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OTAR3088
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BioData-CellLine_annotated

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PMC11621493
Samples were reconstituted in 30 μl chloroform and spotted onto a TLC Silica gel 60 aluminum sheet (1.05553.0001, Merck, Darmstadt, Germany).
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PMC11429241
Therefore, it is clear that TPP provides us with a unique opportunity in terms of bringing standardization to 3D cell culture generation.
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PMC9429973
Aims: The aim of this study was to describe hematologic and extrahematologic features in patients with STS diagnosed at age 15 or more and followed in adult centers.
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PMC10969097
To investigate the effect of MPSSS on prostate CAFs, a conditioned medium derived from CAFs (CAFs-CM) and a conditioned medium of CAFs pre-treated with MPSSS (CAFs-TCM) were first prepared, in which CAFs were treated with MPSSS at concentrations of 0 to 0.25 mg/mL. PC3 cells were then cultured in CAFs-CM and CAFs-TCM for 48 h, followed by treatment with different concentrations of docetaxel for 48 h .
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PMC8584666
GSH and GSSG levels were quantified according to the manufacturer’s protocol (GSSG/GSH Quantification Kit; Dojindo, Kumamoto, Japan).
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PMC4360730
The search uses the annotated ontological term for the biosample, synonyms found in the ontology or inferred relationships to the ontological term breast—UBERON:0000310.
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PMC11438317
Jurkat cells or PBLs were stimulated in 12 mm circular glass coverslips coated overnight at 4 °C with a 10 µg/µl CD3 antibody solution in PBS.
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PMC11387401
The top five terms of each significant functional annotation cluster with a Bonferonni corrected p value <0.05 were retained.
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PMC8711270
Scalable rAAV production is achieved simply by induction, without the use of helper viruses, transfection reagents or plasmids (CEVEC, 2020).
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PMC11261875
Within the GLUT family, GLUT-1 predominantly regulates basal glucose uptake, ensuring the maintenance of foundational cellular glucose metabolism.
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PMC11742431
This refined approach contrasts with conventional PROTACs, which indiscriminately mediate the degradation of certain proteins across all cells, lacking the cell‐type specificity that nanoantibody‐enhanced degradants provide.
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PMC11754291
In addition, many studies in the field rely on single-donor primary cells or immortalized cell lines, which can limit the generalizability of their findings (Regazzetti et al., 2018; Costin and Hearing, 2007).
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PMC11770130
The abundance of NTS peptide in BATs and WATs was almost unchanged upon fasting-refeeding (Supplementary information, Fig. S3e).
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PMC11777207
Treatment of either αPD-L1 10F9.G2 or 43H12 before flow staining completely abolished staining of PD-L1 BMDCs, indicating appropriate dosage with the observed binding occupancy of these antibodies on BMDCs (fig. S6D).
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PMC9429973
HPC cells can be genetically modified e.g. by retroviral transduction, which serves as a source to generate LSCs harboring hematopoietic stem cell oncogenes including BCR/ABL, MLL-AF9 or FLT3-ITD/NRAS.
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PMC9516401
Researchers suggest that some compounds bind to cysteines in the enzyme and inhibit enzyme activity (Song et al., 2003 ▶).
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PMC11543885
Immediately decant the final wash and fix the cells with 4% (wt/vol) paraformaldehyde (PFA), followed by permeabilization and blocking as described above.
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PMC11656380
Despite the lack of sequence homology, these peptides may act through a common, yet unidentified, functional pathway.
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PMC11679033
Here, we will briefly emphasize the significance of the findings obtained using the alkaline comet assay.
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PMC9577200
In addition, treating the HeLa cells with 0.4% for 24 h significantly decreased (p < 0.05) viability to 0.45%, increased (p < 0.05) early apoptosis to 0.27%, increased (p < 0.05) late apoptosis to 27.7%, and increased (p < 0.05) dead cells to 71.6%, relative to untreated controls.
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PMC11629143
Flow cytometry was repeated using cell pools from three biological repeats.
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Most pts (70%) had primary refractory disease.
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PMC10196713
However, the mechanism by which cisplatin-resistant cells acquire ferroptosis resistance remains unclear.
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PMC11683240
Subsequently, the cells were washed, fixed, permeabilized, and quenching was performed.
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Such delays cause unnecessary suffering and, in some cases, permanent damage.
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PMC11087055
Embryos were then washed with PBS to remove PFA, and unincorporated BrdU, and incubated with 1 M HCl for 1 hr at RT to denature DNA.
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PMC11519788
Consistent with this line, the half-lives of STAT3-ΔSBC and STAT3-S514A mutants were found to be longer than that of wild-type STAT3 (STAT3-WT; Figure 4M-N), and SPOP depletion led to a prolonged half-life of STAT3 (Figure 4O-P).
