atom_name_characters_count": 4,
  "atom_name_character_channels": 64,
  "reference_conformer_augment": false,
  "augment_seed": null,
  "ligand_atom_rename": false,
  "materialize_missing_atoms": false
}