OTAR3088/BioData-CellLine_annotated · Datasets at Hugging Face

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PMC11499381	Each data point represents an independent experiment with lines indicating mean ± s.e.m.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Each", "data", "point", "represents", "an", "independent", "experiment", "with", "lines", "indicating", "mean", "±", "s.e.m", "." ] } ]
PMC11449273	We found that while p53-WT did not affect the expression of PUMA, BAX and S100A4, plakoglobin significantly increased PUMA and BAX but not S100A4 expression in H1299 cells (S4A–S4C Fig).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "found", "that", "while", "p53-WT", "did", "not", "affect", "the", "expression", "of", "PUMA", ",", "BAX", "and", "S100A4", ",", "plakoglobin", "significantly", "increased", "PUMA", "and", "BAX", "but", "not", "S100A4", "expression", "in", "H1299", "cells", "(", "S4A", "–", "S4C", "Fig", ")", "." ] } ]
PMC11792090	The expression of CD69 on host T cells and the apoptosis of CAR-T cells were subsequently examined.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "expression", "of", "CD69", "on", "host", "T", "cells", "and", "the", "apoptosis", "of", "CAR-T", "cells", "were", "subsequently", "examined", "." ] } ]
PMC11742431	In vivo assessment of tumor inhibition by KVN and K14N proteins. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "vivo", "assessment", "of", "tumor", "inhibition", "by", "KVN", "and", "K14N", "proteins", ".", "(" ] } ]
PMC10988555	For complexes 3 and 4, containing the phenanthroline-derived ligands, no significant alterations were observed in the intensity of the UV bands upon coordination of the N,N-heteroaromatic ligand.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "complexes", "3", "and", "4", ",", "containing", "the", "phenanthroline-derived", "ligands", ",", "no", "significant", "alterations", "were", "observed", "in", "the", "intensity", "of", "the", "UV", "bands", "upon", "coordination", "of", "the", "N", ",", "N-heteroaromatic", "ligand", "." ] } ]
PMC11306331	To discriminate between these hypotheses, we performed kinetic measurements in cells which were globally illuminated at standard intensity (~200 mW/cm), at low intensity (~30 mW/cm), or at low intensity and under partial-cell illumination (Fig. S3E, F).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "discriminate", "between", "these", "hypotheses", ",", "we", "performed", "kinetic", "measurements", "in", "cells", "which", "were", "globally", "illuminated", "at", "standard", "intensity", "(", "~200", "mW/cm", ")", ",", "at", "low", "intensity", "(", "~30", "mW/cm", ")", ",", "or", "at", "low", "intensity", "and", "under", "partial-cell", "illumination", "(", "Fig.", "S3E", ",", "F", ")", "." ] } ]
PMC11748335	No significant motifs were found in the NE2 vs KYSE510 group.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "No", "significant", "motifs", "were", "found", "in", "the", "NE2", "vs", "KYSE510", "group", "." ] } ]
PMC11344246	Organoid segmentation, based on brightfield images, was performed using CellProfiler software (Broad Institute of MIT and Harvard, version 4.1.3) (39).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Organoid", "segmentation", ",", "based", "on", "brightfield", "images", ",", "was", "performed", "using", "CellProfiler", "software", "(", "Broad", "Institute", "of", "MIT", "and", "Harvard", ",", "version", "4.1.3", ")", "(", "39", ")", "." ] } ]
PMC10253973	A low fluorescence quantum yield indicates the possibility of singlet oxygen generation and intra system transition in these molecules.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "low", "fluorescence", "quantum", "yield", "indicates", "the", "possibility", "of", "singlet", "oxygen", "generation", "and", "intra", "system", "transition", "in", "these", "molecules", "." ] } ]
PMC10204952	It was observed that both AD-CM and CAA-CM mildly suppressed the anti-proliferative effect and reduced nuclear alteration/apoptosis associated with high-concentration S1P treatment.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "was", "observed", "that", "both", "AD-CM", "and", "CAA-CM", "mildly", "suppressed", "the", "anti-proliferative", "effect", "and", "reduced", "nuclear", "alteration/apoptosis", "associated", "with", "high-concentration", "S1P", "treatment", "." ] } ]
PMC11089031	A The expression value was calculated by the TNMplot web tool (www.tnmplot.com, 18 July 2022) using TCGA RNA-seq datasets with available data for tumor and adjacent normal tissues.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "The", "expression", "value", "was", "calculated", "by", "the", "TNMplot", "web", "tool", "(", "www.tnmplot.com", ",", "18", "July", "2022", ")", "using", "TCGA", "RNA-seq", "datasets", "with", "available", "data", "for", "tumor", "and", "adjacent", "normal", "tissues", "." ] } ]
PMC11279598	Phosphorylation of AMPK (Thr172) was detected in a dose-dependent manner, with activity detected with as low as 0.6% MH.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Phosphorylation", "of", "AMPK", "(", "Thr172", ")", "was", "detected", "in", "a", "dose-dependent", "manner", ",", "with", "activity", "detected", "with", "as", "low", "as", "0.6", "%", "MH", "." ] } ]
PMC9429973	Imune paresis was seen in eighty four percent of patients at diagnosis.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Imune", "paresis", "was", "seen", "in", "eighty", "four", "percent", "of", "patients", "at", "diagnosis", "." ] } ]
PMC11758416	Transfer 100 μL of staining master mix solution from 8a to each well.d.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Transfer", "100", "μL", "of", "staining", "master", "mix", "solution", "from", "8a", "to", "each", "well.d", "." ] } ]
PMC9429973	No deaths were reported at day+30.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "No", "deaths", "were", "reported", "at", "day+30", "." ] } ]
PMC11564322	ELANE is a gene coding for human neutrophil elastase, a protease expressed early in neutrophil development, and has also been identified as an oncogene in various tumors associated with both cyclic and autosomal dominant neutropenia .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ELANE", "is", "a", "gene", "coding", "for", "human", "neutrophil", "elastase", ",", "a", "protease", "expressed", "early", "in", "neutrophil", "development", ",", "and", "has", "also", "been", "identified", "as", "an", "oncogene", "in", "various", "tumors", "associated", "with", "both", "cyclic", "and", "autosomal", "dominant", "neutropenia", "." ] } ]
PMC9429973	Summary/Conclusion: EXENT provides superior performance for the identification of M-proteins throughout monitoring.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Summary/Conclusion", ":", "EXENT", "provides", "superior", "performance", "for", "the", "identification", "of", "M-proteins", "throughout", "monitoring", "." ] } ]
