Datasets:
OTAR3088
/
BioData-CellLine_annotated

Dataset card Data Studio Files
xet
Community
1
PMCID
string
Sentences
string
ner
list
PMC9429973
Results: The median age of overall study cohort was 39 years (range 13-74).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Results", ":", "The", "median", "age", "of", "overall", "study", "cohort", "was", "39", "years", "(", "range", "13", "-", "74", ")", "." ] } ]
PMC11026382
The regions spanned by each sublibrary were as follows: amino acid positions 1-40 (sublibrary 1, SL1), 41-80 (sublibrary 2, SL2), 81-120 (sublibrary 3, SL3), and 121-159 (sublibrary 4, SL4). ‘
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "regions", "spanned", "by", "each", "sublibrary", "were", "as", "follows", ":", "amino", "acid", "positions", "1", "-", "40", "(", "sublibrary", "1", ",", "SL1", ")", ",", "41", "-", "80", "(", "sublibrary", "2", ",", "SL2", ")", ",", "81", "-", "120", "(", "sublibrary", "3", ",", "SL3", ")", ",", "and", "121", "-", "159", "(", "sublibrary", "4", ",", "SL4", ")", ".", "‘" ] } ]
PMC9812014
Plaque-assay with wild-type viruses revealed that cherylline inhibits ZIKV life cycles efficiently.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Plaque-assay", "with", "wild-type", "viruses", "revealed", "that", "cherylline", "inhibits", "ZIKV", "life", "cycles", "efficiently", "." ] } ]
PMC10907726
Human osteosarcoma 143B cells were bought from the ATCC (USA).
[ { "tags": [ "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Human", "osteosarcoma", "143B", "cells", "were", "bought", "from", "the", "ATCC", "(", "USA", ")", "." ] } ]
PMC11585254
We examined the internalization of FLAG-tagged phospho-site cluster variants in HEK293 cells by ELISA following CXCL13 stimulation from 0–60 minutes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "examined", "the", "internalization", "of", "FLAG-tagged", "phospho-site", "cluster", "variants", "in", "HEK293", "cells", "by", "ELISA", "following", "CXCL13", "stimulation", "from", "0–60", "minutes", "." ] } ]
PMC9952933
To investigate the influence of CAP on cell motility, a scratch assay was carried out.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "investigate", "the", "influence", "of", "CAP", "on", "cell", "motility", ",", "a", "scratch", "assay", "was", "carried", "out", "." ] } ]
PMC11476004
This is important because many diseases are the result of mutations and genome instabilities.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "is", "important", "because", "many", "diseases", "are", "the", "result", "of", "mutations", "and", "genome", "instabilities", "." ] } ]
PMC11727907
As depicted in Figure 4A,B, ATP synthesis and OCR decreased by 44 and 40%, respectively, 4 h after the IGF-1 treatment, suggesting that the reduction in PK activity may affect the pyruvate pool required for mitochondrial energy production.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "As", "depicted", "in", "Figure", "4A", ",", "B", ",", "ATP", "synthesis", "and", "OCR", "decreased", "by", "44", "and", "40", "%", ",", "respectively", ",", "4", "h", "after", "the", "IGF-1", "treatment", ",", "suggesting", "that", "the", "reduction", "in", "PK", "activity", "may", "affect", "the", "pyruvate", "pool", "required", "for", "mitochondrial", "energy", "production", "." ] } ]
PMC11533140
Cytotoxic activities of compound cell lines in vitro.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cytotoxic", "activities", "of", "compound", "cell", "lines", "in", "vitro", "." ] } ]
PMC9429973
Patients were classified into 4 groups according to their blood group (blood group A, 71 patients: blood group B, 30 patients; blood group AB, 8 patients and blood group O, 85 patients).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Patients", "were", "classified", "into", "4", "groups", "according", "to", "their", "blood", "group", "(", "blood", "group", "A", ",", "71", "patients", ":", "blood", "group", "B", ",", "30", "patients", ";", "blood", "group", "AB", ",", "8", "patients", "and", "blood", "group", "O", ",", "85", "patients", ")", "." ] } ]
PMC9429973
On the contrary, it increases up to 5.5 cm after 12 mts, without significant changes after 24 mts.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "On", "the", "contrary", ",", "it", "increases", "up", "to", "5.5", "cm", "after", "12", "mts", ",", "without", "significant", "changes", "after", "24", "mts", "." ] } ]
PMC10994876
Flow cytometry was employed to assess the proportion of cells in various phases of the cell cycle.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Flow", "cytometry", "was", "employed", "to", "assess", "the", "proportion", "of", "cells", "in", "various", "phases", "of", "the", "cell", "cycle", "." ] } ]
PMC11392912
The reverse transcriptase mixture, along with dNTPs and RNAs inhibitor was added and incubated for 1 h at 42°C as per the manufacturer’s guidelines.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "reverse", "transcriptase", "mixture", ",", "along", "with", "dNTPs", "and", "RNAs", "inhibitor", "was", "added", "and", "incubated", "for", "1", "h", "at", "42", "°", "C", "as", "per", "the", "manufacturer", "’s", "guidelines", "." ] } ]
PMC10936243
Now, why I don’t like using these disposable things too much, like for me I try to avoid using disposable hand towels and all that because I think that is not planet-friendly, environmentally friendly” [D072]. “
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Now", ",", "why", "I", "do", "n’t", "like", "using", "these", "disposable", "things", "too", "much", ",", "like", "for", "me", "I", "try", "to", "avoid", "using", "disposable", "hand", "towels", "and", "all", "that", "because", "I", "think", "that", "is", "not", "planet-friendly", ",", "environmentally", "friendly", "”", "[", "D072", "]", ".", "“" ] } ]
PMC11726848
Among the radioprotective mechanisms alternative to the radiation-induced halt of mitosis, there are mechanisms of cellular senescence .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Among", "the", "radioprotective", "mechanisms", "alternative", "to", "the", "radiation-induced", "halt", "of", "mitosis", ",", "there", "are", "mechanisms", "of", "cellular", "senescence", "." ] } ]
PMC11342785
