【日本淡水鱼类列表】
日本约有近600种的淡水、汽水(半海水)鱼类；其中外来种约有50种，原生种则有约550种。分布于河口的鱼类仍需要更详尽的调查，估计可能将现有的种类倍增，即1000种以上的种类存在。
== 七鳃鳗目 Petromyzontiformes ==
* 七鳃鳗科 Petromyzontidae
# 日本叉牙七鳃鳗 - Lethenteron japonicum (カワヤツメ，川八目)
# 黑尾叉牙七鳃鳗 - Lethenteron kessleri  (シベリアヤツメ)
# 雷氏叉牙七鳃鳗 - Lethenteron reissneri (スナヤツメ，砂八目)
# 叉牙楔齿七鳃鳗 - Entosphenus tridentatus (ミツバヤツメ)
== 半椎鱼目 Semionotiformes ==
* 鳞骨鱼科 Lepisosteidae
# 眼斑雀鳝 - Lepisosteus oculatus (スポッテッドガー)　※移入种
# 纺锤骨雀鳝 - Atractosteus spatula (アリゲーターガー)　※移入种
== 白眼鲛目 Carcharhiniformes ==
* 平滑鲛科 Triakididae
# 皱唇鲨 - Triakis scyllium (ドチザメ，奴智鲛)
* 白眼鲛目 Carcharhinidae
# 鼬鲨 - Galeocerdo cuvier (イタチザメ)
# 尖吻斜锯牙鲨 - Rhizoprionodon acutus (ヒラガシラ)
# 低鳍真鲨 - Carcharhinus leucas (オオメジロザメ，大目白鲛)
# 铅灰真鲨 - Carcharhinus plumbeus (メジロザメ)
* 丫髻鲛科 Sphyrnidae
# 路氏双髻鲨 - Sphyrna lewini (アカシュモクザメ)
== 鳐目 Rajiformes ==
* Pristidae
# 小齿锯鳐 - Pristis microdon (ノコギリエイ)
* 土𫚉科 Dasyatidae
# 赤𫚉 - Dasyatis akajei (アカエイ)
# 费氏窄尾𫚉 - Himantura fai (オグロオトメエイ)
== 鲟形目 Acipenseriformes ==
* 鲟科 Acipenseridae
# 中吻鲟 - Acipenser medirostris (チョウザメ，蝶鲛) ※国内绝灭
== 海鲢目 Elopiformes ==
* 海鲢科 Elopidae
# 夏威夷海鲢 - Elops hawaiensis (カライワシ)
* 大眼海鲢科 Megalopidae
# 大海鲢 - Megalops cyprinoides (イセゴイ，伊势鲤)
==鲱形目 Clupeiformes==
*鲱科 Clupeidae
#鳓 - Ilisha elongata (ヒラ，曹白鱼)
#寿南小沙丁鱼 - Sardinella zunasi (サッパ)
#太平洋鲱 - Clupea pallasii (ニシン，鲱、𬶠)
#斑𬶭 - Konosirus punctatus (コノシロ)
#日本海𬶭 - Nematalosa japonica (ドロクイ)
*鳀科 Engraulidae
#刀鲚 - Coilia nasus  (エツ，斉鱼、鲚) ※固有种
#黄鲫 - Setipinna tenuifilis (ツマリエツ)
#印度侧带小公鱼 - Stolephorus indicus (インドアイノコイワシ)
#康氏侧带小公鱼 - Stolephorus commersonnii (ヤエヤマアイノコイワシ)
#贝拉棱鳀 - Thryssa baelama (オオイワシ)
#汉氏棱鳀 - Thryssa hamiltoni (チョウセンタレクチ)
== 鳗形目 Anguilliformes ==
Anguilla marmorata
* 鳗鲡科 Anguillidae
# 日本鳗鲡 - Anguilla japonica (ウナギ，鳗)
# 太平洋双色鳗鲡 - Anguilla bicolor pacifica (ニューギニアウナギ)
# 欧洲鳗鲡 - Anguilla anguilla (ヨーロッパウナギ)　※移入种
# 花鳗鲡 -  Anguilla marmorata (オオウナギ，大鳗)
* 鯙科 Muraenidae
# 玫唇蛇鳝 - Echidna rhodochilus (ナミダカワウツボ)
# 淡网纹裸胸鳝 - Gymnothorax pseudothyrsoideus (アミメウツボ，网目鱓)
# 豹纹海鳝 - Muraena pardalis (トラウツボ，虎鱓)
# 尾鳝 - Uropterygius concolor (コゲウツボ)
* 蛇鳗科 Ophichthidae
# Lamnostoma polyophthalmum (ハクテンウミヘビ)
# 杂食豆齿鳗 - Pisodonophis boro (ゴマホタテウミヘビ)
== 胡瓜鱼目 Osmeriformes ==
* 胡瓜鱼科 Osmeridae
# 胡瓜鱼 - Osmerus eperlanus mordax (キュウリウオ，胡瓜鱼)
# 长体油胡瓜鱼 - Spirinchus lanceolatus (シシャモ，柳叶鱼) ※固有种
# 西太公鱼 - Hypomesus nipponensis (ワカサギ，若鹭、公鱼、鰙) ※固有种
# 池沼公鱼 - Hypomesus olidus (イシカリワカサギ)
# 日本公鱼 - Hypomesus japonicus (チカ)
# Hypomesus chishimaensis (チシマワカサギ)
Plecoglossus altivelis
