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Titolo: [Genetica Vegetale] Strumenti

Ho un'idea per un progetto nella mia testa e vorrei conoscere i costi 
economici o le strade per arrivare a realizzarla.
Allora, il progetto è quello di creare un database del codice genetico 
di ciascuna delle speci vegetali spontanee che trovo nei "miei" boschi.
Prevedendo che la spesa per poter comprare gli strumenti materiali 
necessari per "leggere" il codice genetico sia troppo elevata, vorrei 
comunque sapere il nome di tutti gli strumenti necessari per 
la "lettura" del codice genetico di una pianta.
Inoltre vorrei sapere se tutti le parti di una pianta 
(fusto,foglie,fiori,semi,radici etc...) contengono gli elementi 
necessari per "leggere" il codice genetico di essa.
Grazie
P.S. So che per realizzare questo "sogno" dovrò collaborare con qualche 
università che magari ha tutti gli strumenti, ma gli aspetti 
burocratici (tanto importanti in questa società) sono l'ultimo passo 
che voglio affrontare.

 di ciascuna delle speci vegetali spontanee che trovo nei "miei" boschi.
Cioè tu vorresti sequenziare tutto il genoma di tutte le speci vegetali 
spontanee che trovi nei "tuoi" boschi?
1 - A che pro?
2 - Cerca quanto è costato, in tempo e soldi, il "progetto genoma" umano.

 di ciascuna delle speci vegetali spontanee che trovo nei "miei" boschi.
L'idea è simpatica, ma al momento attuale manca la tecnologia. Non dovresti
collaborare con un'università, dovresti farlo mettere come priorità alle
Nazioni Unite e agli USA, e probabilmente i finanziamenti non basterebbero
ancora :-)
La cosa è un pochettino più complessa di come pensi tu, temo. Ma magari, fra
vent'anni...
Danilo
 
--------------------------------
Inviato via 
http://arianna.libero.it/usenet/

 Ma magari, fra vent'anni...
Ma non penso proprio che sia problema di tecnologia.
Rubens vorrebbe realizzare un "Progetto Genoma Vegetale" così come è stato fatto per l'uomo
e se si può decodificare il genoma nucleare si può fare anche per il mitocondriale e
il plastidico, e in effetti già si fa o si è fatto, ad es. per Triticum aestivum, Zea mays e 
Brassica napus napus ad opera di Monsanto.
E' noto tutto il genoma di Arabidopsis thaliana fin dal 2001 ( ho il cd-rom a casa, gentile
omaggio della Novartis... )
Oppure non ho capito a quali "insormontabili difficoltà tecniche" ti riferisci.... ;-)
Che poi serva una fracca di soldi, questo è acclarato! Magari ci fai un prestito tu?? ;-))))
In ogni caso faccio mia la perplessità di Guybrush : anche ammesso di voler utilizzare
l'informazione per scopi filogenetici o
tassonomici molecolari, non serve l'intero genoma....
quindi - in generale - a che scopo??
Ciao
-- 
Andrea
***
Si deve portare il massimo rispetto per *ogni* cosa che cresca
in modo esponenziale, non importa quanto piccola essa sia...
(Garrett Hardin - 1968)
Io ne ho viste cose che voi Umani non potreste immaginare...
(Blade Runner - 1982)

 2 - Cerca quanto è costato, in tempo e soldi, il "progetto genoma" umano.
Questo è interessante : 
http://www.jgi.doe.gov/education/index.html
 ;
dà un'idea del progetto genoma, dalle attrezzature ai tempi ai costi....


 Che poi serva una fracca di soldi, questo è acclarato! Magari ci fai un prestito tu?? ;-))))
Appunto. I problemi tecnici, il 90% delle volte, riguardano i soldi che 
ci vorrebbero.


 sue conoscenze..)
Non mi sembra che tu abbia letto con attenzione i precedenti post di Rubens
sulla tassonomia molecolare e le mie risposte in merito....
Prego, provvedere.  
;-))


 conoscenza e cacciatelo" ;-)
Beh, non so a livello di profitto (per quanto potrebbe esserci), ma a
livello di scienza l'utilità sarebbe indubbia.
Sono d'accordo che per una tassonomia arbitraria va bene un marcatore
qualsiasi, ma vuoi mettere una tassonomia e una filogenesi cladistica con la
mappatura dell'intero genoma alle spalle? Praticamente sarebbe eliminato
quasi tutto il rumore di fondo.
Oddio, rimarrebbe il problemino di confrontare qualche migliaio (o milione,
se vogliamo fare sul serio) di genomi di qualche miliardo di basi ciascuno.
_Dopo_ averli mappati, intendo :-)


 conoscenza e cacciatelo" ;-)
Beh, non so a livello di profitto (per quanto potrebbe esserci), ma a
livello di scienza l'utilità sarebbe indubbia.
Sono d'accordo che per una tassonomia arbitraria va bene un marcatore
qualsiasi, ma vuoi mettere una tassonomia e una filogenesi cladistica con la
mappatura dell'intero genoma alle spalle? Praticamente sarebbe eliminato
quasi tutto il rumore di fondo.
Oddio, rimarrebbe il problemino di confrontare qualche migliaio (o milione,
se vogliamo fare sul serio) di genomi di qualche miliardo di basi ciascuno.
_Dopo_ averli mappati, intendo :-)
Danilo
