Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC10808409
Figure 4c shows the release profile of the optimized mixed micelles (O1), the TPGS mixed micelles (O2), and the standard FA, all containing the same drug amount.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Figure", "4c", "shows", "the", "release", "profile", "of", "the", "optimized", "mixed", "micelles", "(", "O1", ")", ",", "the", "TPGS", "mixed", "micelles", "(", "O2", ")", ",", "and", "the", "standard", "FA", ",", "all", "containing", "the", "same", "drug", "amount", "." ] } ]
PMC9429973
S. P. Douglas, I. Kaaja, T. H. Räisänen, E. Pitkänen, O. Kilpivaara, U. Wartiovaara-Kautto Applied Tumor Genomics Research Program, Faculty of Medicine; Department of Clinical and Medical Genetics, Medicum; Institute for Molecular Medicine Finland (FIMM), University of Helsinki; HUSLAB Laboratory of Genetics, HUS Diagnostic Center, Helsinki University Hospital; Department of Hematology, Helsinki University Hospital Comprehensive Cancer Center, University of Helsinki, Helsinki, Finland Background: Biallelic germline mutations in ERCC6L2 cause a bone marrow failure syndrome with a tendency for acquiring somatic TP53 mutations and possible progression to acute myeloid leukemia with erythroid characteristics.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "S.", "P.", "Douglas", ",", "I.", "Kaaja", ",", "T.", "H.", "Räisänen", ",", "E.", "Pitkänen", ",", "O.", "Kilpivaara", ",", "U.", "Wartiovaara-Kautto", "Applied", "Tumor", "Genomics", "Research", "Program", ",", "Faculty", "of", "Medicine", ";", "Department", "of", "Clinical", "and", "Medical", "Genetics", ",", "Medicum", ";", "Institute", "for", "Molecular", "Medicine", "Finland", "(", "FIMM", ")", ",", "University", "of", "Helsinki", ";", "HUSLAB", "Laboratory", "of", "Genetics", ",", "HUS", "Diagnostic", "Center", ",", "Helsinki", "University", "Hospital", ";", "Department", "of", "Hematology", ",", "Helsinki", "University", "Hospital", "Comprehensive", "Cancer", "Center", ",", "University", "of", "Helsinki", ",", "Helsinki", ",", "Finland", "Background", ":", "Biallelic", "germline", "mutations", "in", "ERCC6L2", "cause", "a", "bone", "marrow", "failure", "syndrome", "with", "a", "tendency", "for", "acquiring", "somatic", "TP53", "mutations", "and", "possible", "progression", "to", "acute", "myeloid", "leukemia", "with", "erythroid", "characteristics", "." ] } ]
PMC10898159
Besides, the Hh pathway has crosstalk with PI3K/AKT/mTOR and RAF/MAPK/ERK signal cascades involved in the KIT regulation .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Besides", ",", "the", "Hh", "pathway", "has", "crosstalk", "with", "PI3K/AKT/mTOR", "and", "RAF/MAPK/ERK", "signal", "cascades", "involved", "in", "the", "KIT", "regulation", "." ] } ]
PMC10174970
We found that the gene expression profiles of PAAD cell lines correlate weakly with those of primary pancreatic tumors.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "found", "that", "the", "gene", "expression", "profiles", "of", "PAAD", "cell", "lines", "correlate", "weakly", "with", "those", "of", "primary", "pancreatic", "tumors", "." ] } ]
PMC11413393
Source data are provided as a Source Data file.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Source", "data", "are", "provided", "as", "a", "Source", "Data", "file", "." ] } ]
PMC8336407
unit of measurement = µM)t: tert-Butyl hydroperoxide (t-BHP) E: Pyrus biossieriana Buhse leaves extractt 100 (t-BHP, concentration: 100 µM), t 150 (t-BHP, concentration: 150 µM), t 200 (t-BHP, concentration: 200 µM)Table 3The effect of pyrus biossieriana buhse leaf extract and t-BHP treatment on antioxidant capacity in HepG2 cell lineControl180.10 ± 14.87p valuet100140 ± 12.69p valuet15096 ± 9.76p valueE1.51814 ± 64.85< 0.001t15096 ± 9.760.351t20080 ± 8.800.486E2.02498 ± 37.83< 0.001E1.51814 ± 64.85< 0.001E1.51814 ± 64.85< 0.001E2.53952 ± 37.83< 0.001E2.02498 ± 37.83< 0.001E2.02498 ± 37.83< 0.001t100140 ± 12.690.078E2.53952 ± 37.83< 0.001E2.53952 ± 37.83< 0.001t15096 ± 9.760.008t100 + E1.51381 ± 57.96< 0.001t150 + E1.51081 ± 87.36< 0.001t20080 ± 8.800.001t100 + E2.02438 ± 32.23< 0.001t150 + E2.02294 ± 30.81< 0.001t100 + E1.51381 ± 57.96< 0.001t100 + E2.53832 ± 34.490.002t150 + E2.53508 ± 23.930.096E1.51814 ± 64.85p valueE2.02498 ± 37.83p valueE2.53952 ± 37.83p valueE2.02498 ± 37.83< 0.001E2.53952 ± 37.83< 0.001t100140 ± 12.69< 0.001E2.53952 ± 37.83< 0.001t100 + E2.02438 ± 32.230.03t100 + E2.53832 ± 34.49< 0.001t100 + E1.51381 ± 57.96< 0.001t150 + E2.02294 ± 30.81< 0.001t150 + E2.53508 ± 23.93< 0.001t150 + E1.51081 ± 87.36< 0.001t200 + E2.02234 ± 12.14< 0.001t200 + E2.53075 ± 97.91< 0.001t200 + E1.5924.9 ± 33.78< 0.001E1.51814 ± 64.85< 0.001t200 + E2.02234 ± 12.14< 0.001The experiment was repeated five times and the average is reported with standard error for each group.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "unit", "of", "measurement", "=", "µM)t", ":", "tert-Butyl", "hydroperoxide", "(", "t-BHP", ")", "E", ":", "Pyrus", "biossieriana", "Buhse", "leaves", "extractt", "100", "(", "t-BHP", ",", "concentration", ":", "100", "µM", ")", ",", "t", "150", "(", "t-BHP", ",", "concentration", ":", "150", "µM", ")", ",", "t", "200", "(", "t-BHP", ",", "concentration", ":", "200", "µM)Table", "3The", "effect", "of", "pyrus", "biossieriana", "buhse", "leaf", "extract", "and", "t-BHP", "treatment", "on", "antioxidant", "capacity", "in", "HepG2", "cell", "lineControl180.10", "±", "14.87p", "valuet100140", "±", "12.69p", "valuet15096", "±", "9.76p", "valueE1.51814", "±", "64.85", "<", "0.001t15096", "±", "9.760.351t20080", "±", "8.800.486E2.02498", "±", "37.83", "<", "0.001E1.51814", "±", "64.85", "<", "0.001E1.51814", "±", "64.85", "<", "0.001E2.53952", "±", "37.83", "<", "0.001E2.02498", "±", "37.83", "<", "0.001E2.02498", "±", "37.83", "<", "0.001t100140", "±", "12.690.078E2.53952", "±", "37.83", "<", "0.001E2.53952", "±", "37.83", "<", "0.001t15096", "±", "9.760.008t100", "+", "E1.51381", "±", "57.96", "<", "0.001t150", "+", "E1.51081", "±", "87.36", "<", "0.001t20080", "±", "8.800.001t100", "+", "E2.02438", "±", "32.23", "<", "0.001t150", "+", "E2.02294", "±", "30.81", "<", "0.001t100", "+", "E1.51381", "±", "57.96", "<", "0.001t100", "+", "E2.53832", "±", "34.490.002t150", "+", "E2.53508", "±", "23.930.096E1.51814", "±", "64.85p", "valueE2.02498", "±", "37.83p", "valueE2.53952", "±", "37.83p", "valueE2.02498", "±", "37.83", "<", "0.001E2.53952", "±", "37.83", "<", "0.001t100140", "±", "12.69", "<", "0.001E2.53952", "±", "37.83", "<", "0.001t100", "+", "E2.02438", "±", "32.230.03t100", "+", "E2.53832", "±", "34.49", "<", "0.001t100", "+", "E1.51381", "±", "57.96", "<", "0.001t150", "+", "E2.02294", "±", "30.81", "<", "0.001t150", "+", "E2.53508", "±", "23.93", "<", "0.001t150", "+", "E1.51081", "±", "87.36", "<", "0.001t200", "+", "E2.02234", "±", "12.14", "<", "0.001t200", "+", "E2.53075", "±", "97.91", "<", "0.001t200", "+", "E1.5924.9", "±", "33.78", "<", "0.001E1.51814", "±", "64.85", "<", "0.001t200", "+", "E2.02234", "±", "12.14", "<", "0.001The", "experiment", "was", "repeated", "five", "times", "and", "the", "average", "is", "reported", "with", "standard", "error", "for", "each", "group", "." ] } ]
