Datasets:
Tasks:
named-entity-recognition
Task Categories:
token-classification
Languages:
en
Multilinguality:
monolingual
Size Categories:
1K<n<10K
Licenses:
unknown
Language Creators:
expert-generated
Annotations Creators:
expert-generated
Source Datasets:
original
Dataset Preview
Go to dataset viewer
id (string) | tokens (json) | ner_tags (json) |
---|---|---|
0
| [
"Methanoregula",
"formicica",
"sp",
".",
"nov",
".",
",",
"a",
"methane",
"-",
"producing",
"archaeon",
"isolated",
"from",
"methanogenic",
"sludge",
"."
]
| [
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
1
| [
"A",
"novel",
"methane",
"-",
"producing",
"archaeon",
",",
"strain",
"SMSP",
"(",
"T",
")",
",",
"was",
"isolated",
"from",
"an",
"anaerobic",
",",
"propionate",
"-",
"degrading",
"enrichment",
"culture",
"that",
"was",
"originally",
"obtained",
"from",
"granular",
"sludge",
"in",
"a",
"mesophilic",
"upflow",
"anaerobic",
"sludge",
"blanket",
"(",
"UASB",
")",
"reactor",
"used",
"to",
"treat",
"a",
"beer",
"brewery",
"effluent",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
2
| [
"Cells",
"were",
"non",
"-",
"motile",
",",
"blunt",
"-",
"ended",
",",
"straight",
"rods",
",",
"1",
".",
"0",
"-",
"2",
".",
"6",
"mum",
"long",
"by",
"0",
".",
"5",
"mum",
"wide",
";",
"cells",
"were",
"sometimes",
"up",
"to",
"7",
"mum",
"long",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
3
| [
"Asymmetrical",
"cell",
"division",
"was",
"observed",
"in",
"rod",
"-",
"shaped",
"cells",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
4
| [
"Coccoid",
"cells",
"(",
"0",
".",
"5",
"-",
"1",
".",
"0",
"mum",
"in",
"diameter",
")",
"were",
"also",
"observed",
"in",
"mid",
"-",
"to",
"late",
"-",
"exponential",
"phase",
"cultures",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
5
| [
"Growth",
"was",
"observed",
"between",
"10",
"and",
"40",
"^",
"0C",
"(",
"optimum",
",",
"30",
"-",
"33",
"^",
"0C",
")",
"and",
"pH",
"7",
".",
"0",
"and",
"7",
".",
"6",
"(",
"optimum",
",",
"pH",
"7",
".",
"4",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
6
| [
"The",
"G",
"+",
"C",
"content",
"of",
"the",
"genomic",
"DNA",
"was",
"56",
".",
"2",
"mol",
"%",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
7
| [
"The",
"strain",
"utilized",
"formate",
"and",
"hydrogen",
"for",
"growth",
"and",
"methane",
"production",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
8
| [
"Based",
"on",
"comparative",
"sequence",
"analyses",
"of",
"the",
"16S",
"rRNA",
"and",
"mcrA",
"(",
"encoding",
"the",
"alpha",
"subunit",
"of",
"methyl",
"-",
"coenzyme",
"M",
"reductase",
",",
"a",
"key",
"enzyme",
"in",
"the",
"methane",
"-",
"producing",
"pathway",
")",
"genes",
",",
"strain",
"SMSP",
"(",
"T",
")",
"was",
"affiliated",
"with",
"group",
"E1",
"/",
"E2",
"within",
"the",
"order",
"Methanomicrobiales",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
9
| [
"The",
"closest",
"relative",
"based",
"on",
"both",
"16S",
"rRNA",
"and",
"mcrA",
"gene",
"sequences",
"was",
"Methanoregula",
"boonei",
"6A8",
"(",
"T",
")",
"(",
"96",
".",
"3",
"%",
"16S",
"rRNA",
"gene",
"sequence",
"similarity",
",",
"85",
".",
"4",
"%",
"deduced",
"McrA",
"amino",
"acid",
"sequence",
"similarity",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
10
| [
"The",
"percentage",
"of",
"16S",
"rRNA",
"gene",
"sequence",
"similarity",
"indicates",
"that",
"strain",
"SMSP",
"(",
"T",
")",
"and",
"Methanoregula",
"boonei",
"6A8",
"(",
"T",
")",
"represent",
"different",
"species",
"within",
"the",
"same",
"genus",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
11
| [
"This",
"is",
"supported",
"by",
"our",
"findings",
"of",
"shared",
"phenotypic",
"properties",
",",
"including",
"cell",
"morphology",
"and",
"growth",
"temperature",
"range",
",",
"and",
"phenotypic",
"differences",
"in",
"substrate",
"usage",
"and",
"pH",
"range",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
12
| [
"Based",
"on",
"these",
"genetic",
"and",
"phenotypic",
"properties",
",",
"we",
"propose",
"that",
"strain",
