【日本哺乳动物列表】
日本有100种以上的哺乳类，其中约30%为特有种。
== 食虫目 Insectivora ==
* 猬科 Erinaceidae
# 刺猬 - Erinaceus europaeus (ナミハリネズミ，并针鼠) ※移入种
* 鼩鼱科 Soricidae
# 本州鼩鼱 - Sorex hosonoi (アズミトガリネズミ，安昙尖鼠) ※固有种
## S. h. hosonoi (アズミトガリネズミ，安昙尖鼠)
## S. h. shiroumanus (シロウマトガリネズミ，白马尖鼠)
# 姬鼩鼱 - Sorex minutissimus (チビトガリネズミ，秃尖鼠)
## S. m. hawkeri (トウキョウトガリネズミ，东京尖鼠)
# 细鼩鼱 - Sorex gracillimus (ヒメトガリネズミ，姫尖鼠)
# 中鼩鼱 - Sorex caecutiens (トガリネズミ，尖鼠)
## S. c. shikokensis (シコクトガリネズミ，四国尖鼠) ※固有亜种
## 日本鼩鼱 - S. c. shinto (ホンシュウトガリネズミ，本州尖鼠) ※固有亜种
## S. c. saevus (エゾトガリネズミ，虾夷尖鼠)
# 佐渡鼩鼱 - Sorex sadonis (サドトガリネズミ，佐渡尖鼠) ※固有种
# 长爪鼩鼱 - Sorex unguiculatus (オオアシトガリネズミ，大足尖鼠)
# 西南水鼩 - Chimarrogale platycephala (カワネズミ，川鼠) ※固有种
# 小麝鼩 - Crocidura suaveolens (コジネズミ，小地鼠)
## C. s. shantungensis (チョウセンコジネズミ，朝鲜小地鼠)
# 长尾小麝鼩 - Crocidura horsfieldii (オナガジネズミ，尾长地鼠)
## C. h. watasei (ワタセジネズミ，渡瀬地鼠) ※固有亜种
# 德氏麝鼩 - Crocidura dsinezumi (ジネズミ，地鼠) ※固有种
## C. d. chisai (ホンシュウジネズミ，本州地鼠)
## C. d. dsinezumi (サイゴクジネズミ，西国地鼠)
## C. d. intermedia (タネジネズミ，种地鼠)
## C. d. okinoshimae (オキノシマジネズミ，冲ノ岛地鼠)
## C. d. umbrina (ヤクジネズミ，屋久地鼠)
# 奥里麝鼩 - Crocidura orii (オリイジネズミ，折居地鼠) ※固有种
# 臭鼩 - Suncus murinus (ジャコウネズミ，麝香鼠)
## S. m. riukiuana (リュウキュウジャコウネズミ，琉球麝香鼠)
* 鼹科 Talpidae
# 毛吻鼩鼹 - Dymecodon pilirostris (ヒメヒミズ，姫日不见) ※固有种
# 日本鼩鼹 - Urotrichus talpoides (ヒミズ，日不见) ※固有种
## U. t. adversus (ツシマヒミズ，対马日不见)
## U. t. centralis (シコクヒミズ，四国日不见)
## U. t. hondonis (ホンシュウヒミズ，本州日不见)
## U. t. minutus (オキヒミズ，隠岐日不见)
## U. t. talpoides (キュウシュウヒミズ，九州日不见)
# 本州鼹 - Euroscaptor mizura (ミズラモグラ，髻土竜) ※固有种
## E. m. hiwaensis (ヒワミズラモグラ，ひわ髻土竜)
## E. m. mizura (フジミズラモグラ，富士髻土竜)
## E. m. ohtai (シナノミズラモグラ，信浓髻土竜)
# 尖阁鼹鼠 - Nesoscaptor uchidai (センカクモグラ，尖阁土竜) ※固有种 / 1976年采取、1991年新种认定。