PMC9105697
A total of 10 ng of cfDNA from a healthy donor was spiked with decreasing amounts of FUJI cell line DNA, resulting in a variant allele frequency (VAF) of 2.5%, 0.25%, 0.05% and 0%.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "total", "of", "10", "ng", "of", "cfDNA", "from", "a", "healthy", "donor", "was", "spiked", "with", "decreasing", "amounts", "of", "FUJI", "cell", "line", "DNA", ",", "resulting", "in", "a", "variant", "allele", "frequency", "(", "VAF", ")", "of", "2.5", "%", ",", "0.25", "%", ",", "0.05", "%", "and", "0", "%", "." ] } ]
PMC11604830
The SNR was used to describe the performance of the method and calculated as SNR=Sns−SagarSDnoise.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "SNR", "was", "used", "to", "describe", "the", "performance", "of", "the", "method", "and", "calculated", "as", "SNR", "=", "Sns−SagarSDnoise", "." ] } ]
PMC2614415
SAM analysis did not reveal Aurora-B or C to be significantly over or underexpressed in this dataset.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "SAM", "analysis", "did", "not", "reveal", "Aurora-B", "or", "C", "to", "be", "significantly", "over", "or", "underexpressed", "in", "this", "dataset", "." ] } ]
PMC9429973
During the first 28-day cycle, patients randomized to magrolimab+AZA will receive magrolimab intravenously (IV) at a priming dose of 1 mg/kg on days 1 and 4, 15 mg/kg on day 8, and 30 mg/kg on days 11, 15, and then weekly for 5 doses, followed by every other week beginning 1 week after the fifth weekly 30 mg/kg dose.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "During", "the", "first", "28-day", "cycle", ",", "patients", "randomized", "to", "magrolimab+AZA", "will", "receive", "magrolimab", "intravenously", "(", "IV", ")", "at", "a", "priming", "dose", "of", "1", "mg/kg", "on", "days", "1", "and", "4", ",", "15", "mg/kg", "on", "day", "8", ",", "and", "30", "mg/kg", "on", "days", "11", ",", "15", ",", "and", "then", "weekly", "for", "5", "doses", ",", "followed", "by", "every", "other", "week", "beginning", "1", "week", "after", "the", "fifth", "weekly", "30", "mg/kg", "dose", "." ] } ]
PMC9684669
One-way analysis of variance (ANOVA) with Bonferroni test was used for multiple comparisons.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "One-way", "analysis", "of", "variance", "(", "ANOVA", ")", "with", "Bonferroni", "test", "was", "used", "for", "multiple", "comparisons", "." ] } ]
PMC11591038
Coffee was found to induce VEGF expression in human neuroblastoma SH-SY5Y cells through the activation of HIF-1α, which was related to the inhibition of prolyl hydroxylation independent of caffeine or caffeic acid .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Coffee", "was", "found", "to", "induce", "VEGF", "expression", "in", "human", "neuroblastoma", "SH-SY5Y", "cells", "through", "the", "activation", "of", "HIF-1α", ",", "which", "was", "related", "to", "the", "inhibition", "of", "prolyl", "hydroxylation", "independent", "of", "caffeine", "or", "caffeic", "acid", "." ] } ]
PMC11224020
Cells were stained in 2 mM EDTA and 5% FBS in PBS following the same protocol as described earlier.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "stained", "in", "2", "mM", "EDTA", "and", "5", "%", "FBS", "in", "PBS", "following", "the", "same", "protocol", "as", "described", "earlier", "." ] } ]
PMC10812665
Col had the opposite effect, reducing the amount of modified tubulin to <20%.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Col", "had", "the", "opposite", "effect", ",", "reducing", "the", "amount", "of", "modified", "tubulin", "to", "<", "20", "%", "." ] } ]
PMC11453018
Conversely, in the subset of cell lines harboring P53 mutation, it inhibits P15 independently of P300 through sites containing a single GGAA motif.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Conversely", ",", "in", "the", "subset", "of", "cell", "lines", "harboring", "P53", "mutation", ",", "it", "inhibits", "P15", "independently", "of", "P300", "through", "sites", "containing", "a", "single", "GGAA", "motif", "." ] } ]
PMC11106977
Here, we focus on the effects of O-GlcNAcylation changes on bone physiology and pathophysiology and discuss its potential value as a target in clinical treatment.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Here", ",", "we", "focus", "on", "the", "effects", "of", "O-GlcNAcylation", "changes", "on", "bone", "physiology", "and", "pathophysiology", "and", "discuss", "its", "potential", "value", "as", "a", "target", "in", "clinical", "treatment", "." ] } ]
PMC11640476
For both layers, the final concentrations of fibrinogen, thrombin, and CaCl2 were 2.25 mg/mL, 1.25 U/mL, and 2.5 mM, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "both", "layers", ",", "the", "final", "concentrations", "of", "fibrinogen", ",", "thrombin", ",", "and", "CaCl2", "were", "2.25", "mg/mL", ",", "1.25", "U/mL", ",", "and", "2.5", "mM", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC9429973
There are non-severe (NAA), severe (SAA) and very severe (VSAA) forms of AA.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "are", "non-severe", "(", "NAA", ")", ",", "severe", "(", "SAA", ")", "and", "very", "severe", "(", "VSAA", ")", "forms", "of", "AA", "." ] } ]
PMC9318744
To establish a robust and stable human lung alveolar cell line for SARS-CoV-2 studies, we transduced A549 cells with human ACE2-expressing lentivirus at a low MOI and selected them with puromycin (1 μg/mL).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "establish", "a", "robust", "and", "stable", "human", "lung", "alveolar", "cell", "line", "for", "SARS-CoV-2", "studies", ",", "we", "transduced", "A549", "cells", "with", "human", "ACE2-expressing", "lentivirus", "at", "a", "low", "MOI", "and", "selected", "them", "with", "puromycin", "(", "1", "μg/mL", ")", "." ] } ]
PMC10969097
Furthermore, research on cancer cells, like lung carcinoma, breast cancer, colon cancer and adenocarcinoma, has indicated that mushroom extracts can have an impact by slowing down their growth .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "research", "on", "cancer", "cells", ",", "like", "lung", "carcinoma", ",", "breast", "cancer", ",", "colon", "cancer", "and", "adenocarcinoma", ",", "has", "indicated", "that", "mushroom", "extracts", "can", "have", "an", "impact", "by", "slowing", "down", "their", "growth", "." ] } ]
PMC9119314
The roots of the West African climbing shrub Cryptolepis sanguinolenta (Lindl.)
