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Timestamp: 2019-12-11 17:41:35+00:00

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﻿Selección Genética | Abejas del Sur
https://www.nationalgeographic.com.es/medio/2015/05/05/abejas.mp4
La genética apícola a la luz
Como se sabe, las hembras de las abejas -reinas y obreras- nacen de un huevo, que es la unión de un óvulo de la reina con un espermatozoide de uno de los 10 a 15 zánganos que se aparearon con esa reina. En tanto que los zánganos nacen de los óvulos de la reina, esto significa que la reina produce zánganos sin necesidad de aparearse. Esta particularidad del sistema reproductivo de las abejas se denominó PARTENOGENESIS en 1845 cuando Dzierzon describe por primera vez el fenómeno. En 1986 el brillante apicultor uruguayo Samuel de León del Río, lo rebautizó como TELIGENESIS, en su muy interesante libro «He aquí las abejas» (Editorial Hemisferio Sur), y nos ayudó a comprender que los zánganos de una colmena son medios hermanos de la reina que puso el óvulo de donde nacieron, y no sus hijos como la teoría de la partenogénesis establecía.
Si este mismo proceso se efectuara con las abejas y se esterilizaran los zánganos, ellas igualmente pondrían «huevos» que originarían machos.
Otro de los mitos existentes es el de afirmar que los zánganos serán todos iguales a su «madre hermana» cuando en realidad lo que sucede es lo contrario, pues la célula que origina al macho, ese óvulo hasta ahora llamado huevo infecundo, surge por una meiosis celular de la reina, es decir que de los 32 cromosomas apareados que forman el genoma de la reina sólo 16 pasarán al zángano.
KK x K –
KK KK – KK x I –
KI KI – KI x KK –
KK Ik – KI x I
Es evidente que en BRASIL las APIS MELLÍFICA son africanas puras porque no hay abejas, reinas y zánganos europeos en los enjambres y ni los respectivos híbridos lo que sería una inevitabilidad científica; también tampoco existe la menor posibilidad aún usando las técnicas de la Inseminación Artificial de rescatar las razas antiguas pre-existentes a las africanas A. M. SCUTELLATA. De esto sólo puede ser explicada una conclusión lógica: las europeas y sus mestizas – las africanizadas – ya no existen y lo que hoy son, sí, solamente africanas puras (“AA”) cómo lo confirmó la cuenta de genes.Claudio Mikos
KK KK – KK x A
KA KA KA x A
KA AA AA x A
(“ F-1 ”): La colonia “F0” genera una hija de la “F2” (recuadro del centro). Está encabezada por una reina CÁRNICA PURA, pero que fue fecundada por zánganos AFRICANOS (“A”= a las A. M. SCUTELLATA). Aquí todas las futuras PRINCESAS y las abejas son y serán africanizadas, mestizas: CÁRNICAS AFRICANIZADAS (“KA”). Los zánganos aún son de la raza CÁRNICA (“K”). En este cambio de REINA MAESTRA ya está sufriendo la primera africanización porque la fecundación fue al natural – al aire libre – y con presencia de abejas africanas conjuntamente con sus zánganos en la región. La mansedumbre se mantiene prácticamente inalterada (“KA”): aún no nacen las obreras africanas puras (“AA”). Los GENES de las europeas en el aspecto de la mansedumbre son DOMINANTES en relación a los que responden por la agresividad de las africanas – RECESIVOS.
1– Las PRINCESAS africanas puras nacen un dia antes que las mestizas y cerca de dos antes que las europeas puras;
… Muy frecuentes son los mestizajes simples: el apicultor compra la REINA pura de una raza ya apareada con zánganos de la misma. Después crea las PRINCESAS y estas se aparean con los zánganos de otra raza de abejas existentes en la región. Es el caso típico de los criadores que importan las REINAS de Europa y las PRINCESAS-hijas se aparean con los zánganos africanos de las A. M. SCUTELLATA. Si el lado europeo tiene buenas características y también el africano resulta en un mestizo dócil, prolífico y altamente productivo.
En Biología, los gametos (del griego Gameto, cónyuge) son cada una de las células sexuales … Los órganos que producen los gametos se llaman gónadas .La hembra produce los óvulos y el macho los espermatozoides mitad de los cromosomas necesitados para producir a una abeja obrera a una reina.
Por lo tanto, en las abejas, todos los nuevos gametos se originan de una reina. Decimos «nuevos» gametos porque los zánganos propagan solamente gametos existentes.
