Newsgroup: it.scienza.biologia
Titolo: folding@homr team


Interessante, ma che algoritmo viene utilizzato? E poi si tratta di un
progetto che si basa sul fold recognition, sull'homology modelling o si basa
sulla predizione in base alle proprietà fisico-chimiche determinabili in
base alla sequenza?
dawe
--------------------------------
Inviato via 
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Il Thu, 17 Apr 2003 14:44:01 +0000, dawe ha scritto:
[...]
http://folding.stanford.edu/papers/SPdynamics.pdf
http://folding.stanford.edu/papers/ZSPHairpin01.pdf
Saluti,
Federico 
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 dawe
Ti chiedo scusa se non ti riconosco a vista, ti ho già visto, ma non bazzico
spessissimo il NG...
Tuttavia, che cosa fai?Anche tu studente, o già lavoratore?E dove di bello?
...che dici sei stato fortunato tu, o nel campo della bioinformatica c'è
spazio? (spazio?!?!? mi sa che mancano sopratutto i soldi... nella
ricerca...)
Ciao ciao...
Riky
--
______________________
Tecnologie biomolecolari: spiegazioni interattive per capire la biologia
molecolare
www.molecularlab.it
(Sito del mese di Newton)


Biotecnologie informatiche? Esiste anche questo? E dove? Io sono laureato in
biotecnologie "vecchia guardia" agrarie e sto seguendo di questi tempi un
master in bioinformatica (anche se me ne interesso da mooolto tempo). Il la
predizione del folding delle proteine è un argomento davvero stimolante ma
non è quello di cui vorrei/voglio occuparmi. Per il lavoro... beh, son tempi
duri per tutti. Dipende poi da che vuoi fare, neh! Se vuoi rimanere in
università si fanno tante cose tra cui, per esempio, lo studio del folding,
ma per guadagnare si va in industria. In Italia ci son 2-3 farmaceutiche
interessate ai bioinformatici, per esempio io dovrei finire in una di esse a
fare analisi di sequenze per individuare sonde per attinomiceti (che servono
poi per fare antibiotici). Se hai sotto "un bel paio di palle" ti invito a
rispondere alle selezioni dell'EMBL (non ricordo il link, vai su
www.ebi.ac.uk
, segui per jobs o vacancies....) oppure a quelle del SIB... ma
poi magari già lavori e stai bene...
dawe

dawe wrote:
| Biotecnologie informatiche? Esiste anche questo? E dove?
a Milano Bicocca esiste una laurea specialistica (secondo lo schema 3+2)
in bioinformatica.
mi sembra che tu stia facendo lì il master (se non ricordo male ...)
--
Ciao !
Matteo aka GecKo
studente di Biotecnologie Sanitarie (ancora per poco ... )
Università delgi studi di Milano - Bicocca

 mi sembra che tu stia facendo lě il master (se non ricordo male ...)
Se stai facendo li il Master, usate i laboratori del Biopolo se non erro
vero ? In caso ci vedremo presto... 
Byez!
MacLinuZ
-- 
MacLinuZ aka Marco Mariotti
Intestazione e-mail modificata !

Si sto facendo il master e non ho scelto la laurea specialistica perchè no
ho altri 2 anni da perdere (me piacerebbe anche lavorare bene e con
dedizione...).
Non so se useremo i lab del biopolo, a che lab ti riferisci tu?
dawe


in qualsiasi caso si potrebbe fare un mini raduno di biotecnologi in
bicocca, tanto io e Mac già ci consciamo ...
--
Ciao !
Matteo aka GecKo
studente di Biotecnologie Sanitarie



Ed infine ricordo il tutto, ci si era sentito in un precedente post che
avevo fatto in risposta ad un ragazzo nell'ambito della bioinformatica... ed
è stato quando hai fatto il test di ingresso per il dottorato... ricordo il
tuo festoso annuncio nell'esserci riuscito ^__^
Ciao ciao...
Riky

