Source: http://studylib.es/doc/8776721/el-armamento-de-los-protozoarios-par%C3%A1sitos
Timestamp: 2018-08-21 07:58:09+00:00

Document:
El armamento de los protozoarios parásitos
NUM 13. SEPTIEMBRE-DICIEMBRE 2015
La Electroforesis de Campos Pulsados en Minigeles:
Una alternativa rápida, fiable y económica
Genomas, descifrando la vida
Dra. Elizbeth Álvarez
Dra. Elisa Azuara
Dra. Minerva Camacho
Dr. Mauricio Castañón
Dr. Cesar López Camarillo
Dra. Lilia López Cánovas
Dr. Humberto Nicolini
Dr. José de Jesús Olivares
Dra. Martha Yocupicio
Dra. Selene Zárate
RESPONSABLE DE LA EDICIÓN DE ESTE NÚMERO
RESPONSABLE DE GENÓMICAS HOY
Dr. César López Camarillo
Posgrado en Ciencias Genómicas
Avenida San Lorenzo 290, Colonia Del Valle
Delegación Benito Juárez, C.P. 03100, Ciudad de México
5488 6661 ext. 15313
http://www.uacm.edu.mx/genomicas
genomicas_ucm@yahoo.com.mx
Publicación cuatrimestral, 2500 ejemplares.
Nuestros Investigadores pág. 2
Publicaciones científicas recientes del PCG-UACM pág. 3
Graduados pág. 4
Nuevos Proyectos del PCG-UACM pág. 5
El armamento de los protozoarios parásitos pág. 6
De nuestros colaboradores pág. 10
Proyectos del PCG-UACM pág. 16
Genomas, descifrando la vida pág. 18
Noticias del mundo de la Ciencia pág. 25
Anuncios pág. 28
CienciArte pág. 29
Desde el portaobjetos pág. 32
Dra. Lilia López-Cánovas
Asesora Académica del
Posgrado en Ciencias Genómicas de la
Nació en La Habana, Cuba. Es Médico
Especialista en Bioquímica Clínica por la Facultad
de Ciencias Médicas del Instituto Superior de
Ciencias Médicas de La Habana y Doctora en
Ciencias Médicas por el Centro Nacional de
Investigaciones Científicas de La Habana.
Médico egresada del Instituto Superior de
Ciencias Médicas de La Habana, Cuba, en 1986.
Realizó la Especialidad en Bioquímica Clínica en el
Departamento de Genética del Centro Nacional
de Investigaciones Científicas de La Habana
(CNIC, 1986-1989) estudiando un polimorfismo
del gen del receptor de LDL y su asociación con
los niveles séricos de lípidos en la población
cubana. Obtuvo el Doctorado en Ciencias
Médicas en el CNIC en el año 1998 investigando
los factores que afectan la migración de las
moléculas de ADN en Electroforesis de Campos
Pulsados. La Dra. López-Cánovas recibió por su
trabajo de doctorado el Premio Anual por la Tesis
de Doctorado más Destacada en el Dominio de
las Ciencias Biomédicas otorgado en 1998 por
la Comisión Nacional de Grados Científicos de la
Después de concluir sus estudios de doctorado,
la Dra. López-Cánovas continuó trabajando en el
CNIC y posteriormente en el Departamento de
Biología Molecular del Centro de Neurociencias
de Cuba en el desarrollo de métodos y equipos
nuevos basados en técnicas moleculares para el
diagnóstico en el campo de la genética humana,
de microorganismos y en la epidemiología
molecular de enfermedades infecciosas.
Realizó estancias postdoctorales y trabajos de
colaboración en el Departamento de Patología
Experimental del CINVESTAV-IPN estudiando
la organización del material genético de la
Alcanzó la categoría de Investigador Titular de la
Academia de Ciencias de Cuba y en la actualidad
es miembro (nivel I) del Sistema Nacional de
Investigadores. Posee más de 70 publicaciones
científicas, 34 de ellas en revistas indexadas en
la web of science; cuatro patentes de invención
concedidas en más de 20 países, dos de ellas
concedidas en México; seis modelos industriales
y cinco registros de software en Cuba. Ha
tutorado 1 doctorado, 6 maestrías en ciencias y
5 licenciaturas. Posee 8 desarrollos tecnológicos
y más de 90 trabajos presentados en eventos
científicos. Ha recibido varios premios de
la Academia de Ciencias y del Ministerio de
Educación de Cuba.
La Dra. López-Cánovas se incorporó como Asesora
Académica al Posgrado en Ciencias Genómicas
en Enero del 2013. En la actualidad imparte clases
a los estudiantes de la Licenciatura y Maestría en
Ciencias Genómicas. Realiza investigación en el
campo de la genética molecular humana.
Imagen: Paul & Lindamarie Ambrose
recientes del PCG
La publicación de resultados de los proyectos de investigación en revistas científicas internacionales con arbitraje estricto, constituye un importante indicador de la calidad e impacto de las investigaciones realizadas en el PCG-UACM.
Carvajal-Gamez B.I., Quintas-Granados L.I.,
Arroyo R., Vázquez-Carrillo L., Ramón-Luing
L.; Carrillo-Tapia E., Alvarez-Sánchez M.E.
Putrescine-dependent re-localization of TvCP39,
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profiling reveals that EhPC4 transcription induces
cell migration through up regulation of the 16
kDa actin-binding protein EhABP16 in Entamoeba histolytica.
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Desde el año 2003 a la fecha, en el PCG-UACM se han graduado
57 estudiantes de Maestría y 9 de Doctorado en Ciencias Genómicas.
Q.F.B. Carlos Alberto Galicia Silva
27-Ene-14
Identificación y caracterización del
metaloproteoma de Trichomonas vaginalis
Tutor: Dra. Elizbeth Álvarez Sánchez
Q.F.B. Hugo Gildardo Castelán Sánchez
02-Dic-14
Estudio comparativo de los procesos
evolutivos en la proteína de envoltura de los
miembros de la familia Flaviviridae
Tutora: Dra. Claudia Selene Zárate Guerra
Q.B.P. Yolanda Eliana Manriquez Treviño
Determinación de la posible secuencias
nucleotídica del elemento ERE del RNAm de
tvcp39 que participa en la interacción con
TveIF-5A en Trichomonas vaginalis
Tutora: Dra. Elizbeth Álvarez Sánchez
MIGUEL ANGEL FONSECA SANCHEZ
Perfiles de expresión de microRNAs en
cáncer de mama y análisis de la participación
de miR-944 y miR-18b en la adhesión focal y
Tutor: Dr. Mario César López Camarillo
1er Lugar en el Área de Investigación, Junio 2014. Otorgado por el Colegio de Químicos Clínicos del
Estado de Michoacán A.C.
Carlos Galicia, José Luis Villalpando, Laura Vázquez, Elizbeth Álvarez. Identificación del gen mp50
en aislados de Trichomonas vaginalis de pacientes con tricomoniasis y co-evaluación de la actividad
proteolítica entre un aislado masculino y femenino.
nuevos Proyectos del PCG-uacm 2013-2015
Dr. Mauricio Castañon. Evaluación de las coincidencias y diferencias en la respuesta de macrófagos bovinos
y humanos durante la infección con Mycobacterium. Fondo de Investigación en Ciencia Básica. SEPCONACYT.2013-2015
Dr. Mauricio Castañon. “Evaluación del efecto de la sobreexpresión de rpfC en la expresión de genes de latencia
y la supervivencia de M. bovis. Proyecto UACM-SECITI 2014-2015.
Dra. Elisa Azuara Liceaga. Factores de unión a repetidos teleméricos (TRFS) de Entamoeba histolytica: La
importancia de mantener la integridad del genoma. CONACyT Ciencia Básica 2013-2016.
Dr. Mario Cesar López Camarillo. Análisis funcional de microRNA 2014 en cáncer de mama. CONACyT Ciencia
Básica 2013-2016.
Dr. José de Jesús Olivares. Estudio de la captación de hierro por la proteína GroEL (chaperonina) de Helicabacter
pilori. CONACyT Ciencia Básica 2013-2016.
PARTICIPACIÓN DEL PCG-UACM EN CONGRESOS NACIONALES E INTERNACIONALES
El trabajo realizado en el PCG-UACM ha sido divulgado en diversos
congresos nacionales e internacionales. En estos eventos se exponen
los resultados más relevantes de las investigaciones que realizan los
profesores-investigadores y estudiantes de Maestría y Doctorado.
