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COMPLEJO MAYOR DE HISTOCOMPATIBILIDAD. Molecular - PDF
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Inmaculada Toro Crespo
1 COMPLEJO MAYOR DE HISTOCOMPATIBILIDAD Dra.. Flora Calzadilla Lugo Laboratorio de Genética Molecular
2 POLIMORFISMO GENETICO Presencia en una población de múltiples un gen y que debe estar presente en el 1%. alelos de Variación en la secuencia en un sitio determinado del ADN entre los individuos de una población. Aquellos polimorfismos que afectan a la secuencia codificante o reguladora, y que producen cambios importantes en la estructura de la proteína o en el mecanismo de regulación de la expresión, pueden traducirse en diferentes fenotipos. Un polimorfismo puede consistir en la sustitución de una simple base nitrogenada o puede ser más complejo (por ejemplo, la repetición de una secuencia determinada de ADN, donde un porcentaje de individuos tenga un determinado número de copias de dicha secuencia).
4 POLIMORFISMO Anthony Nolan. Update 2009
5 POLIMORFISMO Número de alelos HLA Clase I: 2351 Locus A B C E F G H J K L P T U V W X Alelos Proteína Nulos Anthony Nolan. Update 2009
6 POLIMORFISMO Número de alelos HLA-DR: 1020 Locus β1 β 2 β 3 β 4 β 5 β 6 β 7 β 8 β 9 Alelos Proteína Nulos Anthony Nolan. Update 2009
7 POLIMORFISMO Número de alelos no-hla Locus MICA MICA TAP1 TAP2 Alelos Proteína Nulos Anthony Nolan. Update 2009
8 Formas para evitar y tratar el rechazo Mayor Compatibilidad Citoquinas Tratamientos inmunosupresores
9 Compatibilidad HLA Técnicas serológicas versus moleculares Control Interno Producto Específico Primer DR52 DR53 CN DR1 DR15 DR16 DR3 DR17 DR18 DR4 DR7 DR8 DR9 DR10 DR11 DR12 DR13 DR13 DR14 DR14* Olerup,, H. Zetterquist.. HLA typing by PCR amplification with sequence-specific specific primers (PCR-SSP) in 2 hours: An alternative to serological DR typing in clinical ical practice including donor-recipient recipient matching in cadaveric transplantations. Tissue Antigens 1992: 39;
10 Mayor resolución DR1 DR15 DR16 DR3 DR17 DR18 DR4 DR7 DR8 DR9 DR10 DR11 DR12 DR13 DR13 DR14 DR14* DR52 DR53 CN DR1 DR15 DR16 DR3 DR17 DR18 DR4 DR7 DR8 DR9 DR10 DR11 DR12 DR13 DR13 DR14 DR14* DR52 DR53 CN CI 1 FE 2 C 3 Receptor Donante 1: Control interno 2: Fragmento esperado 3: Cebadores O. Olerup, H. Zetterquist. HLA typing by PCR amplification with sequence-specific primers (PCR-SSP) in 2 hours: An alternative to serological DR typing in clinical practice including donor-recipient matching in cadaveric transplantations. Tissue Antigens 1992: 39;
11 Homocigótico y Confiabilidad DR1 DR15 DR16 DR3 DR17 DR18 DR4 DR7 DR8 DR9 DR10 DR11 DR12 DR13 DR13 DR14 DR14* DR52 DR53 CN DR1 DR15 DR16 DR3 DR17 DR18 DR4 DR7 DR8 DR9 DR10 DR11 DR12 DR13 DR13 DR14 DR14* DR52 DR53 CN CI 1 FE 2 C 3 Receptor Donante 1: Control interno 2: Fragmento esperado 3: Cebadores O. Olerup, H. Zetterquist. HLA typing by PCR amplification with sequence-specific primers (PCR-SSP) in 2 hours: An alternative to serological DR typing in clinical practice including donor-recipient matching in cadaveric transplantations. Tissue Antigens 1992: 39;
12 Mayor confiabilidad Mayor confiabilidad DR1 DR15 DR16 DR3 DR17 DR18 DR4 DR7 DR8 DR9 DR10 DR11 DR12 DR13 DR13 DR14 DR14* DR52 DR53 CN DR1 DR15 DR16 DR3 DR17 DR18 DR4 DR7 DR8 DR9 DR10 DR11 DR12 DR13 DR13 DR14 DR14* DR52 DR53 CN CI 1 FE 2 C 3 Receptor Donante 1: Control interno 2: Fragmento esperado 3: Cebadores O. Olerup, H. Zetterquist. HLA typing by PCR amplification with sequence-specific primers (PCR-SSP) in 2 hours: An alternative to serological DR typing in clinical practice including donor-recipient matching in cadaveric transplantations. Tissue Antigens 1992: 39;
