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270
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123
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277
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81
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123
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209
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270
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123
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209
4xgc_C-Q7K2L1
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6hul_A-P50382
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81
1unl_D-Q15078
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2hft_A-P13726
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4bog_1-Q6S3H8
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DVVVVVVVVVVVVVVVVVPPPPQLLVVLCCCLQPVLVADQVDDQDPDQQDAKEKAKDKAFAAFPDQDQQQQKTKTKIKIKIKTAHQSSAADCVVSVNCFKHWDQPVRHHDFQKDFPQAPPPDWPWPSPWTWIAGNNRMIMDIIITIGIGRWDDAQQLPPLDKTKTKGKMWGPPDFCSHYDYDHQFDCDPNDTDRPQDNPYPPVNYPPVPFKDWDDKDKDKDWDQDPDPVRGIITMIMIITIMHTPCPVCCVPQVVVLVVLLVQLLCLLVDALPDPVSLVSLVVSLVVLVVSLVVVVVVHHPPHPDQYLVNVLSVVSSVLSVVSNVLSVVLNVLLPDQCVPDDDDPVLCCVLVPPLCVVLVNDDPVPPVPPCVVVVVVVVVVPPPPCVVCVVVVVVVVCVVVVVVVVVVVVVPDDPPPPPPPDPDDPVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVVRVVRSVSSNSSSSSSSSVSSVPSVVVSVVSSVVSVVVSVVPDDPPDDPPDDPPVVVPPDPPPD
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1kzq_A-P13664
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2ly8_A-P36012
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2v83_A-P21784
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209
4kds_A-I3WWD7
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3mca_A-O74774
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123
2gp4_A-Q8EEA0
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DPPVVVVVVVVVVVVVVVLVVQLVVVVVVCQVVLQQLLVRDPDLCVVVLVVDDPVQNVCSVVSVAFEEEEEEAADPVALARVLVVCLQVLLQVLLVVVPHGYDYAFYHHAQDLVPLVDLVSLLCHQVSLQVLLVSLLVRPVSDRGQAYEYEDFDQRRLLSNLLNLLVVLVHHYAYQFQAEFDAFPFLQVLLVVLLCVLVVNDDPVVNVVSVVRGGDHRHHHQFQWNRLLSLLLCVQLQRAAQLRRHDHSPDPVSSVRSSVNSVLSRVVSVVGPPDGRVLQSDDPQSLQSSLLLCQQQLHYQLVLLSSLSSCVSSVHHDFQVVSAVSQLQHFHFFDRALNDRHTQVLCSLLVHSLVSLVLCVVVVSHDQPHGHSQRHTCPCSNPQRDGPVNPDGPPPDPPRHRPSVGGDHQVDGPGNGTQKHWADDLLAIFIKGNSQADPVQQKAKAWEDEDQDLVVVSVCLVVCVPLAAYEYEHAQQALLGSNQGASASVQSSQVVSVVVVHRYAYEYCHGHISSSGHHIYGYVGPPGLVVPGLSQQRDTGFIWIRHNPVRYTDTPDDPVVSVPTDGDDRDRPVFPDDPVSVVVSVQSNQFDRSRSSRHRDDVVVVVD
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123

GO-CC Dataset with ESMFold Structural Sequence

  • Description: Cellular Component of Gene Ontology (GO) project.
  • Number of labels: 320
  • Problem Type: multi_label_classification
  • Columns:
    • aa_seq: protein amino acid sequence
    • foldseek_seq: foldseek 20 3di structural sequence
    • ss8_seq: DSSP 8 secondary structure sequence

Github

Simple, Efficient and Scalable Structure-aware Adapter Boosts Protein Language Models

https://github.com/tyang816/SES-Adapter

Citation

Please cite our work if you use our dataset.

@article{tan2024ses-adapter,
  title={Simple, Efficient and Scalable Structure-aware Adapter Boosts Protein Language Models},
  author={Tan, Yang and Li, Mingchen and Zhou, Bingxin and Zhong, Bozitao and Zheng, Lirong and Tan, Pan and Zhou, Ziyi and Yu, Huiqun and Fan, Guisheng and Hong, Liang},
  journal={arXiv preprint arXiv:2404.14850},
  year={2024}
}
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