Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC6163708
Total lysates containing 30 μg of protein were separated on SDS-PAGE gels and subsequently transferred onto a PVDF membrane (Millipore, Billerica, MA, USA).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Total", "lysates", "containing", "30", "μg", "of", "protein", "were", "separated", "on", "SDS-PAGE", "gels", "and", "subsequently", "transferred", "onto", "a", "PVDF", "membrane", "(", "Millipore", ",", "Billerica", ",", "MA", ",", "USA", ")", "." ] } ]
PMC9429973
J. Hillengass, A. D. Cohen, M. Delforge, H. Einsele, H. Goldschmidt, K. Weisel, M.-S. Raab, C. Scheid, J. M. Schecter, K. C. De Braganca, H. Varsos, T.-M. Yeh, P. Mistry, T. Roccia, C. Corsale, M. Akram, L. Pacaud, T. Nesheiwat, M. Agha, Y. C. Cohen Roswell Park Comprehensive Cancer Center, Buffalo, NY; Abramson Cancer Center, University of Pennsylvania, Philadelphia, PA, United States of America; University Hospitals (UZ) Leuven, Leuven, Belgium; Universitätsklinikum Würzburg, Medizinische Klinik und Poliklinik II, Würzburg; University Hospital Heidelberg, Internal Medicine V and National Center for Tumor Diseases (NCT), Heidelberg; University Medical Center Hamburg-Eppendorf, Hamburg; University Hospital Heidelberg, and Clinical Cooperation Unit Molecular Hematology/Oncology, German Cancer Research Center, Heidelberg; University of Cologne, Cologne, Germany; Janssen R&D, Raritan, NJ, United States of America; Janssen R&D, High Wycombe, United Kingdom; Legend Biotech USA, Piscataway, NJ; UPMC Hillman Cancer Center, Pittsburgh, PA, United States of America; Tel-Aviv Sourasky (Ichilov) Medical Center and Sackler School of Medicine, Tel Aviv University, Tel Aviv, Israel Background: Cohort A of the multicohort phase 2 CARTITUDE-2 (NCT04133636) study is assessing ciltacabtagene autoleucel (cilta-cel), a B-cell maturation antigen (BCMA)-directed chimeric antigen receptor T-cell (CAR-T) therapy, in patients with multiple myeloma (MM) who received 1-3 prior lines of therapy (LOT) and were refractory to lenalidomide (len).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "J.", "Hillengass", ",", "A.", "D.", "Cohen", ",", "M.", "Delforge", ",", "H.", "Einsele", ",", "H.", "Goldschmidt", ",", "K.", "Weisel", ",", "M.-S.", "Raab", ",", "C.", "Scheid", ",", "J.", "M.", "Schecter", ",", "K.", "C.", "De", "Braganca", ",", "H.", "Varsos", ",", "T.-M.", "Yeh", ",", "P.", "Mistry", ",", "T.", "Roccia", ",", "C.", "Corsale", ",", "M.", "Akram", ",", "L.", "Pacaud", ",", "T.", "Nesheiwat", ",", "M.", "Agha", ",", "Y.", "C.", "Cohen", "Roswell", "Park", "Comprehensive", "Cancer", "Center", ",", "Buffalo", ",", "NY", ";", "Abramson", "Cancer", "Center", ",", "University", "of", "Pennsylvania", ",", "Philadelphia", ",", "PA", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "University", "Hospitals", "(", "UZ", ")", "Leuven", ",", "Leuven", ",", "Belgium", ";", "Universitätsklinikum", "Würzburg", ",", "Medizinische", "Klinik", "und", "Poliklinik", "II", ",", "Würzburg", ";", "University", "Hospital", "Heidelberg", ",", "Internal", "Medicine", "V", "and", "National", "Center", "for", "Tumor", "Diseases", "(", "NCT", ")", ",", "Heidelberg", ";", "University", "Medical", "Center", "Hamburg-Eppendorf", ",", "Hamburg", ";", "University", "Hospital", "Heidelberg", ",", "and", "Clinical", "Cooperation", "Unit", "Molecular", "Hematology/Oncology", ",", "German", "Cancer", "Research", "Center", ",", "Heidelberg", ";", "University", "of", "Cologne", ",", "Cologne", ",", "Germany", ";", "Janssen", "R&D", ",", "Raritan", ",", "NJ", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "Janssen", "R&D", ",", "High", "Wycombe", ",", "United", "Kingdom", ";", "Legend", "Biotech", "USA", ",", "Piscataway", ",", "NJ", ";", "UPMC", "Hillman", "Cancer", "Center", ",", "Pittsburgh", ",", "PA", ",", "United", "States", "of", "America", ";", "Tel-Aviv", "Sourasky", "(", "Ichilov", ")", "Medical", "Center", "and", "Sackler", "School", "of", "Medicine", ",", "Tel", "Aviv", "University", ",", "Tel", "Aviv", ",", "Israel", "Background", ":", "Cohort", "A", "of", "the", "multicohort", "phase", "2", "CARTITUDE-2", "(", "NCT04133636", ")", "study", "is", "assessing", "ciltacabtagene", "autoleucel", "(", "cilta-cel", ")", ",", "a", "B-cell", "maturation", "antigen", "(BCMA)-directed", "chimeric", "antigen", "receptor", "T-cell", "(", "CAR-T", ")", "therapy", ",", "in", "patients", "with", "multiple", "myeloma", "(", "MM", ")", "who", "received", "1", "-", "3", "prior", "lines", "of", "therapy", "(", "LOT", ")", "and", "were", "refractory", "to", "lenalidomide", "(", "len", ")", "." ] } ]
PMC11095939
n = 6 mice/group; ****p<0.0001 by one-way ANOVA. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "n", "=", "6", "mice/group", ";", "*", "*", "*", "*", "p<0.0001", "by", "one-way", "ANOVA", ".", "(" ] } ]
PMC9429973
Aims: To describe the clinical and genomic profile of MPN presenting with SVT and to compare it with a matched group of MPN without SVT.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Aims", ":", "To", "describe", "the", "clinical", "and", "genomic", "profile", "of", "MPN", "presenting", "with", "SVT", "and", "to", "compare", "it", "with", "a", "matched", "group", "of", "MPN", "without", "SVT", "." ] } ]
PMC11281366
Equal amounts of viruses (as determined via ELISA for HIV-1 p24 (XpressBio, Frederick, MD, USA, Cat#XB-1000) for CEM or HIV-1 genomic equivalents for primary T lymphocytes) were then incubated with 1 mg/mL of RNase A (Invitrogen, #12091021), the bNAb PGT121 (10 μg/mL, obtained from the NIH HIV Reagent Program) or the purified Abs from patient sera (final dilution 1:5) and with either normal human serum (NHS) or heat-inactivated human serum (HIHS, dilution 1:2) in RPMI-1640 for a total volume of 140 µL. The mixture was then incubated for 3 h at 37 °C prior to freezing at −20 °C.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Equal", "amounts", "of", "viruses", "(", "as", "determined", "via", "ELISA", "for", "HIV-1", "p24", "(", "XpressBio", ",", "Frederick", ",", "MD", ",", "USA", ",", "Cat#XB-1000", ")", "for", "CEM", "or", "HIV-1", "genomic", "equivalents", "for", "primary", "T", "lymphocytes", ")", "were", "then", "incubated", "with", "1", "mg/mL", "of", "RNase", "A", "(", "Invitrogen", ",", "#", "12091021", ")", ",", "the", "bNAb", "PGT121", "(", "10", "μg/mL", ",", "obtained", "from", "the", "NIH", "HIV", "Reagent", "Program", ")", "or", "the", "purified", "Abs", "from", "patient", "sera", "(", "final", "dilution", "1:5", ")", "and", "with", "either", "normal", "human", "serum", "(", "NHS", ")", "or", "heat-inactivated", "human", "serum", "(", "HIHS", ",", "dilution", "1:2", ")", "in", "RPMI-1640", "for", "a", "total", "volume", "of", "140", "µL.", "The", "mixture", "was", "then", "incubated", "for", "3", "h", "at", "37", "°", "C", "prior", "to", "freezing", "at", "−20", "°", "C", "." ] } ]
PMC9952933
The fluorescence at 495/535 nm was recorded with a TECAN m200 multiplate reader (TECAN, Männedorf, Switzerland).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "fluorescence", "at", "495/535", "nm", "was", "recorded", "with", "a", "TECAN", "m200", "multiplate", "reader", "(", "TECAN", ",", "Männedorf", ",", "Switzerland", ")", "." ] } ]
PMC10079526
