【中华民国领土争端】
中国的疆土范围在数千年间一直变动，其内涉及的民族包括汉族和其他少数民族，而中国历史时期的版图大致与汉地吻合。西周以前，势力主要在黄河流域一带。到了西周，建立封建体制，加上扩展领土，中国疆域伸展到南至长江，北达漠南，奠定中国版图的雏形，及后不少政权也会以占有此为代表正统中国政权。及至秦朝统一六国，结束分裂，领土则比西周增多，而建立中央集权体制及设置郡县，就更加确立了中国的版图，到汉朝时曾控制西域，唐朝时更一度扩张至中亚地区，但安史之乱后即失去。元朝则是历史上控制范围最大的时期之一，明朝正式开发南海，清朝中期再次重回新疆地区。但鸦片战争后，中国领土便逐步呈现缩小趋势，俄罗斯帝国侵占外东北和外西北的150多万平方公里，此后汉人进入东北一带充实边疆安全，此时的国际交流增多，使中国人对“汉唐故疆”这一固有国家疆域的概念在晚清时期得以强化。
原中华民国领土纷争图
中华民国成立后未能有效控制许多边远地区，许多地方虽声称属中华民国领土但几近被分裂占领，包括东海与南海、东北地区、外蒙古地区、新疆地区、西藏地区、西南地区等。现今中华民国实际的有效管辖范围仅涵盖台湾、澎湖群岛、福建的金门、马祖与部分南海诸岛的东沙群岛、太平岛与中洲礁，即「自由地区」。另一方面，中华民国政府文书中还存有「法定领土」，例如《中华民国宪法》规定「中华民国领土依其固有之疆域」，但并未明文定义其范围。两岸人民关系条例规定大陆地区是台湾地区以外的中华民国领土。
==外蒙古地区==
2010年立法院「中华民国—蒙古国会议员友好协会」成立大会
1911年武昌起义后，杭达多尔济、车林齐密特等蒙古王公喇嘛在俄国支持下，拥立库伦哲布尊丹巴呼图克图为皇帝，宣布独立，成立“大蒙古国”。中华民国政府拒不承认，仍称其为外蒙古。1913年，沙俄政府内外交迫下，与中华民国签订声明文件，俄罗斯承认中国对外蒙古的宗主权。1915年，外蒙古取消“独立”，改为自治。1919年，外蒙古地方撤销自治。苏联成立后，扶植蒙古人民革命党控制外蒙古。1921年，君主立宪制的「大蒙古国」成立。1924年5月，苏联承认蒙古为中国一部分，但实际上蒙古人已事实上建立政权统治外蒙古，中华民国迫于形势难以改变现状。同年7月，大蒙古国改国号为「蒙古人民共和国」。1928年，国民政府改称外蒙古为蒙古地方，仍未能实现有效统治。
1946年，蒙古人民在苏联协助下进行公投脱离中国，与此同时苏联通过进一步分裂中国东北领土来威迫中华民国政府承认外蒙古独立。1946年1月5日，中华民国承认外蒙古独立。但1953年2月24日，中华民国以苏联并未做到「不援助中共」等条件认为苏联违约在先，故废除《中苏友好同盟条约》，改为不承认外蒙古独立（蒙古人民共和国）。直到2002年，中华民国实质上承认蒙古国，并于对方首都互设具大使馆功能的代表机构。由于近代蒙古国独立牵涉到许多政治、法理与意识型态问题，中华民国方面对于蒙古国承认与否曾经是一敏感政治议题。
2012年5月21日，行政院大陆委员会发表新闻稿表示「一、民国35年（1946年）我国宪法制定公布时，蒙古（俗称外蒙古）独立已为我政府所承认，因此，当时蒙古已非我国宪法第4条所称的『固有之疆域』。外交部虽于民国42年（1953年）提经立法院决议废止「中苏友好同盟条约」，但并未完成宪法领土变更之程序。」「三、外交部在91年（2002年）7月8日函示略以：「蒙古已为主权独立国家，且为联合国会员国之一。国际法上国家之承认，原则上属于『无条件与不可撤回的』，当时承认之相关要件迄今仍存在。」
==西藏地区==
1979年版中华民国地图