PMC11186948	HDACs are divided into four classes based on their structure similarities and catalytic mechanisms: Class I (HDAC1, 2, 3, 8), Class IIa (HDAC4, 5, 7, 9), Class IIb (HDAC6, 10), Class III (SIRT1-7) and Class IV (HDAC11).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HDACs", "are", "divided", "into", "four", "classes", "based", "on", "their", "structure", "similarities", "and", "catalytic", "mechanisms", ":", "Class", "I", "(", "HDAC1", ",", "2", ",", "3", ",", "8)", ",", "Class", "IIa", "(", "HDAC4", ",", "5", ",", "7", ",", "9", ")", ",", "Class", "IIb", "(", "HDAC6", ",", "10", ")", ",", "Class", "III", "(", "SIRT1", "-", "7", ")", "and", "Class", "IV", "(", "HDAC11", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Incorporating sAML-type mutations can further refine the 2017 ELN risk stratification.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Incorporating", "sAML-type", "mutations", "can", "further", "refine", "the", "2017", "ELN", "risk", "stratification", "." ] } ]
PMC11767582	H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 7.74 (s, 1H), 7.47 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 7.04 (dd, J = 8.6, 2.2 Hz, 1H), 6.79 (d, J = 8.6 Hz, 1H), 6.53 (s, 2H), 4.04 (q, J = 7.0 Hz, 2H), 3.82 (s, 3H), 3.69 (s, 6H), 1.41 (t, J = 7.0 Hz, 3H).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "H", "NMR", "(", "400", "MHz", ",", "CDCl3", ")", "δ", "7.74", "(", "s", ",", "1H", ")", ",", "7.47", "(", "d", ",", "J", "=", "2.2", "Hz", ",", "1H", ")", ",", "7.04", "(", "dd", ",", "J", "=", "8.6", ",", "2.2", "Hz", ",", "1H", ")", ",", "6.79", "(", "d", ",", "J", "=", "8.6", "Hz", ",", "1H", ")", ",", "6.53", "(", "s", ",", "2H", ")", ",", "4.04", "(", "q", ",", "J", "=", "7.0", "Hz", ",", "2H", ")", ",", "3.82", "(", "s", ",", "3H", ")", ",", "3.69", "(", "s", ",", "6H", ")", ",", "1.41", "(", "t", ",", "J", "=", "7.0", "Hz", ",", "3H", ")", "." ] } ]
PMC11283030	b. WB analysis to validate the efficiency of ACLY silencing in 786-O and A498 cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "b.", "WB", "analysis", "to", "validate", "the", "efficiency", "of", "ACLY", "silencing", "in", "786-O", "and", "A498", "cells", "." ] } ]
PMC9429973	Bio-rad® reagents used for ABO, RH, K. Results: the number of blood donations is stable according to the quarter, p=0.25 (NS).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Bio-rad", "®", "reagents", "used", "for", "ABO", ",", "RH", ",", "K.", "Results", ":", "the", "number", "of", "blood", "donations", "is", "stable", "according", "to", "the", "quarter", ",", "p=0.25", "(", "NS", ")", "." ] } ]
PMC11539788	The expression patterns of these genes in BCa samples with high or low RNF19A expression are displayed in Supplementary Fig. 1A.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "expression", "patterns", "of", "these", "genes", "in", "BCa", "samples", "with", "high", "or", "low", "RNF19A", "expression", "are", "displayed", "in", "Supplementary", "Fig.", "1A", "." ] } ]
PMC10547921	Chemical structures of amatoxins 88, 89; (B) Binding mode of α-Amanitin (88) in complex with RNA (PDB code 3CQZ).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Chemical", "structures", "of", "amatoxins", "88", ",", "89", ";", "(", "B", ")", "Binding", "mode", "of", "α-Amanitin", "(", "88", ")", "in", "complex", "with", "RNA", "(", "PDB", "code", "3CQZ", ")", "." ] } ]
PMC8584319	We investigated factors involved in AZD8055-mediated inhibition of protein synthesis and found phosphorylation of ERK1/2 and p38 to play a positive role in translation.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "investigated", "factors", "involved", "in", "AZD8055-mediated", "inhibition", "of", "protein", "synthesis", "and", "found", "phosphorylation", "of", "ERK1/2", "and", "p38", "to", "play", "a", "positive", "role", "in", "translation", "." ] } ]
PMC2614415	Pellets were resuspended and fixed in 70% Ethanol/PBS at -20°C overnight.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Pellets", "were", "resuspended", "and", "fixed", "in", "70", "%", "Ethanol/PBS", "at", "-20", "°", "C", "overnight", "." ] } ]
PMC6617630	a, b DHL and THL cell lines were treated with BET bromodomain inhibitors I-BET, JQ1, and OTX, and RT-PCR was performed using MYC- and BCL-6-specific primers.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "a", ",", "b", "DHL", "and", "THL", "cell", "lines", "were", "treated", "with", "BET", "bromodomain", "inhibitors", "I-BET", ",", "JQ1", ",", "and", "OTX", ",", "and", "RT-PCR", "was", "performed", "using", "MYC-", "and", "BCL-6-specific", "primers", "." ] } ]
PMC11536589	The cell viability was measured after 1 µM Erastin treatment were assessed by CCK8 assay in parental PDAC cells and MRTX1133-resistant PDAC cells. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cell", "viability", "was", "measured", "after", "1", "µM", "Erastin", "treatment", "were", "assessed", "by", "CCK8", "assay", "in", "parental", "PDAC", "cells", "and", "MRTX1133-resistant", "PDAC", "cells", ".", "(" ] } ]
PMC11754436	DHRS4-AS1 silencing models in 143B cells, *Represent comparison with the BC group. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "DHRS4-AS1", "silencing", "models", "in", "143B", "cells", ",", "*", "Represent", "comparison", "with", "the", "BC", "group", ".", "(" ] } ]
PMC9429973	Sorafenib was used in 62% of cases, followed by Quizartinib (24%).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Sorafenib", "was", "used", "in", "62", "%", "of", "cases", ",", "followed", "by", "Quizartinib", "(", "24", "%", ")", "." ] } ]
PMC10809689	Gradient elution was linear from 10 to 100% B at a flow rate of 1.2 mL/min in 35 min.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Gradient", "elution", "was", "linear", "from", "10", "to", "100", "%", "B", "at", "a", "flow", "rate", "of", "1.2", "mL/min", "in", "35", "min", "." ] } ]
PMC11746948	n = 6 individual mice.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "n", "=", "6", "individual", "mice", "." ] } ]
PMC11585565	Across 26 studies, 33 CNNM4 variants have been reported as associated with JS.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Across", "26", "studies", ",", "33", "CNNM4", "variants", "have", "been", "reported", "as", "associated", "with", "JS", "." ] } ]
PMC11615828	Our fluorescence imaging revealed that peroxisomes did not or only barely overlap with centriolar satellites (Figure 2a).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "fluorescence", "imaging", "revealed", "that", "peroxisomes", "did", "not", "or", "only", "barely", "overlap", "with", "centriolar", "satellites", "(", "Figure", "2a", ")", "." ] } ]
PMC10968586	Treatment of Caco2 and HT-29 cell lines with 100 μM HT for 8 h led to G1 phase cell cycle arrest, whereas extending the treatment for 48 h caused activation of caspase-3.	[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Treatment", "of", "Caco2", "and", "HT-29", "cell", "lines", "with", "100", "μM", "HT", "for", "8", "h", "led", "to", "G1", "phase", "cell", "cycle", "arrest", ",", "whereas", "extending", "the", "treatment", "for", "48", "h", "caused", "activation", "of", "caspase-3", "." ] } ]