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "roots", "of", "the", "West", "African", "climbing", "shrub", "Cryptolepis", "sanguinolenta", "(", "Lindl", ".", ")" ] } ]
PMC11593713
Numerous disorders, including cancer, degenerative diseases, metabolic diseases, and aging, are related to oxidative stress .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Numerous", "disorders", ",", "including", "cancer", ",", "degenerative", "diseases", ",", "metabolic", "diseases", ",", "and", "aging", ",", "are", "related", "to", "oxidative", "stress", "." ] } ]
PMC10698968
On day 15 post-fertilization, the chick embryos were euthanized, and the tumour masses were removed for further processing.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "day", "15", "post-fertilization", ",", "the", "chick", "embryos", "were", "euthanized", ",", "and", "the", "tumour", "masses", "were", "removed", "for", "further", "processing", "." ] } ]
PMC11604830
Of course, due to the vicinity of the water peak (4.7 ppm), a good shim and an effective water suppression protocol are required (see Data S1), as normally demanded by most MR spectroscopic protocols.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Of", "course", ",", "due", "to", "the", "vicinity", "of", "the", "water", "peak", "(", "4.7", "ppm", ")", ",", "a", "good", "shim", "and", "an", "effective", "water", "suppression", "protocol", "are", "required", "(", "see", "Data", "S1", ")", ",", "as", "normally", "demanded", "by", "most", "MR", "spectroscopic", "protocols", "." ] } ]
PMC9429973
The molecular mechanisms sustaining the cytotoxic activity were evaluated by performing metabolic tracing, rescue experiments and CRISPR/Cas9 KO.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "molecular", "mechanisms", "sustaining", "the", "cytotoxic", "activity", "were", "evaluated", "by", "performing", "metabolic", "tracing", ",", "rescue", "experiments", "and", "CRISPR/Cas9", "KO", "." ] } ]
PMC9985266
Epithelial mesenchymal transition (EMT) is a key step in fibrosis .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Epithelial", "mesenchymal", "transition", "(", "EMT", ")", "is", "a", "key", "step", "in", "fibrosis", "." ] } ]
PMC11532793
The degrees of freedom available for estimating the RTA-dispersions is N(B − 1) where N is the total number of RNA samples and B is the number of technical samples per RNA sample.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "degrees", "of", "freedom", "available", "for", "estimating", "the", "RTA-dispersions", "is", "N(B", "−", "1", ")", "where", "N", "is", "the", "total", "number", "of", "RNA", "samples", "and", "B", "is", "the", "number", "of", "technical", "samples", "per", "RNA", "sample", "." ] } ]
PMC9784246
On the other hand, procyanidins are among the highest-scoring compounds as inhibitors for PDK3 in which the phenolic hydroxyl groups and aromatic rings impart in the interaction with the active site residues.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "the", "other", "hand", ",", "procyanidins", "are", "among", "the", "highest-scoring", "compounds", "as", "inhibitors", "for", "PDK3", "in", "which", "the", "phenolic", "hydroxyl", "groups", "and", "aromatic", "rings", "impart", "in", "the", "interaction", "with", "the", "active", "site", "residues", "." ] } ]
PMC9429973
Peripheral neuropathy (PN) occurred in 5 (4%) of MMB (all Gr ≤2) and 1 (2%) of DAN (Gr ≤2) pts in the RT phase, and none discontinued study drug due to PN.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Peripheral", "neuropathy", "(", "PN", ")", "occurred", "in", "5", "(", "4", "%", ")", "of", "MMB", "(", "all", "Gr", "≤2", ")", "and", "1", "(", "2", "%", ")", "of", "DAN", "(", "Gr", "≤2", ")", "pts", "in", "the", "RT", "phase", ",", "and", "none", "discontinued", "study", "drug", "due", "to", "PN", "." ] } ]
PMC10094992
Cells grown to 80% confluence in tissue culture dishes were transiently transfected with non-specific (NS) or specific CDKN2A siRNAs using Lipofectamine reagent.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "grown", "to", "80", "%", "confluence", "in", "tissue", "culture", "dishes", "were", "transiently", "transfected", "with", "non-specific", "(", "NS", ")", "or", "specific", "CDKN2A", "siRNAs", "using", "Lipofectamine", "reagent", "." ] } ]
PMC11543935
The AlamarBlue assay used in this study is based on the reduction of resazurin to highly fluorescent resorufin by metabolic active cells and is published to be non-cytotoxic at the working concentration of 10 %.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "AlamarBlue", "assay", "used", "in", "this", "study", "is", "based", "on", "the", "reduction", "of", "resazurin", "to", "highly", "fluorescent", "resorufin", "by", "metabolic", "active", "cells", "and", "is", "published", "to", "be", "non-cytotoxic", "at", "the", "working", "concentration", "of", "10", "%", "." ] } ]
PMC11107915
These cases were given as inputs into ChatGPT, and the responses generated by the model were then cross-checked against the correct diagnoses provided in the FMGE online resource.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "cases", "were", "given", "as", "inputs", "into", "ChatGPT", ",", "and", "the", "responses", "generated", "by", "the", "model", "were", "then", "cross-checked", "against", "the", "correct", "diagnoses", "provided", "in", "the", "FMGE", "online", "resource", "." ] } ]
PMC11106977