TPPP, but not the isolated CORE domain, phase-separate into drops in the presence of 12% of dextran crowding agent.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "TPPP", ",", "but", "not", "the", "isolated", "CORE", "domain", ",", "phase-separate", "into", "drops", "in", "the", "presence", "of", "12", "%", "of", "dextran", "crowding", "agent", "." ] } ]
PMC11155445
Acid chlorides need to be dealt with extreme care as any impurity like water can convert them back to carboxylic acid.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Acid", "chlorides", "need", "to", "be", "dealt", "with", "extreme", "care", "as", "any", "impurity", "like", "water", "can", "convert", "them", "back", "to", "carboxylic", "acid", "." ] } ]
PMC9429973
Most frequent tx-related gr ≥3 AEs included neutropenia (n=15, 100%), anemia (n=13, 87%), and thrombocytopenia (n=11, 73%).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Most", "frequent", "tx-related", "gr", "≥3", "AEs", "included", "neutropenia", "(", "n=15", ",", "100", "%", ")", ",", "anemia", "(", "n=13", ",", "87", "%", ")", ",", "and", "thrombocytopenia", "(", "n=11", ",", "73", "%", ")", "." ] } ]
PMC8956657
Overall, our structural and biochemical data confirm a direct and high-affinity interaction between MERS-CoV ORF4b and IMPα subfamilies without a marked preference between isoforms.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Overall", ",", "our", "structural", "and", "biochemical", "data", "confirm", "a", "direct", "and", "high-affinity", "interaction", "between", "MERS-CoV", "ORF4b", "and", "IMPα", "subfamilies", "without", "a", "marked", "preference", "between", "isoforms", "." ] } ]
PMC8345486
In our study, we used the phenomenon of induced drug resistance to obtain the A2780 cell subline, which is highly resistant to cisplatin, and we used this model to test the cytotoxicity of our compounds.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "our", "study", ",", "we", "used", "the", "phenomenon", "of", "induced", "drug", "resistance", "to", "obtain", "the", "A2780", "cell", "subline", ",", "which", "is", "highly", "resistant", "to", "cisplatin", ",", "and", "we", "used", "this", "model", "to", "test", "the", "cytotoxicity", "of", "our", "compounds", "." ] } ]
PMC11089031
Unfortunately, approximately 30% of patients are diagnosed with renal carcinoma in a later stage with a poor prognosis and limited treatment options .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Unfortunately", ",", "approximately", "30", "%", "of", "patients", "are", "diagnosed", "with", "renal", "carcinoma", "in", "a", "later", "stage", "with", "a", "poor", "prognosis", "and", "limited", "treatment", "options", "." ] } ]
PMC9429973
A total of 14/65 (22%) received both ino and blina in CR1; 32/65 (49%) received ino and/or blina.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A", "total", "of", "14/65", "(", "22", "%", ")", "received", "both", "ino", "and", "blina", "in", "CR1", ";", "32/65", "(", "49", "%", ")", "received", "ino", "and/or", "blina", "." ] } ]
PMC11342785
FUS, n = 6; TPPP FL, n = 6; TPPPCcore(45–219), n = 7; TPPP(1–206), n = 7; TPPP(45–206), n = 7; TPPP(1–196), n = 6; TPPP(45–196), n = 6.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "FUS", ",", "n", "=", "6", ";", "TPPP", "FL", ",", "n", "=", "6", ";", "TPPPCcore(45–219", ")", ",", "n", "=", "7", ";", "TPPP(1–206", ")", ",", "n", "=", "7", ";", "TPPP(45–206", ")", ",", "n", "=", "7", ";", "TPPP(1–196", ")", ",", "n", "=", "6", ";", "TPPP(45–196", ")", ",", "n", "=", "6", "." ] } ]
PMC11759751
The killing of B-NHL cells by CD19 CAR T cells after pretreatment with chidamide (C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "killing", "of", "B-NHL", "cells", "by", "CD19", "CAR", "T", "cells", "after", "pretreatment", "with", "chidamide", "(", "C", ")", "." ] } ]
PMC11786767
These results confirm that DHPE-biotin indeed specifically labels lipids in cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "These", "results", "confirm", "that", "DHPE-biotin", "indeed", "specifically", "labels", "lipids", "in", "cells", "." ] } ]
PMC10606998
This indicates the resistance of the dextran shell to all types of radiation in the range of the absorbed doses used.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "This", "indicates", "the", "resistance", "of", "the", "dextran", "shell", "to", "all", "types", "of", "radiation", "in", "the", "range", "of", "the", "absorbed", "doses", "used", "." ] } ]
PMC10891340
Whitley et al., 2019; Chan, 2020).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Whitley", "et", "al.", ",", "2019", ";", "Chan", ",", "2020", ")", "." ] } ]
PMC9429973
We determined the 5-year TTT-free survival after standard IST in patients ≤40 years and >40 years.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "determined", "the", "5-year", "TTT-free", "survival", "after", "standard", "IST", "in", "patients", "≤40", "years", "and", ">", "40", "years", "." ] } ]
PMC9813422
Furthermore, EBV-infected MKN7 and GES1 cells reproducibly demonstrated epigenetic redistribution from heterochromatin to euchromatin by association with EBV episomes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Furthermore", ",", "EBV-infected", "MKN7", "and", "GES1", "cells", "reproducibly", "demonstrated", "epigenetic", "redistribution", "from", "heterochromatin", "to", "euchromatin", "by", "association", "with", "EBV", "episomes", "." ] } ]
PMC9895440
The cells were centrifuged and resuspended in cold FACS buffer with 1:50 dilution of anti-CD8 (SK1, Biolegend) in FACS buffer and incubated for 10 min on ice.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "cells", "were", "centrifuged", "and", "resuspended", "in", "cold", "FACS", "buffer", "with", "1:50", "dilution", "of", "anti-CD8", "(", "SK1", ",", "Biolegend", ")", "in", "FACS", "buffer", "and", "incubated", "for", "10", "min", "on", "ice", "." ] } ]
PMC9693627
In the course of billions of evolution years, the mitochondria dramatically reduced the genome of their ancestors: almost all protomitochondrial genes were transferred to the nucleus or lost .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "course", "of", "billions", "of", "evolution", "years", ",", "the", "mitochondria", "dramatically", "reduced", "the", "genome", "of", "their", "ancestors", ":", "almost", "all", "protomitochondrial", "genes", "were", "transferred", "to", "the", "nucleus", "or", "lost", "." ] } ]