PMC9429973	Mitapivat is the only approved pharmacotherapy in PK deficiency, and may have the potential to improve iron metabolism and reduce FeO in pts with this condition.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Mitapivat", "is", "the", "only", "approved", "pharmacotherapy", "in", "PK", "deficiency", ",", "and", "may", "have", "the", "potential", "to", "improve", "iron", "metabolism", "and", "reduce", "FeO", "in", "pts", "with", "this", "condition", "." ] } ]
PMC11518702	For C1ORF150, its HGAL-homologous subdomains are considered, together with studies that demonstrate C1OR150’s FcϵRI- and KIT-mediated expression and phosphorylation in primary human mast cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "C1ORF150", ",", "its", "HGAL-homologous", "subdomains", "are", "considered", ",", "together", "with", "studies", "that", "demonstrate", "C1OR150", "’s", "FcϵRI-", "and", "KIT-mediated", "expression", "and", "phosphorylation", "in", "primary", "human", "mast", "cells", "." ] } ]
PMC11388384	Together, these results suggest in the presence of SCUBE1, SHH gradients formed by diffusion.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Together", ",", "these", "results", "suggest", "in", "the", "presence", "of", "SCUBE1", ",", "SHH", "gradients", "formed", "by", "diffusion", "." ] } ]
PMC10507284	The difference was considered statistically significant when the p value was less than 0.05.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "difference", "was", "considered", "statistically", "significant", "when", "the", "p", "value", "was", "less", "than", "0.05", "." ] } ]
PMC9910796	At the EM level (Fig 6F and 6G), pEP84R and pp220 dual labeling showed their co-localization at the nuclear envelope, ER and Golgi membranes.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "the", "EM", "level", "(", "Fig", "6F", "and", "6", "G", ")", ",", "pEP84R", "and", "pp220", "dual", "labeling", "showed", "their", "co-localization", "at", "the", "nuclear", "envelope", ",", "ER", "and", "Golgi", "membranes", "." ] } ]
PMC9919300	All results of the treatments with curcumin, andrographolide, and association referred to the steatogenic.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "results", "of", "the", "treatments", "with", "curcumin", ",", "andrographolide", ",", "and", "association", "referred", "to", "the", "steatogenic", "." ] } ]
PMC9429973	0.1 amplitude with 5% error Results: 265 patients, 126 (47.5%) male and 139 (52.5%) female, with a median age of 62 years (34-90).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "0.1", "amplitude", "with", "5", "%", "error", "Results", ":", "265", "patients", ",", "126", "(", "47.5", "%", ")", "male", "and", "139", "(", "52.5", "%", ")", "female", ",", "with", "a", "median", "age", "of", "62", "years", "(", "34", "-", "90", ")", "." ] } ]
PMC11577421	Figure S2).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Figure", "S2", ")", "." ] } ]
PMC11694066	Unless otherwise stated, all graphs show mean values with error bars (SD); 95% confidence intervals were used and considered significance at , P < 0.05; , P < 0.01; , P < 0.001; **, P < 0.0001; ns, not significant.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Unless", "otherwise", "stated", ",", "all", "graphs", "show", "mean", "values", "with", "error", "bars", "(", "SD", ")", ";", "95", "%", "confidence", "intervals", "were", "used", "and", "considered", "significance", "at", "", ",", "P", "<", "0.05", ";", "", "", ",", "P", "<", "0.01", ";", "", "", "", ",", "P", "<", "0.001", ";", "", "", "", "", ",", "P", "<", "0.0001", ";", "ns", ",", "not", "significant", "." ] } ]
PMC6160470	After incubation for 30 minutes, slides were washed and incubated with phalloidin-Alexa fluor 594 (1:40, Invitrogen) for 30 minutes at RT.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "incubation", "for", "30", "minutes", ",", "slides", "were", "washed", "and", "incubated", "with", "phalloidin-Alexa", "fluor", "594", "(", "1:40", ",", "Invitrogen", ")", "for", "30", "minutes", "at", "RT", "." ] } ]
PMC11590870	The dried leaves were milled in a KRUPS Gx41011 coffee grinder (CDMX, Mexico).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "dried", "leaves", "were", "milled", "in", "a", "KRUPS", "Gx41011", "coffee", "grinder", "(", "CDMX", ",", "Mexico", ")", "." ] } ]
PMC11078693	After the glass lid is placed on top of the over-field chamber, there will be no air gap under the lid, and no meniscus to refract trans-illumination light.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "the", "glass", "lid", "is", "placed", "on", "top", "of", "the", "over-field", "chamber", ",", "there", "will", "be", "no", "air", "gap", "under", "the", "lid", ",", "and", "no", "meniscus", "to", "refract", "trans-illumination", "light", "." ] } ]
PMC11098378	Here, we further explore the restricted infections of arboviruses in lepidopterans by infecting moth cells with the rhabdovirus, VSV, and the togaviruses: SINV, RRV, and ONNV.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Here", ",", "we", "further", "explore", "the", "restricted", "infections", "of", "arboviruses", "in", "lepidopterans", "by", "infecting", "moth", "cells", "with", "the", "rhabdovirus", ",", "VSV", ",", "and", "the", "togaviruses", ":", "SINV", ",", "RRV", ",", "and", "ONNV", "." ] } ]
PMC11786767	The data represent mean ± SEM, and individual data points are also shown.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "data", "represent", "mean", "±", "SEM", ",", "and", "individual", "data", "points", "are", "also", "shown", "." ] } ]
PMC11635087	Cells that contained chloroplasts were captured within the field of view, and the area of interest (AOI) was set using Imaging WinGigE software (WALZ).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "that", "contained", "chloroplasts", "were", "captured", "within", "the", "field", "of", "view", ",", "and", "the", "area", "of", "interest", "(", "AOI", ")", "was", "set", "using", "Imaging", "WinGigE", "software", "(", "WALZ", ")", "." ] } ]
PMC11718031	The batch cultures were harvested when viability reached < 80%.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "batch", "cultures", "were", "harvested", "when", "viability", "reached", "<", "80", "%", "." ] } ]
PMC8358006	To understand how the GSDs activated genes defined above are controlled, we focused on TFs because of their broad role in initiating programs key to cell fate and identity in cancer.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "understand", "how", "the", "GSDs", "activated", "genes", "defined", "above", "are", "controlled", ",", "we", "focused", "on", "TFs", "because", "of", "their", "broad", "role", "in", "initiating", "programs", "key", "to", "cell", "fate", "and", "identity", "in", "cancer", "." ] } ]
PMC11541409	Providing evidence that development of new drug targeting non-authentic targets is possible to overcome drug resistance in advanced GIST patients.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Providing", "evidence", "that", "development", "of", "new", "drug", "targeting", "non-authentic", "targets", "is", "possible", "to", "overcome", "drug", "resistance", "in", "advanced", "GIST", "patients", "." ] } ]
