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Titolo: z-dna e %gc

Ciao a tutti....
volevo chiedere se è nota la funzione del dna di tipo z o se è tuttora
sconosciuta....inoltre potreste dirmi cosa si intende per %GC?
Grazie mille!!!
--
C'è sempre una luce, anche nel tunnel più buio.
Nulla è scritto.
Tutto si può cambiare.
Andrea

 potreste dirmi cosa si intende per %GC?
E' quello che sembra, ossia il numero di guanosine e citosine in un Dna
diviso per il numero totale di nucleotidi e moltiplicato per cento.
Al suo aumentare aumenta pressoché linearmente la temperatura alla quale il
Dna è denaturato al 50%, in quanto G e C formano 3 legami idrogeno anziché
2.
Se ben ricordo, è in genere diversa tra eucarioti e procarioti.
ciao
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Danilo Giacomelli
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- Professore, è vero che c'è un'operazione con la quale una ragazza normale
può diventare come le subrette televisive?
- Certo, si chiama lobotomia.
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 ha scritto nel messaggio
news:rOCpa.50607$LB6.1...@news1.tin.it...


 e per la domanda sul dna in conformazione Z?
Non l'avevo mai sentito nominare.
Ho cercato in google e c'è un mucchio di roba.
Dai siti in italiano si capisce solo che è sinistrorso.
Questa pagina
http://web.mit.edu/newsoffice/tt/1995/aug16/40591.html
in inglese, parla di una proteina che si legherebbe a sequanze di Z-Dna.
ciao
--
Danilo Giacomelli
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Dice il Saggio: "Prima di urlare nel corridoio di aver
scoperto il DNB, controlla di non aver fatto correre il
gel con la polarità invertita".
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 ha scritto nel messaggio
news:4mEpa.88171$T34.2...@news2.tin.it...


 Grazie mille in ogni caso!!!
mi posi anche io lo stesso problema quando preparai biologia molecolare. 
speravo infatti che qualcuno rispondesse... 
vedo che in nove anni i testi di biologia molecolare non sono molto 
cambiati...
ladybat
si veste d'estate
di cielo e terra
il mendicante

 cambiati...
su Genetic Analysis 4th edition, Suzuki, Griffiths et al., leggo che la 
forma Z compare solo in cristalli di DNA preparati per via sintetica.
L'edizione non e' recente ma dice che e' allo studio se la forma Z si possa 
trovare anche in natura...
Copio: "this drawing depicts the structure as a left-handed helix of 
alternating guanines and cytosines, generated from the central four base 
pairs of CGCGCG. Phosphate groups on differents chains now face each other 
across the deep minor groove".
ladybat
-- 



DNA Z
è l'unica doppia elica sinistrorsa e ha il numero più alto di coppie di basi
per giro d'elica (12) e quindi è anche la meno spiralizzata (è la più
sottile).
ha un unico solco, nel quale la densità di cariche negative è più alta che
in ciascuno dei solchi della forma B.
la forma Z si riscontra nei polinucleotidi la cui sequenza consiste in
purine alternate a pirimidine.
è stata scoperta in vitro in presenza di condizioni abbastanza insolite,
utilizzando cioè un'alta concentrazione salina per contrastare l'aumento di
repulsione elettrostatica fra i nucleotidi, molto compressi nella doppia
elica sottile della forma Z ). è improbabile che questo DNA si formi in
vivo.
tratto da " IL GENE VI "  lewin
niente sulla funzione....

 volevo chiedere se è nota la funzione del dna di tipo z o se è tuttora
Io ho fatto una ricerca e ho trovato questo articolo:
Herbert A, Rich A. Left-handed Z-DNA: structure and function. Genetica 
1999;106(1-2):37-47
Z-DNA is a high energy conformer of B-DNA that forms in vivo during 
transcription as a result of torsional strain generated by a moving 
polymerase. An understanding of the biological role of Z-DNA has 
advanced with the discovery that the RNA editing enzyme double-stranded 
RNA adenosine deaminase type I (ADAR1) has motifs specific for the Z-DNA 
conformation. Editing by ADAR1 requires a double-stranded RNA substrate. 
In the cases known, the substrate is formed by folding an intron back 
onto the exon that is targeted for modification. The use of introns to 
direct processing of exons requires that editing occurs before splicing. 
Recognition of Z-DNA by ADAR1 may allow editing of nascent transcripts 
to be initiated immediately after transcription, ensuring that editing 
and splicing are performed in the correct sequence. Structural 
characterization of the Z-DNA binding domain indicates that it belongs 
to the winged helix-turn-helix class of proteins and is similar to the 
globular domain of histone-H5.
Devo essere sincera: non l'ho letto e non so se e' quello che cerchi tu, 
ma sono un po' di fretta !!
Ciao
Guya

 > volevo chiedere se è nota la funzione del dna di tipo z o se è tuttora
Io so che il DNA di tipo Z è localizzato in regioni attivamente trascritte,
mentre non è coinvolto nella replicazione.
Ciao
Mr Esox
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Inviato via 
http://usenet.libero.it

Sul DNA-Z ti do un consiglio: te inventa pure che tanto in biologia si può
dire molto e il contrario di molto.
L'importante è che sia plausibile. Oltre a quello che ti è stato scritto in
questo thread tieni conto che il DNA-Z potrebbe essere coinvolto nel
determinare si superavvolgimenti, rilassandoli, proprio perchè si avvolge
in senso opposto al B.
Poi il fatto che ci siano enzimi specifici per il DNA-Z puoi supportarlo
(almeno in teoria) con il fatto che il passo dell'elica è diverso, che le
dimensioni dei solchi sono diverse e che quindi i motivi di DNA-binding
possono essere specifici... a tutto questo aggiungi che "la letteratura è
molto vaga a questo proposito". Cmq secondo me se un docente ti chiede il
DNA-Z e si accanisce su di esso è proprio un puzzone, io gli risponderei
qlcs del tipo "una domanda sul DNA-Z è un insulto alle mie conoscenze in
questo campo, preferirei parlare della dinamica molecolare del complesso di
trascrizione!"
:)
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dawe
www.daweonline.tk