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import streamlit as st | |
from PIL import Image | |
import numpy as np | |
import cv2 | |
from huggingface_hub import from_pretrained_keras | |
st.header("Segmentación de dientes con rayos X") | |
st.markdown( | |
""" | |
Hola estudiantes de Platzi 🚀. Este modelo usa UNet para segmentar imágenes | |
de dientes en rayos X. Se utila un modelo de Keras importado con la función | |
`huggingface_hub.from_pretrained_keras`. Recuerda que el Hub de Hugging Face está integrado | |
con muchas librerías como Keras, scikit-learn, fastai y otras. | |
El modelo fue creado por [SerdarHelli](https://huggingface.co/SerdarHelli/Segmentation-of-Teeth-in-Panoramic-X-ray-Image-Using-U-Net). | |
""" | |
) | |
## Seleccionamos y cargamos el modelo | |
model_id = "SerdarHelli/Segmentation-of-Teeth-in-Panoramic-X-ray-Image-Using-U-Net" | |
model = from_pretrained_keras(model_id) | |
## Permitimos a la usuaria cargar una imagen | |
archivo_imagen = st.file_uploader("Sube aquí tu imagen.", type=["png", "jpg", "jpeg"]) | |
## Si una imagen tiene más de un canal entonces se convierte a escala de grises (1 canal) | |
def convertir_one_channel(img): | |
if len(img.shape) > 2: | |
img = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2GRAY) | |
return img | |
else: | |
return img | |
def convertir_rgb(img): | |
if len(img.shape) == 2: | |
img = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_GRAY2RGB) | |
return img | |
else: | |
return img | |
## Manipularemos la interfaz para que podamos usar imágenes ejemplo | |
## Si el usuario da click en un ejemplo entonces el modelo correrá con él | |
ejemplos = ["dientes_1.png", "dientes_2.png", "dientes_3.png"] | |
## Creamos tres columnas; en cada una estará una imagen ejemplo | |
col1, col2, col3 = st.columns(3) | |
with col1: | |
## Se carga la imagen y se muestra en la interfaz | |
ex = Image.open(ejemplos[0]) | |
st.image(ex, width=200) | |
## Si oprime el botón entonces usaremos ese ejemplo en el modelo | |
if st.button("Corre este ejemplo"): | |
archivo_imagen = ejemplos[0] | |
with col2: | |
ex1 = Image.open(ejemplos[1]) | |
st.image(ex1, width=200) | |
if st.button("Corre este ejemplo"): | |
archivo_imagen = ejemplos[1] | |
with col3: | |
ex2 = Image.open(ejemplos[2]) | |
st.image(ex2, width=200) | |
if st.button("Corre este ejemplo"): | |
archivo_imagen = ejemplos[2] | |
## Si tenemos una imagen para ingresar en el modelo entonces | |
## la procesamos e ingresamos al modelo | |
if archivo_imagen is not None: | |
## Cargamos la imagen con PIL, la mostramos y la convertimos a un array de NumPy | |
img = Image.open(archivo_imagen) | |
st.image(img, width=850) | |
img = np.asarray(img) | |
## Procesamos la imagen para ingresarla al modelo | |
img_cv = convertir_one_channel(img) | |
img_cv = cv2.resize(img_cv, (512, 512), interpolation=cv2.INTER_LANCZOS4) | |
img_cv = np.float32(img_cv / 255) | |
img_cv = np.reshape(img_cv, (1, 512, 512, 1)) | |
## Ingresamos el array de NumPy al modelo | |
predicted = model.predict(img_cv) | |
predicted = predicted[0] | |
## Regresamos la imagen a su forma original y agregamos las máscaras de la segmentación | |
predicted = cv2.resize( | |
predicted, (img.shape[1], img.shape[0]), interpolation=cv2.INTER_LANCZOS4 | |
) | |
mask = np.uint8(predicted * 255) # | |
_, mask = cv2.threshold( | |
mask, thresh=0, maxval=255, type=cv2.THRESH_BINARY + cv2.THRESH_OTSU | |
) | |
kernel = np.ones((5, 5), dtype=np.float32) | |
mask = cv2.morphologyEx(mask, cv2.MORPH_OPEN, kernel, iterations=1) | |
mask = cv2.morphologyEx(mask, cv2.MORPH_CLOSE, kernel, iterations=1) | |
cnts, hieararch = cv2.findContours(mask, cv2.RETR_TREE, cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE) | |
output = cv2.drawContours(convertir_one_channel(img), cnts, -1, (255, 0, 0), 3) | |
## Si obtuvimos exitosamente un resultadod entonces lo mostramos en la interfaz | |
if output is not None: | |
st.subheader("Segmentación:") | |
st.write(output.shape) | |
st.image(output, width=850) | |