OTAR3088/BioData-CellLine_annotated · Datasets at Hugging Face

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PMC11413393	To determine if the anti-proliferative effects of type I PRMT inhibition in ccRCC cell lines translate to antitumor activity in vivo, we evaluated the efficacy of MS023 treatment in ccRCC xenografts.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "determine", "if", "the", "anti-proliferative", "effects", "of", "type", "I", "PRMT", "inhibition", "in", "ccRCC", "cell", "lines", "translate", "to", "antitumor", "activity", "in", "vivo", ",", "we", "evaluated", "the", "efficacy", "of", "MS023", "treatment", "in", "ccRCC", "xenografts", "." ] } ]
PMC11267036	To figure out the role of DHM on EMT in MM cells, the protein expression levels of EMT indicators, E-cadherin and N-cadherin, were detected in U266 and RPMI-8226 cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "figure", "out", "the", "role", "of", "DHM", "on", "EMT", "in", "MM", "cells", ",", "the", "protein", "expression", "levels", "of", "EMT", "indicators", ",", "E-cadherin", "and", "N-cadherin", ",", "were", "detected", "in", "U266", "and", "RPMI-8226", "cells", "." ] } ]
PMC11413393	Source data are provided as a Source Data file.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Source", "data", "are", "provided", "as", "a", "Source", "Data", "file", "." ] } ]
PMC5673060	As shown in our previous study, the two resistant cell lines are highly sensitive to ponatinib treatment .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "shown", "in", "our", "previous", "study", ",", "the", "two", "resistant", "cell", "lines", "are", "highly", "sensitive", "to", "ponatinib", "treatment", "." ] } ]
PMC10547921	Then obtain phenol CBI analogs 77, 78 and amino CBI analogs 79, 80.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Then", "obtain", "phenol", "CBI", "analogs", "77", ",", "78", "and", "amino", "CBI", "analogs", "79", ",", "80", "." ] } ]
PMC6803987	HepG2.2.15 cells were inoculated in culture dishes (2 × 10 cells/mL).	[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "HepG2.2.15", "cells", "were", "inoculated", "in", "culture", "dishes", "(", "2", "×", "10", "cells/mL", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Next, we performed RNA-sequencing in CreER (estrogen receptor) pro-T cells 24 hours after activation of TLX3 expression by adding tamoxifen.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Next", ",", "we", "performed", "RNA-sequencing", "in", "CreER", "(", "estrogen", "receptor", ")", "pro-T", "cells", "24", "hours", "after", "activation", "of", "TLX3", "expression", "by", "adding", "tamoxifen", "." ] } ]
PMC11742231	Over the past few years, the growing accessibility of molecular data obtained from individuals affected by cancer has instigated the advancement of various extensive drug response initiatives.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Over", "the", "past", "few", "years", ",", "the", "growing", "accessibility", "of", "molecular", "data", "obtained", "from", "individuals", "affected", "by", "cancer", "has", "instigated", "the", "advancement", "of", "various", "extensive", "drug", "response", "initiatives", "." ] } ]
PMC9429973	Interestingly, TIGIT+ Tregs are more immunosuppressive than their TIGIT- Treg counterparts and express higher levels of several transcription factors, including Ahr and Hif1α (Joller et al., Immunity, 2014), both involved in the cellular response to microenvironment-mediated stimuli.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interestingly", ",", "TIGIT+", "Tregs", "are", "more", "immunosuppressive", "than", "their", "TIGIT-", "Treg", "counterparts", "and", "express", "higher", "levels", "of", "several", "transcription", "factors", ",", "including", "Ahr", "and", "Hif1α", "(", "Joller", "et", "al.", ",", "Immunity", ",", "2014", ")", ",", "both", "involved", "in", "the", "cellular", "response", "to", "microenvironment-mediated", "stimuli", "." ] } ]
PMC10976516	A range of cytokines, including interleukins, interferons, and tumor necrosis factor-α (TNF-α), are released by dying cells into the immediate environment, further enhancing cell-mediated immunity.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "range", "of", "cytokines", ",", "including", "interleukins", ",", "interferons", ",", "and", "tumor", "necrosis", "factor-α", "(", "TNF-α", ")", ",", "are", "released", "by", "dying", "cells", "into", "the", "immediate", "environment", ",", "further", "enhancing", "cell-mediated", "immunity", "." ] } ]
PMC9841531	All compounds showed functional inhibitory activities against MCT1 at low nanomolar concentrations and great antiproliferative activities against the MCT1-expressing cancer cell lines A-549 and MCF-7, while the compounds were selective over MCT4 (SLC16A4).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "compounds", "showed", "functional", "inhibitory", "activities", "against", "MCT1", "at", "low", "nanomolar", "concentrations", "and", "great", "antiproliferative", "activities", "against", "the", "MCT1-expressing", "cancer", "cell", "lines", "A-549", "and", "MCF-7", ",", "while", "the", "compounds", "were", "selective", "over", "MCT4", "(", "SLC16A4", ")", "." ] } ]
PMC9587298	Chromatographic analyses were performed in duplicate, and cell viability assays were performed in quadruplicate.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Chromatographic", "analyses", "were", "performed", "in", "duplicate", ",", "and", "cell", "viability", "assays", "were", "performed", "in", "quadruplicate", "." ] } ]
PMC11283030	P < 0.05, **P < 0.01 vs. VC.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "P", "<", "0.05", ",", "", "", "P", "<", "0.01", "vs.", "VC", "." ] } ]
PMC11678130	Based on the calculated IS values (Table 1), the QUE (10 µM) + 5-FU (10 µM) association was classified as non-irritant on the CAM.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Based", "on", "the", "calculated", "IS", "values", "(", "Table", "1", ")", ",", "the", "QUE", "(", "10", "µM", ")", "+", "5-FU", "(", "10", "µM", ")", "association", "was", "classified", "as", "non-irritant", "on", "the", "CAM", "." ] } ]
PMC9884169	After AVPI staining, it was shown that the knockdown of MCT4 could significantly promote cell apoptosis detected by flow cytometry (Figure 4(c)).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "AVPI", "staining", ",", "it", "was", "shown", "that", "the", "knockdown", "of", "MCT4", "could", "significantly", "promote", "cell", "apoptosis", "detected", "by", "flow", "cytometry", "(", "Figure", "4(c", ")", ")", "." ] } ]
PMC9429973	Of the pts receiving combination treatment, 19 with R/R CLL/SLL received BGB-11417 ≤160 mg and 7 with R/R MCL received ≤80 mg.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Of", "the", "pts", "receiving", "combination", "treatment", ",", "19", "with", "R/R", "CLL/SLL", "received", "BGB-11417", "≤160", "mg", "and", "7", "with", "R/R", "MCL", "received", "≤80", "mg", "." ] } ]
PMC9429973	R. Colombatti, C. Birkegård, M. Medici University of Padova, Padova, Italy; Novo Nordisk A/S, Søborg, Denmark Background: Sickle cell disease (SCD) has a high prevalence and social impact worldwide, with a high mortality within the first three years of life.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "R.", "Colombatti", ",", "C.", "Birkegård", ",", "M.", "Medici", "University", "of", "Padova", ",", "Padova", ",", "Italy", ";", "Novo", "Nordisk", "A/S", ",", "Søborg", ",", "Denmark", "Background", ":", "Sickle", "cell", "disease", "(", "SCD", ")", "has", "a", "high", "prevalence", "and", "social", "impact", "worldwide", ",", "with", "a", "high", "mortality", "within", "the", "first", "three", "years", "of", "life", "." ] } ]