Our results demonstrate the potential of tailored combination of drugs, based on insight in molecular mechanisms, to improve the efficacy of cancer therapies.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "results", "demonstrate", "the", "potential", "of", "tailored", "combination", "of", "drugs", ",", "based", "on", "insight", "in", "molecular", "mechanisms", ",", "to", "improve", "the", "efficacy", "of", "cancer", "therapies", "." ] } ]
PMC9429973
Among TCE patients who had 4 prior LOTs, 43% of them received a subsequent LOT with a median OS estimate of 8.2 months.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Among", "TCE", "patients", "who", "had", "4", "prior", "LOTs", ",", "43", "%", "of", "them", "received", "a", "subsequent", "LOT", "with", "a", "median", "OS", "estimate", "of", "8.2", "months", "." ] } ]
PMC2944824
The lower levels of p53 protein were sufficient to affect p53 mediated transcription.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "lower", "levels", "of", "p53", "protein", "were", "sufficient", "to", "affect", "p53", "mediated", "transcription", "." ] } ]
PMC11470999
We found that PF significantly enhances the binding affinity between CIP2A and VHL, forming a PF‒CIP2A‒VHL ternary complex.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "found", "that", "PF", "significantly", "enhances", "the", "binding", "affinity", "between", "CIP2A", "and", "VHL", ",", "forming", "a", "PF‒CIP2A‒VHL", "ternary", "complex", "." ] } ]
PMC11748335
D The left stacked bar chart shows the genomic distribution across 109 samples.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D", "The", "left", "stacked", "bar", "chart", "shows", "the", "genomic", "distribution", "across", "109", "samples", "." ] } ]
PMC6114978
Immediately after transfer, membranes were stained with 10 mLs of Ponceau S (0.1% (w/v) in 5% acetic acid) (Sigma-Aldrich, catalog# P7170) .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Immediately", "after", "transfer", ",", "membranes", "were", "stained", "with", "10", "mLs", "of", "Ponceau", "S", "(", "0.1", "%", "(", "w/v", ")", "in", "5", "%", "acetic", "acid", ")", "(", "Sigma-Aldrich", ",", "catalog", "#", "P7170", ")", "." ] } ]
PMC8996378
Most of the diterpenoids with good activity against MDR, such as jatrophanes, ingenanes and lathyranes, were isolated from Euphorbia species.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Most", "of", "the", "diterpenoids", "with", "good", "activity", "against", "MDR", ",", "such", "as", "jatrophanes", ",", "ingenanes", "and", "lathyranes", ",", "were", "isolated", "from", "Euphorbia", "species", "." ] } ]
PMC10421378
Most notable was the reduction in the number of active cells and the increase in both dead and mid-active subpopulations (Figure 10).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Most", "notable", "was", "the", "reduction", "in", "the", "number", "of", "active", "cells", "and", "the", "increase", "in", "both", "dead", "and", "mid-active", "subpopulations", "(", "Figure", "10", ")", "." ] } ]
PMC11261875
However, the clinical utility of PET/CT in GIST remains unclear, and there is lack of direct evidence to show the extent of the effect of imatinib treatment on FDG uptake via downregulation of GLUT contributing to the risk of malignancy and recurrence of GIST.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "the", "clinical", "utility", "of", "PET/CT", "in", "GIST", "remains", "unclear", ",", "and", "there", "is", "lack", "of", "direct", "evidence", "to", "show", "the", "extent", "of", "the", "effect", "of", "imatinib", "treatment", "on", "FDG", "uptake", "via", "downregulation", "of", "GLUT", "contributing", "to", "the", "risk", "of", "malignancy", "and", "recurrence", "of", "GIST", "." ] } ]
PMC11803149
Crispr-mediated ablation of Epas1 promotes terminal exhaustion of young CD8 T cells in tumors, diminishing their anti-tumor activity in young mice.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Crispr-mediated", "ablation", "of", "Epas1", "promotes", "terminal", "exhaustion", "of", "young", "CD8", "T", "cells", "in", "tumors", ",", "diminishing", "their", "anti-tumor", "activity", "in", "young", "mice", "." ] } ]
PMC9429973
Several treatment options are available, including platinum-based chemotherapies such as oxaliplatin plus rituximab and gemcitabine (R-GemOx).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Several", "treatment", "options", "are", "available", ",", "including", "platinum-based", "chemotherapies", "such", "as", "oxaliplatin", "plus", "rituximab", "and", "gemcitabine", "(", "R-GemOx", ")", "." ] } ]
PMC11758416
We recommend passaging the L cells before or when they become ∼80% confluent.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "recommend", "passaging", "the", "L", "cells", "before", "or", "when", "they", "become", "∼80", "%", "confluent", "." ] } ]
PMC11502066
Today, it is increasingly clear that many G protein-coupled receptors (GPCRs) are also involved in controlling the hallmarks of cancer by activating diverse intracellular signaling networks.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Today", ",", "it", "is", "increasingly", "clear", "that", "many", "G", "protein-coupled", "receptors", "(", "GPCRs", ")", "are", "also", "involved", "in", "controlling", "the", "hallmarks", "of", "cancer", "by", "activating", "diverse", "intracellular", "signaling", "networks", "." ] } ]
PMC11082662
High SMPDL3B expression was linked not only to increased proliferation of ovarian cancer cells, but also enhanced migration and invasion.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "High", "SMPDL3B", "expression", "was", "linked", "not", "only", "to", "increased", "proliferation", "of", "ovarian", "cancer", "cells", ",", "but", "also", "enhanced", "migration", "and", "invasion", "." ] } ]
PMC9429973
The PK and ADME profile was consistent with the ones observed in pts with solid malignancies.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "PK", "and", "ADME", "profile", "was", "consistent", "with", "the", "ones", "observed", "in", "pts", "with", "solid", "malignancies", "." ] } ]
PMC11320834
Differences were assessed for statistical significance using repeated-measures ANOVA.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Differences", "were", "assessed", "for", "statistical", "significance", "using", "repeated-measures", "ANOVA", "." ] } ]
PMC6160470
Multidrug resistance (MDR) is a widespread phenomenon exhibited by many cancers and represents a fundamental obstacle for successful cancer treatments.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Multidrug", "resistance", "(", "MDR", ")", "is", "a", "widespread", "phenomenon", "exhibited", "by", "many", "cancers", "and", "represents", "a", "fundamental", "obstacle", "for", "successful", "cancer", "treatments", "." ] } ]
PMC11323699
Two-tailed Pearson and Spearman tests were used to assess the correlation between two linear or monotonic variables, respectively, and Mann–Whitney test was used where appropriate.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Two-tailed", "Pearson", "and", "Spearman", "tests", "were", "used", "to", "assess", "the", "correlation", "between", "two", "linear", "or", "monotonic", "variables", ",", "respectively", ",", "and", "Mann", "–", "Whitney", "test", "was", "used", "where", "appropriate", "." ] } ]
PMC10940855
Recipient C57BL/6 mice were injected via tail vein with 1–2 × 10 cells.