XL CONGRESO NACIONAL DE INFECTOLOGÍA Y MICROBIOLOGÍA CLÍNICA 2015, San Luis
Potosí, SLP. Evaluación del perfil de miRNA’s en respuesta a la infección con Mycobacterium
Castañón-Arreola M., Hernández-de la Cruz O.N., González-Barrios J.A., Barrios-Payan J.A.
Hernández-Pando R.
El armamento de los
protozoarios parásitos:
las cisteína proteinasas que participan en la infección
Dr. Jonathan Puente Rivera
El éxito o fracaso de una campaña en la
mayoría de los conflictos bélicos siempre
ha dependido, de manera general, de la
superioridad estratégica que imponga uno de
los beligerantes sobre el otro en algún aspecto
particular, ya sea mediante el reconocimiento
y adaptación al terreno, el espionaje, la mayor
cantidad de tropas, el equipo o el armamento.
La utilización de armas para atacar al bando
contrario determinará el resultado del
conflicto: mientras mejores armas posean,
capaces de causar más daño al oponente, más
posibilidades tendrán de derrotarlo.
En el ámbito biológico, los procesos infecciosos
ocasionados por los protozoarios parásitos
en los humanos no difieren mucho de los
conflictos armados; en ambos casos, se trata
de conseguir la superioridad en un terreno
específico con cualquiera de las estrategias
mencionadas. Los protozoarios parásitos para
poder sobrevivir, establecen una “guerra”
con la víctima o huésped y tratan de infectar
algún sitio particular del mismo, con lo cual
como en cualquier conflicto, el organismo del
huésped responderá utilizando sus defensas
con el fin de eliminar la amenaza e impedir
que la infección progrese, lo cual llevará a
una inminente confrontación, pero a escala
Continuando con la analogía presentada,
es obvio que los dos bandos utilizarán el
armamento biológico que poseen para
responder a las amenazas de cada uno de
los involucrados. Por el lado del huésped,
algunos componentes del sistema inmune se
activarán para dañar a los parásitos invasores,
y estos últimos, responderán con su arsenal
para llevar a cabo finalmente su objetivo,
establecer la infección. El arsenal biológico
de los parásitos protozoarios está compuesto
de varias proteínas conocidas como factores
de virulencia que pueden causar diversos
efectos en las células del huésped. Existen
diversos factores de virulencia, pero en este
caso, nos ocuparemos de un tipo de proteínas
particulares: las proteinasas. Estas son enzimas
que hidrolizan enlaces peptídicos y convierten
a las proteínas en unidades más pequeñas
denominados péptidos, y son encontradas en
organismos como virus y hasta en mamíferos,
realizando varias funciones1. Existe una
gran variedad de estas “armas biológicas”
(proteinasas), por lo que los científicos las
clasifican de acuerdo con sus mecanismos
catalíticos, es decir, su forma de cortar las
proteínas. En dependencia del aminoácido que
participe en la catálisis se distinguen diferentes
tipos de proteinasas: serina, treonina,
aspártico, metalo o cisteína proteinasas2. Estas
últimas, están a su vez divididas en familias y
en clanes. Particularmente, los protozoarios
parásitos son un grupo diverso de organismos,
donde algunos de sus factores de virulencia
pertenecen a las cisteína proteinasas (CPs)3 y
además de que sean utilizadas como “armas”
estas CPs cumplen funciones biológicas en
los mismos, como actividad catalítica4, o en el
metabolismo degradando proteínas exógenas
como es en el caso de Trypanosoma cruzi,
Trichomonas vaginalis, Plasmodium falciparum,
diferentes especies de Leishmania y Entamoeba
histolytica5.
Sin embargo, cuando estos organismos
deciden utilizar estas CPs como armamento en
la batalla contra el huésped, ignorando lo que
planteó SunTzu en su obra El Arte de la Guerra,
(Las armas son instrumentos fatales que
solamente deben ser utilizadas cuando no hay
otra alternativa) es donde el asunto se vuelve
más interesante y complejo, como veremos a
P. falciparum es el agente causal de la malaria,
la cual se estima afecta a 207 millones de
personas anualmente6. Este protozoo presenta
una proteinasa llamada Falcipaina-2, que es
capaz de degradar gramos de hemoglobina
del huésped durante su ciclo asexual en el
eritrocito, incluso en infecciones moderadas.
De esta manera se deja claro el potencial
de esta arma al destruir una proteína muy
importante para el huésped 7. Al igual que en
una batalla, este parásito invade el terreno
internándose en los eritrocitos del huésped
para invadir posteriormente a otras células
del organismo por lo que requiere de otra CP
la cual actúa desestabilizando la unión entre
anquirina y la banda 3 del citoesqueleto del
eritrocito, facilitando su liberación8.
En T. cruzi, el agente causal de la enfermedad de
Chagas, la cruzipaina, es un factor de virulencia
involucrado en varios pasos críticos en la
interacción con las células del mamífero, como
son la invasión, supervivencia, diferenciación
y multiplicación 9,10. Es claro que T. cruzi utiliza
este armamento para tomar ventajas en su
microcampo de batalla, causando múltiples
efectos en el huésped.
La L. mexicana, el agente causal de la forma
más leve de leishmaniasis, es otro protozoario
que presenta una CP, llamada CPB, la cual es
necesaria para llevar a cabo su ciclo de vida.
La CPB actúa como un factor de virulencia
en células de mamíferos siendo necesaria
para la invasión eficiente de estos parásitos
a los macrófagos del huésped11, además de
que modula el tipo de respuesta inmune,
induciendo una respuesta que es más tolerable
por parte del parásito 12. Sin duda, un arma muy
eficiente que le concede una enorme ventaja
al parásito, anulando el mecanismo por el cual
este puede ser eliminado13.
Las CPs de E. histolytica, agente causal de
la amibiasis, se han implicado en la invasión
y destrucción de los tejidos, y han sido
identificadas como importantes factores de
virulencia14.
Uno de los organismos con una verdadera
armería de proteinasas es T. vaginalis, agente
causal de la tricomonosis que se estima afecta
a 270 millones de personas anualmente15.
T. vaginalis es un parásito rico en actividad
proteolítica (dependiente de CPs), se han
identificado al menos 23 proteinasas de entre
23 y 110 kDa 16 y algunas CPs están involucradas
en citoadherencia, hemólisis, citotoxicidad,
degradación o alteración del citoesqueleto,
de la membrana celular y degradación de
inmunoglobulinas humanas17, además que
pueden participar otros factores como el
hierro 18 para modular sus funciones (Figura 1).
Sin duda, T. vaginalis tiene una muy importante
ventaja al momento de ir a combatir al huésped
para establecer la infección.
Observando todos los ejemplos anteriores
parece claro que si en verdad la infección
protozoaria fuera un conflicto bélico, los
mamíferos no tendríamos ninguna oportunidad
de salir victoriosos de el. El invasor al parecer
supera en número y en armamento al utilizar
a estas CPs contra nuestras defensas, lo que
definitivamente parece ser su mayor fortaleza.
Las CPs utilizadas como armas tienen efectos
tan certeros y contra funciones tan específicas,
que les otorgan innumerables ventajas a los
Figura 1. Trichomonas vaginalis adheridas a las células
prostáticas DU-145. Imagen de Yebran Villegas, estudiante de Maestría del PCG-UACM.“
parásitos frente a nosotros. Sin embargo,
aquí es donde su mayor fortaleza se puede
volver una interesante debilidad. Las CPs
están presentes aparentemente en todos los
protozoarios parásitos, lo que también las
vuelve potenciales blancos para el desarrollo
de fármacos, debido a que los mecanismos de
acción de estas enzimas son similares entre las
CPs homologas de diversos organismos1. Con
esta información se podría crear una biblioteca
de compuestos inhibidores de este mecanismo
de defensa para tratar diferentes infecciones
parasitarias, con lo cual la aparente ventaja de
estas “armas” se vería muy reducida.
Por último, el hecho de que la mayoría de estas
CPs son inmunogénicas facilita su uso como
marcadores específicos de las enfermedades
causadas por los protozoarios parásitos,
donde el diagnóstico diferencial oportuno y
específico es importante ya que varias de estas
infecciones podrían causar más muertes que
las guerras mismas.
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Res Int. http://dx.doi.org/10.1155/2015/946787.
de nuestros COLABORADORES:
A la memoria de la Dra. Ana María Riverón
Posgrado en Ciencias Genómicas. UACM.