"SMSP",
"(",
"T",
")",
"represents",
"a",
"novel",
"species",
"of",
"the",
"genus",
"Methanoregula",
",",
"for",
"which",
"we",
"propose",
"the",
"name",
"Methanoregula",
"formicica",
"sp",
".",
"nov",
".",
",",
"with",
"the",
"type",
"strain",
"SMSP",
"(",
"T",
")",
"(",
"=",
"NBRC",
"105244",
"(",
"T",
")",
"=",
"DSM",
"22288",
"(",
"T",
")",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
13
| [
"Characterizing",
"the",
"role",
"of",
"the",
"microtubule",
"binding",
"protein",
"Bim1",
"in",
"Cryptococcus",
"neoformans",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
]
|
14
| [
"During",
"sexual",
"development",
"the",
"human",
"fungal",
"pathogen",
"Cryptococcus",
"neoformans",
"undergoes",
"a",
"developmental",
"transition",
"from",
"yeast",
"-",
"form",
"growth",
"to",
"filamentous",
"growth",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
15
| [
"This",
"transition",
"requires",
"cellular",
"restructuring",
"to",
"form",
"a",
"filamentous",
"dikaryon",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
16
| [
"Dikaryotic",
"growth",
"also",
"requires",
"tightly",
"controlled",
"nuclear",
"migration",
"to",
"ensure",
"faithful",
"replication",
"and",
"dissemination",
"of",
"genetic",
"material",
"to",
"spore",
"progeny",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
17
| [
"Although",
"the",
"gross",
"morphological",
"changes",
"that",
"take",
"place",
"during",
"dikaryotic",
"growth",
"are",
"largely",
"known",
",",
"the",
"molecular",
"underpinnings",
"that",
"control",
"this",
"process",
"are",
"uncharacterized",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
18
| [
"Here",
"we",
"identify",
"and",
"characterize",
"a",
"C",
".",
"neoformans",
"homolog",
"of",
"the",
"Saccharomyces",
"cerevisiae",
"BIM1",
"gene",
",",
"and",
"establish",
"the",
"importance",
"of",
"BIM1",
"for",
"proper",
"filamentous",
"growth",
"of",
"C",
".",
"neoformans",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0
]
|
19
| [
"Deletion",
"of",
"BIM1",
"leads",
"to",
"truncated",
"sexual",
"development",
"filaments",
",",
"a",
"severe",
"defect",
"in",
"diploid",
"formation",
",",
"and",
"a",
"block",
"in",
"monokaryotic",
"fruiting",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
20
| [
"Our",
"findings",
"lead",
"to",
"a",
"model",
"consistent",
"with",
"a",
"critical",
"role",
"for",
"BIM1",
"in",
"both",
"filament",
"integrity",
"and",
"nuclear",
"congression",
"that",
"is",
"mediated",
"through",
"the",
"microtubule",
"cytoskeleton",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
21
| [
"Serinicoccus",
"profundi",
"sp",
".",
"nov",
".",
",",
"an",
"actinomycete",
"isolated",
"from",
"deep",
"-",
"sea",
"sediment",
",",
"and",
"emended",
"description",
"of",
"the",
"genus",
"Serinicoccus",
"."
]
| [
1,
2,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
22
| [
"A",
"Gram",
"-",
"reaction",
"-",
"positive",
"bacterial",
"strain",
"of",
"the",
"genus",
"Serinicoccus",
",",
"designated",
"MCCC",
"1A05965",
"(",
"T",
")",
",",
"was",
"isolated",
"from",
"a",
"deep",
"-",
"sea",
"(",
"5368",
"m",
")",
"sediment",
"of",
"the",
"Indian",
"Ocean",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
23
| [
"Comparison",
"of",
"16S",
"rRNA",
"gene",
"sequences",
"revealed",
"that",
"the",
"isolate",
"shared",
"97",
".",
"6",
"%",
"sequence",
"similarity",
"with",
"Serinicoccus",
"marinus",
"JC1078",
"(",
"T",
")",
",",
"the",
"type",
"strain",
"of",
"the",
"only",
"described",
"species",
"of",
"the",
"genus",
"Serinicoccus",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
24
| [
"The",
"DNA",
"-",
"DNA",
"relatedness",
"between",
"these",
"two",
"strains",
"was",
"46",
".",
"2",
"%",
"(",
"standard",
"deviation",
"1",
".",
"86",
"%",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
25
| [
"The",
"cell",
"wall",
"contained",
"alanine",
",",
"glycine",
",",
"serine",
",",
"l",
"-",
"ornithine",
"and",
"glutamic",
"acid",
",",
"which",
"corresponds",
"to",
"the",
"description",
"of",
"the",
"genus",