13 Ventajas de las técnicas moleculares vs serológicas INHERENTES AL TIPAJE Homocigóticos Mayor resolución Confiabilidad PRACTICAS Mayor número n de muestras Intercambio con diferentes laboratorios Volumen de la muestra Estudios retrospectivos ECONOMICAS SOCIALES
14 Técnicas moleculares para el tipaje HLA Método Resolución Tiempo PCR-RFLP RFLP > Serología 4-10 días PCR-ASO PCR-SSP Secuenciación Alta Baja-media Definición de alelo 1-2 días 3-4 horas 2 días
15 Selección En función n de la relación n al tiempo Resolución n requerida. Posibilidad de combinar distintas técnicast
16 Evaluación de la histocompatibilidad donante-receptor en trasplantes Sistema de genotipaje de HLA Clase II compatible con los requerimientos de trasplantes de médula ósea y renal (resoluci( resolución vs tiempo) Método seleccionado: Bunce (1999) (modificado( según recomendaciones del National Blood Service, London) Basado en un sistema PCR-SSP para el genotipaje de baja-media resolución
17 Genotipaje por PCR-SSP Extracción de ADN leucocitario por el método de Salting out Reacción en cadena de la Polimerasa (PCR) con cebadores específicos alelos HLA Electroforesis en gel de agarosa al 2% y tinción con bromuro de etidio
18 Denaturalización de las Cadenas de DNA 3 GTACTAACTGTTCCTACGGTCGTATAAAGCCTGTATG CATGATTGACAAGGATGCCAGCATATTTCGGACATAC ºC DENATURALIZACION 3 GTACTAACTGTTCCTACGGTCGTATAAAGCCTGTATG CATGATTGACAAGGATGCCAGCATATTTCGGACATAC 3 3
19 Hibridación de los cebadores a la cadena de ADN 3 GTACTAACTGTTCCTACGGTCGTATAAAGCCTGTATG GACAAGGA 3 3 AAAGCCT 5 5 CATGATTGACAAGGATGCCAGCATATTTCGGACATAC 3 3
20 Tercer Paso. Elongación de los cebadores 5 GTACTAACTGTTCCTACGGTCGTATAAAGCCTGTATG 3 CATGATT GACAAGGATGCCAGCATATTTCGGACATAC GTACTAACTGTTCCTACGGTCGTATAAAGC CTGTATG 3 CATGATTGACAAGGATGCCAGCATATTTCGGACATAC 5 Pool de dntps dntps
21 Tecnología del PCR m n donde: : m es No. de Moléculas de DNA n es No. de ciclos del PCR 230 Amplificación de 1 x 10 9 mil millones de veces
22 PCR-SSP 3 GTACTAACTGTTCCTACGGTCGTATAAAGCCTGTATG 5 5 CATGATT 3 3 TTGTATG 5 5 CATGATTGACAAGGATGCCAGCATATTTCGGACATAC 3 3 GTACTAACTGTTCCTACGGTCGTATAAAGCTTGTATG 5 5 CATGATT 3 3 TTGTATG 5 5 CATGATTGACAAGGATGCCAGCATATTTCGAACATAC 3 NO AMPLIFICA SI AMPLIFICA
23 PCR-SSP Interpretación de resultados HLA-B27 Control interno Gel de agarosa al 2% marcado con Bromuro de etidio
24 PCR-SSP Tipaje HLA Clase II para trasplante de médula m ósea 1 2
25 Ventajas del PCR-SSP Mayor flexibilidad respecto al nivel de resolución deseado Mayor confiabilidad en la detección de homocigóticos Menor tiempo de ejecución Menor costo
26 Combinación de distintas técnicas Resolución MEDIA ALTA SSP SSP RFLP Específico del alelo
27 PCR-SSP combinado con PCR-RFLP RFLP RsA1 HpH1 Fok1 DRβ1*2 DRβ1*02
28 Tabla de interpretación
29 Tabla de interpretación
30 PCR-ASO
31 Contenido del Kit: Placas de PCR que contienen las mezclas Cebadores/dNTPs liofilizados. El punto de orientación se indica en la esquina de la placa con color negro. 2,5 X Mezcla (lista para el uso). Contiene rojo cresol, buffer, glicerol y detergente. Cubierta. Patrones de reacción, posición de los cebadores, indicados en la hoja de trabajo.
32 Programa de PCR Ciclos Temp Tiempo Desnaturalización 94 C 2 min 10 ciclos Desnaturalización 94 C 10 seg Hibridación n /Extensión 65 C 1 min 20 ciclos Desnaturalización 94 C 10 seg Hibridación 61 C 60 seg Extensión 72 C 30 seg Extensión n final 72 C 2 min Espera 4 C
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