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5tw7_A-B4RJH7	MTQDKILILDFGSQVTRLIARRVREAHVYCELHSFDMPLDEIKAFNPKGIILSGGPNSVYESDYQADTGIFDLGIPVLGICYGMQFMAHHLGGEVQPGNQREFGYAQVKTIDSGLTRGIQDDAPNTLDVWMSHGDKVSKLPDGFAVIGDTPSCPIAMMENTEKQFYGIQFHPEVTHTKQGRALLNRFVLDICGAQPGWTMPNYIEEAVAKIREQVGSDEVILGLSGGVDSSVAAALIHRAIGDQLTCVFVDHGLLRLNEGKMVMDMFARNLGVKVIHVDAEGQFMAKLAGVTDPEKKRKIIGAEFIEVFDAEEKKLTNAKWLAQGTIYPDVIESAGAKTKKAHAIKSHHNVGGLPENMKLKLLEPLRDLFKDEVRELGVALGLPREMVYRHPFPGPGLGVRILGEVKKEYADLLRQADDIFIQELRNTTDENGTSWYDLTSQAFAVFLPVKSVGVMGDGRTYDYVVALRAVITSDFMTAHWAELPYSLLGRVSNRIINEVKGINRVVYDVSGKPPATIEWE	DPAAEEEEADQPDLCSLLLVVLCVVLLGHYDYDHLQPDVVVVVVVPHLEYEYEAHDDAPVPDPSDHDPCVLVPLHAYEYEANGQNNVFVVLPFDKDFFPDFDFAWDKKQFDDDLLCHVPDDPDPRIWTFTAGHGMATPGGHPQKDAGIADPRHRRQKIARPNSNYIYGNTQLSDVRGVCSSVSSSSCQCPRSVRDRDRDLVVLLVVLLVVLCVVQPLFAEEEEDALALLSLLQQLSNCVRHPASYEYEYEDQLQAAPCSVVVSCCCCCPVVVHHYDYDDNNVVLLVQLAQPQDLVVLLQSLVVVVLVVVVVVVVVVPRHQEYEASAAQVLVSVLVVPPPPPSPPDVLRDDHGPNDPPPNHHYDHSRHSPDLVSSLVSCVVSPHDNCSSPPADAHSSHLCSLERGGDDSLQSVLQSVLFVLLLVLQQVDDDPVRHGNRNQFNDKGKGWDQFFDDLDVPNPPDRFTEIEIFTWHDPDQAWIWTDPDDPVSVVVSQVCSCVVRPRYPYYHYDGDGDHPPPSDDD	LLLLEEEEEELSLTTHHHHHHHHHHTTLEEEEEETTLLHHHHHHHLLSEEEELLLSSLTTTLLLLLLGGGGGSLSLEEEETHHHHHHHHHTTLEEEEEEEEEEEEEEEEELSLTTTTTLLLSSTTEEEEEEEEEEEEEELLTTLEEEEELSSLTTSEEEETTTTEEEESSLTTSTTSTTHHHHHHIIIIIISLLLLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHTTLEEEEELLSSHHHHHHHHHHHHHHGGGEEEEEEELSLSLTTHHHHHIIIIIIIILLEEEEEELHHHHHHHHTTLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTLTTEEEEELLLLHHHHHHHHTLLSSLLLLLLTTTTSLSSLTTLLLEEELTTTTLLHHHHHHHHHHTTLLHHHHTLLLLLTTGGGGGBSSSLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLBLTTSLBHHHHLSEEEEEEEEEEELSSTTLLLLLEEEEEEEEEELSSSSLLEELLLLHHHHHHHHHHHHHHSTTEEEEEELLLLLLTTLLLLL	9,13,88,98,114,137,156,195,244,253,337,339,378,488
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3p0c_A-Q9Y2I1	EARVVGSELVDTYTVYIIQVTDGSHEWTVKHRYSDFHDLHEKLVAERKIDKNLLPPKKIIGKNSRSLVEKREKDLEVYLQKLLAAFPGVTPRVLAHFLHFHFYEING	DKAFDAWDDDPQFIWTWMWDDPPPDIDIEIDGPVLVVVLLVVCVVVVQDDNPLQDDPDDDDGDDPVVRVVNRVSVRSSVVVQCVSCVDDDDPSVVCVGPDHPPVVPD	LEEEEEEEEETTEEEEEEEEELSSLEEEEEELHHHHHHHHHHHHHTTLSLTTLSLLLLLLLTTLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLSSLLLHHHHHHHHLLSTTTTL	32,229,323,407,416,452