PMC11476106	Our findings highlight the heterogeneity of cell line responses to their microenvironment, underscoring the enormous potential of these hydrogels as mechanodrug-testing platforms and for studying cell protein secretion as an initial step in liquid biopsy biomarker research.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "findings", "highlight", "the", "heterogeneity", "of", "cell", "line", "responses", "to", "their", "microenvironment", ",", "underscoring", "the", "enormous", "potential", "of", "these", "hydrogels", "as", "mechanodrug-testing", "platforms", "and", "for", "studying", "cell", "protein", "secretion", "as", "an", "initial", "step", "in", "liquid", "biopsy", "biomarker", "research", "." ] } ]
PMC11661024	It was recently shown that iKB(α) is also located at the outer mitochondrial membrane (OMM), leading to apoptosis inhibition.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "was", "recently", "shown", "that", "iKB(α", ")", "is", "also", "located", "at", "the", "outer", "mitochondrial", "membrane", "(", "OMM", ")", ",", "leading", "to", "apoptosis", "inhibition", "." ] } ]
PMC6617630	Overall, our finding suggests that MYC-expressing lymphoma cells are most probably addicted to the MYC-oncogenic effect and rely on MYC for their growth regardless of MYC rearrangements.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Overall", ",", "our", "finding", "suggests", "that", "MYC-expressing", "lymphoma", "cells", "are", "most", "probably", "addicted", "to", "the", "MYC-oncogenic", "effect", "and", "rely", "on", "MYC", "for", "their", "growth", "regardless", "of", "MYC", "rearrangements", "." ] } ]
PMC10253973	It includes an example of QM calculations, which, as pointed out at the beginning, are much more demanding but, at the same time, much more reliable; however, such attempts are becoming more common nowadays due to the increasing power and accessibility of high-performance computers.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "includes", "an", "example", "of", "QM", "calculations", ",", "which", ",", "as", "pointed", "out", "at", "the", "beginning", ",", "are", "much", "more", "demanding", "but", ",", "at", "the", "same", "time", ",", "much", "more", "reliable", ";", "however", ",", "such", "attempts", "are", "becoming", "more", "common", "nowadays", "due", "to", "the", "increasing", "power", "and", "accessibility", "of", "high-performance", "computers", "." ] } ]
PMC7039683	Embryos were only excluded from further analysis if they did not carry the reporter transgene.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Embryos", "were", "only", "excluded", "from", "further", "analysis", "if", "they", "did", "not", "carry", "the", "reporter", "transgene", "." ] } ]
PMC5854676	An empirical model was applied to assess the validity of the experimental results, where the modelling results were in good agreement with the experimental results.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "An", "empirical", "model", "was", "applied", "to", "assess", "the", "validity", "of", "the", "experimental", "results", ",", "where", "the", "modelling", "results", "were", "in", "good", "agreement", "with", "the", "experimental", "results", "." ] } ]
PMC6892818	Yet, apart from hematopoietic cells, such as B cells and antigen-presenting cells, CD40 is also expressed by epithelial cells of various origins, including bladder, liver and ovarian carcinoma cells, normal epithelial cells as well as endothelial cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Yet", ",", "apart", "from", "hematopoietic", "cells", ",", "such", "as", "B", "cells", "and", "antigen-presenting", "cells", ",", "CD40", "is", "also", "expressed", "by", "epithelial", "cells", "of", "various", "origins", ",", "including", "bladder", ",", "liver", "and", "ovarian", "carcinoma", "cells", ",", "normal", "epithelial", "cells", "as", "well", "as", "endothelial", "cells", "." ] } ]
PMC11216402	UMAP of scRNA-seq of gastric tumor and adjacent normal stomach tissue from Kim et al. (2022).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "UMAP", "of", "scRNA-seq", "of", "gastric", "tumor", "and", "adjacent", "normal", "stomach", "tissue", "from", "Kim", "et", "al.", "(", "2022", ")", "." ] } ]
PMC11389534	Additionally, in chondrocytes, UFL1 suppresses the activation of NF‐κB signalling pathway induced by IL‐1β.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "in", "chondrocytes", ",", "UFL1", "suppresses", "the", "activation", "of", "NF‐κB", "signalling", "pathway", "induced", "by", "IL‐1β", "." ] } ]
PMC11095939	Based on our observations, the inhibition of certain NRs by Mecp2 depletion during quiescence exit is probably general and not hepatocyte-specific because we also validated the repression of several NRs in cellular models of quiescence exit.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Based", "on", "our", "observations", ",", "the", "inhibition", "of", "certain", "NRs", "by", "Mecp2", "depletion", "during", "quiescence", "exit", "is", "probably", "general", "and", "not", "hepatocyte-specific", "because", "we", "also", "validated", "the", "repression", "of", "several", "NRs", "in", "cellular", "models", "of", "quiescence", "exit", "." ] } ]
PMC10213199	Larvae group (Table 3).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Larvae", "group", "(", "Table", "3", ")", "." ] } ]
PMC11594641	The slight increase in Alix in RAB27A KO SkMel28 sEVs did not reach statistical significance (Figure 5B).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "slight", "increase", "in", "Alix", "in", "RAB27A", "KO", "SkMel28", "sEVs", "did", "not", "reach", "statistical", "significance", "(", "Figure", "5B", ")", "." ] } ]
PMC11281366	Reads were trimmed with Cutadapt v2.5, aligned to the reference genome GRCh38 using STAR version 2.5.1b extracted using FeatureCounts v1.6.0, and specifically, miRNAs were quantified using mirdeep2 v2.0.1.1.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Reads", "were", "trimmed", "with", "Cutadapt", "v2.5", ",", "aligned", "to", "the", "reference", "genome", "GRCh38", "using", "STAR", "version", "2.5.1b", "extracted", "using", "FeatureCounts", "v1.6.0", ",", "and", "specifically", ",", "miRNAs", "were", "quantified", "using", "mirdeep2", "v2.0.1.1", "." ] } ]
PMC9429973	Broviac and PICC were removed for infections in 5% (n=4) and in 3% (n=1) of patients, respectively.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Broviac", "and", "PICC", "were", "removed", "for", "infections", "in", "5", "%", "(", "n=4", ")", "and", "in", "3", "%", "(", "n=1", ")", "of", "patients", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11095939	All the animal studies were performed in accordance with the ethical guidelines of South Medical University ethics committee and were approved by the Ethics Committee on Use and Care of Animals of Southern Medical University (SMUL2017193).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "the", "animal", "studies", "were", "performed", "in", "accordance", "with", "the", "ethical", "guidelines", "of", "South", "Medical", "University", "ethics", "committee", "and", "were", "approved", "by", "the", "Ethics", "Committee", "on", "Use", "and", "Care", "of", "Animals", "of", "Southern", "Medical", "University", "(", "SMUL2017193", ")", "." ] } ]