"Serinicoccus",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
26
| [
"The",
"acyl",
"type",
"of",
"the",
"glycan",
"chain",
"of",
"the",
"peptidoglycan",
"was",
"glycolyl",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
27
| [
"Other",
"characteristics",
"of",
"strain",
"MCCC",
"1A05965",
"(",
"T",
")",
"were",
"consistent",
"with",
"those",
"of",
"the",
"genus",
"Serinicoccus",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
28
| [
"Cells",
"were",
"coccoid",
",",
"moderately",
"halophilic",
",",
"oxidase",
"-",
"negative",
",",
"catalase",
"-",
"positive",
"and",
"non",
"-",
"spore",
"-",
"forming",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
29
| [
"The",
"major",
"menaquinone",
"was",
"MK",
"-",
"8",
"(",
"H",
"(",
"4",
")",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
30
| [
"The",
"predominant",
"cellular",
"fatty",
"acids",
"were",
"iso",
"-",
"C",
"(",
"15",
":",
"0",
")",
"(",
"34",
".",
"7",
"%",
")",
"and",
"iso",
"-",
"C",
"(",
"16",
":",
"0",
")",
"(",
"17",
".",
"0",
"%",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
31
| [
"The",
"polar",
"lipids",
"were",
"phosphatidylglycerol",
",",
"diphosphatidylglycerol",
",",
"phosphatidylcholine",
",",
"phosphatidylinositol",
"and",
"an",
"unknown",
"glycolipid",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
32
| [
"The",
"DNA",
"G",
"+",
"C",
"content",
"was",
"72",
"mol",
"%",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
33
| [
"Strain",
"MCCC",
"1A05965",
"(",
"T",
")",
"(",
"=",
"0714S6",
"-",
"1",
"(",
"T",
")",
"=",
"DSM",
"21363",
"(",
"T",
")",
"=",
"CGMCC",
"4",
".",
"5582",
"(",
"T",
")",
")",
"is",
"assigned",
"as",
"the",
"type",
"strain",
"of",
"a",
"novel",
"species",
",",
"for",
"which",
"the",
"name",
"Serinicoccus",
"profundi",
"sp",
".",
"nov",
"."
]
| [
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
0
]
|
34
| [
"is",
"proposed",
"."
]
| [
0,
0,
0
]
|
35
| [
"Proposal",
"of",
"Mingxiaea",
"gen",
".",
"nov",
".",
"for",
"the",
"anamorphic",
"basidiomycetous",
"yeast",
"species",
"in",
"the",
"Bulleribasidium",
"clade",
"(",
"Tremellales",
")",
"based",
"on",
"molecular",
"phylogenetic",
"analysis",
",",
"with",
"six",
"new",
"combinations",
"and",
"four",
"novel",
"species",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
36
| [
"The",
"distinction",
"and",
"monophyletic",
"property",
"of",
"the",
"basidiomycetous",
"yeast",
"species",
"in",
"the",
"Bulleribasidium",
"clade",
"of",
"the",
"order",
"Tremellales",
"was",
"resolved",
"by",
"molecular",
"phylogenetic",
"analysis",
"based",
"on",
"the",
"combined",
"sequences",
"of",
"the",
"18S",
"rRNA",
"gene",
",",
"internal",
"transcribed",
"spacer",
"(",
"ITS",
")",
"region",
"including",
"5",
".",
"8S",
"rRNA",
"gene",
"and",
"26S",
"rRNA",
"gene",
"D1",
"/",
"D2",
"domain",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
37
| [
"The",
"addition",
"to",
"the",
"clade",
"of",
"new",
"anamorphic",
"species",
"identified",
"among",
"ballistoconidium",
"-",
"forming",
"yeasts",
"isolated",
"from",
"China",
"confirmed",
"and",
"strengthened",
"the",
"separation",
"of",
"this",
"clade",
"from",
"other",
"clades",
"or",
"lineages",
"in",
"the",
"order",
"Tremellales",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
38
| [
"A",
"new",
"anamorphic",
"genus",
",",
"Mingxiaea",
"gen",
".",
"nov",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
39
| [
"(",
"type",
"species",
"Mingxiaea",
"variabilis",
"comb",
".",
"nov",
".",
")",
"is",
"therefore",
"proposed",
"to",
"accommodate",
"the",
"anamorphic",
"species",
"in",
"the",
"Bulleribasidium",
"clade",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
40
| [
"Six",
"new",
"combinations",
"are",
"proposed",
"for",
"the",
"described",
"species",
"of",
"this",
"clade",
"which",
"were",
"formerly",
"assigned",
"to",
"the",
"genus",
"Bullera",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
41
| [
"Four",
"novel",
"species",
"in",
"the",
"new",
"genus",
"were",
"identified",
"among",
"16",
"ballistoconidium",