2ooy_G-Q10343	DVQETQKGALKEIQAFIRSRTSYDVLPTSFRLIVFDVTLFVKTSLSLLTLNNIVSAPLWDSEANKFAGLLTMADFVNVIKYYYQSSSFPEAIAEIDKFRLLGLREVERKIGAIPPETIYVHPMHSLMDACLAMSKSRARRIPLIDVDGETGSEMIVSVLTQYRILKFISMNCKETAMLRVPLNQMTIGTWSNLATASMETKVYDVIKMLAEKNISAVPIVNSEGTLLNVYESVDVMHLIQDGDYSNLDLSVGEALLKRPANFDGVHTCRATDRLDGIFDAIKHSRVHRLFVVDENLKLEGILSLADILNYIIYDKTTTPGVPEQTDNFESAV	DLVVLLLVLLVLLQVVLQVDFLLVLDDPDDDADEAEQQDAPLVVLLVCVVVVHFKHWYAHPVVLATDAMDGLLLVLLLVVLLVPPDDPVVSLVVSRVDTNNCSCVSCVVVVHDDQPRAAAARGHGSLVVLVSCLVSVNQKHWHWDADPPPRGIDTPDIDGLLSVLLVCLVPPPSLLSQFAFQLVPPFFFQPPAAAAEQQDFLNVVSVVCNVVVHFKHFYADPVQATDFMDGSVLVSLQCSVPPPVSSRHGNNVSVVSDDPPDPTAAEDESRGGSSVVSVVSNVDVDQKYFYADPRRHTRTIGGSSRVSCCSSVVCVPDPDPPPCPDPVVPDD	LHHHHHHHHHHHHHHHHHHSBGGGGSLSSLLLLLEETTSBHHHHHHHHHHTTLSEEEEEETTTTEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHSLHHHHHHHHHHLBGGGHHHHHHHTTLLLLLLLLBLTTSBHHHHHHHHHHHTLSEEEEEEELTTTLLEEEEEEEEHHHHHHHHHHHLGGGGGLLSBGGGTTLSBLSSLLLBLTTSBHHHHHHHHHHTTLSEEEEELTTLBEEEEEEHHHHHHHHTTSLGGGGGSBHHHHHTTSLTTLLLLLEELTTLBHHHHHHHHHHSLLSEEEEELTTLBEEEEEEHHHHHHHHHHTTTTLTTSLLLLSTTSSLL	9,24,62,88,98,114,133,158,253,337,339,464,488
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1p7g_A-O93724	VTTKRYTLPPLPYAYNALEPYISAEIMQLHHQKHHQGYVNGANAALEKLEKFRKGEAQIDIRAVLRDLSFHLNGHILHSIFWPNMAPPGKGGGKPGGKIADLINKFFGSFEKFKEEFSQAAKNVEGVGWAILVYEPLEEQLLILQIEKHNLMHAADAQVLLALDVWEHAYYLQYKNDRGSYVDNWWNVVNWDDVERRLQKALNGQIALKL	DPPPADDQDDFPDQLCLAPPLAHSVLSCCCRVPVLRVLSVQLRVLVVVVVCVVVVNDDDDVVVSVVSNQLSVLSNQLVVQARLQFGGFVQAADDADDPVQVQCCVAQVHPVSVLVVQLVLLVPQDAWWKWFWWQDDVVRHIDIDTDDRSNDPCCVQIFTLYMDGQHCSNPCVPQNPCSSSSSVSRNSTGNSVSSVVSVVCSVVVNSPPPD	LLLLLLLLLLLSSLTTTTTTTSLHHHHHIIIIIIIHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTSLLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTTBLLBTTBLSLLLHHHHHHHHHHHSSHHHHHHHHHHHHHTLSSSEEEEEEEETTTTEEEEEEEETTLLLLLTTLEEEEEEELSGGGTHHHHTTLHHHHHHHHGGGBLHHHHHHHHHHHHTTLLSLLL	113,126,199,230,460
3zv0_C-P33322	MSKEDFVIKPEAAGASTDTSEWPLLLKNFDKLLVRSGHYTPIPAGSSPLKRDLKSYISSG	DPPVVPPPPCVVVVVPPPCVCVVVVVVCVVVVCVVVVVDDPDDPPDPVPPPPVVVVVPVD	LLGGGGLLLTTTTTLLSLGGGHHHHHHHHHHHHHHHTSLLLLLTTSLGGGSLHHHHHHHL	463