* 香鱼科 Plecoglossidae
# 香鱼 - Plecoglossus altivelis
## 香鱼 - P. a. altivelis (アユ，鲇)
## 琉球香鱼 - P. a. ryukyuensis (リュウキュウアユ，琉球鲇) ※固有亜种
* 银鱼科 Salangidae
# 小齿日本银鱼 - Salangichthys microdon (シラウオ，白鱼)
# 石川日本银鱼 - Salangichthys ishikawae (イシカワシラウオ，石川白鱼)
# 雷氏新银鱼 - Neosalanx reganius (アリアケヒメシラウオ，有明姫白鱼) ※固有种
# 有明银鱼 - Salanx ariakensis  (アリアケシラウオ，有明白鱼)
== 鲑形目 Salmoniformes ==
* 鲑科 Salmonidae
O. m. masou 陆封型
O. m. rhodurus
# 远东哲罗鱼 - Hucho perryi  (イトウ，伊当、伊富)
# 玛红点鲑 - Salvelinus malma
## 克氏红点鲑 - S. m. krascheninnikovi (オショロコマ)
## 宫部红点鲑 - S. m. miyabei (ミヤベイワナ，宫部岩鱼) ※固有亜种
# 远东红点鲑 - Salvelinus leucomaenis
## 远东红点鲑 - S. l. leucomaenis
### S. l. leucomaenis 降海型 (アメマス，雨鳟、鲩鳟)
### S. l. leucomaenis 陆封型 (エゾイワナ，虾夷岩鱼)
## 雨红点鲑 - S. l. pluvius  (ニッコウイワナ，日光岩鱼) ※固有亜种
## 日本红点鲑 - S. l. japonicus (ヤマトイワナ，大和岩鱼) ※固有亜种
## 斑头红点鲑 - S. l. imbrius (ゴギ) ※固有亜种
# 美洲红点鲑 - Salvelinus fontinalis (カワマス) ※移入种
# 湖红点鲑 - Salvelinus namaycush (レイクトラウト) ※移入种
# 鳟 - Salmo trutta (ブラウントラウト) ※移入种
# 虹鳟 - Oncorhynchus mykiss (ニジマス) ※移入种
# 马苏大麻哈鱼 - Oncorhynchus masou
## 马苏大麻哈鱼 - O. m. masou
### O. m. masou 降海型 (サクラマス，桜鳟)
### O. m. masou 陆封型 (ヤマメ，山女)
## 石川马苏大麻哈鱼 - O. m. ishikawae ※固有种
### O. m. ishikawae 降海型 (サツキマス，皐月鳟、五月鳟)
### O. m. ishikawae 陆封型 (アマゴ，天鱼、雨鱼、甘子)
## 玫瑰马苏大麻哈鱼 - O. m. rhodurus (ビワマス，琵琶鳟) ※固有亜种
# 红大麻哈鱼 - Oncorhynchus nerka
## 红大麻哈鱼 - O. n. nerka
### O. n. nerka 降海型 (ベニザケ，红鲑)
### O. n. nerka 陆封型 (ヒメマス，姫鳟)
## 田沢湖亜种 (斑点大麻哈鱼) - O. n. kawamurae (クニマス，国鳟) ※固有亜种 / 绝灭
# 银大麻哈鱼 - Oncorhynchus kisutch (ギンザケ，银鲑)
# 大鳞大麻哈鱼 - Oncorhynchus tschawytscha (マスノスケ，鳟の介)
# 大麻哈鱼 - Oncorhynchus keta (サケ，鲑)
# 细鳞大麻哈鱼 - Oncorhynchus gorbuscha (カラフトマス，桦太鳟)
# 楚德白鲑 - Coregonus lavaretus maraena (シナノユキマス) ※移入种
== 仙女鱼目 Aulopiformes ==
* 合齿鱼科 Synodontidae
# 云纹蛇鲻 - Saurida nebulosa (ウチウミマダラエソ)
== 鼠𬶮目 Gonorynchiformes ==
* 虱目鱼科 Chanidae
# 虱目鱼 - Chanos chanos (サバヒー)
== 鲤形目 Cypriniformes ==
Zacco platypus
Nipponocypris sieboldii
* 鲤科 Cyprinidae
# Nipponocypris sieboldii (ヌマムツ，沼鯥) ※固有种
# 纵纹𫚭 - Nipponocypris temminckii (カワムツ，川鯥)
# 宽鳍𫚭 - Zacco platypus (オイカワ，追河)
# 真马口鱼 - Opsariichthys uncirostris uncirostris (ハス，鲥) ※固有种
# 锦波鱼 - Hemigrammocypris rasborella  (カワバタモロコ，川端诸子) ※固有种
# 中华细鲫 - Aphyocypris chinensis  (ヒナモロコ)
# 闪电斑马鱼 - Danio albolineatus (パールダニオ)　※移入种
# 印度斑马鱼 - Danio rerio (ゼブラダニオ)　※移入种
# 箱根三齿雅罗鱼 - Tribolodon hakonensis (ウグイ，石斑鱼、鯎)
# 杂食三齿雅罗鱼- Tribolodon brandti  (マルタ，丸太)
# Tribolodon nakamurai  (ウケクチウグイ) ※固有种
# 