[ { "tags": [ "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Recipient", "C57BL/6", "mice", "were", "injected", "via", "tail", "vein", "with", "1–2", "×", "10", "cells", "." ] } ]
PMC11409031
Among the 10 markers, PFN1 was significantly up-regulated in OV cell lines, while the other markers were not as significant.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Among", "the", "10", "markers", ",", "PFN1", "was", "significantly", "up-regulated", "in", "OV", "cell", "lines", ",", "while", "the", "other", "markers", "were", "not", "as", "significant", "." ] } ]
PMC9429973
On average, patients experienced 7.0 symptoms (range: 0─22) in the week prior to survey completion.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "average", ",", "patients", "experienced", "7.0", "symptoms", "(", "range", ":", "0", "─", "22", ")", "in", "the", "week", "prior", "to", "survey", "completion", "." ] } ]
PMC9429973
The median PFS for the total cohort when censored at alloSCT was 4.0 mo; PFS uncensored for alloSCT was 4.4 mo (Figure 1A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "median", "PFS", "for", "the", "total", "cohort", "when", "censored", "at", "alloSCT", "was", "4.0", "mo", ";", "PFS", "uncensored", "for", "alloSCT", "was", "4.4", "mo", "(", "Figure", "1A", ")", "." ] } ]
PMC8701144
The E1B-55k aggregates varied in size with diameters ranging from 1 to 4 μm (not shown), and the width of the E1B-55k protein layer surrounding TNKS was measured to be around 220 nm (Supplementary Figure S2).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "E1B-55k", "aggregates", "varied", "in", "size", "with", "diameters", "ranging", "from", "1", "to", "4", "μm", "(", "not", "shown", ")", ",", "and", "the", "width", "of", "the", "E1B-55k", "protein", "layer", "surrounding", "TNKS", "was", "measured", "to", "be", "around", "220", "nm", "(", "Supplementary", "Figure", "S2", ")", "." ] } ]
PMC11569208
All viruses were propagated on Vero cells and purified on 5–50% OptiPrep (Sigma-Aldrich, St. Louis, MO) gradients.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "viruses", "were", "propagated", "on", "Vero", "cells", "and", "purified", "on", "5–50", "%", "OptiPrep", "(", "Sigma-Aldrich", ",", "St.", "Louis", ",", "MO", ")", "gradients", "." ] } ]
PMC11774112
In this system, poly (L-arginine) and PLA function as hydrophilic and hydrophobic blocks, respectively, which self-assemble into micelles in aqueous solution.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "system", ",", "poly", "(", "L-arginine", ")", "and", "PLA", "function", "as", "hydrophilic", "and", "hydrophobic", "blocks", ",", "respectively", ",", "which", "self-assemble", "into", "micelles", "in", "aqueous", "solution", "." ] } ]
PMC9960565
After 5 h, the cisplatin suspension disappeared, obtaining, in the end, a transparent yellow solution.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "5", "h", ",", "the", "cisplatin", "suspension", "disappeared", ",", "obtaining", ",", "in", "the", "end", ",", "a", "transparent", "yellow", "solution", "." ] } ]
PMC11766309
Furthermore, we detected the expression of YKT6 in diverse cancer cell lines from the Cancer Cell Line Encyclopedia (CCLE) database (Figure 2D).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "I-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "we", "detected", "the", "expression", "of", "YKT6", "in", "diverse", "cancer", "cell", "lines", "from", "the", "Cancer", "Cell", "Line", "Encyclopedia", "(", "CCLE", ")", "database", "(", "Figure", "2D", ")", "." ] } ]
PMC11454387
M. Weingartner: None.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "M.", "Weingartner", ":", "None", "." ] } ]
PMC6024716
This connection was investigated , and preliminary information showed that transient inhibition of OAZ1 in HEK293 cells expressing luciferase by siRNA was associated with increased luciferase expression and a higher intracellular concentration of putrescine.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "connection", "was", "investigated", ",", "and", "preliminary", "information", "showed", "that", "transient", "inhibition", "of", "OAZ1", "in", "HEK293", "cells", "expressing", "luciferase", "by", "siRNA", "was", "associated", "with", "increased", "luciferase", "expression", "and", "a", "higher", "intracellular", "concentration", "of", "putrescine", "." ] } ]
PMC10170482
It is worth noting that accumulation of fragmented mitochondria was linked to decreased mitochondrial membrane potential and energetics.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "It", "is", "worth", "noting", "that", "accumulation", "of", "fragmented", "mitochondria", "was", "linked", "to", "decreased", "mitochondrial", "membrane", "potential", "and", "energetics", "." ] } ]
PMC9429973
Safety and AEs were monitored throughout the study.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Safety", "and", "AEs", "were", "monitored", "throughout", "the", "study", "." ] } ]
PMC11359735
Nonetheless, biochemical evidence for the existence of this anchor is absent due to our reliance on harvesting sporozoites from mosquito salivary glands, which limits the amount of parasite material available for analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nonetheless", ",", "biochemical", "evidence", "for", "the", "existence", "of", "this", "anchor", "is", "absent", "due", "to", "our", "reliance", "on", "harvesting", "sporozoites", "from", "mosquito", "salivary", "glands", ",", "which", "limits", "the", "amount", "of", "parasite", "material", "available", "for", "analysis", "." ] } ]
PMC11742231
This integration enables GNNs to make more precise predictions, enhancing the accuracy of the overall analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "integration", "enables", "GNNs", "to", "make", "more", "precise", "predictions", ",", "enhancing", "the", "accuracy", "of", "the", "overall", "analysis", "." ] } ]
PMC9429973