3i2x_A-P10822	DDDLVDAEGNLVENGGTYYLLPHIWAHGGGIETAKTGNEPCPLTVVRSPNEVSKGEPIRISSQFLSLFIPRGSLVALGFANPPSCAASPWWTVVDSPQGPAVKLSQQKLPEKDILVFKFEKVSHSNIHVYKLLYCQHDEEDVKCDQYIGIHRDRNGNRRLVVTEENPLELVLLKAKSETASSH	DDFAAFQVGDFAFAFFKWWWAAPDQPPAETWEFADDDPDPGGWFIFGHNHRPDSYFIKTWHFPDPDGGGHAPTFIWIFGPDDDPQAPDRTWFWDQDPVAIFITGHNDDDDPQRGRFWHWDADPPDPGGKTFIWGWHDDPPDIDTQWGWDWDQDPVGTTTTHIDNDDTGITGIGGDPPPPPPPD	LLBLBLTTSLBLBTTLEEEEEESSTTSLLLEEEELLTTLSSLLEEEELSLTTLLLLLEEEEESSLLSBLBTTLEEEEEESSLLTTLSLSBEEEELLTTSLEEEELSSLLLGGGTSLEEEEELTTLSSLLEEEEEEEEETTEEEEEEEEEEEELTTLLEEEEEESSSLLEEEEEELLLLLLLLL	24,62,163,290,295,346,426,443
1wyo_A-Q9UPY8	MAVNVYSTSVTSENLSRHDMLAWVNDSLHLNYTKIEQLCSGAAYCQFMDMLFPGCVHLRKVKFQAKLEHEYIHNFKVLQAAFKKMGVDKIIPVEKLVKGKFQDNFEFIQWFKKFFDANYDGKDYNPLLARQGQDVAPPPNPGDQIF	DFDEDDDLPPVVPADDQVVLVVVLCVVQVDDDPALLLCLLLLSVLLLLCQLPPPLADNVQQDQADADLVNSVSNVVRVVSSCVVVVHPDDDPSVVSNVSDRVNSSSVSSSVVVSSVRRDPPDDDDNCVSNVNDDHDGHDHDVNPDD	LLLLLLLLLLGGGLLLHHHHHHHHHHHHTLLLLSGGGGGGLHHHHHHHHHHSTTSSLGGGSLTTLLSHHHHHHHHHHHHHHHHHHTLLLLLLHHHHTTTLHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLLLLLLHHHHTTTLLLLLLLLTTTSLL	73,171,249
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5x8t_H-P82180	QKKVKKIRKIILKEDIPDLGKKGQLLDVRAGFLRNFLLPLGKAEVVTPLLLKEMKMEDERIEAEKKRVKEEAQQLARMFETVGAFKVKRKGGKGKQIFGSVTAQDLVDIIKAQLQRDVDKKVVFLPDIRETGEYIAELKLHPDVTAQVRVTVFAN	DPPPQPKFWKAFCADDPPQGHHGDIDIDGPVCCVPPCVVVVGIDTDDPVNVVVVVVVVVVVVVVVVVLVVVLVVVLVVQAVLAAQEDEFADDPDFFGPDWDALVSVQVSCCVSVVDGDDSVQKDDDTDGGFAKDWIWGPSDPPDIHIHIYGYDHD	LLLLLLEEEEEESSLBTTTBLTTLEEEEEHHHIIIIITTTTLEEELLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHSLEEEEEELBLSTTBBSSLLLHHHHHHHHHHHHLLLLLGGGEELLLLLBSEEEEEEEEEETTEEEEEEEEEEEL	214,397
3i5q_B-P38181	QRIVQLASRIQDACEVAGIQGDILSLVYTDARIDSAIKDELIKTLDGKILSTSELFNDFAVPLSYHEIALFIFKIADFRDHEVIMAKWDELFQSLRMEFNNTGKKEDSMNFINLLSNVLIKIGKNVQDSEFIFPIFELFPIVCNFFYETLPKEHIVSGSIVSIFITAGVSFNKMYYILKELIETSDSDNSVFNKEMTWLIHEWYKSDRKFRDIISYNDIIHLKEYKIDNDPIEKYVKNSGNNLGICFYKE	DVVVVVVLVVVLLVLLLVLLVVQLVCLVPDPVDDPVVSVVSNCVSVVDRDDLVCCQPVGCVVVVVLLSNLLSCQSVVPQPLVVLVVSVVSVLVVLLVVVVVVVDLVCLVVSLVVVLVSLLVSLLSRVVPCRNCVPLVVLVVVLCSNVVRHDPVPDDQQSSVVSNVSSPDDLVNLLVSLVVCCVPDPDDNVNSLSNNLVSLLVCVVPDVCSVVRDDPVNLVVSVVVDPPPGCSVVVVVVVVVPPPDDPPPD	LHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLTTSLHHHHHHHHHHHHHSLLLHHHIIIIIITTTTLHHHHHHHHHHTTLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHLLGGGHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTTLTTTSLHHHHHHHHHHHHHHHSLGGGLLTTHHHHHHHHTTLLHHHHHHHHHHHHHHLLSLTHHHHHHHHHHHHHHHHHLGGGGGTSLHHHHHHHHTSLLTTLHHHHHHHHHHHHLLLLLLLL	214,408
3oc4_A-Q833L5	KIVIIGASFAGISAAIASRKKYPQAEISLIDKQATVGYLSGGLSAYFNHTINELHEARYITEEELRRQKIQLLLNREVVAMDVENQLIAWTRKEEQQWYSYDKLILATGASQFSTQIRGSQTEKLLKYKFLSGALAAVPLLENSQTVAVIGAGPIGMEAIDFLVKMKKTVHVFESLENLLPKYFDKEMVAEVQKSLEKQAVIFHFEETVLGIEETANGIVLETSEQEISCDSGIFALNLHPQLAYLDKKIQRNLDQTIAVDAYLQTSVPNVFAIGDCISVMNEPVAETFYAPLVNNAVRTGLVVANNLEEKTHRFIGSLRTMGTKVGDYYLASTGLTETEGLFFPQTLASIIVRQPAPPLQHGTEILGKLIYDKVTQRVLGAQLCSKNNCLEKINTLALSIQTGQTLTDLLQKDYFYQPSLTNIYDITNLMGASAYWRENDE	DEEEEDQELQRVLLLLLLCVVPVPDAAEYEYLAPWHAADLLLLLCCLVVVDVDSVVRGDDGPVRSVVSVYHYHYNWDWQADDLPQQWTWTDDPNDTDIDHDQFYEYAQAWFQDDPQAAPCPDLLAAGRSDPVSSVSVPVLLLPWQEEEEEDQAPQSLSVLQSSLVVLHQYEYEELADDHNVFFDDHVQCVVVVVVSVVSNYHYDYNKHFRYWDADPQQIWTDIPPDIDDTNGYYRDDDIADDCNRDDPQQDADPSRATDDDQQQATSRLRYGYFAQRHWWQAQLQRDTDRARDSVRSSVNSNSNSVPNPHRDDGDRTAQSWDWDDHDLKIKTKGFGDPVVCVVGPFQKDKDWDWDQPQPQDPFGIKIKMWMAGLPLQWTGMMMIMGSDDPSVVVVVVNVSNVVRHGLVCQQPDDDDDDNNHDDPDDPSNVRSVVSVCVSPVD	LEEEELLSHHHHHHHHHHHHHLTTSLEEEELSSSSSLBLTTHHHHHHTTSLSSGGGLBSSLHHHHHHTTEEEELSLEEEEEETTTTEEEEEETTEEEEEELSEEEELLLLEELLSSSBTTTLTTEELLSSHHHHHHHHHHHHHLSEEEEELLSHHHHHHHHHHHHTTLEEEEEESSSSSSTTTLLHHHHHHHHHHHHTTTEEEEETLLEEEEEEETTEEEEEESSLEEEESEEEELSLEELLLTTLLTTSLBLTTSSBLLLTTSBLSSTTEEELGGGBLEEETTTTEEELLLLHHHHHHHHHHHHTTSSSLLLLLLLLLLLEEEEETTEEEEEEELLHHHHTTSSSLEEEEEEEELLLTTSLLLLEEEEEEEETTTLBEEEEEEEESSLLTTHHHHHHHHHHTTLBHHHHHHSLLLLLTTTSLSSLHHHHHHHHHHHHHHLL	136
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2id4_A-P13134	APPMDSSLLPVKEAEDKLSINDPLFERQWHLVNPSFPGSDINVLDLWYNNITGAGVVAAIVDDGLDYENEDLKDNFCAEGSWDFNDNTNLPKPRLSDDYHGTRCAGEIAAKKGNNFCGVGVGYNAKISGIRILSGDITTEDEAASLIYGLDVNDIYSCSWGPADDGRHLQGPSDLVKKALVKGVTEGRDSKGAIYVFASGNGGTRGDNCNYDGYTNSIYSITIGAIDHKDLHPPYSEGCSAVMAVTYSSGSGEYIHSSDINGRCSNSHGGTSAAAPLAAGVYTLLLEANPNLTWRDVQYLSILSAVGLEKNADGDWRDSAMGKKYSHRYGFGKIDAHKLIEMSKTWENVNAQTWFYLPTLYVSQSTNSTEETLESVITISEKSLQDANFKRIEHVTVTVDIDTEIRGTTTVDLISPAGIISNLGVVRPRDVSSEGFKDWTFMSVAHWGENGVGDWKIKVKTTENGHRIDFHSWRLKLFGESIDSSKTETFVFGNDKEEVE	