玫瑰三齿雅罗鱼 - Tribolodon ezoe (エゾウグイ，虾夷石斑鱼)
# 长尾鱥 - Phoxinus lagowskii
## P. l. steindachneri (アブラハヤ，油𬶏)
## P. l. yamamotis (ヤマナカハヤ) ※固有亜种
# 焦氏尖头鱥 - Phoxinus oxycephalus jouyi (タカハヤ，高𬶏) ※固有亜种
# 萨哈林湖鱥 - Phoxinus percnurus sachalinensis (ヤチウグイ)
# 丁鱥 - Tinca tinca (テンチ) ※移入种
# Ctenopharhyngodon idellus (ソウギョ) ※移入种
# 青鱼 - Ctenopharhynodon piceus (アオウオ) ※移入种
# 石川鱼 - Ischikauia steenackeri  (ワタカ，肠香、黄鱼) ※固有种
# 鳙 (花鲢) - Aristichtys nobilis (コクレン) ※移入种
# 鲢 (白鲢) - Hypophthalmichthys molitrix (ハクレン) ※移入种
# 暗色颌须𬶋 - Gnathopogon caerulescens (ホンモロコ，本诸子) ※固有种
# 长颌须𬶋 - Gnathopogon elongatus ※固有种
## 长颌须𬶋 - G. e. elongatus (タモロコ，田诸子)
## 诹访湖亜种 (短尾长颌须𬶋) - G. e. suwae (スワモロコ) ※固有亜种 / 绝灭
# 扁吻𬶋 - Pungtungia herzi (ムギツク，麦突)
# 麦穗鱼 - Pseudorasbora parva (モツゴ，持子)
# 北方麦穗鱼- Pseudorasbora pumila ※固有种
## 北方麦穗鱼 - P. p. pumila  (シナイモツゴ)
## P. p. subsp.  (ウシモツゴ)
# 琵琶湖鳈 - Sarcocheilichthys biwaensis  (アブラヒガイ，油鳇) ※固有种
# 杂色鳈 - Sarcocheilichthys variegatus ※固有种
## 杂色鳈 - S. v. variegatus (カワヒガイ，河鳇)
## 小眼鳈 - S. v. microoculus (ビワヒガイ，琵琶鳇)
# 长吻似𬶋 - Pseudogobio esocinus esocinus (カマツカ，镰柄)
# 棒花鱼 - Abbottina rivularis (ツチフキ，土吹)
# 琵琶湖𬶋 - Biwia zezera (ゼゼラ) ※固有种
# 兴凯银𬶋 - Squalidus chankaensis
## 琵琶湖银𬶋 - S. c. biwae  (スゴモロコ) ※固有种
## 朝鲜兴凯银𬶋 - S. c. tsuchigae (コウライモロコ，高丽诸子)
# 日本银𬶋 - Squalidus japonicus japonicus (デメモロコ，出目诸子) ※固有亜种
# 细银𬶋 - Squalidus gracilis gracilis (イトモロコ，糸诸子) ※固有亜种
# 长吻鱼骨 - Hemibarbus longirostris (ズナガニゴイ，头长似鲤)
# 日本鱼骨  - Hemibarbus barbus (ニゴイ，似鲤) ※固有种
# 唇䱻|唇鱼骨  - Hemibarbus labeo (コウライニゴイ，高丽似鲤)
# 鲤 - Cyprinus carpio (コイ，鲤)
# 日本白鲫 - Carassius cuvieri (ゲンゴロウブナ，源五郎鲋) ※固有种
# 鲫 - Carassius auratus
## C. a. subsp. (キンブナ，金鲋) ※固有亜种
## 布氏鲫 - C. a. buergeri (オオキンブナ，大金鲋)
## 大眼鲫 - C. a. grandoculis (ニゴロブナ，似五郎鲋) ※固有亜种
## C. a. subsp. (ナガブナ，长鲋) ※固有亜种
## 兰氏鲫 - C. a. langsdorfii  (ギンブナ，银鲋)
## 鲫 (金鱼) - C. a. auratus (キンギョ，金鱼)　※移入种
## 银鲫 - C. a. gibelio (ギベリオブナ)　※移入种
# 矛形田中鳑鲏 - Tanakia lanceolata (ヤリタナゴ，枪𫚈)
# 黄褐田中鳑鲏 - Tanakia limbata (アブラボテ)
# 关东田中鳑鲏 - Tanakia tanago  (ミヤコタナゴ，都𫚈) ※固有种 / 国指定の天然记念物
# 高体鳑鲏|高体鳑鱼皮 - Rhodeus ocellatus
## 高体鳑鲏 - R. o. ocellatus  (タイリクバラタナゴ)　※移入种
## 日本鳑鲏 - R. o. kurumeus  (ニッポンバラタナゴ) ※固有亜种
# 暗色鳑鲏 - Rhodeus atremius
## 九州亜种 (暗色鳑鲏) - R. a. atremius (カゼトゲタナゴ) ※固有亜种
## 山阳亜种 (粗纹暗色鳑鲏) - R. a. suigensis (スイゲンゼニタナゴ)
# 细鳞𫚪 - Acheilognathus typus (ゼニタナゴ，銭𫚈) ※固有种
# 斜方𫚪 - Acheilognathus rhombeus (カネヒラ，金平)
# 长鳍𫚪 - Acheilognathus longipinnis (イタセンパラ) ※固有种 / 国指定の天然记念物
# 黑腹𫚪 - Acheilognathus melanogaster (タナゴ，𫚈) ※固有种
# 纵带𫚪 - Acheilognathus cyanostigma (イチモンジタナゴ) ※固有种
# 巨口𫚪 - Acheilognathus tabira ※固有种
## 琵琶湖亜种 - A. t. tabira (シロヒレタビラ，白鳍田平)
## 山阴亜种 - A. t. subsp.  (アカヒレタビラ，赤鳍田平)
## 九州亜种 - A. t. nakamurae  (セボシタビラ)
# 大鳍𫚪 - Acheilognathus macropterus (オオタナゴ)　※移入种
* 鳅科 Cobitidae