# Mogera imaizumii  (アズマモグラ，东土竜) ※固有种
## M. i. imaizumii (コモグラ，小土竜)
## 本州缺齿鼹 - M. i. minor (コモグラ，小土竜)
# 佐渡缺齿鼹 - Mogera tokudae (サドモグラ，佐渡土竜) ※固有种
## 倭缺齿鼹 - M. t. etigo (エチゴモグラ，越后土竜)
## 佐渡缺齿鼹 - M. t. tokudae (サドモグラ，佐渡土竜)
# 小缺齿鼹 - Mogera wogura  (コウベモグラ，神戸土竜)
## M. w. coreana (コウライモグラ，高丽土竜)
## M. w. kanai (ヤクシマモグラ，屋久岛土竜)
## 日本缺齿鼹 - M. w. kobeae (コウベモグラ，神戸土竜)
## M. w. wogura (コウベモグラ，神戸土竜)
== 翼手目 Chiroptera ==
* 狐蝠科 Pteropidae
# 琉球狐蝠 - Pteropus dasymallus (クビワオオコウモリ，首轮大蝙蝠)
## P. d. daitoensis (ダイトウオオコウモリ，大东大蝙蝠) ※天然记念物
## P. d. dasymallus (エラブオオコウモリ，永良部大蝙蝠) ※天然记念物
## P. d. inopinatus (オリイオオコウモリ，折居大蝙蝠)
## P. d. yayeyamae (ヤエヤマオオコウモリ，八重山大蝙蝠)
# Pteropus loochoensis (オキナワオオコウモリ，冲縄大蝙蝠) ※绝灭种
# 小笠原狐蝠 - Pteropus pselaphon (オガサワラオオコウモリ，小笠原大蝙蝠) ※固有种 / 天然记念物
* 菊头蝠科 Rhinolophidae
# 马铁菊头蝠 - Rhinolophus ferrumequinum (キクガシラコウモリ，菊头蝙蝠)
## R. f. nippon (ニホンキクガシラコウモリ，日本菊头蝙蝠)
## R. f. mikadoi (ミカドキクガシラコウモリ)
# 角菊头蝠 - Rhinolophus cornutus (コキクガシラコウモリ，小菊头蝙蝠)
## R. c. cornutus (ニホンコキクガシラコウモリ，日本小菊头蝙蝠)
## R. c. orii (オリイコキクガシラコウモリ，折居小菊头蝙蝠)
# Rhinolophus pumilus (オキナワコキクガシラコウモリ，冲縄小菊头蝙蝠) ※固有种
## R. p. miyakonis (ミヤココキクガシラコウモリ，宫古小菊头蝙蝠)
## R. p. pumilus (オキナワコキクガシラコウモリ，冲縄小菊头蝙蝠)
# Rhinolophus perditus (ヤエヤマコキクガシラコウモリ，八重山小菊头蝙蝠) ※固有种
## 伊氏菊头蝠 - R. p. imaizumii (イリオモテコキクガシラコウモリ，西表小菊头蝙蝠)
## R. p. perditus (ヤエヤマコキクガシラコウモリ，八重山小菊头蝙蝠)
* 蹄蝠科 Hipposideridae
# 丑蹄蝠 - Hipposideros turpis (カグラコウモリ，神楽蝙蝠)
* 蝙蝠科 Vespertilionidae
# 菲氏鼠耳蝠 - Myotis formosus (クロアカコウモリ，黒赤蝙蝠)
## M. f. tsuensis (ツシマクロアカコウモリ，対马黒赤蝙蝠) ※固有亜种
# 大趾鼠耳蝠 - Myotis macrodactylus (モモジロコウモリ，腿白蝙蝠)
# 水鼠耳蝠 - Myotis daubentonii (ドーベントンコウモリ，ドーベントン蝙蝠)
## M. d. ussuriensis (ウスリドーベントンコウモリ，ウスリドーベントン蝙蝠)
# 须鼠耳蝠 - Myotis mystacinus (ホオヒゲコウモリ，頬髭蝙蝠)
## M. m. gracilis (ウスリホオヒゲコウモリ，ウスリ頬髭蝙蝠)
# 伊氏鼠耳蝠 - Myotis ikonnikovi (ヒメホオヒゲコウモリ，姫頬髭蝙蝠)
## M. i. fujiensis (フジホオヒゲコウモリ，富士頬髭蝙蝠)
## 日本鼠耳蝠 - M. i. hosonoi (シナノホオヒゲコウモリ，信浓頬髭蝙蝠)
## 伊氏鼠耳蝠 - M. i. ikonnikovi (ヒメホオヒゲコウモリ，姫頬髭蝙蝠)
## 本州鼠耳蝠 - M. i. ozensis (オゼホオヒゲコウモリ，尾瀬頬髭蝙蝠)
## M. i. yesoensis (エゾホオヒゲコウモリ，虾夷頬髭蝙蝠)
# 霜白鼠耳蝠 - Myotis pruinosus (クロホオヒゲコウモリ，黒頬髭蝙蝠)
# Myotis yanbarensis (クロホオヒゲコウモリ，黒頬髭蝙蝠) ※固有种 / 1997年発见、1998年新种认定。
# 福建鼠耳蝠 - Myotis frater (カグヤコウモリ，加久矢蝙蝠)
## M. f. kaguyae (カグヤコウモリ，加久矢蝙蝠) ※固有亜种
# 纳氏鼠耳蝠 - Myotis nattereri (ノレンコウモリ，暖帘蝙蝠)
## 嗡声鼠耳蝠 - M. n. bombinus (ホンドノレンコウモリ，本土暖帘蝙蝠)
# 普通伏翼 - Pipistrellus abramus (アブラコウモリ，油蝙蝠)
# 本州伏翼 - Pipistrellus endoi (モリアブラコウモリ，森油蝙蝠) ※固有种
# 萨氏伏翼 - Pipistrellus savii (オオアブラコウモリ，大油蝙蝠) ※迷行种
## P. s. velox (クロオオアブラコウモリ，黒大油蝙蝠)
## P. s. coreensis (コウライオオアブラコウモリ，高丽大油蝙蝠)
# 斯氏伏翼 - Pipistrellus sturdeei (オガサワラアブラコウモリ，小笠原油蝙蝠) ※绝灭种
# 北棕蝠 - Eptesicus nilssonii (キタクビワコウモリ，姫堀川蝙蝠)
## E. n. parvus (ヒメホリカワコウモリ，姫堀川蝙蝠)
# Eptesicus japonensis (クビワコウモリ，首轮蝙蝠) ※固有种
# 日本山蝠 - Nyctalus aviator (ヤマコウモリ，山蝙蝠)
# Nyctalus furvus (コヤマコウモリ，小山蝙蝠)
# 大蝙蝠 - Vespertilio superans (ヒナコウモリ，雏蝙蝠)
# 普通蝙蝠 - Vespertilio murinus (ヒメヒナコウモリ，姫雏蝙蝠) ※迷行种
# 亚洲宽耳蝠 - Barbastella leucomelas (チチブコウモリ，秩父蝙蝠)
## B. l. darjelingensis (チチブコウモリ，秩父蝙蝠)
# 大耳蝠 - Plecotus auritus (ウサギコウモリ，兎蝙蝠)
## P. a. sacrimontis (ニホンウサギコウモリ，日本兎蝙蝠) ※固有亜种
# 亚洲长翼蝠 - Miniopterus fuliginosus (ユビナガコウモリ，指长蝙蝠)
# 长翼蝠 - Miniopterus fuscus (リュウキュウユビナガコウモリ，琉球指长蝙蝠)
# 白腹管鼻蝠 - Murina leucogaster (テングコウモリ，天狗蝙蝠)
## M. l. hilgendorfi (ニホンテングコウモリ，日本天狗蝙蝠)
# Murina ryukyuana (リュウキュウテングコウモリ，琉球天狗蝙蝠) ※固有种 / 1997年発见、1998年新种认定。
# 乌苏里管鼻蝠 - Murina ussuriensis (コテングコウモリ，小天狗蝙蝠)
## 林管鼻蝠 - M. u. silvatica (ニホンコテングコウモリ，日本小天狗蝙蝠)
# 对马管鼻蝠 - Murina tenebrosa (クチバテングコウモリ，口羽天狗蝙蝠) ※固有种 / 1962年発见、1970年新种记载。
* 犬吻蝠科 Molossidae
# 宽耳犬吻蝠 - Tadarida insignis (オヒキコウモリ，尾曳蝙蝠)
## T. i. latouchei (スミイロオヒキコウモリ，墨色尾曳蝙蝠)
== 灵长目 Primate ==
Macaca fuscata