Plantel del Valle, San Lorenzo 290, Col. Del
Valle, Delegación Benito Juarez, 03100 México
D.F., México (55)11070280 Ext. 15314. Email:
llopezcanovas@yahoo.com
Palabras clave: electroforesis de campos pulsados,
La Electroforesis de Campos Pulsados (ECP) es
una metodología creada por los investigadores
norteamericanos David Schwartz y Charles
Cantor en 19841 que permite la separación de
moléculas de ADN de tamaño cromosómico
mediante la aplicación alternada y secuencial
de dos campos eléctricos en dos direcciones
distintas de un gel de agarosa que contiene las
muestras de ADN (Fig. 1). Durante el tiempo
de aplicación de cada campo eléctrico las
moléculas de ADN se reorientan en la dirección
del mismo y después migran durante la porción
del tiempo restante. El tiempo que las moléculas
consumen en reorientarse se denomina tiempo
de reorientación y depende del tamaño de las
moléculas. Como las moléculas mas grandes
poseen mayores tiempos de reorientación
que las más pequeñas, les toma más tiempo
reorientarse por lo que se retrasan con
respecto a estas últimas y es de esta manera
que se separan unas de otras.
La ECP ha permitido incrementar el rango
de resolución de la electroforesis desde las
20kb hasta las 5 Mb, cubriendo el rango de
tamaños que no se podía resolver ni por la
electroforesis convencional ni las técnicas
citogenéticas. Las aplicaciones al inicio de
la metodología fueron la separación del
ADN de tamaño cromosómico de levaduras,
hongos y parásitos unicelulares en patrones
de bandas que se les denominaron cariotipos
electroforéticos, así como el análisis de
grandes regiones del genoma de mamíferos.
Desde hace ya algunos años la metodología
se ha vuelto la de elección para resolver en
por unas pocas variables experimentales
para obtener buenas separaciones de las
mezclas de moléculas de ADN. Sin embargo,
tal y como se describió inicialmente
la metodología de ECP posee algunas
limitaciones que persisten hasta hoy en día
en los equipos que comercializa BioRad.
-Se consumen tiempos que oscilan entre 1830h para separar las moléculas de ADN.
Figura 1. Esquema de las reorientaciones en Electroforesis
de Campos Pulsados
patrones de bandas los macrofragmentos
de restricción del ADN genómico bacteriano
y con esta información subtipar aislados
bacterianos de una misma cepa2.
El diseño por Chu y cols. del sistema CHEF
(del ingles Contour-Clamped Homogeneous
Electric Field) en 1986 constituyó la
mayor innovación en el desarrollo de
configuraciones de electrodos en los
sistemas de ECP3. En este sistema los campos
eléctricos a lo largo y ancho del gel son
uniformes. En consecuencia, los trayectos
de migración son rectos a todo lo ancho del
gel por lo que los patrones de bandas son
comparables entre carrileras, además de
que esta configuración resuelve moléculas
de ADN hasta el rango de las 10 Mb.
El sistema CHEF se ha vuelto el más popular
porque además de las ventajas mencionadas
la instrumentación que se ha logrado hasta
el momento en los equipos comerciales
de los laboratorios Bio-Rad ha permitido
que el usuario sólo tenga que preocuparse
-Se consumen 16-24h para preparar las
muestras de ADN y gran cantidad de
reactivos químicos y biológicos en cada uno
de los experimentos.
-La guía para el diseño de los experimentos
está basada en la experiencia de los
La Dra. Ana María Riverón y su grupo de
investigación en el Centro Nacional de
Investigaciones Científicas y posteriormente
en el Centro de Neurociencias en La Habana,
Cuba, introdujeron a partir de 1994 una serie
de modificaciones a la metodología de ECP
que ha permitido resolver la mayoría de
las limitaciones de la misma, proveyendo a
la comunidad científica de una alternativa
rápida y poca costosa para analizar mediante
ECP el genoma de los microorganismos.
Una de las primeras contribuciones de la
Dra. Riverón y el grupo que ella dirigió fue
desarrollar un modelo cinético para explicar
como ocurría la migración del ADN en ECP4,5.
Dicho modelo explica como se consume el
tiempo que está conectado cada campo
eléctrico (‘tp’, tiempo del pulso) en cada
una de las dos direcciones del gel. Con este
modelo se formalizó matemáticamente
que la migración por pulso de las moléculas
de ADN de un determinado tamaño en el
sistema CHEF era una función monótona
creciente del ‘tp’ y que durante la aplicación
de un único pulso las moléculas de ADN se
podían mover a dos velocidades diferentes.
Cuando el ‘tp’ es mayor que el tiempo de
reorientación de las moléculas de ADN, ellas
invierten una parte del mismo en reorientarse
y el resto en migrar a una velocidad que se
denominó velocidad de migración después
de la reorientación. Sin embargo, si el ‘tp’ es
igual o menor al tiempo de reorientación del
ADN, durante toda la duración del mismo
las moléculas estarán reorientándose en la
nueva dirección del campo y se moverán a
una velocidad que se denominó velocidad
de migración durante la reorientación y
que siempre es menor que la velocidad a
la que migran después de la reorientación.
Unos años mas tardes, este mismo grupo
de investigadores basándose en ese
modelo cinético y el modelo de reptación
de Lumpkin y Zimm en electroforesis
convencional obtuvo una ecuación general
que describe la migración de las moléculas
de ADN de cualquier tamaño, bajo
cualquier intensidad de campo eléctrico,
temperatura del tampón y tiempo de pulso
en el sistema CHEF6. La obtención de esta
ecuación permitió desarrollar simuladores
automatizados de los patrones de bandas
del ADN que se obtendrían en el CHEF, así
como diseñar los experimentos, lo cual sólo
se realizaba mediante la recopilación del
conocimiento experto de los investigadores
que fue acumulándose mediante múltiples
ensayos de prueba y error durante muchos
años de experimentación.
Una de las contribuciones más importantes
de la Dra. Riverón y su grupo de
colaboradores fue el desarrollo de versiones
miniaturizadas de los equipos de ECP, de
los sistemas CHEF y TAFE, que realizan las
separaciones en minigeles7. En estos equipos
de electroforesis de campos pulsados en
minigeles el principio de las separaciones
es el mismo que en las versiones originales,
pero se obtienen las separaciones en al
menos una tercera parte del tiempo debido
a que poseen una distancia pequeña
entre los pares opuestos de electrodos. El
campo eléctrico es la fuerza motriz de la
electroforesis y se calcula como el voltaje
aplicado dividido entre la distancia entre
Figura 2. Patrones de bandas del ADN cromosomal de
cepas de Acinetobacter baumanii digerido con SfiI y resuelto en la minicámara CHEF en 5h y 20min de electroforesis. 40-3s de tiempo de pulso, 10V/cm, agarosa 1.5% en
TBE 0.5X a 20oC (Cortesia de la Maestra Yainelys Garrido,
CNeuro).
los pares de electrodos opuestos (ánodocátodo). En consecuencia, si en las cámaras
de ECP se disminuye la distancia entre dichos
pares de electrodos aplicando el mismo
voltaje se alcanzan campos eléctricos más
elevados, lo cual disminuye los tiempos de
reorientación e incrementa las velocidades
de migración de las moléculas de ADN. De
esta forma es posible obtener,en un tiempo
mucho menor, los mismos patrones de
resolución de las moléculas de ADN que si se
aplicaran campos eléctricos menos elevados
Otra de las limitaciones de la ECP se refiere al
consumo de reactivos químicos y biológicos
tanto en la realización de las electroforesis
como durante la preparación de las muestras
de ADN. Las cámaras miniaturizadas del
sistema CHEF sólo consumen 400 ml de
tampón en su interior y el tamaño de los
geles es de 5 x 7 x 0.5 (largo x ancho x grosor
en cm). Estas dimensiones contrastan con
los 2 L de tampón que requieren las versiones
originales de las cámaras CHEF y de los geles
que son de al menos 14 x 13 x 0.5 cm. Cabe
recordar que las muestras de ADN que se
analizan en ECP se preparan inmovilizadas
en agarosa para evitar su ruptura al azar.
El procedimiento utilizado consiste en
inmovilizar en bloques de agarosa células
intactas e in situ lisar las células y liberar y
desproteinizar las moléculas de ADN. Esto
permite obtener ADN intacto del tamaño
de las megabases. En este procedimiento
se utilizan enzimas líticas para formar
protoplastos o esferoplastos y proteinasa
K para desproteinizar los ADN y los tiempos
de tratamiento pueden durar 8-16h. En
1994, el grupo de la Dra. Riverón dio a
conocer un procedimiento que no utilizaba
proteinasa K ni enzimas líticas, solamente
reactivos químicos, para preparar ADN
intacto de S. cerevisiae y que rendía en 6-8h
ADN adecuado para obtener los cariotipos
electroforéticos de ese microorganismo8,9.