On univariate analysis, we identified as risk factors in the ICU for death the following factors: neutropenia (HR 1,73, CI 95% 0,98-3,1, p=0.06), sepsis or septic shock at ICU admission (HR 2,15, CI 95% 1,18-3,9, p=0.012), length of pre-ICU hospitalization >13 d (HR 1,43, CI 95% 0,81-2,55, p=0,22), Acute Physiology And Chronic Health Evaluation (APACHE) > 26 (HR 5,68, CI 95% 2,54-12,72, p<0,001), Simplified Acute Physiology Score II (SAPSII) score > 58 (HR 4,01, CI 95% 2,04-7,89, p<0,001), need of IMV (HR 3,60, CI 95% 1,41-9,81, p=0,007), vasopressors (HR 18,39, CI 95% 2,56-133,98, p=0,004) and RRT (HR 2,54, CI 95% 1,42-4,55, p=0,002).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "univariate", "analysis", ",", "we", "identified", "as", "risk", "factors", "in", "the", "ICU", "for", "death", "the", "following", "factors", ":", "neutropenia", "(", "HR", "1,73", ",", "CI", "95", "%", "0,98", "-", "3,1", ",", "p=0.06", ")", ",", "sepsis", "or", "septic", "shock", "at", "ICU", "admission", "(", "HR", "2,15", ",", "CI", "95", "%", "1,18", "-", "3,9", ",", "p=0.012", ")", ",", "length", "of", "pre-ICU", "hospitalization", ">", "13", "d", "(", "HR", "1,43", ",", "CI", "95", "%", "0,81", "-", "2,55", ",", "p=0,22", ")", ",", "Acute", "Physiology", "And", "Chronic", "Health", "Evaluation", "(", "APACHE", ")", ">", "26", "(", "HR", "5,68", ",", "CI", "95", "%", "2,54", "-", "12,72", ",", "p<0,001", ")", ",", "Simplified", "Acute", "Physiology", "Score", "II", "(", "SAPSII", ")", "score", ">", "58", "(", "HR", "4,01", ",", "CI", "95", "%", "2,04", "-", "7,89", ",", "p<0,001", ")", ",", "need", "of", "IMV", "(", "HR", "3,60", ",", "CI", "95", "%", "1,41", "-", "9,81", ",", "p=0,007", ")", ",", "vasopressors", "(", "HR", "18,39", ",", "CI", "95", "%", "2,56", "-", "133,98", ",", "p=0,004", ")", "and", "RRT", "(", "HR", "2,54", ",", "CI", "95", "%", "1,42", "-", "4,55", ",", "p=0,002", ")", "." ] } ]
PMC9118379
Notably, 1.8% (4/227), 2.8% (7/252), and 4.0% (11/272) of the PSMs obtained by Comet, MS-GF+, and X!Tandem, respectively, were not included in the PSMs obtained using the CMSe-gFDR strategy.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Notably", ",", "1.8", "%", "(", "4/227", ")", ",", "2.8", "%", "(", "7/252", ")", ",", "and", "4.0", "%", "(", "11/272", ")", "of", "the", "PSMs", "obtained", "by", "Comet", ",", "MS-GF+", ",", "and", "X!Tandem", ",", "respectively", ",", "were", "not", "included", "in", "the", "PSMs", "obtained", "using", "the", "CMSe-gFDR", "strategy", "." ] } ]
PMC11621493
Cells were washed 3 × 10 min with 200 μl PBS and blocked using 3% BSA in PBS for 1 h. After that, cells were incubated with an anti-6xHis tag antibody (ab18184, Abcam, Cambridge) diluted 1:200 in 3% BSA overnight at 4°C.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "were", "washed", "3", "×", "10", "min", "with", "200", "μl", "PBS", "and", "blocked", "using", "3", "%", "BSA", "in", "PBS", "for", "1", "h.", "After", "that", ",", "cells", "were", "incubated", "with", "an", "anti-6xHis", "tag", "antibody", "(", "ab18184", ",", "Abcam", ",", "Cambridge", ")", "diluted", "1:200", "in", "3", "%", "BSA", "overnight", "at", "4", "°", "C", "." ] } ]
PMC9841531
On the other hand, reference inhibitor 8 had an inferior free binding energy of −6.5 kcal·mol and formed two conventional hydrogen bonds with Arg313.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "the", "other", "hand", ",", "reference", "inhibitor", "8", "had", "an", "inferior", "free", "binding", "energy", "of", "−6.5", "kcal·mol", "and", "formed", "two", "conventional", "hydrogen", "bonds", "with", "Arg313", "." ] } ]
PMC11406030
Briefly, for siRNA transfection, cells were grown to a confluence of 30%–40% in 12-well plates (Becton Dickinson, Franklin Lakes, NJ, USA) and transfected with 3 μL NeoFX reagent (1631, Ambion), 2 μL of 20 μmol siRNA, and OptiMEM medium (31985-047, Invitrogen, Waltham, MA, USA) up to a final volume of 100 μL. Neo FX reagent and siRNA were incubated at room temperature (RT) for 10 min and then applied onto 1.0 × 10 cells per well.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Briefly", ",", "for", "siRNA", "transfection", ",", "cells", "were", "grown", "to", "a", "confluence", "of", "30%–40", "%", "in", "12-well", "plates", "(", "Becton", "Dickinson", ",", "Franklin", "Lakes", ",", "NJ", ",", "USA", ")", "and", "transfected", "with", "3", "μL", "NeoFX", "reagent", "(", "1631", ",", "Ambion", ")", ",", "2", "μL", "of", "20", "μmol", "siRNA", ",", "and", "OptiMEM", "medium", "(", "31985", "-", "047", ",", "Invitrogen", ",", "Waltham", ",", "MA", ",", "USA", ")", "up", "to", "a", "final", "volume", "of", "100", "μL.", "Neo", "FX", "reagent", "and", "siRNA", "were", "incubated", "at", "room", "temperature", "(", "RT", ")", "for", "10", "min", "and", "then", "applied", "onto", "1.0", "×", "10", "cells", "per", "well", "." ] } ]
PMC11739484
cBioPortal was chosen for mutational analysis of MMPs across TCGA SKCM patients due to its comprehensive data integration and visualization capabilities, allowing for a detailed assessment of MMP-related genetic alterations and their potential implications in SKCM pathogenesis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "cBioPortal", "was", "chosen", "for", "mutational", "analysis", "of", "MMPs", "across", "TCGA", "SKCM", "patients", "due", "to", "its", "comprehensive", "data", "integration", "and", "visualization", "capabilities", ",", "allowing", "for", "a", "detailed", "assessment", "of", "MMP-related", "genetic", "alterations", "and", "their", "potential", "implications", "in", "SKCM", "pathogenesis", "." ] } ]
PMC9429973
R.-X. Deng, Y. He, X.-L. Zhu, H.-X. Fu, X.-D. Mo, J.-Z. Wang, K.-Y. Liu, X.-J. Huang, X.-H. Zhang Peking University People’s Hospital, Peking University Institute of Hematology; Collaborative Innovation Center of Hematology, Peking University; Beijing Key Laboratory of Hematopoietic Stem Cell Transplantation; National Clinical Research Center for Hematologic Disease, Beijing, China Background: As a serious complication following allogenic haematopoietic stem cell transplantation (allo-HSCT), venous thromboembolism (VTE) is significantly related to poor survival and increased nonrelapse mortality.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "R.-X.", "Deng", ",", "Y.", "He", ",", "X.-L.", "Zhu", ",", "H.-X.", "Fu", ",", "X.-D.", "Mo", ",", "J.-Z.", "Wang", ",", "K.-Y.", "Liu", ",", "X.-J.", "Huang", ",", "X.-H.", "Zhang", "Peking", "University", "People", "’s", "Hospital", ",", "Peking", "University", "Institute", "of", "Hematology", ";", "Collaborative", "Innovation", "Center", "of", "Hematology", ",", "Peking", "University", ";", "Beijing", "Key", "Laboratory", "of", "Hematopoietic", "Stem", "Cell", "Transplantation", ";", "National", "Clinical", "Research", "Center", "for", "Hematologic", "Disease", ",", "Beijing", ",", "China", "Background", ":", "As", "a", "serious", "complication", "following", "allogenic", "haematopoietic", "stem", "cell", "transplantation", "(", "allo-HSCT", ")", ",", "venous", "thromboembolism", "(", "VTE", ")", "is", "significantly", "related", "to", "poor", "survival", "and", "increased", "nonrelapse", "mortality", "." ] } ]
