Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC9429973
One year-OS (95% confidence interval [CI]) was 78.4% (73.9-82.9), 84.8% (79.7-89.9) and 93.0% (86.3-99.7); 2 year-OS (95%CI) was 61.3% (55.8-68.5), 74.5% (68.2-80.6) and 77.7% (65.0-90.4) in 2015-16, 2016-18 and 2019-20 cohorts, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "One", "year-OS", "(", "95", "%", "confidence", "interval", "[", "CI", "]", ")", "was", "78.4", "%", "(", "73.9", "-", "82.9", ")", ",", "84.8", "%", "(", "79.7", "-", "89.9", ")", "and", "93.0", "%", "(", "86.3", "-", "99.7", ")", ";", "2", "year-OS", "(", "95%CI", ")", "was", "61.3", "%", "(", "55.8", "-", "68.5", ")", ",", "74.5", "%", "(", "68.2", "-", "80.6", ")", "and", "77.7", "%", "(", "65.0", "-", "90.4", ")", "in", "2015", "-", "16", ",", "2016", "-", "18", "and", "2019", "-", "20", "cohorts", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11461874
TRAF7 was originally identified by a screening for components in the TNFα/NF-κB pathway, in which TRAF7 promotes ubiquitination of an adapter molecule NEMO, NF-κB essential modulator, and the tumor suppressor protein p53.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "TRAF7", "was", "originally", "identified", "by", "a", "screening", "for", "components", "in", "the", "TNFα/NF-κB", "pathway", ",", "in", "which", "TRAF7", "promotes", "ubiquitination", "of", "an", "adapter", "molecule", "NEMO", ",", "NF-κB", "essential", "modulator", ",", "and", "the", "tumor", "suppressor", "protein", "p53", "." ] } ]
PMC11519077
Additionally, when the IL-12 gene's expression in the AD-MSC and AD-CM groups was compared to that of the control, it was shown that there was a considerably higher level of gene expression in the AD-MSC (6.36 ± 1.523; p < 0.001) and AD-CM (14.69 ± 1.966; p < 0.001) groups (Figure 6(c)).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "when", "the", "IL-12", "gene", "'s", "expression", "in", "the", "AD-MSC", "and", "AD-CM", "groups", "was", "compared", "to", "that", "of", "the", "control", ",", "it", "was", "shown", "that", "there", "was", "a", "considerably", "higher", "level", "of", "gene", "expression", "in", "the", "AD-MSC", "(", "6.36", "±", "1.523", ";", "p", "<", "0.001", ")", "and", "AD-CM", "(", "14.69", "±", "1.966", ";", "p", "<", "0.001", ")", "groups", "(", "Figure", "6(c", ")", ")", "." ] } ]
PMC11591030
In contrast, both the AOP + LPS and LPS + ML385 + AOP treatment groups alleviated the overactivation of NF-κB caused by LPS but did not mitigate the oxidative damage in the PBLs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "contrast", ",", "both", "the", "AOP", "+", "LPS", "and", "LPS", "+", "ML385", "+", "AOP", "treatment", "groups", "alleviated", "the", "overactivation", "of", "NF-κB", "caused", "by", "LPS", "but", "did", "not", "mitigate", "the", "oxidative", "damage", "in", "the", "PBLs", "." ] } ]
PMC11388384
For tracking with exposure time of 24 ms, the main excitation laser 561 nm was pulsed for 6 ms using the acousto-optic tunable filter, to achieve 6 ms excitation times during a 24 ms frame capture (21).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "tracking", "with", "exposure", "time", "of", "24", "ms", ",", "the", "main", "excitation", "laser", "561", "nm", "was", "pulsed", "for", "6", "ms", "using", "the", "acousto-optic", "tunable", "filter", ",", "to", "achieve", "6", "ms", "excitation", "times", "during", "a", "24", "ms", "frame", "capture", "(", "21", ")", "." ] } ]
PMC9688728
We considered the change in the abundances of metabolites to be statistically significant with values of log2 (averaged abundances fold change) > 1.2 or <−1.2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "considered", "the", "change", "in", "the", "abundances", "of", "metabolites", "to", "be", "statistically", "significant", "with", "values", "of", "log2", "(", "averaged", "abundances", "fold", "change", ")", ">", "1.2", "or", "<", "−1.2", "." ] } ]
PMC9119314
The crystal was flash-frozen and kept at 150°K during data collection.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "crystal", "was", "flash-frozen", "and", "kept", "at", "150", "°", "K", "during", "data", "collection", "." ] } ]
PMC11763126
C Transwell assays showing changes in migration and invasion capabilities of RCC cells after different treatments.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "C", "Transwell", "assays", "showing", "changes", "in", "migration", "and", "invasion", "capabilities", "of", "RCC", "cells", "after", "different", "treatments", "." ] } ]
PMC11532793
For every scenario, simulations without any real differential expression between groups (null simulations) were also generated to assess methods’ type I error rate control.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "every", "scenario", ",", "simulations", "without", "any", "real", "differential", "expression", "between", "groups", "(", "null", "simulations", ")", "were", "also", "generated", "to", "assess", "methods", "’", "type", "I", "error", "rate", "control", "." ] } ]
PMC7185206
sPD-L1 may also act as a sink for circulating PD-L1 inhibitors (see Figure 4(e)).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "sPD-L1", "may", "also", "act", "as", "a", "sink", "for", "circulating", "PD-L1", "inhibitors", "(", "see", "Figure", "4(e", ")", ")", "." ] } ]
PMC10502403
Principal component analysis of 357 detected metabolites.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Principal", "component", "analysis", "of", "357", "detected", "metabolites", "." ] } ]
PMC8316344
Thus, these results were to some extent, indicative of the exclusive role of TRIB2 to regulate ferroptosis in liver cancer cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thus", ",", "these", "results", "were", "to", "some", "extent", ",", "indicative", "of", "the", "exclusive", "role", "of", "TRIB2", "to", "regulate", "ferroptosis", "in", "liver", "cancer", "cells", "." ] } ]
PMC11310713
Similar to pharmaceutical hormone-treated groups, the GTB-treated group showed a recovery tendency of all parameters with significant differences compared to OVX rats.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Similar", "to", "pharmaceutical", "hormone-treated", "groups", ",", "the", "GTB-treated", "group", "showed", "a", "recovery", "tendency", "of", "all", "parameters", "with", "significant", "differences", "compared", "to", "OVX", "rats", "." ] } ]
PMC6835428