PMC9352806
Once they developed into gravid, worms were transferred to a fresh RNAi plate to lay eggs and obtain the second generation for treatment of BMS.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Once", "they", "developed", "into", "gravid", ",", "worms", "were", "transferred", "to", "a", "fresh", "RNAi", "plate", "to", "lay", "eggs", "and", "obtain", "the", "second", "generation", "for", "treatment", "of", "BMS", "." ] } ]
PMC11777207
Even in the presence of high amounts of either sCD80 or sPD-1 Cd80, BMDCs could not promote DC migration in vitro (Fig. 4C).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Even", "in", "the", "presence", "of", "high", "amounts", "of", "either", "sCD80", "or", "sPD-1", "Cd80", ",", "BMDCs", "could", "not", "promote", "DC", "migration", "in", "vitro", "(", "Fig.", "4C", ")", "." ] } ]
PMC11724582
The expression levels of α-SMA and FAP in the NF, CAF-24 h and CAF-48 h groups were detected by Western blotting. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "expression", "levels", "of", "α-SMA", "and", "FAP", "in", "the", "NF", ",", "CAF-24", "h", "and", "CAF-48", "h", "groups", "were", "detected", "by", "Western", "blotting", ".", "(" ] } ]
PMC11391695
The amount of TERT in each well was determined by calculating the absorbance at 450 nm using a microplate reader (Thermo Fisher Scientific, USA) and the corresponding standard curve.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "amount", "of", "TERT", "in", "each", "well", "was", "determined", "by", "calculating", "the", "absorbance", "at", "450", "nm", "using", "a", "microplate", "reader", "(", "Thermo", "Fisher", "Scientific", ",", "USA", ")", "and", "the", "corresponding", "standard", "curve", "." ] } ]
PMC11680982
Overall, this study indicates an imperative role for the HER2 pathway in determining the efficacy of CDK4/6 inhibitor combined with endocrine therapy for HR/HER2-low breast cancer.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Overall", ",", "this", "study", "indicates", "an", "imperative", "role", "for", "the", "HER2", "pathway", "in", "determining", "the", "efficacy", "of", "CDK4/6", "inhibitor", "combined", "with", "endocrine", "therapy", "for", "HR/HER2-low", "breast", "cancer", "." ] } ]
PMC9429973
A. Tivey, R. Shotton, T. A. Eyre, D. Lewis, N. Crosbie, E. Nga, R. Guerrero Camacho, W. Swe, H. Marr, C. Rees, S. Moule, T. Sutton, D. Wrench, N. Thomas, M. Wilson, J. Bailey, M. Prahladan, A. Hodson, M. Koppana, S. Smith, S. Jones, F. Miall, J. Norman, E. Davies, C. Hildyard, L. Lowry, S. Paneesha, I. Qureshi, A. Beech, C. Bedford, A. Everden, D. Tucker, J. Wright, J. Goddard, T. Nicholson, J. Wilson, A. Lord, B. Jackson, M. Flont, A. Gibb, K. Linton Department of Medical Oncology, The Christie NHS Foundation Trust, Manchester; Oxford University Hospitals NHS Foundation Trust, Oxford; University Hospitals Plymouth NHS Foundation Trust, Plymouth; Airedale NHS Foundation Trust, Airedale; Blackpool Teaching Hospitals NHS Foundation Trust, Blackpool; Calderdale and Huddersfield NHS Foundation Trust, Huddersfield; The Freeman Hospital, Newcastle; Frimley Health NHS Foundation Trust, Frimley; Gateshead Health NHS Foundation Trust, Gateshead; Guy’s and St Thomas’ NHS Foundation Trust, London, London; Harrogate and District NHS Foundation Trus, Harrogate; Hull University Teaching Hospitals NHS Trust, Hull; East Suffolk and North Essex NHS Foundation Trust, Ipswich; Sherwood Forest Hospitals NHS Foundation Trust, Sutton in Ashfield; University Hospitals of Leicester NHS Foundation Trust, Leicester; Manchester University NHS Foundation Trust, Manchester; Milton Keynes University Hospital, Milton Keynes; Somerset NHS Foundation Trust, Taunton; University Hospitals Birmingham NHS Foundation Trust, Birmingham; Nottingam University Hospitals, Nottingham; Royal Cornwall Hospitals NHS Trust, Truro; Sheffield Teaching Hospitals NHS Foundation Trust, Sheffield; St Helens & Knowsley Teaching Hospitals NHS Trust, Whiston; University Hospitals Sussex NHS Foundation Trust, Chichester; Torbay and South Devon NHS Foundation Trust, Torbay; York and Scarborough Teaching Hospitals NHS Foundation Trust, York; Department of Medical Oncology, The Christie NHS Foundation Trust, Manchester, Manchester, United Kingdom Background: Ibrutinib (IBR) is an oral covalent Bruton tyrosine kinase inhibitor (BTKi), licensed for treatment of relapsed or refractory mantle cell lymphoma (MCL).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "A.", "Tivey", ",", "R.", "Shotton", ",", "T.", "A.", "Eyre", ",", "D.", "Lewis", ",", "N.", "Crosbie", ",", "E.", "Nga", ",", "R.", "Guerrero", "Camacho", ",", "W.", "Swe", ",", "H.", "Marr", ",", "C.", "Rees", ",", "S.", "Moule", ",", "T.", "Sutton", ",", "D.", "Wrench", ",", "N.", "Thomas", ",", "M.", "Wilson", ",", "J.", "Bailey", ",", "M.", "Prahladan", ",", "A.", "Hodson", ",", "M.", "Koppana", ",", "S.", "Smith", ",", "S.", "Jones", ",", "F.", "Miall", ",", "J.", "Norman", ",", "E.", "Davies", ",", "C.", "Hildyard", ",", "L.", "Lowry", ",", "S.", "Paneesha", ",", "I.", "Qureshi", ",", "A.", "Beech", ",", "C.", "Bedford", ",", "A.", "Everden", ",", "D.", "Tucker", ",", "J.", "Wright", ",", "J.", "Goddard", ",", "T.", "Nicholson", ",", "J.", "Wilson", ",", "A.", "Lord", ",", "B.", "Jackson", ",", "M.", "Flont", ",", "A.", "Gibb", ",", "K.", "Linton", "Department", "of", "Medical", "Oncology", ",", "The", "Christie", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Manchester", ";", "Oxford", "University", "Hospitals", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Oxford", ";", "University", "Hospitals", "Plymouth", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Plymouth", ";", "Airedale", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Airedale", ";", "Blackpool", "Teaching", "Hospitals", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Blackpool", ";", "Calderdale", "and", "Huddersfield", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Huddersfield", ";", "The", "Freeman", "Hospital", ",", "Newcastle", ";", "Frimley", "Health", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