中华民国政府声称对西藏拥有主权，而学术界普遍认为在中华民国大陆时期，西藏并不受北洋政府和国民政府（以下简称国府）管辖或支配，甚至达成事实上的独立262，国府驻藏办事处处长沈宗濂及其同事也认为自1911年以后，西藏实际上完全独立86n104。有学者认为中华民国大陆时期是中国秩序解体的时期，全国处于事实上的分裂状态，政府对西藏等边疆仅有「想像的主权」52。
1912年藏军将驻藏清军全部解除武装，连同清朝官员一起一律驱逐到内地，是为第一次驱汉事件。1913年举行的西姆拉会议，西藏希望划定西藏与中印的边界，并要求中国承认西藏独立。然而北洋政府坚持对西藏拥有主权，拒绝在《西姆拉条约》上签字。英藏签订了条约，以麦克马洪线划分藏印边境，成为今日中印领土争议的根源之一。西藏改以武力试图收复康区（西康省）和安多地区（青海省），造成康藏边界纠纷，结果双方以金沙江划境。
目前，西藏地区的边界主要是中印边界问题。东段边界问题源自英属印度时期。清末民初，英国乘中国内乱之际划“麦克马洪线”，吞并西藏南部的疆域。中国大陆称之为藏南。印度独立后，中印双方并未能就此地区的主权问题达成共识。于1960年代初更爆发中印战争。藏南地区在1972年被编为印度的“东北边境特区”，后来又改为“阿鲁纳恰尔中央直辖区”。1986年，印度议会两院通过将阿鲁纳恰尔中央直辖区升格为邦。1987年，印度正式宣布成立阿鲁纳恰尔邦。阿鲁纳恰尔邦在中国被划分为西藏的墨脱县、察隅县、错那县，此地区亦包含达旺市、丹巴曲、卡门河、察隅河、雅鲁藏布江大峡谷等地。虽然经过多年谈判，但双方始终未能达成共识，中国声称对此地区拥有主权。在西段地区，中国实际控制克什米尔东部阿克塞钦地区（属新疆和阗县）。新藏公路途径此地，所以这一地区对中国而言具有重要的战略意义。中印战争的起因之一便是印方发现中国在这一地区铺设公路。
中华民国由于无法管辖蒙藏地区，蒙藏委员会的权限与业务有所改变，主要负责在台藏人、蒙古人的生活和就业，以及与今日蒙古国、西藏流亡政府之间的政治、经济、文化、教育事务的交流。2017年9月15日，文化部的蒙藏文化中心取代蒙藏委员会，承接蒙藏委员会文化相关业务与大多数蒙藏会人员。
==东北地区==
海兰泡惨案中，俄军绑缚中国人准备屠杀
俄罗斯在近代史上是获得最多中国领土的国家，在清朝时期占领外东北100余万平方公里的领土，中华人民共和国已和俄罗斯签订新约，放弃收回此地的权利。中国外东北引起俄罗斯觊觎，所以俄罗斯借此故意划定国界，从黑龙江经过乌苏里江沿岸到兴凯湖以南延伸至海参崴的领土，以及原为中国内海的海参崴和库页岛之间的鞑靼海峡、乌苏里湾、结雅河、结雅水库、外兴安岭及四分之三的兴凯湖都被俄罗斯并吞。在并吞发生之前，库页岛原是中国第一大岛屿。图们江出口原本可让中国船只自由进出日本海。在清朝，俄罗斯夺走中国外东北地区同时，也夺走图们江的出海口，并不准中国船只自由进出图们江，切断中国和日本海的唯一重要河道和出海口，导致中国和日本海的连接从此中断。《中俄瑷珲条约》规定，中国人在江东六十四屯享有居住权，清政府对该处人民享有管辖权，但是清朝并无此地之主权。1900年发生义和团运动，清政府无暇兼顾东北情势，俄国遂派兵制造江东六十四屯惨案和海兰泡惨案。1902年中俄议和后，虽经清朝政府多次交涉，但沙俄政府却采取种种手段，拒绝居住于该地的中国人民返回世代久居的家园。清政府和中华民国政府一直不承认此地为俄罗斯领土。
黑瞎子岛和乌苏里江各岛屿原本为中国领土，在1929年的中东路事件中被苏联强占。中华民国和中华人民共和国政府均不承认这是俄国领土。根据2004年《中华人民共和国和俄罗斯联邦关于中俄国界东段的补充协定》，中国拿到半个黑瞎子岛的主权，只收回西半部黑瞎子岛，获地174平方公里，当中第二大的岛屿银龙岛，因位处黑瞎岛之西北，故此全部归属中国。俄罗斯保留黑瞎子岛东半部份。此外，珍宝岛、七里沁岛、卡脖子岛归属中国所有。阿巴该图洲渚是位于中俄界河额尔古纳河江心主航道中国一侧的一个小岛，是中俄间有争议的领土。阿巴该图洲渚面积50平方公里，可是额尔古纳河涨潮时，面积会大大缩小。该岛于1929年被苏联实际占领，但是中国历届政府一直主张拥有其主权，是中国和苏联（包括俄罗斯）旷日持久的边界争端的一部分。