Notably, a single gene product often controls many of the above cellular phenotypes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Notably", ",", "a", "single", "gene", "product", "often", "controls", "many", "of", "the", "above", "cellular", "phenotypes", "." ] } ]
PMC11754094
The sequencing process ran at a speed of 260 bps and base calls were made on the resulting data using guppy (Oxford Nanopore) with super high accuracy mode.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "sequencing", "process", "ran", "at", "a", "speed", "of", "260", "bps", "and", "base", "calls", "were", "made", "on", "the", "resulting", "data", "using", "guppy", "(", "Oxford", "Nanopore", ")", "with", "super", "high", "accuracy", "mode", "." ] } ]
PMC9111184
whereas the FTIR studies didn't show similar changes between ezetimibe and the three hydroxycinnamic acid derivatives in protein and nucleic acids region, suggesting that these compounds have hypocholesterolemic effect.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "whereas", "the", "FTIR", "studies", "did", "n't", "show", "similar", "changes", "between", "ezetimibe", "and", "the", "three", "hydroxycinnamic", "acid", "derivatives", "in", "protein", "and", "nucleic", "acids", "region", ",", "suggesting", "that", "these", "compounds", "have", "hypocholesterolemic", "effect", "." ] } ]
PMC10907726
Our study found that DATS significantly inhibited EGFR expression and induced autophagy, which played a vital role in apoptosis and migration.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "study", "found", "that", "DATS", "significantly", "inhibited", "EGFR", "expression", "and", "induced", "autophagy", ",", "which", "played", "a", "vital", "role", "in", "apoptosis", "and", "migration", "." ] } ]
PMC10291556
Previous results showed that the studied Pt(IV) complexes, as well as free DCF ligand, can influence the level of COX-2 expression.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Previous", "results", "showed", "that", "the", "studied", "Pt(IV", ")", "complexes", ",", "as", "well", "as", "free", "DCF", "ligand", ",", "can", "influence", "the", "level", "of", "COX-2", "expression", "." ] } ]
PMC7305184
60 µl of the sample was transferred between electrodes, and electric pulses were applied.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "60", "µl", "of", "the", "sample", "was", "transferred", "between", "electrodes", ",", "and", "electric", "pulses", "were", "applied", "." ] } ]
PMC9429973
Median time to the first line (1L) and from 1L to second line (2L) were evaluated using a Kaplan-Meier analysis (KM) to account for censoring.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Median", "time", "to", "the", "first", "line", "(", "1L", ")", "and", "from", "1L", "to", "second", "line", "(", "2L", ")", "were", "evaluated", "using", "a", "Kaplan-Meier", "analysis", "(", "KM", ")", "to", "account", "for", "censoring", "." ] } ]
PMC11621493
All enzyme activity assays were carried out by incubating 1 μg of partially purified protein with 20 μl of lipid substrate (1 mM) in PBS (pH 7.4) containing 2% BSA (FA free) for 1 h at 37°C (n = 3).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "enzyme", "activity", "assays", "were", "carried", "out", "by", "incubating", "1", "μg", "of", "partially", "purified", "protein", "with", "20", "μl", "of", "lipid", "substrate", "(", "1", "mM", ")", "in", "PBS", "(", "pH", "7.4", ")", "containing", "2", "%", "BSA", "(", "FA", "free", ")", "for", "1", "h", "at", "37", "°", "C", "(", "n", "=", "3", ")", "." ] } ]
PMC11678130
The obtained IC50 value was 11.08 µM. According to this, 10 µM QUE was further used for the combinatorial treatment with 5-FU.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "obtained", "IC50", "value", "was", "11.08", "µM.", "According", "to", "this", ",", "10", "µM", "QUE", "was", "further", "used", "for", "the", "combinatorial", "treatment", "with", "5-FU", "." ] } ]
PMC9429973
C. Rodriguez, J. L. Kaufman, J. Laubach, D. W. Sborov, B. Reeves, A. Chari, R. Silbermann, L. J. Costa, L. D. Anderson Jr, N. Nathwani, N. Shah, N. Bumma, A. Jakubowiak, R. Z. Orlowski, H. Pei, A. Cortoos, S. Patel, T. S. Lin, P. G. Richardson, P. M. Voorhees Wake Forest University School of Medicine, Winston-Salem; Winship Cancer Institute, Emory University, Atlanta; Dana-Farber Cancer Institute, Boston; Huntsman Cancer Institute, University of Utah School of Medicine, Salt Lake City; University of North Carolina – Chapel Hill, Chapel Hill; Tisch Cancer Institute, Mount Sinai School of Medicine, New York; Knight Cancer Institute, Oregon Health & Science University, Portland; University of Alabama at Birmingham, Birmingham; Simmons Comprehensive Cancer Center, UT Southwestern Medical Center, Dallas; Judy and Bernard Briskin Center for Multiple Myeloma Research, City of Hope Comprehensive Cancer Center, Duarte; Department of Medicine, University of California San Francisco, San Francisco; Division of Hematology, The Ohio State University Comprehensive Cancer Center, Columbus; University of Chicago Medical Center, Chicago; Department of Lymphoma and Myeloma, The University of Texas MD Anderson Cancer Center, Houston; Janssen Research & Development, LLC, Titusville; Janssen Scientific Affairs, LLC, Horsham; Levine Cancer Institute, Atrium Health, Charlotte, United States of America Background: In the primary analysis of the phase 2 randomized GRIFFIN study, Daratumumab (DARA) + lenalidomide, bortezomib, and dexamethasone (D-RVd) improved the stringent complete response (sCR) rate by end of consolidation for transplant-eligible newly diagnosed multiple myeloma (NDMM) (42.4% vs 32.0%; 1-sided P = 0.068).