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Q708S6
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O23507
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P33527
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Q9NPI9
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Q708S8
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Q944M5
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O93295
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Q9SD53
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Q80ZI2
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Q14524
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Q14246
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Q9TV66
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Q8GWJ6
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Q8L8Z1
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Q949G3
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P04775
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P11234
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P08953
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Q8R4G0
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Q9LYU7
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LLLLLLLLLLLTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTLLLLLEEEELLTTLLHHHHHHHHHSLLEEEEEETTEEEEEEELTTSLEEEEEEELLGGGSSLTTSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLTTBLLEEEEEEETTEEEEEEELLTTEEHHHHHHHHHTTSSLLLHHHHHHHHHHHHHHHHIIIIISSSLLLLSLLSGGGEEELTTLLEEELSTTGGGTSLLTTLLLLTTSLHHHHHHLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLTTSLSLSSLTTLLLHHHHHHHHHHHTLGGGGSLTTSLLSHHHHHHHHHHHHHHHHHTLSSGGGSLLHHHHHHHHHHHTTL
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Q2EG98
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LLSLLSSSSSSSSSSTTTSSBBSLLLLLLLLLBLSSEEEEEEEEEELHHHHHHHHHHTTEEELBTTLHHHHHHHHHHLLTTLEEELBLLLLLTTSLLLSLLLSLLLSLSLLLTTEEEEEEEETTEEEEEEEETTSLEEEEEEEELLSLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLSLLLLLLLLLLSSLLLLLLLLLLLSLLSLLSSSLLLLLLLLLLEEEEBLLLLLLLLLLLLLLLLLBLLBLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLBLLLLLLLLLLLLBLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLSSSLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLBLLLLLLLBLLLLLLLLLLLLLLLBLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLSSSLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLBLLLLLSLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLSLLLLLLLLLLLLLLLLLLLSSSLSSLLLLLBLLLBLLLLLLLLLBLLLLLLLLLLLLLLLLLLLEELLLLLLLLLBBBLLLLLLLLLLLLLLLLLLLBLLLLLBLLLLLLLLLLLLLEELLLLLLLLLLLLLLLLSLLBLLLLLLLLLLLEELLLLLLLLSSLLLLLLLTTHHHHHHHHHHHHHHHTSLLLLLLLLLLSLLLLLLLLLLLSSLLLLLSLLLLLSSTTTHHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHTTTSLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTLLLSSLEEEELSSEEEEEEEELGGGGGGLEEEELTTSLEEEELLLTTTTHHHHHHLSSEEEEEEEESSLSLLLSSLLLBLSLEEEEEEELSSSEELLLSLSSLEEEEEELLTTSLLLLEEEEELSSEEEEEEEELLTTSEEEEEEEESSLLLEEEEEEESSLLLTTLLSEEEELLTTLLLLTTLLEEEEELGGGLTTLSEEEEEEEEELLLSSLLLLLLEEEEEEEEEEEEEEEETTTTEEELTTEEELTTLLSSEEEEEESSLSEEEEEEEEELLLLTHHHHTHHHHSGGGLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTLEEEELTTLLTTLLEEEEEEEEELSSTTLSLLSLEEEEEEETTEELLLEEELLTTSLLSLTTLEEEEEEEESSLLLSEEEEEEEELLLSSLLLEEEEEEEEEETTTLLEEEEEEEEEEBSTTSSLBSEEEELLLLHHHHTLHHHHHHHHHHHHHHHTLHHHHHHSLLTTLSSLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSLSLLLLLLLBSSBBLLBHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLLLLSSLLSLLLLSLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLGGGTSSLLSLLLLSLLHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSLLLLLSBSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSLSLSLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSLLSSLLLLLEEELLLSLLLSLLSLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSLHHHHHHHHHHHHHHHHHIIIIIHHHHHHHHHHHHHHHGGGLGGGGSSHHHHHHHHHHHHTTSLLLLLLLLLTTLTTSSLLLLLLLLLLLSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTLLTHHHHHHHHHHHHHSTTTTTLLSHHHHHHHIIIIIHHHHHLSSSLTTSSSSEEEEEEEEEEEEELLGGGLLSLLSLSLLSSLLLLLLLLLLLLTTSLLLLTTLLSSLGGGLEELHHHHTSLLEELSSLEELSLEEEEELLSSHHHHHHHHHHHHHTTLSLTTEEEEEEEEEEEETTTTEEEEEEEEEEELTTSLEEEEEEEEEEELTTSLTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTHHHHSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLTTSLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTLTTTTTTTTTTTSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTLGGGSSHHHHHHHHHHHHTTLSLLHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTEEEESSHHHHHHHHHHHSLLLLLLLLLSSLLLLLLLLLSLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLL
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Q9JKB0
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DDPPPPPPPPPPPPPCPVQNVQVVALFPLSNLLPPPDPPDPSNVVSVVVSVVLVVVLVVVLVVLVVCQVVAQWDKDKDWDFDQKDQFWKKKKFFLQQFFQVQQALLCCVFCVVVVVNPPPVDPVVDPVLDDPVLVVVSVVSPPCVVPDHDDDDPLVCLVRGGDQCQQWFPFKDALNHGDDSVQWDWAQDPSGTMTMHQLPPPVDDGDMFRDFDFSNGMKTKTFSPCVRHRSRDDPDPPSPPAGFMWMATHHSQADDPRVPRTDTDHAQKEKEKAKAKEKEAADPPPSGFADAPDCPDPAPFGSDDDLRSLQLSQLQVQCCVFLVAGDSNGDDDGHHDGSVSCPPPSVVSVVVCVVVVVPRRDRGHHRIDMDMDIDMDMDRCDDVVSLVVVCVVVVHDSVSNNHGMYMYIYTHNRNIHMYTHIDGPDDPVRSCCVSVVSVCCSSVVSNVVVVVVVVVVVVVVVVVVCVPPCVVVVVVVCVVPPPVPPPPPPVVPDPPPPDPPDDPDDDDDPPPPPPPPPPPPPPPDPPD
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DLVVVLVVLVVVLVVQVVVPDVVSSVVSVVVSVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVPPPPPPDDD
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P43286
MAKDVEAVPGEGFQTRDYQDPPPAPFIDGAELKKWSFYRAVIAEFVATLLFLYITVLTVIGYKIQSDTDAGGVDCGGVGILGIAWAFGGMIFILVYCTAGISGGHINPAVTFGLFLARKVSLPRALLYIIAQCLGAICGVGFVKAFQSSYYTRYGGGANSLADGYSTGTGLAAEIIGTFVLVYTVFSATDPKRSARDSHVPVLAPLPIGFAVFMVHLATIPITGTGINPARSFGAAVIYNKSKPWDDHWIFWVGPFIGAAIAAFYHQFVLRASGSKSLGSFRSAANV
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P28566
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P28565
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DDDPPPPPVDDPPPVVPPVVPVPPPDDPVVLLVVLVVVLVVLVVLLVLLLVLLVLLLVLCVVDPVNPFLLSVLVNLLSVLLNQCSPLQSVVVSVCSNPVFPPVDPVSLLVNQLSVLLSLLLNLLSLLVSLVLLLCCLPPVPVSVVPGDNVVSVVSSVVSNVVSNVQSVVLSVVCVVVPPPPDRHSPDDLVCLVVLCSSCCVRPVVSLVSSVVSLVSSVVSLVCCVVCVPPPPPPPPVCCCVVCVVPDDDPPPDDPPDDDDDPPDDPDPVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVSVLSVLVSVLSVVLSVLQCVLQVQLVVCSVVCNVCVPNDPPDPVSNVVSVVSNSSSSSVSSVSCCVRPPSNVVSVVCVVCVVVVD
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P22739
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P30530
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P63138
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P51172
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Q8L7E9
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O08603
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M

DeepLocBinary Dataset with ESMFold Structural Sequence

  • Description: Protein localization encompasses the processes that establish and maintain proteins at specific locations.
  • Number of labels: 2
  • Problem Type: single_label_classification
  • Columns:
    • aa_seq: protein amino acid sequence
    • foldseek_seq: foldseek 20 3di structural sequence
    • ss8_seq: DSSP 8 secondary structure sequence
    • location: On the membrane or not

Github

Simple, Efficient and Scalable Structure-aware Adapter Boosts Protein Language Models

https://github.com/tyang816/SES-Adapter

Citation

Please cite our work if you use our dataset.

@article{tan2024ses-adapter,
  title={Simple, Efficient and Scalable Structure-aware Adapter Boosts Protein Language Models},
  author={Tan, Yang and Li, Mingchen and Zhou, Bingxin and Zhong, Bozitao and Zheng, Lirong and Tan, Pan and Zhou, Ziyi and Yu, Huiqun and Fan, Guisheng and Hong, Liang},
  journal={arXiv preprint arXiv:2404.14850},
  year={2024}
}
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