"-",
"forming",
"yeast",
"strains",
"isolated",
"from",
"plant",
"leaves",
"collected",
"in",
"Hainan",
"province",
",",
"southern",
"China",
",",
"by",
"D1",
"/",
"D2",
"and",
"ITS",
"sequence",
"analyses",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
42
| [
"The",
"novel",
"species",
"are",
"described",
"as",
"Mingxiaea",
"sanyaensis",
"sp",
".",
"nov",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
43
| [
"(",
"type",
"strain",
"SY",
"-",
"3",
".",
"23",
"(",
"T",
")",
"=",
"AS",
"2",
".",
"3623",
"(",
"T",
")",
"=",
"CBS",
"11408",
"(",
"T",
")",
")",
",",
"Mingxiaea",
"hainanensis",
"(",
"type",
"strain",
"WZS",
"-",
"8",
".",
"13",
"(",
"T",
")",
"=",
"AS",
"2",
".",
"4161",
"(",
"T",
")",
"=",
"CBS",
"11409",
"(",
"T",
")",
")",
",",
"Mingxiaea",
"foliicola",
"(",
"type",
"strain",
"WZS",
"-",
"8",
".",
"14",
"(",
"T",
")",
"=",
"AS",
"2",
".",
"3518",
"(",
"T",
")",
"=",
"CBS",
"11407",
"(",
"T",
")",
")",
"and",
"Mingxiaea",
"wuzhishanensis",
"(",
"type",
"strain",
"WZS",
"-",
"29",
".",
"8",
"(",
"T",
")",
"=",
"AS",
"2",
".",
"4163",
"(",
"T",
")",
"=",
"CBS",
"11411",
"(",
"T",
")",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
44
| [
"Scardovia",
"wiggsiae",
"sp",
".",
"nov",
".",
",",
"isolated",
"from",
"the",
"human",
"oral",
"cavity",
"and",
"clinical",
"material",
",",
"and",
"emended",
"descriptions",
"of",
"the",
"genus",
"Scardovia",
"and",
"Scardovia",
"inopinata",
"."
]
| [
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0
]
|
45
| [
"Six",
"strains",
"of",
"anaerobic",
",",
"pleomorphic",
"Gram",
"-",
"positive",
"bacilli",
",",
"isolated",
"from",
"the",
"human",
"oral",
"cavity",
"and",
"an",
"infected",
"arm",
"wound",
",",
"were",
"subjected",
"to",
"a",
"comprehensive",
"range",
"of",
"phenotypic",
"and",
"genotypic",
"tests",
"and",
"were",
"found",
"to",
"comprise",
"a",
"homogeneous",
"group",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
46
| [
"16S",
"rRNA",
"gene",
"sequence",
"analysis",
"revealed",
"that",
"the",
"isolates",
"were",
"most",
"closely",
"related",
"to",
"Scardovia",
"inopinata",
"CCUG",
"35729",
"(",
"T",
")",
"(",
"94",
".",
"8",
"-",
"94",
".",
"9",
"%",
"16S",
"rRNA",
"gene",
"sequence",
"similarity",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
47
| [
"The",
"isolates",
"were",
"saccharolytic",
"and",
"produced",
"acetic",
"and",
"lactic",
"acids",
"as",
"end",
"products",
"of",
"fermentation",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
48
| [
"The",
"major",
"fatty",
"acids",
"were",
"C",
"(",
"16",
":",
"0",
")",
"(",
"49",
".",
"8",
"%",
")",
"and",
"C",
"(",
"18",
":",
"1",
")",
"omega9c",
"(",
"35",
".",
"8",
"%",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
49
| [
"Polar",
"lipid",
"analysis",
"revealed",
"a",
"variety",
"of",
"glycolipids",
",",
"diphosphatidylglycerol",
",",
"an",
"unidentified",
"phospholipid",
"and",
"an",
"unidentified",
"phosphoglycolipid",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
50
| [
"No",
"respiratory",
"quinones",
"were",
"detected",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
51
| [
"The",
"peptidoglycan",
"was",
"of",
"the",
"type",
"A4alpha",
"L",
"-",
"Lys",
"-",
"Thr",
"-",
"Glu",
",",
"with",
"L",
"-",
"lysine",
"partially",
"replaced",
"by",
"L",
"-",
"ornithine",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
52
| [
"The",
"DNA",
"G",
"+",
"C",
"content",
"of",
"one",
"of",
"the",
"strains",
",",
"C1A",
"_",
"55",
"(",
"T",
")",
"(",
",",
")",
"was",
"55",
"mol",
"%",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
53
| [
"A",
"novel",
"species",
",",
"Scardovia",
"wiggsiae",
"sp",
".",
"nov",
".",
",",
"is",
"proposed",
"to",
"accommodate",
"the",
"six",
"isolates",
",",
"with",
"the",
"type",
"strain",
"C1A",
"_",
"55",
"(",
"T",
")",
"(",
"=",
"DSM",
"22547",
"(",
"T",
")",
"=",
"CCUG",
"58090",
"(",
"T",
")",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
54
| [
"Flavobacterium",
"ponti",
"sp",
".",
"nov",
".",
",",
"isolated",
"from",
"seawater",
"."