Las mitocondrias son los pequeños organelos que se encuentran en cada célula viva. Las mitocondrias son esenciales para la producción de energía, están presentes en el citoplasma de las células y – lo que es relevante aquí – poseen su propio ADN. son los qué hacen posible la respiración. Liberan energía quemando azúcar con el oxigeno.
– Principios de selección: Apinetla
– Crianza y genética de las abejas de la miel Por: Juan R. Harbo y Thomas E. Rinderer1
– Principios de las genéticas de la abeja Por: Tom Glenn en la reunión de EAS, Universidad Agosto De 2002 De Cornell
– Genética y Evolución de Claudio Mikos
– Crianza de la abeja del Hermano Adán
– Malcolm T. Sanford Edificio 970, caja 110620 Universidad de la Florida Gainesville
– Antonio José Manrique Investigador. FONAIAP-Gerencia General. Actualmente cursando estudios de Doctorado en Genética de Abejas. Universidad de Sao Paulo, Ribeirao Preto. Departamento de Genética. Brasil.
– Trasmisión de las características hereditarias. (anónimo)
SENCILLO SOFTWARE IDENTIFICACIÓN RAZA – ESPECIE – SUBESPECIE DE ABEJAS.
Acerca de IdentiFly
IdentiFly es un software para clasificación semiautomática basada en morfometría geométrica. Principalmente fue desarrollado para la identificación de especies de insectos, pero se puede usar para la clasificación de cualquier objeto que difiera en su forma. Además, IdentiFly se puede utilizar como una alternativa a tpsDig para digitalizar puntos de referencia en dos dimensiones.
Descarga el archivo ZIP: IdentiFly1_2.zip
Desempaquete el archivo ZIP y copie el directorio IdentiFly1_2 en su disco duro.
Ejecuta el identifly.exe
1.1. Después de Descargar e Instalar el IdentiFly capturamos la imagen del Ala derecha delantera de la abeja a identificar.
1.2. Carga Imagen. La Primera pestaña que vemos en la imagen inferior.
1.4. Seleccionar Clasificación y elegir criterio de clasificación (raza, subespecie…).
1.5. Prototipo. Es un ejemplo de dónde debemos Marcar las Coordenadas. Podemos verlo en la imagen inferior de la ala de la abeja.
1.6. Seleccionar la Flecha con el símbolo +. Es la última pestaña de la imagen inferior.
1.7. Marcar Coordenadas lo más preciso posible, justo en el centro de los cruces, como se observa en la imagen inferior.
yyy Para Finalizar:
Una vez completados los 19 puntos, –> Clasificar.
Es un Sencillo Software, sencillo manejo, y con una simple foto desde nuestro teléfono móvil, podemos asegurar que la especie que estamos seleccionando es la más adecuada para su reproducción.
Esperemos sea de vuestro interés….. a Nosotr@s nos es muy útil….
DIFERENCIACIÓN DE LAS RAZAS DE ABEJAS
Las abejas domesticadas utilizadas en la apicultura pertenecen a la especie Apis mellifera . Una especie es un grupo de individuos capaces de tener una descendencia viable y fértil si los crían. También hay una diversidad dentro de las especies: esto se llama sub-especie, raza o variedad. Sin embargo, el concepto de raza no está claro. Este término se utiliza en este artículo para referirse a un conjunto de individuos cercanos en ciertos caracteres y que tienen una historia evolutiva común en una escala más pequeña que las especies.
A• apis mellifera linnacus, B• apis mellifera koschevnicov, C •apis mellifera nigrocinta Smith,
D• apis cerana Fabricius, E• apis dorsata Fabricius, F• apis florea, G• apis andreniformis
Las diferencias entre las razas se deben a mutaciones naturales que se generalizan por la selección (natural y antropogénico), la deriva genética (probabilidad) y gracias a un flujo de genes entre razas. No hay que confundir la raza y el ecotipo. Un ecotipo es un grupo de individuos de la misma raza y que tienen características específicas que resultan de una adaptación gradual a un entorno. Poseer un ecotipo características se heredan. El concepto de población se utiliza muy poco; que corresponde a un conjunto de individuos de la misma especie y que tiene una ubicación común. Por tanto, una población puede corresponder a varias carreras.
En la primera parte, la metodología para la diferenciación de razas de abejas se presentará y luego a comprender la biogeografía de Apis mellifera .