PMC11754436	By contrast, downregulation of DHRS4-AS1 significantly inhibited the apoptosis of 143B cells and promoted cell proliferation (Fig. 1E, G and I).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "By", "contrast", ",", "downregulation", "of", "DHRS4-AS1", "significantly", "inhibited", "the", "apoptosis", "of", "143B", "cells", "and", "promoted", "cell", "proliferation", "(", "Fig.", "1E", ",", "G", "and", "I", ")", "." ] } ]
PMC6222635	T-series dextran was weighed precisely and dissolved in distilled water to obtain standard solutions.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "T-series", "dextran", "was", "weighed", "precisely", "and", "dissolved", "in", "distilled", "water", "to", "obtain", "standard", "solutions", "." ] } ]
PMC10454535	After 24 h, cells were lysed, and protein was extracted using RIPA lysis buffer (Thermo Fischer Scientific Inc.).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "24", "h", ",", "cells", "were", "lysed", ",", "and", "protein", "was", "extracted", "using", "RIPA", "lysis", "buffer", "(", "Thermo", "Fischer", "Scientific", "Inc.", ")", "." ] } ]
PMC11785489	Altogether, this process yielded 29 estimates of βTCR – mem for 29 groups of T cells, each specific to a different Dextramer.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Altogether", ",", "this", "process", "yielded", "29", "estimates", "of", "βTCR", "–", "mem", "for", "29", "groups", "of", "T", "cells", ",", "each", "specific", "to", "a", "different", "Dextramer", "." ] } ]
PMC7348793	Indeed, the PCR amplification of tandem repeats can result in products with a reduced number of repeat units and under certain conditions can lead to an increase in the number of repeats .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Indeed", ",", "the", "PCR", "amplification", "of", "tandem", "repeats", "can", "result", "in", "products", "with", "a", "reduced", "number", "of", "repeat", "units", "and", "under", "certain", "conditions", "can", "lead", "to", "an", "increase", "in", "the", "number", "of", "repeats", "." ] } ]
PMC11723947	We identified differentially expressed genes (DEG) as genes with an absolute log2 fold change greater than 1 and an adjusted p-value below 0.05.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "identified", "differentially", "expressed", "genes", "(", "DEG", ")", "as", "genes", "with", "an", "absolute", "log2", "fold", "change", "greater", "than", "1", "and", "an", "adjusted", "p-value", "below", "0.05", "." ] } ]
PMC9429973	Results: Twenty-five patients from six academic centers were treated with gilteritinib for FLT3-mutated R/R AML.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "Twenty-five", "patients", "from", "six", "academic", "centers", "were", "treated", "with", "gilteritinib", "for", "FLT3-mutated", "R/R", "AML", "." ] } ]
PMC11704834	These data indicated that E-cadherin repression in part underlies the TLE1-mediated resistance to gefitinib in lung cancer cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "data", "indicated", "that", "E-cadherin", "repression", "in", "part", "underlies", "the", "TLE1-mediated", "resistance", "to", "gefitinib", "in", "lung", "cancer", "cells", "." ] } ]
PMC11791264	Left panels provide a graphical representation of the accumulated number of migrated cells at 24 h, and the right panels show the representative images (200 × magnification).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Left", "panels", "provide", "a", "graphical", "representation", "of", "the", "accumulated", "number", "of", "migrated", "cells", "at", "24", "h", ",", "and", "the", "right", "panels", "show", "the", "representative", "images", "(", "200", "×", "magnification", ")", "." ] } ]
PMC11055323	ns, not significant.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ns", ",", "not", "significant", "." ] } ]
PMC9429973	Most of the work relies on thymic tissue removed during cardiac surgery to provide access to the heart and major cardiac vessels.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Most", "of", "the", "work", "relies", "on", "thymic", "tissue", "removed", "during", "cardiac", "surgery", "to", "provide", "access", "to", "the", "heart", "and", "major", "cardiac", "vessels", "." ] } ]
PMC11502327	The biological mechanism may be related to the effect of Baicalein on p38 Mitogen‐activated protein kinase(MAPK)-dependent NF-κB signaling pathway.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "biological", "mechanism", "may", "be", "related", "to", "the", "effect", "of", "Baicalein", "on", "p38", "Mitogen‐activated", "protein", "kinase(MAPK)-dependent", "NF-κB", "signaling", "pathway", "." ] } ]
PMC11583010	On PDXs from bladder, TNBC and ovarian cancer, and human skin (SciempathBio), detection of nectin-4 by IHC was performed on paraffin sections deparaffinized in three successive xylene immersions (3 minutes each) and rehydrated through a descending series of alcohol to water.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "PDXs", "from", "bladder", ",", "TNBC", "and", "ovarian", "cancer", ",", "and", "human", "skin", "(", "SciempathBio", ")", ",", "detection", "of", "nectin-4", "by", "IHC", "was", "performed", "on", "paraffin", "sections", "deparaffinized", "in", "three", "successive", "xylene", "immersions", "(", "3", "minutes", "each", ")", "and", "rehydrated", "through", "a", "descending", "series", "of", "alcohol", "to", "water", "." ] } ]
PMC6450504	The lack of cytotoxicity of empty liposomes also supports the safety of the carrier system achieved for two main reasons.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "lack", "of", "cytotoxicity", "of", "empty", "liposomes", "also", "supports", "the", "safety", "of", "the", "carrier", "system", "achieved", "for", "two", "main", "reasons", "." ] } ]
PMC11476222	The LC run lasted 25 min, programmed as follows: MPB was gradually increased to 60% over the first 14 min, held constant at 60% for 5 min, and then returned to 0% at 20 min until the end of the run.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "LC", "run", "lasted", "25", "min", ",", "programmed", "as", "follows", ":", "MPB", "was", "gradually", "increased", "to", "60", "%", "over", "the", "first", "14", "min", ",", "held", "constant", "at", "60", "%", "for", "5", "min", ",", "and", "then", "returned", "to", "0", "%", "at", "20", "min", "until", "the", "end", "of", "the", "run", "." ] } ]
PMC10891340	Cell culture supernatants were collected for TCID50.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell", "culture", "supernatants", "were", "collected", "for", "TCID50", "." ] } ]
PMC9622879	One of main problems of a system-centric CEMS is the poor computational time for solving its optimization problem.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "One", "of", "main", "problems", "of", "a", "system-centric", "CEMS", "is", "the", "poor", "computational", "time", "for", "solving", "its", "optimization", "problem", "." ] } ]
PMC11015054	p < 0.001.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "p", "<", "0.001", "." ] } ]
