OTAR3088/BioData-CellLine_annotated · Datasets at Hugging Face

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PMC11792090	To investigate how the SAP module promoted survival, proliferation, and anti-tumor function of UCAR-T cells, RNA sequencing was conducted on mock CAR-T, UCAR-T, and SAP UCAR-T cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "investigate", "how", "the", "SAP", "module", "promoted", "survival", ",", "proliferation", ",", "and", "anti-tumor", "function", "of", "UCAR-T", "cells", ",", "RNA", "sequencing", "was", "conducted", "on", "mock", "CAR-T", ",", "UCAR-T", ",", "and", "SAP", "UCAR-T", "cells", "." ] } ]
PMC11420784	P values were determined using Student t test.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "P", "values", "were", "determined", "using", "Student", "t", "test", "." ] } ]
PMC10849234	We found that Nutridoma did not improve the ability of NLCs differentiated from HL-60s to degranulate (Fig 2A–2D).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "found", "that", "Nutridoma", "did", "not", "improve", "the", "ability", "of", "NLCs", "differentiated", "from", "HL-60s", "to", "degranulate", "(", "Fig", "2A–2D", ")", "." ] } ]
PMC5673955	DNA from non‐transfected cells was used for reference control.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "DNA", "from", "non‐transfected", "cells", "was", "used", "for", "reference", "control", "." ] } ]
PMC11092382	Neurotoxicity and cardiotoxicity of sophocarpine.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Neurotoxicity", "and", "cardiotoxicity", "of", "sophocarpine", "." ] } ]
PMC8427838	HEK-293, RKO, 786-0 cells were each maintained in Dulbecco’s modified Eagle medium (DMEM) supplemented with 10% fetal bovine serum (FBS), L-glutamine (2 mM), penicillin (50 units/ml) and streptomycin (50 mg/ml).	[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HEK-293", ",", "RKO", ",", "786", "-", "0", "cells", "were", "each", "maintained", "in", "Dulbecco", "’s", "modified", "Eagle", "medium", "(", "DMEM", ")", "supplemented", "with", "10", "%", "fetal", "bovine", "serum", "(", "FBS", ")", ",", "L-glutamine", "(", "2", "mM", ")", ",", "penicillin", "(", "50", "units/ml", ")", "and", "streptomycin", "(", "50", "mg/ml", ")", "." ] } ]
PMC9813422	The genome structures range from gene loops to topologically associating domains and compartment A/B (61, 62).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "genome", "structures", "range", "from", "gene", "loops", "to", "topologically", "associating", "domains", "and", "compartment", "A/B", "(", "61", ",", "62", ")", "." ] } ]
PMC10748106	Moreover, ligand-based drug design is a method that combines mathematical modeling, and the physicochemical and structural properties, of a variety of biologically active chemical structures, to find the key elements that trigger their biological activity.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "ligand-based", "drug", "design", "is", "a", "method", "that", "combines", "mathematical", "modeling", ",", "and", "the", "physicochemical", "and", "structural", "properties", ",", "of", "a", "variety", "of", "biologically", "active", "chemical", "structures", ",", "to", "find", "the", "key", "elements", "that", "trigger", "their", "biological", "activity", "." ] } ]
PMC11185260	Zeta potential (surface charge) of nanocomplexes. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Zeta", "potential", "(", "surface", "charge", ")", "of", "nanocomplexes", ".", "(" ] } ]
PMC10965680	To assess selection signals in Xiangdong black goats, the composite likelihood ratio (CLR) statistic was applied.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "assess", "selection", "signals", "in", "Xiangdong", "black", "goats", ",", "the", "composite", "likelihood", "ratio", "(", "CLR", ")", "statistic", "was", "applied", "." ] } ]
PMC11774251	Heatmap showing global gene expression changes between Con and Tan-I groups. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Heatmap", "showing", "global", "gene", "expression", "changes", "between", "Con", "and", "Tan-I", "groups", ".", "(" ] } ]
PMC6799808	Deregulated mTOR signaling has been frequently observed in various types of tumors, so mTOR is regarded as a promising target for cancer therapy.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Deregulated", "mTOR", "signaling", "has", "been", "frequently", "observed", "in", "various", "types", "of", "tumors", ",", "so", "mTOR", "is", "regarded", "as", "a", "promising", "target", "for", "cancer", "therapy", "." ] } ]
PMC9611901	The splitting of the fibre structure at this stage of processing is important to achieve the final softness and strength of the finished hide .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "splitting", "of", "the", "fibre", "structure", "at", "this", "stage", "of", "processing", "is", "important", "to", "achieve", "the", "final", "softness", "and", "strength", "of", "the", "finished", "hide", "." ] } ]
PMC11767725	Regarding microbiome-targeted therapies, as already stated, rosacea is linked to the overexpression of TLR2 receptors, which drive inflammatory responses and disrupt the skin microbiome.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Regarding", "microbiome-targeted", "therapies", ",", "as", "already", "stated", ",", "rosacea", "is", "linked", "to", "the", "overexpression", "of", "TLR2", "receptors", ",", "which", "drive", "inflammatory", "responses", "and", "disrupt", "the", "skin", "microbiome", "." ] } ]
PMC11657744	Representative immunofluorescence images of ciliated NIH3T3 cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "Representative", "immunofluorescence", "images", "of", "ciliated", "NIH3T3", "cells", "." ] } ]
PMC11746942	To evaluate the therapeutic potential of S1PR3 inhibition in psoriasis, we administered the S1PR3 antagonist TY (3 mg/kg/day) to mice with IMQ-induced psoriasiform dermatitis for six consecutive days.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "evaluate", "the", "therapeutic", "potential", "of", "S1PR3", "inhibition", "in", "psoriasis", ",", "we", "administered", "the", "S1PR3", "antagonist", "TY", "(", "3", "mg/kg/day", ")", "to", "mice", "with", "IMQ-induced", "psoriasiform", "dermatitis", "for", "six", "consecutive", "days", "." ] } ]
PMC11718109	The localization of VGAT to synaptophysin vesicle condensates is consistent with previous findings, suggesting that VGAT-positive vesicles are most likely comprised of SSVs.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "localization", "of", "VGAT", "to", "synaptophysin", "vesicle", "condensates", "is", "consistent", "with", "previous", "findings", ",", "suggesting", "that", "VGAT-positive", "vesicles", "are", "most", "likely", "comprised", "of", "SSVs", "." ] } ]
PMC11786600	To further evaluate the effect of varying PF-127 concentrations on the microscopic morphology of portable electrospinning, the fiber diameters of PED0 to PED3 gradually coarsened with increasing PF-127 content.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "further", "evaluate", "the", "effect", "of", "varying", "PF-127", "concentrations", "on", "the", "microscopic", "morphology", "of", "portable", "electrospinning", ",", "the", "fiber", "diameters", "of", "PED0", "to", "PED3", "gradually", "coarsened", "with", "increasing", "PF-127", "content", "." ] } ]
