Edit model card

CardicBERT-mix

This model is a fine-tuned version of emilyalsentzer/Bio_ClinicalBERT on an unknown dataset. It achieves the following results on the evaluation set:

  • Loss: 0.0986

Model description

More information needed

Intended uses & limitations

More information needed

Training and evaluation data

More information needed

Training procedure

Training hyperparameters

The following hyperparameters were used during training:

  • learning_rate: 3e-05
  • train_batch_size: 1024
  • eval_batch_size: 1024
  • seed: 42
  • optimizer: Adam with betas=(0.9,0.999) and epsilon=1e-08
  • lr_scheduler_type: linear
  • num_epochs: 400

Training results

Training Loss Epoch Step Validation Loss
No log 1.0 103 0.6997
No log 2.0 206 0.3004
No log 3.0 309 0.2163
1.0692 4.0 412 0.1791
1.0692 5.0 515 0.1588
1.0692 6.0 618 0.1470
1.0692 7.0 721 0.1406
0.1758 8.0 824 0.1334
0.1758 9.0 927 0.1322
0.1758 10.0 1030 0.1265
0.1758 11.0 1133 0.1237
0.1425 12.0 1236 0.1208
0.1425 13.0 1339 0.1211
0.1425 14.0 1442 0.1165
0.1425 15.0 1545 0.1136
0.1287 16.0 1648 0.1152
0.1287 17.0 1751 0.1122
0.1287 18.0 1854 0.1135
0.1287 19.0 1957 0.1146
0.1214 20.0 2060 0.1098
0.1214 21.0 2163 0.1106
0.1214 22.0 2266 0.1085
0.1214 23.0 2369 0.1092
0.116 24.0 2472 0.1050
0.116 25.0 2575 0.1084
0.116 26.0 2678 0.1044
0.116 27.0 2781 0.1053
0.1124 28.0 2884 0.1036
0.1124 29.0 2987 0.1027
0.1124 30.0 3090 0.1025
0.1124 31.0 3193 0.1041
0.1095 32.0 3296 0.1014
0.1095 33.0 3399 0.1057
0.1095 34.0 3502 0.1036
0.1095 35.0 3605 0.1025
0.1071 36.0 3708 0.1024
0.1071 37.0 3811 0.1019
0.1071 38.0 3914 0.1053
0.1071 39.0 4017 0.1050
0.1056 40.0 4120 0.1030
0.1056 41.0 4223 0.1027
0.1056 42.0 4326 0.1031
0.1056 43.0 4429 0.0991
0.1042 44.0 4532 0.1015
0.1042 45.0 4635 0.1009
0.1042 46.0 4738 0.0978
0.1042 47.0 4841 0.1010
0.1025 48.0 4944 0.0986
0.1025 49.0 5047 0.0979
0.1025 50.0 5150 0.1000
0.1025 51.0 5253 0.0997
0.1012 52.0 5356 0.0972
0.1012 53.0 5459 0.0996
0.1012 54.0 5562 0.0979
0.1012 55.0 5665 0.0989
0.1003 56.0 5768 0.0981
0.1003 57.0 5871 0.0995
0.1003 58.0 5974 0.0982
0.1003 59.0 6077 0.0997
0.0993 60.0 6180 0.0991
0.0993 61.0 6283 0.0992
0.0993 62.0 6386 0.1000
0.0993 63.0 6489 0.0994
0.0983 64.0 6592 0.0957
0.0983 65.0 6695 0.0985
0.0983 66.0 6798 0.0978
0.0983 67.0 6901 0.0986
0.098 68.0 7004 0.0975
0.098 69.0 7107 0.0987
0.098 70.0 7210 0.0960
0.098 71.0 7313 0.0964
0.0974 72.0 7416 0.0996
0.0974 73.0 7519 0.0973
0.0974 74.0 7622 0.0975
0.0974 75.0 7725 0.0966
0.0962 76.0 7828 0.0976
0.0962 77.0 7931 0.0946
0.0962 78.0 8034 0.0956
0.0962 79.0 8137 0.0941
0.0959 80.0 8240 0.0961
0.0959 81.0 8343 0.0968
0.0959 82.0 8446 0.0963
0.0959 83.0 8549 0.0952
0.095 84.0 8652 0.0953
0.095 85.0 8755 0.0972
0.095 86.0 8858 0.0961