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "C.", "Rodriguez", ",", "J.", "L.", "Kaufman", ",", "J.", "Laubach", ",", "D.", "W.", "Sborov", ",", "B.", "Reeves", ",", "A.", "Chari", ",", "R.", "Silbermann", ",", "L.", "J.", "Costa", ",", "L.", "D.", "Anderson", "Jr", ",", "N.", "Nathwani", ",", "N.", "Shah", ",", "N.", "Bumma", ",", "A.", "Jakubowiak", ",", "R.", "Z.", "Orlowski", ",", "H.", "Pei", ",", "A.", "Cortoos", ",", "S.", "Patel", ",", "T.", "S.", "Lin", ",", "P.", "G.", "Richardson", ",", "P.", "M.", "Voorhees", "Wake", "Forest", "University", "School", "of", "Medicine", ",", "Winston-Salem", ";", "Winship", "Cancer", "Institute", ",", "Emory", "University", ",", "Atlanta", ";", "Dana-Farber", "Cancer", "Institute", ",", "Boston", ";", "Huntsman", "Cancer", "Institute", ",", "University", "of", "Utah", "School", "of", "Medicine", ",", "Salt", "Lake", "City", ";", "University", "of", "North", "Carolina", "–", "Chapel", "Hill", ",", "Chapel", "Hill", ";", "Tisch", "Cancer", "Institute", ",", "Mount", "Sinai", "School", "of", "Medicine", ",", "New", "York", ";", "Knight", "Cancer", "Institute", ",", "Oregon", "Health", "&", "Science", "University", ",", "Portland", ";", "University", "of", "Alabama", "at", "Birmingham", ",", "Birmingham", ";", "Simmons", "Comprehensive", "Cancer", "Center", ",", "UT", "Southwestern", "Medical", "Center", ",", "Dallas", ";", "Judy", "and", "Bernard", "Briskin", "Center", "for", "Multiple", "Myeloma", "Research", ",", "City", "of", "Hope", "Comprehensive", "Cancer", "Center", ",", "Duarte", ";", "Department", "of", "Medicine", ",", "University", "of", "California", "San", "Francisco", ",", "San", "Francisco", ";", "Division", "of", "Hematology", ",", "The", "Ohio", "State", "University", "Comprehensive", "Cancer", "Center", ",", "Columbus", ";", "University", "of", "Chicago", "Medical", "Center", ",", "Chicago", ";", "Department", "of", "Lymphoma", "and", "Myeloma", ",", "The", "University", "of", "Texas", "MD", "Anderson", "Cancer", "Center", ",", "Houston", ";", "Janssen", "Research", "&", "Development", ",", "LLC", ",", "Titusville", ";", "Janssen", "Scientific", "Affairs", ",", "LLC", ",", "Horsham", ";", "Levine", "Cancer", "Institute", ",", "Atrium", "Health", ",", "Charlotte", ",", "United", "States", "of", "America", "Background", ":", "In", "the", "primary", "analysis", "of", "the", "phase", "2", "randomized", "GRIFFIN", "study", ",", "Daratumumab", "(", "DARA", ")", "+", "lenalidomide", ",", "bortezomib", ",", "and", "dexamethasone", "(", "D-RVd", ")", "improved", "the", "stringent", "complete", "response", "(", "sCR", ")", "rate", "by", "end", "of", "consolidation", "for", "transplant-eligible", "newly", "diagnosed", "multiple", "myeloma", "(", "NDMM", ")", "(", "42.4", "%", "vs", "32.0", "%", ";", "1-sided", "P", "=", "0.068", ")", "." ] } ]
PMC11594806
It is produced from the metabolism of adenosine triphosphate (ATP) or nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) and is transported by the nucleoside transporter ENT1 and other transporters.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "is", "produced", "from", "the", "metabolism", "of", "adenosine", "triphosphate", "(", "ATP", ")", "or", "nicotinamide", "adenine", "dinucleotide", "(", "NAD+", ")", "and", "is", "transported", "by", "the", "nucleoside", "transporter", "ENT1", "and", "other", "transporters", "." ] } ]
PMC11765678
Additional research is needed to address potential limitations, including off-target effects and toxicity profiles of ferroptosis inducers.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additional", "research", "is", "needed", "to", "address", "potential", "limitations", ",", "including", "off-target", "effects", "and", "toxicity", "profiles", "of", "ferroptosis", "inducers", "." ] } ]
PMC11666785
Scale bar = 1μm.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Scale", "bar", "=", "1μm", "." ] } ]
PMC11530949
The highly sensitive HepG2 cell line was treated with the IC50 concentration for 24 hours.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "highly", "sensitive", "HepG2", "cell", "line", "was", "treated", "with", "the", "IC50", "concentration", "for", "24", "hours", "." ] } ]
PMC7917457
After 22 h incubation, CD40L-induced NF-κB activation was measured.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "22", "h", "incubation", ",", "CD40L-induced", "NF-κB", "activation", "was", "measured", "." ] } ]
PMC11658074
iNOS, which is downstream of the NF-κB pathway, had lower expression in the shNC-AT-EV group than in the shAdipoR-AT-EV group (Fig. 5f, g).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "iNOS", ",", "which", "is", "downstream", "of", "the", "NF-κB", "pathway", ",", "had", "lower", "expression", "in", "the", "shNC-AT-EV", "group", "than", "in", "the", "shAdipoR-AT-EV", "group", "(", "Fig.", "5f", ",", "g", ")", "." ] } ]
PMC9219615
Controls were included as previously described.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Controls", "were", "included", "as", "previously", "described", "." ] } ]
PMC7305184
60 µl samples were placed between plate electrodes and pulses were delivered (8 × 100 µs, 1 Hz, 200 V).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "60", "µl", "samples", "were", "placed", "between", "plate", "electrodes", "and", "pulses", "were", "delivered", "(", "8", "×", "100", "µs", ",", "1", "Hz", ",", "200", "V", ")", "." ] } ]
PMC11206502
It is associated with a poor prognosis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "is", "associated", "with", "a", "poor", "prognosis", "." ] } ]
PMC10502403
NE1-GMCs contained more metabolites of the tricarboxylic acid (TCA) cycle and oxidative phosphorylation (OXPHOS) in both unstimulated and stimulated states (Figure 3C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "NE1-GMCs", "contained", "more", "metabolites", "of", "the", "tricarboxylic", "acid", "(", "TCA", ")", "cycle", "and", "oxidative", "phosphorylation", "(", "OXPHOS", ")", "in", "both", "unstimulated", "and", "stimulated", "states", "(", "Figure", "3C", ")", "." ] } ]
PMC11442172
For example, several groups have set out to establish patient-derived explants (PDEs) to investigate tumor cell metabolism.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "example", ",", "several", "groups", "have", "set", "out", "to", "establish", "patient-derived", "explants", "(", "PDEs", ")", "to", "investigate", "tumor", "cell", "metabolism", "." ] } ]
PMC9429973