PMC11453018	For RNA sequencing (RNA-Seq), libraries were prepared from 500 ng of total RNA extracted from cells treated with iP300w (1.0 µM) for 4 h. Library preparation and sequencing (2 × 150 bp, 20M paired-end reads) was done at Azenta Life Science, USA.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "RNA", "sequencing", "(", "RNA-Seq", ")", ",", "libraries", "were", "prepared", "from", "500", "ng", "of", "total", "RNA", "extracted", "from", "cells", "treated", "with", "iP300w", "(", "1.0", "µM", ")", "for", "4", "h.", "Library", "preparation", "and", "sequencing", "(", "2", "×", "150", "bp", ",", "20", "M", "paired-end", "reads", ")", "was", "done", "at", "Azenta", "Life", "Science", ",", "USA", "." ] } ]
PMC5025404	This issue was resolved using dextran sulfate based anti-clumping agent (Lonza, Switzerland).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "issue", "was", "resolved", "using", "dextran", "sulfate", "based", "anti-clumping", "agent", "(", "Lonza", ",", "Switzerland", ")", "." ] } ]
PMC10523483	For qPCR, ROS measurement, GSH assay, n = 3 per group; for cell survival measurement by MTT assay, n = 4 to 5 per group.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "qPCR", ",", "ROS", "measurement", ",", "GSH", "assay", ",", "n", "=", "3", "per", "group", ";", "for", "cell", "survival", "measurement", "by", "MTT", "assay", ",", "n", "=", "4", "to", "5", "per", "group", "." ] } ]
PMC11698348	For depilation induced hair cycle, mice were anesthetized using ketamine and xylazine cocktail mixture (90–10 mg/kg, intraperitoneal injections) and kept in a heating pad during the depilation procedure.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "depilation", "induced", "hair", "cycle", ",", "mice", "were", "anesthetized", "using", "ketamine", "and", "xylazine", "cocktail", "mixture", "(", "90–10", "mg/kg", ",", "intraperitoneal", "injections", ")", "and", "kept", "in", "a", "heating", "pad", "during", "the", "depilation", "procedure", "." ] } ]
PMC11380454	C. Drug- and stress-related pathways.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "C.", "Drug-", "and", "stress-related", "pathways", "." ] } ]
PMC11743316	Earlier investigations revealed that VEGF and its receptor (VEGFR) have critical roles in pathological angiogenesis, notably cancer neovascularization, resulting in the emergence of numerous treatment techniques that target the VEGF system .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Earlier", "investigations", "revealed", "that", "VEGF", "and", "its", "receptor", "(", "VEGFR", ")", "have", "critical", "roles", "in", "pathological", "angiogenesis", ",", "notably", "cancer", "neovascularization", ",", "resulting", "in", "the", "emergence", "of", "numerous", "treatment", "techniques", "that", "target", "the", "VEGF", "system", "." ] } ]
PMC11739504	e, f) Fluorescence images showed comparison between ciliary markers under Kat2b silencing with serum starvation 6 h, 24 h. Arl13b marked ciliary membrane (green), ac-α-tubulin, marked ciliary axoneme (red), and nuclei were stained with DAPI (blue).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "e", ",", "f", ")", "Fluorescence", "images", "showed", "comparison", "between", "ciliary", "markers", "under", "Kat2b", "silencing", "with", "serum", "starvation", "6", "h", ",", "24", "h.", "Arl13b", "marked", "ciliary", "membrane", "(", "green", ")", ",", "ac-α-tubulin", ",", "marked", "ciliary", "axoneme", "(", "red", ")", ",", "and", "nuclei", "were", "stained", "with", "DAPI", "(", "blue", ")", "." ] } ]
PMC10213199	The higher the rich factor is, the higher the degree of enrichment.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "higher", "the", "rich", "factor", "is", ",", "the", "higher", "the", "degree", "of", "enrichment", "." ] } ]
PMC11732628	no. BL003A; 1:4,000; Biosharp, Anhui, China).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "no.", "BL003A", ";", "1:4,000", ";", "Biosharp", ",", "Anhui", ",", "China", ")", "." ] } ]
PMC10887351	β3-AR induced motility in pre-implantation embryos , in the first stages of embryogenesis , in embryo tissues and in the placenta of human and animal germ cells.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "β3-AR", "induced", "motility", "in", "pre-implantation", "embryos", ",", "in", "the", "first", "stages", "of", "embryogenesis", ",", "in", "embryo", "tissues", "and", "in", "the", "placenta", "of", "human", "and", "animal", "germ", "cells", "." ] } ]
PMC11470999	The current data do not clarify whether PF promotes CIP2A degradation through a molecular glue mechanism or allosteric modulation, indicating the need for further structural biology studies.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "current", "data", "do", "not", "clarify", "whether", "PF", "promotes", "CIP2A", "degradation", "through", "a", "molecular", "glue", "mechanism", "or", "allosteric", "modulation", ",", "indicating", "the", "need", "for", "further", "structural", "biology", "studies", "." ] } ]
PMC11627060	Nigella sativa seeds (N. sativa) have many bioactive compounds, such as the main ingredient thymoquinone (TQ) (2-isopropyl-5-methyl-1,4-benzoquinone), as well as monoterpenes like α-pinene and p-cymene, unique alkaloids like nigellone and nigellimine, and a saponin .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nigella", "sativa", "seeds", "(", "N.", "sativa", ")", "have", "many", "bioactive", "compounds", ",", "such", "as", "the", "main", "ingredient", "thymoquinone", "(", "TQ", ")", "(", "2-isopropyl-5-methyl-1,4-benzoquinone", ")", ",", "as", "well", "as", "monoterpenes", "like", "α-pinene", "and", "p-cymene", ",", "unique", "alkaloids", "like", "nigellone", "and", "nigellimine", ",", "and", "a", "saponin", "." ] } ]
PMC11129910	The membrane was incubated with anti-Rab25 monoclonal mouse IgG (ProMab, Albany, CA) overnight at 4°C.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "membrane", "was", "incubated", "with", "anti-Rab25", "monoclonal", "mouse", "IgG", "(", "ProMab", ",", "Albany", ",", "CA", ")", "overnight", "at", "4", "°", "C", "." ] } ]
PMC11653533	Worldwide, herbal medications are used to treat a wide range of illnesses and diseases (Hasnat H, Akter Shompa S, Tasnim Richi F, Mirazul Islam M, Hasan Suman M, Uddin Ahmed N, et al. Bioactive Secondary Metabolites to Combat Diabetic Complications: Evidenced from in Silico Study.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Worldwide", ",", "herbal", "medications", "are", "used", "to", "treat", "a", "wide", "range", "of", "illnesses", "and", "diseases", "(", "Hasnat", "H", ",", "Akter", "Shompa", "S", ",", "Tasnim", "Richi", "F", ",", "Mirazul", "Islam", "M", ",", "Hasan", "Suman", "M", ",", "Uddin", "Ahmed", "N", ",", "et", "al.", "Bioactive", "Secondary", "Metabolites", "to", "Combat", "Diabetic", "Complications", ":", "Evidenced", "from", "in", "Silico", "Study", "." ] } ]
PMC2614416	Comparative proteomics of a normal tissue against those of its tumor cell line could afford useful insights into qualitative and quantitative changes in proteins profiles following tumor development, and facilitate the discovery of novel markers of tumors.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Comparative", "proteomics", "of", "a", "normal", "tissue", "against", "those", "of", "its", "tumor", "cell", "line", "could", "afford", "useful", "insights", "into", "qualitative", "and", "quantitative", "changes", "in", "proteins", "profiles", "following", "tumor", "development", ",", "and", "facilitate", "the", "discovery", "of", "novel", "markers", "of", "tumors", "." ] } ]