Similarly, Goldberg et al. .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Similarly", ",", "Goldberg", "et", "al.", "." ] } ]
PMC11574271
To further investigate the specific mechanism of RON regulation of MMP12, we explored the potential direct interaction between RON and MMP12 in regulating its expression, however, our co-immunoprecipitation experiment yielded a negative result (Fig. 4A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "further", "investigate", "the", "specific", "mechanism", "of", "RON", "regulation", "of", "MMP12", ",", "we", "explored", "the", "potential", "direct", "interaction", "between", "RON", "and", "MMP12", "in", "regulating", "its", "expression", ",", "however", ",", "our", "co-immunoprecipitation", "experiment", "yielded", "a", "negative", "result", "(", "Fig.", "4A", ")", "." ] } ]
PMC11317131
These optimized conditions resulted in insertion rates as high as 80% of target sites (Figure 6A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "optimized", "conditions", "resulted", "in", "insertion", "rates", "as", "high", "as", "80", "%", "of", "target", "sites", "(", "Figure", "6A", ")", "." ] } ]
PMC11599565
Concurrently, transcription factors associated with stemness and EMT like Slug, SOX2, Klf-4, Notch1 and Nanog were clearly upregulated, as was Vimentin.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Concurrently", ",", "transcription", "factors", "associated", "with", "stemness", "and", "EMT", "like", "Slug", ",", "SOX2", ",", "Klf-4", ",", "Notch1", "and", "Nanog", "were", "clearly", "upregulated", ",", "as", "was", "Vimentin", "." ] } ]
PMC9429973
Results: In total 7,128 studies were identified, whereof 1,475 duplicates were removed in Covidence.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "In", "total", "7,128", "studies", "were", "identified", ",", "whereof", "1,475", "duplicates", "were", "removed", "in", "Covidence", "." ] } ]
PMC2118063
Relative gene expression of tonsillar B cell subsets was determined by comparison with levels in IgD PBBs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Relative", "gene", "expression", "of", "tonsillar", "B", "cell", "subsets", "was", "determined", "by", "comparison", "with", "levels", "in", "IgD", "PBBs", "." ] } ]
PMC11033180
B and C) Sema5A-Fc exposure reduces the number of spontaneously active neurons (B) and the firing frequency of active neurons (C). (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B", "and", "C", ")", "Sema5A-Fc", "exposure", "reduces", "the", "number", "of", "spontaneously", "active", "neurons", "(", "B", ")", "and", "the", "firing", "frequency", "of", "active", "neurons", "(", "C", ")", ".", "(" ] } ]
PMC10938336
Nodes in this integrated network represent disease-related pathways, compounds, and proteins, while solid lines represent interactions between these nodes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nodes", "in", "this", "integrated", "network", "represent", "disease-related", "pathways", ",", "compounds", ",", "and", "proteins", ",", "while", "solid", "lines", "represent", "interactions", "between", "these", "nodes", "." ] } ]
PMC11126803
B, the qRT-PCR results show that LncRNA-SERB was successfully overexpressed (oe) in A498 cells transduced by lentiviral LncRNA-SERB, and LncRNA-SERB was knocked down (sh) in 786-O cells transduced by lentiviral shRNA of LncRNA-SERB.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B", ",", "the", "qRT-PCR", "results", "show", "that", "LncRNA-SERB", "was", "successfully", "overexpressed", "(", "oe", ")", "in", "A498", "cells", "transduced", "by", "lentiviral", "LncRNA-SERB", ",", "and", "LncRNA-SERB", "was", "knocked", "down", "(", "sh", ")", "in", "786-O", "cells", "transduced", "by", "lentiviral", "shRNA", "of", "LncRNA-SERB", "." ] } ]
PMC9503685
Results were calculated as mean value ± standard deviation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", "were", "calculated", "as", "mean", "value", "±", "standard", "deviation", "." ] } ]
PMC11770199
Additionally, we observed pyroptosis vesicles adhering to the crumpled syncytia and detected cleaved GSDME protein.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "we", "observed", "pyroptosis", "vesicles", "adhering", "to", "the", "crumpled", "syncytia", "and", "detected", "cleaved", "GSDME", "protein", "." ] } ]
PMC2614415
Cells were washed 3 times with cold PBS and fixed in 4% paraformaldehyde for 15 minutes at room temperature, permeablized on ice for 2 minutes in 0.5% Tween-20/PBS and blocked in 5% nonfat dry milk (NFDM) for 30 minutes at room temperature.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "washed", "3", "times", "with", "cold", "PBS", "and", "fixed", "in", "4", "%", "paraformaldehyde", "for", "15", "minutes", "at", "room", "temperature", ",", "permeablized", "on", "ice", "for", "2", "minutes", "in", "0.5", "%", "Tween-20/PBS", "and", "blocked", "in", "5", "%", "nonfat", "dry", "milk", "(", "NFDM", ")", "for", "30", "minutes", "at", "room", "temperature", "." ] } ]
PMC3164356
Furthermore, such modifications can induce immune responses if they differ from native human glycans.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "such", "modifications", "can", "induce", "immune", "responses", "if", "they", "differ", "from", "native", "human", "glycans", "." ] } ]
PMC10994876