PMC11696576	Cells were preincubated with inhibitors for 2 h before incubating with 30 µM Ca ionophore A23187 for 15 min to activate cPLA2α.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "preincubated", "with", "inhibitors", "for", "2", "h", "before", "incubating", "with", "30", "µM", "Ca", "ionophore", "A23187", "for", "15", "min", "to", "activate", "cPLA2α", "." ] } ]
PMC9429973	Summary/Conclusion: This first study has examined the utility of new red cell parameters in patients with IRIDA.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Summary/Conclusion", ":", "This", "first", "study", "has", "examined", "the", "utility", "of", "new", "red", "cell", "parameters", "in", "patients", "with", "IRIDA", "." ] } ]
PMC11400680	There are a total of 54,016 instances (including cells and nuclei) in the dataset, which have been randomly divided into three sets: training, validation, and testing, as described in Table 1.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "There", "are", "a", "total", "of", "54,016", "instances", "(", "including", "cells", "and", "nuclei", ")", "in", "the", "dataset", ",", "which", "have", "been", "randomly", "divided", "into", "three", "sets", ":", "training", ",", "validation", ",", "and", "testing", ",", "as", "described", "in", "Table", "1", "." ] } ]
PMC9429973	Briefly, mononuclear cells were isolated by Ficoll and seeded on collagen-coated plates.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Briefly", ",", "mononuclear", "cells", "were", "isolated", "by", "Ficoll", "and", "seeded", "on", "collagen-coated", "plates", "." ] } ]
PMC11461874	The dried and desalted peptides were dissolved in distilled water containing 2% acetonitrile and 0.1% TFA.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "dried", "and", "desalted", "peptides", "were", "dissolved", "in", "distilled", "water", "containing", "2", "%", "acetonitrile", "and", "0.1", "%", "TFA", "." ] } ]
PMC11661040	In this study, we have identified the oncogenic role of CGREF1 in osteosarcoma and investigated its involvement and potential molecular mechanisms in the malignant biological behaviors of osteosarcoma cells through both in vivo and in vitro experiments.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "study", ",", "we", "have", "identified", "the", "oncogenic", "role", "of", "CGREF1", "in", "osteosarcoma", "and", "investigated", "its", "involvement", "and", "potential", "molecular", "mechanisms", "in", "the", "malignant", "biological", "behaviors", "of", "osteosarcoma", "cells", "through", "both", "in", "vivo", "and", "in", "vitro", "experiments", "." ] } ]
PMC11258145	Chloroform were used as a high purity solvent to obtain lipids’ solutions, but only for DPPS dissolution; 9:1 v/v chloroform:methanol (POCH (Avantor Poland) were used.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Chloroform", "were", "used", "as", "a", "high", "purity", "solvent", "to", "obtain", "lipids", "’", "solutions", ",", "but", "only", "for", "DPPS", "dissolution", ";", "9:1", "v/v", "chloroform", ":", "methanol", "(", "POCH", "(", "Avantor", "Poland", ")", "were", "used", "." ] } ]
PMC9031474	Compound 18 was the most active compound against most of the cancer cell lines.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Compound", "18", "was", "the", "most", "active", "compound", "against", "most", "of", "the", "cancer", "cell", "lines", "." ] } ]
PMC11509224	Diterpenoids represent a class of structurally diverse terpenes with various biological activities.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Diterpenoids", "represent", "a", "class", "of", "structurally", "diverse", "terpenes", "with", "various", "biological", "activities", "." ] } ]
PMC10734950	As previously mentioned, the experimental and control treatments were evaluated in three independent measurements and normalized.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "previously", "mentioned", ",", "the", "experimental", "and", "control", "treatments", "were", "evaluated", "in", "three", "independent", "measurements", "and", "normalized", "." ] } ]
PMC11786767	PS was only located in regions of epichromatin.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "PS", "was", "only", "located", "in", "regions", "of", "epichromatin", "." ] } ]
PMC11285179	The characteristics of pericytes were identified by immunofluorescence staining α-SMA, PDGFRβ, and NG2 (Fig. 2C).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "characteristics", "of", "pericytes", "were", "identified", "by", "immunofluorescence", "staining", "α-SMA", ",", "PDGFRβ", ",", "and", "NG2", "(", "Fig.", "2C", ")", "." ] } ]
PMC11759751	We found that low concentrations of chidamide did not enhance the ability of CD19 CAR T cells to kill B-NHL cells during and after preparation.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "found", "that", "low", "concentrations", "of", "chidamide", "did", "not", "enhance", "the", "ability", "of", "CD19", "CAR", "T", "cells", "to", "kill", "B-NHL", "cells", "during", "and", "after", "preparation", "." ] } ]
PMC11786156	Holm correction was manually performed based on the results of the t-tests, where corrected P = P × (number of pairs tested + 1 – rank of P-value tested).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Holm", "correction", "was", "manually", "performed", "based", "on", "the", "results", "of", "the", "t-tests", ",", "where", "corrected", "P", "=", "P", "×", "(", "number", "of", "pairs", "tested", "+", "1", "–", "rank", "of", "P-value", "tested", ")", "." ] } ]
PMC11388384	Surplus forelimbs and hindlimbs from E13.0 embryos were dissected and embedded in 4% low-melt agarose, then sectioned on ice using a Leica VT1200S vibratome with a step size of 100 µm.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Surplus", "forelimbs", "and", "hindlimbs", "from", "E13.0", "embryos", "were", "dissected", "and", "embedded", "in", "4", "%", "low-melt", "agarose", ",", "then", "sectioned", "on", "ice", "using", "a", "Leica", "VT1200S", "vibratome", "with", "a", "step", "size", "of", "100", "µm", "." ] } ]
PMC11637276	Cells were washed 3 times with PBS and once with ionised water.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "washed", "3", "times", "with", "PBS", "and", "once", "with", "ionised", "water", "." ] } ]