PMC10142392	Thanks to their fibrous structure, electrospun mats have a larger surface area than films cast in a solvent.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thanks", "to", "their", "fibrous", "structure", ",", "electrospun", "mats", "have", "a", "larger", "surface", "area", "than", "films", "cast", "in", "a", "solvent", "." ] } ]
PMC11772585	I, J The protein and mRNA levels of BCL-2 and BAX were detected by western blot and qRT-PCR (n = 6), respectively.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "I", ",", "J", "The", "protein", "and", "mRNA", "levels", "of", "BCL-2", "and", "BAX", "were", "detected", "by", "western", "blot", "and", "qRT-PCR", "(", "n", "=", "6", ")", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC10965315	GraphPad Prism® 8.2.1 software was recruited to analyze the data by a one‐way analysis of variance (ANOVA) and Dunnett's post hoc tests.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "GraphPad", "Prism", "®", "8.2.1", "software", "was", "recruited", "to", "analyze", "the", "data", "by", "a", "one‐way", "analysis", "of", "variance", "(", "ANOVA", ")", "and", "Dunnett", "'s", "post", "hoc", "tests", "." ] } ]
PMC9429973	Achievement of complete metabolic response (CMR) assessed by PET/CT imaging prior to hematopoietic stem cell transplant (HSCT) predicts favorable progression free survival (PFS) and overall survival (OS).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Achievement", "of", "complete", "metabolic", "response", "(", "CMR", ")", "assessed", "by", "PET/CT", "imaging", "prior", "to", "hematopoietic", "stem", "cell", "transplant", "(", "HSCT", ")", "predicts", "favorable", "progression", "free", "survival", "(", "PFS", ")", "and", "overall", "survival", "(", "OS", ")", "." ] } ]
PMC6442998	A study by Yu et al. suggested the use of PDE inhibitors to indirectly inhibit YAP pathway by activation of the Hippo pathway in a cAMP-PKA -dependent manner in the MDA-MB-231 human breast adenocarcinoma cell line.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "study", "by", "Yu", "et", "al.", "suggested", "the", "use", "of", "PDE", "inhibitors", "to", "indirectly", "inhibit", "YAP", "pathway", "by", "activation", "of", "the", "Hippo", "pathway", "in", "a", "cAMP-PKA", "-dependent", "manner", "in", "the", "MDA-MB-231", "human", "breast", "adenocarcinoma", "cell", "line", "." ] } ]
PMC9429973	The qualitative variables were analyzed with chi squared and the quantitative variables Student’s T. Survival was analyzed with Kaplan-Meier curves.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "qualitative", "variables", "were", "analyzed", "with", "chi", "squared", "and", "the", "quantitative", "variables", "Student", "’s", "T.", "Survival", "was", "analyzed", "with", "Kaplan-Meier", "curves", "." ] } ]
PMC11739484	Panel (A) presents the miRNA-mRNA network, highlighting the interactions between MMP7, MMP11, and MMP14 genes and 08 associated miRNAs.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Panel", "(", "A", ")", "presents", "the", "miRNA-mRNA", "network", ",", "highlighting", "the", "interactions", "between", "MMP7", ",", "MMP11", ",", "and", "MMP14", "genes", "and", "08", "associated", "miRNAs", "." ] } ]
PMC10993311	Within this context, in a study using computational analyses of obesity (enrichment and pathway analyses), functional categories of GO terms such as “glucose homeostasis” and “glucose response” indicated that genes associated with obesity may confer risks for type 2 diabetes mellitus (Cheng et al., 2018).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Within", "this", "context", ",", "in", "a", "study", "using", "computational", "analyses", "of", "obesity", "(", "enrichment", "and", "pathway", "analyses", ")", ",", "functional", "categories", "of", "GO", "terms", "such", "as", "“", "glucose", "homeostasis", "”", "and", "“", "glucose", "response", "”", "indicated", "that", "genes", "associated", "with", "obesity", "may", "confer", "risks", "for", "type", "2", "diabetes", "mellitus", "(", "Cheng", "et", "al.", ",", "2018", ")", "." ] } ]
PMC11306331	Negative values indicate condensate disruption.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Negative", "values", "indicate", "condensate", "disruption", "." ] } ]
PMC11683240	The intensity values of the bar graph are given as x-fold of the untreated control (Con), normalized to Hsp90, mean ± SD (n ≥ 1).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "intensity", "values", "of", "the", "bar", "graph", "are", "given", "as", "x-fold", "of", "the", "untreated", "control", "(", "Con", ")", ",", "normalized", "to", "Hsp90", ",", "mean", "±", "SD", "(", "n", "≥", "1", ")", "." ] } ]
PMC9926039	The lowest binding energy in docking studies was calculated as −7.57 in cluster 1 with 3 conformers from all runs.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "lowest", "binding", "energy", "in", "docking", "studies", "was", "calculated", "as", "−7.57", "in", "cluster", "1", "with", "3", "conformers", "from", "all", "runs", "." ] } ]
PMC9587866	After refinement, the structural and topological features of the EYA3 protein template was determined using protein model validation database such as ERRAT, Verify 3D, ProCHECK, Pro-SA, VADAR and ResPROX (Shah et al., 2021).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "refinement", ",", "the", "structural", "and", "topological", "features", "of", "the", "EYA3", "protein", "template", "was", "determined", "using", "protein", "model", "validation", "database", "such", "as", "ERRAT", ",", "Verify", "3D", ",", "ProCHECK", ",", "Pro-SA", ",", "VADAR", "and", "ResPROX", "(", "Shah", "et", "al.", ",", "2021", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Pts received a single infusion of tisagenlecleucel at 0.2-5.0×10 CAR+ viable T cells/kg body weight for pts ≤50 kg and 0.1-2.5×10 CAR+ viable T cells for pts >50 kg.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Pts", "received", "a", "single", "infusion", "of", "tisagenlecleucel", "at", "0.2", "-", "5.0", "×", "10", "CAR+", "viable", "T", "cells/kg", "body", "weight", "for", "pts", "≤50", "kg", "and", "0.1", "-", "2.5", "×", "10", "CAR+", "viable", "T", "cells", "for", "pts", ">", "50", "kg", "." ] } ]
PMC11670407	The immunohistochemical results revealed that cisplatin indeed upregulated the expression of OTULIN and GPX4; concomitantly, OTULIN knockdown significantly inhibited the cisplatin-induced increase in GPX4 expression in vivo (Fig. 8i, j).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "immunohistochemical", "results", "revealed", "that", "cisplatin", "indeed", "upregulated", "the", "expression", "of", "OTULIN", "and", "GPX4", ";", "concomitantly", ",", "OTULIN", "knockdown", "significantly", "inhibited", "the", "cisplatin-induced", "increase", "in", "GPX4", "expression", "in", "vivo", "(", "Fig.", "8i", ",", "j", ")", "." ] } ]
PMC9429973	However, the time course of the transplanted HSCs to reconstitute the entire blood system and the spatial transition within the whole body have remained a mystery.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "time", "course", "of", "the", "transplanted", "HSCs", "to", "reconstitute", "the", "entire", "blood", "system", "and", "the", "spatial", "transition", "within", "the", "whole", "body", "have", "remained", "a", "mystery", "." ] } ]
PMC10213179	NGS data from both selections were analyzed to generate a non-redundant database of all unique aptamers with normalized read counts from each selection round.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "NGS", "data", "from", "both", "selections", "were", "analyzed", "to", "generate", "a", "non-redundant", "database", "of", "all", "unique", "aptamers", "with", "normalized", "read", "counts", "from", "each", "selection", "round", "." ] } ]