* 猴科 Cercopithecidae
# 日本猴 - Macaca fuscata (ニホンザル，日本猿) ※固有种 / 天然记念物
## M. f. fuscata (ホンドザル，本土猿)
## M. f. yakui (ヤクシマザル，屋久岛猿)
# 台湾猴 - Macaca cyclopis (タイワンザル，台湾猿) ※移入种
# 猕猴 - Macaca mulatta (アカゲザル，赤毛猿) ※移入种
== 兔形目 Lagomorpha ==
* 鼠兔科 Ochotonidae
# 极北鼠兔 - Ochotona hyperborea (ナキウサギ，鸣兎)
## O. h. yesoensis (エゾナキウサギ，虾夷鸣兎)
* 兔科 Leporidae
# 琉球兔 - Pentalagus furnessi (アマミノクロウサギ，奄美野黒兎) ※固有种 /特别天然记念物
# 雪兔 - Lepus timidus (ユキウサギ，雪兎)
## L. t. ainu (エゾユキウサギ，虾夷雪兎)
# 短尾兔 - Lepus brachyurus (ノウサギ，野兎) ※固有种
## L. b. angustidens (トウホクノウサギ，东北野兎)
## L. b. brachyurus (キュウシュウノウサギ，九州野兎)
## L. b. lyoni (サドノウサギ，佐渡野兎)
## L. b. okiensis (オキノウサギ，隠岐野兎)
# 穴兔 - Oryctolagus cuniculus (アナウサギ，穴兎) ※移入种
== 啮齿目 Rodentia ==
T. s. lineatus
* 松鼠科 Sciuridae
# 赤腹丽松鼠 - Callosciurus erythraeus (タイワンリス，台湾栗鼠) ※移入种
## C. e. thaiwanensis (タイワンリス，台湾栗鼠)
# 松鼠 - Sciurus vulgaris (キタリス，北栗鼠)
## S. v. orientis (エゾリス，虾夷栗鼠)
# 日本松鼠 - Sciurus lis (ニホンリス，日本栗鼠) ※固有种
# 花鼠 - Tamias sibiricus (シマリス，缟栗鼠)
## T. s. barberi (チョウセンシマリス，朝鲜缟栗鼠) ※移入种
## T. s. lineatus (エゾシマリス，虾夷缟栗鼠)
# 日本飞鼠 - Pteromys momonga (ホンドモモンガ，本土モモンガ) ※固有种
# 飞鼠 - Pteromys volans (タイリクモモンガ，大陆モモンガ)
## P. v. orii (エゾモモンガ，虾夷モモンガ) ※固有亜种
# 白颊鼯鼠 - Petaurista leucogenys (ムササビ，鼯鼠・鼺鼠) ※固有种
## P. l. leucogenys (キュウシュウムササビ，九州鼯鼠)
## P. l. nikkonis (ニッコウムササビ)
## P. l. oreas (ワカヤマムササビ，和歌山鼯鼠)
* 睡鼠科 Gliridae
# 日本睡鼠 - Glirulus japonicus (ヤマネ，山鼠) ※固有种 / 天然记念物
* 鼠科 Muridae
Apodemus speciosus
# 棕背䶄|棕背鼠平 - Clethrionomys rufocanus (タイリクヤチネズミ，大陆谷地鼠)
## C. r. bedfordiae (エゾヤチネズミ，虾夷谷地鼠)
## 库页鼠平 - C. r. sikotanensis (シコタンヤチネズミ，色丹谷地鼠)
# Clethrionomys rex (ムクゲネズミ，尨毛鼠)
## C. r. montanus (ミヤマムクゲネズミ，御山尨毛鼠) ※固有亜种
## C. r. rex (リシリムクゲネズミ，利尻尨毛鼠) ※固有亜种
# 红背䶄|红背鼠平 - Clethrionomys rutilus (ヒメヤチネズミ，姫谷地鼠)
## C. r. mikado (ミカドネズミ，帝鼠) ※固有亜种
# Eothenomys andersoni (ヤチネズミ，谷地鼠) ※固有种
## E. a. andersoni (トウホクヤチネズミ，东北谷地鼠)
## E. a. niigatae (ニイガタヤチネズミ，新潟谷地鼠)
## E. a. imaizumii (ワカヤマヤチネズミ，和歌山谷地鼠)
# Eothenomys smithii (スミスネズミ，スミス鼠) ※固有种
## E. s. okiensis (オキスミスネズミ，隠岐スミス鼠)
## E. s. smithii (スミスネズミ，スミス鼠)
## E. s. kageus (カゲネズミ，鹿毛鼠)
# 日本田鼠 - Microtus montebelli (ハタネズミ，畑鼠) ※固有种
## M. m. brevicorpus (サドハタネズミ，佐渡畑鼠)
## M. m. montebelli (ハタネズミ，畑鼠)
# 麝鼠 - Ondatra zibethicus (マスクラット) ※移入种
# 巢鼠 - Micromys minutus (カヤネズミ，萱鼠)
## M. m. aokii (ツシマカヤネズミ，対马萱鼠)
## M. m. japonicus (シコクカヤネズミ，四国萱鼠)
## M. m. hondonis (ホンシュウカヤネズミ，本州萱鼠)
# 黑线姬鼠 - Apodemus agrarius (セスジネズミ，背筋鼠)
# 日本姬鼠 - Apodemus argenteus (ヒメネズミ，姫鼠) ※固有种
## A. a. argenteus (ホンドヒメネズミ，本土姫鼠)
## A. a. celatus (オキヒメネズミ，隠岐姫鼠)
## A. a. hokkaidi (エゾヒメネズミ，虾夷姫鼠)
## A. a. sagax (ツシマヒメネズミ，対马姫鼠)
## A. a. tanei (タネヒメネズミ，种姫鼠)
## A. a. yakui (ヤクシマヒメネズミ，屋久岛姫鼠)
# 朝鲜姬鼠 - Apodemus peninsulae (ハントウアカネズミ，半岛赤鼠)
## A. p. giliacus (カラフトアカネズミ，桦太赤鼠)
# 大林姬鼠 - Apodemus speciosus (アカネズミ，赤鼠) ※固有种
## A. s. ainu (エゾアカネズミ，虾夷赤鼠)
## A. s. dorsalis (セグロアカネズミ，背黒赤鼠)
## A. s. insperatus (オオシマアカネズミ，大岛赤鼠)
## A. s. miyakensis (ミヤケアカネズミ，三宅赤鼠)
## A. s. navigator (オキアカネズミ，隠岐赤鼠)
## A. s. speciosus (ホンドアカネズミ，本土赤鼠)
## A. s. sadoensis (サドアカネズミ，佐渡赤鼠)
## A. s. tusimaensis (ツシマアカネズミ，対马赤鼠)
# 裔鼠 - Tokudaia osimensis (トゲネズミ，棘鼠) ※固有种 / 天然记念物
## 明氏裔鼠 - T. o. muenninki (オキナワトゲネズミ，冲縄棘鼠)
## T. o. osimensis (アマミトゲネズミ，奄美棘鼠)
## 德之岛刺鼠 - T. o. tokunoshimensis (トクノシマトゲネズミ，徳之岛棘鼠) ※2006年新种记载（Endo and Tsuchiya, 2006）。
# 褐家鼠 - Rattus norvegicus (ドブネズミ，沟鼠)
## R. n. caraco (ニホンドブネズミ，日本沟鼠)
## R. n. norvegicus (ヨウシュウドブネズミ，扬州沟鼠)
# 黑家鼠 - Rattus rattus (クマネズミ，熊鼠)
## R. r. diardi (マレーシアクマネズミ，マレーシア熊鼠)
## 达氏家鼠 - R. r. tanezumi (ニホンクマネズミ，日本熊鼠)
# 琉球鼠 - Diplorthrix legata (ケナガネズミ，毛长鼠) ※固有种 / 天然记念物
# 小家鼠 - Mus musculus (ハツカネズミ，廿日鼠)
## M. m. molossinus (ホンドハツカネズミ，本土廿日鼠)
## M. m. musculus (ヨウシュウハツカネズミ，扬州廿日鼠)
# 台湾小家鼠 - Mus caroli (オキナワハツカネズミ，冲縄廿日鼠)
* 河狸鼠科 Myocastoridae