鸭绿江上的薪岛、绸缎岛、多智岛、威化岛、黄金坪岛等岛屿以及长白山顶峰和天池本是中国和朝鲜边界争议领土，因为朝鲜宣称他们的领导人金正日出生在此（事实上金正日出生在苏联境内伯力附近的维亚茨科耶军营），因而称这是「圣山」。
==新疆地区==
帕米尔高原全境属于清朝管辖。1890年间，俄国、英国签订英俄协定，由英国取得瓦罕帕米尔，俄国取得一大片的北部帕米尔高原。中华民国成立以后帕米尔高原始终无法有效统治。但中华民国政府始终将帕米尔高原西边的喷赤河视为中国的极西点。
1933年11月12日，沙比提大毛拉等在喀什疏附县建立了东突厥斯坦共和国。1945年哈巴河县、布尔津县、承化县、拜城、阿克苏旧城、库尔干均被纳入东突厥斯坦共和国版图。1946年1月2日，中华民国和苏联签定了《十一条和平条款》，取消了“东突厥斯坦共和国”的名称。
==西南地区==
这一地区的边境纠纷主要是中缅和中越边境纠纷。中缅边界纠纷分为北中南三个部分，即中缅北段未定界，围绕江心坡等伊洛瓦底江上游“瓯脱之地”的主权纷争，1914年曾爆发片马事件；中缅中段未定界，围绕“勐卯三角地”永久租借及主权关系的争议；中缅南段未定界，围绕“一九四一年线”合法性及班洪、班老部落归属与炉房银矿权益的争议，1934年爆发班洪事件。
==台湾、东海==
1949年中华民国政府迁台，实际控制台澎金马地区，获得美国支持并多次击退中国人民解放军，中华人民共和国宣称台湾是中华人民共和国的一部分，但多数台湾人民拒绝一国两制方案，两岸政治分立至今。
中华民国与日本关于-{zh:钓鱼岛及其附属岛屿; zh-hans:钓鱼岛及其附属岛屿; zh-hant:钓鱼台列屿}-主权问题存在争议。日本政府在1895年认为钓鱼岛是无人岛，而且没有受清朝统治的迹象，基于无主地先占先得的原则将其划归冲绳县。二战结束后，该岛屿实际由美国控制，直至1972年5月15日美国将琉球群岛管理权移交日本，同时一并将钓鱼台列屿的行政管辖权也交给日本。
==南海==
中华民国海上领土问题亦包括西沙群岛、中沙群岛、南沙群岛等海岛，与越南、菲律宾、马来西亚等国有主权争议。第二次世界大战结束后，中华民国政府派遣军舰收回被日军所占据的南海诸岛，并划入其十一段线之内，称其为中华民国在南海的疆界。
1933年，法国占领南沙群岛9个主要岛屿（太平岛、中业岛、西月岛、南威岛、北子岛、南子岛、南钥岛、鸿庥岛、安波沙洲），中华民国政府向法国政府提出抗议。1934年，中华民国水陆地图审查委员会，专门审定了南海各岛礁滩洲名称共132座，包括东沙群岛1座，西沙群岛28座，中沙群岛（当时称为「南沙群岛」）7座和南沙群岛（当时称为「团沙群岛」）96座。1939年，日本占领南沙群岛。
1945年战后先由台湾省行政长官公署接收管辖南海诸岛。1946年7月，南沙群岛在内的南海诸岛改归广东省政府管辖。1946年中华民国内政部会同海军部和广东省政府委派萧次尹和麦蕴瑜分别为西沙群岛和南沙群岛专员，前往接管西沙群岛和南沙群岛。1947年，中华民国内政部重新命名包括南沙群岛在内的南海诸岛全部岛礁沙滩名称共159个，并公布施行。1955年11月27日，民国政府在南沙群岛的一个岛屿上修建一座气象台。
目前，中华民国实际控制太平岛及中洲礁，隶属高雄市旗津区代管，由行政院海岸巡防署驻守。2016年1月28日，马英九登上太平岛宣示主权，称太平岛是岛屿不是岩礁。2016年7月13日，中华民国总统蔡英文在南海仲裁结果公布次日，重申中华民国对太平岛及南海的主权立场。