Datasets:

Task Categories: token-classification
Languages: en
Multilinguality: monolingual
Size Categories: 1K<n<10K
Licenses: unknown
Language Creators: expert-generated
Annotations Creators: expert-generated
Source Datasets: original
Dataset Preview Go to dataset viewer
id (string)tokens (json)ner_tags (json)
0
[ "Methanoregula", "formicica", "sp", ".", "nov", ".", ",", "a", "methane", "-", "producing", "archaeon", "isolated", "from", "methanogenic", "sludge", "." ]
[ 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
1
[ "A", "novel", "methane", "-", "producing", "archaeon", ",", "strain", "SMSP", "(", "T", ")", ",", "was", "isolated", "from", "an", "anaerobic", ",", "propionate", "-", "degrading", "enrichment", "culture", "that", "was", "originally", "obtained", "from", "granular", "sludge", "in", "a", "mesophilic", "upflow", "anaerobic", "sludge", "blanket", "(", "UASB", ")", "reactor", "used", "to", "treat", "a", "beer", "brewery", "effluent", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
2
[ "Cells", "were", "non", "-", "motile", ",", "blunt", "-", "ended", ",", "straight", "rods", ",", "1", ".", "0", "-", "2", ".", "6", "mum", "long", "by", "0", ".", "5", "mum", "wide", ";", "cells", "were", "sometimes", "up", "to", "7", "mum", "long", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
3
[ "Asymmetrical", "cell", "division", "was", "observed", "in", "rod", "-", "shaped", "cells", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
4
[ "Coccoid", "cells", "(", "0", ".", "5", "-", "1", ".", "0", "mum", "in", "diameter", ")", "were", "also", "observed", "in", "mid", "-", "to", "late", "-", "exponential", "phase", "cultures", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
5
[ "Growth", "was", "observed", "between", "10", "and", "40", "^", "0C", "(", "optimum", ",", "30", "-", "33", "^", "0C", ")", "and", "pH", "7", ".", "0", "and", "7", ".", "6", "(", "optimum", ",", "pH", "7", ".", "4", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
6
[ "The", "G", "+", "C", "content", "of", "the", "genomic", "DNA", "was", "56", ".", "2", "mol", "%", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
7
[ "The", "strain", "utilized", "formate", "and", "hydrogen", "for", "growth", "and", "methane", "production", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
8
[ "Based", "on", "comparative", "sequence", "analyses", "of", "the", "16S", "rRNA", "and", "mcrA", "(", "encoding", "the", "alpha", "subunit", "of", "methyl", "-", "coenzyme", "M", "reductase", ",", "a", "key", "enzyme", "in", "the", "methane", "-", "producing", "pathway", ")", "genes", ",", "strain", "SMSP", "(", "T", ")", "was", "affiliated", "with", "group", "E1", "/", "E2", "within", "the", "order", "Methanomicrobiales", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
9
[ "The", "closest", "relative", "based", "on", "both", "16S", "rRNA", "and", "mcrA", "gene", "sequences", "was", "Methanoregula", "boonei", "6A8", "(", "T", ")", "(", "96", ".", "3", "%", "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "similarity", ",", "85", ".", "4", "%", "deduced", "McrA", "amino", "acid", "sequence", "similarity", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
10
[ "The", "percentage", "of", "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "similarity", "indicates", "that", "strain", "SMSP", "(", "T", ")", "and", "Methanoregula", "boonei", "6A8", "(", "T", ")", "represent", "different", "species", "within", "the", "same", "genus", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
11
[ "This", "is", "supported", "by", "our", "findings", "of", "shared", "phenotypic", "properties", ",", "including", "cell", "morphology", "and", "growth", "temperature", "range", ",", "and", "phenotypic", "differences", "in", "substrate", "usage", "and", "pH", "range", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
