Newsgroup: it.scienza.biologia
Titolo: ossidazione amminoacidi...please rispondete al piu' presto

scusate se scocciamo ancora ma rivedendo alcuni argomenti dell'esame di
biochimica che abbiamo la settimana prossima, vorremo chiarimenti inerenti
all'ossidazione degli aminoacidi in particolare circa la sintesi del
glutammato , glutammina e carbamilfosfato e la relazione di queste con
l'amminazione riduttiva dell'alfa-chetoglutarato, produzione dell'azoto
ammidico e reazione di ammidazione mediante l'aparagina sintetasi.
ringraziamo chiunque ci possa dare queste delucidazioni!
Veronica e Daniela

La risposta è un po' complessa per un biologo che non si occupa in maniera
specifica di cicli metabolici, ma se chiedete a Soviet Mario ( che è un
chimico organico ) su it.scienza.chimica avrete tutte le risposte in modo
chiaro ed esauriente. E in brevissimo tempo... provare per credere!!!
In bocca a lupo per l'esame.
Andrea.

 ha scritto nel messaggio
news:nNR%9.130196$0v.37...@news1.tin.it...

Scusate se mi intrometto, ma sono tutte domande da libro di testo. Stryer o
Lenhingher ? In biblioteca dovreste trovarli .
Ciao

se forse stiamo chiedendo al news group è perchè non siamo all'università ma
a casa a studiare e visto che l'uni è distante abbiamo pensato di trovare
nel news group qualcuno che poteva aiutarci!

 ha scritto nel messaggio
news:HlV%9.131523$0v.37...@news1.tin.it...

Non volevo essere insolente... solo che con un libro di testo in mano e'
piu' facile: ci sono schemi, disegni utili a capire.
In particolare x ogni composto cosa vi serve sapere ? 1 domanda alla volta
?.
Scusare l'irruenza, non volevo sembrare cafone.
Ciao.

 Veronica e Daniela
1)nel citosol....
   alfa-chetoglutarato + L-aminoacido <---------> L-glutammto +
alfa-chetoacido
..che è una transaminazione (catal. dalle transaminasi)
2) nei mitocondri, il glutammato viene sottoposto a deamminazione ossidativa
(glutammato deidrogenasi)
     glutammato + H2O <---------> alfa-chetoglutarato + ione ammonio
I due processi di sopra configuano insieme la "transdeamminazione" e solo
pochi aa vanno incontro direttamente alla sola deamminazione ossidativa
2) La glutammina viene utilizzata come trasportatore di gruppi amminici
(attraversa le membrane facilmente a differenza del glutammato) e viene
sintetizzata ad opera della glutammina sintetasi
glutammato + ATP + ione ammonio <--------> glutammina + ADP + P.inorganico
(intermedio: gamma-glutammil fosfato)
Giunta nel fegato (nei mitocondri) , la glutammina rilascia l'azoto ammidico
sotto forma di ammoniaca (glutamminasi)
glutammina + H2O <----------> glutammato + ione ammonio
3) poi c'è il ciclo glucosio-alanina......che non avete chiesto...e che
serve a trasportare l'ammoniaca dai muscoli al fegato (altra funzione di
trasporto)
4) finalmente siamo giunti al destino che gli ioni ammonio, prodotti da
tutte le reazioni fin qui elencate (glutammico deidrogasi, glutamminasi e
alanina amminotransferasi), faranno.
Siamo coè giunti al ciclo dell'urea (nel fegato) in cui gli ioni ammonio,
qualunque ne sia la fonte, vengono fatti reagire (occhio al fatto che il
ciclo dell'urea si compone di diverse reazioni enzimatiche distribuite in
due compartimenti: citosolico e mitocondriale), per opera della carbamil
fosfato sintetasi I, con il bicarbonato di provenienza dalla respirazione
mitocondriale.
bicarbonato + 2ATP +ione ammonio <---------->  2ADP +P.inorg. + carbamil
fosfato.
Il carbamil fosfato entra nel ciclo dell'urea (4 tappe enzimatiche):
1) carbamil-fosfato + ornitina <---------->citrullina + P.inorg. (ornitina
transcarbamilasi)
2)La citrullina così formatasi esce dai mitocondri e riceve dall'aspartato
citosolico (giunto nel citosol dai mitocondri, dove era stato generato per
transamminazione) un seconto gruppo amminico: si genera così
argininosuccinato (argininosuccinato sintetasi)
3) l'argininosuccinato viene poi scisso dall'argininosuccinato liasi in
arginina e fumarato (quest'ultimo entra nel ciclo dell'acido citrico)
4) l'enzima citosolico arginasi, scinde l'arginina in ornitina ed urea:
l'ornitina rientra nei mitocondri ed il ciclo riprende.
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Fin qui abbiamo parlato fondamentalmente del ciclo dell'urea e del
catabolismo degli aa. Tu però chiedi anche dell'asparagina sintetasi che è
un enzima coinvolto però non nel catabolismo ma nella sintesi degli
aminoacidi. Già: l'asparagina si forma per ammidazione dell'aspartato e la
glutammina è il donatore dello ione ammonio in questa reazione (ricorda che
l'enzima in questione, l'asparagina sintetasi, essendo un sintetasi utilizza
ATP).
Ciao