Los criterios para la diferenciación de las razas de abejas
El término «biometría» significa «la medición de los vivos» y se refiere más amplio estudio cuantitativo de los seres vivos. Este artículo se basa en el trabajo de Cornuet et al. que es una síntesis de los datos biométricos en la abeja. La realización de un examen biométrico requiere la eliminación de 30 a 40 jóvenes abejas dentro de la colmena. Deben ser mantenidas con vida y poner en una dieta de 48 horas antes de matarlas con acetato de etilo o asfixia. Las muestras se deben colocar en alcohol a 60 °. En su estudio, Cornuet et al. utilizar métodos estadísticos planificados (análisis discriminante y la clasificación jerárquica de acuerdo con el algoritmo de Roux). Se llevaron a cabo satisfactoriamente la discriminación y clasificación de las 8 carreras de abejas y 3 híbridos interraciales (mestizos) utilizando 6 criterios morfológicos.
La coloración abdomen
La coloración abdominal se midió en el 2° Tergito abdominal (aumento x 10) y, más precisamente el ancho de tareas o la raya amarilla presente en este Tergito. La anchura obtenida debe estar entre 0,01 y 2,40 mm.
el pelo abdominal
La longitud del pelo abdominal se midió en el quinto Tergito abdominal utilizando un retículo ocular 120 divisiones (magnificación x 40).
La anchura de tomento
El tomento es la banda abdominal cabelludo. Se mide en el Tergito abdominal cuarto (magnificación x 10).
La longitud de la lengua
La longitud de la lengua (probocis) se mide después de cortar y volvió la cabeza de la abeja (aumento x 10). la glosa (parte de laspiezas bucales de la abeja) se extiende utilizando unas pinzas de disección.
El índice cubital
El índice cubital se mide en las venas de las alas anteriores de un trabajador. Las nervaduras definen células. En la 3 ª celular cubital, se mide la longitud de las nervaduras A y B. El índice cubital es la relación A / B.
La transgresión discoide
La transgresión discoide se mide a las costillas de las alas anteriores de una abeja obrera. Para determinar la posición del punto discoide (A) debe trazar una línea que conecta los dos extremos de la célula radial (CR) y luego dibujar una línea a través perpendicular a la intersección de las costillas de la célula radial y cubital. Si la línea perpendicular está en posición proximal del ala con respecto al punto A: la transgresión discoidal es negativa. Si la línea perpendicular se encuentra en una posición distal del ala con respecto al punto A: la transgresión discoidal es positiva. Esta característica es particularmente útil para discriminar la abeja negro pero es difícil cobertura para medir puesto que es necesario determinar con precisión los extremos de la célula radial.
Resumen de los datos biométricos
Ruttner determinó en 1988 que las razas de abejas se pueden clasificar en 4 principales linajes evolutivos:
la línea M en el oeste de Europa, desde España hasta Escandinavia (abeja negro);
la línea C en Europa central y del norte;
la línea A en África;
la línea O en Turquía y el Cáucaso.
Cada una de estas líneas se ha diversificado en varias carreras. El siguiente documento presenta la distribución geográfica de cada raza y linaje. Para intermissa, la morfología, la mitocondria y los datos nucleares en realidad no se especifique la pertenencia al linaje A, o M.
La siguiente tabla resume los resultados biométricos de abejas. Los valores se han redondeado al 0,5 más cercano.
linea subespecie valores medios y extremos Color(mm) Pilosidad(mm) Tomentum(mm) Lengua(mm) Indice cubital Transgresion discoidal
C(maternal) Buckfast
cercalingustica cerca lingustica cerca lingustica cerca lingustica cerca lingustica Positivo
medio 1,75 0,3 0,85 6,5 2,3 Positivo
valor extremo 1,40-2,2 0,20-0,40 0,80-1,00 6,30-6,60 2,00-2,70
Moyenne 0,35 0,3 0,9 6,6 2,6 Positivo
valor extremo 0,20-0,60 0,20-0,40 0,80-1,00 6,40-6,80 2,30-3,20
medio Jaune
6,38 2.72±0.3
O anatolica
medio 0,3 0,3 1 7 2 Nulo
valor extremo 0,20-0,40 0,25-0,40 0,80-1,20 6,70-7,20 1,70-2,30
M mellifera (Negra) medio 0,25 0,45 0,75 6,3 1,75 Négativo
Valor extremo 0,00-0,30 0,40-0,52 0,60-0,80 6,00-6,50 1,40-2,10
A intermissa
medio 0,2 0,2 0,6 6,4 2,2
Valor extremo 0,10-0,40 0,15-0,35 0,50-0,70 6,30-6,60 2,10-2,30
medio 1,53 0,18 0,97 5,82 2,26
medio 1,53 0,2 0,53 5,91 2,71
adansonii medio 1,52 0,13 0,37 5,58 2,2
syriava medio 1,59 0,16 0,83 6,44 2,44
Apiclass El software permite el análisis de múltiples puntos en las alas tomadas con un escáner de diapositivas (Plustek). Este software utiliza un sistema de medición semi-automática que elimina el operador efecto. Los datos han sido verificados de los análisis morfométricos y moleculares. Este sistema está disponible en línea y se requiere el uso de treinta abejas para determinar el número de miembros de una colonia para reproducirse. Este sistema parece poco fiable (una madre negro 98% da intermissa niñas pasaron la misma foto varias veces dan resultados diferentes escáner): características de los híbridos (mestizos) no se guardan en el software.