12
[ "Based", "on", "these", "genetic", "and", "phenotypic", "properties", ",", "we", "propose", "that", "strain", "SMSP", "(", "T", ")", "represents", "a", "novel", "species", "of", "the", "genus", "Methanoregula", ",", "for", "which", "we", "propose", "the", "name", "Methanoregula", "formicica", "sp", ".", "nov", ".", ",", "with", "the", "type", "strain", "SMSP", "(", "T", ")", "(", "=", "NBRC", "105244", "(", "T", ")", "=", "DSM", "22288", "(", "T", ")", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
13
[ "Characterizing", "the", "role", "of", "the", "microtubule", "binding", "protein", "Bim1", "in", "Cryptococcus", "neoformans", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0 ]
14
[ "During", "sexual", "development", "the", "human", "fungal", "pathogen", "Cryptococcus", "neoformans", "undergoes", "a", "developmental", "transition", "from", "yeast", "-", "form", "growth", "to", "filamentous", "growth", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
15
[ "This", "transition", "requires", "cellular", "restructuring", "to", "form", "a", "filamentous", "dikaryon", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
16
[ "Dikaryotic", "growth", "also", "requires", "tightly", "controlled", "nuclear", "migration", "to", "ensure", "faithful", "replication", "and", "dissemination", "of", "genetic", "material", "to", "spore", "progeny", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
17
[ "Although", "the", "gross", "morphological", "changes", "that", "take", "place", "during", "dikaryotic", "growth", "are", "largely", "known", ",", "the", "molecular", "underpinnings", "that", "control", "this", "process", "are", "uncharacterized", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
18
[ "Here", "we", "identify", "and", "characterize", "a", "C", ".", "neoformans", "homolog", "of", "the", "Saccharomyces", "cerevisiae", "BIM1", "gene", ",", "and", "establish", "the", "importance", "of", "BIM1", "for", "proper", "filamentous", "growth", "of", "C", ".", "neoformans", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0 ]
19
[ "Deletion", "of", "BIM1", "leads", "to", "truncated", "sexual", "development", "filaments", ",", "a", "severe", "defect", "in", "diploid", "formation", ",", "and", "a", "block", "in", "monokaryotic", "fruiting", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
20
[ "Our", "findings", "lead", "to", "a", "model", "consistent", "with", "a", "critical", "role", "for", "BIM1", "in", "both", "filament", "integrity", "and", "nuclear", "congression", "that", "is", "mediated", "through", "the", "microtubule", "cytoskeleton", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
21
[ "Serinicoccus", "profundi", "sp", ".", "nov", ".", ",", "an", "actinomycete", "isolated", "from", "deep", "-", "sea", "sediment", ",", "and", "emended", "description", "of", "the", "genus", "Serinicoccus", "." ]
[ 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
22
[ "A", "Gram", "-", "reaction", "-", "positive", "bacterial", "strain", "of", "the", "genus", "Serinicoccus", ",", "designated", "MCCC", "1A05965", "(", "T", ")", ",", "was", "isolated", "from", "a", "deep", "-", "sea", "(", "5368", "m", ")", "sediment", "of", "the", "Indian", "Ocean", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
23
[ "Comparison", "of", "16S", "rRNA", "gene", "sequences", "revealed", "that", "the", "isolate", "shared", "97", ".", "6", "%", "sequence", "similarity", "with", "Serinicoccus", "marinus", "JC1078", "(", "T", ")", ",", "the", "type", "strain", "of", "the", "only", "described", "species", "of", "the", "genus", "Serinicoccus", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
24
[ "The", "DNA", "-", "DNA", "relatedness", "between", "these", "two", "strains", "was", "46", ".", "2", "%", "(", "standard", "deviation", "1", ".", "86", "%", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