PMC11707577
Altogether these results demonstrated the theranostic potential of the M13EGFR(TNP) platform, able to detect EGFR‐positive cancer cells and simultaneously induce their controlled ablation.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Altogether", "these", "results", "demonstrated", "the", "theranostic", "potential", "of", "the", "M13EGFR(TNP", ")", "platform", ",", "able", "to", "detect", "EGFR‐positive", "cancer", "cells", "and", "simultaneously", "induce", "their", "controlled", "ablation", "." ] } ]
PMC11314247
We observed that HO-AAVPA induced the downregulation of GPER and arrest in the S phase of the cell cycle in MCF-7 cells alongside a decrease in the G2/M phase in MCF and MDA-MB-231 cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "observed", "that", "HO-AAVPA", "induced", "the", "downregulation", "of", "GPER", "and", "arrest", "in", "the", "S", "phase", "of", "the", "cell", "cycle", "in", "MCF-7", "cells", "alongside", "a", "decrease", "in", "the", "G2/M", "phase", "in", "MCF", "and", "MDA-MB-231", "cells", "." ] } ]
PMC11786704
Additionally, p38 MAPK directly participates in apoptosis by influencing the expression of cell cycle proteins and pro-apoptotic factors [, , ].
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "p38", "MAPK", "directly", "participates", "in", "apoptosis", "by", "influencing", "the", "expression", "of", "cell", "cycle", "proteins", "and", "pro-apoptotic", "factors", "[", ",", ",", "]", "." ] } ]
PMC11694066
P < 0.05; ****, P < 0.0001; ns, not significant.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "P", "<", "0.05", ";", "*", "*", "*", "*", ",", "P", "<", "0.0001", ";", "ns", ",", "not", "significant", "." ] } ]
PMC11461874
In this study, we show that DBP protein levels are down-regulated by the ubiquitin-proteasome pathway.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "study", ",", "we", "show", "that", "DBP", "protein", "levels", "are", "down-regulated", "by", "the", "ubiquitin-proteasome", "pathway", "." ] } ]
PMC11770130
On the other hand, physiological factors other than lipolysis seem responsible for the elevation of body weight in Ntsr2 AKO mice.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "the", "other", "hand", ",", "physiological", "factors", "other", "than", "lipolysis", "seem", "responsible", "for", "the", "elevation", "of", "body", "weight", "in", "Ntsr2", "AKO", "mice", "." ] } ]
PMC11707577
The performances of M13EGFR(TNP) in PDT were tested on the EGFR‐overexpressing A431 cell line.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "performances", "of", "M13EGFR(TNP", ")", "in", "PDT", "were", "tested", "on", "the", "EGFR‐overexpressing", "A431", "cell", "line", "." ] } ]
PMC11244823
The bands were analysed by mass spectrometry for protein identification at the Functional Genomics Center Zurich (FGCZ) of University of Zurich and ETH Zurich.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "bands", "were", "analysed", "by", "mass", "spectrometry", "for", "protein", "identification", "at", "the", "Functional", "Genomics", "Center", "Zurich", "(", "FGCZ", ")", "of", "University", "of", "Zurich", "and", "ETH", "Zurich", "." ] } ]
PMC11706776
A, B, C, and D: Mann–Whitney test.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", ",", "B", ",", "C", ",", "and", "D", ":", "Mann", "–", "Whitney", "test", "." ] } ]
PMC9780037
In non-small lung cell cancer patients, serum cyt c increased at least 13-fold after the first cycle of chemotherapy .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "non-small", "lung", "cell", "cancer", "patients", ",", "serum", "cyt", "c", "increased", "at", "least", "13-fold", "after", "the", "first", "cycle", "of", "chemotherapy", "." ] } ]
PMC11697065
Indeed, FOXO signalling was previously reported to be associated with qP and a recent study described the addition of autophagy-inducing peptides to enhance productivity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Indeed", ",", "FOXO", "signalling", "was", "previously", "reported", "to", "be", "associated", "with", "qP", "and", "a", "recent", "study", "described", "the", "addition", "of", "autophagy-inducing", "peptides", "to", "enhance", "productivity", "." ] } ]
PMC9964635
Scheme 1 depicts the synthetic route of final compounds 7a–f. The Fischer esterification method was used to create compound 2 by refluxing compound 1 with absolute CH3OH at 76 °C for 3–4 h .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Scheme", "1", "depicts", "the", "synthetic", "route", "of", "final", "compounds", "7a", "–", "f.", "The", "Fischer", "esterification", "method", "was", "used", "to", "create", "compound", "2", "by", "refluxing", "compound", "1", "with", "absolute", "CH3OH", "at", "76", "°", "C", "for", "3–4", "h", "." ] } ]
PMC9429973
She achieved hematological complete remission after the first cycle of chemotherapy, maintaining that until an HLA identical sibling bone marrow transplant was performed.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "She", "achieved", "hematological", "complete", "remission", "after", "the", "first", "cycle", "of", "chemotherapy", ",", "maintaining", "that", "until", "an", "HLA", "identical", "sibling", "bone", "marrow", "transplant", "was", "performed", "." ] } ]
PMC10631132
iPSCs were passaged at 70–80% confluency using 5 U/mL Dispase (StemCell Technologies, Vancouver, Canada).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "iPSCs", "were", "passaged", "at", "70–80", "%", "confluency", "using", "5", "U/mL", "Dispase", "(", "StemCell", "Technologies", ",", "Vancouver", ",", "Canada", ")", "." ] } ]
PMC11228511