La biometría es una herramienta para identificar las razas de abejas. Hermano Adam estaba trabajando en la etología de cada carrera, es decir, su comportamiento. La siguiente tabla presenta un resumen de sus estudios.
Los siguientes cuadros son otra representación de la obra del hermano Adam. El primer lienzo compara las dos razas utilizadas principalmente por los apicultores franceses.
Podemos ver que en comparación con la abeja Buckfast, la abeja negra :
tiene un mejor sentido de la orientación;
construida rayos más irregulares;
utiliza más de propóleos;
un poco más resistente a la intemperie;
tiene un sentido ligeramente más desarrollado del olfato;
tiene una mayor capacidad de volar;
tiene una durabilidad superior.
La abeja Buckfast (hermano Adán) de la abeja negra:
tiene mejor resistencia a las enfermedades;
tiene una mayor tendencia a pulular;
tiene una mayor fertilidad;
almacena la miel lejos de la camada que no bloquea la puesta;
es más suave;
ha ocupado la posición más alta.
El estudio del genoma mitocondrial
En las abejas, la información genética está contenida en la forma de ADN en el núcleo y unos orgánulos tales como mitocondrias. Las mitocondrias se heredan única y exclusivamente de la madre. El estudio del genoma mitocondrial de un solo trabajo, por tanto, proporciona información sobre el genotipo de la reina. El único genoma mitocondrial materno no proporcionan información sobre el genotipo de los varones de la cual los trabajadores. Este estudio proporciona sólo una determinación aproximada de la raza.
La determinación de una línea desde el genoma mitocondrial
El genoma mitocondrial permite que las líneas discrimier. Una línea corresponde a una raza o grupo de razas con una historia evolutiva común. El genoma mitocondrial se caracteriza por las abejas regiones intergénicas CO II COI y que varían en longitud de una carrera a otra. En estas áreas, hay unidades sub P (54-67 pb, hechas de 100% adenina y timina) y subunidades Q (192-196 pb compuesto por un 93,4% y adenina . timina Estas subunidades pueden tener diferentes combinaciones: P, PQ, PQQ … para estudiar las regiones intergénicas, hay que amplificar por PCR usando los siguientes cebadores:
Los fragmentos son entonces migran por electroforesis. La siguiente figura indica los tamaños identificados en la electroforesis en gel. Las muestras que contengan:
subunidades son la vía P intergénica M;
subunidades son intergénica línea Po A;
o subunidades y P intergénicas intergénicas o subunidades Po son la línea C.
Con el fin de discriminar con precisión las subunidades intergénicas P y Po, los fragmentos de ADN deben ser digeridos por la enzima de restricción DRA1. Después de la digestión, la electroforesis se realiza usando un gel de poliacrilamida entre 5 y 10%. Haplotipos A y M se definen utilizando estos perfiles de restricción. También es posible secuenciar la porción amplificada para discriminar fragmentos P y Po.
Los datos proporcionados por el estudio del genoma mitocondrial
Los datos adquiridos a partir del estudio de genoma mitocondrial se utilizan en diversos métodos de clasificación y permitieron la construcción de árboles de clasificación similares. Este árbol es robusto: se hace notar en cada caso que las líneas A y C están más relacionados entre sí que con la línea M.
El estudio del genoma nuclear
El genoma nuclear se pasa a la descendencia por la madre y el padre, en el caso de l as obreras, y sólo por la madre en el caso de los zanganos ). El estudio del genoma nuclear, hacen falta al menos 50 obreras, al menos, para determinar el genotipo del macho fertilizar a la reina y, por tanto, la introgresión. El ADN nuclear tiene ligeras variaciones entre los individuos; sólo se usan regiones altamente variables del genoma: se habla marcador. Los marcadores más utilizados en las abejas son los microsatélites. Se corresponden con zonas del genoma (loci) que consta de cientos de repeticiones en tándem unos pocos pares de bases (pb) 1-5. Por el mismo locus, hay un número variable de repeticiones de acuerdo con la subespecie (alelos). A partir del estudio de varios loci, los árboles se hicieron por el método de fenética «vecino a participar», que cuantifica la similitud entre los individuos. Para esto, calcula un índice de similitud global y, por tanto, las distancias genéticas para cada par de individuos. Construimos el árbol por la consolidación sucesiva de los individuos más similares durante más diferentes. Dado que el ADN es una «lengua cuaternaria» (ACTG), esta técnica plantea el problema de que dos secuencias similares pueden ser o muy cerca o muy lejos de tantas mutaciones. Para limitar el sesgo de este método, las muestras no se agrupan de acuerdo con su similitud en función, pero un algoritmo que minimiza la longitud total del eje. Con el aumento de los ordenadores potencia de cálculo, el método fenética es obsoleto y se utilizan métodos probabilísticos (sin publicación está pendiente de publicación).