]
| [
1,
2,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
55
| [
"A",
"Gram",
"-",
"stain",
"-",
"negative",
",",
"non",
"-",
"flagellated",
",",
"non",
"-",
"gliding",
",",
"yellow",
"-",
"pigmented",
"and",
"rod",
"-",
"shaped",
"bacterial",
"strain",
",",
"designated",
"GSW",
"-",
"R14",
"(",
"T",
")",
",",
"was",
"isolated",
"from",
"seawater",
"of",
"Geoje",
"Island",
"in",
"the",
"South",
"Sea",
",",
"Korea",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
56
| [
"Strain",
"GSW",
"-",
"R14",
"(",
"T",
")",
"grew",
"optimally",
"at",
"25",
"^",
"0C",
",",
"at",
"pH",
"7",
".",
"0",
"-",
"8",
".",
"0",
"and",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"2",
"%",
"(",
"w",
"/",
"v",
")",
"NaCl",
"."
]
| [
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
57
| [
"Phylogenetic",
"analyses",
"based",
"on",
"16S",
"rRNA",
"gene",
"sequences",
"showed",
"that",
"strain",
"GSW",
"-",
"R14",
"(",
"T",
")",
"belonged",
"to",
"the",
"genus",
"Flavobacterium",
",",
"joining",
"Flavobacterium",
"gelidilacus",
"LMG",
"21477",
"(",
"T",
")",
"by",
"a",
"bootstrap",
"resampling",
"value",
"of",
"100",
"%",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
58
| [
"Strain",
"GSW",
"-",
"R14",
"(",
"T",
")",
"exhibited",
"97",
".",
"6",
"%",
"16S",
"rRNA",
"gene",
"sequence",
"similarity",
"to",
"F",
".",
"gelidilacus",
"LMG",
"21477",
"(",
"T",
")",
"and",
"similarities",
"of",
"91",
".",
"2",
"-",
"95",
".",
"2",
"%",
"to",
"other",
"members",
"of",
"the",
"genus",
"Flavobacterium",
"."
]
| [
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
59
| [
"Strain",
"GSW",
"-",
"R14",
"(",
"T",
")",
"contained",
"MK",
"-",
"6",
"as",
"the",
"predominant",
"menaquinone",
"."
]
| [
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
60
| [
"The",
"fatty",
"acid",
"profile",
"of",
"strain",
"GSW",
"-",
"R14",
"(",
"T",
")",
"was",
"similar",
"to",
"that",
"of",
"F",
".",
"gelidilacus",
"LMG",
"21477",
"(",
"T",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
61
| [
"The",
"DNA",
"G",
"+",
"C",
"content",
"of",
"strain",
"GSW",
"-",
"R14",
"(",
"T",
")",
"was",
"31",
".",
"4",
"mol",
"%",
"and",
"its",
"DNA",
"-",
"DNA",
"relatedness",
"with",
"F",
".",
"gelidilacus",
"LMG",
"21477",
"(",
"T",
")",
"was",
"31",
"%",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
62
| [
"Strain",
"GSW",
"-",
"R14",
"(",
"T",
")",
"could",
"be",
"distinguished",
"from",
"F",
".",
"gelidilacus",
"and",
"the",
"other",
"species",
"of",
"the",
"genus",
"Flavobacterium",
"by",
"its",
"phylogenetic",
"and",
"genetic",
"distinctiveness",
"and",
"by",
"several",
"phenotypic",
"properties",
"."
]
| [
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
63
| [
"On",
"the",
"basis",
"of",
"these",
"data",
",",
"strain",
"GSW",
"-",
"R14",
"(",
"T",
")",
"is",
"considered",
"to",
"represent",
"a",
"novel",
"species",
"of",
"the",
"genus",
"Flavobacterium",
",",
"for",
"which",
"the",
"name",
"Flavobacterium",
"ponti",
"sp",
".",
"nov",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2
]
|
64
| [
"is",
"proposed",
";",
"the",
"type",
"strain",
"is",
"GSW",
"-",
"R14",
"(",
"T",
")",
"(",
"=",
"KCTC",
"22802",
"(",
"T",
")",
"=",
"CCUG",
"58402",
"(",
"T",
")",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
65
| [
"Thermasporomyces",
"composti",
"gen",
".",
"nov",
".",
",",
"sp",
".",
"nov",
".",
",",
"a",
"thermophilic",
"actinomycete",
"isolated",
"from",
"compost",
"."