Because progerin causes repetitive NM ruptures in SMCs (21) and because NM ruptures are more frequent in cells with a nuclear bleb (Fig. 6B), we suspected that we would find NM ruptures within blebs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Because", "progerin", "causes", "repetitive", "NM", "ruptures", "in", "SMCs", "(", "21", ")", "and", "because", "NM", "ruptures", "are", "more", "frequent", "in", "cells", "with", "a", "nuclear", "bleb", "(", "Fig.", "6B", ")", ",", "we", "suspected", "that", "we", "would", "find", "NM", "ruptures", "within", "blebs", "." ] } ]
PMC11643491
Paclitaxel entrapment efficiency and drug loading were estimated by dissolving the particles in acetonitrile.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Paclitaxel", "entrapment", "efficiency", "and", "drug", "loading", "were", "estimated", "by", "dissolving", "the", "particles", "in", "acetonitrile", "." ] } ]
PMC8524093
Chikungunya virus infects and replicates in a plenty of cell types.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Chikungunya", "virus", "infects", "and", "replicates", "in", "a", "plenty", "of", "cell", "types", "." ] } ]
PMC11638288
This review provides a comprehensive understanding of NKp46, offering a theoretical foundation for the research and development of diagnostic and therapeutic approaches for related diseases.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "review", "provides", "a", "comprehensive", "understanding", "of", "NKp46", ",", "offering", "a", "theoretical", "foundation", "for", "the", "research", "and", "development", "of", "diagnostic", "and", "therapeutic", "approaches", "for", "related", "diseases", "." ] } ]
PMC7504302
In this regard, while the epithelioid subtype displays features of epithelial cells, the sarcomatoid and biphasic histological subtypes are usually recognized as mesenchymal and intermediate phenotypes, respectively .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "regard", ",", "while", "the", "epithelioid", "subtype", "displays", "features", "of", "epithelial", "cells", ",", "the", "sarcomatoid", "and", "biphasic", "histological", "subtypes", "are", "usually", "recognized", "as", "mesenchymal", "and", "intermediate", "phenotypes", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC8875242
To investigate the inhibitory effect of antivirals on ABCB1 in the intestine, we used hPCIS prepared from jejunal tissue obtained from five donors.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "investigate", "the", "inhibitory", "effect", "of", "antivirals", "on", "ABCB1", "in", "the", "intestine", ",", "we", "used", "hPCIS", "prepared", "from", "jejunal", "tissue", "obtained", "from", "five", "donors", "." ] } ]
PMC5916734
In particular, the hemophilia among European royal families (Royal family disease) was believed to have been caused by point mutation in the FIX gene, leading to incorrect splicing of its mRNA and the emergence of an inactive, truncated FIX protein .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "particular", ",", "the", "hemophilia", "among", "European", "royal", "families", "(", "Royal", "family", "disease", ")", "was", "believed", "to", "have", "been", "caused", "by", "point", "mutation", "in", "the", "FIX", "gene", ",", "leading", "to", "incorrect", "splicing", "of", "its", "mRNA", "and", "the", "emergence", "of", "an", "inactive", ",", "truncated", "FIX", "protein", "." ] } ]
PMC11721587
Fu/Ulk3 kinase activation requires low Hh concentration and short ligand exposure time, whereas SUMO-SIM–driven condensation, Fu/Ulk3 conformational maturation, and Ci/Gli phosphorylation and activation require higher Hh concentration and longer ligand exposure time.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fu/Ulk3", "kinase", "activation", "requires", "low", "Hh", "concentration", "and", "short", "ligand", "exposure", "time", ",", "whereas", "SUMO-SIM", "–", "driven", "condensation", ",", "Fu/Ulk3", "conformational", "maturation", ",", "and", "Ci/Gli", "phosphorylation", "and", "activation", "require", "higher", "Hh", "concentration", "and", "longer", "ligand", "exposure", "time", "." ] } ]
PMC9268620
Budding and apoptotic cells were noticeable in the cells treated with 10 μg/mL of nordamnacanthal.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Budding", "and", "apoptotic", "cells", "were", "noticeable", "in", "the", "cells", "treated", "with", "10", "μg/mL", "of", "nordamnacanthal", "." ] } ]
PMC11283030
Because ACLY is the critical enzyme regulating the level of cytosolic acetyl-CoA, we postulated that ACLY silencing-induced Akt/mTORC1 inactivation might be dependent on the acetyl-CoA. Acetyl-CoA is decreased in ACLY knockdown cells , and sodium acetate (5 mM) could rescue the reduced cellular acetyl-CoA level in ACLY knockdown cell .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Because", "ACLY", "is", "the", "critical", "enzyme", "regulating", "the", "level", "of", "cytosolic", "acetyl-CoA", ",", "we", "postulated", "that", "ACLY", "silencing-induced", "Akt/mTORC1", "inactivation", "might", "be", "dependent", "on", "the", "acetyl-CoA.", "Acetyl-CoA", "is", "decreased", "in", "ACLY", "knockdown", "cells", ",", "and", "sodium", "acetate", "(", "5", "mM", ")", "could", "rescue", "the", "reduced", "cellular", "acetyl-CoA", "level", "in", "ACLY", "knockdown", "cell", "." ] } ]
PMC11047729
The noted telomerase activity decrease was to 92% with the use of a 0.1 µM concentration and to 0% with a 1 µM concentration .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "noted", "telomerase", "activity", "decrease", "was", "to", "92", "%", "with", "the", "use", "of", "a", "0.1", "µM", "concentration", "and", "to", "0", "%", "with", "a", "1", "µM", "concentration", "." ] } ]
PMC11047729
Sulfoquinovosyldiacylglycerol (SQDG) is a substance found in plants and seaweed.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Sulfoquinovosyldiacylglycerol", "(", "SQDG", ")", "is", "a", "substance", "found", "in", "plants", "and", "seaweed", "." ] } ]
PMC8806312
In contrast, the low-risk group had higher fractions of CD8 T cells (P < 0.001), M2 macrophages (P = 0.007) and neutrophils (P = 0.018) (Figure 7(a)).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "contrast", ",", "the", "low-risk", "group", "had", "higher", "fractions", "of", "CD8", "T", "cells", "(", "P", "<", "0.001", ")", ",", "M2", "macrophages", "(", "P", "=", "0.007", ")", "and", "neutrophils", "(", "P", "=", "0.018", ")", "(", "Figure", "7(a", ")", ")", "." ] } ]