Con el método de phenetic, árboles obtenidos son similares a los de los métodos mitocondriales y morfométricos excepto para la carrera intermissa que está en la línea M de acuerdo con el algoritmo utilizado.
La comprensión de la biogeografía de Apis mellifera
El trabajo del equipo Diniz Filho-JAF fue reunir datos moleculares y morfológicos para entender la biogeografía de las abejas. Su trabajo se presenta en el siguiente documento. La página central de líneas de abejas es el Oriente Medio. Notamos que :
Una línea colonizaron África;
línea M colonizó Europa Occidental;
líneas C y O están más relacionados entre sí: la línea C ha colonizado los territorios al sur de los Alpes a través de Turquía, mientras que la línea O colonizaron el este de Europa a través del Cáucaso.
Los datos moleculares nos llevan a pensar que la eliminación de estas líneas tuvo lugar en el Pleistoceno. Pleistoceno, los rangos M y las líneas externas están separadas por una capa de hielo. Esto puede explicar la discrepancia surgió entre las primeras líneas y M CO. La diferencia entre C y O líneas es tarde, porque el aislamiento de las dos líneas fue más débil con el tiempo.
Todas estas razas pueden reproducirlos. El calentamiento de Europa y el derretimiento de los casquetes polares ha llevado a una elaboración de la cerveza: las poblaciones A. mellifera tiene muchos individuos mestizos M / C de Queens importaciones de la línea C durante los últimos 40 años. Las razas Ibérica, y lingüstica Sicula tienen orígenes mestizos de más edad que resultan de introgresión secundaria AM ramitas (en España), MC (países del Este) y el volumen de negocios (en Francia). El mestizaje puede llegar a niveles extremos ya que la población de Portugal se compone sólo de un haplotipo A, mientras que los individuos han analizado un genoma nuclear aparentemente pura millones. Estas diferencias pueden estar relacionados con la diversidad de comportamiento entre los sexos y razas, a la influencia del hombre y las posibles restricciones selectivas aplicadas a las moléculas estudiadas.
Conclusión sobre razas de abejas
las distintas razas de abejas no solo están determinadas por sus datos biométricos (colores, índices …), sino también utilizando marcadores moleculares (mitocondrial y nuclear). Todo esto nos permite entender la biogeografía de la abeja. Hay un centro de dispersión en el norte del Golfo Pérsico desde el que las abejas han colonizado Europa. La glaciación del Pleistoceno ha conducido al aislamiento de la población y el desarrollo de las razas. Después de que el hielo se derritió, las diferentes razas fueron entonces razas mixtas: la conservación y cría de razas puras, parece ser que va contra la naturaleza ahora. Sin embargo, la preservación de las razas puras le permite disfrutar del efecto de heterosis (individuo heterocigoto) La cría pura promueve la biodiversidad si se permite la conservación de ciertos alelos en un contexto determinado (por ejemplo, el carácter spin-off, la agresividad, la celebración de la trama). Es en este caso para crear un «banco de alelos raros» que serán necesarios en el futuro.
Bibliografía sobre razas de abejas
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Kekeçoglu M. (2009) La divergencia genética y las relaciones filogenéticas de las poblaciones de abejas de miel usando PCR-RFLP a partir del análisis de pavo de dos segmentos de ADN mitocondrial.