]
| [
1,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
66
| [
"A",
"thermophilic",
",",
"Gram",
"-",
"positive",
"bacterium",
"that",
"formed",
"a",
"branched",
"vegetative",
"mycelium",
"was",
"isolated",
"from",
"compost",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
67
| [
"The",
"strain",
",",
"designated",
"I3",
"(",
"T",
")",
",",
"grew",
"at",
"temperatures",
"between",
"35",
"and",
"62",
"^",
"0C",
",",
"with",
"optimum",
"growth",
"at",
"50",
"-",
"55",
"^",
"0C",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
68
| [
"No",
"growth",
"was",
"observed",
"below",
"29",
"^",
"0C",
"or",
"above",
"65",
"^",
"0C",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
69
| [
"The",
"pH",
"range",
"for",
"growth",
"was",
"5",
".",
"7",
"-",
"10",
".",
"0",
",",
"the",
"pH",
"for",
"optimum",
"growth",
"was",
"7",
".",
"0",
"and",
"no",
"growth",
"was",
"observed",
"below",
"pH",
"5",
".",
"6",
"or",
"above",
"pH",
"10",
".",
"8",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
70
| [
"The",
"DNA",
"G",
"+",
"C",
"content",
"of",
"strain",
"I3",
"(",
"T",
")",
"was",
"69",
".",
"2",
"mol",
"%",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
71
| [
"The",
"major",
"fatty",
"acids",
"found",
"were",
"C",
"(",
"15",
":",
"0",
")",
"iso",
"(",
"14",
".",
"2",
"%",
")",
",",
"C",
"(",
"15",
":",
"0",
")",
"anteiso",
"(",
"12",
".",
"1",
"%",
")",
",",
"C",
"(",
"17",
":",
"0",
")",
"iso",
"(",
"16",
".",
"3",
"%",
")",
"and",
"C",
"(",
"17",
":",
"0",
")",
"anteiso",
"(",
"21",
".",
"7",
"%",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
72
| [
"The",
"major",
"menaquinones",
"were",
"MK",
"-",
"9",
"(",
"H",
"(",
"4",
")",
")",
",",
"MK",
"-",
"10",
"(",
"H",
"(",
"4",
")",
")",
"and",
"MK",
"-",
"11",
"(",
"H",
"(",
"4",
")",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
73
| [
"The",
"cell",
"wall",
"contained",
"glutamic",
"acid",
",",
"glycine",
",",
"alanine",
"and",
"ll",
"-",
"diaminopimelic",
"acid",
"in",
"a",
"molar",
"ratio",
"of",
"1",
".",
"0",
":",
"3",
".",
"9",
":",
"0",
".",
"6",
":",
"0",
".",
"5",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
74
| [
"The",
"polar",
"lipids",
"consisted",
"of",
"ninhydrin",
"-",
"positive",
"phosphoglycolipids",
",",
"phosphatidylglycerol",
",",
"diphosphatidylglycerol",
"and",
"an",
"unknown",
"glycolipid",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
75
| [
"The",
"cell",
"-",
"wall",
"sugars",
"were",
"rhamnose",
"and",
"arabinose",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
76
| [
"16S",
"rRNA",
"gene",
"sequence",
"analysis",
"assigned",
"this",
"actinomycete",
"to",
"the",
"family",
"Nocardioidaceae",
",",
"but",
"its",
"16S",
"rRNA",
"gene",
"sequence",
"shared",
"no",
"more",
"than",
"95",
".",
"5",
"%",
"similarity",
"with",
"those",
"of",
"other",
"members",
"of",
"the",
"family",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
77
| [
"The",
"chemotaxonomic",
"and",
"phenotypic",
"characteristics",
"of",
"strain",
"I3",
"(",
"T",
")",
"differed",
"in",
"some",
"respects",
"from",
"those",
"of",
"members",
"of",
"the",
"genus",
"Actinopolymorpha",
",",
"the",
"most",
"closely",
"related",
"genus",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
78
| [
"Therefore",
",",
"strain",
"I3",
"(",
"T",
")",
"represents",
"a",
"novel",
"species",
"in",
"a",
"new",
"genus",
"of",
"the",
"family",
"Nocardioidaceae",
",",
"for",
"which",
"the",
"name",
"Thermasporomyces",
"composti",
"gen",
".",
"nov",
".",
",",
"sp",
".",
"nov",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2
]
|
79
| [
"is",
"proposed",
"."