# 短薄鳅 - Leptobotia curta (アユモドキ，鲇拟) ※固有种 / 国指定の天然记念物
# 泥鳅 - Misgurnus anguillicaudatus (ドジョウ，泥䲡)
# 大鳞泥鳅 - Misgurnus mizolepis (カラドジョウ)　※移入种
# 松原鳅 - Cobitis matsubarae (ヤマトシマドジョウ，大和缟泥䲡) ※固有种
# 条纹鳅 - Cobitis taenia striata (スジシマドジョウ，筋缟泥䲡) ※固有种
# 琵琶湖鳅 - Cobitis biwae (シマドジョウ，缟泥䲡) ※固有种
# 高鳅 - Cobitis takatsuensis (イシドジョウ，石泥䲡) ※固有种
# Cobitis shikokuensis (ヒナイシドジョウ)
# 后鳍花鳅 - Niwaella delicata  (アジメドジョウ，味女泥䲡) ※固有种
# 斑北鳅 - Lefua echigonia (ホトケドジョウ，仏泥䲡) ※固有种
# Lefua sp.  (ナガレホトケドジョウ) ※固有种
# 短体北鳅 - Lefua nikkonis (エゾホトケドジョウ，虾夷仏泥䲡) ※固有种
# 北鳅 - Lefua costata (ヒメドジョウ)　※移入种
# Noemacheilus barbatulus toni  (フクドジョウ)
== 鲶形目 Siluriformes ==
* 北美鲶科 Ictaluridae
# 斑真𫚔 - Ictalurus punctatus (チャネルキャットフィッシュ) ※移入种
* 𬶏科 Bagridae
# Pseudobagrus nudiceps (ギギ，义义) ※固有种 (Pelteobagrus nudiceps)
# 越南拟鲿 - Pseudobagrus tokiensis (ギバチ，义蜂) ※固有种
# 桔色拟鲿 - Pseudobagrus aurantiacus (アリアケギバチ，有明义蜂) ※固有种
# 石川氏拟鲿 - Pseudobagrus ichikawai (ネコギギ，猫义义) ※固有种 / 国指定の天然记念物
* 鲶科 Siluridae
# 花鲶 - Silurus asotus (ナマズ，鲶)
# 琵琶湖鲶 - Silurus biwaensis  (ビワコオオナマズ，琵琶湖大鲶) ※固有种
# 石鲶 - Silurus lithophilus (イワトコナマズ，岩床鲶) ※固有种
* 𫚔科 Amblycipitidae
# 红鱼央 - Liobagrus reinii (アカザ，赤佐) ※固有种
* 塘虱鱼科 Clariidae
# 胡鲶 - Clarias fuscus (ヒレナマズ)　※移入种
* 海鲶科 Ariidae
# 斑海鲶 - Arius maculatus  (ハマギギ)
# 硬头海鲶 - Arius leiotetocephalus (トウカイハマギギ)
* 鳗鲶科 Plotosidae
# 线纹鳗鲶 - Plotosus lineatus (ゴンズイ)
* 骨甲鲶科 Loricariidae
# 野脂身鲶 - Liposarcus disjunctivus (マダラロリカリア) ※移入种
== 鹤鱵目 Beloniformes ==
* 鱵科 Hemiramphidae
# 间下鱵鱼 - Hyporhamphus intermedius (クルメサヨリ)
# 日本下鱵鱼 - Hyporhamphus sajori (サヨリ，细鱼、鱵)
# 瓜氏下鱵鱼 - Hyporhamphus quoyi (センニンサヨリ)
# 纵带异鳞鱵 - Zenarchopterus dunckeri (コモチサヨリ)
* 鹤鱵科 Belonidae
# 尖嘴柱颌针鱼 - Strongylura anastomella (ダツ)
* 异鳉科 Adrianichthyidae
Oryzias latipes
# 青鳉 - Oryzias latipes (メダカ，目高)
== 鲤齿目 Cyprinodontiformes ==
* 花鳉科 Poeciliidae
# 食蚊鱼 - Gambusia affinis (カダヤシ) ※移入种
# 孔雀花鳉 - Poecilia reticulata (グッピー) ※移入种
# 黑花鳉 (摩丽鱼)- Poecilia sphenops (コクチモーリー) ※移入种
# 剑尾鱼 - Xiphophorus helleri (ソードテール) ※移入种
# 花斑剑尾鱼 - Xiphophorus maculatus (ムーンフィッシュ) ※移入种
== 海龙鱼目 Syngnathiformes ==
* 鼠鱼衔科Callionymidae
# 弯棘斜棘鱼衔 - Repomucenus curvicornis (ネズミゴチ，鼠鲬)
# 池田拟美尾鱼衔 - Pseudocalliurichthys ikedai (ナリタイトヒキヌメリ)
*  海龙科 Syngnathidae