Interfaz gráfica de usuario IDENTIFLY
Aparte del menú, la barra de herramientas y la barra de estado habituales, hay un espacio en la parte central de la ventana donde se puede mostrar una imagen usando la opción Abrir. Para agregar puntos de referencia, se debe hacer clic en la imagen mientras IdentiFly está en el modo Agregar. Por otro lado, los puntos de referencia se pueden eliminar y mover cuando el software está en el modo de selección o el modo de arrastre . Los puntos de referencia se pueden mover utilizando el método de arrastrar y soltar. Los hitos se muestran como cruces rojas numeradas. Las cruces pueden estar rodeadas de círculo negro o rojo. El círculo rojo indica que la marca se seleccionó y se puede eliminar o mover. Se puede seleccionar un punto de referencia haciendo clic en él (en el modo de selección o en el modo de arrastre)) o haciendo clic a su lado y arrastrando un rectángulo a su alrededor (solo en el modo Seleccionar ). Se puede seleccionar más de un punto de interés haciendo clic en ellos mientras se presiona la tecla Ctrl (en el modo de selección o en el modo de arrastre ) o haciendo clic al lado de los puntos de referencia y arrastrando un rectángulo alrededor de ellos (solo en el modo de selección ). En el modo Agregar la selección de puntos de referencia no es posible.
Landmark es un punto correspondiente a una parte particular de un objeto representado en la imagen. Se describe por sus coordenadas x e y. Por lo general, en una imagen hay un grupo de puntos de referencia que forman una configuración. Cada punto de referencia está asociado con un número que es único dentro de una imagen.
Configuración La
configuración de puntos de referencia es un grupo de puntos de referencia utilizados para medir un objeto que se muestra en una imagen. La configuración se describe en la lista de coordenadas xey de los puntos de referencia. Los puntos de referencia dentro de una configuración están numerados consecutivamente comenzando con uno. Dos o más configuraciones son comparables cuando consisten en el mismo número de puntos de referencia y cuando los puntos de referencia con el mismo número corresponden a la misma parte de los objetos analizados.
en el software IdentiFly prototipo es una imagen que contiene una configuración de puntos de referencia. El prototipo se puede utilizar como referencia para la colocación manual de puntos de referencia en una nueva imagen. En este caso, el prototipo debe mostrarse (usando el prototipo Ver) en una ventana separada junto a la ventana principal.
Además, el prototipo es una fuente de información sobre la forma y el tamaño de la configuración utilizada por las opciones Restablecer puntos de referencia y Ajustar puntos de referencia.
Formato DW.PNG
Los datos sobre puntos de referencia y otra información se almacenan junto con la imagen en archivos con la extensión «.dw.png». Es seguro ver las imágenes DW.PNG en otro software, sin embargo, su edición en otro software probablemente destruirá la información adicional. Los datos de puntos de referencia se pueden leer desde una imagen incluso si la extensión es .png. Sin embargo, se recomienda utilizar la extensión completa (.dw.png) para proporcionar información de que algunos datos adicionales se guardan en la imagen, lo que puede destruirse mediante la edición en un software que no es compatible. Para ver las coordenadas de los hitos guardados en. En el archivo DW.PNG puede ver los datos o exportarlos en formato TPS, CSV o TXT. El formato TPS se puede importar a TPS y al software MorphoJ. El formato CSV se puede importar a Excel y a otra hoja de cálculo. El formato TXT puede ser importado por MorphoJ y R software.
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Zoom de puntos de referencia
Use esta entrada de menú para cambiar la ampliación de la imagen mostrada actualmente de tal manera que todos los puntos de referencia sean visibles.
Punto de referencia del menú
Eliminar punto de referencia
Use esta entrada del menú para eliminar los puntos de referencia seleccionados. Un hito seleccionado puede ser reconocido por un círculo rojo a su alrededor. Para más información ver la interfaz gráfica de usuario.
Use esta entrada de menú para mostrar puntos de referencia del archivo prototipo. Los puntos de referencia que se muestran actualmente se eliminarán.
Use esta entrada de menú para ajustar la posición de los puntos de referencia. Los ajustes están basados ​​en el archivo prototipo. Antes de instalar, al menos, el usuario debe ubicar el primer y último hito. Los otros puntos de referencia deben estar fuera de la imagen.
Use esta entrada del menú para verificar la presencia de valores atípicos. Esto es posible solo cuando hay un gran número de objetos medidos. Se debe indicar un directorio donde se almacenan todas las imágenes. La configuración promedio de los puntos de referencia se determina para las imágenes. Se muestra la imagen con la configuración que más se diferenció de la configuración promedio. Las diferencias están marcadas con líneas amarillas. También se pueden mostrar otras imágenes del mismo directorio con las diferencias marcadas al abrir la imagen siguiente. Las imágenes están ordenadas de la más diferente a la menos diferente de la media. Esta opción se puede usar para detectar errores en las mediciones, incluyendo: el intercambio de puntos de referencia en la posición incorrecta de algunos puntos de referencia.