A. Inati, M. Sabbagh, C. Al Alam, A. Al Kheir, Z. Massouh, R. Demachkie, C. Ojaimy, N. Dani, A. Siddiqui, R. Rajat Adhikary, B. Lynch, A. Srivastava School of Medicine, Lebanese American University; Novartis, Beirut, Lebanon; American Center for Psychiatry and Neurology, Abu Dhabi, United Arab Emirates; Saudi German Hospital, Dammam, Saudi Arabia; Department of Pediatrics, NINI Hospital, Tripoli; School of Medicine, Lebanese American University, Byblos, Lebanon; Novartis; Novartis Pharma AG, Basel, Switzerland; Novartis, Hyderabad, India; Novartis, Dublin, Ireland Background: Sickle cell disease (SCD) remains associated with high healthcare resource utilization (HRU), despite a reduction in morbidity and mortality associated with the use of disease-modifying therapies, mostly because of vaso-occlusive crises (VOC).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A.", "Inati", ",", "M.", "Sabbagh", ",", "C.", "Al", "Alam", ",", "A.", "Al", "Kheir", ",", "Z.", "Massouh", ",", "R.", "Demachkie", ",", "C.", "Ojaimy", ",", "N.", "Dani", ",", "A.", "Siddiqui", ",", "R.", "Rajat", "Adhikary", ",", "B.", "Lynch", ",", "A.", "Srivastava", "School", "of", "Medicine", ",", "Lebanese", "American", "University", ";", "Novartis", ",", "Beirut", ",", "Lebanon", ";", "American", "Center", "for", "Psychiatry", "and", "Neurology", ",", "Abu", "Dhabi", ",", "United", "Arab", "Emirates", ";", "Saudi", "German", "Hospital", ",", "Dammam", ",", "Saudi", "Arabia", ";", "Department", "of", "Pediatrics", ",", "NINI", "Hospital", ",", "Tripoli", ";", "School", "of", "Medicine", ",", "Lebanese", "American", "University", ",", "Byblos", ",", "Lebanon", ";", "Novartis", ";", "Novartis", "Pharma", "AG", ",", "Basel", ",", "Switzerland", ";", "Novartis", ",", "Hyderabad", ",", "India", ";", "Novartis", ",", "Dublin", ",", "Ireland", "Background", ":", "Sickle", "cell", "disease", "(", "SCD", ")", "remains", "associated", "with", "high", "healthcare", "resource", "utilization", "(", "HRU", ")", ",", "despite", "a", "reduction", "in", "morbidity", "and", "mortality", "associated", "with", "the", "use", "of", "disease-modifying", "therapies", ",", "mostly", "because", "of", "vaso-occlusive", "crises", "(", "VOC", ")", "." ] } ]
PMC11760643
HEK‐P2X7 and HEK‐293 cells were plated in a black clear‐bottom 96‐well plate (5 × 10 cells per well; Greiner Bio‐One, Krems Master, Austria) overnight at 37°C and 95% air/5% CO2.
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HEK‐P2X7", "and", "HEK‐293", "cells", "were", "plated", "in", "a", "black", "clear‐bottom", "96‐well", "plate", "(", "5", "×", "10", "cells", "per", "well", ";", "Greiner", "Bio‐One", ",", "Krems", "Master", ",", "Austria", ")", "overnight", "at", "37", "°", "C", "and", "95", "%", "air/5", "%", "CO2", "." ] } ]
PMC11583010
The secondary antibody only constituted another negative control, and a rituximab biosimilar (1 μg/mL) was used as an internal positive control.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "secondary", "antibody", "only", "constituted", "another", "negative", "control", ",", "and", "a", "rituximab", "biosimilar", "(", "1", "μg/mL", ")", "was", "used", "as", "an", "internal", "positive", "control", "." ] } ]
PMC11359735
Glycosylphosphatidylinositol (GPI) anchor protein modification in Plasmodium species is well known and represents the principal form of glycosylation in these organisms.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Glycosylphosphatidylinositol", "(", "GPI", ")", "anchor", "protein", "modification", "in", "Plasmodium", "species", "is", "well", "known", "and", "represents", "the", "principal", "form", "of", "glycosylation", "in", "these", "organisms", "." ] } ]
PMC11462929
However, another aCGH analysis confirmed that BENC‐CNA was not present in the original primary sample at relapse.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "another", "aCGH", "analysis", "confirmed", "that", "BENC‐CNA", "was", "not", "present", "in", "the", "original", "primary", "sample", "at", "relapse", "." ] } ]
PMC10998613
Laser powers were set to 400 nW for 488 nm beam and 700 nW for 561 nm beam using an energy meter (Thorlabs).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Laser", "powers", "were", "set", "to", "400", "nW", "for", "488", "nm", "beam", "and", "700", "nW", "for", "561", "nm", "beam", "using", "an", "energy", "meter", "(", "Thorlabs", ")", "." ] } ]
PMC11277157
The signaling cascade was initiated by EIF2AK2 (PKR, an IFN-induced dsRNA-dependent kinase), which plays a central role in the innate immune response to viral infection .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "signaling", "cascade", "was", "initiated", "by", "EIF2AK2", "(", "PKR", ",", "an", "IFN-induced", "dsRNA-dependent", "kinase", ")", ",", "which", "plays", "a", "central", "role", "in", "the", "innate", "immune", "response", "to", "viral", "infection", "." ] } ]
PMC11650848
All tests were conducted in a single session lasting between 90 and 120 min per child.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "tests", "were", "conducted", "in", "a", "single", "session", "lasting", "between", "90", "and", "120", "min", "per", "child", "." ] } ]
PMC11190538
Proteins show high absorbencies in this region, which is within the mid-infrared region and is different for each protein, where the position and the intensity of the bands are specific for every protein allowing its possible identification .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Proteins", "show", "high", "absorbencies", "in", "this", "region", ",", "which", "is", "within", "the", "mid-infrared", "region", "and", "is", "different", "for", "each", "protein", ",", "where", "the", "position", "and", "the", "intensity", "of", "the", "bands", "are", "specific", "for", "every", "protein", "allowing", "its", "possible", "identification", "." ] } ]
PMC11441402
Added benefits of the automated cell imaging include the ability to effectively compare adherent and suspension cell lines, as well as the reduced time it takes to perform the assay, the ability to include other dyes of interest for staining, microscopic imaging of cells which may provide insight into morphological changes occurring to the cells and mechanisms of cell death, and environmental control allowing for long term imaging studies.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Added", "benefits", "of", "the", "automated", "cell", "imaging", "include", "the", "ability", "to", "effectively", "compare", "adherent", "and", "suspension", "cell", "lines", ",", "as", "well", "as", "the", "reduced", "time", "it", "takes", "to", "perform", "the", "assay", ",", "the", "ability", "to", "include", "other", "dyes", "of", "interest", "for", "staining", ",", "microscopic", "imaging", "of", "cells", "which", "may", "provide", "insight", "into", "morphological", "changes", "occurring", "to", "the", "cells", "and", "mechanisms", "of", "cell", "death", ",", "and", "environmental", "control", "allowing", "for", "long", "term", "imaging", "studies", "." ] } ]
PMC6190245
After three different treatment time periods (24, 48 and 72 hr), the medium was removed and the HeLa cells were treated with MTT solution (5 mg/ml in PBS) for 4 hr.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "three", "different", "treatment", "time", "periods", "(", "24", ",", "48", "and", "72", "hr", ")", ",", "the", "medium", "was", "removed", "and", "the", "HeLa", "cells", "were", "treated", "with", "MTT", "solution", "(", "5", "mg/ml", "in", "PBS", ")", "for", "4", "hr", "." ] } ]