PMC11687167	① MAPK signaling pathway.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "①", "MAPK", "signaling", "pathway", "." ] } ]
PMC9429973	Of note, all patients received enoxaparin for DVT prophylaxis during the intensification phase.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Of", "note", ",", "all", "patients", "received", "enoxaparin", "for", "DVT", "prophylaxis", "during", "the", "intensification", "phase", "." ] } ]
PMC9429973	Methods: Under the auspices of the European Hematology Association (EHA), the development of guidelines for the use of PROs in adult patients with haematological malignancies was conceptualised.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "Under", "the", "auspices", "of", "the", "European", "Hematology", "Association", "(", "EHA", ")", ",", "the", "development", "of", "guidelines", "for", "the", "use", "of", "PROs", "in", "adult", "patients", "with", "haematological", "malignancies", "was", "conceptualised", "." ] } ]
PMC7305184	Similar results were obtained also between CTRL + EP and EP group.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Similar", "results", "were", "obtained", "also", "between", "CTRL", "+", "EP", "and", "EP", "group", "." ] } ]
PMC11806106	However, this sensor was only sufficiently activated by endogenous peptide opioids like Met-enkephalin or its analogs.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "this", "sensor", "was", "only", "sufficiently", "activated", "by", "endogenous", "peptide", "opioids", "like", "Met-enkephalin", "or", "its", "analogs", "." ] } ]
PMC8357004	In colorectal cancer, the over-activity of DNMT3a and DNMT3b leads to cancer induction.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "colorectal", "cancer", ",", "the", "over-activity", "of", "DNMT3a", "and", "DNMT3b", "leads", "to", "cancer", "induction", "." ] } ]
PMC10523483	H1.2 was highly expressed in NSCLC tumors and promoted cancer cell growth. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "H1.2", "was", "highly", "expressed", "in", "NSCLC", "tumors", "and", "promoted", "cancer", "cell", "growth", ".", "(" ] } ]
PMC10936243	They are not concerned whether there is any bedding or anything in the cage” [D073]. “	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "They", "are", "not", "concerned", "whether", "there", "is", "any", "bedding", "or", "anything", "in", "the", "cage", "”", "[", "D073", "]", ".", "“" ] } ]
PMC9429973	Fifteen cases of pleural effusion (PEf) occurred, 5 within the first mo, and 12 in total by 24 mos; 3 were asymptomatically detected on chest x-ray.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Fifteen", "cases", "of", "pleural", "effusion", "(", "PEf", ")", "occurred", ",", "5", "within", "the", "first", "mo", ",", "and", "12", "in", "total", "by", "24", "mos", ";", "3", "were", "asymptomatically", "detected", "on", "chest", "x-ray", "." ] } ]
PMC9429973	Since activation of CXCR3, which is a receptor for chemokines Cxcl9 and Cxcl10, has been shown to induce chemotaxis of activated T cells, we treated allo-SCT mice with AMG487, an antagonist of CXCR3, resulted in an improved recovery of both perivascular niche cells and hematopoiesis in allo-SCT mice.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Since", "activation", "of", "CXCR3", ",", "which", "is", "a", "receptor", "for", "chemokines", "Cxcl9", "and", "Cxcl10", ",", "has", "been", "shown", "to", "induce", "chemotaxis", "of", "activated", "T", "cells", ",", "we", "treated", "allo-SCT", "mice", "with", "AMG487", ",", "an", "antagonist", "of", "CXCR3", ",", "resulted", "in", "an", "improved", "recovery", "of", "both", "perivascular", "niche", "cells", "and", "hematopoiesis", "in", "allo-SCT", "mice", "." ] } ]
PMC11763111	We used P2A ligation to clone CD38 CAR and LLT1 sequences into lentiviral PCDH vectors in order to investigate whether LLT1 overexpression in HLA-deficient CAR-T cells may decrease allogeneic NK cell rejection (Fig. 1A).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "used", "P2A", "ligation", "to", "clone", "CD38", "CAR", "and", "LLT1", "sequences", "into", "lentiviral", "PCDH", "vectors", "in", "order", "to", "investigate", "whether", "LLT1", "overexpression", "in", "HLA-deficient", "CAR-T", "cells", "may", "decrease", "allogeneic", "NK", "cell", "rejection", "(", "Fig.", "1A", ")", "." ] } ]
PMC11731614	This indicates that GFP-containing EVs originating in the epidermis are retrogradely trafficked into the DRG neuron cell body, where presumably they can initiate transcriptional changes due to their cargo.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "indicates", "that", "GFP-containing", "EVs", "originating", "in", "the", "epidermis", "are", "retrogradely", "trafficked", "into", "the", "DRG", "neuron", "cell", "body", ",", "where", "presumably", "they", "can", "initiate", "transcriptional", "changes", "due", "to", "their", "cargo", "." ] } ]
PMC11678841	Indeed, only the hyphal form has the capability to induce cell damage and activate the epithelial immune response, primarily driven by candidalysin, a cytolytic toxin secreted by C. albicans hyphae .	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Indeed", ",", "only", "the", "hyphal", "form", "has", "the", "capability", "to", "induce", "cell", "damage", "and", "activate", "the", "epithelial", "immune", "response", ",", "primarily", "driven", "by", "candidalysin", ",", "a", "cytolytic", "toxin", "secreted", "by", "C.", "albicans", "hyphae", "." ] } ]
PMC11545737	OspC3, in particular, catalyzes a post-translational modification, arginine ADP riboxanation, of caspase-4 Arg314 and caspase-11 Arg310.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "OspC3", ",", "in", "particular", ",", "catalyzes", "a", "post-translational", "modification", ",", "arginine", "ADP", "riboxanation", ",", "of", "caspase-4", "Arg314", "and", "caspase-11", "Arg310", "." ] } ]
PMC11406030	Upon reaching final concentrations, cells were grown in the absence of chemotherapeutic drugs for 2 weeks, followed by replacement of the drug and verification of resistance by the trypan blue cell viability and MTT cell proliferation assays.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Upon", "reaching", "final", "concentrations", ",", "cells", "were", "grown", "in", "the", "absence", "of", "chemotherapeutic", "drugs", "for", "2", "weeks", ",", "followed", "by", "replacement", "of", "the", "drug", "and", "verification", "of", "resistance", "by", "the", "trypan", "blue", "cell", "viability", "and", "MTT", "cell", "proliferation", "assays", "." ] } ]
PMC9429973	S. Zhang, H. Liu Beijing Hospital, Beijing, China Background: Acute myeloid leukemia (AML) is a malignant blood cancer that develops mainly in elderly adults and has dismal clinical outcomes.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "S.", "Zhang", ",", "H.", "Liu", "Beijing", "Hospital", ",", "Beijing", ",", "China", "Background", ":", "Acute", "myeloid", "leukemia", "(", "AML", ")", "is", "a", "malignant", "blood", "cancer", "that", "develops", "mainly", "in", "elderly", "adults", "and", "has", "dismal", "clinical", "outcomes", "." ] } ]