PMC9429973
When stratified by risk factors twenty-two patients (36.1%) were found to be standard risk and 2-year OS was 45.5% with median 28.5 months (4.3-52.7); with a single risk factor the 2-years OS was 30% with median survival of 14 months (8.6-19.4); two or more risk factors the 2- year OS was 5% with median of 5.9 months (4.1-11). (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "When", "stratified", "by", "risk", "factors", "twenty-two", "patients", "(", "36.1", "%", ")", "were", "found", "to", "be", "standard", "risk", "and", "2-year", "OS", "was", "45.5", "%", "with", "median", "28.5", "months", "(", "4.3", "-", "52.7", ")", ";", "with", "a", "single", "risk", "factor", "the", "2-years", "OS", "was", "30", "%", "with", "median", "survival", "of", "14", "months", "(", "8.6", "-", "19.4", ")", ";", "two", "or", "more", "risk", "factors", "the", "2-", "year", "OS", "was", "5", "%", "with", "median", "of", "5.9", "months", "(", "4.1", "-", "11", ")", ".", "(" ] } ]
PMC11672142
The compound was determined to be Na[Fe(C60H50N18O6S2)]·2H2O·2 CH3OH by C,H,N elemental analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "compound", "was", "determined", "to", "be", "Na[Fe(C60H50N18O6S2)]·2H2O·2", "CH3OH", "by", "C", ",", "H", ",", "N", "elemental", "analysis", "." ] } ]
PMC9429973
The efficacy and safety of nemtabrutinib in patients (pts) with CLL/SLL and B-cell non-Hodgkin lymphoma (NHL) were also evaluated at a higher dose during the dose-expansion phase.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "efficacy", "and", "safety", "of", "nemtabrutinib", "in", "patients", "(", "pts", ")", "with", "CLL/SLL", "and", "B-cell", "non-Hodgkin", "lymphoma", "(", "NHL", ")", "were", "also", "evaluated", "at", "a", "higher", "dose", "during", "the", "dose-expansion", "phase", "." ] } ]
PMC6468656
All data are presented as the mean ± S.D. The p values at the following levels were considered to be significant: * p < 0.05, ** p < 0.01, and *** p < 0.001.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "data", "are", "presented", "as", "the", "mean", "±", "S.D.", "The", "p", "values", "at", "the", "following", "levels", "were", "considered", "to", "be", "significant", ":", "*", "p", "<", "0.05", ",", "*", "*", "p", "<", "0.01", ",", "and", "*", "*", "*", "p", "<", "0.001", "." ] } ]
PMC9429973
This data supports the results we have seen with PRMT5 inhibition in pre-clinical models of human MCL and reinforce the MCL disease characteristics of this model.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "data", "supports", "the", "results", "we", "have", "seen", "with", "PRMT5", "inhibition", "in", "pre-clinical", "models", "of", "human", "MCL", "and", "reinforce", "the", "MCL", "disease", "characteristics", "of", "this", "model", "." ] } ]
PMC11237030
Cells treated with cpt-cAMP exhibited a stronger staining for AQP5 on the plasma membrane (Fig. 5b), showing that AQP5 can translocate to the cell membrane after stimulation with cpt-cAMP.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cells", "treated", "with", "cpt-cAMP", "exhibited", "a", "stronger", "staining", "for", "AQP5", "on", "the", "plasma", "membrane", "(", "Fig.", "5b", ")", ",", "showing", "that", "AQP5", "can", "translocate", "to", "the", "cell", "membrane", "after", "stimulation", "with", "cpt-cAMP", "." ] } ]
PMC11759543
∗∗∗ and ###p < 0.001, ∗∗p < 0.01.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "∗∗∗", "and", "#", "#", "#", "p", "<", "0.001", ",", "∗∗p", "<", "0.01", "." ] } ]
PMC10993311
Repeated measures ANOVA/mixed model with Bonferroni’s post hoc test.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Repeated", "measures", "ANOVA/mixed", "model", "with", "Bonferroni", "’s", "post", "hoc", "test", "." ] } ]
PMC11342785
Although these N-terminal fragments showed bundling and binding activity in vitro, their activity was weaker than C-terminal fragments.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Although", "these", "N-terminal", "fragments", "showed", "bundling", "and", "binding", "activity", "in", "vitro", ",", "their", "activity", "was", "weaker", "than", "C-terminal", "fragments", "." ] } ]
PMC11701801
Depleting EP300 decreased the viability of SMARCA4/SMARCA2-deficient DMS114 cells (Fig. 5A; Supplementary Fig. S5A; Lane 3) and SS18–SSX fusion Fuji cells (Fig. 5B; Supplementary Fig. S5B; Lane 3); however, additional depletion of KREMEN1 rescued the viability of SMARCA4/SMARCA2-deficient DMS114 cells (Fig. 5A; Supplementary Fig. S5C; Lane 4) and SS18–SSX fusion Fuji cells (Fig. 5B; Supplementary Fig. S5D; Lane 4), indicating that KREMEN1 mediates the decrease in cell viability induced by depleting EP300.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Depleting", "EP300", "decreased", "the", "viability", "of", "SMARCA4/SMARCA2-deficient", "DMS114", "cells", "(", "Fig.", "5A", ";", "Supplementary", "Fig.", "S5A", ";", "Lane", "3", ")", "and", "SS18–SSX", "fusion", "Fuji", "cells", "(", "Fig.", "5B", ";", "Supplementary", "Fig.", "S5B", ";", "Lane", "3", ")", ";", "however", ",", "additional", "depletion", "of", "KREMEN1", "rescued", "the", "viability", "of", "SMARCA4/SMARCA2-deficient", "DMS114", "cells", "(", "Fig.", "5A", ";", "Supplementary", "Fig.", "S5C", ";", "Lane", "4", ")", "and", "SS18–SSX", "fusion", "Fuji", "cells", "(", "Fig.", "5B", ";", "Supplementary", "Fig.", "S5D", ";", "Lane", "4", ")", ",", "indicating", "that", "KREMEN1", "mediates", "the", "decrease", "in", "cell", "viability", "induced", "by", "depleting", "EP300", "." ] } ]
PMC11680982
Additionally, the cell lines used were identified as HR/HER2-low according to public databases, and these limitations may affect the current findings and conclusions.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "the", "cell", "lines", "used", "were", "identified", "as", "HR/HER2-low", "according", "to", "public", "databases", ",", "and", "these", "limitations", "may", "affect", "the", "current", "findings", "and", "conclusions", "." ] } ]
PMC6684588
Peak twitch force generated by ACE-083-injected or uninjected (contralateral) TA muscles as determined in situ.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Peak", "twitch", "force", "generated", "by", "ACE-083-injected", "or", "uninjected", "(", "contralateral", ")", "TA", "muscles", "as", "determined", "in", "situ", "." ] } ]