# 毛须海龙 - Urocampus carinirostris (ミナミオクヨウジ)
# 舒氏海龙 - Syngnathus schlegeli (ヨウジウオ)
# 短尾腹囊海龙 - Microphis brachyurus brachyurus (テングヨウジ，天狗杨子)
# 菲律宾腹囊海龙 - Microphis jagorii (ヒメテングヨウジ)
# 无棘腹囊海龙 - Microphis leiaspis (イッセンヨウジ)
# 扁吻腹囊海龙 - Microphis argulus (ホシイッセンヨウジ)
# 雷氏腹囊海龙 - Microphis retzii (タニヨウジ)
# 笔状多环海龙 - Hippichthys penicillus (ガンテンイシヨウジ)
# 蓝点多环海龙 - Hippichthys cyanospilus (ハクテンヨウジ)
# 带纹多环海龙 - Hippichthys spicifer  (カワヨウジ，川杨子)
# 前鳍多环海龙 - Hippichthys heptagonus  (アミメカワヨウジ)
# 大海马 - Hippocampus kelloggi (オオウミウマ)
# 管海马 - Hippocampus kuda (クロウミウマ)
# 莫氏海马 - Hippocampus mohnikei (サンゴタツ)
== 银汉鱼目 Atheriniformes ==
* 银汉鱼科 Atherinidae
# 牙汉鱼 - Odonthestes bonariensis (ペヘレイ) ※移入种
# 蓝美银汉鱼 - Atherinomorus lacunosus (ヤクシマイワシ)
# 后肛下银汉鱼 - Hypoatherina tsurugae (ギンイソイワシ)
# 凡氏下银汉鱼 - Hypoatherina valenciennei (トウゴロウイワシ，三重志摩)
# 吴氏下银汉鱼 - Hypoatherina woodwardi (オキナワトウゴロウ)
== 鲻形目 Mugiliformes ==
* 鲻科 Mugilidae
# 鲻 - Mugil cephalus cephalus (ボラ，鲻)
# 鮻 - Chelon haematocheilus (メナダ，赤目鱼、眼奈太)
# Chelon affinis (セスジボラ)
# 澎湖鮻 - Chelon macrolepis (コボラ)
# 绿背鮻 - Chelon subviridis (アンピンボラ)
# - Chelon melinopterus (ヒルギメナダ)
# 多鳞莫鲻 - Moolgarda seheli (タイワンメナダ)
# 少鳞莫鲻 - Moolgarda perusii (ナンヨウボラ)
# - Moolgarda pedaraki (カマヒレボラ)
# 英氏莫鲻 - Moolgarda engeli (モンナシボラ)
# 粒唇鲻 - Crenimugil crenilabis (フウライボラ)
# 异唇粒唇鲻 - Crenimugil heterocheilos (ナガレフウライボラ)
# 黄鲻 - Ellochelon vaigiensis (オニボラ)
# Cestraeus sp. (カワボラ)
== 鲈形目 Perciformes ==
* 棘背鱼科 Gasterosteidae
# 三刺鱼 - Gasterosteus aculeateus complex 太平洋型 (イトヨ，糸鱼)
# Gasterosteus sp. 日本海型 (イトヨ，糸鱼)
# 小头刺鱼 - Gasterosteus microcephalus (ハリヨ)
# 八棘多刺鱼 - Pungitius pungitius (イバラトミヨ淡水型)
# Pungitius sp. omono type (イバラトミヨ雄物型) ※固有种
# Pungitius sp.  (イバラトミヨ汽水型)
# 图们江多刺鱼 - Pungitius tymensis (エゾトミヨ，虾夷富鱼)
# Pungitius sp. 1 (ムサシトミヨ，武蔵富鱼) ※固有种
# 南方多刺鱼 - Pungitius kaibarae (ミナミトミヨ，南富鱼) ※固有种 / 绝灭
* 鮨科 Serranidae
# 莹点石斑鱼 - Epinephelus caeruleopunctatus (ハクテンハタ)
# 纹波石斑鱼 - Epinephelus ongus (ナミハタ)
# 点带石斑鱼 - Epinephelus coioides (チャイロマルハタ)
* 绵鳚科|绵鱼尉科 Zoarcidae
# 长绵鱼尉 - Zoarces elongatus (ナガガジ)
* 鲉科 Scorpaenidae
# 无备平鲉 - Sebastes inermis (メバル，眼张)
# 许氏平鲉 - Sebastes schlegelii (クロソイ，黒曹以)
# 椭圆平鲉 - Sebastes oblongus (タケノコメバル，笋眼张)
# 厚头平鲉 - Sebastes pachycephalus pachycephalus (ムラソイ，斑曹以)
* 真裸皮鲉科 Tetrarogidae
# 无须真裸皮鲉 - Tetraroge niger (ヒゲソリオコゼ)
# 髭真裸皮鲉 - Tetraroge barbata (アゴヒゲオコゼ)
* 牛尾鱼科 Platycephalidae
# Platycephalus sp.  (マゴチ，真鲬)
# 鳄鲬 - Cociella crocodila (イネゴチ)
# 日本瞳鲬 - Inegocia japonica (トカゲゴチ)
* 六线鱼科 Hexagrammidae