A partir de ese momento dicho grupo de
investigadores desarrollaron una serie de
protocolos basados en ese procedimiento
no enzimático para obtener en un día
de trabajo ADN intacto de E. histolytica
y de bacterias como E. coli, P. aeruginosa,
Vibrio cholerae, Aeromonas, Salmonella y S.
pyogenes, adecuado para ECP. De igual forma
reportaron protocolos estandarizados
para resolver en la minicámara CHEF los
patrones de bandas del genoma de esos
microorganismos digeridos con diferentes
enzimas de restricción10-15. Los mencionados
protocolos brindan patrones de bandas con
igual resolución y comparables con los que
se obtienen en las cámaras CHEF de mayores
dimensiones incluidas las que comercializa
la BioRad12,14,16(Fig. 3).
Los sistemas miniaturizados de ECP poseen
versiones comerciales denominadas Guefast
que incluyen además de las minicámaras de
ECP el software de simulación17. De igual
forma, los métodos de preparación de ADN
genómico intacto e inmovilizado de bacterias
y levaduras han sido incorporados en los
kits de reactivos BacKit y Levkit17. Ambos
productos son producidos y comercializados
en la actualidad por las firmas Neuronic S.ACuba y Neuronic Mexicana S.A. de C.V. y
están protegidos por patentes en diferentes
países17-20.
alternativas confiables, rápidas, económicas
y accesibles para los laboratorios que
requieren de la metodología, así como un
ejemplo de que en nuestros países es posible
la investigación a ciclo completo desde el
desarrollo de la ciencia básica, la generación
de un producto y su posterior transferencia
tecnológica para ser comercializado.
Figura 3. Patrones de bandas del ADN genómico de Salmonella Braenderup digerido con XbaI resueltos en las minicámara CHEF (1) y en la cámara CHEF (2) (DRIII BioRaD)
durante 5h, 30 min y 18h, respectivamente. (M) l mers.
kb: kilo pares de bases. Zonas de resolución a, b, cminiCHEF =
a, b, cCHEF (Pt2 de Hotelling=0.05). Basada en la información publicada en Lopez-Canovas L. et al., Anal. Biochem.388,2:
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y juego de reactivos empleado. Patente:
México 24617; Estados Unidos US 7,731,828;
Europa EP1350852; Canada 2,428,313;
Japón 3955817; India 243278; Hong Kong
HK1063822; Ecuador 08-1915; Turquía TR
2007 01530; Portugal PT1350852; Dinamarca
DK/EP1350852;
DE60125832;
España 2 276843; Cuba 23095.
19-Herrera Isidrón J.A., Riverón A.M., Canino
Ramos C.A., Lopez-Canovas L., Noa Blanco
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electrodes of trays used in the CHEF Pulsed
Electrophoresis System Patente:
México 265145; Europa EP1406087; Canada
2,449,743; Estados Unidos US 7,556,726;
Japón 4113494; China 307760; Cuba 22855.
20-Riveron
Lopez-Canovas
ArencibiaDiaz O, Herrera J.A, PerezPerez
G., Orozco Orozco E., Canino Ramos C.A.,
GigatoPerez R., Batista L.M., Ruiz Esquivel
L., Noa M.D., Javert E. Pulsed Field Gel
Electrophoresis chambers, accessories
and methods of use for the separation of
DNA molecules. Patente Estados Unidos
US 8,034,225; US Patent 7,189,316; Europa
EP1291649; España 2 334978; Portugal
PT1291649; Cuba 22849; Cuba 22782.
PROYECTOS DEL PCG
En esta sección se resumen algunos de los trabajos
de tesis experimental que desarrollan actualmente
los estudiantes del PCG.
PROTEÍNA DE TIPO L-PSP PRESENTE EN Trichomonas vaginalis
M. en C. Alma Villalobos Osnaya
Estudiante de Doctorado en Ciencias Genómicas
EEn 1995, Tatuzo Oka, identificó proteínas del
hígado de rata que fueron solubles en ácido
perclórico, estas fueron llamadas L-PSP (del
inglés Liver-Perchloric Acid-Soluble) [1]. Estas
proteínas han sido descritas en organismos
como humano [2-3], mosca [4], levadura [5], y
bacterias [6], se clasifican dentro de la familia
YER057c/YjgF por la similitud que presentan
con las proteínas de levadura (YER057c) y de
Escherichia coli (yjgf) ademas se han descrito
como una familia de proteínas multifuncionales. Algunos reportes han indicado la participación de las proteínas L-PSP en procesos biológicos como inhibidores de la traducción [1],
RNAsa [2], chaperona [4], regulación de isoleucina [6], estabilidad del genoma mitocondrial
[5] y su participación en el desarrollo del cáncer [7].
Estas son proteínas pequeñas de aproximadamente ~14 kDa [8], su unidad funcional se constituye de un homotrímero. Cada subunidad presenta una estructura de barril rodeada por dos
hélices α y seis hojas β. [8-10].
En parásitos como Entamoeba histolytica se ha
reportado una proteína de esta familia como
miembro de la maquinaria de degradación de
los RNAm [11] y en Leishmania infantum se propone que está involucrada en la sobrevivencia
del parásito [12]. Dentro del grupo de investigación de la Dra. Álvarez-Sánchez del PCG-UACM,
estudió la presencia de estas proteínas solubles en ácido perclórico del parásito Trichomonas vaginalis. Este parásito es de importancia
médica y es el agente causal de la tricomoniasis
una infección de transmisión sexual que afecta
el tracto urogenital del humano representando
un problema de salud pública a nivel nacional,
con un alta prevalencia.
Mediante análisis in silico del genoma de T. vaginalis, se identificaron tres marcos de lectura
abierto que codifican para proteínas L-PSP y
utilizando herramientas de biología molecular
se logró demostrar que al menos uno de estos
genes se expresa. Posteriormente se obtuvo la
proteína recombinante de T. vaginalis a la cual
llamamos TvL-PSP y fue usada para la producción de anticuerpos policlonales anti-TvL-PSP,
de manera interesante mediante la inmunodeteccion con ese anticuerpo se observó la for-
Esto es importante para mostrar un panorama
de cómo se podrían regular algunos genes que
participan en propiedades de virulencia del parasito, y proponer algún blanco terapéutico o
de diagnóstico de la infección.
Figura 1. Predicción de estructura monomérica y homotrimérica de la proteína TvL-PSP de T. vaginalis utilizando el
programa VMD (Visual Molecular Dynamics).
mación de una estructura cuaternaria, lo cual
concuerda con lo reportado en otros organismos. En vías de corroborar la estructura cuaternaria de esta proteína se ha hecho uso de
algunas técnicas como dicroísmo circular, cromatografía de exclusión molecular, dispersión
de luz, con las cuales se ha podido comprobar
la estructura homotrimerica de la proteína TvLPSP (Fig. 1) y mediante microscopia electrónica
de transmisión se ha inmunolocalizado a TvLPSP en núcleo, hidrogenosoma y citoplasma de
Por otro lado, para determinar la posible función de TvL-PSP en T. vaginalis se realizó un
análisis in silico encontrando un posible dominio de endorribonuclesa. Este hallazgo resultó
interesante, debido a que esta proteína podría
estar participando en la maquinaria de degradación del RNAm al igual que lo reportado en
E. histolytica [11] .
En el caso particular de T. vaginalis, han sido
descritos mecanismos de regulación génica, los
cuales se basan en la estabilidad de los RNAm,
como son por interacción proteínas-RNA (IRE/
IRP), sin embargo, no han sido propuestos mecanismos de degradación del RNAm que pueda
ser per se un mecanismo de regulación de la
expresión génica en este parásito.