PMC9739791	Further studies revealed that senescence was the major factor of cell death rather than apoptosis.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Further", "studies", "revealed", "that", "senescence", "was", "the", "major", "factor", "of", "cell", "death", "rather", "than", "apoptosis", "." ] } ]
PMC11637820	Hence, there is a requirement for novel strategies that can be applied in first-line treatments to counter DFU.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Hence", ",", "there", "is", "a", "requirement", "for", "novel", "strategies", "that", "can", "be", "applied", "in", "first-line", "treatments", "to", "counter", "DFU", "." ] } ]
PMC9516447	Next day, the cells were either treated with DMSO vehicle control, HA15, or YUM70 at the indicated concentration and incubated for 48 hr.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Next", "day", ",", "the", "cells", "were", "either", "treated", "with", "DMSO", "vehicle", "control", ",", "HA15", ",", "or", "YUM70", "at", "the", "indicated", "concentration", "and", "incubated", "for", "48", "hr", "." ] } ]
PMC11541241	GTR1/GTR2 homologues are identified in the investigated pathogens; however, EGO1 and EGO3 are unique to S. cerevisiae and not identified in the other species, indicating that the EGO complex can be formed only in S. cerevisiae.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "GTR1/GTR2", "homologues", "are", "identified", "in", "the", "investigated", "pathogens", ";", "however", ",", "EGO1", "and", "EGO3", "are", "unique", "to", "S.", "cerevisiae", "and", "not", "identified", "in", "the", "other", "species", ",", "indicating", "that", "the", "EGO", "complex", "can", "be", "formed", "only", "in", "S.", "cerevisiae", "." ] } ]
PMC9429973	According to IMWG criteria, all first relapse patients responded(ORR100%)and CR:3pts(25%),VGPR:7pts(58.33%),PR:2pts(16.67%).Patients with ≥2 relapese, the ORR was44.44%,≥VGPR:0pts(0%), PR:4pts(44.44%),SD:3pts (33.33%),PD:2pts(22.22%).This results established that BPD has a deep Response in first relapse MM with EMD.The 1-year PFS was79.16%of all patients.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "According", "to", "IMWG", "criteria", ",", "all", "first", "relapse", "patients", "responded(ORR100%)and", "CR:3pts(25%),VGPR:7pts(58.33%),PR:2pts(16.67%).Patients", "with", "≥2", "relapese", ",", "the", "ORR", "was44.44%,≥VGPR:0pts(0", "%", ")", ",", "PR:4pts(44.44%),SD:3pts", "(33.33%),PD:2pts(22.22%).This", "results", "established", "that", "BPD", "has", "a", "deep", "Response", "in", "first", "relapse", "MM", "with", "EMD.The", "1-year", "PFS", "was79.16%of", "all", "patients", "." ] } ]
PMC11612315	Further exploration of GLP-1 administration routes led us to assess the effects of the oral administration of GLP-1(7–36).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Further", "exploration", "of", "GLP-1", "administration", "routes", "led", "us", "to", "assess", "the", "effects", "of", "the", "oral", "administration", "of", "GLP-1(7–36", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Results: Patients characteristics were as follows: male/female, 78/58; age, 25 to 94 years; median age, 79 years; AML, 50 patients; B-NHL, 32; MDS, 24; MM, 13; T-NHL 6; ALL, 5; ATL 2, CMML 2, and PV, 2.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "Patients", "characteristics", "were", "as", "follows", ":", "male/female", ",", "78/58", ";", "age", ",", "25", "to", "94", "years", ";", "median", "age", ",", "79", "years", ";", "AML", ",", "50", "patients", ";", "B-NHL", ",", "32", ";", "MDS", ",", "24", ";", "MM", ",", "13", ";", "T-NHL", "6", ";", "ALL", ",", "5", ";", "ATL", "2", ",", "CMML", "2", ",", "and", "PV", ",", "2", "." ] } ]
PMC8010066	All the other co-culture combinations had a strong and impressive effect on viability.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "the", "other", "co-culture", "combinations", "had", "a", "strong", "and", "impressive", "effect", "on", "viability", "." ] } ]
PMC11532793	If all the reads for a particular multi-transcript gene are assigned to a single EC, then that will necessarily also be true for all reads from all the bootstrap samples as well.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "If", "all", "the", "reads", "for", "a", "particular", "multi-transcript", "gene", "are", "assigned", "to", "a", "single", "EC", ",", "then", "that", "will", "necessarily", "also", "be", "true", "for", "all", "reads", "from", "all", "the", "bootstrap", "samples", "as", "well", "." ] } ]
PMC10958426	However, scWGS could not distinguish different cell types with normal genomes and is high cost, which hinders its wide application.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "scWGS", "could", "not", "distinguish", "different", "cell", "types", "with", "normal", "genomes", "and", "is", "high", "cost", ",", "which", "hinders", "its", "wide", "application", "." ] } ]
PMC7039683	Intersection of TP63, IRF6, KLF4 and H3K27Ac ChIP-seq peaks in human NHEK cells. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Intersection", "of", "TP63", ",", "IRF6", ",", "KLF4", "and", "H3K27Ac", "ChIP-seq", "peaks", "in", "human", "NHEK", "cells", ".", "(" ] } ]
PMC8584319	Several eukaryotic initiation factors (eIFs) tightly regulated by various signals are involved in translation initiation.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Several", "eukaryotic", "initiation", "factors", "(", "eIFs", ")", "tightly", "regulated", "by", "various", "signals", "are", "involved", "in", "translation", "initiation", "." ] } ]
PMC9444294	All cell lines were maintained in RPMI-1640 medium with 10% fetal bovine serum and grown at 37°C with 5% CO2.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "cell", "lines", "were", "maintained", "in", "RPMI-1640", "medium", "with", "10", "%", "fetal", "bovine", "serum", "and", "grown", "at", "37", "°", "C", "with", "5", "%", "CO2", "." ] } ]
PMC6163708	GLI3 activates only exceptionally and behaves rather as a suppressor.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "GLI3", "activates", "only", "exceptionally", "and", "behaves", "rather", "as", "a", "suppressor", "." ] } ]
PMC11457557	Loci around such single nucleotide polymorphisms (SNPs) were discovered to have high genome-wide association with increased BMI, hypertension, dyslipidemia, DM, coronary artery disease (CAD), and stroke.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Loci", "around", "such", "single", "nucleotide", "polymorphisms", "(", "SNPs", ")", "were", "discovered", "to", "have", "high", "genome-wide", "association", "with", "increased", "BMI", ",", "hypertension", ",", "dyslipidemia", ",", "DM", ",", "coronary", "artery", "disease", "(", "CAD", ")", ",", "and", "stroke", "." ] } ]
PMC11543935	These results suggest that the phantom can mimic the response of soft tissue and is a useful tool for studying cellular response and damage caused by EP or other treatment techniques.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "results", "suggest", "that", "the", "phantom", "can", "mimic", "the", "response", "of", "soft", "tissue", "and", "is", "a", "useful", "tool", "for", "studying", "cellular", "response", "and", "damage", "caused", "by", "EP", "or", "other", "treatment", "techniques", "." ] } ]