While various transgenes have been utilized to enhance these cell characteristics individually, our study proposes that the overexpression of YAP5SA can effectively address multiple bioprocess-related limitations simultaneously.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "While", "various", "transgenes", "have", "been", "utilized", "to", "enhance", "these", "cell", "characteristics", "individually", ",", "our", "study", "proposes", "that", "the", "overexpression", "of", "YAP5SA", "can", "effectively", "address", "multiple", "bioprocess-related", "limitations", "simultaneously", "." ] } ]
PMC8973085
IR (KBr, v, cm): 3235 (NH), 2215 (CN), 1736 (C=O), 1644 (C=O); H NMR (DMSO-d6): δ 2.32 (s, 3H, CH3), 2.36 (s, 3H, CH3), 2.54 (s, 3H, CH3), 4.28 (s, 2H, CH2), 7.13–7.41 (m, 8H, CH-Ar), 10.49 (bs, 1H, NH); C NMR (DMSO-d6): δ 21.31, 23.19, 29.76, 39.98, 104.04, 115.40, 115.87, 116.00, 121.87, 128.74, 129.33, 129.52, 131.52, 134.95, 139.89, 151.78, 158.30, 158.45, 161.39, 201.97; MS m/z (%): 433 [M] (30), 390 (25), 323 (100), 281 (83), 110 (44).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "IR", "(", "KBr", ",", "v", ",", "cm", "):", "3235", "(", "NH", ")", ",", "2215", "(", "CN", ")", ",", "1736", "(", "C", "=", "O", ")", ",", "1644", "(", "C", "=", "O", ")", ";", "H", "NMR", "(", "DMSO-d6", "):", "δ", "2.32", "(", "s", ",", "3H", ",", "CH3", ")", ",", "2.36", "(", "s", ",", "3H", ",", "CH3", ")", ",", "2.54", "(", "s", ",", "3H", ",", "CH3", ")", ",", "4.28", "(", "s", ",", "2H", ",", "CH2", ")", ",", "7.13–7.41", "(", "m", ",", "8H", ",", "CH-Ar", ")", ",", "10.49", "(", "bs", ",", "1H", ",", "NH", ")", ";", "C", "NMR", "(", "DMSO-d6", "):", "δ", "21.31", ",", "23.19", ",", "29.76", ",", "39.98", ",", "104.04", ",", "115.40", ",", "115.87", ",", "116.00", ",", "121.87", ",", "128.74", ",", "129.33", ",", "129.52", ",", "131.52", ",", "134.95", ",", "139.89", ",", "151.78", ",", "158.30", ",", "158.45", ",", "161.39", ",", "201.97", ";", "MS", "m/z", "(", "%", "):", "433", "[", "M", "]", "(", "30", ")", ",", "390", "(", "25", ")", ",", "323", "(", "100", ")", ",", "281", "(", "83", ")", ",", "110", "(", "44", ")", "." ] } ]
PMC11401350
In the case of AITL choosing the right receptor is not straight forward.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "case", "of", "AITL", "choosing", "the", "right", "receptor", "is", "not", "straight", "forward", "." ] } ]
PMC6114978
TAZ and YAP are transcriptional coactivators negatively regulated by the Hippo pathway that have emerged as key oncoproteins in several cancers including sarcomas.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "TAZ", "and", "YAP", "are", "transcriptional", "coactivators", "negatively", "regulated", "by", "the", "Hippo", "pathway", "that", "have", "emerged", "as", "key", "oncoproteins", "in", "several", "cancers", "including", "sarcomas", "." ] } ]
PMC9429973
Transcriptional analysis pointed to an altered and improved homing of Cdk6 LT-HSCs, which was confirmed in homing assays in vivo.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Transcriptional", "analysis", "pointed", "to", "an", "altered", "and", "improved", "homing", "of", "Cdk6", "LT-HSCs", ",", "which", "was", "confirmed", "in", "homing", "assays", "in", "vivo", "." ] } ]
PMC8998437
We used an early-passage Akuba cell line that was recovered from stock frozen in 1972.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "used", "an", "early-passage", "Akuba", "cell", "line", "that", "was", "recovered", "from", "stock", "frozen", "in", "1972", "." ] } ]
PMC11295144
α2β3γ2-GABAAR and NL2 co-expression is the most potent combination in inducing synaptic contacts.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "α2β3γ2-GABAAR", "and", "NL2", "co-expression", "is", "the", "most", "potent", "combination", "in", "inducing", "synaptic", "contacts", "." ] } ]
PMC11695623
In addition, this study may provide clues for the diagnosis of LUAD and the search for new therapeutic targets.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "addition", ",", "this", "study", "may", "provide", "clues", "for", "the", "diagnosis", "of", "LUAD", "and", "the", "search", "for", "new", "therapeutic", "targets", "." ] } ]
PMC11583010
Then, the Meso Scale Delivery read buffer was added to allow the emission of electrochemiluminescence by the bounded SULFO-Tag antibodies.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Then", ",", "the", "Meso", "Scale", "Delivery", "read", "buffer", "was", "added", "to", "allow", "the", "emission", "of", "electrochemiluminescence", "by", "the", "bounded", "SULFO-Tag", "antibodies", "." ] } ]
PMC11765988
In another study, DNA of Bb was identified using PCR in a minority of sarcoidosis patients, and a possible etiologic role was suggested for these cases .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "another", "study", ",", "DNA", "of", "Bb", "was", "identified", "using", "PCR", "in", "a", "minority", "of", "sarcoidosis", "patients", ",", "and", "a", "possible", "etiologic", "role", "was", "suggested", "for", "these", "cases", "." ] } ]
PMC10940855
Cells were stimulated in a volume of 200 μL at 37°C for 15 minutes using a concentration of 10 μg/mL of EPHB4-Fc and IgG1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "stimulated", "in", "a", "volume", "of", "200", "μL", "at", "37", "°", "C", "for", "15", "minutes", "using", "a", "concentration", "of", "10", "μg/mL", "of", "EPHB4-Fc", "and", "IgG1", "." ] } ]
PMC5941560
The Jurkat cell line was isolated in 1977 from the blood of a fourteen-year-old boy with Acute Lymphoblastic Leukemia .
