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Q24210
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Q5QGZ9
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Q03770
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Q8NCG7
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Q14246
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Q9TV66
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Q8GWJ6
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Q8L8Z1
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DVVVVVVVVVVVVVVVVVVVLVVLLVVLLVLLVLLLVLLVLLLVLQQPQKDWDFDFDDPDPPDGTDTDIDMDHLVVDPLSVLLNVLSVVSNVLSVVVSVVSVPPPSDDDPVNLVVNLVVLVVSLVSLVVSLVSLVVVLVCLCPPDVVVPSDNNCVGRVSSSVSSVVSSVSSVVSSVSSVVSSVSSVVPDD
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Q949G3
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LLLLLGGGGSLLLTTSHHHHTTTSTTTSSSSSTTLLSSLLLSLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHSLHHHHTTEEEEELTTSLEEEEEGGGLLHHHHHHHHHHHLSSHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTLLLLLLLEEEEEEEEEEEELBGGGGSLLHHHHHHHHHHHHHHHTTSSLLLLEEEEEEEEEEEEELTTSEEEEELLTTSSHHHHHHHHTTLLLTTSEEEEEEEETTEETTSSLHHHHEEEELSSLLLLTTSBHHHHHHHHHHHHLLTTHHHHHHHHHHHHHHTTLLLLHHHHHHHHHHHSTTTHHHHHHHHHHHHTTLSTTTTSBLLLSSSLLLLHHHHHHHHHHHHHTSLLSEEEELSTTTTLLHHHHHHHHHHHHHHHHHTTLEEEEELSSLLHHHHTTLSEEEEEETTEEEEEEEGGGHHHHHHHTTBLLLTTSLHHHHHHHTTLTTTGGGGBLLTTSLLLLLLHHHHHHHHHHSHHHHHHHHHHHSLLLGGGSLTTTSLLLSSSSLHHHHHHHHHHHHHHHHHHTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSLGGGLLLSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHGGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSLHHHHHHHHHHTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLSHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSSSLGGGSLGGGHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHTSGGGLLLLTTLSSLHHHHHHHHTTLLLLTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLSLLLLLLBLTHHHHHHHSLLLLLLLLLLLLLLLSLLLLLLSSLLLLLLEEEEEEEEEEELLHHHHHTTLLLSEEEEEEEEEEEELTTLEEEEEESTTSSHHHHHHHHHTLLLSSEEEEEEEETTEELLHHHHHHHEEEELSSLLLLTTSBHHHHHHHHHHHHSLTTSLHHHHHHHHHHHHHHTTLGGGTTLBLLLTTTSSSLHHHHHHHHHHHHHTTLLSEEEESSTTTTLLHHHHHHHHHHHHHHHHTTLEEEEELSSLLHHHHHTLSEEEEEETTTEEEEEEELLGGGHHHHHHHHTSTTLLLLLTTLLHHHHHHHHTSHHHHHHHTLLHHHHHHHSHHHHHHHHHHHHHTSLLTTLLLLLLSSSSSSLHHHHHHHHHHHHHHHHHTLTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTLTTLLSSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSSLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSSSHHHHHHHHHHHHHHHHHTSSSSSLGGGSLGGGHHHHHHLHHHHHHHHHHHHHHTTLLLBLSSSSSBHHHHIIIIILLLGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLL
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Q9C6K9
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Q70Z44
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DPPPDDDDDPPPPPDPPPPDPDQLDADEQQQDQLDQPDRDPVSCQVQLVCQVDDQDNDLPAFWEKAWAWEWEDFDDDLDQKIKTWTKIKIKTFHRNDAYDCVSSNNDFKDKDFCNSHHDAPKDKPQFPDDWDHRFIWMDGGRMIITITITIGIWGFPDPDDPPDFTWIDKGKMKHWPDGDYDYDYDYDYDDPPFKDWPDKDKDWDWDDDPNTIMIMIIITTGMHGPPPPPPVVVVLVVVLVVLLVQLLCLLPDDLVVVCSLVSLVVSLVVLVVSVVVCVVVHSPPPPPDDPPDDPPPPPPRDPCLVVVLSVLSSVLSVVSSVLSVVLNVLLVCLLVPLDDDDVVLVVLLCCLVVDDDDDDDDDPDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDDPDPPVVVVVVVVVVVVVVVSSVVSSVSSVSSSVSSSVVVSVVSVVSVVVSVVVSVVVSVD