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PMC11487720
Unlike apoptosis, BCD does not exhibit membrane phosphatidylserine flip-over, mitochondrial apoptosis, damage to the Golgi complex, and chromosomal DNA fragmentation.
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PMC11799620
The in vitro tests showed that Opuntia ficus indica aqueous extract has a high capacity to disable the free radical effect and prevent HepG2 and erythrocytes.
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PMC11736898
Briefly, biopsies of keloid lesions or normal human skin were fixed in 10% buffered neutral formalin, and tissues were processed, embedded in paraffin and sectioned by the Histopathology Core Facility at the UC College of Medicine.
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PMC11258145
For the DOPC:curcumin system with increasing curcumin level the compression modulus decreased, while for the SK-N-SH:curcumin model this effect was opposite.
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PMC9429973
Donor-derived T-cells are transduced with a lentiviral vector to express the anti-CD22 chimeric antigen receptor (CAR; anti-CD22 scFv-41BB-CD3ζ) and are modified using Cellectis’ TALEN technology to disrupt the T-cell receptor α constant (TRAC) and CD52 genes to minimize risk of graft-vs-host disease (GvHD) and allow use of anti-CD52 drugs for lymphodepletion (LD).
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PMC10996034
With extensive research performed on EOC, several treatment modalities are available, including surgical treatment, chemotherapy, immunotherapy, targeted therapies and others; however, primary debulking surgery and combination chemotherapeutic regimens, including paclitaxel (Taxol), remain the standard of care for patients with advanced-stage EOC (3–5).
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PMC10545062
Intervention Bolus Statistics.
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PMC8978939
Panel IV shows mitotic figures indicated with black arrows; ×100. (
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PMC11700165
In a steady state, ITK-SYK was predominantly in the cytoplasm, and only a small fraction was localized to the nucleus or the membrane (Fig. 3A).
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PMC11684269
While, the kidney TRM cells, under physiological conditions, are constantly maintained in a state of readiness for combat, for the reason that renal tubular epithelial cells are furnished with the capacity of stimulating T cells in an MHC-independent manner (138).
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PMC10747160
When making MNE virus/pseudovirus with all three additional structural proteins, 40 μL of XtremeGENE HP Version 9 was added to the transfection mixture instead of 30 μL. All other protocols for lentivirus creation and storage were performed unchanged, as described above.
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PMC11371747
However, intestinal uptake of folic acid is predominantly mediated by PCFT and to a lesser extent by FR (Matherly and Hou, 2008; Zhao et al., 2008; Nutt et al., 2010).
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PMC10882807
qRT-PCR detected the expression of hsa_circ_0005397 in HCCLM3 cells transfected with shNC + vector, shEIF4A3 + pcDNA or shEIF4A3 + pcDNA. (
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PMC11506827
The cells were then pre-treated with GEF or DMSO for 12 h before treatment with or without TRAIL for another 12 h. Wound images were captured using a light microscope (OLYMPUS CKX41, Tokyo, Japan), and the wound size after scratching was quantified using ImageJ software.
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PMC11711663
RCVL1 and RCVL2 serve as the upper bounds for the CVL values.
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PMC11588085
They are capable of differentiating into various cell types or remaining undifferentiated to survive, proliferate, and migrate.
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PMC10940855
Femurs were fixed in 10 mL of 4% paraformaldehyde for 4 hours at 4°C.
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PMC11442172
Sensors can also be integrated to perform real-time monitoring of physicochemical cues, such as pH and O2 levels (84).
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PMC11755467
Enoxacin and nalidixic acid (Sigma-Aldrich, St. Louis, MO, USA) 10 mM stock solutions in 10 mL total volume were prepared freshly the day before usage in cell culture grade 50% DMSO (Sigma-Aldrich, St. Louis, MO, USA) with 5 mM NaOH final concentration under occasional shaking/ultra-sonication.
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PMC10858941
Interestingly, lowering HIF-1α levels seems to be related to an increased sensibility to TMZ , suggesting that a chemotherapy treatment combining TMZ and NNC could be beneficial for GBM patients.
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PMC8956657
This region has been shown to be required for ORF4b to block the nuclear translocation of the p65 subunit of NF-ĸB, thereby blocking NF-ĸB-dependent cytokine production, by binding specifically to IMPα3.
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PMC11472639
Displays a MREM participant on lenalidomide maintenance with detectable plasma cells, comprising only polyclonal plasma cells.
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The most frequent additional mutations were found in CALR mutated patients, including high risk mutation as ASXL1 and U2AF1 (Figure 1).