[ { "tags": [ "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "Jurkat", "cell", "line", "was", "isolated", "in", "1977", "from", "the", "blood", "of", "a", "fourteen-year-old", "boy", "with", "Acute", "Lymphoblastic", "Leukemia", "." ] } ]
PMC9429973
Methods: Within a year we analyzed 122 lymph node biopsies of all 110 children referred to our new Dutch National Pediatric Cancer Center because of suspected malignant lymphoma, using a standardized workflow combining histology and immunohistochemistry, flow cytometry, and next-generation sequencing technologies.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "Within", "a", "year", "we", "analyzed", "122", "lymph", "node", "biopsies", "of", "all", "110", "children", "referred", "to", "our", "new", "Dutch", "National", "Pediatric", "Cancer", "Center", "because", "of", "suspected", "malignant", "lymphoma", ",", "using", "a", "standardized", "workflow", "combining", "histology", "and", "immunohistochemistry", ",", "flow", "cytometry", ",", "and", "next-generation", "sequencing", "technologies", "." ] } ]
PMC11188874
HAT activators did not increase proteasome activity, suggesting alternative mechanisms of action (Supplementary Fig. S14D).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HAT", "activators", "did", "not", "increase", "proteasome", "activity", ",", "suggesting", "alternative", "mechanisms", "of", "action", "(", "Supplementary", "Fig.", "S14D", ")", "." ] } ]
PMC6379402
For each of MCF7 breast cancer (a), PC-3 prostate cancer (b), A549 lung cancer (c), and HCT116 colon cancer (d) cell lines, cells were seeded in triplicates into 96-well plates and were transfected with indicated esiRNAs 24 h after seeding.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "each", "of", "MCF7", "breast", "cancer", "(", "a", ")", ",", "PC-3", "prostate", "cancer", "(", "b", ")", ",", "A549", "lung", "cancer", "(", "c", ")", ",", "and", "HCT116", "colon", "cancer", "(", "d", ")", "cell", "lines", ",", "cells", "were", "seeded", "in", "triplicates", "into", "96-well", "plates", "and", "were", "transfected", "with", "indicated", "esiRNAs", "24", "h", "after", "seeding", "." ] } ]
PMC10212663
RANKL overexpression shRNA was built and the modulative effect on RANKL mRNA expression was validated via qRT‐PCR (Figure 7(e)–(h) and Figure S4C,D).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "RANKL", "overexpression", "shRNA", "was", "built", "and", "the", "modulative", "effect", "on", "RANKL", "mRNA", "expression", "was", "validated", "via", "qRT‐PCR", "(", "Figure", "7(e)–(h", ")", "and", "Figure", "S4C", ",", "D", ")", "." ] } ]
PMC11190062
The following TLR agonists were used for stimulation of MM cells: TLR2/1, Pam3Cys (EMC Microcollections, Tübingen, Germany); TLR2/6, FSL-1 (EMC Microcollections); TLR3, Poly(I:C) HMW (Invivogen, San Diego, CA, USA); TLR4, Ultrapure LPS (E.coli 0111:B4, Invivogen); TLR5, Flagellin FLA-ST (Invivogen); TLR7 and TLR8, R-848 (Invivogen); and TLR9, CpG ODN 2006 (TIB Molbiol, Berlin, Germany).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "following", "TLR", "agonists", "were", "used", "for", "stimulation", "of", "MM", "cells", ":", "TLR2/1", ",", "Pam3Cys", "(", "EMC", "Microcollections", ",", "Tübingen", ",", "Germany", ")", ";", "TLR2/6", ",", "FSL-1", "(", "EMC", "Microcollections", ")", ";", "TLR3", ",", "Poly(I", ":", "C", ")", "HMW", "(", "Invivogen", ",", "San", "Diego", ",", "CA", ",", "USA", ")", ";", "TLR4", ",", "Ultrapure", "LPS", "(", "E.coli", "0111:B4", ",", "Invivogen", ")", ";", "TLR5", ",", "Flagellin", "FLA-ST", "(", "Invivogen", ")", ";", "TLR7", "and", "TLR8", ",", "R-848", "(", "Invivogen", ")", ";", "and", "TLR9", ",", "CpG", "ODN", "2006", "(", "TIB", "Molbiol", ",", "Berlin", ",", "Germany", ")", "." ] } ]
PMC11705547
CTLs recognize and rapidly eliminate tumor cells bearing specific antigens, while the memory cells provide long-term immunity .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "CTLs", "recognize", "and", "rapidly", "eliminate", "tumor", "cells", "bearing", "specific", "antigens", ",", "while", "the", "memory", "cells", "provide", "long-term", "immunity", "." ] } ]
PMC5811757
In this study, complete sensitivity to doxorubicin did not occur despite the dramatic reduction in expression of P-gp.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "study", ",", "complete", "sensitivity", "to", "doxorubicin", "did", "not", "occur", "despite", "the", "dramatic", "reduction", "in", "expression", "of", "P-gp", "." ] } ]
PMC11637820
Recent studies also indicate antibiotic resistance frequently occurs in natural environments, such as soil reservoirs and regions with increased population densities, while elevated temperatures hasten the acquisition, accumulation, and dissemination of antibiotic resistance and indirectly influence the bacterial diversity and virulence in DFU .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Recent", "studies", "also", "indicate", "antibiotic", "resistance", "frequently", "occurs", "in", "natural", "environments", ",", "such", "as", "soil", "reservoirs", "and", "regions", "with", "increased", "population", "densities", ",", "while", "elevated", "temperatures", "hasten", "the", "acquisition", ",", "accumulation", ",", "and", "dissemination", "of", "antibiotic", "resistance", "and", "indirectly", "influence", "the", "bacterial", "diversity", "and", "virulence", "in", "DFU", "." ] } ]
PMC10605143
Cells were harvested by trypsinization and suspended in a serum-free Hepes-buffered medium containing 0.1% BSA, seeded at the top of the chambers and placed in wells containing culture medium supplemented with 10% fetal bovine serum.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "harvested", "by", "trypsinization", "and", "suspended", "in", "a", "serum-free", "Hepes-buffered", "medium", "containing", "0.1", "%", "BSA", ",", "seeded", "at", "the", "top", "of", "the", "chambers", "and", "placed", "in", "wells", "containing", "culture", "medium", "supplemented", "with", "10", "%", "fetal", "bovine", "serum", "." ] } ]
PMC11389534
Lastly, the pancreas, especially pancreatic β cells, is well‐known for its endocrine function, which is necessary in controlling blood glucose levels.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Lastly", ",", "the", "pancreas", ",", "especially", "pancreatic", "β", "cells", ",", "is", "well‐known", "for", "its", "endocrine", "function", ",", "which", "is", "necessary", "in", "controlling", "blood", "glucose", "levels", "." ] } ]
PMC11367146
The teal blue rectangular nodes indicate the target genes, Purple oval nodes indicate components of VTE with a lower degree score and the pink oval nodes components with the target genes, the purple oval nodes indicate components of VTE with a lower degree score, and the pink oval nodes are components with a high degree score.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "teal", "blue", "rectangular", "nodes", "indicate", "the", "target", "genes", ",", "Purple", "oval", "nodes", "indicate", "components", "of", "VTE", "with", "a", "lower", "degree", "score", "and", "the", "pink", "oval", "nodes", "components", "with", "the", "target", "genes", ",", "the", "purple", "oval", "nodes", "indicate", "components", "of", "VTE", "with", "a", "lower", "degree", "score", ",", "and", "the", "pink", "oval", "nodes", "are", "components", "with", "a", "high", "degree", "score", "." ] } ]