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GENOMAS,
(C. elegans)
Lic. Cisneros de Alba C. Montserrat
en Ciencias Genómicas
En 1963, el biólogo sudafricano Sydney Brenner (Premio Nobel de Fisiología y Medicina en
2002) observó que el éxito de la biología molecular se debe a la existencia de sistemas de
modelos, definidos como organismos extremadamente simples, tales como los fagos bacterianos que se pueden manipular en grandes
cantidades. Con la conciencia de lo importante
que son los sistemas modelo en la investigación biológica, introdujo a Caenorhabditis elegans (C. elegans), como un organismo modelo
para actividades de investigación en biología
del desarrollo y neurología. Caenorhabditis elegans (Caeno, reciente; Rhabditis, vara, elegans,
agradable), informalmente conocido como “el
gusano”, es un nemátodo no parásito de vida
libre que se encuentra en el suelo de cualquier
parte del mundo y que puede ser ampliamente
utilizado con seguridad en el laboratorio como
un sistema modelo para el estudio de la biología de los metazoos.1
Debido a su pequeño genoma y su anatomía
simple se ha convertido en un organismo modelo muy atractivo para resolver preguntas tan
diversas como: ¿Por qué envejecen los seres
vivos?, ¿Cómo se forma un organismo?, ¿Cómo
funcionan las neuronas?, ¿Cómo se diferencia
una célula?, ¿Qué determina el comportamiento de un organismo? y muchas otras más.2
EL ESTELAR: Caenorhabditis elegans
Es un organismo multicelular que se desarrolla
a partir de un óvulo fecundado en un gusano
adulto como lo hace un ser humano.3
Su tamaño es de 1mm de longitud aproximadamente, es transparente lo que, podría dificultar
su manipulación y observación, se alimenta de
bacterias, tales como E. coli, y puede ser fácilmente cultivado en grandes cantidades en el
laboratorio (10 000 gusanos/placa petri). C. elegans tiene cinco pares de autosomas y un par
de cromosomas sexuales. Tiene dos sexos, hermafrodita y macho. La determinación sexual
en C. elegans es similar a Drosophila; la propor-
ción de cromosomas sexuales para autosomas
determina su sexo. Si el sexto par de cromosomas es XX, C. elegans será un hermafrodita.
Una combinación XY en el sexto par de cromosomas producirá un macho. Los hermafroditas
pueden auto-fertilizarse o aparearse con los
machos, pero no puede fertilizarse mutuamente. En la naturaleza, los hermafroditas son el
sexo más común. Cuando éstos se aparean con
los machos, 50% de la progenie serán machos
y 50% serán hermafroditas. En el laboratorio, la
autofecundación de los hermafroditas o cruza
con los machos puede ser manipulada para producir progenie con los genotipos deseados que
son especialmente útiles para el estudio genético. Además, C. elegans es extremadamente fecundo, un hermafrodita puede producir de 300
a 350 crías bajo autofecundación y más si se
aparea con machos. Estas características hacen
que sea fácil de producir numerosos genotipos
y fenotipos para la investigación genética.1, 4, 5
Lo que hace especial a este organismo es que
tiene un ciclo de vida corto. El ciclo de huevo a
larva tarda unos 3 días, el mismo tiempo nece-
sario para realizar cruces genéticos en levaduras. Su vida útil es de alrededor de 2 a 3 semanas bajo las adecuadas condiciones de vida. En
comparación con el uso de otros organismos
modelo, tales como ratones, el corto ciclo de
vida de C. elegans se reduce al ciclo experimental y facilita el estudio biológico. Además, los
ejemplares de tipo nativo contienen una constante de 959 células, así como la posición de
éstas. Es fácil rastrear las células y seguir los
linajes celulares. El linaje celular completo que
demostró de qué células se derivaban, se completó en la década de 1980 por John Sulston.1,5,6
GENOMICAMENTE HABLANDO
El tamaño del genoma de C. elegans es alrededor de cien millones de pares de bases. Esto es
aproximadamente 20 veces mayor que el de E.
coli y corresponde a una quinta parte del genoma humano. El genoma de C. elegans se secuenció completamente al final de 1998 y es el
primer organismo multicelular (animal) que tiene un genoma secuenciado completamente.7
Robert Waterston (biólogo americano mejor
conocido por su trabajo en el Proyecto Genoma
Humano, del que fue uno de los pioneros), destacó el valor de este logro, cuando dijo: “Este
es un momento tremendamente gratificante y
más un principio que un final. Hemos proporcionado a los biólogos una nueva y poderosa
herramienta para experimentar y aprender
cómo funcionan los genomas. Seremos capaces de hacer y responder a preguntas que ni siquiera se podía pensar antes”.8 Además, como
su genoma es sorprendentemente similar al de
los seres humanos (40% de homología) C. elegans se convirtió en un organismo atractivo en
el estudio de enfermedades humanas.
Pero todo esto se remonta casi diez años an22
tes, en 1986, cuatro investigadores (Alan Coulson, John Sulston, Sydney Brenner y Jonathan
Karn), del Consejo de Investigaciones Médicas
del Laboratorio de Biología Molecular, en Cambridge, publicaron un artículo donde se propuso construir un mapa físico del genoma de este
nemátodo lo cual consistió de una colección
de fragmentos de DNA clonados, solapados
y congelados como cósmidos del tipo YAC o
clones X, además, los datos (obtenidos por la
restricción enzimática) de las características de
cada fragmentos estaban contenidos en una
base de datos para que los clones entrantes
pudieran ser comparados con los anteriores. El
mapa genético poseía, en ese momento, unos
500 loci conocidos, y este gran conjunto aumentó continuamente a través de los nuevos
genes clonados, los polimorfismos de longitud
de fragmentos obtenidos por restricción y los
puntos de interrupción genéticos por los que
los mapas genéticos y físicos pudieron ser correlacionados. Muchos clones se localizaron
en las regiones cromosómicas mediante hibridación in situ.9
Teniendo en cuenta estas prioridades, se eligió
llevar a cabo un “fingerprinting” que permitió
hacer coincidir los clones entre sí de manera
que se sobrelaparon para ser reconocidos. Se
propuso un mapeo en 2 fases. En la primera, los
clones se recogieron al azar y se compararon
entre sí para dar una mezcla de contigs (es decir, grupos de clones con secuencias de nucleótidos contiguos) y de los clones no unidos. En
la segunda, los clones fueron preseleccionados
por medio de sondas de hibridación marcadas
en los extremos de los contigs y los clones no
unidos, para llenar los gaps. 9
En 1990 se logró el financiamiento conjunto del
National Institute of Health (NIH) y el Medical
Research Conuncil (MRC) para llevar un proyecto piloto que permitió realizar la secuenciación
del genoma de “el gusano”. En ambos laboratorios, se diseñó una infraestructura que separa la producción de datos y la secuencia de las
tareas de terminación en dos actividades distintas, pero acopladas. Los grupos de producción
se centraron en la preparación del templete, las
reacciones de secuenciación y la carga de geles de secuenciación. Un objetivo clave para el
tercer año del proyecto piloto era alcanzar un
nivel de rendimiento de 1 Mb secuenciada por
año. Se pensó que si se podía llegar a este nivel
de rendimiento de secuenciación, se lograrían
alcanzar los aumentos adicionales necesarios
para completar el genoma de C. elegans y sería posible realizar la completa secuenciación
en un tiempo razonable. En agosto de 1993, el
total había aumentado a poco más de 2 Mb. En
diciembre de 1994, más de 10 Mb del genoma
de C. elegans se había terminado.10
Después de ocho años de duro trabajo se pudo
obtener la secuencia completa del cromosoma
del nemátodo C. elegans. El análisis de las 97
Mb de la secuencia total del genoma reveló la
existencia de 19 099 genes (16 260 de los cuales fueron revisados manualmente) para una
densidad media de un gen por cada 5 Kb. Cada
gen tiene un promedio de cinco intrones y 27%
del genoma reside en los exones. Además de
los genes que codifican proteínas, el genoma
del gusano contiene varios cientos de genes
de RNA no codificante. Hay 659 genes de RNAs
de transferencia (tRNAs) ampliamente dispersos, y por lo menos 29 tRNAs son derivados
de pseudogenes. Curiosamente, el 44% de los
genes de tARNs se encuentra en el cromosoma
X, que contiene sólo 20% de la secuencia total.
Varios otros genes de RNAs no codificantes, tales como aquellos para los spliceosomal RNAs,
se producen en familias multigénicas dispersas.