# 河狸鼠 - Myocastor coypus (ヌートリア，海狸鼠・沼狸) ※移入种
== 食肉目 Carnivora ==
* 熊科 Ursidae
# 北极熊 - Ursus maritimus (ホッキョクグマ，北极熊) ※迷行种
# 棕熊 - Ursus arctos (ヒグマ，罴)
## U. a. yesoensis (エゾヒグマ，虾夷罴)
# 亚洲黑熊 - Ursus thibetanus (ツキノワグマ，月轮熊)
## 日本黑熊 - U. t. japonicus (ニホンツキノワグマ，日本月轮熊)
* 浣熊科 Procyonidae
# 浣熊 - Procyon lotor (アライグマ) ※移入种
# 食蟹浣熊 - Procyon cancrivorus (カニクイアライグマ) ※移入种
* 犬科 Canidae
N. p. viverrinus
V. v. schrencki
# 貉 - Nyctereutes procyonoides (タヌキ，狸)
## N. p. albus (エゾタヌキ，虾夷狸)
## N. p. viverrinus (ホンドタヌキ，本土狸) ※天然记念物
# 赤狐 - Vulpes vulpes (キツネ，狐)
## V. v. japonica (ホンドキツネ，本土狐)
## V. v. schrencki (キタキツネ，北狐)
# 狼 - Canis lupus (オオカミ，狼)
## 北海道狼 - C. l. hattai (エゾオオカミ，虾夷狼) ※绝灭种
## 日本狼 - C. l. hodophilax (ニホンオオカミ，日本狼) ※绝灭种
* 貂科 Mustelidae
M. m. anakuma
# 日本貂 - Martes melampus (テン，貂)
## M. m. melampus (ホンドテン，本土貂)
## 对马貂 - M. m. tsuensis (ツシマテン，対马貂) ※天然记念物
# 紫貂 - Martes zibellina (クロテン，黒貂)
## M. z. brachyura (エゾクロテン，虾夷黒貂)
# 日本鼬 - Mustela itatsi (イタチ，鼬) ※固有种
## M. i. asaii (オオシマイタチ)
## M. i. itatsi (ホンドイタチ，本土鼬)
## 琉球鼬 - M. i. sho (コイタチ，小鼬)
# 黄鼬 - Mustela sibirica (チョウセンイタチ，朝鲜鼬)
## 朝鲜鼬 - M. s. coreana (チョウセンイタチ，朝鲜鼬)
# 伶鼬 - Mustela nivalis (イイズナ，饭纲)
## M. n. namiyei (ニホンイイズナ，日本饭纲) ※固有种
# 白鼬 - Mustela erminea (オコジョ)
## 日本白鼬 - M. e. nippon (ホンドオコジョ，本土オコジョ) ※固有亜种
## 北海道白鼬 - M. e. orientalis (エゾオコジョ，虾夷オコジョ)
# 北美水貂 - Mustela vison (ミンク) ※移入种
# 獾 - Meles meles (アナグマ，穴熊)
## 日本獾 - M. m. anakuma (ニホンアナグマ，日本穴熊)
# 水獭 - Lutra lutra (カワウソ，川獭)
## 日本水獭 - L. l. whiteleyi (ニホンカワウソ，日本川獭) ※特别天然记念物 ※绝灭种
# 海獭 - Enhydra lutris (ラッコ，海獭・猟虎)
* 灵猫科 Viverridae
# 果子狸 - Paguma larvata (ハクビシン，白鼻芯)
* 獴科 Herpestidae