PMC10745221	Cell viability was measured in an assay using water-soluble tetrazolium-8 (WST-8) as previously described .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell", "viability", "was", "measured", "in", "an", "assay", "using", "water-soluble", "tetrazolium-8", "(", "WST-8", ")", "as", "previously", "described", "." ] } ]
PMC10748106	Cervical cancer is a malignant neoplastic disease, mainly associated to HPV infection, with high mortality rates.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cervical", "cancer", "is", "a", "malignant", "neoplastic", "disease", ",", "mainly", "associated", "to", "HPV", "infection", ",", "with", "high", "mortality", "rates", "." ] } ]
PMC9429973	Patients with NTDT reported high morbidity burden such as diabetes (prevalence across studies range, 1.4–44.0%), heart failure (2.1–6.7%), pulmonary hypertension (10.0–33%), hypothyroidism (1.4–83.3%), hypogonadism (1.4–83.3%), cholelithiasis (13.8–100.0%), osteoporosis (13.3–83.3%), osteopenia (11.0–83.3%), extramedullary hematopoiesis (0.6–40.0%), hepatosplenomegaly (20.0–37.7%), hepatitis C virus infection (0.3–55.0%), thrombosis (6.7–26.7%), and liver complications (7.5–32.1%).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Patients", "with", "NTDT", "reported", "high", "morbidity", "burden", "such", "as", "diabetes", "(", "prevalence", "across", "studies", "range", ",", "1.4–44.0", "%", ")", ",", "heart", "failure", "(", "2.1–6.7", "%", ")", ",", "pulmonary", "hypertension", "(", "10.0–33", "%", ")", ",", "hypothyroidism", "(", "1.4–83.3", "%", ")", ",", "hypogonadism", "(", "1.4–83.3", "%", ")", ",", "cholelithiasis", "(", "13.8–100.0", "%", ")", ",", "osteoporosis", "(", "13.3–83.3", "%", ")", ",", "osteopenia", "(", "11.0–83.3", "%", ")", ",", "extramedullary", "hematopoiesis", "(", "0.6–40.0", "%", ")", ",", "hepatosplenomegaly", "(", "20.0–37.7", "%", ")", ",", "hepatitis", "C", "virus", "infection", "(", "0.3–55.0", "%", ")", ",", "thrombosis", "(", "6.7–26.7", "%", ")", ",", "and", "liver", "complications", "(", "7.5–32.1", "%", ")", "." ] } ]
PMC10734950	Previously it has been shown that thiophene compounds can induce apoptosis in cancer cell lines .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Previously", "it", "has", "been", "shown", "that", "thiophene", "compounds", "can", "induce", "apoptosis", "in", "cancer", "cell", "lines", "." ] } ]
PMC11476264	Metastasis is the primary cause of death in patients with lung cancer .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Metastasis", "is", "the", "primary", "cause", "of", "death", "in", "patients", "with", "lung", "cancer", "." ] } ]
PMC10926885	The interaction between NDE1 and PAFAN1B1 was confirmed by western blot. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "interaction", "between", "NDE1", "and", "PAFAN1B1", "was", "confirmed", "by", "western", "blot", ".", "(" ] } ]
PMC7925574	As a result, the Figure legend, “(a) Box plots of E1A and E1B RNA-expression data from the six HEK293 cell lines.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "a", "result", ",", "the", "Figure", "legend", ",", "“", "(", "a", ")", "Box", "plots", "of", "E1A", "and", "E1B", "RNA-expression", "data", "from", "the", "six", "HEK293", "cell", "lines", "." ] } ]
PMC9503669	However, related isothiazolones are reactive electrophiles and interact with Cys proteases and other proteins with active site cysteines, which may limit their further development.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "related", "isothiazolones", "are", "reactive", "electrophiles", "and", "interact", "with", "Cys", "proteases", "and", "other", "proteins", "with", "active", "site", "cysteines", ",", "which", "may", "limit", "their", "further", "development", "." ] } ]
PMC7757104	Colonies were fixed in absolute ethanol for 10 min and stained with 0.5% crystal violet (Sigma-Aldrich; Merck KGaA) for 1 h at room temperature.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Colonies", "were", "fixed", "in", "absolute", "ethanol", "for", "10", "min", "and", "stained", "with", "0.5", "%", "crystal", "violet", "(", "Sigma-Aldrich", ";", "Merck", "KGaA", ")", "for", "1", "h", "at", "room", "temperature", "." ] } ]
PMC10196713	1; BD Biosciences).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "1", ";", "BD", "Biosciences", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Doses of milademetan and combination therapy are provided in Table 1.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Doses", "of", "milademetan", "and", "combination", "therapy", "are", "provided", "in", "Table", "1", "." ] } ]
PMC11755467	ShapeMapper2 includes built-in quality control measures and alignment tools that ensure accuracy.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ShapeMapper2", "includes", "built-in", "quality", "control", "measures", "and", "alignment", "tools", "that", "ensure", "accuracy", "." ] } ]
PMC11701801	First, we constructed a cell line panel comprising a SWI/SNF-proficient type (SWI/SNF+), a SMARCA4 single-deficient type (SMARCA4−), a SMARCA4 and SMARCA2 double-deficient type (SMARCA4−SMARCA2−), an ARID1A-deficient type (ARID1A−), a PBRM1-deficient type (PBRM1−), and an SS18–SSX fusion type (SS18–SSX; Fig. 1A–D; Supplementary Fig. S1A).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "First", ",", "we", "constructed", "a", "cell", "line", "panel", "comprising", "a", "SWI/SNF-proficient", "type", "(", "SWI/SNF+", ")", ",", "a", "SMARCA4", "single-deficient", "type", "(", "SMARCA4−", ")", ",", "a", "SMARCA4", "and", "SMARCA2", "double-deficient", "type", "(", "SMARCA4−SMARCA2−", ")", ",", "an", "ARID1A-deficient", "type", "(", "ARID1A−", ")", ",", "a", "PBRM1-deficient", "type", "(", "PBRM1−", ")", ",", "and", "an", "SS18–SSX", "fusion", "type", "(", "SS18–SSX", ";", "Fig.", "1A", "–", "D", ";", "Supplementary", "Fig.", "S1A", ")", "." ] } ]
PMC11659921	We utilized the GSCALite website as a tool to assess the importance of the genome across various tumors.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "utilized", "the", "GSCALite", "website", "as", "a", "tool", "to", "assess", "the", "importance", "of", "the", "genome", "across", "various", "tumors", "." ] } ]
PMC10823017	Alpelisib (BYL719) is a selective PI3Kα inhibitor that was developed by Novartis Pharma; it was purchased from Advanced Chemblock Inc., while ICA-1 was purchased from United Chemical Resources.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Alpelisib", "(", "BYL719", ")", "is", "a", "selective", "PI3Kα", "inhibitor", "that", "was", "developed", "by", "Novartis", "Pharma", ";", "it", "was", "purchased", "from", "Advanced", "Chemblock", "Inc.", ",", "while", "ICA-1", "was", "purchased", "from", "United", "Chemical", "Resources", "." ] } ]
PMC9429973	Although they proliferated normally in vitro, the knockdown of UCK2 dramatically suppressed cell growth of ATL cell lines (Fig. C).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Although", "they", "proliferated", "normally", "in", "vitro", ",", "the", "knockdown", "of", "UCK2", "dramatically", "suppressed", "cell", "growth", "of", "ATL", "cell", "lines", "(", "Fig.", "C", ")", "." ] } ]
PMC5874706	The supernatant was removed.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "supernatant", "was", "removed", "." ] } ]