]
| [
0,
0,
0
]
|
80
| [
"The",
"type",
"strain",
"of",
"the",
"type",
"species",
"is",
"I3",
"(",
"T",
")",
"(",
"=",
"JCM",
"16421",
"(",
"T",
")",
"=",
"DSM",
"22891",
"(",
"T",
")",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
81
| [
"Phycicoccus",
"cremeus",
"sp",
".",
"nov",
".",
",",
"isolated",
"from",
"forest",
"soil",
",",
"and",
"emended",
"description",
"of",
"the",
"genus",
"Phycicoccus",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
82
| [
"A",
"bacterial",
"strain",
",",
"designated",
"V2M29",
"(",
"T",
")",
",",
"was",
"isolated",
"from",
"forest",
"soil",
"collected",
"in",
"the",
"Changbai",
"Mountains",
",",
"Heilongjiang",
"Province",
",",
"China",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
83
| [
"Cells",
"of",
"strain",
"V2M29",
"(",
"T",
")",
"were",
"Gram",
"-",
"positive",
",",
"rod",
"-",
"shaped",
"(",
"0",
".",
"5",
"-",
"0",
".",
"8",
"mum",
"in",
"diameter",
"and",
"1",
".",
"5",
"-",
"2",
".",
"0",
"mum",
"in",
"length",
")",
",",
"strictly",
"aerobic",
"and",
"non",
"-",
"motile",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
84
| [
"Colonies",
"produced",
"on",
"R2A",
"agar",
"plates",
"were",
"creamy",
",",
"smooth",
",",
"circular",
"and",
"0",
".",
"3",
"-",
"0",
".",
"8",
"mm",
"in",
"diameter",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
85
| [
"Strain",
"V2M29",
"(",
"T",
")",
"grew",
"at",
"14",
"-",
"35",
"^",
"0C",
"(",
"optimum",
",",
"29",
"^",
"0C",
")",
",",
"at",
"pH",
"4",
".",
"1",
"-",
"10",
".",
"0",
"(",
"optimum",
",",
"pH",
"7",
".",
"0",
"-",
"8",
".",
"0",
")",
"and",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"0",
"-",
"7",
".",
"0",
"%",
"(",
"w",
"/",
"v",
")",
"NaCl",
"(",
"optimum",
",",
"0",
"-",
"2",
".",
"0",
"%",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
86
| [
"Strain",
"V2M29",
"(",
"T",
")",
"contained",
"MK",
"-",
"8",
"(",
"H",
"(",
"4",
")",
")",
"as",
"the",
"major",
"respiratory",
"quinone",
"and",
"iso",
"-",
"C",
"(",
"15",
":",
"0",
")",
"(",
"20",
".",
"9",
"%",
")",
",",
"iso",
"-",
"C",
"(",
"16",
":",
"0",
")",
"(",
"18",
".",
"5",
"%",
")",
",",
"C",
"(",
"17",
":",
"1",
")",
"omega8c",
"(",
"16",
".",
"7",
"%",
")",
"and",
"10",
"-",
"methyl",
"-",
"C",
"(",
"17",
":",
"0",
")",
"(",
"9",
".",
"2",
"%",
")",
"as",
"the",
"major",
"cellular",
"fatty",
"acids",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
87
| [
"The",
"cell",
"-",
"wall",
"peptidoglycan",
"type",
"was",
"based",
"on",
"meso",
"-",
"2",
",",
"6",
"-",
"diaminopimelic",
"acid",
"and",
"the",
"acyl",
"type",
"of",
"the",
"muramic",
"acid",
"was",
"acetyl",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
88
| [
"Diphosphatidylglycerol",
",",
"phosphatidylinositol",
"and",
"six",
"unknown",
"glycolipids",
"were",
"the",
"major",
"polar",
"lipids",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
89
| [
"The",
"G",
"+",
"C",
"content",
"of",
"the",
"DNA",
"was",
"72",
".",
"0",
"mol",
"%",
"(",
"T",
"(",
"m",
")",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
90
| [
"16S",
"rRNA",
"gene",
"sequence",
"analysis",
"indicated",
"that",
"strain",
"V2M29",
"(",
"T",
")",
"was",
"phylogenetically",
"related",
"to",
"members",
"of",
"the",
"genus",
"Phycicoccus",
",",
"with",
"sequence",
"similarities",
"ranging",
"from",
"96",
".",
"6",
"-",
"97",
".",
"8",
"%",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
91
| [
"The",
"DNA",
"-",
"DNA",
"relatedness",
"values",
"of",
"strain",
"V2M29",
"(",
"T",
")",
"to",
"Phycicoccus",
"dokdonensis",
"DS",
"-",
"8",
"(",
"T",
")",
"and",
"Phycicoccus",
"bigeumensis",
"DSM",
"19264",
"(",
"T",
")",
"were",
"32",
".",
"5",
"+",
"/",
"-",
"3",
".",
"3",
"%",
"and",
"29",
".",
"2",
"+",
"/",
"-",
"2",
".",
"3",
"%",
",",
"respectively",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
92
| [
"Based",
"on",
"these",
"results",
",",
"it",
"is",
"concluded",
"that",
"strain",
"V2M29",
"(",
"T",
")",
"represents",
"a",
"novel",
"species",
"of",
"the",
"genus",
"Phycicoccus",
",",
"for",
"which",
"the",
"name",
"Phycicoccus",
"cremeus",
"sp",
".",
"nov",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
93
| [
"is",
"proposed",
",",
"with",
"V2M29",
"(",
"T",
")",
"(",
"=",
"CGMCC",
"1",
".",
"6963",
"(",
"T",
")",
"=",
"NBRC",
"104261",
"(",
"T",
")",
")",
"as",
"the",
"type",
"strain",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
94
| [
"Streptomyces",
"hyderabadensis",
"sp",
".",
"nov",
".",
",",
"an",
"actinomycete",
"isolated",
"from",
"soil",
"."