Otros genes de RNAs no codificantes se encuentran en forma de largos tandem arrays; los
genes del RNA ribosómico (rRNA) se encuentran únicamente en el extremo del cromosoma
I, y los genes del RNA 5S se localizan en una serie en tandem en el cromosoma V. Gran parte
de la secuencia que no codifica para proteínas
o RNAs (codificantes y no codificantes) está
implicada en la regulación de genes, la replicación, el mantenimiento y el movimiento de los
cromosomas. Una significativa fracción del genoma de C. elegans es repetitiva y se puede clasificar en repeticiones en tándem locales (por
ejemplo, repeticiones de secuencias invertidas
y simples) o repeticiones dispersas. Las repeticiones en tándem locales representan el 2,7%
del genoma y se encuentran en promedio cada
3.6 Kb. Las repeticiones invertidas representan
el 3.6% del genoma y se encuentran en promedio cada 4.9 Kb. A lo largo del genoma, estas repeticiones locales están distribuidas de manera
no uniforme con respecto a los genes.7,10
ORGANIZANDO LOS CROMOSOMAS
El genoma de C. elegans parece extraordinariamente uniforme: el contenido de GC es en
esencia constante a través de todos los cromosomas en un 36%, a diferencia de los cromosomas humanos que tienen diferentes isocoros.11 No hay centrómeros localizados como se
encuentran en la mayoría de otros metazoos.
En lugar de las secuencias extensas altamente
repetitivas, que están implicadas en la unión
del huso en otros organismos, se presentan
algunas de las muchas repeticiones en tándem
de manera dispersa entre los genes, en particular en los brazos cromosómicos. La densidad
de genes también es uniforme a través de los
cromosomas, aunque algunas diferencias son
evidentes, en particular entre los centros de los
autosomas, los brazos autosómicos y el cromosoma X, El tándem de secuencias repetidas e
invertidas tanto son más frecuentes en los brazos autosómicos que en las regiones centrales
o en el cromosoma X. Esta abundancia de repeticiones de los brazos es probablemente la razón por la cual existen tantas dificultades para
la clonación de cósmidos y la secuenciación de
las terminaciones en estas regiones.7,10
Cuando un mutante se encuentra, se puede cruzar con gusanos que tienen un fondo genético
conocido y, además, se puede aprender donde
este gen ha mutado puede, ser localizado y definir su función. Además, hay muchos mutantes
de C. elegans disponibles para la investigación
biológica, que es especialmente importante
para el estudio genético.
Las propiedades de este nemátodo y la investigación realizada con él proporciona una gran
cantidad de información y un atractivo compendio de recursos para los investigadores.
Además, este bien establecido sistema modelo
ofrece a los educadores un buen recurso en la
tis elegans. Science. Vol: 240: 1448 - 1452
7. Waterston HR. (1998). The C. elegans Sequencing Consortium: Genome sequence of the nematode C. elegans: A plataform for investigating biology.
Science. Vol: 282: 2012 - 2018.
8. BBC. Small worm makes history. On line: [21
de Septiembre de 2012, http://news.bbc.co.uk/hi/
english/sci/tech/newsid_232000/232608.stm]
9. Coulson A, Sulston J, Brenner S, Karn J. (1986).
Toward a physical map of the genome of the Caenorhabditis elegans. Proceedings of the National
Academy of Sciences USA. Vol. 38: 7821 – 7825.
10. Wilson RK. (1999). How worm was won, the C.
elegans genome sequencing project. Trends in Genetics. Vol. 15(2): 51 – 58.
11. Bernardi, G. (1995) The human genome: organization and evolutionary history. Annu. Rev. Genet.
Vol. 29: 445 – 476.
1. Donald, DL. (1997). C. elegans II. New York, NY:
2. Navarro GRE. (2003). El nemátodo Caenorhabditis elegans como modelo de estudio del desarrollo.
Ed. Facultad de Medicina, UNAM. México.
3. Angier, N. (1995). The beauty of the beastly:
new views on the nature of life. Boston, MA: Houghton Mifflin
4. Horvitz, H. R. (1997). A nematode as a model organism: the genetics of programmed death [Film].
Cogito Learning Media, Inc. On line: [21 de Septiembre de 2012, http://www.cogitomedia.com].
5. Wood, W. B. (1988). The nematode Caenorhabditis elegans. New York, NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press.
6. Kenyon, C. (1988). The nematode Caenorhabdi25
La historia de sus infecciones virales
en una gota sangre
Fotografía: Alfredo Padilla Barberi, PCG
Una nueva tecnología desarrollada por investigadores del Instituto Médico Howard
Hughes (HHMI) hace que con sólo una gota
de sangre de una persona se pueda analizar
infecciones presentes y pasadas con cualquier virus humano conocido. El método,
llamado VirScan, es una alternativa eficaz a
los diagnósticos existentes que analizan la
presencia de virus específicos uno a la vez.
Utilizando el VirScan, los científicos pueden
ejecutar un único análisis para determinar
qué virus han infectado a un individuo, en
lugar de limitar el análisis a grupos de virus
en particular. Ese enfoque imparcial podría
descubrir factores inesperados que afecten
la salud de cada paciente, y también amplía
las oportunidades para analizar y comparar
infecciones virales en poblaciones grandes.
El análisis completo se puede realizar por
alrededor de 25 dólares por muestra de sangre. Por ahora el análisis está siendo utilizado sólo como herramienta de investigación
y no está disponible de forma comercial.
Stephen J. Elledge, investigador del HHMI en
el Hospital Brigham and Women’s, condujo
el desarrollo del VirScan. “Hemos desarrollado una metodología que básicamente permite mirar el pasado en el suero sanguíneo y
ver a qué virus uno ha sido expuesto”, dice.
“En lugar de analizar los virus uno por uno,
lo que requiere una labor intensiva, podemos analizarlos a todos al mismo tiempo. Se
hace todo de una sola vez”.
Elledge y sus colegas ya han utilizado el
VirScan para analizar la sangre de 569 personas en los Estados Unidos, Sudáfrica,
Tailandia y Perú. Los científicos describieron
la nueva tecnología y publicaron sus resultados en el número del 05 de junio de 2015, de
la revista Science.
El VirScan consiste en la búsqueda de anticuerpos sanguíneos contra cualquiera de las
206 especies de virus conocidas que infectan
a los seres humanos. El sistema inmunitario
inicia la producción de anticuerpos específicos contra patógenos cuando se encuentra
con un virus por primera vez, y puede seguir
produciendo esos anticuerpos durante años
o décadas después de que se elimina la infección. Eso significa el VirScan no sólo identifica las infecciones virales contra las cuales
el sistema inmunológico está luchando activamente, sino que también proporciona una
historia sobre las infecciones pasadas de un
Para desarrollar el nuevo análisis, Elledge
y sus colegas sintetizaron más de 93.000
pequeños pedazos de ADN que codifican
para diferentes segmentos de proteínas virales. Introdujeron esos pedazos de ADN en
virus que infectan bacterias llamados bacteriófagos. Cada bacteriófago fabricó uno de
los segmentos proteicos -conocido como
péptido- y desplegó el péptido en su superficie. Como grupo, los bacteriófagos desplegaron todas las secuencias de proteínas que
se encuentran en más de 1.000 cepas conocidas de virus humanos.
Los anticuerpos en la sangre encuentran a
sus dianas virales mediante el reconocimiento de características únicas conocidas como
epítopos, que están incrustados en las proteínas de la superficie del virus. Para realizar
el análisis VirScan, todos bacteriófagos que
presentan los péptidos se ponen en contacto con una muestra de sangre. Los anticuerpos antivirales en la sangre encuentran y
se unen a sus epítopos diana que son parte
de los péptidos que se presentan. Los científicos entonces recuperan los anticuerpos
y descartan todo a excepción de los pocos
bacteriófagos que se aferran a los anticuerpos. Al secuenciar el ADN de los bacteriófagos, pueden identificar a qué piezas proteicas virales se aferraron los anticuerpos de la
muestra de sangre. Eso les indica a los científicos qué virus el sistema inmunológico de
una persona ha encontrado previamente,
ya sea por infección o por medio de vacunación. Elledge estima que el procesar 100
muestras llevaría cerca de 2-3 días, si la secuenciación funcionara de manera óptima.
Confía en que la velocidad del ensayo se incrementará con un mayor desarrollo.
Para probar el método, el equipo lo usó para
analizar muestras de sangre de pacientes
que se sabe que están infectados con ciertos virus en particular, como el VIH y el virus
de la hepatitis C. “Funcionó muy bien”, dice
Elledge. “Obtuvimos un rango de sensibilidad del 95 al 100 por ciento, y la especificidad fue buena ya que no identificamos falsamente personas que eran negativas. Eso nos
dio confianza de que podríamos detectar
otros virus, y de que cuando lo hiciéramos
sabríamos que eran reales”.