PMC9429973	The survey consisted in a first part about the existence of center-specific fertility preservation guidelines, the presence of a specialized medical counseling for fertility and a dedicated evaluation at diagnosis (AMH/semen analysis/etc).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "survey", "consisted", "in", "a", "first", "part", "about", "the", "existence", "of", "center-specific", "fertility", "preservation", "guidelines", ",", "the", "presence", "of", "a", "specialized", "medical", "counseling", "for", "fertility", "and", "a", "dedicated", "evaluation", "at", "diagnosis", "(", "AMH/semen", "analysis/etc", ")", "." ] } ]
PMC7039683	The approach used to identify enhancers that are active in the mouse palate epithelium was similar.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "approach", "used", "to", "identify", "enhancers", "that", "are", "active", "in", "the", "mouse", "palate", "epithelium", "was", "similar", "." ] } ]
PMC11534035	15 days after transfection, A431 tumor sphere formation (A) and size of spheres (B) are shown, relative to siRNA controls. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "15", "days", "after", "transfection", ",", "A431", "tumor", "sphere", "formation", "(", "A", ")", "and", "size", "of", "spheres", "(", "B", ")", "are", "shown", ",", "relative", "to", "siRNA", "controls", ".", "(" ] } ]
PMC11539788	In contrast, the downregulation of RNF19A led to reduced ILK polyubiquitylation (Fig. 5N).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "contrast", ",", "the", "downregulation", "of", "RNF19A", "led", "to", "reduced", "ILK", "polyubiquitylation", "(", "Fig.", "5N", ")", "." ] } ]
PMC11291697	Breakpoint refinement on the proband’s DNA was achieved by qPCR using primer pairs spanning the deleted region (proximal/distal 1-4 probes); two additional probes in the non-deleted proximal and distal regions (proximal/distal control) and one probe in the centre of the microdeletion (deletion control) were included as controls (Fig. 1A and Supplementary Table S1).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Breakpoint", "refinement", "on", "the", "proband", "’s", "DNA", "was", "achieved", "by", "qPCR", "using", "primer", "pairs", "spanning", "the", "deleted", "region", "(", "proximal/distal", "1", "-", "4", "probes", ")", ";", "two", "additional", "probes", "in", "the", "non-deleted", "proximal", "and", "distal", "regions", "(", "proximal/distal", "control", ")", "and", "one", "probe", "in", "the", "centre", "of", "the", "microdeletion", "(", "deletion", "control", ")", "were", "included", "as", "controls", "(", "Fig.", "1A", "and", "Supplementary", "Table", "S1", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Methods: All the patients and their parents/guardians were subjected to a bleeding questionnaire to assess their bleeding score developed by ISTH/SSC-BAT (Bleeding assessement tool) and were investigated for platelet surface receptor GPIIb-IIIa (CD41 and CD61) by using flow cytometry.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "All", "the", "patients", "and", "their", "parents/guardians", "were", "subjected", "to", "a", "bleeding", "questionnaire", "to", "assess", "their", "bleeding", "score", "developed", "by", "ISTH/SSC-BAT", "(", "Bleeding", "assessement", "tool", ")", "and", "were", "investigated", "for", "platelet", "surface", "receptor", "GPIIb-IIIa", "(", "CD41", "and", "CD61", ")", "by", "using", "flow", "cytometry", "." ] } ]
PMC11509224	Kalihinols M–N, with a formamide functionality at C-4, extended the structural breadth of this diterpenoid family.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Kalihinols", "M", "–", "N", ",", "with", "a", "formamide", "functionality", "at", "C-4", ",", "extended", "the", "structural", "breadth", "of", "this", "diterpenoid", "family", "." ] } ]
PMC11696659	B, percentage of telomeres of a sample with a telomere length under a given threshold (Short Tel).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B", ",", "percentage", "of", "telomeres", "of", "a", "sample", "with", "a", "telomere", "length", "under", "a", "given", "threshold", "(", "Short", "Tel", ")", "." ] } ]
PMC8526701	PUMA is required for the antitumor effects of the combination.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "PUMA", "is", "required", "for", "the", "antitumor", "effects", "of", "the", "combination", "." ] } ]
PMC9429973	Regarding the composite outcome of severe complications, we found a HR 1.03, (95% CI 0.59-1.80)p=0.896.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Regarding", "the", "composite", "outcome", "of", "severe", "complications", ",", "we", "found", "a", "HR", "1.03", ",", "(", "95", "%", "CI", "0.59", "-", "1.80)p=0.896", "." ] } ]
PMC7519871	3D and (B) 2D poses of WDL with B-cell lymphoma 2 Protein (Bcl-2) PDB ID: 4LXD. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "3D", "and", "(", "B", ")", "2D", "poses", "of", "WDL", "with", "B-cell", "lymphoma", "2", "Protein", "(", "Bcl-2", ")", "PDB", "ID", ":", "4LXD", ".", "(" ] } ]
PMC11180402	Cycle threshold (Ct) values were ascertained post-analysis, with relative miRNA expression quantified via the 2 method, aligning with previously established protocols .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cycle", "threshold", "(", "Ct", ")", "values", "were", "ascertained", "post-analysis", ",", "with", "relative", "miRNA", "expression", "quantified", "via", "the", "2", "method", ",", "aligning", "with", "previously", "established", "protocols", "." ] } ]
PMC11066331	In ovarian cancer patients, epigenetic loss of TUSC3 expression correlates with poor prognosis and reduced survival .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "ovarian", "cancer", "patients", ",", "epigenetic", "loss", "of", "TUSC3", "expression", "correlates", "with", "poor", "prognosis", "and", "reduced", "survival", "." ] } ]
PMC10898159	Bortezomib can bind to Cbl, an E3 ubiquitin-protein ligase, destabilizing the c-KIT-Hsp90Β-Apaf-1 complex and releasing Apaf-1; then KIT was unleashed from the complex, and be internalized and degraded in the cytoplasm of GIST cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Bortezomib", "can", "bind", "to", "Cbl", ",", "an", "E3", "ubiquitin-protein", "ligase", ",", "destabilizing", "the", "c-KIT-Hsp90Β-Apaf-1", "complex", "and", "releasing", "Apaf-1", ";", "then", "KIT", "was", "unleashed", "from", "the", "complex", ",", "and", "be", "internalized", "and", "degraded", "in", "the", "cytoplasm", "of", "GIST", "cells", "." ] } ]
PMC11551844	Our previous studies have showed significant cytotoxic activity of JDH, JDE and jaspamide—obtained from the sponge Jaspis diastra—on the TERA1, A172, DLD1 and HaCaT cell lines.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "previous", "studies", "have", "showed", "significant", "cytotoxic", "activity", "of", "JDH", ",", "JDE", "and", "jaspamide", "—", "obtained", "from", "the", "sponge", "Jaspis", "diastra", "—", "on", "the", "TERA1", ",", "A172", ",", "DLD1", "and", "HaCaT", "cell", "lines", "." ] } ]
PMC10976516	L-IFN (YSCH-01) single useIIntratumoral injection with YSCH-01 in solid tumors (including NSCLC) determining MTD and safety.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "L-IFN", "(", "YSCH-01", ")", "single", "useIIntratumoral", "injection", "with", "YSCH-01", "in", "solid", "tumors", "(", "including", "NSCLC", ")", "determining", "MTD", "and", "safety", "." ] } ]
PMC11732523	The patient improved significantly, with resolution of respiratory symptoms, improved oxygen saturation, and a negative COVID-19 RT-PCR.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "patient", "improved", "significantly", ",", "with", "resolution", "of", "respiratory", "symptoms", ",", "improved", "oxygen", "saturation", ",", "and", "a", "negative", "COVID-19", "RT-PCR", "." ] } ]