PMC11489175	Although USP8 targeting may appear not amenable due to the essential role of this gene in cell viability as shown by embryonic lethality in knockout mice 92, a certain degree of selectivity could be provided by increased expression in tumors.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Although", "USP8", "targeting", "may", "appear", "not", "amenable", "due", "to", "the", "essential", "role", "of", "this", "gene", "in", "cell", "viability", "as", "shown", "by", "embryonic", "lethality", "in", "knockout", "mice", "92", ",", "a", "certain", "degree", "of", "selectivity", "could", "be", "provided", "by", "increased", "expression", "in", "tumors", "." ] } ]
PMC11777207	Furthermore, the PD-L1 43H12 antibody clone also resulted in loss of CD80 on the surface of the DC as previously demonstrated with the PD-L1 10F9G.2 clone (figs. S4B and S2, D, F, and H) (6, 9).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "the", "PD-L1", "43H12", "antibody", "clone", "also", "resulted", "in", "loss", "of", "CD80", "on", "the", "surface", "of", "the", "DC", "as", "previously", "demonstrated", "with", "the", "PD-L1", "10F9G.2", "clone", "(", "figs.", "S4B", "and", "S2", ",", "D", ",", "F", ",", "and", "H", ")", "(", "6", ",", "9", ")", "." ] } ]
PMC11412721	Cell migration assays toward the chemokine CCL21 were performed with Boyden chambers essentially as described (Calpe et al., 2011) by measuring transwell migration across bare polycarbonate membranes with a pore size of 5 μm (Corning).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell", "migration", "assays", "toward", "the", "chemokine", "CCL21", "were", "performed", "with", "Boyden", "chambers", "essentially", "as", "described", "(", "Calpe", "et", "al.", ",", "2011", ")", "by", "measuring", "transwell", "migration", "across", "bare", "polycarbonate", "membranes", "with", "a", "pore", "size", "of", "5", "μm", "(", "Corning", ")", "." ] } ]
PMC11040965	A Representative western blots of PI3K/AKT pathway components in conditions of CD28 stimulation or blocking.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "Representative", "western", "blots", "of", "PI3K/AKT", "pathway", "components", "in", "conditions", "of", "CD28", "stimulation", "or", "blocking", "." ] } ]
PMC10999934	Increasing evidence indicates that the PI3K-Akt signaling pathway plays a role in chemoresistance, with PI3K activation leading to heightened chemoresistance in cases of ovarian cancer [, , ].	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Increasing", "evidence", "indicates", "that", "the", "PI3K-Akt", "signaling", "pathway", "plays", "a", "role", "in", "chemoresistance", ",", "with", "PI3", "K", "activation", "leading", "to", "heightened", "chemoresistance", "in", "cases", "of", "ovarian", "cancer", "[", ",", ",", "]", "." ] } ]
PMC3888431	6,887 new clusters could be introduced by our non-reference-based approach.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "6,887", "new", "clusters", "could", "be", "introduced", "by", "our", "non-reference-based", "approach", "." ] } ]
PMC11789597	Female six‐ to eight‐week‐old NOD‐Prkdc IL2rg/Bcgen (B‐NDG) mice were purchased from Biocytogen (Wakefield, MA, USA) and were housed and treated following conditions approved by the Institutional Animal Caring and Using Committee of Guangzhou Medical University (GY2023‐781).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Female", "six‐", "to", "eight‐week‐old", "NOD‐Prkdc", "IL2rg/Bcgen", "(", "B‐NDG", ")", "mice", "were", "purchased", "from", "Biocytogen", "(", "Wakefield", ",", "MA", ",", "USA", ")", "and", "were", "housed", "and", "treated", "following", "conditions", "approved", "by", "the", "Institutional", "Animal", "Caring", "and", "Using", "Committee", "of", "Guangzhou", "Medical", "University", "(", "GY2023‐781", ")", "." ] } ]
PMC10858941	B–E Quantification of HIF-1α (B, C) or p62 (D, E) levels (p < 0.05; p < 0.01; **p < 0.005; n = 6 U-251 MG, n = 5 A-172).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B", "–", "E", "Quantification", "of", "HIF-1α", "(", "B", ",", "C", ")", "or", "p62", "(", "D", ",", "E", ")", "levels", "(", "", "p", "<", "0.05", ";", "", "", "p", "<", "0.01", ";", "", "", "", "p", "<", "0.005", ";", "n", "=", "6", "U-251", "MG", ",", "n", "=", "5", "A-172", ")", "." ] } ]
PMC9351137	At least of 300 telophases were scored in two independent experiments for both treated cells and control HeLa cells. ***	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "At", "least", "of", "300", "telophases", "were", "scored", "in", "two", "independent", "experiments", "for", "both", "treated", "cells", "and", "control", "HeLa", "cells", ".", "", "", "*" ] } ]
PMC8633974	Nested PCR for assayed proviral DNA excision wherein unedited amplicons are 2986 bp and CRISPR-edited amplicons are approximately 525 bp.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Nested", "PCR", "for", "assayed", "proviral", "DNA", "excision", "wherein", "unedited", "amplicons", "are", "2986", "bp", "and", "CRISPR-edited", "amplicons", "are", "approximately", "525", "bp", "." ] } ]
PMC11670407	Taken together, these results suggest that OTULIN modulates GPX4 protein stability by preventing proteasomal protein degradation.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Taken", "together", ",", "these", "results", "suggest", "that", "OTULIN", "modulates", "GPX4", "protein", "stability", "by", "preventing", "proteasomal", "protein", "degradation", "." ] } ]
PMC10955424	Median cPARP/GAPDH band density relative to control RJY13-treated was calculated (E); malignant ascites n = 13, cirrhosis ascites n = 3, chemoresistance-inducing cirrhosis ascites n = 1, GAPDH was used as loading control. *	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Median", "cPARP/GAPDH", "band", "density", "relative", "to", "control", "RJY13-treated", "was", "calculated", "(", "E", ")", ";", "malignant", "ascites", "n", "=", "13", ",", "cirrhosis", "ascites", "n", "=", "3", ",", "chemoresistance-inducing", "cirrhosis", "ascites", "n", "=", "1", ",", "GAPDH", "was", "used", "as", "loading", "control", ".", "*" ] } ]
PMC11055510	In mice injected with A2780 cells, sh-circMAN1A2 inhibited IL1RAP protein levels and TAK1 phosphorylation compared with the sh-nc group (Fig. 9E).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "mice", "injected", "with", "A2780", "cells", ",", "sh-circMAN1A2", "inhibited", "IL1RAP", "protein", "levels", "and", "TAK1", "phosphorylation", "compared", "with", "the", "sh-nc", "group", "(", "Fig.", "9E", ")", "." ] } ]
PMC11204465	A sample of STCs and their biological activities, sources are summarized in Table 1.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "sample", "of", "STCs", "and", "their", "biological", "activities", ",", "sources", "are", "summarized", "in", "Table", "1", "." ] } ]
PMC11537649	After cotransfection of the reporter plasmid and NC/miR-152-3p inhibitor or miR-NC/miR-152-3p mimics, luciferase activity was examined using a Luciferase Reporter Gene Assay kit (Yeasen, China).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "After", "cotransfection", "of", "the", "reporter", "plasmid", "and", "NC/miR-152", "-", "3p", "inhibitor", "or", "miR-NC/miR-152", "-", "3p", "mimics", ",", "luciferase", "activity", "was", "examined", "using", "a", "Luciferase", "Reporter", "Gene", "Assay", "kit", "(", "Yeasen", ",", "China", ")", "." ] } ]