Elledge y sus colegas usaron el VirScan para
analizar los anticuerpos en 569 personas
de cuatro países, examinando unos 100 millones de potenciales interacciones anticuerpo/epítopo. Encontraron que, en promedio,
cada persona tenía anticuerpos contra diez
especies diferentes de virus. Como se esperaba, los anticuerpos contra ciertos virus
eran comunes entre adultos, pero no en los
niños, lo que sugiere que los niños aún no
habían sido expuestos a esos virus. Las personas en Sudáfrica, Perú y Tailandia, tendían
a tener anticuerpos contra más virus que las
personas en los Estados Unidos. Los investigadores también encontraron que las personas infectadas con VIH tenían anticuerpos
contra muchos más virus que las personas
sin VIH.
había identificado en la historia de toda la
exploración viral”, dice. La sorprendente
reproducibilidad de esas interacciones le
permitió al equipo refinar su análisis y mejorar la sensibilidad del VirScan, y Elledge dice
que el método seguirá mejorando a medida
que su equipo analice más muestras. Sus
descubrimientos sobre los epítopos virales
también pueden tener implicaciones importantes para el diseño de vacunas.
Elledge dice el enfoque que su equipo ha
desarrollado no se limita a anticuerpos antivirales. Su propio laboratorio también lo
está utilizando para buscar anticuerpos que
atacan a los propios tejidos del cuerpo en
ciertas enfermedades autoinmunes que se
asocian con el cáncer. Un enfoque similar
también se podría utilizar para la detección
de anticuerpos contra otros tipos de patógenos.
Noticias del Instituto Howard-Huges.
Reproducido con autorización del HHMI
http://www.hhmi.org/news/la-historia-desus-infecciones-virales-en-una-gota-sangre
Elledge dice que el equipo se sorprendió al
encontrar que las respuestas de anticuerpos
contra virus específicos eran sorprendentemente similares entre los individuos, dado
que los anticuerpos de diferentes personas
reconocían aminoácidos idénticos en los
péptidos virales. “En sólo este trabajo se
identificaron más interacciones anticuerpo/
péptido para proteínas virales de lo que se
Se solicitan estudiantes de licenciatura para realizar
tesis, servicio social y/o posgrado en proyectos de investigación genómica y proteómica en el PCG-UACM.
Se solicitan estudiantes para realizar su tesis de licenciatura y posgrado en el estudio de la expresión génica y
proteómica de T. vaginalis.
Se desarrollaran proyectos en mecanismos de regulación de la expresión génica de T. vaginalis mediado por
poliaminas, así como proyectos en expresión proteómica de la tricomonosis en hombres. Requisitos: Estar inscrito en una institución de educación superior. Contar al menos con el 75% de los créditos de la licenciatura y con
promedio general no menor a 8.0.
Informes: Dra.Elizbeth Álvarez Sánchez. Tel: 5488-6661 ext. 15306.
Email: elizbethalvarezsanchez@yahoo.com.mx
Solicito dos estudiantes para desarrollar proyectos en Genómica y Proteómica del Cáncer de Mama.
Se desarrollarán proyectos de investigación enfocados al análisis funcional de microRNAs y análisis proteómico
de biopsias de carcinomas mamarios.
Informes: Dr. César López-Camarillo. Tel: 5488-6661 ext. 15307 y 15312.
Email: cesar.lopez@uacm.edu.mx
Solicito estudiantes para realizar su tesis de licenciatura, servicio social y/o en proyectos relacionados con el
parásito Entamoeba histolytica.
Requisitos. Estar inscrito en una institución de educación superior. Contar con al menos el 75% de los créditos
de la licenciatura.
Informes: Dra. Elisa Azuara, Posgrado en Ciencias. Tel: 5488-6661 ext. 15312.
Email: elisa.azuara@uacm.edu.mx
Solicito estudiantes de licenciatura para realizar estancias de investigación, servicio social y o tesis, desarrollando proyectos de investigación sobre: Interacción entre Mycobacterium spp. y los macrófagos. Epidemiología
molecular de Acinetobacter baumanii.
Requisitos: Ser alumno regular, haber cubierto el 85% o la totalidad de sus créditos y contar con un promedio
mínimo de 8.0
Interesados contactarse con: Mauricio Castañón Arreola, Dr. En C.
Email: castanon.mauricio@gmail.com
Se solicita estudiante interesado en desarrollar su tesis de licenciatura en la línea de investigación “respuesta
Intracelular de la Infección por Virus”
Informes: Dra. Martha Yucopicio. PCG. Tel: 5488 6661 ext.15308.
Email: Martha_ym@yahoo.com.mx
conCienciArte:
El mundo de los sentidos traslapados
Eduardo Flores Soto
Profesor Investigador, UACM
ír un color, tocar con la vista, oler una
imagen, ver la música, escuchar en el fondo
de la forma, ¿Qué es esto?, ¿la poética de
los sentidos? o ¿el potencial guardado de la
experiencia perceptual del cerebro humano?
En estas mismas preguntas hay un juego, que es
lenguaje y que nos desata a la siguiente sucesión
reflexiva. La Poesía expande este mundo de metáforas,
analogías y trans-locaciones semánticas, pero ¿es sólo
lenguaje? Y en todo caso su origen ¿tiene que ver con
una experiencia sensorial transformada en palabra
poética? Y aun más, si nos atenemos al lenguaje de las
palabras y su significado, ¿estamos con la Poesía en la
orilla de una realidad más cercana a las cosas que a la
imaginación?, o ¿es esto la imaginación? Aquello que el
poeta habrá de transmitir en la palabra ¿no es a caso
una revelación de un registro extraordinario de algo
“visto” en realidad con un sentido antiquísimo alojado
en el espacio mítico del cerebro humano: en su Mente?
Sin duda armar el mundo, o mejor aún, crearlo, a partir
de la palabra o de un lenguaje, es un acto genial, pues
da cuenta de lo que podemos ver simultáneamente,
antes de que nos sea explicado bajo modelos. Pero
no habría inteligencia que abarcara el ensueño de lo
que dice esa palabra que no hubiera experimentado
antes del lenguaje las señales perceptuales integradas
a la postre del encuentro con la “realidad Real”.
Acepto que confronto una estética a una lógica de los
sentidos humanos, pues esta idea se basa en algunos
saberes formales respecto a ciertas capacidades para
decodificar, en los sentidos, las señales del mundo
y, a la vez, conjugo ese potencial con la hipótesis de
legitimar los universos que hemos entregado a la
imaginación humana a través del arte poético.
El fenómeno de la percepción sensorial ha sido terreno
de la psicología pero ahora las neurociencias abren
el estudio a las mediciones de la actividad neuronal
durante el fenómeno perceptual. La idea simple de
la precepción sensorial cobra mayor relevancia si se
lleva al terreno de la “conciencia”. Decir que “Una flor
es roja en un campo verde bajo un cielo azul donde
varios pájaros sobrevuelan a la luz del día mientras
avanzamos hacia una persona de rostro familiar”,
representa una gran prueba para los sentidos. Pero
estos objetos, su posición en el espacio, sus colores
y sus formas, no son registrados bajo un esquema
aislado de colores y formas. Son más bien integrados
a un todo “coherente” y, esta dimensión de ese
fragmento temporal de la realidad es consciente.
(Por otra parte, sabemos que es parte de un proceso
cognoscitivo desatado desde nuestro nacimiento; un
niño tanto mas presto que nosotros para el disfrute
sensorial, no lo verbalizaría con la facilidad con la
que lo exprese líneas arriba, pero por supuesto que
lo podría percibir, y tal vez con mayor intensidad que
yo, que así lo describo). En las neurociencias medir
esta “consciencia” implica determinar la forma en
que operan las redes neuronales del cerebro. Dos
cosas se plantean al respecto. La primera supone
que para cada objeto del mundo existe una señal que
habría de contar con un grupo neuronal específico
que lo registrase, lo que implicaría la necesidad de
un cerebro enorme y rígido. De la misma manera,
tampoco se espera contar con un “mapa neuronal”
que construya cada objeto. En cambio, resulta más
coherente que con una cantidad finita de neuronas, el
mundo sea percibido de una forma más “inteligente,
sensata, eficaz, plástica y elástica” mediante grupos de
neuronas, localizadas en diferentes áreas del cerebro,
analizando y registrando características generales de
los objetos, bajo un mecanismo que logre “enlazar”
sus diferentes tareas, de tal modo que en su conjunto
esta información se unifique. Bajo este modelo, se
infiere que la reconstrucción del mundo perceptual es
una constante integración de atributos que se enlazan
en combinaciones multimodales. Además para cada
modalidad sensorial, donde entra en juego un sentido,
la percepción de un objeto en el mundo es a su vez
analizado por sus dominios, y reducido a sus atributos.