Frimley", ";", "Gateshead", "Health", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Gateshead", ";", "Guy", "’s", "and", "St", "Thomas", "’", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "London", ",", "London", ";", "Harrogate", "and", "District", "NHS", "Foundation", "Trus", ",", "Harrogate", ";", "Hull", "University", "Teaching", "Hospitals", "NHS", "Trust", ",", "Hull", ";", "East", "Suffolk", "and", "North", "Essex", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Ipswich", ";", "Sherwood", "Forest", "Hospitals", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Sutton", "in", "Ashfield", ";", "University", "Hospitals", "of", "Leicester", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Leicester", ";", "Manchester", "University", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Manchester", ";", "Milton", "Keynes", "University", "Hospital", ",", "Milton", "Keynes", ";", "Somerset", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Taunton", ";", "University", "Hospitals", "Birmingham", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Birmingham", ";", "Nottingam", "University", "Hospitals", ",", "Nottingham", ";", "Royal", "Cornwall", "Hospitals", "NHS", "Trust", ",", "Truro", ";", "Sheffield", "Teaching", "Hospitals", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Sheffield", ";", "St", "Helens", "&", "Knowsley", "Teaching", "Hospitals", "NHS", "Trust", ",", "Whiston", ";", "University", "Hospitals", "Sussex", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Chichester", ";", "Torbay", "and", "South", "Devon", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Torbay", ";", "York", "and", "Scarborough", "Teaching", "Hospitals", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "York", ";", "Department", "of", "Medical", "Oncology", ",", "The", "Christie", "NHS", "Foundation", "Trust", ",", "Manchester", ",", "Manchester", ",", "United", "Kingdom", "Background", ":", "Ibrutinib", "(", "IBR", ")", "is", "an", "oral", "covalent", "Bruton", "tyrosine", "kinase", "inhibitor", "(", "BTKi", ")", ",", "licensed", "for", "treatment", "of", "relapsed", "or", "refractory", "mantle", "cell", "lymphoma", "(", "MCL", ")", "." ] } ]
PMC11665555
Resistant cells were maintained in culture without gemcitabine to have proper untreated controls.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Resistant", "cells", "were", "maintained", "in", "culture", "without", "gemcitabine", "to", "have", "proper", "untreated", "controls", "." ] } ]
PMC9895440
p < 0.05, ** p < 0.01, *** p < 0.001 and **** p < 0.0001.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "p", "<", "0.05", ",", "*", "*", "p", "<", "0.01", ",", "*", "*", "*", "p", "<", "0.001", "and", "*", "*", "*", "*", "p", "<", "0.0001", "." ] } ]
PMC11617590
Kallifatidis et al. found that SFN induced apoptosis through the protein kinase C (PKC) pathway .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Kallifatidis", "et", "al.", "found", "that", "SFN", "induced", "apoptosis", "through", "the", "protein", "kinase", "C", "(", "PKC", ")", "pathway", "." ] } ]
PMC10669966
No. 456-1034, Bio-Rad), and blotted to PVDF membranes (Mini Format, Cat.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "No.", "456", "-", "1034", ",", "Bio-Rad", ")", ",", "and", "blotted", "to", "PVDF", "membranes", "(", "Mini", "Format", ",", "Cat", "." ] } ]
PMC11792090
By supplementing IL-7 during the in vitro expansion of CAR-T cells (51), constructing CAR-T cells that express IL-7 or IL-7R (36, 52), or treating mice with modified IL-7 following CAR-T infusion (53, 54), the persistence and anti-tumor efficacy of CAR-T cells can be significantly enhanced.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "By", "supplementing", "IL-7", "during", "the", "in", "vitro", "expansion", "of", "CAR-T", "cells", "(", "51", ")", ",", "constructing", "CAR-T", "cells", "that", "express", "IL-7", "or", "IL-7R", "(", "36", ",", "52", ")", ",", "or", "treating", "mice", "with", "modified", "IL-7", "following", "CAR-T", "infusion", "(", "53", ",", "54", ")", ",", "the", "persistence", "and", "anti-tumor", "efficacy", "of", "CAR-T", "cells", "can", "be", "significantly", "enhanced", "." ] } ]
PMC11423992
JeKo-1 cell line was purchased from the National Collection of Authenticated Cell Cultures (CCRID cat. #
[ { "tags": [ "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "JeKo-1", "cell", "line", "was", "purchased", "from", "the", "National", "Collection", "of", "Authenticated", "Cell", "Cultures", "(", "CCRID", "cat", ".", "#" ] } ]
PMC10565698
Hence, we speculated that miR-211-5p may serve as a circUSP10 target.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Hence", ",", "we", "speculated", "that", "miR-211", "-", "5p", "may", "serve", "as", "a", "circUSP10", "target", "." ] } ]
PMC10958426
We found that the CNVs inferred by scRNA-seq in each tumor subclones were essentially consistent with that inferred by scWGS (Figs. S6A–C), consistent with previous studies .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "found", "that", "the", "CNVs", "inferred", "by", "scRNA-seq", "in", "each", "tumor", "subclones", "were", "essentially", "consistent", "with", "that", "inferred", "by", "scWGS", "(", "Figs.", "S6A", "–", "C", ")", ",", "consistent", "with", "previous", "studies", "." ] } ]
PMC11530949
The production of ROS in cells treated with the IC50 concentration of Ephedra intermedia extract and biogenic Ag-doped CuO nanoparticles compared to control cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "production", "of", "ROS", "in", "cells", "treated", "with", "the", "IC50", "concentration", "of", "Ephedra", "intermedia", "extract", "and", "biogenic", "Ag-doped", "CuO", "nanoparticles", "compared", "to", "control", "cells", "." ] } ]
PMC10728200
Further elucidating the potential mechanism of STUB1 and GPX4 in GIST and screening new drug combinations based on IM could represent a promising strategy for the treatment of GIST in the future.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Further", "elucidating", "the", "potential", "mechanism", "of", "STUB1", "and", "GPX4", "in", "GIST", "and", "screening", "new", "drug", "combinations", "based", "on", "IM", "could", "represent", "a", "promising", "strategy", "for", "the", "treatment", "of", "GIST", "in", "the", "future", "." ] } ]