PMC8740518	The most popular methods for metabolomics analysis are gas chromatography-mass (GC-MS), liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS), and nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "most", "popular", "methods", "for", "metabolomics", "analysis", "are", "gas", "chromatography-mass", "(", "GC-MS", ")", ",", "liquid", "chromatography-mass", "spectrometry", "(", "LC-MS", ")", ",", "and", "nuclear", "magnetic", "resonance", "(", "NMR", ")", "spectroscopy", "." ] } ]
PMC9429973	Methods: This study is a multicentric randomized1:1:1 study with informed consent.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Methods", ":", "This", "study", "is", "a", "multicentric", "randomized1:1:1", "study", "with", "informed", "consent", "." ] } ]
PMC11361748	Data reported as mean ± SEM.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Data", "reported", "as", "mean", "±", "SEM", "." ] } ]
PMC10761218	The plates were then placed in an incubator with 5% CO2 at 37°C for 4 h. Subsequently, the medium containing MTT was removed, the formazan purple precipitate was solubilized, and 100 µL of DMSO was added.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "plates", "were", "then", "placed", "in", "an", "incubator", "with", "5", "%", "CO2", "at", "37", "°", "C", "for", "4", "h.", "Subsequently", ",", "the", "medium", "containing", "MTT", "was", "removed", ",", "the", "formazan", "purple", "precipitate", "was", "solubilized", ",", "and", "100", "µL", "of", "DMSO", "was", "added", "." ] } ]
PMC9429973	The effects of SOCS-1 polymorphisms on the pathogenesis of MM and SOCS-1 methylation will shed light on the literature.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "effects", "of", "SOCS-1", "polymorphisms", "on", "the", "pathogenesis", "of", "MM", "and", "SOCS-1", "methylation", "will", "shed", "light", "on", "the", "literature", "." ] } ]
PMC11754436	D-E) Expression levels of apoptosis-related proteins in MG63 cells, *Represent comparison with the mNC group, # represents comparison with the mm group. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D-E", ")", "Expression", "levels", "of", "apoptosis-related", "proteins", "in", "MG63", "cells", ",", "*", "Represent", "comparison", "with", "the", "mNC", "group", ",", "#", "represents", "comparison", "with", "the", "mm", "group", ".", "(" ] } ]
PMC11188874	Shown is the relative change in pan-HLA-ABC expression.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Shown", "is", "the", "relative", "change", "in", "pan-HLA-ABC", "expression", "." ] } ]
PMC10808409	The increase in the EE % upon increasing the Pluronic P123% (X2) could be due to the hydrophobic nature of FA, which has a higher affinity to the Pluronic P123, due its more hydrophobic core (HLB = 7–9), as compared to Pluronic F127 (HLB = 22).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "increase", "in", "the", "EE", "%", "upon", "increasing", "the", "Pluronic", "P123", "%", "(", "X2", ")", "could", "be", "due", "to", "the", "hydrophobic", "nature", "of", "FA", ",", "which", "has", "a", "higher", "affinity", "to", "the", "Pluronic", "P123", ",", "due", "its", "more", "hydrophobic", "core", "(", "HLB", "=", "7–9", ")", ",", "as", "compared", "to", "Pluronic", "F127", "(", "HLB", "=", "22", ")", "." ] } ]
PMC9429973	By contrast, OHI- patients had better survival (79%) than predicted by their prognostic scores (OR 0.15; CI 0.07-0.34).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "By", "contrast", ",", "OHI-", "patients", "had", "better", "survival", "(", "79", "%", ")", "than", "predicted", "by", "their", "prognostic", "scores", "(", "OR", "0.15", ";", "CI", "0.07", "-", "0.34", ")", "." ] } ]
PMC11699042	Red dots denote significant DEG (BH adjusted P < 0.01; \|FC \| > 1).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Red", "dots", "denote", "significant", "DEG", "(", "BH", "adjusted", "P", "<", "0.01", ";", "\|FC", "\|", ">", "1", ")", "." ] } ]
PMC11453018	Pathway enrichment analysis was performed using KEGG (https://www.genome.jp/kegg/), with figures generated by clusterProfiler (version 3.16.1).	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Pathway", "enrichment", "analysis", "was", "performed", "using", "KEGG", "(", "https://www.genome.jp/kegg/", ")", ",", "with", "figures", "generated", "by", "clusterProfiler", "(", "version", "3.16.1", ")", "." ] } ]
PMC11587541	The SMA causing gene is mapped on chromosome 5q13 , which is split up into 2 parts: telomeric part & centromeric part.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "SMA", "causing", "gene", "is", "mapped", "on", "chromosome", "5q13", ",", "which", "is", "split", "up", "into", "2", "parts", ":", "telomeric", "part", "&", "centromeric", "part", "." ] } ]
PMC9429973	ASCT induced a more “exhausted” T-cells repertoire.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ASCT", "induced", "a", "more", "“", "exhausted", "”", "T-cells", "repertoire", "." ] } ]
PMC9429973	Double negativity was calculated as 53.1%, while double positivity was calculated as 26.5%.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Double", "negativity", "was", "calculated", "as", "53.1", "%", ",", "while", "double", "positivity", "was", "calculated", "as", "26.5", "%", "." ] } ]
PMC11036064	Therefore, hsa-miR-34a-5p and the combination therapy can regulate the MAPK pathway compared to the control and temozolomide groups, respectively.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Therefore", ",", "hsa-miR-34a-5p", "and", "the", "combination", "therapy", "can", "regulate", "the", "MAPK", "pathway", "compared", "to", "the", "control", "and", "temozolomide", "groups", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC11345828	Mcl-1 Ki in the presence of 1% fetal bovine serum.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Mcl-1", "Ki", "in", "the", "presence", "of", "1", "%", "fetal", "bovine", "serum", "." ] } ]
PMC11539788	D-G) After RNF19A was overexpressed, cell proliferation was assessed via CCK-8 and colony formation assays. (	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "D-G", ")", "After", "RNF19A", "was", "overexpressed", ",", "cell", "proliferation", "was", "assessed", "via", "CCK-8", "and", "colony", "formation", "assays", ".", "(" ] } ]
PMC11787651	Histones extracted from cells treated with either a histone deacetylase inhibitor or transforming growth factor-beta 1 were analyzed by data-independent acquisition on two mass spectrometers: an Orbitrap Exploris 240 with a 55-min nanoflow LC gradient and the SCIEX ZenoTOF 7600 with a 10-min microflow gradient.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Histones", "extracted", "from", "cells", "treated", "with", "either", "a", "histone", "deacetylase", "inhibitor", "or", "transforming", "growth", "factor-beta", "1", "were", "analyzed", "by", "data-independent", "acquisition", "on", "two", "mass", "spectrometers", ":", "an", "Orbitrap", "Exploris", "240", "with", "a", "55-min", "nanoflow", "LC", "gradient", "and", "the", "SCIEX", "ZenoTOF", "7600", "with", "a", "10-min", "microflow", "gradient", "." ] } ]
PMC11775197	Colorectal cancer (CRC) represents the second most common cause of mortality worldwide.	[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Colorectal", "cancer", "(", "CRC", ")", "represents", "the", "second", "most", "common", "cause", "of", "mortality", "worldwide", "." ] } ]