0.095 87.0 8961 0.0948
0.0946 88.0 9064 0.0930
0.0946 89.0 9167 0.0969
0.0946 90.0 9270 0.0947
0.0946 91.0 9373 0.0948
0.0942 92.0 9476 0.0964
0.0942 93.0 9579 0.0952
0.0942 94.0 9682 0.0950
0.0942 95.0 9785 0.0952
0.0937 96.0 9888 0.0969
0.0937 97.0 9991 0.0962
0.0937 98.0 10094 0.0974
0.0937 99.0 10197 0.0957
0.0935 100.0 10300 0.0967
0.0935 101.0 10403 0.0962
0.0935 102.0 10506 0.0967
0.0935 103.0 10609 0.0966
0.0929 104.0 10712 0.0959
0.0929 105.0 10815 0.0968
0.0929 106.0 10918 0.0958
0.0929 107.0 11021 0.0941
0.0923 108.0 11124 0.0961
0.0923 109.0 11227 0.0938
0.0923 110.0 11330 0.0950
0.0923 111.0 11433 0.0950
0.092 112.0 11536 0.0960
0.092 113.0 11639 0.0972
0.092 114.0 11742 0.0927
0.092 115.0 11845 0.0945
0.0914 116.0 11948 0.0932
0.0914 117.0 12051 0.0939
0.0914 118.0 12154 0.0947
0.0914 119.0 12257 0.0979
0.0913 120.0 12360 0.0926
0.0913 121.0 12463 0.0943
0.0913 122.0 12566 0.0941
0.0913 123.0 12669 0.0967
0.0909 124.0 12772 0.0960
0.0909 125.0 12875 0.0962
0.0909 126.0 12978 0.0970
0.0909 127.0 13081 0.0938
0.0905 128.0 13184 0.0973
0.0905 129.0 13287 0.0949
0.0905 130.0 13390 0.0920
0.0905 131.0 13493 0.0941
0.09 132.0 13596 0.0964
0.09 133.0 13699 0.0968
0.09 134.0 13802 0.0960
0.09 135.0 13905 0.0956
0.09 136.0 14008 0.0958
0.09 137.0 14111 0.0939
0.09 138.0 14214 0.0952
0.09 139.0 14317 0.0939
0.0893 140.0 14420 0.0942
0.0893 141.0 14523 0.0964
0.0893 142.0 14626 0.0944
0.0893 143.0 14729 0.0948
0.0894 144.0 14832 0.0979
0.0894 145.0 14935 0.0921
0.0894 146.0 15038 0.0925
0.0894 147.0 15141 0.0976
0.089 148.0 15244 0.0964
0.089 149.0 15347 0.0975
0.089 150.0 15450 0.0961
0.089 151.0 15553 0.0927
0.0888 152.0 15656 0.0949
0.0888 153.0 15759 0.0936
0.0888 154.0 15862 0.0940
0.0888 155.0 15965 0.0956
0.0884 156.0 16068 0.0945
0.0884 157.0 16171 0.0948
0.0884 158.0 16274 0.0954
0.0884 159.0 16377 0.0953
0.0882 160.0 16480 0.0980
0.0882 161.0 16583 0.0958
0.0882 162.0 16686 0.0944
0.0882 163.0 16789 0.0949
0.0881 164.0 16892 0.0916
0.0881 165.0 16995 0.0937
0.0881 166.0 17098 0.0936
0.0881 167.0 17201 0.0944
0.0876 168.0 17304 0.0963
0.0876 169.0 17407 0.0947
0.0876 170.0 17510 0.0941
0.0876 171.0 17613 0.0961
0.0875 172.0 17716 0.0946
0.0875 173.0 17819 0.0955
0.0875 174.0 17922 0.0918
0.0875 175.0 18025 0.0946
0.0873 176.0 18128 0.0968
0.0873 177.0 18231 0.0937
0.0873 178.0 18334 0.0965
0.0873 179.0 18437 0.0971
0.0869 180.0 18540 0.0951
0.0869 181.0 18643 0.0938
0.0869 182.0 18746 0.0991
0.0869 183.0 18849 0.0921
0.0868 184.0 18952 0.0936
0.0868 185.0 19055 0.0942
0.0868 186.0 19158 0.0929
0.0868 187.0 19261 0.0953
0.0868 188.0 19364 0.0940
0.0868 189.0 19467 0.0937
0.0868 190.0 19570 0.0944
0.0868 191.0 19673 0.0946
0.0865 192.0 19776 0.0936
0.0865 193.0 19879 0.0927