25
[ "The", "cell", "wall", "contained", "alanine", ",", "glycine", ",", "serine", ",", "l", "-", "ornithine", "and", "glutamic", "acid", ",", "which", "corresponds", "to", "the", "description", "of", "the", "genus", "Serinicoccus", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
26
[ "The", "acyl", "type", "of", "the", "glycan", "chain", "of", "the", "peptidoglycan", "was", "glycolyl", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
27
[ "Other", "characteristics", "of", "strain", "MCCC", "1A05965", "(", "T", ")", "were", "consistent", "with", "those", "of", "the", "genus", "Serinicoccus", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
28
[ "Cells", "were", "coccoid", ",", "moderately", "halophilic", ",", "oxidase", "-", "negative", ",", "catalase", "-", "positive", "and", "non", "-", "spore", "-", "forming", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
29
[ "The", "major", "menaquinone", "was", "MK", "-", "8", "(", "H", "(", "4", ")", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
30
[ "The", "predominant", "cellular", "fatty", "acids", "were", "iso", "-", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "(", "34", ".", "7", "%", ")", "and", "iso", "-", "C", "(", "16", ":", "0", ")", "(", "17", ".", "0", "%", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
31
[ "The", "polar", "lipids", "were", "phosphatidylglycerol", ",", "diphosphatidylglycerol", ",", "phosphatidylcholine", ",", "phosphatidylinositol", "and", "an", "unknown", "glycolipid", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
32
[ "The", "DNA", "G", "+", "C", "content", "was", "72", "mol", "%", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
33
[ "Strain", "MCCC", "1A05965", "(", "T", ")", "(", "=", "0714S6", "-", "1", "(", "T", ")", "=", "DSM", "21363", "(", "T", ")", "=", "CGMCC", "4", ".", "5582", "(", "T", ")", ")", "is", "assigned", "as", "the", "type", "strain", "of", "a", "novel", "species", ",", "for", "which", "the", "name", "Serinicoccus", "profundi", "sp", ".", "nov", "." ]
[ 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0 ]
34
[ "is", "proposed", "." ]
[ 0, 0, 0 ]
35
[ "Proposal", "of", "Mingxiaea", "gen", ".", "nov", ".", "for", "the", "anamorphic", "basidiomycetous", "yeast", "species", "in", "the", "Bulleribasidium", "clade", "(", "Tremellales", ")", "based", "on", "molecular", "phylogenetic", "analysis", ",", "with", "six", "new", "combinations", "and", "four", "novel", "species", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
36
[ "The", "distinction", "and", "monophyletic", "property", "of", "the", "basidiomycetous", "yeast", "species", "in", "the", "Bulleribasidium", "clade", "of", "the", "order", "Tremellales", "was", "resolved", "by", "molecular", "phylogenetic", "analysis", "based", "on", "the", "combined", "sequences", "of", "the", "18S", "rRNA", "gene", ",", "internal", "transcribed", "spacer", "(", "ITS", ")", "region", "including", "5", ".", "8S", "rRNA", "gene", "and", "26S", "rRNA", "gene", "D1", "/", "D2", "domain", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
37
[ "The", "addition", "to", "the", "clade", "of", "new", "anamorphic", "species", "identified", "among", "ballistoconidium", "-", "forming", "yeasts", "isolated", "from", "China", "confirmed", "and", "strengthened", "the", "separation", "of", "this", "clade", "from", "other", "clades", "or", "lineages", "in", "the", "order", "Tremellales", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
38
[ "A", "new", "anamorphic", "genus", ",", "Mingxiaea", "gen", ".", "nov", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
39
[ "(", "type", "species", "Mingxiaea", "variabilis", "comb", ".", "nov", ".", ")", "is", "therefore", "proposed", "to", "accommodate", "the", "anamorphic", "species", "in", "the", "Bulleribasidium", "clade", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
