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import streamlit as st
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from PIL import Image
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import numpy as np
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import cv2
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@@ -6,7 +6,8 @@ from huggingface_hub import from_pretrained_keras
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st.header("Segmentación de dientes con rayos X")
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st.markdown(
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Hola estudiantes de Platzi 🚀. Este modelo usa UNet para segmentar imágenes
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de dientes en rayos X. Se utila un modelo de Keras importado con la función
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@@ -15,56 +16,93 @@ con muchas librerías como Keras, scikit-learn, fastai y otras.
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El modelo fue creado por [SerdarHelli](https://huggingface.co/SerdarHelli/Segmentation-of-Teeth-in-Panoramic-X-ray-Image-Using-U-Net).
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model_id = "SerdarHelli/Segmentation-of-Teeth-in-Panoramic-X-ray-Image-Using-U-Net"
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model=from_pretrained_keras(model_id)
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##
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def convertir_one_channel(img):
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if len(img.shape)>2:
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img= cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2GRAY)
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return img
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else:
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return img
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def convertir_rgb(img):
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if len(img.shape)==2:
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img= cv2.cvtColor(img,cv2.COLOR_GRAY2RGB)
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return img
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else:
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return img
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import streamlit as st
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from PIL import Image
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3 |
import numpy as np
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import cv2
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7 |
st.header("Segmentación de dientes con rayos X")
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+
st.markdown(
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+
"""
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Hola estudiantes de Platzi 🚀. Este modelo usa UNet para segmentar imágenes
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de dientes en rayos X. Se utila un modelo de Keras importado con la función
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El modelo fue creado por [SerdarHelli](https://huggingface.co/SerdarHelli/Segmentation-of-Teeth-in-Panoramic-X-ray-Image-Using-U-Net).
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+
"""
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+
)
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+
## Seleccionamos y cargamos el modelo
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model_id = "SerdarHelli/Segmentation-of-Teeth-in-Panoramic-X-ray-Image-Using-U-Net"
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+
model = from_pretrained_keras(model_id)
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+
## Permitimos a la usuaria cargar una imagen
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+
archivo_imagen = st.file_uploader("Sube aquí tu imagen.", type=["png", "jpg", "jpeg"])
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+
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+
## Si una imagen tiene más de un canal entonces se convierte a escala de grises (1 canal)
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def convertir_one_channel(img):
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+
if len(img.shape) > 2:
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+
img = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2GRAY)
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return img
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else:
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return img
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+
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+
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def convertir_rgb(img):
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+
if len(img.shape) == 2:
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+
img = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_GRAY2RGB)
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41 |
return img
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42 |
else:
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43 |
return img
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+
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+
## Manipularemos la interfaz para que podamos usar imágenes ejemplo
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+
## Si el usuario da click en un ejemplo entonces el modelo correrá con él
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+
ejemplos = ["dientes_1.png", "dientes_2.png", "dientes_3.png"]
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+
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+
## Creamos tres columnas; en cada una estará una imagen ejemplo
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+
col1, col2, col3 = st.columns(3)
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+
with col1:
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53 |
+
## Se carga la imagen y se muestra en la interfaz
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54 |
+
ex = Image.open(ejemplos[0])
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55 |
+
st.image(ex, width=200)
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56 |
+
## Si oprime el botón entonces usaremos ese ejemplo en el modelo
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57 |
+
if st.button("Corre este ejemplo"):
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+
archivo_imagen = ejemplos[0]
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+
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60 |
+
with col2:
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61 |
+
ex1 = Image.open(ejemplos[1])
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62 |
+
st.image(ex1, width=200)
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63 |
+
if st.button("Corre este ejemplo"):
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64 |
+
archivo_imagen = ejemplos[1]
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65 |
+
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66 |
+
with col3:
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67 |
+
ex2 = Image.open(ejemplos[2])
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68 |
+
st.image(ex2, width=200)
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69 |
+
if st.button("Corre este ejemplo"):
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70 |
+
archivo_imagen = ejemplos[2]
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71 |
+
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72 |
+
## Si tenemos una imagen para ingresar en el modelo entonces
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73 |
+
## la procesamos e ingresamos al modelo
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+
if archivo_imagen is not None:
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+
## Cargamos la imagen con PIL, la mostramos y la convertimos a un array de NumPy
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76 |
+
img = Image.open(archivo_imagen)
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77 |
+
st.image(img, width=850)
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+
img = np.asarray(img)
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79 |
+
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+
## Procesamos la imagen para ingresarla al modelo
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81 |
+
img_cv = convertir_one_channel(img)
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82 |
+
img_cv = cv2.resize(img_cv, (512, 512), interpolation=cv2.INTER_LANCZOS4)
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83 |
+
img_cv = np.float32(img_cv / 255)
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84 |
+
img_cv = np.reshape(img_cv, (1, 512, 512, 1))
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85 |
+
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+
## Ingresamos el array de NumPy al modelo
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87 |
+
predicted = model.predict(img_cv)
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88 |
+
predicted = predicted[0]
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89 |
+
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90 |
+
## Regresamos la imagen a su forma original y agregamos las máscaras de la segmentación
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91 |
+
predicted = cv2.resize(
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92 |
+
predicted, (img.shape[1], img.shape[0]), interpolation=cv2.INTER_LANCZOS4
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93 |
+
)
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+
mask = np.uint8(predicted * 255) #
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+
_, mask = cv2.threshold(
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+
mask, thresh=0, maxval=255, type=cv2.THRESH_BINARY + cv2.THRESH_OTSU
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+
)
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+
kernel = np.ones((5, 5), dtype=np.float32)
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99 |
+
mask = cv2.morphologyEx(mask, cv2.MORPH_OPEN, kernel, iterations=1)
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100 |
+
mask = cv2.morphologyEx(mask, cv2.MORPH_CLOSE, kernel, iterations=1)
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101 |
+
cnts, hieararch = cv2.findContours(mask, cv2.RETR_TREE, cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)
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102 |
+
output = cv2.drawContours(convertir_one_channel(img), cnts, -1, (255, 0, 0), 3)
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103 |
+
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+
## Si obtuvimos exitosamente un resultadod entonces lo mostramos en la interfaz
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105 |
+
if output is not None:
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st.subheader("Segmentación:")
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107 |
+
st.write(output.shape)
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108 |
+
st.image(output, width=850)
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