PMC11754094	Both small indels and large-deletion events occurred at lower frequencies at targets with TC motifs with ABE-UGI, consistent with the UGI inhibiting the production of DSBs produced through a mechanism similar to that observed for the CBEs (Fig. 4b,d).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Both", "small", "indels", "and", "large-deletion", "events", "occurred", "at", "lower", "frequencies", "at", "targets", "with", "TC", "motifs", "with", "ABE-UGI", ",", "consistent", "with", "the", "UGI", "inhibiting", "the", "production", "of", "DSBs", "produced", "through", "a", "mechanism", "similar", "to", "that", "observed", "for", "the", "CBEs", "(", "Fig.", "4b", ",", "d", ")", "." ] } ]
PMC11575040	Melanoma cells may undergo a metabolic shift to avoid BRAF-induced senescence by limiting their reliance on OXPHOS and by promoting proliferation.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Melanoma", "cells", "may", "undergo", "a", "metabolic", "shift", "to", "avoid", "BRAF-induced", "senescence", "by", "limiting", "their", "reliance", "on", "OXPHOS", "and", "by", "promoting", "proliferation", "." ] } ]
PMC11754094	Moreover, we found that treatment with ART558 decreased the large-deletion events (Fig. 4f), suggesting that TMEJ remains the major pathway for BE-mediated large deletions.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Moreover", ",", "we", "found", "that", "treatment", "with", "ART558", "decreased", "the", "large-deletion", "events", "(", "Fig.", "4f", ")", ",", "suggesting", "that", "TMEJ", "remains", "the", "major", "pathway", "for", "BE-mediated", "large", "deletions", "." ] } ]
PMC10877303	Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV) is an unprecedented virus that caused Middle East respiratory syndrome (MERS), a highly deadly respiratory disease reported in June 2012 in the Arabian Peninsula and subsequently expanded globally .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Middle", "East", "Respiratory", "Syndrome", "Coronavirus", "(", "MERS-CoV", ")", "is", "an", "unprecedented", "virus", "that", "caused", "Middle", "East", "respiratory", "syndrome", "(", "MERS", ")", ",", "a", "highly", "deadly", "respiratory", "disease", "reported", "in", "June", "2012", "in", "the", "Arabian", "Peninsula", "and", "subsequently", "expanded", "globally", "." ] } ]
PMC8567602	A, Schematic of BAF-family complex subtypes and their varied componentry in synovial sarcoma. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", ",", "Schematic", "of", "BAF-family", "complex", "subtypes", "and", "their", "varied", "componentry", "in", "synovial", "sarcoma", ".", "(" ] } ]
PMC9429973	Results: A total of 69 MM patients were included in the study with a mean age at diagnosis of 64.9 ± 11.0 years.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "A", "total", "of", "69", "MM", "patients", "were", "included", "in", "the", "study", "with", "a", "mean", "age", "at", "diagnosis", "of", "64.9", "±", "11.0", "years", "." ] } ]
PMC11565047	Excellent RNA integrity was confirmed using a TapeStation 2200 (Agilent), where all samples had an equivalent RNA integrity number (RINe) > 8.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Excellent", "RNA", "integrity", "was", "confirmed", "using", "a", "TapeStation", "2200", "(", "Agilent", ")", ",", "where", "all", "samples", "had", "an", "equivalent", "RNA", "integrity", "number", "(", "RINe", ")", ">", "8", "." ] } ]
PMC11704135	The findings indicated that compound 12 exhibited a minimal level of antitumor activity, as evidenced by its IC50 value of 420.75 µg/ml, suggesting relatively lower efficacy in inhibiting tumor growth.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "findings", "indicated", "that", "compound", "12", "exhibited", "a", "minimal", "level", "of", "antitumor", "activity", ",", "as", "evidenced", "by", "its", "IC50", "value", "of", "420.75", "µg/ml", ",", "suggesting", "relatively", "lower", "efficacy", "in", "inhibiting", "tumor", "growth", "." ] } ]
PMC11803918	Photodynamic therapy (PDT) is a minimally invasive therapeutic strategy and is suitable for melanoma treatment with spatiotemporal control.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Photodynamic", "therapy", "(", "PDT", ")", "is", "a", "minimally", "invasive", "therapeutic", "strategy", "and", "is", "suitable", "for", "melanoma", "treatment", "with", "spatiotemporal", "control", "." ] } ]
PMC9429973	Finally, PTCy may suppress graft-versus-leukemia effects in the setting of matched donor cells, potentially increasing the risk of relapse.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Finally", ",", "PTCy", "may", "suppress", "graft-versus-leukemia", "effects", "in", "the", "setting", "of", "matched", "donor", "cells", ",", "potentially", "increasing", "the", "risk", "of", "relapse", "." ] } ]
PMC11699465	To confirm its nuclear localization, we designed different protocols in live or fixed cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "confirm", "its", "nuclear", "localization", ",", "we", "designed", "different", "protocols", "in", "live", "or", "fixed", "cells", "." ] } ]
PMC11155445	The antioxidant activity of the compound (121a) was due to the presence of the hydroxyl group while that of compound (121b) was attributed to benzothiazole (Fig. 51).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "antioxidant", "activity", "of", "the", "compound", "(", "121a", ")", "was", "due", "to", "the", "presence", "of", "the", "hydroxyl", "group", "while", "that", "of", "compound", "(", "121b", ")", "was", "attributed", "to", "benzothiazole", "(", "Fig.", "51", ")", "." ] } ]
PMC11422497	RT-qPCR, reverse transcription- quantitative PCR.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "RT-qPCR", ",", "reverse", "transcription-", "quantitative", "PCR", "." ] } ]
PMC11502443	Experimental replicates involved plating cells from a distinct passage, separate transient transfection and separate signaling assays which constituted an experimental n. Group sizes varied between n = 3 and n = 5.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Experimental", "replicates", "involved", "plating", "cells", "from", "a", "distinct", "passage", ",", "separate", "transient", "transfection", "and", "separate", "signaling", "assays", "which", "constituted", "an", "experimental", "n.", "Group", "sizes", "varied", "between", "n", "=", "3", "and", "n", "=", "5", "." ] } ]
PMC5600151	However, only the targeted vehicle successfully downregulated BCL-2 expression by around 80% .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "only", "the", "targeted", "vehicle", "successfully", "downregulated", "BCL-2", "expression", "by", "around", "80", "%", "." ] } ]
PMC11657744	These findings are consistent with previous research demonstrating that disruption of Cep83, Sclt1, and Cep164 significantly impairs ciliogenesis, reinforcing their critical roles in the assembly of primary cilia .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "findings", "are", "consistent", "with", "previous", "research", "demonstrating", "that", "disruption", "of", "Cep83", ",", "Sclt1", ",", "and", "Cep164", "significantly", "impairs", "ciliogenesis", ",", "reinforcing", "their", "critical", "roles", "in", "the", "assembly", "of", "primary", "cilia", "." ] } ]