40
[ "Six", "new", "combinations", "are", "proposed", "for", "the", "described", "species", "of", "this", "clade", "which", "were", "formerly", "assigned", "to", "the", "genus", "Bullera", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
41
[ "Four", "novel", "species", "in", "the", "new", "genus", "were", "identified", "among", "16", "ballistoconidium", "-", "forming", "yeast", "strains", "isolated", "from", "plant", "leaves", "collected", "in", "Hainan", "province", ",", "southern", "China", ",", "by", "D1", "/", "D2", "and", "ITS", "sequence", "analyses", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
42
[ "The", "novel", "species", "are", "described", "as", "Mingxiaea", "sanyaensis", "sp", ".", "nov", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
43
[ "(", "type", "strain", "SY", "-", "3", ".", "23", "(", "T", ")", "=", "AS", "2", ".", "3623", "(", "T", ")", "=", "CBS", "11408", "(", "T", ")", ")", ",", "Mingxiaea", "hainanensis", "(", "type", "strain", "WZS", "-", "8", ".", "13", "(", "T", ")", "=", "AS", "2", ".", "4161", "(", "T", ")", "=", "CBS", "11409", "(", "T", ")", ")", ",", "Mingxiaea", "foliicola", "(", "type", "strain", "WZS", "-", "8", ".", "14", "(", "T", ")", "=", "AS", "2", ".", "3518", "(", "T", ")", "=", "CBS", "11407", "(", "T", ")", ")", "and", "Mingxiaea", "wuzhishanensis", "(", "type", "strain", "WZS", "-", "29", ".", "8", "(", "T", ")", "=", "AS", "2", ".", "4163", "(", "T", ")", "=", "CBS", "11411", "(", "T", ")", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
44
[ "Scardovia", "wiggsiae", "sp", ".", "nov", ".", ",", "isolated", "from", "the", "human", "oral", "cavity", "and", "clinical", "material", ",", "and", "emended", "descriptions", "of", "the", "genus", "Scardovia", "and", "Scardovia", "inopinata", "." ]
[ 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0 ]
45
[ "Six", "strains", "of", "anaerobic", ",", "pleomorphic", "Gram", "-", "positive", "bacilli", ",", "isolated", "from", "the", "human", "oral", "cavity", "and", "an", "infected", "arm", "wound", ",", "were", "subjected", "to", "a", "comprehensive", "range", "of", "phenotypic", "and", "genotypic", "tests", "and", "were", "found", "to", "comprise", "a", "homogeneous", "group", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
46
[ "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "analysis", "revealed", "that", "the", "isolates", "were", "most", "closely", "related", "to", "Scardovia", "inopinata", "CCUG", "35729", "(", "T", ")", "(", "94", ".", "8", "-", "94", ".", "9", "%", "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "similarity", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
47
[ "The", "isolates", "were", "saccharolytic", "and", "produced", "acetic", "and", "lactic", "acids", "as", "end", "products", "of", "fermentation", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
48
[ "The", "major", "fatty", "acids", "were", "C", "(", "16", ":", "0", ")", "(", "49", ".", "8", "%", ")", "and", "C", "(", "18", ":", "1", ")", "omega9c", "(", "35", ".", "8", "%", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
49
[ "Polar", "lipid", "analysis", "revealed", "a", "variety", "of", "glycolipids", ",", "diphosphatidylglycerol", ",", "an", "unidentified", "phospholipid", "and", "an", "unidentified", "phosphoglycolipid", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
50
[ "No", "respiratory", "quinones", "were", "detected", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
51
[ "The", "peptidoglycan", "was", "of", "the", "type", "A4alpha", "L", "-", "Lys", "-", "Thr", "-", "Glu", ",", "with", "L", "-", "lysine", "partially", "replaced", "by", "L", "-", "ornithine", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
52