PMC11345828
All samples were of ≥95% purity as analyzed by HPLC.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "samples", "were", "of", "≥95", "%", "purity", "as", "analyzed", "by", "HPLC", "." ] } ]
PMC11658074
d, e The protein expression of AdipoR in the NIH3T3-shNC group and NIH3T3-shAdipoR group.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "d", ",", "e", "The", "protein", "expression", "of", "AdipoR", "in", "the", "NIH3T3-shNC", "group", "and", "NIH3T3-shAdipoR", "group", "." ] } ]
PMC11306331
Here, we report progress toward these goals by developing an optogenetic strategy for IDR-based condensate dissolution.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Here", ",", "we", "report", "progress", "toward", "these", "goals", "by", "developing", "an", "optogenetic", "strategy", "for", "IDR-based", "condensate", "dissolution", "." ] } ]
PMC9429973
Immunophenotype analysis revealed reduced propensities of NK cells, CD4+ T-cells with an inverted CD4/CD8 ratio, T-follicular helper cells and hypogammaglobulinemia across patients, while the p.I325V patient also had a reduction in relative and absolute B-cells and low relative proportions of Treg, MAIT and iNKT populations.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Immunophenotype", "analysis", "revealed", "reduced", "propensities", "of", "NK", "cells", ",", "CD4", "+", "T-cells", "with", "an", "inverted", "CD4/CD8", "ratio", ",", "T-follicular", "helper", "cells", "and", "hypogammaglobulinemia", "across", "patients", ",", "while", "the", "p.", "I325V", "patient", "also", "had", "a", "reduction", "in", "relative", "and", "absolute", "B-cells", "and", "low", "relative", "proportions", "of", "Treg", ",", "MAIT", "and", "iNKT", "populations", "." ] } ]
PMC11621493
The strong DAG accumulation upon MAG supplementation points toward a role of the enzyme in the metabolization of MAG from extracellular sources.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "strong", "DAG", "accumulation", "upon", "MAG", "supplementation", "points", "toward", "a", "role", "of", "the", "enzyme", "in", "the", "metabolization", "of", "MAG", "from", "extracellular", "sources", "." ] } ]
PMC10812665
The up-regulation of OH-glutarate also suggests that reduced levels of, e.g., citrate, are unlikely due to an overall loss of mitochondrial mass.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "up-regulation", "of", "OH-glutarate", "also", "suggests", "that", "reduced", "levels", "of", ",", "e.g.", ",", "citrate", ",", "are", "unlikely", "due", "to", "an", "overall", "loss", "of", "mitochondrial", "mass", "." ] } ]
PMC9429973
We defined two SRC populations (cut off value 80 pmol/min/x105 cells): higher (124±47 pmol/min/x105 cells) and lower (52±25 pmol/min/x105cells) levels (p=0.0001).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "defined", "two", "SRC", "populations", "(", "cut", "off", "value", "80", "pmol/min/x105", "cells", "):", "higher", "(", "124±47", "pmol/min/x105", "cells", ")", "and", "lower", "(", "52±25", "pmol/min/x105cells", ")", "levels", "(", "p=0.0001", ")", "." ] } ]
PMC11700247
Although more CD8 T cells infiltrated the tumors of both groups that received RT (supplemental Figure 2B), only the group that received the combination treatment demonstrated a significant increase in cytotoxic CD107 T cells (supplemental Figure 2C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Although", "more", "CD8", "T", "cells", "infiltrated", "the", "tumors", "of", "both", "groups", "that", "received", "RT", "(", "supplemental", "Figure", "2B", ")", ",", "only", "the", "group", "that", "received", "the", "combination", "treatment", "demonstrated", "a", "significant", "increase", "in", "cytotoxic", "CD107", "T", "cells", "(", "supplemental", "Figure", "2C", ")", "." ] } ]
PMC3675084
BPR0L075 is not a substrate for the P-gp and BCRP efflux pumps, evidenced by the similar BPR0L075 intracellular levels achieved in the parental and resistant sublines (Figure 2C) and comparable IC50 values in MCF7 and MCF7/MX cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "BPR0L075", "is", "not", "a", "substrate", "for", "the", "P-gp", "and", "BCRP", "efflux", "pumps", ",", "evidenced", "by", "the", "similar", "BPR0L075", "intracellular", "levels", "achieved", "in", "the", "parental", "and", "resistant", "sublines", "(", "Figure", "2C", ")", "and", "comparable", "IC50", "values", "in", "MCF7", "and", "MCF7/MX", "cells", "." ] } ]
PMC11634794
The UALCAN database(http://ualcan.path.uab.edu/index.html) provides in-depth RNA-SEQ expression analysis derived from the TCGA database and facilitates comparative assessment of protein expression disparities between tumor tissues and normal tissues (13).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "UALCAN", "database(http://ualcan.path.uab.edu/index.html", ")", "provides", "in-depth", "RNA-SEQ", "expression", "analysis", "derived", "from", "the", "TCGA", "database", "and", "facilitates", "comparative", "assessment", "of", "protein", "expression", "disparities", "between", "tumor", "tissues", "and", "normal", "tissues", "(", "13", ")", "." ] } ]
PMC9341513
Box plot showing a similar measurement but extracted from n = 440 simulated configurations from each cell line (see Supplemental Methods for details of the calculation; simulation length units roughly map to physical units as σ ≈ 21.8 nm, so σ ≈ 1.04 × 10 µm).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Box", "plot", "showing", "a", "similar", "measurement", "but", "extracted", "from", "n", "=", "440", "simulated", "configurations", "from", "each", "cell", "line", "(", "see", "Supplemental", "Methods", "for", "details", "of", "the", "calculation", ";", "simulation", "length", "units", "roughly", "map", "to", "physical", "units", "as", "σ", "≈", "21.8", "nm", ",", "so", "σ", "≈", "1.04", "×", "10", "µm", ")", "." ] } ]
PMC9429973
At wk 96, more pts on asciminib than BOS had BCR::ABL1 ≤1% (45.1% vs 19.4%) (Table).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "wk", "96", ",", "more", "pts", "on", "asciminib", "than", "BOS", "had", "BCR::ABL1", "≤1", "%", "(", "45.1", "%", "vs", "19.4", "%", ")", "(", "Table", ")", "." ] } ]
PMC6222726