PMC11732635
Physical examination findings included severe malnutrition and hepatosplenomegaly.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Physical", "examination", "findings", "included", "severe", "malnutrition", "and", "hepatosplenomegaly", "." ] } ]
PMC11687167
In this review, we summarized the biological processes involved, the relationships of different subtypes of T cells with PCSK9, and the signaling pathways associated with PCSK9.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "this", "review", ",", "we", "summarized", "the", "biological", "processes", "involved", ",", "the", "relationships", "of", "different", "subtypes", "of", "T", "cells", "with", "PCSK9", ",", "and", "the", "signaling", "pathways", "associated", "with", "PCSK9", "." ] } ]
PMC6222726
Kusunokinin isolated from P. nigrum showed potent cytotoxic activity on breast cancer cells (MCF-7 and MDA-MB-468) with IC50 values of 1.18 and 1.62 μg/mL, respectively, but demonstrated lower cytotoxicity on normal breast cell lines (IC50 higher than 11 μg/mL).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Kusunokinin", "isolated", "from", "P.", "nigrum", "showed", "potent", "cytotoxic", "activity", "on", "breast", "cancer", "cells", "(", "MCF-7", "and", "MDA-MB-468", ")", "with", "IC50", "values", "of", "1.18", "and", "1.62", "μg/mL", ",", "respectively", ",", "but", "demonstrated", "lower", "cytotoxicity", "on", "normal", "breast", "cell", "lines", "(", "IC50", "higher", "than", "11", "μg/mL", ")", "." ] } ]
PMC11670407
For JC-1 assay, cells were rinsed with PBS and treated with 2 μM JC-1 (HY-K0601, MCE) for 20 min at 37 °C in the dark.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "JC-1", "assay", ",", "cells", "were", "rinsed", "with", "PBS", "and", "treated", "with", "2", "μM", "JC-1", "(", "HY-K0601", ",", "MCE", ")", "for", "20", "min", "at", "37", "°", "C", "in", "the", "dark", "." ] } ]
PMC11634027
Deletion of the A, B, C, E, or F motifs did not impair the ability to bind Dachs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Deletion", "of", "the", "A", ",", "B", ",", "C", ",", "E", ",", "or", "F", "motifs", "did", "not", "impair", "the", "ability", "to", "bind", "Dachs", "." ] } ]
PMC11453018
E The Lasso Cox regression model correlates gene expression with overall survival, assigning risk scores based on gene expression levels.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "E", "The", "Lasso", "Cox", "regression", "model", "correlates", "gene", "expression", "with", "overall", "survival", ",", "assigning", "risk", "scores", "based", "on", "gene", "expression", "levels", "." ] } ]
PMC2614416
The 'part of' is slightly more complicated than the 'is a' relationship.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "'", "part", "of", "'", "is", "slightly", "more", "complicated", "than", "the", "'", "is", "a", "'", "relationship", "." ] } ]
PMC11552389
FOXN3 KEGG analyses. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "FOXN3", "KEGG", "analyses", ".", "(" ] } ]
PMC8740518
The mice of the model group are labeled by red color (T), and the controls are blue (N).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "mice", "of", "the", "model", "group", "are", "labeled", "by", "red", "color", "(", "T", ")", ",", "and", "the", "controls", "are", "blue", "(", "N", ")", "." ] } ]
PMC8992508
Derivatives of chalcone (6) [Figure 4] are a class of natural compounds, precursor of flavonoids, characterized by the presence of two phenyl moieties, A-ring and B-ring.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Derivatives", "of", "chalcone", "(", "6", ")", "[", "Figure", "4", "]", "are", "a", "class", "of", "natural", "compounds", ",", "precursor", "of", "flavonoids", ",", "characterized", "by", "the", "presence", "of", "two", "phenyl", "moieties", ",", "A-ring", "and", "B-ring", "." ] } ]
PMC6160470
The inhibition was similar to verapamil and slightly lower than CsA. On the other hand, MACs showed lower inhibitory potential towards P-gp than DACs, with only MAC-4 showing statistically significant decrease of Rho123 efflux in A2780/Adr cells (p < 0.05), compared to control cells (Fig. 2d).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "inhibition", "was", "similar", "to", "verapamil", "and", "slightly", "lower", "than", "CsA.", "On", "the", "other", "hand", ",", "MACs", "showed", "lower", "inhibitory", "potential", "towards", "P-gp", "than", "DACs", ",", "with", "only", "MAC-4", "showing", "statistically", "significant", "decrease", "of", "Rho123", "efflux", "in", "A2780/Adr", "cells", "(", "p", "<", "0.05", ")", ",", "compared", "to", "control", "cells", "(", "Fig.", "2d", ")", "." ] } ]
PMC9429973
Image: Summary/Conclusion: The majority of RAV-treated patients did not display Hb improvement after 6 months of treatment, and patients lacking Hb improvement also demonstrated increased HCRU.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Image", ":", "Summary/Conclusion", ":", "The", "majority", "of", "RAV-treated", "patients", "did", "not", "display", "Hb", "improvement", "after", "6", "months", "of", "treatment", ",", "and", "patients", "lacking", "Hb", "improvement", "also", "demonstrated", "increased", "HCRU", "." ] } ]
PMC9429973
Results: High mtDNAc was independently associated with increased relapse risk.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "High", "mtDNAc", "was", "independently", "associated", "with", "increased", "relapse", "risk", "." ] } ]
PMC11740207
Due to their morphology, VSLSLCs can be mistaken for EVs and ABs in some assays and vice versa.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Due", "to", "their", "morphology", ",", "VSLSLCs", "can", "be", "mistaken", "for", "EVs", "and", "ABs", "in", "some", "assays", "and", "vice", "versa", "." ] } ]
PMC11733919
These MNPs were functionalized with streptavidin (STV) to subsequently attach a biotin-modified CD26 antibody in order to target senescent cells (Scheme 1).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "MNPs", "were", "functionalized", "with", "streptavidin", "(", "STV", ")", "to", "subsequently", "attach", "a", "biotin-modified", "CD26", "antibody", "in", "order", "to", "target", "senescent", "cells", "(", "Scheme", "1", ")", "." ] } ]