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Titolo: NUOVA TECNICA PER IL SEQUENZIAMENTO DEL DNA (se non l'anno già inventata):

NUOVA TECNICA PER IL SEQUENZIAMENTO DEL DNA (se non l'anno già inventata):
---Da enciclopedia-----
La reazione a catena della polimerasi avviene in tre fasi. Nella prima,
denominata denaturazione, il frammento di DNA viene riscaldato a una
temperatura di 90-95 °C per 30 secondi, allo scopo di indurre la separazione
dei due filamenti complementari che lo compongono. Nella seconda fase, detta
annealing o attacco, la temperatura viene mantenuta per 20 secondi a 55 °C,
il che determina il legame tra i primers con i due filamenti di DNA. Nella
terza fase, la polimerizzazione, la temperatura viene innalzata a 75 °C e la
polimerasi copia con grande rapidità il DNA, aggiungendo a ciascun filamento
i nucleotidi complementari.
---Fine----------------
Si fa avvenire la terza fase della PCR in un piccolo recipiente a cui sono
collegati quattro paia di tubi, ognuno dei quattro paia serve a far scorrere
nel recipiente una soluzione contenente un solo tipo di nucleotide.
Con ritmo regolare vengono fatti fluire da tali tubi uno solo alla volta
ognuna delle quattro soluzioni
Nel recipiente sono contenuti numerosi filamenti di DNA i cui nucleotidi
iniziali sono legati a
particelle di resina trattenute da un filtro (il metodo usato per trattenere
i filamenti di DNA nel recipiente può essere perfezionato).
---RIASSUNTO DI UN'ARTICOLO COPIATO DA UN LIBRO:-----
Nel 1965 fu sintetizzata l'insulina con questo metodo:
L'amminoacido iniziale della catena veniva legato ad una particella di
resina che poteva venire separata mediante semplici filtrazioni; Si
aggiungeva una nuova soluzione col successivo amminoacido che si sarebbe
lagato al primo; Seguiva un'altra filtrazione, a cosi via.
---Fine------------
Quando i nucleotidi di un solo tipo si legano al DNA, i sensori nel piccolo
recipiente registrano o variazioni di temperatura o fotoni emessi dalla
reazione.
In base a quali tubi erano aperti, e quindi quale dei quattro nucleotidi era
in soluzione, nel momento che i sensori rilevano che è avvenuta una reazione
, e possibile stabilire quale dei quattro nucleotidi si è legato alla catena
di DNA.
Un computer memorizza in un file i segnali elettrici provenienti dai sensori
e dallo stato delle valvole (aperte o chiuse).
Se si attaccano due o più nucleotidi dello stesso tipo in successione nella
catena, vi dovrebbe essere una differenza che i sensori sono in grado di
rilevare e tradurre (come segnale elettrico) in due o piu nucleotidi dello
stesso tipo invece di uno.
ATTUALI METODI:
----Da enciclopedia-----
Per procedere all'analisi della struttura del DNA, i frammenti di acido
nucleico vengono fissati in piastre analoghe a quella qui illustrata,
costituite da gel, nelle quali per elettroforesi è avvenuta la separazione
delle diverse componenti. In tal modo, ricorrendo a sofisticate elaborazioni
al computer, i frammenti possono essere confrontati con sequenze già note ed
essere decifrati.
[......]
Lo studio del genoma implica il sequenziamento del DNA, cioè
l'identificazione dell'esatta sequenza dei 3 miliardi di coppie di basi
azotate che ne compongono la molecola e la mappatura, ovvero la
determinazione della posizione occupata da ciascun gene rispetto agli altri.
[......]
Secondo il metodo sviluppato dal biochimico britannico Frederick Sanger,
specifiche porzioni di DNA vengono duplicate e modificate alle estremità
attraverso l'aggiunta di un composto fluorescente, diverso a seconda della
base azotata cui è legato. I sequenziatori automatici riconoscono con un
raggio laser il nucleotide modificato, e determinano l'esatto numero di
nucleotidi di ciascuna catena. Queste informazioni vengono integrate da un
computer, che ricostruisce la sequenza di coppie di basi presente nella
molecola di DNA originale.
[......]
Il risultato della Celera Genomics apparentemente metteva in concorrenza la
ricerca pubblica e quella privata. I laboratori di Venter hanno completato
il lavoro in sei mesi, avvalendosi di 300 apparecchiature per il
sequenziamento del DNA (sequenziatori), e di computer estremamente sofistica
ti, attivi 24 ore su 24. Per la ricerca è stata adottata una particolare
tecnica, il sequenziamento whole-genome shotgun: un campione contenente un
patrimonio genetico umano intero viene suddiviso in frammenti; questi
vengono analizzati separatamente dai sequenziatori; calcolatori elettronici
elaborano i dati in modo da ricomporre il puzzle delle sequenze di basi;
alla fine, si deve procedere alla mappatura. Al contrario, i laboratori del
Progetto Genoma Umano hanno proceduto frazionando il DNA in frammenti,
mappando i geni di ciascuna porzione e sequenziando infine la molecola
dell'acido nucleico.
----Fine-----------------

 NUOVA TECNICA PER IL SEQUENZIAMENTO DEL DNA (se non l'anno già inventata):
[CUT]
O___o
Quando riparte Zelig?...
-- 
Do. Or do not. There is no try.

> (se non l'anno già inventata):
la grammatica l'hanno già inventata di sicuro

Non c'č nessuno che vuole suggerire come migliorare il procedimento? E
contribuire alla sua ideazione?
Ricevo sempre commenti negativi.

Tizio wrote:

fatti delle domande.



Povero!!
Non ti crucciare, sta pur certo che la maggioranza silenziosa ti
sostiene. In particolare hai tutta la mia stima.
ciao

Tizio wrote:

Ma perche' non ti metti a studiare sul serio senza tirare in ballo roba 
da enciclopedie? ma che cultura di base hai?
Comunque studiati la tecnica di sequenziamento di Sanger che male non ti fa.
Saluti
                                 Sandro

 Comunque studiati la tecnica di sequenziamento di Sanger
Il mio mononeurone perde colpi...
Era il metodo enzimatico con i dideossi?