]
| [
1,
2,
2,
2,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
95
| [
"A",
"novel",
"actinomycete",
",",
"designated",
"strain",
"OU",
"-",
"40",
"(",
"T",
")",
",",
"was",
"isolated",
"from",
"farm",
"soil",
"collected",
"from",
"the",
"Hyderabad",
"region",
"of",
"Andhra",
"Pradesh",
",",
"southern",
"India",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
96
| [
"The",
"strain",
"was",
"found",
"to",
"have",
"morphological",
"and",
"chemotaxonomic",
"characteristics",
"typical",
"of",
"species",
"of",
"the",
"genus",
"Streptomyces",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
97
| [
"Phylogenetic",
"analysis",
"based",
"on",
"16S",
"rRNA",
"gene",
"sequences",
"indicated",
"that",
"strain",
"OU",
"-",
"40",
"(",
"T",
")",
"belonged",
"to",
"the",
"genus",
"Streptomyces",
",",
"and",
"was",
"related",
"most",
"closely",
"to",
"Streptomyces",
"pactum",
"NBRC",
"13433",
"(",
"T",
")",
"(",
"99",
".",
"0",
"%",
"sequence",
"similarity",
")",
",",
"Streptomyces",
"olivaceus",
"NBRC",
"12805",
"(",
"T",
")",
"(",
"99",
".",
"0",
"%",
")",
"and",
"Streptomyces",
"parvulus",
"NBRC",
"13193",
"(",
"T",
")",
"(",
"98",
".",
"8",
"%",
")",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
98
| [
"Strain",
"OU",
"-",
"40",
"(",
"T",
")",
"could",
"be",
"distinguished",
"from",
"the",
"type",
"strains",
"of",
"its",
"closest",
"phylogenetic",
"relatives",
"based",
"on",
"levels",
"of",
"DNA",
"-",
"DNA",
"relatedness",
"and",
"comparison",
"of",
"morphological",
"and",
"phenotypic",
"data",
"."
]
| [
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0
]
|
99
| [
"It",
"is",
"therefore",
"concluded",
"that",
"strain",
"OU",
"-",
"40",
"(",
"T",
")",
"represents",
"a",
"novel",
"species",
"of",
"the",
"genus",
"Streptomyces",
",",
"for",
"which",
"the",
"name",
"Streptomyces",
"hyderabadensis",
"sp",
".",
"nov",
"."
]
| [
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
0,
1,
2,
2,
2,
2,
2
]
|
End of preview (truncated to 100
rows)
Dataset Card for [Dataset Name]
Dataset Summary
[More Information Needed]
Supported Tasks and Leaderboards
[More Information Needed]
Languages
[More Information Needed]
Dataset Structure
Data Instances
[More Information Needed]
Data Fields
id
: Sentence identifier.tokens
: Array of tokens composing a sentence.ner_tags
: Array of tags, where0
indicates no species mentioned,1
signals the first token of a species and2
the subsequent tokens of the species.
Data Splits
[More Information Needed]
Dataset Creation
Curation Rationale
[More Information Needed]
Source Data
Initial Data Collection and Normalization
[More Information Needed]
Who are the source language producers?
[More Information Needed]
Annotations
Annotation process
[More Information Needed]
Who are the annotators?
[More Information Needed]
Personal and Sensitive Information
[More Information Needed]
Considerations for Using the Data
Social Impact of Dataset
[More Information Needed]
Discussion of Biases
[More Information Needed]
Other Known Limitations
[More Information Needed]
Additional Information
Dataset Curators
[More Information Needed]
Licensing Information
[More Information Needed]
Citation Information
[More Information Needed]
Contributions
Thanks to @edugp for adding this dataset.