PMC11413393

To determine if the anti-proliferative effects of type I PRMT inhibition in ccRCC cell lines translate to antitumor activity in vivo, we evaluated the efficacy of MS023 treatment in ccRCC xenografts.

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PMC11267036

To figure out the role of DHM on EMT in MM cells, the protein expression levels of EMT indicators, E-cadherin and N-cadherin, were detected in U266 and RPMI-8226 cells.

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Source data are provided as a Source Data file.

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PMC5673060

As shown in our previous study, the two resistant cell lines are highly sensitive to ponatinib treatment .

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PMC10547921

Then obtain phenol CBI analogs 77, 78 and amino CBI analogs 79, 80.

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HepG2.2.15 cells were inoculated in culture dishes (2 × 10 cells/mL).

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Next, we performed RNA-sequencing in CreER (estrogen receptor) pro-T cells 24 hours after activation of TLX3 expression by adding tamoxifen.

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PMC11742231

Over the past few years, the growing accessibility of molecular data obtained from individuals affected by cancer has instigated the advancement of various extensive drug response initiatives.

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PMC9429973

Interestingly, TIGIT+ Tregs are more immunosuppressive than their TIGIT- Treg counterparts and express higher levels of several transcription factors, including Ahr and Hif1α (Joller et al., Immunity, 2014), both involved in the cellular response to microenvironment-mediated stimuli.

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PMC10976516

A range of cytokines, including interleukins, interferons, and tumor necrosis factor-α (TNF-α), are released by dying cells into the immediate environment, further enhancing cell-mediated immunity.

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PMC9841531

All compounds showed functional inhibitory activities against MCT1 at low nanomolar concentrations and great antiproliferative activities against the MCT1-expressing cancer cell lines A-549 and MCF-7, while the compounds were selective over MCT4 (SLC16A4).

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Chromatographic analyses were performed in duplicate, and cell viability assays were performed in quadruplicate.

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PMC11283030

P < 0.05, **P < 0.01 vs. VC.

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Based on the calculated IS values (Table 1), the QUE (10 µM) + 5-FU (10 µM) association was classified as non-irritant on the CAM.

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After AVPI staining, it was shown that the knockdown of MCT4 could significantly promote cell apoptosis detected by flow cytometry (Figure 4(c)).

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Of the pts receiving combination treatment, 19 with R/R CLL/SLL received BGB-11417 ≤160 mg and 7 with R/R MCL received ≤80 mg.

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R. Colombatti, C. Birkegård, M. Medici University of Padova, Padova, Italy; Novo Nordisk A/S, Søborg, Denmark Background: Sickle cell disease (SCD) has a high prevalence and social impact worldwide, with a high mortality within the first three years of life.

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PMC11754436

By contrast, downregulation of DHRS4-AS1 significantly inhibited the apoptosis of 143B cells and promoted cell proliferation (Fig. 1E, G and I).

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PMC6222635

T-series dextran was weighed precisely and dissolved in distilled water to obtain standard solutions.

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After 24 h, cells were lysed, and protein was extracted using RIPA lysis buffer (Thermo Fischer Scientific Inc.).

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Altogether, this process yielded 29 estimates of βTCR – mem for 29 groups of T cells, each specific to a different Dextramer.

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Indeed, the PCR amplification of tandem repeats can result in products with a reduced number of repeat units and under certain conditions can lead to an increase in the number of repeats .

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We identified differentially expressed genes (DEG) as genes with an absolute log2 fold change greater than 1 and an adjusted p-value below 0.05.

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PMC9429973

Results: Twenty-five patients from six academic centers were treated with gilteritinib for FLT3-mutated R/R AML.

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PMC11704834

These data indicated that E-cadherin repression in part underlies the TLE1-mediated resistance to gefitinib in lung cancer cells.

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Left panels provide a graphical representation of the accumulated number of migrated cells at 24 h, and the right panels show the representative images (200 × magnification).

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ns, not significant.

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Most of the work relies on thymic tissue removed during cardiac surgery to provide access to the heart and major cardiac vessels.

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The biological mechanism may be related to the effect of Baicalein on p38 Mitogen‐activated protein kinase(MAPK)-dependent NF-κB signaling pathway.

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On PDXs from bladder, TNBC and ovarian cancer, and human skin (SciempathBio), detection of nectin-4 by IHC was performed on paraffin sections deparaffinized in three successive xylene immersions (3 minutes each) and rehydrated through a descending series of alcohol to water.

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PMC6450504

The lack of cytotoxicity of empty liposomes also supports the safety of the carrier system achieved for two main reasons.

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PMC11476222

The LC run lasted 25 min, programmed as follows: MPB was gradually increased to 60% over the first 14 min, held constant at 60% for 5 min, and then returned to 0% at 20 min until the end of the run.

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PMC10891340

Cell culture supernatants were collected for TCID50.

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PMC9622879

One of main problems of a system-centric CEMS is the poor computational time for solving its optimization problem.

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p < 0.001.

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For RNA sequencing (RNA-Seq), libraries were prepared from 500 ng of total RNA extracted from cells treated with iP300w (1.0 µM) for 4 h. Library preparation and sequencing (2 × 150 bp, 20M paired-end reads) was done at Azenta Life Science, USA.

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PMC5025404

This issue was resolved using dextran sulfate based anti-clumping agent (Lonza, Switzerland).

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PMC10523483

For qPCR, ROS measurement, GSH assay, n = 3 per group; for cell survival measurement by MTT assay, n = 4 to 5 per group.

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PMC11698348

For depilation induced hair cycle, mice were anesthetized using ketamine and xylazine cocktail mixture (90–10 mg/kg, intraperitoneal injections) and kept in a heating pad during the depilation procedure.

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PMC11380454

C. Drug- and stress-related pathways.

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PMC11743316

Earlier investigations revealed that VEGF and its receptor (VEGFR) have critical roles in pathological angiogenesis, notably cancer neovascularization, resulting in the emergence of numerous treatment techniques that target the VEGF system .

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PMC11739504

e, f) Fluorescence images showed comparison between ciliary markers under Kat2b silencing with serum starvation 6 h, 24 h. Arl13b marked ciliary membrane (green), ac-α-tubulin, marked ciliary axoneme (red), and nuclei were stained with DAPI (blue).

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PMC10213199

The higher the rich factor is, the higher the degree of enrichment.

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PMC11732628

no. BL003A; 1:4,000; Biosharp, Anhui, China).

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PMC10887351

β3-AR induced motility in pre-implantation embryos , in the first stages of embryogenesis , in embryo tissues and in the placenta of human and animal germ cells.

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PMC11470999

The current data do not clarify whether PF promotes CIP2A degradation through a molecular glue mechanism or allosteric modulation, indicating the need for further structural biology studies.

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PMC11627060

Nigella sativa seeds (N. sativa) have many bioactive compounds, such as the main ingredient thymoquinone (TQ) (2-isopropyl-5-methyl-1,4-benzoquinone), as well as monoterpenes like α-pinene and p-cymene, unique alkaloids like nigellone and nigellimine, and a saponin .

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PMC11129910

The membrane was incubated with anti-Rab25 monoclonal mouse IgG (ProMab, Albany, CA) overnight at 4°C.

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PMC11653533

Worldwide, herbal medications are used to treat a wide range of illnesses and diseases (Hasnat H, Akter Shompa S, Tasnim Richi F, Mirazul Islam M, Hasan Suman M, Uddin Ahmed N, et al. Bioactive Secondary Metabolites to Combat Diabetic Complications: Evidenced from in Silico Study.

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PMC2614416

Comparative proteomics of a normal tissue against those of its tumor cell line could afford useful insights into qualitative and quantitative changes in proteins profiles following tumor development, and facilitate the discovery of novel markers of tumors.

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PMC11687167

① MAPK signaling pathway.

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PMC9429973

Of note, all patients received enoxaparin for DVT prophylaxis during the intensification phase.

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Methods: Under the auspices of the European Hematology Association (EHA), the development of guidelines for the use of PROs in adult patients with haematological malignancies was conceptualised.

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PMC7305184

Similar results were obtained also between CTRL + EP and EP group.

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PMC11806106

However, this sensor was only sufficiently activated by endogenous peptide opioids like Met-enkephalin or its analogs.