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PMC11380454
Moreover, these effects of AS101 resulted in increased tumor cell sensitivity to chemotherapy 28.
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Data are represented as mean +/− standard deviation.
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A single laser power (3 W/cm) and time of irradiation (3 min) were used throughout all the cell lines.
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PMC2118063
Although transcripts can be detected at low levels in several tissues, protein expression is limited to lymphocytes (53).
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PMC7840816
Chan et al. demonstrated that SOX7 could significantly suppress the expressions of Wnt targets cyclin D1 and c-Myc in endometrial cells (29).
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Recent studies have revealed that pirfenidone is a specific inhibitor of p38γ, and the p38 family is a cascade kinase involved in controlling cell responses to cytokines and stress.
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PMC10761218
The MTT assay is widely used to assess cell viability, cell proliferation, cytotoxicity testing, and drug screening .
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PMC11786704
Cell culture flask (TCF011025), cell culture dish (TCP010006, TCP010024 and TCP010096) and PCR tubes (PCR520200) were purchased from Guangzhou Jet Bio-Filtration Co., Ltd. Glass-bottom cell culture plates (801002 and 801004) and frozen storage tube (612521) were purchased from NEST Biotechnology Co. Ltd. (Wuxi, China).
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PMC11679033
Using specific modification of comet assay with formamidopyrimidine-DNA glycosylase (Fpg) enzyme, CIT at concentrations ≤60 μM for 24 h did not show toxic effect on HEK293 cells .
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PMC7185206
First, high serum sPD-L1 is a predictor of poor response to PD-1 inhibition in some malignancies and predicts poor outcomes overall in hepatocellular carcinoma, cholangiocarcinoma, lung cancer, melanoma, myeloma, NK T cell lymphoma, and others.
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PMC11093197
In addition, MCF10A cells expressing ZEB1 by the treatment with TGF‐β exhibit decreased entry into S phase in MCF10A cells. ,
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PMC7802142
ReN cell spheres were dissociated with Accutase (Life Technologies).
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PMC9046263
Increased expression of ERVK3-1 in GBM patients is associated with a poor prognosis independent of IDH-mutational status.
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PMC8973085
Yellow solid (90%); mp 190–192 °C (EtOH); IR (KBr, v, cm): 3461 (NH), 3277 (NH), 2221 (CN), 1695 (C=O), 1650 (C=O); H NMR (DMSO-d6): δ 2.51 (s, 3H, CH3), 2.66 (s, 3H, CH3), 3.66 (s, 3H, OCH3), 3.68 (s, 3H, OCH3), 7.04–7.79 (m, 12H, CH-Ar), 9.66 (bs, 1H, NH), 10.40 (bs, 1H, NH); C NMR (DMSO-d6): δ 20.50, 54.80, 56.20, 104.50, 113.70, 114.40, 115.60, 115.90, 116.60, 121.90, 122.80, 127.50, 129.50, 130.10, 135.40, 136.70, 139.10, 150.20, 154.20, 155.90, 158.30, 162.60, 163.10, 165.10, 170.00, 193.50; MS m/z (%): 583 [M] (91).
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PMC8998437
Furthermore, the CCR1 chemokine ligands (endogenous agonists) are abundantly secreted in bone marrow (CCL3, CCL7), lymph nodes (CCL4, CCL14), spleen (CCL3, CCL8, CCL14), tonsil (CCL8), and liver (CCL14, CCL15, CCL16) (reviewed in ).
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PMC8708099
The proliferation was analyzed according to the manufacturer’s instructions.
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PMC9599726
Supernatants were removed and 100 µL of BD cytofix–cytoperm was added to each pellet for 30 min on ice.
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PMC11055443
The bacterial attachment and invasion were evaluated according to our previous study (8).
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PMC11332076
We then transfected these constructs into Cos-7 cells and assessed their overexpression using an anti-myc antibody.
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Data are mean±s.d.,
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PMC9454178
The bands were visualized by incubating the blots with enhanced chemiluminescence (ECL, Yeasen) solution and were imaged by a Bio-Rad Imaging system detector.
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PMC11478724
See Table 3, Figure 5a-d].
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PMC9895440
b Mean log2 fold changes for gRNA enrichment in the pooled CRISPR/Cas9 screen.
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PMC9429973
During the follow-up period 81/608 (13.3%) patients developed VTE: CVL 61/608 (10.0%), deep vein thrombosis 16/608 (2.63%), pulmonary embolism 4/608 (0.01%).
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PMC9812014
The two major classes of alkaloids, indole alkaloids and isoquinoline alkaloids (each with about 4000 molecules) are generally categorised according to their chemical skeleton.