PMC11499381

Each data point represents an independent experiment with lines indicating mean ± s.e.m.

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PMC11449273

We found that while p53-WT did not affect the expression of PUMA, BAX and S100A4, plakoglobin significantly increased PUMA and BAX but not S100A4 expression in H1299 cells (S4A–S4C Fig).

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PMC11792090

The expression of CD69 on host T cells and the apoptosis of CAR-T cells were subsequently examined.

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PMC11742431

In vivo assessment of tumor inhibition by KVN and K14N proteins. (

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PMC10988555

For complexes 3 and 4, containing the phenanthroline-derived ligands, no significant alterations were observed in the intensity of the UV bands upon coordination of the N,N-heteroaromatic ligand.

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PMC11306331

To discriminate between these hypotheses, we performed kinetic measurements in cells which were globally illuminated at standard intensity (~200 mW/cm), at low intensity (~30 mW/cm), or at low intensity and under partial-cell illumination (Fig. S3E, F).

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PMC11748335

No significant motifs were found in the NE2 vs KYSE510 group.

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PMC11344246

Organoid segmentation, based on brightfield images, was performed using CellProfiler software (Broad Institute of MIT and Harvard, version 4.1.3) (39).

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A low fluorescence quantum yield indicates the possibility of singlet oxygen generation and intra system transition in these molecules.

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It was observed that both AD-CM and CAA-CM mildly suppressed the anti-proliferative effect and reduced nuclear alteration/apoptosis associated with high-concentration S1P treatment.

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A The expression value was calculated by the TNMplot web tool (www.tnmplot.com, 18 July 2022) using TCGA RNA-seq datasets with available data for tumor and adjacent normal tissues.

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Phosphorylation of AMPK (Thr172) was detected in a dose-dependent manner, with activity detected with as low as 0.6% MH.

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Imune paresis was seen in eighty four percent of patients at diagnosis.

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Transfer 100 μL of staining master mix solution from 8a to each well.d.

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No deaths were reported at day+30.

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ELANE is a gene coding for human neutrophil elastase, a protease expressed early in neutrophil development, and has also been identified as an oncogene in various tumors associated with both cyclic and autosomal dominant neutropenia .

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PMC9429973

Summary/Conclusion: EXENT provides superior performance for the identification of M-proteins throughout monitoring.

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HDACs are divided into four classes based on their structure similarities and catalytic mechanisms: Class I (HDAC1, 2, 3, 8), Class IIa (HDAC4, 5, 7, 9), Class IIb (HDAC6, 10), Class III (SIRT1-7) and Class IV (HDAC11).

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Incorporating sAML-type mutations can further refine the 2017 ELN risk stratification.

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H NMR (400 MHz, CDCl3) δ 7.74 (s, 1H), 7.47 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 7.04 (dd, J = 8.6, 2.2 Hz, 1H), 6.79 (d, J = 8.6 Hz, 1H), 6.53 (s, 2H), 4.04 (q, J = 7.0 Hz, 2H), 3.82 (s, 3H), 3.69 (s, 6H), 1.41 (t, J = 7.0 Hz, 3H).

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PMC11283030

b. WB analysis to validate the efficiency of ACLY silencing in 786-O and A498 cells.

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Bio-rad® reagents used for ABO, RH, K. Results: the number of blood donations is stable according to the quarter, p=0.25 (NS).

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The expression patterns of these genes in BCa samples with high or low RNF19A expression are displayed in Supplementary Fig. 1A.

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PMC10547921

Chemical structures of amatoxins 88, 89; (B) Binding mode of α-Amanitin (88) in complex with RNA (PDB code 3CQZ).

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We investigated factors involved in AZD8055-mediated inhibition of protein synthesis and found phosphorylation of ERK1/2 and p38 to play a positive role in translation.

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Pellets were resuspended and fixed in 70% Ethanol/PBS at -20°C overnight.

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a, b DHL and THL cell lines were treated with BET bromodomain inhibitors I-BET, JQ1, and OTX, and RT-PCR was performed using MYC- and BCL-6-specific primers.

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The cell viability was measured after 1 µM Erastin treatment were assessed by CCK8 assay in parental PDAC cells and MRTX1133-resistant PDAC cells. (

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DHRS4-AS1 silencing models in 143B cells, *Represent comparison with the BC group. (

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Sorafenib was used in 62% of cases, followed by Quizartinib (24%).

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Gradient elution was linear from 10 to 100% B at a flow rate of 1.2 mL/min in 35 min.

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n = 6 individual mice.

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Across 26 studies, 33 CNNM4 variants have been reported as associated with JS.

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Our fluorescence imaging revealed that peroxisomes did not or only barely overlap with centriolar satellites (Figure 2a).

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PMC10968586

Treatment of Caco2 and HT-29 cell lines with 100 μM HT for 8 h led to G1 phase cell cycle arrest, whereas extending the treatment for 48 h caused activation of caspase-3.

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Mitapivat is the only approved pharmacotherapy in PK deficiency, and may have the potential to improve iron metabolism and reduce FeO in pts with this condition.

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For C1ORF150, its HGAL-homologous subdomains are considered, together with studies that demonstrate C1OR150’s FcϵRI- and KIT-mediated expression and phosphorylation in primary human mast cells.

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Together, these results suggest in the presence of SCUBE1, SHH gradients formed by diffusion.

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The difference was considered statistically significant when the p value was less than 0.05.

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At the EM level (Fig 6F and 6G), pEP84R and pp220 dual labeling showed their co-localization at the nuclear envelope, ER and Golgi membranes.

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All results of the treatments with curcumin, andrographolide, and association referred to the steatogenic.

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0.1 amplitude with 5% error Results: 265 patients, 126 (47.5%) male and 139 (52.5%) female, with a median age of 62 years (34-90).

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Figure S2).

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PMC11694066

Unless otherwise stated, all graphs show mean values with error bars (SD); 95% confidence intervals were used and considered significance at *, P < 0.05; **, P < 0.01; ***, P < 0.001; ****, P < 0.0001; ns, not significant.

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PMC6160470

After incubation for 30 minutes, slides were washed and incubated with phalloidin-Alexa fluor 594 (1:40, Invitrogen) for 30 minutes at RT.

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PMC11590870

The dried leaves were milled in a KRUPS Gx41011 coffee grinder (CDMX, Mexico).

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PMC11078693

After the glass lid is placed on top of the over-field chamber, there will be no air gap under the lid, and no meniscus to refract trans-illumination light.

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PMC11098378

Here, we further explore the restricted infections of arboviruses in lepidopterans by infecting moth cells with the rhabdovirus, VSV, and the togaviruses: SINV, RRV, and ONNV.

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PMC11786767

The data represent mean ± SEM, and individual data points are also shown.

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PMC11635087

Cells that contained chloroplasts were captured within the field of view, and the area of interest (AOI) was set using Imaging WinGigE software (WALZ).

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PMC11718031

The batch cultures were harvested when viability reached < 80%.

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PMC8358006

To understand how the GSDs activated genes defined above are controlled, we focused on TFs because of their broad role in initiating programs key to cell fate and identity in cancer.

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PMC11541409

Providing evidence that development of new drug targeting non-authentic targets is possible to overcome drug resistance in advanced GIST patients.

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PMC11476106

Our findings highlight the heterogeneity of cell line responses to their microenvironment, underscoring the enormous potential of these hydrogels as mechanodrug-testing platforms and for studying cell protein secretion as an initial step in liquid biopsy biomarker research.

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PMC11661024

It was recently shown that iKB(α) is also located at the outer mitochondrial membrane (OMM), leading to apoptosis inhibition.