0.0865 194.0 19982 0.0974
0.0865 195.0 20085 0.0948
0.0862 196.0 20188 0.0974
0.0862 197.0 20291 0.0949
0.0862 198.0 20394 0.0928
0.0862 199.0 20497 0.0915
0.0859 200.0 20600 0.0928
0.0859 201.0 20703 0.0912
0.0859 202.0 20806 0.0944
0.0859 203.0 20909 0.0948
0.0859 204.0 21012 0.0935
0.0859 205.0 21115 0.0947
0.0859 206.0 21218 0.0956
0.0856 207.0 21321 0.0950
0.0856 208.0 21424 0.0953
0.0856 209.0 21527 0.0970
0.0856 210.0 21630 0.0948
0.0853 211.0 21733 0.0940
0.0853 212.0 21836 0.0928
0.0853 213.0 21939 0.0949
0.0853 214.0 22042 0.0963
0.0851 215.0 22145 0.0926
0.0851 216.0 22248 0.0924
0.0851 217.0 22351 0.0955
0.0851 218.0 22454 0.0932
0.0852 219.0 22557 0.0957
0.0852 220.0 22660 0.0958
0.0852 221.0 22763 0.0950
0.0852 222.0 22866 0.0967
0.0848 223.0 22969 0.0940
0.0848 224.0 23072 0.0954
0.0848 225.0 23175 0.0950
0.0848 226.0 23278 0.0966
0.0846 227.0 23381 0.0966
0.0846 228.0 23484 0.0940
0.0846 229.0 23587 0.0959
0.0846 230.0 23690 0.0947
0.0847 231.0 23793 0.0957
0.0847 232.0 23896 0.0953
0.0847 233.0 23999 0.0965
0.0847 234.0 24102 0.0958
0.0844 235.0 24205 0.0945
0.0844 236.0 24308 0.0982
0.0844 237.0 24411 0.0958
0.0844 238.0 24514 0.0958
0.0842 239.0 24617 0.0924
0.0842 240.0 24720 0.0978
0.0842 241.0 24823 0.0935
0.0842 242.0 24926 0.0934
0.0839 243.0 25029 0.0945
0.0839 244.0 25132 0.0962
0.0839 245.0 25235 0.0961
0.0839 246.0 25338 0.0971
0.0838 247.0 25441 0.0960
0.0838 248.0 25544 0.0968
0.0838 249.0 25647 0.0937
0.0838 250.0 25750 0.0964
0.0836 251.0 25853 0.0949
0.0836 252.0 25956 0.0966
0.0836 253.0 26059 0.0937
0.0836 254.0 26162 0.0940
0.0834 255.0 26265 0.0951
0.0834 256.0 26368 0.0946
0.0834 257.0 26471 0.0934
0.0834 258.0 26574 0.0940
0.0834 259.0 26677 0.0959
0.0834 260.0 26780 0.0944
0.0834 261.0 26883 0.0944
0.0834 262.0 26986 0.0933
0.0831 263.0 27089 0.0952
0.0831 264.0 27192 0.0923
0.0831 265.0 27295 0.0975
0.0831 266.0 27398 0.0943
0.0832 267.0 27501 0.0960
0.0832 268.0 27604 0.0951
0.0832 269.0 27707 0.0961
0.0832 270.0 27810 0.0939
0.0828 271.0 27913 0.0979
0.0828 272.0 28016 0.0939
0.0828 273.0 28119 0.0967
0.0828 274.0 28222 0.0942
0.0828 275.0 28325 0.0963
0.0828 276.0 28428 0.0962
0.0828 277.0 28531 0.0972
0.0828 278.0 28634 0.0979
0.0822 279.0 28737 0.0952
0.0822 280.0 28840 0.0960
0.0822 281.0 28943 0.0948
0.0822 282.0 29046 0.0967
0.0824 283.0 29149 0.0951
0.0824 284.0 29252 0.0957
0.0824 285.0 29355 0.0956
0.0824 286.0 29458 0.0958
0.0823 287.0 29561 0.0950
0.0823 288.0 29664 0.0943
0.0823 289.0 29767 0.0953
0.0823 290.0 29870 0.0956
0.082 291.0 29973 0.0961
0.082 292.0 30076 0.0962
0.082 293.0 30179 0.0966
0.082 294.0 30282 0.0963
0.0822 295.0 30385 0.0949
0.0822 296.0 30488 0.0964
0.0822 297.0 30591 0.0944
0.0822 298.0 30694 0.0944
0.0816 299.0 30797 0.0960