# 大泷六线鱼 - Hexagrammos otakii (アイナメ，相尝・鲇并)
* 杜父鱼科 Cottidae
# 松江鲈 - Trachidermus fasciatus (ヤマノカミ，山の神)
# 西刺杜父鱼 - Cottus kazika  (カマキリ，镰切、杜夫鱼) ※固有种
# 图们江杜父鱼 - Cottus hangiongensis (カンキョウカジカ)
# 萨哈林杜父鱼 - Cottus amblystomopsis (エゾハナカジカ，虾夷花鳅)
# 大棘杜父鱼 - Cottus nozawae (ハナカジカ，花鳅) ※固有种
# 钝头杜父鱼 - Cottus pollux (カジカ，鳅) ※固有种
# 赖氏杜父鱼 - Cottus reinii  (ウツセミカジカ) ※固有种
* 线鳚科|线鱼尉科 Stichaeidae
# 黑体网鱼尉 - Dictyosoma burgeri (ダイナンギンポ，大滩银宝)
# 红斑网鱼尉 - Dictyosoma rubrimaculatum (ベニツケギンポ)
# 六线鱼尉 - Ernogrammus hexagrammus (ムスジガジ)
* 锦鳚科|锦鱼尉科 Pholidae
# 云斑锦鱼尉 - Pholis nebulosa (ギンポ，银宝)
== 攀鲈目 Anabantiformes ==
* 斗鱼科 Belontiidae
# 圆尾斗鱼 - Macropodus chinensis (チョウセンブナ) ※移入种
# 叉尾斗鱼 - Macropodus opercularis (タイワンキンギョ，台湾金鱼) ※移入种
* 鳢科 Channidae
# 乌鳢 - Channa argus (カムルチー) ※移入种
# 斑鳢 - Channa maculata (タイワンドジョウ) ※移入种
# 月鳢 (七星鳢) - Channa asiatica (コウタイ) ※移入种
== 日鲈目 Centrarchiformes ==
* 太阳鱼科 Centrarchidae
# 大口黑鲈 - Micropterus salmoides (オオクチバス) ※移入种
# Micropterus floridanus (フロリダバス) ※移入种
# 小口黑鲈 - Micropterus dolomieu (コクチバス) ※移入种
# 斑点黑鲈 - Micropterus punctulatus (スポッテッドバス) ※移入种
# 蓝鳃太阳鱼 - Lepomis macrochirus (ブルーギル) ※移入种
* 鱾科 Girellidae
# 斑鱾 - Girella punctata (メジナ，眼仁奈)
# 小鳞黑鱾 - Girella leonina (クロメジナ，冲眼仁奈)
* 汤鲤科 Kuhliidae
# 黑边汤鲤 - Kuhlia marginata  (ユゴイ，汤鲤)
# 大口汤鲤 - Kuhlia rupestris (オオクチユゴイ，大口汤鲤)
# 长棘汤鲤 - Kuhlia boninensis (トゲナガユゴイ)
* 细刺鱼科 Microcanthidae
# 细刺鱼 - Microcanthus strigatus (カゴカキダイ)
* 鳜科 Sinipercidae
# 川目少鳞鳜 - Coreoperca kawamebari  (オヤニラミ，亲睨)
* 𬶟科 Terapontidae
# 突吻𬶟 - Rhynchopelates oxyrhynchus (シマイサキ，缟伊佐木)
# 细鳞𬶟 - Terapon jarbua (コトヒキ，琴引)
# Mesopristes iravi (シミズシマイサキ)
# 银身中锯𬶟 - Mesopristes argenteus (ニセシマイサキ)
# 格纹中锯𬶟 - Mesopristes cancellatus (ヨコシマイサキ)
== 钩头鱼目 Kurtiformes ==
* 天竺鲷科 Apogonidae
# 弓线天竺鲷 - Apogon amboinensis (アマミイシモチ)
# 扁头天竺鲷 - Apogon hyalosoma (カガミテンジクダイ)
# 半线天竺鲷 - Apogon semilineatus (ネンブツダイ)
# 侧条天竺鲷 - Apogon lateralis (ワキイシモチ)
# 红尾圆竺鲷 - Sphaeramia orbicularis (ホソスジマンジュウイシモチ)
# 钝尾拟天竺鲷 - Pseudamia amblyuroptera (ヒルギヌメリテンジクダイ)
== 鲹形目 Carangiformes ==
* 鲹科 Carangidae
# 六带鲹 - Caranx sexfasciatus (ギンガメアジ，银河目鯵)
# 珍鲹 - Caranx ignobilis  (ロウニンアジ，浪人鯵)
== 蝴蝶鱼目 Chaetodontiformes ==
* 鲾科 Leiognathidae
# 小牙鲾 - Gazza minuta (コバンヒイラギ)
# Gazza rhombea (ヒシコバンヒイラギ)
# 颈斑鲾 - Leiognathus nuchalis (ヒイラギ，柊鱼)
# 长棘鲾 - Leiognathus fasciatus (シマヒイラギ)
# 短棘鲾 - Leiognathus equulus (セイタカヒイラギ)
# 黑边鲾 - Leiognathus splendens (タイワンヒイラギ)
== 松鲷目 Lobotiformes ==
* 松鲷科 Lobotidae