PMC10878518
Representative photographs of bone and soft-tissue sarcoma cells 72 h after infection with OBP-401 at the indicated doses.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Representative", "photographs", "of", "bone", "and", "soft-tissue", "sarcoma", "cells", "72", "h", "after", "infection", "with", "OBP-401", "at", "the", "indicated", "doses", "." ] } ]
PMC8992508
Among the obtained compounds, the four bis(cyclohexanol)amine geometrical isomers 115 [Figure 24] bearing trans-3,4,5-trimethoxycinnamyl and 2,2-bis-(4-methoxyphenyl) moieties are particularly interesting because of their clear-cut dependence on stereochemistry for their potency.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Among", "the", "obtained", "compounds", ",", "the", "four", "bis(cyclohexanol)amine", "geometrical", "isomers", "115", "[", "Figure", "24", "]", "bearing", "trans-3,4,5-trimethoxycinnamyl", "and", "2,2-bis-(4-methoxyphenyl", ")", "moieties", "are", "particularly", "interesting", "because", "of", "their", "clear-cut", "dependence", "on", "stereochemistry", "for", "their", "potency", "." ] } ]
PMC11604015
However, due to the lack of pre-treatment sequencing data, whether these CD7-negative relapses originated from CD7-negative leukemic cells that were already present before treatment or from new mutations caused by treatment remained to be investigated .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "However", ",", "due", "to", "the", "lack", "of", "pre-treatment", "sequencing", "data", ",", "whether", "these", "CD7-negative", "relapses", "originated", "from", "CD7-negative", "leukemic", "cells", "that", "were", "already", "present", "before", "treatment", "or", "from", "new", "mutations", "caused", "by", "treatment", "remained", "to", "be", "investigated", "." ] } ]
PMC4395774
The results presented show one representative experiment from a series of three experiments.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "results", "presented", "show", "one", "representative", "experiment", "from", "a", "series", "of", "three", "experiments", "." ] } ]
PMC11335267
The numbers on top of each lane indicate individual mice from which samples were obtained. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "numbers", "on", "top", "of", "each", "lane", "indicate", "individual", "mice", "from", "which", "samples", "were", "obtained", ".", "(" ] } ]
PMC8316344
Cell death, lipid ROS generation, and cell viability were measured in Bel-7404 cell with TRIB2 knocked out in the presence or absence of TRIB2 reconstitution, or in SK-Hep1 cells with TRIB2 overexpressed following treating with RSL3 (5 µM, 12 h) or erastin (10 µM, 12 h) with or without DFO (25 µM, 12 h), as measured by Sytox green following flow cytometry (D, G), C11-BODIPY staining following flow cytometry (E, H) and a ATP detection kit (F, I).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Cell", "death", ",", "lipid", "ROS", "generation", ",", "and", "cell", "viability", "were", "measured", "in", "Bel-7404", "cell", "with", "TRIB2", "knocked", "out", "in", "the", "presence", "or", "absence", "of", "TRIB2", "reconstitution", ",", "or", "in", "SK-Hep1", "cells", "with", "TRIB2", "overexpressed", "following", "treating", "with", "RSL3", "(", "5", "µM", ",", "12", "h", ")", "or", "erastin", "(", "10", "µM", ",", "12", "h", ")", "with", "or", "without", "DFO", "(", "25", "µM", ",", "12", "h", ")", ",", "as", "measured", "by", "Sytox", "green", "following", "flow", "cytometry", "(", "D", ",", "G", ")", ",", "C11-BODIPY", "staining", "following", "flow", "cytometry", "(", "E", ",", "H", ")", "and", "a", "ATP", "detection", "kit", "(", "F", ",", "I", ")", "." ] } ]
PMC11155445
The presence of 3 methyl groups, a carboxamide group and a chlorine atom in compounds (151c, 151g and 151h) was proposed as the reason for better activity.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "presence", "of", "3", "methyl", "groups", ",", "a", "carboxamide", "group", "and", "a", "chlorine", "atom", "in", "compounds", "(", "151c", ",", "151", "g", "and", "151h", ")", "was", "proposed", "as", "the", "reason", "for", "better", "activity", "." ] } ]
PMC11188874
Error bars represent the MADP of the average.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Error", "bars", "represent", "the", "MADP", "of", "the", "average", "." ] } ]
PMC2614415
Ca – carcinoma, Ad – adenoma, CC – cancers pre-treated with chemotherapy. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Ca", "–", "carcinoma", ",", "Ad", "–", "adenoma", ",", "CC", "–", "cancers", "pre-treated", "with", "chemotherapy", ".", "(" ] } ]
PMC11568601
The relative expression was calculated with the 2 method.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "relative", "expression", "was", "calculated", "with", "the", "2", "method", "." ] } ]
PMC11699042
Our findings indicate that research with COTF-driven cell line models such as EwS should be in principle reproducible, even after genetic modifications, and extensive periods of continuous culture.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Our", "findings", "indicate", "that", "research", "with", "COTF-driven", "cell", "line", "models", "such", "as", "EwS", "should", "be", "in", "principle", "reproducible", ",", "even", "after", "genetic", "modifications", ",", "and", "extensive", "periods", "of", "continuous", "culture", "." ] } ]
PMC11365427
Interestingly, we observed an increase in phenylalanine levels in MM cells following BTZ administration (Fig. 8A).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Interestingly", ",", "we", "observed", "an", "increase", "in", "phenylalanine", "levels", "in", "MM", "cells", "following", "BTZ", "administration", "(", "Fig.", "8A", ")", "." ] } ]
PMC10976516
The study is ongoing.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "study", "is", "ongoing", "." ] } ]
PMC11075223