Currently, there are two recognized subgenera: one subgenus named Bursera (previously called section Bursera) that includes species commonly known with the general vernacular name of “cuajiotes”, and the other is called Elaphrium (previously called section Bullockia) that comprises species with the general common name of “copales” .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Currently", ",", "there", "are", "two", "recognized", "subgenera", ":", "one", "subgenus", "named", "Bursera", "(", "previously", "called", "section", "Bursera", ")", "that", "includes", "species", "commonly", "known", "with", "the", "general", "vernacular", "name", "of", "“", "cuajiotes", "”", ",", "and", "the", "other", "is", "called", "Elaphrium", "(", "previously", "called", "section", "Bullockia", ")", "that", "comprises", "species", "with", "the", "general", "common", "name", "of", "“", "copales", "”", "." ] } ]
PMC11001582
The UAS-(GR)36 flies have been previously described.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "UAS-(GR)36", "flies", "have", "been", "previously", "described", "." ] } ]
PMC9429973
One serious AESI of G2 GvHD limited to the skin was reported in the setting of reactivation of prior allogeneic transplant donor stem cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "One", "serious", "AESI", "of", "G2", "GvHD", "limited", "to", "the", "skin", "was", "reported", "in", "the", "setting", "of", "reactivation", "of", "prior", "allogeneic", "transplant", "donor", "stem", "cells", "." ] } ]
PMC8140214
Measurement of GPx activity GPx activity was measured bythe process described by Fecondo and Augustey based on monitoring continuous substitution of reduced GSH from oxidized form (G-S-S-G) in the presence of enzyme glutathione reductase.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Measurement", "of", "GPx", "activity", "GPx", "activity", "was", "measured", "bythe", "process", "described", "by", "Fecondo", "and", "Augustey", "based", "on", "monitoring", "continuous", "substitution", "of", "reduced", "GSH", "from", "oxidized", "form", "(", "G-S-S-G", ")", "in", "the", "presence", "of", "enzyme", "glutathione", "reductase", "." ] } ]
PMC9429973
There was no difference in PFS between frailty subgroups.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "was", "no", "difference", "in", "PFS", "between", "frailty", "subgroups", "." ] } ]
PMC10142392
Generally, an increase in the solvophilic components leads to higher CMC in aggregates.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Generally", ",", "an", "increase", "in", "the", "solvophilic", "components", "leads", "to", "higher", "CMC", "in", "aggregates", "." ] } ]
PMC8316344
C Deletion of TRIB2 elevated labile iron via TFRC in Bel-7404 cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "C", "Deletion", "of", "TRIB2", "elevated", "labile", "iron", "via", "TFRC", "in", "Bel-7404", "cells", "." ] } ]
PMC11786767
E: Negative correlation of the biotin-DHPE ratio and Ki-67 signal intensity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "E", ":", "Negative", "correlation", "of", "the", "biotin-DHPE", "ratio", "and", "Ki-67", "signal", "intensity", "." ] } ]
PMC9429973
These remained significant after adjusting for differential distribution in age, gender and ethnicity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "remained", "significant", "after", "adjusting", "for", "differential", "distribution", "in", "age", ",", "gender", "and", "ethnicity", "." ] } ]
PMC4485786
Cloning and sequencing of the CDR3 region confirmed that the peaks contained limited numbers of different T-cell clones with strongly amplified TRBV segments in the 2 treatment groups, such as TRBV29-1 in all individuals of the NHS-IL12/FcIL-7 cohort or TRBV5-5 and TRBV18 in the NHS-IL12/IL-2MAB602 cohort (Fig. 4B, C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cloning", "and", "sequencing", "of", "the", "CDR3", "region", "confirmed", "that", "the", "peaks", "contained", "limited", "numbers", "of", "different", "T-cell", "clones", "with", "strongly", "amplified", "TRBV", "segments", "in", "the", "2", "treatment", "groups", ",", "such", "as", "TRBV29", "-", "1", "in", "all", "individuals", "of", "the", "NHS-IL12/FcIL-7", "cohort", "or", "TRBV5", "-", "5", "and", "TRBV18", "in", "the", "NHS-IL12/IL-2MAB602", "cohort", "(", "Fig.", "4B", ",", "C", ")", "." ] } ]
PMC11015054
Finally, METTL5 promoted neutrophil activation and NETs release, but the specific molecular mechanism remains to be further investigated.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Finally", ",", "METTL5", "promoted", "neutrophil", "activation", "and", "NETs", "release", ",", "but", "the", "specific", "molecular", "mechanism", "remains", "to", "be", "further", "investigated", "." ] } ]
PMC11345828
No.: 26140).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "No.", ":", "26140", ")", "." ] } ]
PMC9429973
In HCL, the use of PET-CT has been reported mainly in patients who presents with unusual clinical sites of involvement or manifestation, and are available in the literature only as case reports.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "HCL", ",", "the", "use", "of", "PET-CT", "has", "been", "reported", "mainly", "in", "patients", "who", "presents", "with", "unusual", "clinical", "sites", "of", "involvement", "or", "manifestation", ",", "and", "are", "available", "in", "the", "literature", "only", "as", "case", "reports", "." ] } ]
PMC11730311
For determination of pharmacokinetic profile, 700 nmol/kg of each selected lipidated peptide were administered intravenously (IV).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "determination", "of", "pharmacokinetic", "profile", ",", "700", "nmol/kg", "of", "each", "selected", "lipidated", "peptide", "were", "administered", "intravenously", "(", "IV", ")", "." ] } ]
PMC9621239
The western blot assays were used to assess the ubiquitination levels of MYC by the antibody aginst the ubiquitin after the MYC-Flag was immunoprecipitated in the Huh 7 cells transiently expressing HBx-WT, HBx-SM, HBx-DM or HBx-TM.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "western", "blot", "assays", "were", "used", "to", "assess", "the", "ubiquitination", "levels", "of", "MYC", "by", "the", "antibody", "aginst", "the", "ubiquitin", "after", "the", "MYC-Flag", "was", "immunoprecipitated", "in", "the", "Huh", "7", "cells", "transiently", "expressing", "HBx-WT", ",", "HBx-SM", ",", "HBx-DM", "or", "HBx-TM", "." ] } ]
PMC11777207