PMC11802855	A The volcano plot of the differentially expressed genes revealed by RNA-seq profiling of the CXCL7-OE and NC RPMI8226 cell lines (\|logFC \| > 1, p < 0.05).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "The", "volcano", "plot", "of", "the", "differentially", "expressed", "genes", "revealed", "by", "RNA-seq", "profiling", "of", "the", "CXCL7-OE", "and", "NC", "RPMI8226", "cell", "lines", "(", "\|logFC", "\|", ">", "1", ",", "p", "<", "0.05", ")", "." ] } ]
PMC11320834	Topotecan hydrochloride and olaparib were obtained from Selleck Chemicals LLC (Houston, TX, USA).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Topotecan", "hydrochloride", "and", "olaparib", "were", "obtained", "from", "Selleck", "Chemicals", "LLC", "(", "Houston", ",", "TX", ",", "USA", ")", "." ] } ]
PMC11392912	Using the slope of the standard curve, Clo-miR-14 concentration was measured in blood plasma and the rhizome of turmeric. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Using", "the", "slope", "of", "the", "standard", "curve", ",", "Clo-miR-14", "concentration", "was", "measured", "in", "blood", "plasma", "and", "the", "rhizome", "of", "turmeric", ".", "(" ] } ]
PMC8978939	In vitro, we found that these variants have a significantly shorter half-life compared to wild-type VHL but still form a functional VBC complex.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "vitro", ",", "we", "found", "that", "these", "variants", "have", "a", "significantly", "shorter", "half-life", "compared", "to", "wild-type", "VHL", "but", "still", "form", "a", "functional", "VBC", "complex", "." ] } ]
PMC11644761	Transcript quantitative detection was conducted with SensiFAST™ SYBR & Fluorescein Kit (Bioline Reagents, London, UK, Cat.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Transcript", "quantitative", "detection", "was", "conducted", "with", "SensiFAST", "™", "SYBR", "&", "Fluorescein", "Kit", "(", "Bioline", "Reagents", ",", "London", ",", "UK", ",", "Cat", "." ] } ]
PMC10631132	No differences were observed regarding OC differentiation between the PBMC- and fibroblast-derived iPSC lines used in this study.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "No", "differences", "were", "observed", "regarding", "OC", "differentiation", "between", "the", "PBMC-", "and", "fibroblast-derived", "iPSC", "lines", "used", "in", "this", "study", "." ] } ]
PMC9429973	Importantly, combination immunotherapy triggered improved anti-tumor T cell killing function and promoted an inflammatory cytokine-rich “hot” TME.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Importantly", ",", "combination", "immunotherapy", "triggered", "improved", "anti-tumor", "T", "cell", "killing", "function", "and", "promoted", "an", "inflammatory", "cytokine-rich", "“", "hot", "”", "TME", "." ] } ]
PMC11707832	The glycosylation modification of proteins and the turnover processes of glycan hydrolysis play a pivotal role in maintaining essential protein functions across various biological processes .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "glycosylation", "modification", "of", "proteins", "and", "the", "turnover", "processes", "of", "glycan", "hydrolysis", "play", "a", "pivotal", "role", "in", "maintaining", "essential", "protein", "functions", "across", "various", "biological", "processes", "." ] } ]
PMC7351993	In the case of hiPSC therapy, label-free enrichment and applications of naïve stem cells is important for increasing the efficiency of preparing target types of differentiated cells such as retinal cells for human macular degeneraiton.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "case", "of", "hiPSC", "therapy", ",", "label-free", "enrichment", "and", "applications", "of", "naïve", "stem", "cells", "is", "important", "for", "increasing", "the", "efficiency", "of", "preparing", "target", "types", "of", "differentiated", "cells", "such", "as", "retinal", "cells", "for", "human", "macular", "degeneraiton", "." ] } ]
PMC11779993	Our findings demonstrated that SPEE could increase the phosphorylation of FAK and Src in a concentration-dependent manner.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "findings", "demonstrated", "that", "SPEE", "could", "increase", "the", "phosphorylation", "of", "FAK", "and", "Src", "in", "a", "concentration-dependent", "manner", "." ] } ]
PMC11612794	Error bars show the mean ± SD; p-values were calculated by one-way ANOVA (F (2,27) = 245.1; p < 0.0001) followed by Tukey’s test. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Error", "bars", "show", "the", "mean", "±", "SD", ";", "p-values", "were", "calculated", "by", "one-way", "ANOVA", "(", "F", "(", "2,27", ")", "=", "245.1", ";", "p", "<", "0.0001", ")", "followed", "by", "Tukey", "’s", "test", ".", "(" ] } ]
PMC11240448	One of the prerequisites of cSTAR is to have an ample quantity of measured proteins or genes for cell state classifications and for constructing the STVs.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "One", "of", "the", "prerequisites", "of", "cSTAR", "is", "to", "have", "an", "ample", "quantity", "of", "measured", "proteins", "or", "genes", "for", "cell", "state", "classifications", "and", "for", "constructing", "the", "STVs", "." ] } ]
PMC11206502	It offers increased metabolic flexibility in cancer cells, which are able to utilize different nutrients in response to increased energy demands due to high proliferation and maintenance of ROS at a moderate level.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "offers", "increased", "metabolic", "flexibility", "in", "cancer", "cells", ",", "which", "are", "able", "to", "utilize", "different", "nutrients", "in", "response", "to", "increased", "energy", "demands", "due", "to", "high", "proliferation", "and", "maintenance", "of", "ROS", "at", "a", "moderate", "level", "." ] } ]
PMC9784246	Despite chemotherapeutic drugs’ high efficacy, many patients experience serious chemotherapy-induced side effects .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Despite", "chemotherapeutic", "drugs", "’", "high", "efficacy", ",", "many", "patients", "experience", "serious", "chemotherapy-induced", "side", "effects", "." ] } ]
PMC9429973	Unfortunately the administration of HDMTX is related with risk of renal, hepatic and haematological adverse events.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Unfortunately", "the", "administration", "of", "HDMTX", "is", "related", "with", "risk", "of", "renal", ",", "hepatic", "and", "haematological", "adverse", "events", "." ] } ]
PMC9813422	The Burkitt lymphoma only expresses viral protein EBNA1, and represses other viral proteins, which belongs to the latency type I. On the contrary, LCL expresses all of the EBNAs as well as LMPs of EBV, belonging to the latency type III and similar conditions for viral reactivation of Akata-Zta cell, an EBV-positive BL (2, 57).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Burkitt", "lymphoma", "only", "expresses", "viral", "protein", "EBNA1", ",", "and", "represses", "other", "viral", "proteins", ",", "which", "belongs", "to", "the", "latency", "type", "I.", "On", "the", "contrary", ",", "LCL", "expresses", "all", "of", "the", "EBNAs", "as", "well", "as", "LMPs", "of", "EBV", ",", "belonging", "to", "the", "latency", "type", "III", "and", "similar", "conditions", "for", "viral", "reactivation", "of", "Akata-Zta", "cell", ",", "an", "EBV-positive", "BL", "(", "2", ",", "57", ")", "." ] } ]