Escala menú de
la barra de escala Set
Utilice esta entrada del menú para proporcionar información sobre la barra de escala. Debe proporcionarse la distancia en metros correspondiente a la barra de escala. Los dos últimos puntos de referencia se convierten en una barra de escala.
Borrar barra de escala
Utilice esta entrada de menú para eliminar información sobre la barra de escala.
Use esta entrada de menú para proporcionar información sobre la resolución de la imagen. Las unidades de la resolución deben ser píxeles por metro. Por ejemplo, si toma la imagen de un papel cuadriculado y 1 centímetro está representado en la imagen por 1000 píxeles, la resolución es de 100 000 píxeles por metro (que puede calcularse como 1000 píxeles divididos por 0,01 metros). Si en la imagen se puede ver un papel cuadriculado de barra de escala, puede usar la barra de escala Establecer para determinar la resolución de la imagen.
Establecer resolución en directorio
Use esta entrada de menú para proporcionar información sobre la resolución de todas las imágenes en un directorio.
Información de escala
Utilice esta entrada de menú para obtener información sobre la barra de escala y la resolución.
Establecer clasificación
Utilice esta entrada del menú para elegir el archivo de clasificación. Este archivo contiene principalmente información útil para la identificación, sin embargo, también hay información sobre el prototipo.
Use esta entrada de menú para mostrar una nueva ventana con la imagen del prototipo. La ventana puede ser útil cuando agrega o corrige la posición de los puntos de referencia. Puede acercar y alejar la imagen usando Ctrl + arriba y Ctrl + abajo, respectivamente.
Utilice esta entrada de menú para clasificar un objeto que se muestra en la imagen como uno de los grupos cubiertos por el archivo de clasificación. La clasificación se basa en la configuración de puntos de referencia. El número de puntos de referencia debe ser el mismo que en el archivo prototipo. Los resultados de la clasificación se muestran en una nueva ventana.
Use esta entrada de menú para clasificar los objetos representados por imágenes de un directorio como uno de los grupos cubiertos por el archivo de clasificación. La clasificación se basa en la configuración promedio calculada a partir de todas las imágenes en el directorio. Esta opción puede ser útil cuando clasificamos una colonia de abejas con un grupo de trabajadores o cuando clasificamos una planta usando medidas de varias hojas.
Ayuda del menú
Utilice esta entrada del menú para obtener información básica sobre IdentiFly. Hay información sobre la versión y el enlace al sitio web con información de ayuda.
Uso de IdentiFly para la identificación de los linajes y subespecies de
las abejas. En las abejas hay más de 20 subespecies (o razas geográficas) que se agruparon en cuatro linajes evolutivos.
Antes de que una colonia de abejas pueda clasificarse como uno de los linajes evolutivos, debe obtener imágenes de al menos diez trabajadores de la colonia. Las imágenes de ala de diferentes colonias deben guardarse en directorios separados. Cada una de las alas tiene que ser medida. En el caso de las abejas melíferas, 19 puntos de referencia deben estar ubicados en la parte apropiada del ala. Los puntos de referencia deben colocarse de manera que los círculos azules alrededor de ellos sean tangentes al contorno de la ubicación en al menos tres puntos. La posición de los puntos de referencia es esencial para una correcta clasificación.
Para localizar los puntos de referencia, utilice el modo apropiado: Modo -> Agregar puntos de referencia. En este modo, al hacer clic en la imagen se agregará un punto de referencia. Se recomienda ampliar la imagen y verificar si el punto de referencia está colocado correctamente. Si es necesario, la posición del hito puede ser corregida. Para corregir la posición de los puntos de referencia, debe cambiar el modo: Modo -> Editar puntos de referencia . En este modo, se puede arrastrar y colocar una marca en una nueva posición. Después de las mediciones, el archivo de imagen debe guardarse: Archivo -> Guardar . La posición de los puntos de referencia se guarda dentro del archivo y luego se puede verificar, corregir y exportar.
En el caso de las abejas hay varias clasificaciones posibles. Para elegir la opción de clasificación apropiada, se debe utilizar Clasificación -> Establecer clasificación . Para la identificación de los linajes de las abejas, seleccione el archivo «ranking_apis_mellifera_lineages.dw.xml». Con cada archivo de clasificación se asocia un archivo prototipo. Es una imagen que contiene información sobre el número y la posición de los puntos de referencia. Para ver la opción de prototipo, se puede utilizar la Clasificación -> Ver prototipo . Luego, se muestra el prototipo y se puede usar como referencia para la posición correcta de los puntos de referencia.
