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Timestamp: 2017-10-19 00:04:18+00:00

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Inicio / Postgrado e Investigación / Másteres Universitarios / MÁSTER UNIVERSITARIO EN CRISTALOGRAFÍA Y CRISTALIZACIÓN / Resolución y refino de estructuras
Resolución y refino de estructuras
El objetivo de esta asignatura es el establecimiento razonado sobre parámetros estructurales de interpretaciones científicas a las propiedades o comportamientos físicos, químicos o biológicos investigados.
A) Fundamentos matemáticos para la resolución y refino de estructuras
Lenguajes de programación de uso común en Cristalografía (FORTRAN, PYTHON, etc.).
Sistemas operativos útiles en Cristalografía estructural (Windows y Linux).
Herramientas matemáticas aplicadas al ajuste de variables estructurales.
Estadística y Cristalografía.
Teoría de errores aplicada a parámetros estructurales.
B) Métodos de resolución de estructuras
Integración de datos experimentales.
Métodos matemáticos de resolución de estructuras: Métodos directos, Patterson y otros relacionados.
Mapas de densidad electrónica aplicados a la resolución estructural.
Refino estructural.
Parámetros de desplazamiento térmico. Movimiento molecular.
Análisis de la estructura absoluta y de la quiralidad molecular.
Fenómenos de dispersión anómala.
Programas para la resolución y refino estructural.
C) Validación y análisis de estructuras cristalinas
Validación de estructuras.
Criterios y software de validación.
Bases de datos en Cristalografía.
Relación estructura-actividad a partir de los parámetros estructurales.
Fuentes bibliográficas estructurales.
Uso legal de la información Cristalográfíca.
CT2.- Conocimiento de lenguas extranjeras
CE8.- Ser capaz de definir experimentos optimizados de difracción y metodologias óptimas de recogida y proceso de datos
AF2.- Talleres de resolución de problemas.
AF3.- Talleres prácticos y demostraciones experimentales en el aula.
AF11.- Visitas a empresa o centro de investigación.
Los objetivos planteados para el presente curso serán:
El alumno debe ser capaz de interaccionar con los equipos de cálculo, asociados a equipos de medida o independientes, con conocimiento suficiente tanto a nivel de sistema operativo, como en el contexto de usuario de los paquetes de resolución y refino estructural.
El alumno debe conocer los criterios estadísticos de calidad para evaluar la bondad de unos datos experimentales y acometer el método de resolución estructural apropiado.
El alumno debe conocer los detalles conceptuales y prácticos para la extracción de la información experimental de un proceso de difracción.
El alumno debe ser capaz de realizar el proceso de resolución estructural de compuestos de diferentes tipos, aplicando los programas experimentales más adecuados.
El alumno conocerá al final del curso los métodos de representación estructural y será capaz de articular sobre los resultados estructurales una interpretación de la actividad o propiedades específicas investigadas.
Para la normalización de los parámetros estructurales obtenidos, el alumno deberá adquirir un conocimiento profundo de los tipos de bases estructurales existentes, así como de los mecanismos de extracción de información.
Prueba escrita (35%-45%)
Hojas de problemas (5%-10%)
Realización de prácticas y/o cuaderno de prácticas (5%-10%)
Realización y presentación de trabajos e informes (20%-30%)
Participación en clase (5%-10%)
Lahoz Díaz, Fernando José
Wood , Peter
Blake , Alexander
Mata Martínez, Ignasi
Instituto de Ciencias de Materiales de Barcelona (ICMAB)
García Ruiz, Juan Manuel
Esteve Cano, José Vicente
Usón Finkenzeller, María Isabel
Profesora de Investigación ICREA
Cooper , Richard
Friese , Karen
Senier Scientist
García Orduña, María Pilar
Técnico Superior del CSIC
William Clegg, Crystal Structure Determination, Ed. Oxford University Press, Oxford, 1998. (Oxford Chemistry Primers).
George H. Stout and Lyle H. Jensen, X-Ray Structure Determination, A practical Guide, Ed. John Wiley & Sons, New York, 1989 (2ª edición).
C. Giacovazzo et al, Fundamentals of Crystallography, Ed. Oxford Science Publications (IUCr), Oxford, 1992 (1ª edición). 2002 (2ª edición).
C. Giacovazzo Direct phasing in crystallography. IUCr Monographs on Crystallography No. 8. Oxford: IUCr/Oxford Science Publications, 1999. Pp.xxiii + 767.
Jenny P. Glusker, Mitchell Lewis and Miriam Rossi, Crystal Structure Analysis for Chemists and Biologists, Ed.VCH, New York, 1994.
M.F.C. Ladd and R.A. Palmer, Structure Determination by X-Ray Crystallography, Ed. Plenum Press, New York, 1994. (3ª edición).
D.E. Sands, Vectors and Tensors in Crystallography, Addison-Wesley Publishing, Reading (Massachussetts), 1982.
Coppens, X-Ray Charge Densities and Chemical Bonding, Oxford University Press, Oxford, 1997.

References: Resolución 

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