DPPPPVLCVVVVVLCVLLVFQAPCASQQVQDPPSPAGPLHQAQSVVVNVVLQLAPAEEEEEFAFEPCVALFAVVQEDQQQEAEPQVGDSHRHHDDPPRWLSHFLQFQQAGATNRHYWHGHLRPNHHYYYYHQPPHDHDLVSLLCNLQGPLVHHQEYQYEDFDDLQLAAQDERDPSNVVSLLCQLQPGPNRLHHAYFYEQFQNQLQQDASLSTRVLQDLSYAYEWEDESQREQARRTHFFQSHAAYGYADDPPAGGWGDTPPNHIDRHGGDSSNTRSNVVNLVSSQCVLPVNHGNVNLSVLQQVQADDDVVPYDFPWDDEPVRFIAGSRGRRHHNHSVSSNVCSNPDDYFADKFKDKDDKDWQFDKDQDQVDKRKDKDFDAPVRCVVRQFAWFQKKKKWWDKFKQFQLQKWKWKQAPVGDIGTSRHHRPPHRDRNHRHRRMGMGRRHGGHRRGTMMMMIMGGNDGPMMMTTTIMMMMTMHTGNDNVPDDDDDPVVVPPPPD	LLLLLGGGHHHHHHHHHHTLLLTTGGGLTTTLLSSSTTLSLLLHHHHHTTLSLTTLEEEEEESLLLTTSTTTGGGBLSTTLEETTTTBSLLLLLSTTTTHHHHHHHHHHLLTTSSSSLLLTTTTSEEEEEELSSSLLLHHHHHHHHTTTTTTLSEEEELLLSLSSSLLLBLLLHHHHHHHHHHHHHHHHHTLLEEEEELLSLGGGTLLGGGBTTTSLTTEEEEEEELTTSLLLTTSLLLTTEEEEEELLBTTBLEEEEETTTEEEEEELSHHHHHHHHHHHHHHHHHHLTTLLHHHHHHHHHHTLBLLTTTSLLLLEELTTSLEEBTTTBTLBLLHHHHHHHHHTLLLLLLEEEEELLLEEEEEEELLTTLLEEEEEEELHHHHHHTTEEEEEEEEEEEEEEESSGGGEEEEEELTTLLEEEEELLLTTLLLSLLEEEEEEEELTTTTLLLLEEEEEEEEESSTTLLEEEEEEEEEEEEEESLGGGSLLLLTTLLLLLLL	35,36,47,81,192,243,386,475
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GO-MF Dataset with ESMFold Structural Sequence

Description: Molecular Function of Gene Ontology (GO) project.
Number of labels: 489
Problem Type: multi_label_classification
Columns:
- aa_seq: protein amino acid sequence
- foldseek_seq: foldseek 20 3di structural sequence
- ss8_seq: DSSP 8 secondary structure sequence

Github

Simple, Efficient and Scalable Structure-aware Adapter Boosts Protein Language Models

https://github.com/tyang816/SES-Adapter

Citation

Please cite our work if you use our dataset.

@article{tan2024ses-adapter,
  title={Simple, Efficient and Scalable Structure-aware Adapter Boosts Protein Language Models},
  author={Tan, Yang and Li, Mingchen and Zhou, Bingxin and Zhong, Bozitao and Zheng, Lirong and Tan, Pan and Zhou, Ziyi and Yu, Huiqun and Fan, Guisheng and Hong, Liang},
  journal={arXiv preprint arXiv:2404.14850},
  year={2024}
}

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