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PMC6617630

Overall, our finding suggests that MYC-expressing lymphoma cells are most probably addicted to the MYC-oncogenic effect and rely on MYC for their growth regardless of MYC rearrangements.

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PMC10253973

It includes an example of QM calculations, which, as pointed out at the beginning, are much more demanding but, at the same time, much more reliable; however, such attempts are becoming more common nowadays due to the increasing power and accessibility of high-performance computers.

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PMC7039683

Embryos were only excluded from further analysis if they did not carry the reporter transgene.

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PMC5854676

An empirical model was applied to assess the validity of the experimental results, where the modelling results were in good agreement with the experimental results.

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PMC6892818

Yet, apart from hematopoietic cells, such as B cells and antigen-presenting cells, CD40 is also expressed by epithelial cells of various origins, including bladder, liver and ovarian carcinoma cells, normal epithelial cells as well as endothelial cells.

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PMC11216402

UMAP of scRNA-seq of gastric tumor and adjacent normal stomach tissue from Kim et al. (2022).

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PMC11389534

Additionally, in chondrocytes, UFL1 suppresses the activation of NF‐κB signalling pathway induced by IL‐1β.

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Based on our observations, the inhibition of certain NRs by Mecp2 depletion during quiescence exit is probably general and not hepatocyte-specific because we also validated the repression of several NRs in cellular models of quiescence exit.

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Larvae group (Table 3).

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The slight increase in Alix in RAB27A KO SkMel28 sEVs did not reach statistical significance (Figure 5B).

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PMC11281366

Reads were trimmed with Cutadapt v2.5, aligned to the reference genome GRCh38 using STAR version 2.5.1b extracted using FeatureCounts v1.6.0, and specifically, miRNAs were quantified using mirdeep2 v2.0.1.1.

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PMC9429973

Broviac and PICC were removed for infections in 5% (n=4) and in 3% (n=1) of patients, respectively.

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PMC11095939

All the animal studies were performed in accordance with the ethical guidelines of South Medical University ethics committee and were approved by the Ethics Committee on Use and Care of Animals of Southern Medical University (SMUL2017193).

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PMC11696576

Cells were preincubated with inhibitors for 2 h before incubating with 30 µM Ca ionophore A23187 for 15 min to activate cPLA2α.

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PMC9429973

Summary/Conclusion: This first study has examined the utility of new red cell parameters in patients with IRIDA.

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PMC11400680

There are a total of 54,016 instances (including cells and nuclei) in the dataset, which have been randomly divided into three sets: training, validation, and testing, as described in Table 1.

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Briefly, mononuclear cells were isolated by Ficoll and seeded on collagen-coated plates.

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The dried and desalted peptides were dissolved in distilled water containing 2% acetonitrile and 0.1% TFA.

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PMC11661040

In this study, we have identified the oncogenic role of CGREF1 in osteosarcoma and investigated its involvement and potential molecular mechanisms in the malignant biological behaviors of osteosarcoma cells through both in vivo and in vitro experiments.

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PMC11258145

Chloroform were used as a high purity solvent to obtain lipids’ solutions, but only for DPPS dissolution; 9:1 v/v chloroform:methanol (POCH (Avantor Poland) were used.

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PMC9031474

Compound 18 was the most active compound against most of the cancer cell lines.

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PMC11509224

Diterpenoids represent a class of structurally diverse terpenes with various biological activities.

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PMC10734950

As previously mentioned, the experimental and control treatments were evaluated in three independent measurements and normalized.

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PS was only located in regions of epichromatin.

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PMC11285179

The characteristics of pericytes were identified by immunofluorescence staining α-SMA, PDGFRβ, and NG2 (Fig. 2C).

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PMC11759751

We found that low concentrations of chidamide did not enhance the ability of CD19 CAR T cells to kill B-NHL cells during and after preparation.

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PMC11786156

Holm correction was manually performed based on the results of the t-tests, where corrected P = P × (number of pairs tested + 1 – rank of P-value tested).

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PMC11388384

Surplus forelimbs and hindlimbs from E13.0 embryos were dissected and embedded in 4% low-melt agarose, then sectioned on ice using a Leica VT1200S vibratome with a step size of 100 µm.

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PMC11637276

Cells were washed 3 times with PBS and once with ionised water.

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PMC11754094

Both small indels and large-deletion events occurred at lower frequencies at targets with TC motifs with ABE-UGI, consistent with the UGI inhibiting the production of DSBs produced through a mechanism similar to that observed for the CBEs (Fig. 4b,d).

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PMC11575040

Melanoma cells may undergo a metabolic shift to avoid BRAF-induced senescence by limiting their reliance on OXPHOS and by promoting proliferation.

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PMC11754094

Moreover, we found that treatment with ART558 decreased the large-deletion events (Fig. 4f), suggesting that TMEJ remains the major pathway for BE-mediated large deletions.

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PMC10877303

Middle East Respiratory Syndrome Coronavirus (MERS-CoV) is an unprecedented virus that caused Middle East respiratory syndrome (MERS), a highly deadly respiratory disease reported in June 2012 in the Arabian Peninsula and subsequently expanded globally .

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PMC8567602

A, Schematic of BAF-family complex subtypes and their varied componentry in synovial sarcoma. (

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PMC9429973

Results: A total of 69 MM patients were included in the study with a mean age at diagnosis of 64.9 ± 11.0 years.

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PMC11565047

Excellent RNA integrity was confirmed using a TapeStation 2200 (Agilent), where all samples had an equivalent RNA integrity number (RINe) > 8.

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PMC11704135

The findings indicated that compound 12 exhibited a minimal level of antitumor activity, as evidenced by its IC50 value of 420.75 µg/ml, suggesting relatively lower efficacy in inhibiting tumor growth.

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PMC11803918

Photodynamic therapy (PDT) is a minimally invasive therapeutic strategy and is suitable for melanoma treatment with spatiotemporal control.

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PMC9429973

Finally, PTCy may suppress graft-versus-leukemia effects in the setting of matched donor cells, potentially increasing the risk of relapse.

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PMC11699465

To confirm its nuclear localization, we designed different protocols in live or fixed cells.

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PMC11155445

The antioxidant activity of the compound (121a) was due to the presence of the hydroxyl group while that of compound (121b) was attributed to benzothiazole (Fig. 51).

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PMC11422497

RT-qPCR, reverse transcription- quantitative PCR.

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PMC11502443

Experimental replicates involved plating cells from a distinct passage, separate transient transfection and separate signaling assays which constituted an experimental n. Group sizes varied between n = 3 and n = 5.

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PMC5600151

However, only the targeted vehicle successfully downregulated BCL-2 expression by around 80% .

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PMC11657744

These findings are consistent with previous research demonstrating that disruption of Cep83, Sclt1, and Cep164 significantly impairs ciliogenesis, reinforcing their critical roles in the assembly of primary cilia .

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