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Titolo: Perché l'emoglobina ha la struttura  che ha?

... Aehm.... scusate la domanda idiota ma non sono un 
biologo. A spanne, posso idealmente immaginare una 
gran quantità di molecole con la stessa energia di 
legame con l'ossigeno, e prima di andare a pensare a 
un peso molecolare di 45.000 e passa, ce ne vuole, pur 
con tutte le possibili questioni steriche. Un amico 
biologo mi ha detto che la struttura della molecola è 
"dovuta" alla necessità di variare l'energia di legame 
in dipendenza della CO2 presente (e infatti lo si vede 
dalla curva di dissociazione), e come controesempio mi 
ha citato la mioglobina che non si comporta in tal modo.
Ora la domanda: esistono una quantità di siti e info 
sulla biochimica ma non ho mai trovato nulla che sia 
impostato sulle questioni strutturali come quella che 
mi interessa, magari con una serie di controesempi 
tipo "se sostituissimo questo atomo con quest'altro, 
succede quest'altra cosa ancora". C'è da qualche parte 
in rete la "spiegazione" della forma dell'emoglobina 
con un minimo di dettaglio? Il massimo sarebbe qualche 
bel sito di più ampio respiro, ma anche quanto sopra 
sarebbe già molto. In altre parole, per come vedo le 
cose, c'è qualche Monod, con un profondo amore per la 
biochimica, che abbia cercato di trasmetterne la poesia?
Grazie a chi potrà darmi una mano!
Apx.

Ciao! Ammetto di non avere capito molto bene quello che vuoi sapere... :)
Azzardo tuttavia una risposta, almeno a quello che io penso tu voglia
sapere. Fermami se parto per la tangente.
Premetto che neanche io sono un biologo.
La vera molecola reattiva e trasportatrice di ossigeno è il gruppo eme, la
porfirina che sta proprio nel mezzo della molecola di emoglobina, ma anche
della mioglobina, o meglio, l'atomo di ferro che sta nel mezzo del gruppo
eme che sta in mezzo alla molecola.
Questo atomo è molto suscettibile alle ossidazioni. Se viene ossidato perde
la sua funzionalita di trasportatore di ossigeno. Siccome deve viaggiare in
un mezzo acquoso, che di suo è molto ossidante, deve viaggiare protetto. E
qui entra in gioco la catena proteica, che si avvolge attorno all'eme e lo
isola al meglio dal mezzo liquido, perche espone all'estero gli aminoacidi
idrofili e lascia all'interno quelli idrofobi, che tengono lontana l'acqua e
aiutano a tenere a posto il gruppo eme, anche lui idrofobo, che è anche
legato covalentemente alla catena.
Naturalmente la molecola non deve essere COMPLETAMENTE isolata, altrimenti
perderebbe di utilita. Lascia quindi esposto il sito di legame, in una sorta
di compromesso tra esposizione e protezione.
Quando una molecola di O2 si lega al primo gruppo eme dell'emoglobina questa
si "agita" un po e rende piu facile alle altre 3 molecole di ossigeno che Hb
puo portare il legame con i rispettivi eme. E questo spiega la curva di
saturazione.
In piu il fatto che l'Hb sia proteica la rende sensibile alle variazioni di
pH, fatto ampiamente sfruttato dai tessuti, per facilitare la liberazione di
ossigeno dove ce ne sia bisogno (effetto Bohr), visto che dove l'O2 è
necessario c'è tanta CO2, che si scioglie in acqua (nel plasma) formando
acido carbonico, che abbassa il pH e sposta la curva di dissociazione a
destra, causando liberazione di O2.
Spero di essere stato esauriente e, soprattutto, di non aver scritto troppe
cazzate! :)
Se manca qualcosa, chiedi pure!
-- 
CiaociaO!
Marco!!!
rutman(at)
katmail.com
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Remember what old Jack Burton does when the earth quakes
and the poison arrows fall from the sky in sheets as thick as
lead and the pillars of heaven shake.
Yeah, Jack Burton just looks that big old storm right square
in the eye and he says: "Gimme your best shot, pal. I can take it"


Scusa il ritardo con cui ti ringrazio ma ero 
incasinato..... era esattamente quel che cercavo, 
anche se mi chiedo fino a che punto di dettaglio si 
conoscano questo tipo di questioni. Che so, attaccando 
il gruppo eme a una catena leggermente diversa 
l'esposizione del gruppo all'esterno è tale che la 
curva di dissociazione che ne risulta scasina 
indirettamente certe reazioni eccetera. Ma credo che 
da questi punti di vista la biologia sia ancora agli 
inizi, anche se per questa perplessità posso meritarmi 
una bella rampognata....
grazie ancora!!!
Apx.