0.0816 300.0 30900 0.0942
0.0816 301.0 31003 0.0982
0.0816 302.0 31106 0.0969
0.0818 303.0 31209 0.0955
0.0818 304.0 31312 0.0940
0.0818 305.0 31415 0.0977
0.0818 306.0 31518 0.0940
0.0814 307.0 31621 0.0961
0.0814 308.0 31724 0.0931
0.0814 309.0 31827 0.0948
0.0814 310.0 31930 0.0959
0.0816 311.0 32033 0.0957
0.0816 312.0 32136 0.0983
0.0816 313.0 32239 0.0976
0.0816 314.0 32342 0.0923
0.0811 315.0 32445 0.0947
0.0811 316.0 32548 0.0954
0.0811 317.0 32651 0.0967
0.0811 318.0 32754 0.0945
0.081 319.0 32857 0.0960
0.081 320.0 32960 0.0947
0.081 321.0 33063 0.0950
0.081 322.0 33166 0.0950
0.0809 323.0 33269 0.0963
0.0809 324.0 33372 0.0958
0.0809 325.0 33475 0.0948
0.0809 326.0 33578 0.0973
0.0809 327.0 33681 0.0956
0.0809 328.0 33784 0.0947
0.0809 329.0 33887 0.0949
0.0809 330.0 33990 0.0966
0.0807 331.0 34093 0.0941
0.0807 332.0 34196 0.0967
0.0807 333.0 34299 0.0952
0.0807 334.0 34402 0.0963
0.0808 335.0 34505 0.0954
0.0808 336.0 34608 0.0978
0.0808 337.0 34711 0.0940
0.0808 338.0 34814 0.0969
0.0805 339.0 34917 0.0939
0.0805 340.0 35020 0.0986
0.0805 341.0 35123 0.0967
0.0805 342.0 35226 0.0970
0.0807 343.0 35329 0.0962
0.0807 344.0 35432 0.0956
0.0807 345.0 35535 0.0971
0.0807 346.0 35638 0.0982
0.0803 347.0 35741 0.0963
0.0803 348.0 35844 0.0980
0.0803 349.0 35947 0.0932
0.0803 350.0 36050 0.0981
0.0803 351.0 36153 0.0934
0.0803 352.0 36256 0.0975
0.0803 353.0 36359 0.0985
0.0803 354.0 36462 0.0970
0.0804 355.0 36565 0.0975
0.0804 356.0 36668 0.0991
0.0804 357.0 36771 0.0945
0.0804 358.0 36874 0.0959
0.0802 359.0 36977 0.0998
0.0802 360.0 37080 0.0955
0.0802 361.0 37183 0.0981
0.0802 362.0 37286 0.0967
0.0802 363.0 37389 0.0974
0.0802 364.0 37492 0.0966
0.0802 365.0 37595 0.0945
0.0802 366.0 37698 0.0980
0.0798 367.0 37801 0.0987
0.0798 368.0 37904 0.0968
0.0798 369.0 38007 0.0950
0.0798 370.0 38110 0.0972
0.08 371.0 38213 0.0966
0.08 372.0 38316 0.0950
0.08 373.0 38419 0.0972
0.08 374.0 38522 0.0978
0.0798 375.0 38625 0.0970
0.0798 376.0 38728 0.0953
0.0798 377.0 38831 0.0951
0.0798 378.0 38934 0.0936
0.0797 379.0 39037 0.0962
0.0797 380.0 39140 0.0969
0.0797 381.0 39243 0.0946
0.0797 382.0 39346 0.0952
0.0798 383.0 39449 0.0949
0.0798 384.0 39552 0.0959
0.0798 385.0 39655 0.0989
0.0798 386.0 39758 0.0969
0.0796 387.0 39861 0.0951
0.0796 388.0 39964 0.0996
0.0796 389.0 40067 0.0961
0.0796 390.0 40170 0.0984
0.0796 391.0 40273 0.0939
0.0796 392.0 40376 0.0981
0.0796 393.0 40479 0.0956
0.0796 394.0 40582 0.0969
0.0795 395.0 40685 0.0965
0.0795 396.0 40788 0.0954
0.0795 397.0 40891 0.0962
0.0795 398.0 40994 0.0963
0.0795 399.0 41097 0.0970
0.0795 400.0 41200 0.0981

Framework versions

  • Transformers 4.33.2
  • Pytorch 2.1.0+cu121
  • Datasets 2.14.6
  • Tokenizers 0.13.3
Downloads last month
2

Finetuned from