PMC11792090

To investigate how the SAP module promoted survival, proliferation, and anti-tumor function of UCAR-T cells, RNA sequencing was conducted on mock CAR-T, UCAR-T, and SAP UCAR-T cells.

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PMC11420784

P values were determined using Student t test.

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PMC10849234

We found that Nutridoma did not improve the ability of NLCs differentiated from HL-60s to degranulate (Fig 2A–2D).

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PMC5673955

DNA from non‐transfected cells was used for reference control.

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Neurotoxicity and cardiotoxicity of sophocarpine.

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PMC8427838

HEK-293, RKO, 786-0 cells were each maintained in Dulbecco’s modified Eagle medium (DMEM) supplemented with 10% fetal bovine serum (FBS), L-glutamine (2 mM), penicillin (50 units/ml) and streptomycin (50 mg/ml).

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PMC9813422

The genome structures range from gene loops to topologically associating domains and compartment A/B (61, 62).

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PMC10748106

Moreover, ligand-based drug design is a method that combines mathematical modeling, and the physicochemical and structural properties, of a variety of biologically active chemical structures, to find the key elements that trigger their biological activity.

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Zeta potential (surface charge) of nanocomplexes. (

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To assess selection signals in Xiangdong black goats, the composite likelihood ratio (CLR) statistic was applied.

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Heatmap showing global gene expression changes between Con and Tan-I groups. (

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Deregulated mTOR signaling has been frequently observed in various types of tumors, so mTOR is regarded as a promising target for cancer therapy.

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The splitting of the fibre structure at this stage of processing is important to achieve the final softness and strength of the finished hide .

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Regarding microbiome-targeted therapies, as already stated, rosacea is linked to the overexpression of TLR2 receptors, which drive inflammatory responses and disrupt the skin microbiome.

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Representative immunofluorescence images of ciliated NIH3T3 cells.

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To evaluate the therapeutic potential of S1PR3 inhibition in psoriasis, we administered the S1PR3 antagonist TY (3 mg/kg/day) to mice with IMQ-induced psoriasiform dermatitis for six consecutive days.

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The localization of VGAT to synaptophysin vesicle condensates is consistent with previous findings, suggesting that VGAT-positive vesicles are most likely comprised of SSVs.

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To further evaluate the effect of varying PF-127 concentrations on the microscopic morphology of portable electrospinning, the fiber diameters of PED0 to PED3 gradually coarsened with increasing PF-127 content.

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Thanks to their fibrous structure, electrospun mats have a larger surface area than films cast in a solvent.

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I, J The protein and mRNA levels of BCL-2 and BAX were detected by western blot and qRT-PCR (n = 6), respectively.

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GraphPad Prism® 8.2.1 software was recruited to analyze the data by a one‐way analysis of variance (ANOVA) and Dunnett's post hoc tests.

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Achievement of complete metabolic response (CMR) assessed by PET/CT imaging prior to hematopoietic stem cell transplant (HSCT) predicts favorable progression free survival (PFS) and overall survival (OS).

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A study by Yu et al. suggested the use of PDE inhibitors to indirectly inhibit YAP pathway by activation of the Hippo pathway in a cAMP-PKA -dependent manner in the MDA-MB-231 human breast adenocarcinoma cell line.

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The qualitative variables were analyzed with chi squared and the quantitative variables Student’s T. Survival was analyzed with Kaplan-Meier curves.

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Panel (A) presents the miRNA-mRNA network, highlighting the interactions between MMP7, MMP11, and MMP14 genes and 08 associated miRNAs.

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PMC10993311

Within this context, in a study using computational analyses of obesity (enrichment and pathway analyses), functional categories of GO terms such as “glucose homeostasis” and “glucose response” indicated that genes associated with obesity may confer risks for type 2 diabetes mellitus (Cheng et al., 2018).

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Negative values indicate condensate disruption.

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The intensity values of the bar graph are given as x-fold of the untreated control (Con), normalized to Hsp90, mean ± SD (n ≥ 1).

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The lowest binding energy in docking studies was calculated as −7.57 in cluster 1 with 3 conformers from all runs.

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PMC9587866

After refinement, the structural and topological features of the EYA3 protein template was determined using protein model validation database such as ERRAT, Verify 3D, ProCHECK, Pro-SA, VADAR and ResPROX (Shah et al., 2021).

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PMC9429973

Pts received a single infusion of tisagenlecleucel at 0.2-5.0×10 CAR+ viable T cells/kg body weight for pts ≤50 kg and 0.1-2.5×10 CAR+ viable T cells for pts >50 kg.

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The immunohistochemical results revealed that cisplatin indeed upregulated the expression of OTULIN and GPX4; concomitantly, OTULIN knockdown significantly inhibited the cisplatin-induced increase in GPX4 expression in vivo (Fig. 8i, j).

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However, the time course of the transplanted HSCs to reconstitute the entire blood system and the spatial transition within the whole body have remained a mystery.

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NGS data from both selections were analyzed to generate a non-redundant database of all unique aptamers with normalized read counts from each selection round.

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PMC9739791

Further studies revealed that senescence was the major factor of cell death rather than apoptosis.

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Hence, there is a requirement for novel strategies that can be applied in first-line treatments to counter DFU.

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Next day, the cells were either treated with DMSO vehicle control, HA15, or YUM70 at the indicated concentration and incubated for 48 hr.

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PMC11541241

GTR1/GTR2 homologues are identified in the investigated pathogens; however, EGO1 and EGO3 are unique to S. cerevisiae and not identified in the other species, indicating that the EGO complex can be formed only in S. cerevisiae.

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PMC9429973

According to IMWG criteria, all first relapse patients responded(ORR100%)and CR:3pts(25%),VGPR:7pts(58.33%),PR:2pts(16.67%).Patients with ≥2 relapese, the ORR was44.44%,≥VGPR:0pts(0%), PR:4pts(44.44%),SD:3pts (33.33%),PD:2pts(22.22%).This results established that BPD has a deep Response in first relapse MM with EMD.The 1-year PFS was79.16%of all patients.

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PMC11612315

Further exploration of GLP-1 administration routes led us to assess the effects of the oral administration of GLP-1(7–36).

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PMC9429973

Results: Patients characteristics were as follows: male/female, 78/58; age, 25 to 94 years; median age, 79 years; AML, 50 patients; B-NHL, 32; MDS, 24; MM, 13; T-NHL 6; ALL, 5; ATL 2, CMML 2, and PV, 2.

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PMC8010066

All the other co-culture combinations had a strong and impressive effect on viability.

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If all the reads for a particular multi-transcript gene are assigned to a single EC, then that will necessarily also be true for all reads from all the bootstrap samples as well.

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PMC10958426

However, scWGS could not distinguish different cell types with normal genomes and is high cost, which hinders its wide application.

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PMC7039683

Intersection of TP63, IRF6, KLF4 and H3K27Ac ChIP-seq peaks in human NHEK cells. (

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PMC8584319

Several eukaryotic initiation factors (eIFs) tightly regulated by various signals are involved in translation initiation.

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PMC9444294

All cell lines were maintained in RPMI-1640 medium with 10% fetal bovine serum and grown at 37°C with 5% CO2.

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PMC6163708

GLI3 activates only exceptionally and behaves rather as a suppressor.

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PMC11457557

Loci around such single nucleotide polymorphisms (SNPs) were discovered to have high genome-wide association with increased BMI, hypertension, dyslipidemia, DM, coronary artery disease (CAD), and stroke.

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PMC11543935

These results suggest that the phantom can mimic the response of soft tissue and is a useful tool for studying cellular response and damage caused by EP or other treatment techniques.

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PMC10745221

Cell viability was measured in an assay using water-soluble tetrazolium-8 (WST-8) as previously described .

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PMC10748106

Cervical cancer is a malignant neoplastic disease, mainly associated to HPV infection, with high mortality rates.

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PMC9429973

Patients with NTDT reported high morbidity burden such as diabetes (prevalence across studies range, 1.4–44.0%), heart failure (2.1–6.7%), pulmonary hypertension (10.0–33%), hypothyroidism (1.4–83.3%), hypogonadism (1.4–83.3%), cholelithiasis (13.8–100.0%), osteoporosis (13.3–83.3%), osteopenia (11.0–83.3%), extramedullary hematopoiesis (0.6–40.0%), hepatosplenomegaly (20.0–37.7%), hepatitis C virus infection (0.3–55.0%), thrombosis (6.7–26.7%), and liver complications (7.5–32.1%).