# 松鲷 - Lobotes surinamensis (マツダイ)
== 银鲈目 Gerreiformes ==
* 钻嘴鱼科 Gerreidae
# 红尾银鲈 - Gerres erythrourus (セダカクロサギ)
# Gerres equulus (クロサギ，黒鹭)
# 日本银𬬻 - Gerres japonicus (ダイミョウサギ，大名鹭)
# Gerres shima (シマクロサギ)
# 大棘银鲈 - Gerres macracanthus (ホソイトヒキサギ)
# 长棘银鲈 - Gerres filamentosus (イトヒキサギ)
== 笛鲷目 Lutjaniformes ==
* 石鲈科 Haemulidae
# 花尾胡椒鲷 - Plectorhinchus cinctus (コショウダイ)
# 驼背胡椒鲷 - Plectorhinchus gibbosus (クロコショウダイ)
# 白带胡椒鲷 - Plectorhinchus albovittatus (ダイダイコショウダイ)
# Hapalogenys sennin (ヒゲダイ)
* 笛鲷科 Lutjanidae
# 蓝点笛鲷 - Lutjanus rivulatus (ナミフエダイ)
# 黄足笛鲷 - Lutjanus fulvus (オキフエダイ)
# 紫红笛鲷 - Lutjanus argentimaculatus (ゴマフエダイ)
# 金焰笛鲷 - Lutjanus fulviflamma (ニセクロホシフエダイ)
# 勒氏笛鲷 - Lutjanus russellii (クロホシフエダイ)
# 巴布亚笛鱼尉 - Lutjanus goldiei (ウラウチフエダイ)
== 鲷形目 Spariformes ==
* 鲷科 Sparidae
Acanthopagrus schlegeli
# 黑鲷 - Acanthopagrus schlegeli (クロダイ，黒鲷)
# 黄鳍棘鲷 - Acanthopagrus latus (キチヌ，黄茅渟)
# 桔鳍棘鲷 - Acanthopagrus sivicolus (ミナミクロダイ，南黒鲷)
# 灰鳍棘鲷 - Acanthopagrus berda (ナンヨウチヌ，南洋茅渟)
# 平鲷 - Sparus sarba (ヘダイ，平鲷)
== 慈鲷目 Cichliformes ==
* 慈鲷科 Cichlidae
# 莫桑比克口孵非鲫 - Oreochromis mossambicus (カワスズメ) ※移入种
# 尼罗口孵非鲫 - Oreochromis niloticus (ナイルティラピア) ※移入种
# 石爬大咽非鲫 - Otopharynx lithobates (オトファリンクス・リトバテス) ※移入种
# 齐氏非鲫 - Tilapia zillii (ジルティラピア) ※移入种
# 布氏非鲫 - Tilapia buttikoferi (ティラピア・ブッティコフェリ) ※移入种
# 九间丽体鱼 - Cichlasoma nigrofasciatum (コンヴィクトシクリッド) ※移入种
# 匠丽体鱼 - Herichthys carpinte (テキサスシクリッド) ※移入种
== 鳚形目 Blenniiformes ==
*三鳍鳚科|三鳍鱼尉科 Tripterygiidae
# 陈氏双线鱼尉 - Enneapterygius cheni (ウラウチヘビギンポ)
* 鳚科|鱼尉科 Blenniidae
# 似肩鳃鱼尉 - Omox biporos (ヒルギギンポ)
# 斑头肩鳃鳚|斑头肩鳃鱼尉 - Omobranchus fasciolatoceps (トサカギンポ)
# 斑点肩鳃鱼尉 - Omobranchus punctatus (イダテンギンポ)
# 美肩鳃鱼尉 - Omobranchus elegans (ナベカ)
# 长肩鳃鱼尉 - Omobranchus elongatus (ゴマクモギンポ)
# 猛肩鳃鱼尉 - Omobranchus ferox (カワギンポ，川银宝)
== 虾虎鱼目 Gobiiformes ==
* 溪鳢科 Rhyacichthyidae
# 溪鳢 - Rhyacichthys aspro (ツバサハゼ，翼鲨)
* 塘鳢科 Eleotridae
# 安汶嵴塘鳢 - Butis amboinensis (ヤエヤマノコギリハゼ)
# 中华乌塘鳢 - Bostrychus sinensis  (ジャノメハゼ)
# 头孔塘鳢 - Ophiocara porocephala  (ホシマダラハゼ)
# 尖头塘鳢 - Eleotris oxycephala (カワアナゴ，川穴子)
# 刺盖塘鳢 - Eleotris acanthopoma (チチブモドキ)
# 黑塘鳢 - Eleotris melanosoma (オカメハゼ)
# 褐塘鳢 - Eleotris fusca  (テンジクカワアナゴ)
# 似鲤黄黝鱼 - Hypseleotris cyprinoides (タナゴモドキ)
# Ophieleotris sp.  (タメトモハゼ)
# Ophieleotris sp.  (ゴシキタメトモハゼ)
# 棘鳃塘鳢 - Belobranchus belobranchus (エリトゲハゼ)
* 沙塘鳢科 Odontobutidae
# 小黄黝鱼 - Micropercops swinhonis (ヨコシマドンコ) ※移入种
# 暗色沙塘鳢 - Odontobutis obscura  (ドンコ，钝甲) ※固有种
# Odontobutis hikimius (イシドンコ)
* 𫚥虎科 Gobiidae