LLLLLLLSLLLLLLLLLLLLLLLLLLLBLLLTTEETTEELGGGGHHHHTTTTSLSLSSTTSLLLBLLEEEEEEEEELSSSEEEEEEEEEEEEELTTLBLLTTTTTTLLEEEEEGGGSLLLLLEETTBLSLLLSSLEEEEETTEEEEEEEEEEEEEBLLLLLSSSLLBBLLEEEEEESSSLLLLLLLLLBLLLSSEEEEEEEEEEEEEEETTEEEEEEEEEEEEEELLLLTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSLGGGSLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSLLLLLLSLLLSLLTTSLTTSSLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLHHHHHHHHHHHHSLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLTTTHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHL
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Q9LFB8
MEDDKDIYTKDGTLDIHKKPANKNKTGTWKACRFILGTECCERLAYYGMSTNLINYLEKQMNMENVSASKSVSNWSGTCYATPLIGAFIADAYLGRYWTIASFVVIYIAGMTLLTISASVPGLTPTCSGETCHATAGQTAITFIALYLIALGTGGIKPCVSSFGADQFDDTDEKEKESKSSFFNWFYFVINVGAMIASSVLVWIQMNVGWGWGLGVPTVAMAIAVVFFFAGSNFYRLQKPGGSPLTRMLQVIVASCRKSKVKIPEDESLLYENQDAESSIIGSRKLEHTKILTFFDKAAVETESDNKGAAKSSSWKLCTVTQVEELKALIRLLPIWATGIVFASVYSQMGTVFVLQGNTLDQHMGPNFKIPSASLSLFDTLSVLFWAPVYDKLIVPFARKYTGHERGFTQLQRIGIGLVISIFSMVSAGILEVARLNYVQTHNLYNEETIPMTIFWQVPQYFLVGCAEVFTFIGQLEFFYDQAPDAMRSLCSALSLTAIAFGNYLSTFLVTLVTKVTRSGGRPGWIAKNLNNGHLDYFFWLLAGLSFLNFLVYLWIAKWYTYKKTTGHAL
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Q9UGT4
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P04775
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P11234
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P78348
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P43287
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P43286
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Q63344
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Q969I6
MDPMELRNVNIEPDDESSSGESAPDSYIGIGNSEKAAMSSQFANEDTESQKFLTNGFLGKKKLADYADEHHPGTTSFGMSSFNLSNAIMGSGILGLSYAMANTGIILFIIMLLAVAILSLYSVHLLLKTAKEGGSLIYEKLGEKAFGWPGKIGAFVSITMQNIGAMSSYLFIIKYELPEVIRAFMGLEENTGEWYLNGNYLIIFVSVGIILPLSLLKNLGYLGYTSGFSLTCMVFFVSVVIYKKFQIPCPLPVLDHSVGNLSFNNTLPMHVVMLPNNSESSDVNFMMDYTHRNPAGLDENQAKGSLHDSGVEYEAHSDDKCEPKYFVFNSRTAYAIPILVFAFVCHPEVLPIYSELKDRSRRKMQTVSNISITGMLVMYLLAALFGYLTFYGEVEDELLHAYSKVYTLDIPLLMVRLAVLVAVTLTVPIVLFPIRTSVITLLFPKRPFSWIRHFLIAAVLIALNNVLVILVPTIKYIFGFIGASSATMLIFILPAVFYLKLVKKETFRSPQKVGALIFLVVGIFFMIGSMALIIIDWIYDPPNSKHH
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0
M

DeepLocBinary Dataset with AlphaFold2 Structural Sequence

  • Description: Protein localization encompasses the processes that establish and maintain proteins at specific locations.
  • Number of labels: 2
  • Problem Type: single_label_classification
  • Columns:
    • aa_seq: protein amino acid sequence
    • foldseek_seq: foldseek 20 3di structural sequence
    • ss8_seq: DSSP 8 secondary structure sequence
    • location: On the membrane or not

Github

Simple, Efficient and Scalable Structure-aware Adapter Boosts Protein Language Models

https://github.com/tyang816/SES-Adapter

Citation

Please cite our work if you use our dataset.

@article{tan2024ses-adapter,
  title={Simple, Efficient and Scalable Structure-aware Adapter Boosts Protein Language Models},
  author={Tan, Yang and Li, Mingchen and Zhou, Bingxin and Zhong, Bozitao and Zheng, Lirong and Tan, Pan and Zhou, Ziyi and Yu, Huiqun and Fan, Guisheng and Hong, Liang},
  journal={arXiv preprint arXiv:2404.14850},
  year={2024}
}
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