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Titolo: La funzionalità delle proteine

Mi piacerebbe chiarirmi un po' le idee riguardo a una affermazione riportata
dal Curtis-Barnes "Invito alla biologia", secondo la quale la specificità
degli enzimi (e quindi delle proteine in generale), dipende dalla struttura
primaria, cosa che non mi trova affatto d'accordo.
Una proteina denaturata, pur mantenendo la propria struttura primaria, perde
la propria funzionalità, in seguito a perdita della struttura terziaria.
Inoltre le patologia causate da prioni agiscono, appunto, alterando la
struttura terziaria delle proteine normali e, quindi, la loro funzionalità
Bye
--
"Salve. Voi capire me? Qualcuno parlare mia lingua?"
"Siamo in Africa, signore. Non su Marte"

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8ff662$fc8$1...@pegasus.tiscalinet.it...
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 primaria, cosa che non mi trova affatto d'accordo.
Forse voleva dire che alterando la struttura primaria, cioè la sequenza
aminoacidica, le proprietà di un enzima si alterano drasticamente. E questo
è vero quasi in qualunque circostanza.
Ovviamente la perdita di funzionalità può riguardare anche gli altri (e più
complessi) livelli di struttura, ma il discorso si fa più fine.
--
Emanuele Passerini
ema.pa...@libero.it
http://meltingpot.fortunecity.com/pakistan/72
ICQ# 34957310

 agli isoenzimi).
In una diversa sezione del libro, l'autore parla di specificità di un enzima
come capacità di catalizzare una o, al massimo, un tipo di reazione
biochimica. Quindi il legame enzima-substrato riguarda, in questo senso, la
specificità enzimatica.
E' chiaro che la struttura III dipende dalla sequenza amminoacidica, come
anche il legame con il substrato. Sta di fatto che il mantenimento della
sola struttura I non è condizione sufficiente perchè l'enzima (o la proteina
in, generale) possa funzionare.
La tua interpretazione, d'altronde, è corretta. Forse l'autore (o meglio, il
traduttore) avrebe dovuto utilizzare un termine diverso da specificità.
Magari sarebbe stato più corretto parlare di funzionalità. E' una faccenda,
temo, senza vie di uscita, data la stretta correlazione fra i diversi ordini
di struttura: la replica potrebbe essere che una mutazione che abbia come
conseguenza una modificazione della struttura I dell'enzima può produrre lo
stesso effetto (inattivazione, x es.).
Non sono invece in accordo con l'uso del termine attività, in quanto essa,
mi pare, è definita come velocità della reazione catalizzata, non come
legame enzima-substrato, anche se è dalla formazione di questo legame che
essa dipende.
Bye

 wrote in message
news:8fh4e5$bm5$2...@pegasus.tiscalinet.it...
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Son daccordissimo con luiss! essenzialmente la specificità dipende da
entrambe le cose (e non puo esistere specificità della struttura secondaria
senza una sequenza aminoacidica particolare che la determina
inequivocabilmente) semmai, se vogliamo essere pignoli ci possono essere
delle modificazioni post-traduzionali che ne possono modificare od alterare
l'attività, e cio comunque è sbagliato dire che non sia dipendente dalla
struttura primaria, dato che tali enzimi che fanno modificazioni
post-traduzionali devono riconosce la proteina da modificare (mica ne
prendono una a caso!!) e... di solito ne riconoscono una breve seq. primaria
(come una specie di codice a barre che la identifica inequivocabilmente)
Ciao!!!!
Renato

 (come una specie di codice a barre che la identifica inequivocabilmente)
Comincio a pensare di essermi spiegato proprio male. Io non contesto il
fatto che la specificità dipenda anche dalla struttura I, ma il fatto che
l'autore da me citato pare indicare la struttura I non solo come principale,
ma addirittura come UNICA responsabile della specificità.
In questo modo però un sacco di cose non tornano: il sito attivo di un
enzima o anche di un anticorpo non è detto debba essere costruito da una
breve sequenza I di amminoacidi, in quanto possiamo ritrovarvi amminoacidi
distanti nella struttura I, che però si trovano vicini in quella III; le
modificazioni indotte dalle patologie da prioni alterano la struttura III
delle proteine, senza intaccarne la struttura I; al limite, una tale
modificazione potrebbe nascondere o alterare un epitopo, apportando, a
maggior ragione, una modificazione della specificità.
Questo nulla toglie alla importanza della struttura I. Tutt'altro. Solo, non
sono d'accordo sull'indicarla come unica o principale responsabile della
specificità, essendo questa determinata da una molteplicità di fattori.
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