PMC9429973
Aims: The aim of this project was to share real-world experience of asciminib use in the UK.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "The", "aim", "of", "this", "project", "was", "to", "share", "real-world", "experience", "of", "asciminib", "use", "in", "the", "UK", "." ] } ]
PMC11224020
Fig. 1CCR7 upregulation in immature DCs is shape sensitive.a, Left, migrating CD11c DCs in an ear explant.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fig.", "1CCR7", "upregulation", "in", "immature", "DCs", "is", "shape", "sensitive.a", ",", "Left", ",", "migrating", "CD11c", "DCs", "in", "an", "ear", "explant", "." ] } ]
PMC11637276
For p38 inhibitor experiments, cells were serum starved for 16 to 18 h. Cells were detached using TrypLE and neutralised with serum-free media, and 5 × 10 MDA-MB-231 cells per well were seeded into a CDM-coated 12-well plate.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "p38", "inhibitor", "experiments", ",", "cells", "were", "serum", "starved", "for", "16", "to", "18", "h.", "Cells", "were", "detached", "using", "TrypLE", "and", "neutralised", "with", "serum-free", "media", ",", "and", "5", "×", "10", "MDA-MB-231", "cells", "per", "well", "were", "seeded", "into", "a", "CDM-coated", "12-well", "plate", "." ] } ]
PMC11477621
Most of these compounds showed good selectivity towards the HDAC6 isomer.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Most", "of", "these", "compounds", "showed", "good", "selectivity", "towards", "the", "HDAC6", "isomer", "." ] } ]
PMC9429973
Linezolid (LZ) is the first-in-class oxazolidinone antimicrobial agent active against gram-positive bacteria, often administered during FN as treatment for hospital-acquired pneumonia, gram-positive bacteriemia and soft-skin tissue infection.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Linezolid", "(", "LZ", ")", "is", "the", "first-in-class", "oxazolidinone", "antimicrobial", "agent", "active", "against", "gram-positive", "bacteria", ",", "often", "administered", "during", "FN", "as", "treatment", "for", "hospital-acquired", "pneumonia", ",", "gram-positive", "bacteriemia", "and", "soft-skin", "tissue", "infection", "." ] } ]
PMC11723947
In their system, as in ours, IFN-γ production by Tconv was thus inhibited by Treg without affecting their accumulation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "their", "system", ",", "as", "in", "ours", ",", "IFN-γ", "production", "by", "Tconv", "was", "thus", "inhibited", "by", "Treg", "without", "affecting", "their", "accumulation", "." ] } ]
PMC11277157
In expanding the role of DJ-1 in cell signaling, it has been argued that its location, and the pattern of its post-translational modifications, determines the effect of DJ-1 in different cell systems , as studied by overexpression or knockdown (KD) (e.g., ).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "expanding", "the", "role", "of", "DJ-1", "in", "cell", "signaling", ",", "it", "has", "been", "argued", "that", "its", "location", ",", "and", "the", "pattern", "of", "its", "post-translational", "modifications", ",", "determines", "the", "effect", "of", "DJ-1", "in", "different", "cell", "systems", ",", "as", "studied", "by", "overexpression", "or", "knockdown", "(", "KD", ")", "(", "e.g.", ",", ")", "." ] } ]
PMC11686380
Coronal sections were prepared and immunostained with anti-Myc.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Coronal", "sections", "were", "prepared", "and", "immunostained", "with", "anti-Myc", "." ] } ]
PMC7215722
A key morphological feature of inflammatory bowel disease (IBD) is the loss of the barrier function of intestinal epithelial cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "key", "morphological", "feature", "of", "inflammatory", "bowel", "disease", "(", "IBD", ")", "is", "the", "loss", "of", "the", "barrier", "function", "of", "intestinal", "epithelial", "cells", "." ] } ]
PMC11371627
Exacerbation or, as in our case, subjective onset of clinical symptoms after infection (as in this case SARS-CoV-2) has to our knowledge not been investigated before in patients with MLS.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Exacerbation", "or", ",", "as", "in", "our", "case", ",", "subjective", "onset", "of", "clinical", "symptoms", "after", "infection", "(", "as", "in", "this", "case", "SARS-CoV-2", ")", "has", "to", "our", "knowledge", "not", "been", "investigated", "before", "in", "patients", "with", "MLS", "." ] } ]
PMC9848491
It is significant to note, however, that our study has several limitations.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "is", "significant", "to", "note", ",", "however", ",", "that", "our", "study", "has", "several", "limitations", "." ] } ]
PMC10713411
Finally, to further confirm the impact of PCD in RCC, we comprehensively explored the effect of TRIB3 (a hub gene in PRPCDGs) on renal tumors.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Finally", ",", "to", "further", "confirm", "the", "impact", "of", "PCD", "in", "RCC", ",", "we", "comprehensively", "explored", "the", "effect", "of", "TRIB3", "(", "a", "hub", "gene", "in", "PRPCDGs", ")", "on", "renal", "tumors", "." ] } ]
PMC5839394
SKBR3 cells (5 × 10 cells/well) were seeded on 6-well plates, grown to 90% of confluence and treated for 24h with AgNPs-EPS IC50 in a serum-free medium.
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "SKBR3", "cells", "(", "5", "×", "10", "cells/well", ")", "were", "seeded", "on", "6-well", "plates", ",", "grown", "to", "90", "%", "of", "confluence", "and", "treated", "for", "24h", "with", "AgNPs-EPS", "IC50", "in", "a", "serum-free", "medium", "." ] } ]
PMC9960565
C-NMR (100 MHz, D2O) [ppm]: δ= 30.32 (Cc + Ci), 33.64 (Ca), 34.25 (Cf), 48.23 (Cg), 50.30 (Ch), 50.99 (Cb), 174.33 (Cd), 177.53 (Cp).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "C-NMR", "(", "100", "MHz", ",", "D2O", ")", "[", "ppm", "]", ":", "δ=", "30.32", "(", "Cc", "+", "Ci", ")", ",", "33.64", "(", "Ca", ")", ",", "34.25", "(", "Cf", ")", ",", "48.23", "(", "Cg", ")", ",", "50.30", "(", "Ch", ")", ",", "50.99", "(", "Cb", ")", ",", "174.33", "(", "Cd", ")", ",", "177.53", "(", "Cp", ")", "." ] } ]
PMC9512971
Some patients develop advanced disease within about 10 days of onset, with life-threatening symptoms, including severe inflammatory reactions, dyspnea, and severe acute pneumonia .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Some", "patients", "develop", "advanced", "disease", "within", "about", "10", "days", "of", "onset", ",", "with", "life-threatening", "symptoms", ",", "including", "severe", "inflammatory", "reactions", ",", "dyspnea", ",", "and", "severe", "acute", "pneumonia", "." ] } ]
PMC11742864
Lung cancer is one of the most frequently diagnosed cancers, and its high mortality rates require continued researches.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Lung", "cancer", "is", "one", "of", "the", "most", "frequently", "diagnosed", "cancers", ",", "and", "its", "high", "mortality", "rates", "require", "continued", "researches", "." ] } ]