[ "The", "DNA", "G", "+", "C", "content", "of", "one", "of", "the", "strains", ",", "C1A", "_", "55", "(", "T", ")", "(", ",", ")", "was", "55", "mol", "%", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
53
[ "A", "novel", "species", ",", "Scardovia", "wiggsiae", "sp", ".", "nov", ".", ",", "is", "proposed", "to", "accommodate", "the", "six", "isolates", ",", "with", "the", "type", "strain", "C1A", "_", "55", "(", "T", ")", "(", "=", "DSM", "22547", "(", "T", ")", "=", "CCUG", "58090", "(", "T", ")", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
54
[ "Flavobacterium", "ponti", "sp", ".", "nov", ".", ",", "isolated", "from", "seawater", "." ]
[ 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0 ]
55
[ "A", "Gram", "-", "stain", "-", "negative", ",", "non", "-", "flagellated", ",", "non", "-", "gliding", ",", "yellow", "-", "pigmented", "and", "rod", "-", "shaped", "bacterial", "strain", ",", "designated", "GSW", "-", "R14", "(", "T", ")", ",", "was", "isolated", "from", "seawater", "of", "Geoje", "Island", "in", "the", "South", "Sea", ",", "Korea", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
56
[ "Strain", "GSW", "-", "R14", "(", "T", ")", "grew", "optimally", "at", "25", "^", "0C", ",", "at", "pH", "7", ".", "0", "-", "8", ".", "0", "and", "in", "the", "presence", "of", "2", "%", "(", "w", "/", "v", ")", "NaCl", "." ]
[ 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
57
[ "Phylogenetic", "analyses", "based", "on", "16S", "rRNA", "gene", "sequences", "showed", "that", "strain", "GSW", "-", "R14", "(", "T", ")", "belonged", "to", "the", "genus", "Flavobacterium", ",", "joining", "Flavobacterium", "gelidilacus", "LMG", "21477", "(", "T", ")", "by", "a", "bootstrap", "resampling", "value", "of", "100", "%", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
58
[ "Strain", "GSW", "-", "R14", "(", "T", ")", "exhibited", "97", ".", "6", "%", "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "similarity", "to", "F", ".", "gelidilacus", "LMG", "21477", "(", "T", ")", "and", "similarities", "of", "91", ".", "2", "-", "95", ".", "2", "%", "to", "other", "members", "of", "the", "genus", "Flavobacterium", "." ]
[ 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
59
[ "Strain", "GSW", "-", "R14", "(", "T", ")", "contained", "MK", "-", "6", "as", "the", "predominant", "menaquinone", "." ]
[ 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
60
[ "The", "fatty", "acid", "profile", "of", "strain", "GSW", "-", "R14", "(", "T", ")", "was", "similar", "to", "that", "of", "F", ".", "gelidilacus", "LMG", "21477", "(", "T", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
61
[ "The", "DNA", "G", "+", "C", "content", "of", "strain", "GSW", "-", "R14", "(", "T", ")", "was", "31", ".", "4", "mol", "%", "and", "its", "DNA", "-", "DNA", "relatedness", "with", "F", ".", "gelidilacus", "LMG", "21477", "(", "T", ")", "was", "31", "%", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
62
[ "Strain", "GSW", "-", "R14", "(", "T", ")", "could", "be", "distinguished", "from", "F", ".", "gelidilacus", "and", "the", "other", "species", "of", "the", "genus", "Flavobacterium", "by", "its", "phylogenetic", "and", "genetic", "distinctiveness", "and", "by", "several", "phenotypic", "properties", "." ]
[ 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
63
[ "On", "the", "basis", "of", "these", "data", ",", "strain", "GSW", "-", "R14", "(", "T", ")", "is", "considered", "to", "represent", "a", "novel", "species", "of", "the", "genus", "Flavobacterium", ",", "for", "which", "the", "name", "Flavobacterium", "ponti", "sp", ".", "nov", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2 ]
64
[ "is", "proposed", ";", "the", "type", "strain", "is", "GSW", "-", "R14", "(", "T", ")", "(", "=", "KCTC", "22802", "(", "T", ")", "=", "CCUG", "58402", "(", "T", ")", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
65