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PMC8357004

In colorectal cancer, the over-activity of DNMT3a and DNMT3b leads to cancer induction.

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H1.2 was highly expressed in NSCLC tumors and promoted cancer cell growth. (

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They are not concerned whether there is any bedding or anything in the cage” [D073]. “

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PMC9429973

Fifteen cases of pleural effusion (PEf) occurred, 5 within the first mo, and 12 in total by 24 mos; 3 were asymptomatically detected on chest x-ray.

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PMC9429973

Since activation of CXCR3, which is a receptor for chemokines Cxcl9 and Cxcl10, has been shown to induce chemotaxis of activated T cells, we treated allo-SCT mice with AMG487, an antagonist of CXCR3, resulted in an improved recovery of both perivascular niche cells and hematopoiesis in allo-SCT mice.

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PMC11763111

We used P2A ligation to clone CD38 CAR and LLT1 sequences into lentiviral PCDH vectors in order to investigate whether LLT1 overexpression in HLA-deficient CAR-T cells may decrease allogeneic NK cell rejection (Fig. 1A).

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PMC11731614

This indicates that GFP-containing EVs originating in the epidermis are retrogradely trafficked into the DRG neuron cell body, where presumably they can initiate transcriptional changes due to their cargo.

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PMC11678841

Indeed, only the hyphal form has the capability to induce cell damage and activate the epithelial immune response, primarily driven by candidalysin, a cytolytic toxin secreted by C. albicans hyphae .

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PMC11545737

OspC3, in particular, catalyzes a post-translational modification, arginine ADP riboxanation, of caspase-4 Arg314 and caspase-11 Arg310.

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PMC11406030

Upon reaching final concentrations, cells were grown in the absence of chemotherapeutic drugs for 2 weeks, followed by replacement of the drug and verification of resistance by the trypan blue cell viability and MTT cell proliferation assays.

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PMC9429973

S. Zhang, H. Liu Beijing Hospital, Beijing, China Background: Acute myeloid leukemia (AML) is a malignant blood cancer that develops mainly in elderly adults and has dismal clinical outcomes.

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PMC11489175

Although USP8 targeting may appear not amenable due to the essential role of this gene in cell viability as shown by embryonic lethality in knockout mice 92, a certain degree of selectivity could be provided by increased expression in tumors.

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PMC11777207

Furthermore, the PD-L1 43H12 antibody clone also resulted in loss of CD80 on the surface of the DC as previously demonstrated with the PD-L1 10F9G.2 clone (figs. S4B and S2, D, F, and H) (6, 9).

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Cell migration assays toward the chemokine CCL21 were performed with Boyden chambers essentially as described (Calpe et al., 2011) by measuring transwell migration across bare polycarbonate membranes with a pore size of 5 μm (Corning).

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PMC11040965

A Representative western blots of PI3K/AKT pathway components in conditions of CD28 stimulation or blocking.

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Increasing evidence indicates that the PI3K-Akt signaling pathway plays a role in chemoresistance, with PI3K activation leading to heightened chemoresistance in cases of ovarian cancer [, , ].

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PMC3888431

6,887 new clusters could be introduced by our non-reference-based approach.

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PMC11789597

Female six‐ to eight‐week‐old NOD‐Prkdc IL2rg/Bcgen (B‐NDG) mice were purchased from Biocytogen (Wakefield, MA, USA) and were housed and treated following conditions approved by the Institutional Animal Caring and Using Committee of Guangzhou Medical University (GY2023‐781).

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PMC10858941

B–E Quantification of HIF-1α (B, C) or p62 (D, E) levels (*p < 0.05; **p < 0.01; ***p < 0.005; n = 6 U-251 MG, n = 5 A-172).

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PMC9351137

At least of 300 telophases were scored in two independent experiments for both treated cells and control HeLa cells. ***

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PMC8633974

Nested PCR for assayed proviral DNA excision wherein unedited amplicons are 2986 bp and CRISPR-edited amplicons are approximately 525 bp.

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PMC11670407

Taken together, these results suggest that OTULIN modulates GPX4 protein stability by preventing proteasomal protein degradation.

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PMC10955424

Median cPARP/GAPDH band density relative to control RJY13-treated was calculated (E); malignant ascites n = 13, cirrhosis ascites n = 3, chemoresistance-inducing cirrhosis ascites n = 1, GAPDH was used as loading control. *

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PMC11055510

In mice injected with A2780 cells, sh-circMAN1A2 inhibited IL1RAP protein levels and TAK1 phosphorylation compared with the sh-nc group (Fig. 9E).

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PMC11204465

A sample of STCs and their biological activities, sources are summarized in Table 1.

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PMC11537649

After cotransfection of the reporter plasmid and NC/miR-152-3p inhibitor or miR-NC/miR-152-3p mimics, luciferase activity was examined using a Luciferase Reporter Gene Assay kit (Yeasen, China).

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PMC8740518

The most popular methods for metabolomics analysis are gas chromatography-mass (GC-MS), liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS), and nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy.

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PMC9429973

Methods: This study is a multicentric randomized1:1:1 study with informed consent.

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PMC11361748

Data reported as mean ± SEM.

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PMC10761218

The plates were then placed in an incubator with 5% CO2 at 37°C for 4 h. Subsequently, the medium containing MTT was removed, the formazan purple precipitate was solubilized, and 100 µL of DMSO was added.

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PMC9429973

The effects of SOCS-1 polymorphisms on the pathogenesis of MM and SOCS-1 methylation will shed light on the literature.

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PMC11754436

D-E) Expression levels of apoptosis-related proteins in MG63 cells, *Represent comparison with the mNC group, # represents comparison with the mm group. (

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Shown is the relative change in pan-HLA-ABC expression.

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PMC10808409

The increase in the EE % upon increasing the Pluronic P123% (X2) could be due to the hydrophobic nature of FA, which has a higher affinity to the Pluronic P123, due its more hydrophobic core (HLB = 7–9), as compared to Pluronic F127 (HLB = 22).

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PMC9429973

By contrast, OHI- patients had better survival (79%) than predicted by their prognostic scores (OR 0.15; CI 0.07-0.34).

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PMC11699042

Red dots denote significant DEG (BH adjusted P < 0.01; |FC | > 1).

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PMC11453018

Pathway enrichment analysis was performed using KEGG (https://www.genome.jp/kegg/), with figures generated by clusterProfiler (version 3.16.1).

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PMC11587541

The SMA causing gene is mapped on chromosome 5q13 , which is split up into 2 parts: telomeric part & centromeric part.

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PMC9429973

ASCT induced a more “exhausted” T-cells repertoire.

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Double negativity was calculated as 53.1%, while double positivity was calculated as 26.5%.

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PMC11036064

Therefore, hsa-miR-34a-5p and the combination therapy can regulate the MAPK pathway compared to the control and temozolomide groups, respectively.

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PMC11345828

Mcl-1 Ki in the presence of 1% fetal bovine serum.

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PMC11539788

D-G) After RNF19A was overexpressed, cell proliferation was assessed via CCK-8 and colony formation assays. (

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PMC11787651

Histones extracted from cells treated with either a histone deacetylase inhibitor or transforming growth factor-beta 1 were analyzed by data-independent acquisition on two mass spectrometers: an Orbitrap Exploris 240 with a 55-min nanoflow LC gradient and the SCIEX ZenoTOF 7600 with a 10-min microflow gradient.

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PMC11775197

Colorectal cancer (CRC) represents the second most common cause of mortality worldwide.

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