Table 2Processing methods of Cimicifugae Rhizoma in different periodsDynastyProcessing methodBookEditorReferencesEastern Tsin dynastyhoney processedZhouhou Beiji FangGe HongNorthern and southern dynastiesSteam processed, cleansing, polygonati rhizoma juice processedLeigong Paozhi LunLei XiaoSong dynastyCutting (mashing, fine grinding, filing) carbonized processed, roasted processedShengji ZongluCompiled by the government of the Song DynastyMing dynastyfried yellow processed, vinegar processed, wine processed, salt-water processed,PujifangPaozhi DafaZhu SuXi YongQing dynastyGinger juice processed, soil processedLeizheng ZhicaiYizong JinjianLin PeiqinWu QianModernHoney processed, wine processed, carbonized processed, etc// Processing methods of Cimicifugae Rhizoma in different periods Pujifang Paozhi Dafa Zhu Su Xi Yong Leizheng Zhicai Yizong Jinjian Lin Peiqin Wu Qian TCMs processing is beneficial to increase the therapeutic effect, change drug properties and reduce toxic side effects to meet the needs of clinical medication.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Table", "2Processing", "methods", "of", "Cimicifugae", "Rhizoma", "in", "different", "periodsDynastyProcessing", "methodBookEditorReferencesEastern", "Tsin", "dynastyhoney", "processedZhouhou", "Beiji", "FangGe", "HongNorthern", "and", "southern", "dynastiesSteam", "processed", ",", "cleansing", ",", "polygonati", "rhizoma", "juice", "processedLeigong", "Paozhi", "LunLei", "XiaoSong", "dynastyCutting", "(", "mashing", ",", "fine", "grinding", ",", "filing", ")", "carbonized", "processed", ",", "roasted", "processedShengji", "ZongluCompiled", "by", "the", "government", "of", "the", "Song", "DynastyMing", "dynastyfried", "yellow", "processed", ",", "vinegar", "processed", ",", "wine", "processed", ",", "salt-water", "processed", ",", "PujifangPaozhi", "DafaZhu", "SuXi", "YongQing", "dynastyGinger", "juice", "processed", ",", "soil", "processedLeizheng", "ZhicaiYizong", "JinjianLin", "PeiqinWu", "QianModernHoney", "processed", ",", "wine", "processed", ",", "carbonized", "processed", ",", "etc//", "Processing", "methods", "of", "Cimicifugae", "Rhizoma", "in", "different", "periods", "Pujifang", "Paozhi", "Dafa", "Zhu", "Su", "Xi", "Yong", "Leizheng", "Zhicai", "Yizong", "Jinjian", "Lin", "Peiqin", "Wu", "Qian", "TCMs", "processing", "is", "beneficial", "to", "increase", "the", "therapeutic", "effect", ",", "change", "drug", "properties", "and", "reduce", "toxic", "side", "effects", "to", "meet", "the", "needs", "of", "clinical", "medication", "." ] } ]
PMC5963610
To analyze the percentage of survival, animals (n=10/group) were monitored every day.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "To", "analyze", "the", "percentage", "of", "survival", ",", "animals", "(", "n=10/group", ")", "were", "monitored", "every", "day", "." ] } ]
PMC11757131
The protein loading amount was 20 μg per well, with electrophoresis parameters set at a low voltage of 70 V for 30 min, followed by a high voltage of 110 V for 1 h. A constant-current transfer membrane was used at 250 mA for 90 min.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "protein", "loading", "amount", "was", "20", "μg", "per", "well", ",", "with", "electrophoresis", "parameters", "set", "at", "a", "low", "voltage", "of", "70", "V", "for", "30", "min", ",", "followed", "by", "a", "high", "voltage", "of", "110", "V", "for", "1", "h.", "A", "constant-current", "transfer", "membrane", "was", "used", "at", "250", "mA", "for", "90", "min", "." ] } ]
PMC10976516
In both models, systemic infection with WR A34R(IHD-J) TK-Luc+ induced a significantly higher tumor clearance level as compared with the WR strain.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "both", "models", ",", "systemic", "infection", "with", "WR", "A34R(IHD-J", ")", "TK-Luc+", "induced", "a", "significantly", "higher", "tumor", "clearance", "level", "as", "compared", "with", "the", "WR", "strain", "." ] } ]
PMC9429973
Of the pts with MRD samples within the first year after HSCT available, pts with at least 1 MRD sample after HSCT had a significantly higher cumulative incidence of relapse (CIR, P=.008, Figure 1A) & shorter relapse-free survival (RFS, P=.02, Figure 1B).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Of", "the", "pts", "with", "MRD", "samples", "within", "the", "first", "year", "after", "HSCT", "available", ",", "pts", "with", "at", "least", "1", "MRD", "sample", "after", "HSCT", "had", "a", "significantly", "higher", "cumulative", "incidence", "of", "relapse", "(", "CIR", ",", "P=.008", ",", "Figure", "1A", ")", "&", "shorter", "relapse-free", "survival", "(", "RFS", ",", "P=.02", ",", "Figure", "1B", ")", "." ] } ]
PMC11486946
The successful selection of all TKIs for EGFR from a library consisting of 1134 FDA-approved compounds provides the proof of concept of this approach.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "successful", "selection", "of", "all", "TKIs", "for", "EGFR", "from", "a", "library", "consisting", "of", "1134", "FDA-approved", "compounds", "provides", "the", "proof", "of", "concept", "of", "this", "approach", "." ] } ]
PMC9429973
Twenty-seven patients who had at least two serial ctDNA assessment with at least one month interval were included for dynamic ctDNA analysis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Twenty-seven", "patients", "who", "had", "at", "least", "two", "serial", "ctDNA", "assessment", "with", "at", "least", "one", "month", "interval", "were", "included", "for", "dynamic", "ctDNA", "analysis", "." ] } ]
PMC9429973
All in all, gene expression dysregulation and aberrant mRNA splicing disturb important biological pathways and drive the molecular pathomechanism in Zrsr2Tet2 mice.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "All", "in", "all", ",", "gene", "expression", "dysregulation", "and", "aberrant", "mRNA", "splicing", "disturb", "important", "biological", "pathways", "and", "drive", "the", "molecular", "pathomechanism", "in", "Zrsr2Tet2", "mice", "." ] } ]
PMC11033180
In both samples, a band at 220 and 200 kDa was detected for Plexin A1 and Plexin A2, respectively.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "both", "samples", ",", "a", "band", "at", "220", "and", "200", "kDa", "was", "detected", "for", "Plexin", "A1", "and", "Plexin", "A2", ",", "respectively", "." ] } ]
PMC6133382
Additionally, there exists evidence to suggest a broad mannosidase inhibitor like kifunensine may negatively impact protein folding through interference of the calnexin/calreticulin pathway [72–75].