[ "Thermasporomyces", "composti", "gen", ".", "nov", ".", ",", "sp", ".", "nov", ".", ",", "a", "thermophilic", "actinomycete", "isolated", "from", "compost", "." ]
[ 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
66
[ "A", "thermophilic", ",", "Gram", "-", "positive", "bacterium", "that", "formed", "a", "branched", "vegetative", "mycelium", "was", "isolated", "from", "compost", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
67
[ "The", "strain", ",", "designated", "I3", "(", "T", ")", ",", "grew", "at", "temperatures", "between", "35", "and", "62", "^", "0C", ",", "with", "optimum", "growth", "at", "50", "-", "55", "^", "0C", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
68
[ "No", "growth", "was", "observed", "below", "29", "^", "0C", "or", "above", "65", "^", "0C", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
69
[ "The", "pH", "range", "for", "growth", "was", "5", ".", "7", "-", "10", ".", "0", ",", "the", "pH", "for", "optimum", "growth", "was", "7", ".", "0", "and", "no", "growth", "was", "observed", "below", "pH", "5", ".", "6", "or", "above", "pH", "10", ".", "8", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
70
[ "The", "DNA", "G", "+", "C", "content", "of", "strain", "I3", "(", "T", ")", "was", "69", ".", "2", "mol", "%", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
71
[ "The", "major", "fatty", "acids", "found", "were", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "iso", "(", "14", ".", "2", "%", ")", ",", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "anteiso", "(", "12", ".", "1", "%", ")", ",", "C", "(", "17", ":", "0", ")", "iso", "(", "16", ".", "3", "%", ")", "and", "C", "(", "17", ":", "0", ")", "anteiso", "(", "21", ".", "7", "%", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
72
[ "The", "major", "menaquinones", "were", "MK", "-", "9", "(", "H", "(", "4", ")", ")", ",", "MK", "-", "10", "(", "H", "(", "4", ")", ")", "and", "MK", "-", "11", "(", "H", "(", "4", ")", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
73
[ "The", "cell", "wall", "contained", "glutamic", "acid", ",", "glycine", ",", "alanine", "and", "ll", "-", "diaminopimelic", "acid", "in", "a", "molar", "ratio", "of", "1", ".", "0", ":", "3", ".", "9", ":", "0", ".", "6", ":", "0", ".", "5", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
74
[ "The", "polar", "lipids", "consisted", "of", "ninhydrin", "-", "positive", "phosphoglycolipids", ",", "phosphatidylglycerol", ",", "diphosphatidylglycerol", "and", "an", "unknown", "glycolipid", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
75
[ "The", "cell", "-", "wall", "sugars", "were", "rhamnose", "and", "arabinose", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
76
[ "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "analysis", "assigned", "this", "actinomycete", "to", "the", "family", "Nocardioidaceae", ",", "but", "its", "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "shared", "no", "more", "than", "95", ".", "5", "%", "similarity", "with", "those", "of", "other", "members", "of", "the", "family", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
77
[ "The", "chemotaxonomic", "and", "phenotypic", "characteristics", "of", "strain", "I3", "(", "T", ")", "differed", "in", "some", "respects", "from", "those", "of", "members", "of", "the", "genus", "Actinopolymorpha", ",", "the", "most", "closely", "related", "genus", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
78
[ "Therefore", ",", "strain", "I3", "(", "T", ")", "represents", "a", "novel", "species", "in", "a", "new", "genus", "of", "the", "family", "Nocardioidaceae", ",", "for", "which", "the", "name", "Thermasporomyces", "composti", "gen", ".", "nov", ".", ",", "sp", ".", "nov", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2 ]
79
[ "is", "proposed", "." ]
[ 0, 0, 0 ]
80
