Source: https://digital.csic.es/cris/rp/rp02661/
Timestamp: 2018-01-19 11:37:23+00:00

Document:
CSIC – Estación Experimental de Aula Dei (EEAD) / Fundación ARAID
Grupo de Biología Computacional y Estructural / Computational & Structural Biology Lab
Investigador científico ARAID
Desarrollo de métodos computacionales para la genómica y la regulación genética de plantas y el análisis estructural y funcional de macromoléculas biológicas. Objetivos: 1) Análisis evolutivo y estructural de factores de transcripción, metaloproteínas, enzimas y proteínas desordenadas en plantas. 2) Genómica de gramíneas: cebada y Brachypodium. 3) Selección de marcadores para mejora de cebada, diagnóstico molecular y metagenómica.
Google Scholar: xtWJ8JsAAAAJ
Scopus authorID: 6602677166
researcherID: G-4334-2011
bcontreras@eead.csic.es
1 openAccess 2010 3D-footprint: a database for the structural analysis of protein–DNA complexes Contreras-Moreira, Bruno Artículo
2 openAccess 27-may-2016 A Cluster of Nucleotide-Binding Site–Leucine-Rich Repeat Genes Resides in a Barley Powdery Mildew Resistance Quantitative Trait Loci on 7HL Pérez Cantalapiedra, Carlos ; Contreras-Moreira, Bruno ; Silvar Casao, Cristina ; Perovic, Dragan; Ordon, Frank; Gracia Gimeno, María Pilar ; Igartua Arregui, Ernesto ; Casas Cendoya, Ana María Artículo
3 closedAccess jun-2016 A shotgun proteomic approach reveals that fe deficiency causes marked changes in the protein profiles of plasma membrane and detergent-resistant microdomain preparations from beta vulgaris roots Gutiérrez-Carbonell, Elain; Takahashi, Daisuke; Lüthje, Sabine; González-Reyes, José Antonio; Mongrand, Sébastien; Contreras-Moreira, Bruno ; Abadía Bayona, Anunciación ; Uemura, Matsuo; Abadía Bayona, Javier ; López-Millán, Ana Flor Artículo
4 closedAccess 2008 An efficient conformational sampling method for homology modeling Han, Rongsheng; Leo-Macías, Alejandra ; Zerbino, Daniel; Bastolla, Ugo; Contreras-Moreira, Bruno ; Ortiz, Ángel R. Artículo
5 openAccess feb-2017 Analysis of plant pan-genomes and transcriptomes with GET_HOMOLOGUES-EST, a clustering solution for sequences of the same species Contreras-Moreira, Bruno ; Pérez Cantalapiedra, Carlos ; García-Pereira, María J.; Gordon, Sean P.; Vogel, John P.; Igartua Arregui, Ernesto ; Casas Cendoya, Ana María ; Vinuesa, Pablo Artículo
6 openAccess oct-2015 Analysis of the DNA-binding activities of the Arabidopsis R2R3-MYB transcription factor family by one-hybrid experiments in yeast Kelemen, Zsolt; Sebastián Yagüe, Álvaro ; Xu, Wenjia; Grain, Damaris; Salsac, Fabien; Avon, Alexandra; Berger, Nathalie; Tran, Joseph; Dubreucq, Bertrand; Lurin, Claire; Lepiniec, Löic; Contreras-Moreira, Bruno ; Dubos, Christian Artículo
7 openAccess ene-2015 BARLEYMAP: physical and genetic mapping of nucleotide sequences and annotation of surrounding loci in barley Pérez Cantalapiedra, Carlos ; Boudiar, Ridha ; Casas Cendoya, Ana María ; Igartua Arregui, Ernesto ; Contreras-Moreira, Bruno Artículo
8 openAccess 2006 Comparative footprinting of DNA-binding proteins Contreras-Moreira, Bruno ; Collado-Vides, Julio Artículo
9 openAccess dic-2017 Comparative plastome genomics and phylogenomics of Brachypodium: flowering time signatures, introgression and recombination in recently diverged ecotypes Sancho, Rubén; Cantalapiedra, Carlos P.; López-Alvarez, Diana; Gordon, Sean P.; Vogel, John P.; Catalán, Pilar; Contreras-Moreira, Bruno Artículo
10 openAccess 2010 Comparison of DNA binding across protein superfamilies Contreras-Moreira, Bruno ; Sancho Sanz, Javier; Espinosa Angarica, Vladimir Artículo
12 openAccess 23-ago-2010 Dissecting the expression patterns of transcription factors across conditions using an integrated network-based approach Janga, Sarath Chandra; Contreras-Moreira, Bruno Artículo
13 openAccess oct-2010 Evolutionary divergence of chloroplast FAD synthetase proteins Yruela Guerrero, Inmaculada ; Arilla-Luna, S.; Medina, Milagros; Contreras-Moreira, Bruno Artículo
14 openAccess dic-2017 Extensive gene content variation in the Brachypodium distachyon pan-genome correlates with population structure Gordon, Sean P.; Contreras-Moreira, Bruno ; Woods, Daniel P.; Des Marais, David L.; Burgess, Diane; Shu, Shengqiang; Stritt, Christoph; Roulin, Anne C.; Schackwitz, Wendy; Tyler, Ludmila; Martin, Joel; Lipzen, Anna; Dochy, Niklas; Phillips, Jeremy; Barry, Kerrie; Geuten, Koen; Budak, Hikmet; Juenger, Thomas E.; Amasino, Richard; Caicedo, Ana L.; Goodstein, David; Davidson, Patrick; Mur, Luis A. J.; Figueroa, Melania; Freeling, Michael; Catalán, Pilar; Vogel, John P. Artículo
15 openAccess dic-2013 Fine mapping of the Rrs1 resistance locus against scald in two large populations derived from Spanish barley landraces Hofmann, Kerstin; Silvar Casao, Cristina ; Casas Cendoya, Ana María ; Herz, Markus; Büttner, Bianca; Gracia Gimeno, María Pilar ; Contreras-Moreira, Bruno ; Wallwork, Hugh; Igartua Arregui, Ernesto ; Schweizer, Günther Artículo
16 openAccess ene-2014 FootprintDB: A database of transcription factors with annotated cis elements and binding interfaces Sebastián Yagüe, Álvaro ; Contreras-Moreira, Bruno Artículo
17 openAccess 9-nov-2013 Genetic recombination is associated with intrinsic disorder in plant proteomes Yruela Guerrero, Inmaculada ; Contreras-Moreira, Bruno Artículo
18 openAccess 19-oct-2009 Genome-Wide Identification of Transcription Start Sites, Promoters and Transcription Factor Binding Sites in E. coli Mendoza-Vargas, A.; Olvera, L.; Olvera, M.; Grande, R.; Vega-Alvarado, L.; Taboada, B.; Jiménez-Jacinto, V.; Salgado, H.; Juárez, K.; Contreras-Moreira, Bruno ; Huerta, A. M.; Collado-Vides, Julio; Morett, E. Artículo
19 openAccess 2013 GET_HOMOLOGUES, a versatile software package for scalable and robust microbial pangenome analysis Contreras-Moreira, Bruno ; Vinuesa, Pablo Artículo
20 openAccess may-2011 HvFT1 (VrnH3) drives latitudinal adaptation in Spanish barleys Casas Cendoya, Ana María ; Djemel, Abderrahmane ; Ciudad, Francisco J.; Yahiaoui, Samia ; Ponce Molina, Luis Jonatan ; Contreras-Moreira, Bruno ; Gracia Gimeno, María Pilar ; Lasa Dolhagaray, José Manuel ; Igartua Arregui, Ernesto Artículo

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