La imagen visual de la flor roja de la estampa descrita
arriba, implicaría que en su percepción, se activarían
los analizadores de la forma, el color, el contraste,
etc. de tal suerte que interconectadas las neuronas
asociadas a ello, en un instante, pudieran construir
la flor roja que se liga a la realidad. Este mecanismo,
llamado “binding” en inglés o “enlace”, establece el
problema de entender “el cómo” de éste momento.
Tal pareciera que, la coherencia del mundo es una
armonía, una sincronía del tiempo, una conjunción de
energías cuyas fronteras podrían anular o deformar la
realidad, o bien, transformarla en algo inusual para la
coherencia a la que el enlace nos tiene acostumbrados,
por así decirlo. Y he aquí la consecuencia de especular
al respecto. En una primera dimensión de ello, uno
preguntaría si la modalidad sensorial que registra un
atributo bajo ciertos límites, fuese integrada en una
conexión equivocada para el enlace normal, ¿daría ello
una percepción extraña de la realidad? La respuesta
es sí, aunque sus alcances aún no los entendemos, Tal
situación de sentidos traslapados cuya base cerebral,
estaría posiblemente asociada a lo que se ha descrito
en el “enlace”, tiene que ver con el fenómeno de la
sinestesia. Esta es una condición perceptual en la
que un estímulo externo es registrado como una
modalidad sensorial y es traducido en el cerebro
como si fuesen dos modalidades, Como si el “enlace”
hubiese activado simultáneamente dos modalidades
asociando más de un atributo al estímulo externo.
¿Realidad distorsionada o revelación de sus metáforas?
Primero diremos que si alguien dice encontrar en un
color depuesto sobre un objeto de la naturaleza - cuya
experiencia perceptual es evidentemente visual – una
forma armónica de un tono musical, es que en verdad
la fenomenología de esta categoría puede no ser una
metáfora en el sentido tradicional. Existen habilidades
sensoriales que son integradas en el cerebro con datos
cuya naturaleza difiere de su propio código. Oír un
color o ver un sonido es algo cerebral; - el lenguaje que
lo toca trastabilla con solo intentarlo- . Pero ¿existe
una base fisiológica de la percepción sinestésica, es
decir, de la percepción no correspondiente de un
estímulo?
La sinestesia, significa percepción unida. Es una
condición en la que un individuo puede tener una
experiencia perceptual multimodal, a partir de un
estímulo sensorial unimodal, eso sí, de manera
involuntaria: un sentido es estimulado, por ejemplo
el oído, en tanto que, otro sentido responde (pues es
estimulado por añadidura), por ejemplo la vista. Pero
incluso, el individuo sinésteta puede “transducir”
una dimensión semántica, como una letra o número
o un rostro en colores. Richard Cytowic, uno de los
científicos que más han estudiado científicamente
esta condición, establece que la sinestesia no es
imaginación o aprendizaje, no es una metáfora, pero
habla de su expresión en 1 de cada 23 personas y
puede ocurrir entre familiares, por lo que la considera
más un “carácter”, como lo es el color de ojos, que
En realidad esta condición fue considerada por mucho
tiempo como una farsa, algo de lo que la psicología
conductista reprobaba por su subjetividad y es posible
que muchos casos tuviesen que haber sido tratados en
la categoría de la locura o la drogadicción. Este aspecto
podría abrir una interesante especulación sobre las
fronteras de nuestra percepción y el procesamiento
de los datos en el campo útil de la cordura. Así mismo,
debiera lanzar nuevas hipótesis sobre las conexiones
cerebrales que pueden desencadenar las drogas,
asumiendo que las rutas para la trans-locación de la
percepción y con ello de un fragmento de la realidad
están trazadas potencialmente antes de inducirlas
Sin embargo, la situación cambió hasta el momento
en que la psicometría amplió sus métodos para
aportar datos empíricos en individuos sinéstetas,
y por otro lado, con las neurociencias, existen
evidencias científicas directas de esta condición
con las valoraciones neurofisiológicas de sinéstetas
sometidos a técnicas de neuroimagen.
La Sinestesia se delinea porque es involuntaria y
automática, lo que debe de diferenciarse de las
asociaciones que pueden darse con el recuerdo. Es un
hecho perceptual de facto. La sinestesia puede llegar
a tener una espacialidad, figurada por sensaciones
táctiles al contacto perceptual del gusto. Por otro
lado, la condición sinestésica es consistente, ya que un
individuo sinésteta bajo pruebas psicométricas podrá
repetir prácticamente al 100% la experiencia separada
en el tiempo, en tanto que individuos “normales”
fallarán esta repetición, acertando alrededor de un
17%. Hay que anotar que la experiencia sinestésica
está asociada sólo a rasgos perceptuales y no
construcciones complejas, como cuadros o frases
líricas. La condición estará presente toda la vida del
sinésteta, Aún más la sinestesia puede adoptar la
forma de una emoción, que puede ser desagradable
o agradable, pues el estímulo sensorial conlleva un
estado de ánimo ligado a la percepción en cuestión.
Pues bien, todas estas dimensiones de la sinestesia
nos deben llevar a preguntarnos si no estos casos
registrados y experimentados son sólo casos
observables y cuantificables, o bien se trata de la
frontera de una condición sutil de la percepción
humana que podría explicar, desde la plasticidad del
cerebro, la manera en que hemos construido el mundo.
Digamos que con base en un equívoco, las cosas en el
mundo se mezclan, se tocan, se corresponden, en una
categoría a priori, pero es desdoblado (el mundo) sólo
porque no es unívoco, y el cerebro humano puede
“esculpír” la realidad con el cincel de los sentidos
traslapados…
Imágenes del MicroUniverso
Reconstrucción en 3D en colores de las imágenes tomadas con un microscopio electrónico a
cientos de láminas de 30-nm de grosor de tejido cerebral de ratón.
Se muestra un grupo de neuronas de la corteza somato-sensorial del cerebro de ratón, la cual
contiene un mapa del cuerpo a partir de diferentes sensaciones táctiles como dolor, presión y
Los modelos tridimensionales (3D) de alta resolución a color de las neuronas y sus conexiones
se generan a partir de la reconstrucción de un conjunto de imágenes del cerebro registradas
con microscopia electrónica (ME) bidimensional. Una de las imágenes originales es mostrada
en gris detrás de las neuronas en colores. El ancho de todo el grupo de neuronas es aproximadamente el de un pelo humano. El cerebro de ratón contiene alrededor de 75 millones de neuronas, mientras que el humano tiene aproximadamente 86 billones. El mapeo de las conexiones cerebrales a este nivel de detalle, el cual posee una resolución un trillón de veces mayor que
la de las imágenes de resonancia magnética nuclear (MRI), permite a los científicos estudiar la
anatomía y la función del cerebro normal y patológico a nivel celular y sináptico.
Tomado de: http://www.hhmi.org/biointeractive/deciphering-tangled-connections
Image credit Daniel Berger PhD, Massachusetts Institute of Technology (MIT), Cambridge, MA.
Dra. Micaela Rosalinda Cruz Monje
Dr. Koulsy Lamko
y Extensión Universitaria
Mtro. Igor Peña Ibarra
Encargado del despacho de la
Coordinación del Colegio de Ciencia y Tecnología
Genómicas hoy
Boletín cuatrimestral del Posgrado en Ciencias Genómicas UACM
fue impresa en septiembre de 2015 en el taller de impresión de la
con un tiraje de dos mil quinientos ejemplares
Genómicas hoy es una publicación del
Posgrado en Ciencias Genómicas de la UACM
Diseño: Alfredo Padilla
Genomicas Hoy Uacm
articles-93003 ArchivoPowerPoint 0
1ª serie de problemas
Welcome to GUSANO.INFO !!
MAPA DE NUBIA
INGENIERÍA GENÉTICA (TOTAL: 3 ACTIVIDADES) 1. Con relación
ADN (Ácido Desoxirribonucleico) • Bilogía • Genética • Genes • Repercusiones éticas
EL PROYECTO DEL GENOMA HUMANO Comenzó a finales del s
EXAMEN DE BIOLOGIA 2.−DIBUJAR LA MEMBRANA PLASMATICA E INDICAR SUS PARTES
ADN (Ácido Desoxirribonucleico) • Algas rojas • Membrana plasmática • Plantas
mutagen1.pdf
UNIDAD DE PRODUCCIÓN DEL CONOCIMIENTO ADN

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