[ "The", "type", "strain", "of", "the", "type", "species", "is", "I3", "(", "T", ")", "(", "=", "JCM", "16421", "(", "T", ")", "=", "DSM", "22891", "(", "T", ")", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
81
[ "Phycicoccus", "cremeus", "sp", ".", "nov", ".", ",", "isolated", "from", "forest", "soil", ",", "and", "emended", "description", "of", "the", "genus", "Phycicoccus", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
82
[ "A", "bacterial", "strain", ",", "designated", "V2M29", "(", "T", ")", ",", "was", "isolated", "from", "forest", "soil", "collected", "in", "the", "Changbai", "Mountains", ",", "Heilongjiang", "Province", ",", "China", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
83
[ "Cells", "of", "strain", "V2M29", "(", "T", ")", "were", "Gram", "-", "positive", ",", "rod", "-", "shaped", "(", "0", ".", "5", "-", "0", ".", "8", "mum", "in", "diameter", "and", "1", ".", "5", "-", "2", ".", "0", "mum", "in", "length", ")", ",", "strictly", "aerobic", "and", "non", "-", "motile", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
84
[ "Colonies", "produced", "on", "R2A", "agar", "plates", "were", "creamy", ",", "smooth", ",", "circular", "and", "0", ".", "3", "-", "0", ".", "8", "mm", "in", "diameter", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
85
[ "Strain", "V2M29", "(", "T", ")", "grew", "at", "14", "-", "35", "^", "0C", "(", "optimum", ",", "29", "^", "0C", ")", ",", "at", "pH", "4", ".", "1", "-", "10", ".", "0", "(", "optimum", ",", "pH", "7", ".", "0", "-", "8", ".", "0", ")", "and", "in", "the", "presence", "of", "0", "-", "7", ".", "0", "%", "(", "w", "/", "v", ")", "NaCl", "(", "optimum", ",", "0", "-", "2", ".", "0", "%", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
86
[ "Strain", "V2M29", "(", "T", ")", "contained", "MK", "-", "8", "(", "H", "(", "4", ")", ")", "as", "the", "major", "respiratory", "quinone", "and", "iso", "-", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "(", "20", ".", "9", "%", ")", ",", "iso", "-", "C", "(", "16", ":", "0", ")", "(", "18", ".", "5", "%", ")", ",", "C", "(", "17", ":", "1", ")", "omega8c", "(", "16", ".", "7", "%", ")", "and", "10", "-", "methyl", "-", "C", "(", "17", ":", "0", ")", "(", "9", ".", "2", "%", ")", "as", "the", "major", "cellular", "fatty", "acids", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
87
[ "The", "cell", "-", "wall", "peptidoglycan", "type", "was", "based", "on", "meso", "-", "2", ",", "6", "-", "diaminopimelic", "acid", "and", "the", "acyl", "type", "of", "the", "muramic", "acid", "was", "acetyl", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
88
[ "Diphosphatidylglycerol", ",", "phosphatidylinositol", "and", "six", "unknown", "glycolipids", "were", "the", "major", "polar", "lipids", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
89
[ "The", "G", "+", "C", "content", "of", "the", "DNA", "was", "72", ".", "0", "mol", "%", "(", "T", "(", "m", ")", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
90
[ "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "analysis", "indicated", "that", "strain", "V2M29", "(", "T", ")", "was", "phylogenetically", "related", "to", "members", "of", "the", "genus", "Phycicoccus", ",", "with", "sequence", "similarities", "ranging", "from", "96", ".", "6", "-", "97", ".", "8", "%", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
91
[ "The", "DNA", "-", "DNA", "relatedness", "values", "of", "strain", "V2M29", "(", "T", ")", "to", "Phycicoccus", "dokdonensis", "DS", "-", "8", "(", "T", ")", "and", "Phycicoccus", "bigeumensis", "DSM", "19264", "(", "T", ")", "were", "32", ".", "5", "+", "/", "-", "3", ".", "3", "%", "and", "29", ".", "2", "+", "/", "-", "2", ".", "3", "%", ",", "respectively", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
92