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Additionally", ",", "there", "exists", "evidence", "to", "suggest", "a", "broad", "mannosidase", "inhibitor", "like", "kifunensine", "may", "negatively", "impact", "protein", "folding", "through", "interference", "of", "the", "calnexin/calreticulin", "pathway", "[", "72–75", "]", "." ] } ]
PMC4270159
We will also determine the sample size post hoc as described in Power Calculations.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "We", "will", "also", "determine", "the", "sample", "size", "post", "hoc", "as", "described", "in", "Power", "Calculations", "." ] } ]
PMC11122631
Those marine prostanoids present diverse pharmacological effects, including anti-proliferative , cytotoxic , and anti-inflammatory activities .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Those", "marine", "prostanoids", "present", "diverse", "pharmacological", "effects", ",", "including", "anti-proliferative", ",", "cytotoxic", ",", "and", "anti-inflammatory", "activities", "." ] } ]
PMC11740508
Drugs: C, DMSO; T, 5 nM talazoparib; D, 14 nM decitabine; T + D, both drugs.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Drugs", ":", "C", ",", "DMSO", ";", "T", ",", "5", "nM", "talazoparib", ";", "D", ",", "14", "nM", "decitabine", ";", "T", "+", "D", ",", "both", "drugs", "." ] } ]
PMC10812665
In the last part of the study, we made use of the fact that three hits had a similar mode of action (c-I inhibition), and that we had gathered a multi-dimensional data set on these mechanistically related compounds.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "In", "the", "last", "part", "of", "the", "study", ",", "we", "made", "use", "of", "the", "fact", "that", "three", "hits", "had", "a", "similar", "mode", "of", "action", "(", "c-I", "inhibition", ")", ",", "and", "that", "we", "had", "gathered", "a", "multi-dimensional", "data", "set", "on", "these", "mechanistically", "related", "compounds", "." ] } ]
PMC11705862
F = female, M = male.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "F", "=", "female", ",", "M", "=", "male", "." ] } ]
PMC9952933
The current treatment methods, especially chemotherapy, have plenty of undesirable side effects such as changes in bone development, increased bone resorption, and thus an increased risk of bone fractures .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "current", "treatment", "methods", ",", "especially", "chemotherapy", ",", "have", "plenty", "of", "undesirable", "side", "effects", "such", "as", "changes", "in", "bone", "development", ",", "increased", "bone", "resorption", ",", "and", "thus", "an", "increased", "risk", "of", "bone", "fractures", "." ] } ]
PMC11791264
Recent reports have described the role of LC3B phosphorylation in controlling autophagosomal transport (2, 6).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Recent", "reports", "have", "described", "the", "role", "of", "LC3B", "phosphorylation", "in", "controlling", "autophagosomal", "transport", "(", "2", ",", "6", ")", "." ] } ]
PMC11534035
Given the relevant predictive value of clonogenicity assays in cancer research, our investigation established that targeting GPER1 and PAI1 has the potential to prevent or slow the expansion of metastasized cells into full blown metastases.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Given", "the", "relevant", "predictive", "value", "of", "clonogenicity", "assays", "in", "cancer", "research", ",", "our", "investigation", "established", "that", "targeting", "GPER1", "and", "PAI1", "has", "the", "potential", "to", "prevent", "or", "slow", "the", "expansion", "of", "metastasized", "cells", "into", "full", "blown", "metastases", "." ] } ]
PMC11755624
Under pathological conditions, the expression of numerous lncRNA molecules is dysregulated.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Under", "pathological", "conditions", ",", "the", "expression", "of", "numerous", "lncRNA", "molecules", "is", "dysregulated", "." ] } ]
PMC11633763
Activation of the Wnt/β‐catenin pathway increases the nuclear accumulation of β‐catenin, which attaches to TCF/LEF family members, initiating downstream target gene transcription .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Activation", "of", "the", "Wnt/β‐catenin", "pathway", "increases", "the", "nuclear", "accumulation", "of", "β‐catenin", ",", "which", "attaches", "to", "TCF/LEF", "family", "members", ",", "initiating", "downstream", "target", "gene", "transcription", "." ] } ]
PMC11574271
Taken together, these results suggest that hsa-miR-659-3p exerts a negative regulatory effect on RON-mediated migration and invasion of bladder cancer cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Taken", "together", ",", "these", "results", "suggest", "that", "hsa-miR-659", "-", "3p", "exerts", "a", "negative", "regulatory", "effect", "on", "RON-mediated", "migration", "and", "invasion", "of", "bladder", "cancer", "cells", "." ] } ]
PMC8973085
Molecular docking analysis illustrated that the synthesized compounds are predicted to fit into the binding sites of the target 4k9g and 4dk7 proteins associated with specific cancer cell types.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Molecular", "docking", "analysis", "illustrated", "that", "the", "synthesized", "compounds", "are", "predicted", "to", "fit", "into", "the", "binding", "sites", "of", "the", "target", "4k9", "g", "and", "4dk7", "proteins", "associated", "with", "specific", "cancer", "cell", "types", "." ] } ]
PMC9250505
B Kaplan–Meier analysis: relapse and survival times were compared by Kaplan–Meier analysis and overall survival (OS) or progression-free survival (PFS) were tested for significance by using the log-rank test.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "B", "Kaplan", "–", "Meier", "analysis", ":", "relapse", "and", "survival", "times", "were", "compared", "by", "Kaplan", "–", "Meier", "analysis", "and", "overall", "survival", "(", "OS", ")", "or", "progression-free", "survival", "(", "PFS", ")", "were", "tested", "for", "significance", "by", "using", "the", "log-rank", "test", "." ] } ]
PMC11659921
KM curves of overall survival between the two clusters. (
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "KM", "curves", "of", "overall", "survival", "between", "the", "two", "clusters", ".", "(" ] } ]
PMC9429973
Thus, LSD1i treated and GFI1B IPSC-derived cells showed an increase in myeloid marker gene expression after differentiation and downregulation of coagulation-associated genes, hinting at a decreased potential to differentiate into megakaryocytes.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Thus", ",", "LSD1i", "treated", "and", "GFI1B", "IPSC-derived", "cells", "showed", "an", "increase", "in", "myeloid", "marker", "gene", "expression", "after", "differentiation", "and", "downregulation", "of", "coagulation-associated", "genes", ",", "hinting", "at", "a", "decreased", "potential", "to", "differentiate", "into", "megakaryocytes", "." ] } ]
PMC9739791
Blebbing and increased permeability to PI were observed, which indicated that oncosis is the cell death mode of cells incubated with BODI-Pt, but not of cells incubated with carboplatin .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Blebbing", "and", "increased", "permeability", "to", "PI", "were", "observed", ",", "which", "indicated", "that", "oncosis", "is", "the", "cell", "death", "mode", "of", "cells", "incubated", "with", "BODI-Pt", ",", "but", "not", "of", "cells", "incubated", "with", "carboplatin", "." ] } ]
PMC9592219
The molecules were optimized using the OPLS2005 force field.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "molecules", "were", "optimized", "using", "the", "OPLS2005", "force", "field", "." ] } ]
PMC4443654
ChIP-seq, chromatin immunoprecipitation sequencing; TAD, topological domain.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "ChIP-seq", ",", "chromatin", "immunoprecipitation", "sequencing", ";", "TAD", ",", "topological", "domain", "." ] } ]
PMC11190538
Scientific evidence suggests that antioxidants reduce the risk of chronic diseases, including cancer and heart disease .