PMC11612626
B, RPMI-8226 were pretreated with compound A for 48 hours, after which they were washed and co-cultured with healthy CD8 cytotoxic T cells for 18 hours at E:T ratios of 1:1, 2:1, and 3:1.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B", ",", "RPMI-8226", "were", "pretreated", "with", "compound", "A", "for", "48", "hours", ",", "after", "which", "they", "were", "washed", "and", "co-cultured", "with", "healthy", "CD8", "cytotoxic", "T", "cells", "for", "18", "hours", "at", "E", ":", "T", "ratios", "of", "1:1", ",", "2:1", ",", "and", "3:1", "." ] } ]
PMC11026382
6 R)-methylenetetrahydrofolic acid (MTHF, CH2H4fol) was purchased from Merck & Cie (Switzerland) and dissolved to 100 mM in nitrogen-sparged citrate-ascorbate buffer (10 mM ascorbic acid, 8.5 mM sodium citrate, pH 8.0).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "6", "R)-methylenetetrahydrofolic", "acid", "(", "MTHF", ",", "CH2H4fol", ")", "was", "purchased", "from", "Merck", "&", "Cie", "(", "Switzerland", ")", "and", "dissolved", "to", "100", "mM", "in", "nitrogen-sparged", "citrate-ascorbate", "buffer", "(", "10", "mM", "ascorbic", "acid", ",", "8.5", "mM", "sodium", "citrate", ",", "pH", "8.0", ")", "." ] } ]
PMC11001582
n = 5 mice per genotype, one-way ANOVA, Bonferroni’s multiple comparison.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "n", "=", "5", "mice", "per", "genotype", ",", "one-way", "ANOVA", ",", "Bonferroni", "’s", "multiple", "comparison", "." ] } ]
PMC9429973
The absence of epidemiological studies in Spain leads us to believe that ASMD is highly underdiagnosed, and that the incidence of GD data is still to be defined.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "absence", "of", "epidemiological", "studies", "in", "Spain", "leads", "us", "to", "believe", "that", "ASMD", "is", "highly", "underdiagnosed", ",", "and", "that", "the", "incidence", "of", "GD", "data", "is", "still", "to", "be", "defined", "." ] } ]
PMC11661040
CHIR99021 (MedChemExpress, USA) at a concentration of 5µM was used to activate Wnt pathway for subsequent experiments.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "CHIR99021", "(", "MedChemExpress", ",", "USA", ")", "at", "a", "concentration", "of", "5µM", "was", "used", "to", "activate", "Wnt", "pathway", "for", "subsequent", "experiments", "." ] } ]
PMC11144200
In total, 5 μg/ml of Nb36, LPS-RGD-Nb36 (an equimolar amount of 5 μg/ml Nb), LPS-RGD-Nb36-DOX (an equimolar amount of 5 μg/ml Nb), LPS, or an equimolar amount of anti-CTLA-4 mAb(Abcam, UK, Cat No. ab210384) have been employed to culture these cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "total", ",", "5", "μg/ml", "of", "Nb36", ",", "LPS-RGD-Nb36", "(", "an", "equimolar", "amount", "of", "5", "μg/ml", "Nb", ")", ",", "LPS-RGD-Nb36-DOX", "(", "an", "equimolar", "amount", "of", "5", "μg/ml", "Nb", ")", ",", "LPS", ",", "or", "an", "equimolar", "amount", "of", "anti-CTLA-4", "mAb(Abcam", ",", "UK", ",", "Cat", "No.", "ab210384", ")", "have", "been", "employed", "to", "culture", "these", "cells", "." ] } ]
PMC7039683
Briefly, sorted cells were lysed with 50 µL cold lysis buffer (10 mM Tris-‐HCl, pH 7.4, 10 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 0.1% NP-40; all components purchased from Sigma) in a centrifuge at 500 x g for 15 min at 4°C.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Briefly", ",", "sorted", "cells", "were", "lysed", "with", "50", "µL", "cold", "lysis", "buffer", "(", "10", "mM", "Tris-‐HCl", ",", "pH", "7.4", ",", "10", "mM", "NaCl", ",", "3", "mM", "MgCl2", ",", "0.1", "%", "NP-40", ";", "all", "components", "purchased", "from", "Sigma", ")", "in", "a", "centrifuge", "at", "500", "x", "g", "for", "15", "min", "at", "4", "°", "C", "." ] } ]
PMC6835762
The MTX–PGA conjugate self-assembled into nanoparticles with a size dependent on the amount of conjugated MTX and the pH of medium.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "MTX", "–", "PGA", "conjugate", "self-assembled", "into", "nanoparticles", "with", "a", "size", "dependent", "on", "the", "amount", "of", "conjugated", "MTX", "and", "the", "pH", "of", "medium", "." ] } ]
PMC9429973
BID dosing may affect optimal compliance for pts and ASC4OPT will investigate both asciminib 40 mg BID and 80 mg QD.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "BID", "dosing", "may", "affect", "optimal", "compliance", "for", "pts", "and", "ASC4OPT", "will", "investigate", "both", "asciminib", "40", "mg", "BID", "and", "80", "mg", "QD", "." ] } ]
PMC9429973
Results: STP938 is a potent and reversible low molecular weight inhibitor of CTPS1, which shows >1,300-fold selectivity for human CTPS1 over CTPS2.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "STP938", "is", "a", "potent", "and", "reversible", "low", "molecular", "weight", "inhibitor", "of", "CTPS1", ",", "which", "shows", ">", "1,300-fold", "selectivity", "for", "human", "CTPS1", "over", "CTPS2", "." ] } ]
PMC9503669
Inhibitors in this class were subsequently shown to block HIV-1 replication enhancement by Nef variants representative of all major HIV-1 subtypes .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Inhibitors", "in", "this", "class", "were", "subsequently", "shown", "to", "block", "HIV-1", "replication", "enhancement", "by", "Nef", "variants", "representative", "of", "all", "major", "HIV-1", "subtypes", "." ] } ]
PMC9429973
One case of transient clonal evolution (abnormal karyotype present at Wk 13; absent at Wk 26) was reported.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "One", "case", "of", "transient", "clonal", "evolution", "(", "abnormal", "karyotype", "present", "at", "Wk", "13", ";", "absent", "at", "Wk", "26", ")", "was", "reported", "." ] } ]
PMC11751675
Lipsch.,
[ { "tags": [ "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Lipsch", ".", "," ] } ]
PMC11247842
The SNP with highest significance, rs210373936 (single trait meta-analysis for clinical mastitis), is located downstream of the GC gene, outside the CNV region.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "SNP", "with", "highest", "significance", ",", "rs210373936", "(", "single", "trait", "meta-analysis", "for", "clinical", "mastitis", ")", ",", "is", "located", "downstream", "of", "the", "GC", "gene", ",", "outside", "the", "CNV", "region", "." ] } ]
PMC11310713
In summary, our GTBs not only prove the effectiveness of hormone therapy but also suggest the feasibility of a non-invasive approach in cell-based HRT.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "summary", ",", "our", "GTBs", "not", "only", "prove", "the", "effectiveness", "of", "hormone", "therapy", "but", "also", "suggest", "the", "feasibility", "of", "a", "non-invasive", "approach", "in", "cell-based", "HRT", "." ] } ]
PMC9243326
The structure of the non-redundant unigenes was also analyzed in our study.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "structure", "of", "the", "non-redundant", "unigenes", "was", "also", "analyzed", "in", "our", "study", "." ] } ]