# 爪哇獴 - Herpestes javanicus (ジャワマングース) ※移入种
* 猫科 Felidae
P. b. euptilura
# 豹猫 - Prionailurus bengalensis (ベンガルヤマネコ，ベンガル山猫)
## P. b. euptilura (ツシマヤマネコ，対马山猫) ※天然记念物
## 西表山猫 - P. b. iriomotensis (イリオモテヤマネコ，西表山猫) ※固有种 /特别天然记念物 / 1967年新种记载。
* 海狮科 Otariidae
# 加州海狮 - Zalophus californianus (アシカ，苇鹿)
## 日本海狮 -Z. c. japonicus (ニホンアシカ，日本苇鹿) ※绝灭种
# 北海狮 - Eumetopias jubatus (トド，胡㺍)
# 海狗 - Callorthinus ursinus (オットセイ，腽肭脐)
* 海象科 Odobenidae
# 海象 - Odobenus rosmarus (セイウチ，海象) ※迷行种
* 海豹科 Phocidae
# 港海豹 - Phoca vitulina (ゼニガタアザラシ，銭形海豹)
# 斑海豹 - Phoca largha (ゴマフアザラシ，胡麻斑海豹)
## P. l. stejnegeri (ゴマフアザラシ，胡麻斑海豹)
# 环斑海豹 - Phoca hispida (ワモンアザラシ，轮纹海豹)
# 环海豹 - Histriophoca fasciata (クラカケアザラシ，鞍挂海豹)
# 髯海豹 - Erignathus barbatus (アゴヒゲアザラシ，颚须海豹)
== 偶蹄目 Artiodactyla ==
* 猪科 Suidae
# 野猪 - Sus scrofa (イノシシ，猪)
## 日本野猪 - S. s. leucomystax (ニホンイノシシ，日本猪) ※固有亜种
## 琉球野猪 - S. s. riukiuanus (リュウキュウイノシシ，琉球猪) ※固有亜种
* 鹿科 Cervidae
C. n. yesoensis
# 梅花鹿 - Cervus nippon (ニホンジカ，日本鹿)
## C. n. keramae (ケラマジカ，庆良间鹿) ※固有亜种 / 天然记念物
## C. n. nippon (ニホンジカ，日本鹿) ※固有亜种
## C. n. pulchellus (ツシマジカ，対马鹿) ※固有亜种
## C. n. taiouanus (タイワンジカ，台湾鹿) ※移入种
## C. n. yakushimae (ヤクシカ，屋久鹿) ※固有亜种
## C. n. yesoensis (エゾジカ，虾夷鹿) ※固有亜种
# 小麂 - Muntiacus reevesi (キョン，羌) ※移入种
* 牛科 Bovidae
Capricornis crispus
# 日本鬣羚 - Capricornis crispus (ニホンカモシカ，日本毡鹿) ※固有种 /特别天然记念物
== 海牛目 Sirenia ==
* 儒艮科 Dugongidae
# 儒艮 - Dugong dugon (ジュゴン，儒艮) ※天然记念物
== 鲸目 Cetacea ==
* 露脊鲸科 Balaenidae
# 北极鲸 - Balaena mysticetus (ホッキョククジラ，北极鲸)
# 露脊鲸 - Balaena glacialis (セミクジラ，背美鲸)
* 灰鲸科 Eschrichtiidae
# 灰鲸 - Eschrichtius robustus (コククジラ，克鲸)
* 须鲸科 Balaenopteridae
# 蓝鲸 - Balaenoptera musculus (シロナガスクジラ，白长须鲸)
# 长须鲸 - Balaenoptera physalus (ナガスクジラ，长须鲸)
# 鳁鲸 - Balaenoptera borealis (イワシクジラ，鰯鲸)
# 鳀鲸 - Balaenoptera edeni (ニタリクジラ，似鲸)
# 小鳁鲸 - Balaenoptera acutorostrata (ミンククジラ，小鰯鲸)
# 角岛鲸 - Balaenoptera omurai (ツノシマクジラ，角岛鲸) ※1998年死体発见、2002年新种発表。
# 座头鲸 - Megaptera novaeangliae (ザトウクジラ，座头鲸)
* 抹香鲸科 Physeteridae