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PMC11395280
The BBB is formed by endothelial cells that use zonule occludins (ZO-1) and claudins to form tight junctions that facilitate the assembly of cells into intact monolayers while playing crucial roles in maintaining the integrity of the BBB .
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PMC11204465
Intramolecular acetals B-4 were generated spontaneously and synthesised.
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DNA was extracted with the DNeasy Blood and Tissue Kit (Qiagen, Hilden, Germany).
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PMC8839885
Chemicals and assay kits: The chemicals 2-methoxyestradiol (2ME2), 2-hydroxyestradiol 2HE2 and GNF-5 were obtained from Cayman Chemical Company (Ann Arbor, MI, USA).
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PMC9429973
While severe CRS rates did not significantly differ between cohorts, grade ≥3 ICANS was more common in US patients (25% vs. 9%, p<0.001), likely reflecting the more frequent use of of Axi-cel.
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PMC11533140
Finally, compound 17p exhibited excellent liver microsome stability and good pharmacokinetic properties, as well as low toxicity in the Ames test and hERG potassium channel assay.
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PMC11733919
However, a fraction of caspase 3-positive cells with lower fluorescence intensity and smaller cell size also occurred, suggesting that the apoptosis-based early response to MNP@CD26@17D treatment was accompanied by a massive cell fragmentation (Figure 4b).
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This altered microenvironment involves the interaction of many types of cells, but the communication between leukemic-initiating cells and mesenchymal stromal cells (MSC) has been studied in more detail .
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PMC4443654
Variable importance within random forest regression models was measured using the mean decrease in accuracy in the out-of-bag sample.
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Results: A total of 14,309 patients were included in this analysis.
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PMC10652261
In short, the K562, HL-60, and THP-1 cells (1 × 10 cells/well) were seeded in six-well plates and treated with IC50 values of compounds 2e–h for 24 h. After the incubations, the analysis was performed according to the kit procedure, processed for data acquisition, and analyzed on a Becton-Dickinson Accuri C6 flow cytometer using Accuri C6 software.
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PMC8345486
The crude product was purified by silica gel column chromatography using a gradient of methanol in methylene chloride as an eluent.
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These results suggested that CA inhibits CDK19 expression in liver cancer cells under HG conditions.
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Anti-HAZV N mAbs (182-1, used for immunoblot; 3102-1, used for immunoprecipitation) were generated by immunization of BALB/c mice with HAZV-infected L929 cells.
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A total of 126 publications reporting on 116 study populations were included.
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PMC11420784
The bar graph depicts the percentage of bacteria colocalizing with LC3 relative to the total number of cells.
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The current standard of care for pediatric instances is combination chemotherapy; however, these powerful therapies frequently result in protracted side effects over time.
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PMC11483468
Therefore, QGY-7701 cells were treated with GST-TAT-LPTS39 protein at final concentrations of 10 and 40 µg/mL every other day for a long time.
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PMC11756937
From a biobanking perspective, generating high-quality hiPSCs with low batch-to-batch variation is important to maximise consistency and reproducibility in basic research, disease modelling, drug screening and translational studies.
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PMC11632064
Pellets were washed with 70% ethanol and allowed to dry at RT before being dissolved in TE buffer (1 mM EDTA pH 8.0, 10 mM Tris–HCl pH 8.0) for 16–20 h at 4°C.
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PMC11711127
Necroptosis is a type of regulated necrosis that occurs under caspase-inhibitory conditions and is dependent on the activity of receptor-interacting protein kinases (RIPK).
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PMC11377827
Moreover, we did not observe any changes in Histone 2B lysine120 ubiquitination (H2BK120Ub) following USP43 loss, nor an association between USP43 and H2BK120Ub, in contrast to a prior report implicating USP43 in the regulation of this activating epigenetic mark (He et al, 2018) (Appendix Fig. S4A,B).Figure 6USP43 KO reduces HIF-1 binding to chromatin at HREs.(A) HIF-1α ChIP-PCR for HREs of CA9, PHD3 and VEGF in control, HIF1β or USP43 depleted HeLa cells treated with 21 or 1% oxygen for 6 h. n = 4 biologically independent samples, mean ± sd.
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PMC4005030
30 min prior to ulcer induction was found to possess significant antiulcer property and the ulcer index was significantly less in comparison to vehicle control animals.
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PMC11544122
BRET ratios were calculated by dividing the acceptor emission light intensity by the donor emission light intensity from three consecutive reads, and the resulting BRET ratios were averaged.
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PMC10094992
In fact, a high NLR could decrease the effects of the lymphocyte-mediated cellular immune response and promote tumour progression/maintenance .
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