Riky wrote:
| ..Sigh che tristezza... Ma la verità è che esattamente non so cosa
| voglio fare  ^__^ io nel mio corso di studi, da un approccio
| biologico delle superiori sono passato a quello biotecnologo (agrario
| anche io), per poi trasferirmi là dove potevo fare l'indirizzo di
| bioinformatica. Passaggi tutti azzzeccati, secondo me (inteso come
| che mi piace quel che faccio ora), ma non so bene ancora gestire
| l'ambito bioinformatico, e quindi sceglietre...
beh, allora ci si vedrà l'anno prossimo ... io non farò bioinformatica, ma
l'indirizzo farmaco genomico è quello che più mi interessa ( ho deciso di
abbandonare le biotech sanitarie ...), anche se dovrò sanare un pò di
debiti di crediti ...
| Figata.... io invece farò dal 5 Maggio un tirocinio di 2 mesi all'
| Istituto di Oncolcogia Europeo, dove studierò profili di espressione
| genica di cellule in differenziamento (cellule mieloidi).
| Successovamente il confronto con cellule mieloidi tumorali.
scusa, non voglio essere invadente, ma questo "stage" (perchè  è quello
che vai a fare, vero ?) non è che centri molto con l'indirizzo agrario che
hai scelto ...
--
Ciao !
Matteo aka GecKo
vds SOS Lambrate - Milano

 hai scelto ...
Io dall'indirizzo di Biotecnologie Agrarie, sono passato all'indirizzo
bioinformatico, quindě non c'entro piů con agrario (o medico, farmaceutico,
industriale..),
lo stage, č bioinformatico.... se vogliamo con un risvolto e su apllicazioni
di tipo medico, ma io vado a studiare profili di espressione, che siano di
cellule umane, vegetali, animali, o che siano ricostruzione... non mi
interessa.
Imparerň a gestire una mole di dati cosě importante, e cercare di cavarne
qualcosa fuori, oltre che imparare gli applicativi naturalmente (e a farmi
un mazzo tanto dato che saranno due mesi di puro inglese dalla mattina alla
sera............
Have nice day boy....
I must go..
see you ...


Riky wrote:
| Io dall'indirizzo di Biotecnologie Agrarie, sono passato all'indirizzo
| bioinformatico, quindì non c'entro più con agrario (o medico,
| farmaceutico, industriale..),
| lo stage, è bioinformatico.... se vogliamo con un risvolto e su
| apllicazioni di tipo medico, ma io vado a studiare profili di
| espressione, che siano di cellule umane, vegetali, animali, o che
| siano ricostruzione... non mi interessa.
| Imparerò a gestire una mole di dati così importante, e cercare di
| cavarne qualcosa fuori, oltre che imparare gli applicativi
| naturalmente (e a farmi un mazzo tanto dato che saranno due mesi di
| puro inglese dalla mattina alla sera............
... fico ... peccato che io di bioinformatica non ci capisca niente ...
non so usare nemmeno un programma di modelling ...
--
Ciao !
Matteo aka GecKo


 non so usare nemmeno un programma di modelling .
...modechč???
che farebbe ?!?!?
Riky

Riky wrote:
|| non so usare nemmeno un programma di modelling .
| ...modechè???
| che farebbe ?!?!?
modelling = costruzione di modelli 3D proteici a partire dalla loro
sequenza amminoacidica (è incluso tutto un discorso sulla probabilità che
si formi una struttura 3D con un determinato folding ...)
se qualcuno lo sa spiegare meglio mi venga in aiuto !! ...


 wrote:

Concordo in pieno con te...
I laboratori sono quelli del biopolo, 5° piano dell'edificio di Scienze
Geologiche. Per intenderci quelli anche del Gene Chip.
Io inizio li il 5 del mese...
Come ha detto Gecko, io e lui già ci conosciamo, potremmo bere un caffé
ma direi che a questo punto é meglio continuare in pvt per non tediare
il ng... ;-)))