[ "Based", "on", "these", "results", ",", "it", "is", "concluded", "that", "strain", "V2M29", "(", "T", ")", "represents", "a", "novel", "species", "of", "the", "genus", "Phycicoccus", ",", "for", "which", "the", "name", "Phycicoccus", "cremeus", "sp", ".", "nov", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
93
[ "is", "proposed", ",", "with", "V2M29", "(", "T", ")", "(", "=", "CGMCC", "1", ".", "6963", "(", "T", ")", "=", "NBRC", "104261", "(", "T", ")", ")", "as", "the", "type", "strain", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
94
[ "Streptomyces", "hyderabadensis", "sp", ".", "nov", ".", ",", "an", "actinomycete", "isolated", "from", "soil", "." ]
[ 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
95
[ "A", "novel", "actinomycete", ",", "designated", "strain", "OU", "-", "40", "(", "T", ")", ",", "was", "isolated", "from", "farm", "soil", "collected", "from", "the", "Hyderabad", "region", "of", "Andhra", "Pradesh", ",", "southern", "India", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
96
[ "The", "strain", "was", "found", "to", "have", "morphological", "and", "chemotaxonomic", "characteristics", "typical", "of", "species", "of", "the", "genus", "Streptomyces", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
97
[ "Phylogenetic", "analysis", "based", "on", "16S", "rRNA", "gene", "sequences", "indicated", "that", "strain", "OU", "-", "40", "(", "T", ")", "belonged", "to", "the", "genus", "Streptomyces", ",", "and", "was", "related", "most", "closely", "to", "Streptomyces", "pactum", "NBRC", "13433", "(", "T", ")", "(", "99", ".", "0", "%", "sequence", "similarity", ")", ",", "Streptomyces", "olivaceus", "NBRC", "12805", "(", "T", ")", "(", "99", ".", "0", "%", ")", "and", "Streptomyces", "parvulus", "NBRC", "13193", "(", "T", ")", "(", "98", ".", "8", "%", ")", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
98
[ "Strain", "OU", "-", "40", "(", "T", ")", "could", "be", "distinguished", "from", "the", "type", "strains", "of", "its", "closest", "phylogenetic", "relatives", "based", "on", "levels", "of", "DNA", "-", "DNA", "relatedness", "and", "comparison", "of", "morphological", "and", "phenotypic", "data", "." ]
[ 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
99
[ "It", "is", "therefore", "concluded", "that", "strain", "OU", "-", "40", "(", "T", ")", "represents", "a", "novel", "species", "of", "the", "genus", "Streptomyces", ",", "for", "which", "the", "name", "Streptomyces", "hyderabadensis", "sp", ".", "nov", "." ]
[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2 ]
End of preview (truncated to 100 rows)

Dataset Card for [Dataset Name]

Dataset Summary

[More Information Needed]

Supported Tasks and Leaderboards

[More Information Needed]

Languages

[More Information Needed]

Dataset Structure

Data Instances

[More Information Needed]

Data Fields

  • id: Sentence identifier.
  • tokens: Array of tokens composing a sentence.
  • ner_tags: Array of tags, where 0 indicates no species mentioned, 1 signals the first token of a species and 2 the subsequent tokens of the species.

Data Splits

[More Information Needed]

Dataset Creation

Curation Rationale

[More Information Needed]

Source Data

Initial Data Collection and Normalization

[More Information Needed]

Who are the source language producers?

[More Information Needed]

Annotations

Annotation process

[More Information Needed]

Who are the annotators?

[More Information Needed]

Personal and Sensitive Information

[More Information Needed]

Considerations for Using the Data

Social Impact of Dataset

[More Information Needed]

Discussion of Biases

[More Information Needed]

Other Known Limitations

[More Information Needed]

Additional Information

Dataset Curators

[More Information Needed]

Licensing Information

[More Information Needed]

Citation Information

[More Information Needed]

Contributions

Thanks to @edugp for adding this dataset.

Update on GitHub