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language: "pt" |
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widget: |
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- text: "Dispneia importante aos esforços + dor tipo peso no peito no esforço." |
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- text: "Obeso, has, icc c # cintilografia miocardica para avaliar angina. Discreto edema mmii pricn a esquerda." |
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- text: "Plastia Mitral ( Insuficiencia ), CRM Saf-2Mg e e Saf-3MG ).(09/03/16). Nega palpitação." |
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- text: "Uso: AAS 100 -1xd; Metoprolol 25 -1xd; FSM -1xd ; Levotiroxina 175 -1xd; Sinva 40 -1xd; Fluoxetina 20-1xd." |
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- text: "Refere melhora da dispneia depois da cx porem mantem aos mdoeardos-leves esforço." |
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datasets: |
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- TempClinBr |
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# Portuguese NER- TempClinBr - BioBERTpt(clin) |
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Treinado com BioBERTpt(clin), com o corpus TempClinBr. |
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Metricas: |
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``` |
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precision recall f1-score support |
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0 1.00 0.85 0.92 33 |
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1 0.73 0.69 0.71 78 |
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2 0.75 0.55 0.63 11 |
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3 0.70 0.70 0.70 10 |
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4 0.90 1.00 0.95 71 |
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5 0.75 0.90 0.82 503 |
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6 0.83 0.90 0.87 112 |
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7 0.93 0.90 0.92 2236 |
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8 0.78 0.50 0.61 28 |
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9 0.82 0.84 0.83 291 |
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10 0.79 0.96 0.87 124 |
|
11 0.82 0.73 0.77 420 |
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accuracy 0.87 3917 |
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macro avg 0.82 0.79 0.80 3917 |
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weighted avg 0.88 0.87 0.87 3917 |
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``` |
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Parâmetros: |
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``` |
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device = cuda (Colab) |
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nclasses = len(tag2id) |
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nepochs = 50 => parou na 16 |
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batch_size = 16 |
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batch_status = 32 |
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learning_rate = 3e-5 |
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early_stop = 5 |
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max_length = 256 |
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write_path = 'model' |
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``` |
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Eval no conjunto de teste - TempClinBr |
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OBS: Avaliação com tag "O" (label 7), se necessário fazer a média sem essa tag. |
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``` |
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tag2id ={'<pad>': 12, |
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'B-DepartamentoClinico': 2, |
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'B-Evidencia': 4, |
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'B-Ocorrencia': 10, |
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'B-Problema': 5, |
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'B-Teste': 6, |
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'B-Tratamento': 9, |
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'I-DepartamentoClinico': 3, |
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'I-Ocorrencia': 8, |
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'I-Problema': 11, |
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'I-Teste': 0, |
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'I-Tratamento': 1, |
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'O': 7} |
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precision recall f1-score support |
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0 0.70 0.30 0.42 99 |
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1 0.84 0.75 0.79 146 |
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2 1.00 0.90 0.95 30 |
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3 0.93 0.93 0.93 14 |
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4 1.00 0.95 0.98 128 |
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5 0.83 0.97 0.89 713 |
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6 0.80 0.80 0.80 194 |
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7 0.93 0.93 0.93 2431 |
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8 0.56 0.20 0.29 51 |
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9 0.86 0.85 0.85 261 |
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10 0.77 0.88 0.82 146 |
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11 0.85 0.82 0.83 645 |
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12 0.00 0.00 0.00 0 |
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accuracy 0.88 4858 |
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macro avg 0.77 0.71 0.73 4858 |
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weighted avg 0.88 0.88 0.88 4858 |
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``` |
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Como citar: **em breve** |