Cuando se midieron todas las imágenes de ala de una colonia, la colonia se puede clasificar: Clasificación -> Directorio de clasificación , a continuación, elija el directorio donde se guardaron las imágenes de ala. También es posible clasificar una sola ala (usando la opción Clasificación -> Clasificar), sin embargo, esto no se recomienda porque la identificación de linajes y subespecies de abejas basadas en un solo ala es muy inexacta. La información de clasificación se mostrará en una nueva ventana. El más importante es el grupo al que se asignó la colonia. Para una correcta interpretación de la clasificación, el usuario debe inspeccionar también la probabilidad de clasificación. Los valores de probabilidad pueden ir de cero a uno. La mayor probabilidad de asignación a un grupo particular indica una alta similitud entre la colonia clasificada y las muestras de referencia.
En el mejor de los casos, la probabilidad de una subespecie será alta y, en todas las subespecies restantes, muy baja. En este caso, la colonia focal debe clasificarse como subespecie o linaje con una alta probabilidad de clasificación. Es difícil recomendar un valor de umbral por encima del cual una probabilidad de clasificación debe considerarse alta. En otro escenario, la probabilidad de clasificación es relativamente alta en dos o más subespecies. En este caso, la colonia focal debe considerarse como híbrida entre las subespecies con altas probabilidades de clasificación. Finalmente, la probabilidad de clasificación puede ser baja en todas las subespecies. En este caso, la clasificación de la colonia focal como una de las subespecies debe concluirse como dudosa. Esto puede suceder en dos casos: cuando la colonia focal es muy diferente de todas las muestras de referencia o cuando hay un error en las mediciones. El primer caso puede ocurrir cuando la colonia pertenece a especies distintas deA. mellifera , por ejemplo, A. cerana , o la colonia pertenece a subespecies no incluidas en el modelo de clasificación, por ejemplo, A. m. pomonella . Esto no debería suceder muy a menudo porque la clasificación presentada aquí cubre la mayoría de las subespecies de las abejas. Las probabilidades de clasificación bajas en todas las subespecies ocurren con mayor frecuencia porque hay un error en las mediciones. Uno de los errores más comunes es el cambio de posición de dos puntos de referencia. Con el fin de detectar posibles errores , se pueden utilizar puntos de referencia -> Valores atípicos . Luego se comparan los archivos de una carpeta y se muestran las alas más diferentes del promedio. Las diferencias de cada punto de referencia con respecto al promedio están marcadas con líneas amarillas.
También hay representación gráfica de la identificación. La colonia se representa como un punto negro en el gráfico CVA con subespecies o linajes marcados como elipsis. Cuanto más cerca esté el punto del centro de la elipse, mayor será la similitud de la colonia con la subespecie o linaje particular. El gráfico debe interpretarse con cuidado, especialmente por los usuarios que no están familiarizados con el análisis estadístico multivariante. Es importante notar que en muchos casos hay más dimensiones que las dos presentadas en el gráfico y la proximidad de un punto a una elipse puede ser engañosa. La información sobre otras variables canónicas se presenta en la tabla a continuación. Si la colonia difiere marcadamente de todas las subespecies, el marcador negro puede ser invisible en la gráfica.
A modo de ejemplo, presentamos los resultados de clasificación de una colonia recolectada en Chipre. Primero hemos usado el archivo de clasificación «ranking_apis_mellifera_lineages.dw.xml».
La colonia fue clasificada como linaje O. La probabilidad de clasificación para este grupo fue de 0.16, que es mucho mayor que los valores para los linajes A, C y M: 2.0×10-10, 1.1×10-8 y 1.5×10-17, respectivamente. En este caso, es seguro concluir que la colonia identificada era del linaje O.
En la gráfica que muestra CV1 y CV2, el cuadrado negro que representa la colonia está dentro de O elipse.
A continuación, hemos utilizado el archivo de clasificación «ranking_apis_mellifera_subspecies.dw.xml».
La misma colonia fue clasificada como A. m. armeniaca . La probabilidad de clasificación (8.5×10-4) es mucho menor que anteriormente. La segunda probabilidad más alta (3.9×10-9) es para A. m. siriaca . En este caso, debemos concluir que la colonia identificada es similar a A. m. armeniaca pero notablemente diferente de la muestra de referencia de esta subespecie y es híbrida con A. m. Syriaca o pertenece a subespecies no cubiertas por el modelo de identificación. Sabemos que la explicación posterior es cierta porque al usar otros métodos, la colonia se identificó como A. m. chipre. La colonia se clasificó correctamente como perteneciente al linaje O. Sin embargo, no se pudo clasificar como A. m. Chipre porque esta subespecie no se incluyó en el modelo de clasificación debido al pequeño tamaño de la muestra.

References: resolución

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