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PMC10734950

Previously it has been shown that thiophene compounds can induce apoptosis in cancer cell lines .

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PMC11476264

Metastasis is the primary cause of death in patients with lung cancer .

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PMC10926885

The interaction between NDE1 and PAFAN1B1 was confirmed by western blot. (

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PMC7925574

As a result, the Figure legend, “(a) Box plots of E1A and E1B RNA-expression data from the six HEK293 cell lines.

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PMC9503669

However, related isothiazolones are reactive electrophiles and interact with Cys proteases and other proteins with active site cysteines, which may limit their further development.

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PMC7757104

Colonies were fixed in absolute ethanol for 10 min and stained with 0.5% crystal violet (Sigma-Aldrich; Merck KGaA) for 1 h at room temperature.

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PMC10196713

1; BD Biosciences).

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PMC9429973

Doses of milademetan and combination therapy are provided in Table 1.

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PMC11755467

ShapeMapper2 includes built-in quality control measures and alignment tools that ensure accuracy.

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PMC11701801

First, we constructed a cell line panel comprising a SWI/SNF-proficient type (SWI/SNF+), a SMARCA4 single-deficient type (SMARCA4−), a SMARCA4 and SMARCA2 double-deficient type (SMARCA4−SMARCA2−), an ARID1A-deficient type (ARID1A−), a PBRM1-deficient type (PBRM1−), and an SS18–SSX fusion type (SS18–SSX; Fig. 1A–D; Supplementary Fig. S1A).

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PMC11659921

We utilized the GSCALite website as a tool to assess the importance of the genome across various tumors.

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PMC10823017

Alpelisib (BYL719) is a selective PI3Kα inhibitor that was developed by Novartis Pharma; it was purchased from Advanced Chemblock Inc., while ICA-1 was purchased from United Chemical Resources.

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PMC9429973

Although they proliferated normally in vitro, the knockdown of UCK2 dramatically suppressed cell growth of ATL cell lines (Fig. C).

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PMC5874706

The supernatant was removed.

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PMC9429973

The survey consisted in a first part about the existence of center-specific fertility preservation guidelines, the presence of a specialized medical counseling for fertility and a dedicated evaluation at diagnosis (AMH/semen analysis/etc).

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PMC7039683

The approach used to identify enhancers that are active in the mouse palate epithelium was similar.

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PMC11534035

15 days after transfection, A431 tumor sphere formation (A) and size of spheres (B) are shown, relative to siRNA controls. (

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PMC11539788

In contrast, the downregulation of RNF19A led to reduced ILK polyubiquitylation (Fig. 5N).

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PMC11291697

Breakpoint refinement on the proband’s DNA was achieved by qPCR using primer pairs spanning the deleted region (proximal/distal 1-4 probes); two additional probes in the non-deleted proximal and distal regions (proximal/distal control) and one probe in the centre of the microdeletion (deletion control) were included as controls (Fig. 1A and Supplementary Table S1).

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PMC9429973

Methods: All the patients and their parents/guardians were subjected to a bleeding questionnaire to assess their bleeding score developed by ISTH/SSC-BAT (Bleeding assessement tool) and were investigated for platelet surface receptor GPIIb-IIIa (CD41 and CD61) by using flow cytometry.

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PMC11509224

Kalihinols M–N, with a formamide functionality at C-4, extended the structural breadth of this diterpenoid family.

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PMC11696659

B, percentage of telomeres of a sample with a telomere length under a given threshold (Short Tel).

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PMC8526701

PUMA is required for the antitumor effects of the combination.

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PMC9429973

Regarding the composite outcome of severe complications, we found a HR 1.03, (95% CI 0.59-1.80)p=0.896.

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PMC7519871

3D and (B) 2D poses of WDL with B-cell lymphoma 2 Protein (Bcl-2) PDB ID: 4LXD. (

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PMC11180402

Cycle threshold (Ct) values were ascertained post-analysis, with relative miRNA expression quantified via the 2 method, aligning with previously established protocols .

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PMC11066331

In ovarian cancer patients, epigenetic loss of TUSC3 expression correlates with poor prognosis and reduced survival .

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PMC10898159

Bortezomib can bind to Cbl, an E3 ubiquitin-protein ligase, destabilizing the c-KIT-Hsp90Β-Apaf-1 complex and releasing Apaf-1; then KIT was unleashed from the complex, and be internalized and degraded in the cytoplasm of GIST cells.

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PMC11551844

Our previous studies have showed significant cytotoxic activity of JDH, JDE and jaspamide—obtained from the sponge Jaspis diastra—on the TERA1, A172, DLD1 and HaCaT cell lines.

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PMC10976516

L-IFN (YSCH-01) single useIIntratumoral injection with YSCH-01 in solid tumors (including NSCLC) determining MTD and safety.

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PMC11732523

The patient improved significantly, with resolution of respiratory symptoms, improved oxygen saturation, and a negative COVID-19 RT-PCR.

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PMC11802855

A The volcano plot of the differentially expressed genes revealed by RNA-seq profiling of the CXCL7-OE and NC RPMI8226 cell lines (|logFC | > 1, p < 0.05).

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PMC11320834

Topotecan hydrochloride and olaparib were obtained from Selleck Chemicals LLC (Houston, TX, USA).

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PMC11392912

Using the slope of the standard curve, Clo-miR-14 concentration was measured in blood plasma and the rhizome of turmeric. (

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PMC8978939

In vitro, we found that these variants have a significantly shorter half-life compared to wild-type VHL but still form a functional VBC complex.

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PMC11644761

Transcript quantitative detection was conducted with SensiFAST™ SYBR & Fluorescein Kit (Bioline Reagents, London, UK, Cat.

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PMC10631132

No differences were observed regarding OC differentiation between the PBMC- and fibroblast-derived iPSC lines used in this study.

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PMC9429973

Importantly, combination immunotherapy triggered improved anti-tumor T cell killing function and promoted an inflammatory cytokine-rich “hot” TME.

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PMC11707832

The glycosylation modification of proteins and the turnover processes of glycan hydrolysis play a pivotal role in maintaining essential protein functions across various biological processes .

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PMC7351993

In the case of hiPSC therapy, label-free enrichment and applications of naïve stem cells is important for increasing the efficiency of preparing target types of differentiated cells such as retinal cells for human macular degeneraiton.

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PMC11779993

Our findings demonstrated that SPEE could increase the phosphorylation of FAK and Src in a concentration-dependent manner.

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PMC11612794

Error bars show the mean ± SD; p-values were calculated by one-way ANOVA (F (2,27) = 245.1; p < 0.0001) followed by Tukey’s test. (

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One of the prerequisites of cSTAR is to have an ample quantity of measured proteins or genes for cell state classifications and for constructing the STVs.

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PMC11206502

It offers increased metabolic flexibility in cancer cells, which are able to utilize different nutrients in response to increased energy demands due to high proliferation and maintenance of ROS at a moderate level.

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PMC9784246

Despite chemotherapeutic drugs’ high efficacy, many patients experience serious chemotherapy-induced side effects .

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Unfortunately the administration of HDMTX is related with risk of renal, hepatic and haematological adverse events.

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PMC9813422

The Burkitt lymphoma only expresses viral protein EBNA1, and represses other viral proteins, which belongs to the latency type I. On the contrary, LCL expresses all of the EBNAs as well as LMPs of EBV, belonging to the latency type III and similar conditions for viral reactivation of Akata-Zta cell, an EBV-positive BL (2, 57).

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