The residues most essential for PD-L1 binding with CD80 are PD-L1 residues Y56, G119, and G120 (32).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "residues", "most", "essential", "for", "PD-L1", "binding", "with", "CD80", "are", "PD-L1", "residues", "Y56", ",", "G119", ",", "and", "G120", "(", "32", ")", "." ] } ]
PMC10454535
RES and its derivatives PIN and PIC demonstrated overall dose- and time-dependent effects in reducing RPMI 8226 viability (Figure 1a–c).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "RES", "and", "its", "derivatives", "PIN", "and", "PIC", "demonstrated", "overall", "dose-", "and", "time-dependent", "effects", "in", "reducing", "RPMI", "8226", "viability", "(", "Figure", "1a", "–", "c", ")", "." ] } ]
PMC9429973
The engrafting clones could be traced back to a small subclone in the original patient samples.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "engrafting", "clones", "could", "be", "traced", "back", "to", "a", "small", "subclone", "in", "the", "original", "patient", "samples", "." ] } ]
PMC11755519
The three major upstream signaling cascades of the EMT process were then analyzed, including β-catenin/TCF4, Notch/HES1, and transforming growth factor β (TGF-β)/SMAD signaling.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "three", "major", "upstream", "signaling", "cascades", "of", "the", "EMT", "process", "were", "then", "analyzed", ",", "including", "β-catenin/TCF4", ",", "Notch/HES1", ",", "and", "transforming", "growth", "factor", "β", "(TGF-β)/SMAD", "signaling", "." ] } ]
PMC10440586
YTZ, YCL, SW, JSW, and LMS contributed to data interpretation and revised the manuscript.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "YTZ", ",", "YCL", ",", "SW", ",", "JSW", ",", "and", "LMS", "contributed", "to", "data", "interpretation", "and", "revised", "the", "manuscript", "." ] } ]
PMC11046454
As assayed with flow cytometry, the FITC fluorescence profile of CEM cells was gradually shifted by increasing the concentration of FITC-DNA-DBCO (Figures 1E and S7A), matching well with the gradually enhanced fluorescence on the cell surface (Figure S7B), indicating the successful construction of cancer cells containing artificial antigen of different surface densities (Figure S8).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "assayed", "with", "flow", "cytometry", ",", "the", "FITC", "fluorescence", "profile", "of", "CEM", "cells", "was", "gradually", "shifted", "by", "increasing", "the", "concentration", "of", "FITC-DNA-DBCO", "(", "Figures", "1E", "and", "S7A", ")", ",", "matching", "well", "with", "the", "gradually", "enhanced", "fluorescence", "on", "the", "cell", "surface", "(", "Figure", "S7B", ")", ",", "indicating", "the", "successful", "construction", "of", "cancer", "cells", "containing", "artificial", "antigen", "of", "different", "surface", "densities", "(", "Figure", "S8", ")", "." ] } ]
PMC7887261
During discovery, we identified 25 rare deleterious variants associated with LC susceptibility, including 13 reported in ClinVar.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "During", "discovery", ",", "we", "identified", "25", "rare", "deleterious", "variants", "associated", "with", "LC", "susceptibility", ",", "including", "13", "reported", "in", "ClinVar", "." ] } ]
PMC11365427
Next, Gene Set Enrichment Analysis (GSEA) of all detected genes was performed by GSEA software (version 3.0), which analyzed the differences in biological functions between two groups based on gene sets.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Next", ",", "Gene", "Set", "Enrichment", "Analysis", "(", "GSEA", ")", "of", "all", "detected", "genes", "was", "performed", "by", "GSEA", "software", "(", "version", "3.0", ")", ",", "which", "analyzed", "the", "differences", "in", "biological", "functions", "between", "two", "groups", "based", "on", "gene", "sets", "." ] } ]
PMC11468365
Also, a regularization method is applied to the weights and outputs of layers to reduce overfitting between training and testing scores.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Also", ",", "a", "regularization", "method", "is", "applied", "to", "the", "weights", "and", "outputs", "of", "layers", "to", "reduce", "overfitting", "between", "training", "and", "testing", "scores", "." ] } ]
PMC3122064
Furthermore, Nutlin-3 treatment led to a more pronounced nuclear localisation of p53 in all wild-type p53-expressing TC cells (Supplementary Figure 2b).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "Nutlin-3", "treatment", "led", "to", "a", "more", "pronounced", "nuclear", "localisation", "of", "p53", "in", "all", "wild-type", "p53-expressing", "TC", "cells", "(", "Supplementary", "Figure", "2b", ")", "." ] } ]
PMC11743975
Blue: opto-MitoA group.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Blue", ":", "opto-MitoA", "group", "." ] } ]
PMC11532793
edgeR further assumes that the true expression level of transcript t varies between biological replicates with squared coefficient of variation equal to ψt.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "edgeR", "further", "assumes", "that", "the", "true", "expression", "level", "of", "transcript", "t", "varies", "between", "biological", "replicates", "with", "squared", "coefficient", "of", "variation", "equal", "to", "ψt", "." ] } ]
PMC11612315
ANOVA analysis of variance, CAP capsaicin, DRG dorsal root ganglia, GLP-1 glucagon-like peptide-1, S.E.M. standard error of the mean, TRPV1 transient receptor potential vanilloid 1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ANOVA", "analysis", "of", "variance", ",", "CAP", "capsaicin", ",", "DRG", "dorsal", "root", "ganglia", ",", "GLP-1", "glucagon-like", "peptide-1", ",", "S.E.M.", "standard", "error", "of", "the", "mean", ",", "TRPV1", "transient", "receptor", "potential", "vanilloid", "1", "." ] } ]
PMC11488203
The intensities were quantified using image J densitometry analysis by comparison of the controls (= 1) to their corresponding taxol treatment (A). (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "intensities", "were", "quantified", "using", "image", "J", "densitometry", "analysis", "by", "comparison", "of", "the", "controls", "(=", "1", ")", "to", "their", "corresponding", "taxol", "treatment", "(", "A", ")", ".", "(" ] } ]
PMC9429973
The impact of SARS-CoV-2 infection on CML pts in treatment-free remission (TFR) has not been studied so far.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "impact", "of", "SARS-CoV-2", "infection", "on", "CML", "pts", "in", "treatment-free", "remission", "(", "TFR", ")", "has", "not", "been", "studied", "so", "far", "." ] } ]