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Scientific", "evidence", "suggests", "that", "antioxidants", "reduce", "the", "risk", "of", "chronic", "diseases", ",", "including", "cancer", "and", "heart", "disease", "." ] } ]
PMC8303372
The results are reported in Figure S3.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "results", "are", "reported", "in", "Figure", "S3", "." ] } ]
PMC11653533
Also it is cultivated for shades and fruits (Paarakh, 2009).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Also", "it", "is", "cultivated", "for", "shades", "and", "fruits", "(", "Paarakh", ",", "2009", ")", "." ] } ]
PMC10605143
The primary antibody was detected by an appropriate secondary antibody conjugated with horseradish peroxidase (Thermo Fisher Scientific) and visualized with an ECL kit (Thermo Fisher Scientific).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "primary", "antibody", "was", "detected", "by", "an", "appropriate", "secondary", "antibody", "conjugated", "with", "horseradish", "peroxidase", "(", "Thermo", "Fisher", "Scientific", ")", "and", "visualized", "with", "an", "ECL", "kit", "(", "Thermo", "Fisher", "Scientific", ")", "." ] } ]
PMC11721277
The reaction mass was extracted with CH2Cl2 (10 mL), washed with water (2 × 10 mL), and the organic phase was dried over anhydrous Na2SO4 and concentrated under reduced pressure.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "reaction", "mass", "was", "extracted", "with", "CH2Cl2", "(", "10", "mL", ")", ",", "washed", "with", "water", "(", "2", "×", "10", "mL", ")", ",", "and", "the", "organic", "phase", "was", "dried", "over", "anhydrous", "Na2SO4", "and", "concentrated", "under", "reduced", "pressure", "." ] } ]
PMC9429973
Most likely, this is due to the fact that the “point of application” for this treatment does not coincide with the pathogenesis of anemia in these patients.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Most", "likely", ",", "this", "is", "due", "to", "the", "fact", "that", "the", "“", "point", "of", "application", "”", "for", "this", "treatment", "does", "not", "coincide", "with", "the", "pathogenesis", "of", "anemia", "in", "these", "patients", "." ] } ]
PMC11469524
HSP27 was not found to be regulated by p38 activity in BL-2 cells.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CellLine", "O", "O" ], "tokens": [ "HSP27", "was", "not", "found", "to", "be", "regulated", "by", "p38", "activity", "in", "BL-2", "cells", "." ] } ]
PMC11640247
For axonal analysis, a plasmid solution containing 0.1 µg of pCAG-Myc-empty (control), -Myc-RAC3, or -Myc-RAC3-R66W was co-injected with 0.4 µg of pCAG-GFP.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "For", "axonal", "analysis", ",", "a", "plasmid", "solution", "containing", "0.1", "µg", "of", "pCAG-Myc-empty", "(", "control", ")", ",", "-Myc-RAC3", ",", "or", "-Myc-RAC3-R66W", "was", "co-injected", "with", "0.4", "µg", "of", "pCAG-GFP", "." ] } ]
PMC11388384
SHH diffused as a mixture of populations that associated with different extracellular environments, which matches the basic assumptions of the classic hindered diffusion model (Fig. 2E).
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "SHH", "diffused", "as", "a", "mixture", "of", "populations", "that", "associated", "with", "different", "extracellular", "environments", ",", "which", "matches", "the", "basic", "assumptions", "of", "the", "classic", "hindered", "diffusion", "model", "(", "Fig.", "2E", ")", "." ] } ]
PMC11682172
The tumor cells were trypsinized, collected into sterile tubes, and washed with PBS in six consecutive steps.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "The", "tumor", "cells", "were", "trypsinized", ",", "collected", "into", "sterile", "tubes", ",", "and", "washed", "with", "PBS", "in", "six", "consecutive", "steps", "." ] } ]
PMC9874064
Platinum anticancer drugs, such as cisplatin, oxaliplatin, and carboplatin, are the first-line anticancer alkylating agents in clinic practice.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "Platinum", "anticancer", "drugs", ",", "such", "as", "cisplatin", ",", "oxaliplatin", ",", "and", "carboplatin", ",", "are", "the", "first-line", "anticancer", "alkylating", "agents", "in", "clinic", "practice", "." ] } ]
PMC11267830
h Flow cytometry analysis indicated that the depletion of THOC1 led to a notable increase in apoptosis.
[ { "tags": [ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ], "tokens": [ "h", "Flow", "cytometry", "analysis", "indicated", "that", "the", "depletion", "of", "THOC1", "led", "to", "a", "notable", "increase", "in", "apoptosis", "." ] } ]