# 抹香鲸 - Physeter marcrocephalus (マッコウクジラ，抹香鲸)
* 小抹香鲸科 Kogiidae
# 小抹香鲸 - Kogia breviceps (コマッコウ，小抹香)
# 矮抹香鲸 - Kogia simus (オガワマッコウ，小川小抹香)
* 喙鲸科 Ziphiidae
# 古氏剑吻鲸 - Ziphius carvirostris (アカボウクジラ，赤坊鲸)
# 太平洋剑喙鲸 - Indopacetus pacificus (タイヘイヨウアカボウモドキ，太平洋赤坊拟)
# 斯氏喙鲸 - Mesoplodon stejnegeri (オウギハクジラ，扇歯鲸)
# 卡氏喙鲸 - Mesoplodon carlhubbsi (ハッブスオウギハクジラ，ハッブス扇歯鲸)
# 瘤齿喙鲸 - Mesoplodon densirostris (コブハクジラ，瘤歯鲸)
# 杏齿喙鲸 - Mesoplodon ginkgodens (イチョウハクジラ，银杏歯鲸)
# 拜氏鲸 - Berardius bairdii (ツチクジラ，槌鲸)
* 独角鲸科 Monodontidae
# 独角鲸 - Monodon monoceros (イッカク，一角) ※迷行种
# 白鲸 - Delphinapterus leucas (シロイルカ，白海豚)
* 海豚科 Delphinidae
# 逆戟鲸 - Orcinus orca (シャチ，𩾇)
# 大吻巨头鲸 - Globicephala macrorhynchus (コビレゴンドウ，小鳍巨头)
# 巨头鲸 - Globicephala melas (ヒレナガゴンドウ，鳍长巨头) ※绝灭 (日本)
# 伪虎鲸 - Pseudorca crassidens (オキゴンドウ，冲巨头)
# 小逆戟鲸 - Feresa attenuata (ユメゴンドウ，梦巨头)
# 瓜头海豚 - Peponocephala electra (カズハゴンドウ，数歯巨头)
# 灰海豚 - Grampus griseus (ハナゴンドウ，花巨头)
# 短吻真海豚 - Delphinus delphis (マイルカ，真海豚)
# 长吻真海豚 - Delphinus capensis (ハセイルカ)
# 蓝白海豚 - Stenella coeruleoalba (スジイルカ，筋海豚)
# 弱原海豚 - Stenella attenuata (マダライルカ，斑海豚)
# 长嘴海豚 - Stenella longirostris (ハシナガイルカ，嘴长海豚)
# 宽吻海豚 - Tursiops truncatus (ハンドウイルカ，半道海豚)
# 太平洋斑纹海豚 - Lagenorhynchus obliquidens (カマイルカ，镰海豚)
# 北鲸豚 - Lissodelphis borealis (セミイルカ，背美海豚)
# 糙齿长吻海豚 - Steno bredanensis (シワハイルカ，皱歯海豚)
# 霍氏海豚 - Lagenodelphis hosei (サラワクイルカ，サラワク海豚)
* 鼠海豚科 Phocoenidae
# 大西洋鼠海豚 - Phocoena phocoena (ネズミイルカ，鼠海豚)
# 白腰鼠海豚 - Phocoenoides dalli (イシイルカ)
# 江豚 - Neophocaena phocaenoides (スナメリ，砂滑) ※天然记念物
== 参考文献 ==
* 阿部永他，1994，『日本の哺乳类』。东海大学出版会。
* 小宫辉之，2002，『フィールド ベスト図鉴 日本の哺乳类』。学习研究社。
* 今泉吉典，1960，『原色日本哺乳类図鉴』。保育社。