PMC9918897
Liquids were fully consumed in all groups every day.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Liquids", "were", "fully", "consumed", "in", "all", "groups", "every", "day", "." ] } ]
PMC5963610
A representative dot plot from one mice/group is shown in Supplementary Figure 2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "representative", "dot", "plot", "from", "one", "mice/group", "is", "shown", "in", "Supplementary", "Figure", "2", "." ] } ]
PMC11194678
Statistics data in this figure are presented as the mean ± SD; *P < 0.05 using one-way ANOVA with Tukey’s multiple comparison test. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Statistics", "data", "in", "this", "figure", "are", "presented", "as", "the", "mean", "±", "SD", ";", "*", "P", "<", "0.05", "using", "one-way", "ANOVA", "with", "Tukey", "’s", "multiple", "comparison", "test", ".", "(" ] } ]
PMC9429973
Emerging evidence suggests an association between chronic hemolytic anemia in SCD and both short-term and long-term adverse outcomes, including EOD.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Emerging", "evidence", "suggests", "an", "association", "between", "chronic", "hemolytic", "anemia", "in", "SCD", "and", "both", "short-term", "and", "long-term", "adverse", "outcomes", ",", "including", "EOD", "." ] } ]
PMC11738017
Indeed, analysis of the CoMMpass data set demonstrated that SV in TNFRSF17 and POU2AF1 increased the transcript expression of the respective genes (Figure 1G-H), and a positive correlation was noted between the POU2AF1 and TNFRSF17 transcript levels (Figure 1I).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Indeed", ",", "analysis", "of", "the", "CoMMpass", "data", "set", "demonstrated", "that", "SV", "in", "TNFRSF17", "and", "POU2AF1", "increased", "the", "transcript", "expression", "of", "the", "respective", "genes", "(", "Figure", "1G-H", ")", ",", "and", "a", "positive", "correlation", "was", "noted", "between", "the", "POU2AF1", "and", "TNFRSF17", "transcript", "levels", "(", "Figure", "1I", ")", "." ] } ]
PMC11627133
To create the bifunctional aptamer AP3‐RhoBAST, we tested three different scaffolds for linking AP3 and RhoBAST: i) The F30‐scaffold (F30), characterized by a stable three‐way junction, supporting stable and independent folding of both connected aptamers; ii) insertion of the protein‐binding aptamer into RhoBAST's tetraloop (Loop), known to be exchangeable without compromising the binding affinity or specificity to SpyRho; iii) a flexible, single‐stranded 10‐nucleotide linker (Linker) between the aptamers (Figure S1A–C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "create", "the", "bifunctional", "aptamer", "AP3‐RhoBAST", ",", "we", "tested", "three", "different", "scaffolds", "for", "linking", "AP3", "and", "RhoBAST", ":", "i", ")", "The", "F30‐scaffold", "(", "F30", ")", ",", "characterized", "by", "a", "stable", "three‐way", "junction", ",", "supporting", "stable", "and", "independent", "folding", "of", "both", "connected", "aptamers", ";", "ii", ")", "insertion", "of", "the", "protein‐binding", "aptamer", "into", "RhoBAST", "'s", "tetraloop", "(", "Loop", ")", ",", "known", "to", "be", "exchangeable", "without", "compromising", "the", "binding", "affinity", "or", "specificity", "to", "SpyRho", ";", "iii", ")", "a", "flexible", ",", "single‐stranded", "10‐nucleotide", "linker", "(", "Linker", ")", "between", "the", "aptamers", "(", "Figure", "S1A", "–", "C", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Acute promyelocytic leukemia (APL) is a unique subtype of AML, with PML-RARA fusion caused by t(15;17)(q22;q12) translocation, and is now considered a highly curable disease.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Acute", "promyelocytic", "leukemia", "(", "APL", ")", "is", "a", "unique", "subtype", "of", "AML", ",", "with", "PML-RARA", "fusion", "caused", "by", "t(15;17)(q22;q12", ")", "translocation", ",", "and", "is", "now", "considered", "a", "highly", "curable", "disease", "." ] } ]
PMC9429973
Severe neutropenia (absolute neutrophil count <500/µL), thrombocytopenia (platelets <50K/µL) and anemia (hemoglobin <10g/dl) occurred in 15 (79%), 5 (26%), and 7 (37%) patients, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Severe", "neutropenia", "(", "absolute", "neutrophil", "count", "<", "500/µL", ")", ",", "thrombocytopenia", "(", "platelets", "<", "50K/µL", ")", "and", "anemia", "(", "hemoglobin", "<", "10g/dl", ")", "occurred", "in", "15", "(", "79", "%", ")", ",", "5", "(", "26", "%", ")", ",", "and", "7", "(", "37", "%", ")", "patients", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11322866
In the present study, we found that EZH2 inhibition activated p21, decreased p-RB, promoted the accumulation of Lamin B1, and promoted SAHF formation in MM cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "present", "study", ",", "we", "found", "that", "EZH2", "inhibition", "activated", "p21", ",", "decreased", "p-RB", ",", "promoted", "the", "accumulation", "of", "Lamin", "B1", ",", "and", "promoted", "SAHF", "formation", "in", "MM", "cells", "." ] } ]
PMC11350568
In the replacement experiments, it was found that AptG-1 could replace the Cy5-labeled Sgc8c aptamer that binds to CCRF-CEM cells to form a TMPDS as indicated by the significantly lowered fluorescence intensity (Figure 3d).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "replacement", "experiments", ",", "it", "was", "found", "that", "AptG-1", "could", "replace", "the", "Cy5-labeled", "Sgc8c", "aptamer", "that", "binds", "to", "CCRF-CEM", "cells", "to", "form", "a", "TMPDS", "as", "indicated", "by", "the", "significantly", "lowered", "fluorescence", "intensity", "(", "Figure", "3d", ")", "." ] } ]
PMC11525028
The membranes were further UV cross-linked twice with 2000 mJ for 25-50s.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "membranes", "were", "further", "UV", "cross-linked", "twice", "with", "2000", "mJ", "for", "25", "-", "50s", "." ] } ]
PMC11782780
The impact of EBF3 on cancer progression has gradually been reported.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "impact", "of", "EBF3", "on", "cancer", "progression", "has", "gradually", "been", "reported", "." ] } ]
PMC11462673
D CRISPR screen data indicated the dependence of T-ALL cell line Jurkat on LDB1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D", "CRISPR", "screen", "data", "indicated", "the", "dependence", "of", "T-ALL", "cell", "line", "Jurkat", "on", "LDB1", "." ] } ]