Periophthalmus modestus
# 种子岛美𫚥虎鱼 - Callogobius tanegasimae (タネハゼ)
# Callogobius sp. (ミスジハゼ) ※固有种
# 长鳍凡塘鳢 - Valenciennea longipinnis (サザナミハゼ)
# 六斑凡塘鳢 - Valenciennea sexguttata (ミズタマハゼ)
# 大鳞凡塘鳢 - Valenciennea puellaris (オトメハゼ)
# 多纹锯鳞𫚥虎鱼 - Priolepis semidoliata (イレズミハゼ)
# 日本矶塘鳢 - Eviota japonica (ミナミイソハゼ)
# Eviota ocellifer (ウラウチイソハゼ)
# 拟丝𫚥虎鱼 - Cryptocentroides insignis (ハスジマハゼ)
# 项冠𫚥虎鱼 - Cristatogobius lophius  (トサカハゼ)
# Cristatogobius aurimaculatus  (ヒメトサカハゼ)
# 浅色项冠𫚥虎鱼 - Cristatogobius nonatoae  (クロトサカハゼ)
# 斑纹舌𫚥虎鱼 - Glossogobius olivaceus (ウロハゼ)
# 钝吻舌𫚥虎鱼 - Glossogobius circumspectus (スダレウロハゼ)
# 盘鳍舌𫚥虎鱼 - Glossogobius celebius (イワハゼ，岩鲨)
# 金黄舌𫚥虎鱼 - Glossogobius aureus (コンジキハゼ)
# 双须舌𫚥虎 - Glossogobius bicirrhosus (アゴヒゲハゼ)
# - Glossogobius sp.  (フタゴハゼ)
# 双斑舌𫚥虎鱼 - Glossogobius biocellatus (ヒトミハゼ)
# 云斑裸颊𫚥虎鱼 - Yongeichthys criniger (ツムギハゼ)
# 纵带鹦𫚥虎鱼 - Exyrias puntang (インコハゼ)
# 饰衔𫚥虎鱼- Istigobius ornatus (カザリハゼ)
# 戈氏衔𫚥虎鱼 - Istigobius goldmanni (ヒメカザリハゼ)
# 凯氏衔𫚥虎鱼 - Istigobius campbelli (クツワハゼ)
# 大眼𫚥虎鱼 - Cabillus tongarevae (ヨリメハゼ)
# 深𫚥虎鱼 - Bathygobius fuscus (クモハゼ)
# - Bathygobius sp.  (カワクモハゼ)
# 椰子深𫚥虎鱼 - Bathygobius cocosensis (スジクモハゼ)
# 巴东深𫚥虎鱼 - Bathygobius padangensis (クロヤハズハゼ)
# 红丝𫚥虎鱼 - Flabelligobius russus (ウシオニハゼ)
# 蓝点丝𫚥虎鱼 - Cryptocentrus caeruleomaculatus (タカノハハゼ)
# 新加坡丝𫚥虎鱼 - Cryptocentrus singapurensis (オイランハゼ)
# 条纹丝𫚥虎鱼 - Cryptocentrus fasciatus (ムラサメハゼ)
# 大口犁突𫚥虎鱼 - Myersina macrostoma (ハゴロモハゼ)
# 黄点梵𫚥虎鱼 - Vanderhorstia ornatissima (ヤツシハゼ)
# 条腹裸滑𫚥虎鱼 - Psilogobius prolatus (ハラマキハゼ)
# 短唇钝𫚥虎鱼 - Amblygobius nocturnus (ホホベニサラサハゼ)
# 尾斑钝𫚥虎鱼 - Amblygobius phalaena (サラサハゼ)
# 林克钝𫚥虎鱼 - Amblygobius linki (ワカケサラサハゼ)
# 星塘鳢 - Asterropteryx semipunctata (ホシハゼ)
# Silhouettea sp.  (ニセシラヌイハゼ)
# 道津扁头𫚥虎鱼 - Silhouettea dotui (シラヌイハゼ)
# 裸项蜂巢𫚥虎鱼 - Favonigobius gymnauchen  (ヒメハゼ，姫鲨)
# 赖氏蜂巢𫚥虎鱼 - Favonigobius reichei (ミナミヒメハゼ)
# 黑带细棘𫚥虎鱼 - Acentrogobius moloanus (フタスジノボリハゼ)
# 紫鳍细棘𫚥虎鱼 - Acentrogobius janthinopterus (カスミハゼ)
# 弯纹细棘𫚥虎鱼 - Acentrogobius audax (ニセツムギハゼ)
# 裸项细棘𫚥虎鱼 - Acentrogobius suluensis (ホホグロスジハゼ)
# 多带细棘𫚥虎鱼 - Acentrogobius multifasciatus (セイタカスジハゼ)
# 头纹细棘𫚥虎鱼 - Acentrogobius viganensis (スズメハゼ)
# 青斑细棘𫚥虎鱼 - Acentrogobius viridipunctatus (キララハゼ)
# 犬牙细棘𫚥虎鱼 - Acentrogobius caninus (ホクロハゼ)
# 普氏细棘𫚥虎鱼 - Acentrogobius pflaumii (スジハゼ)
# Drombus sp.  (クロコハゼ)
# 芒𫚥虎鱼 - Mangarinus waterousi (ウチワハゼ)
# 拟沙𫚥虎鱼 - Parkraemeria ornata (ギンポハゼ)
# 彼氏冰𫚥虎鱼 - Leucopsarion petersii (シロウオ，素鱼)
# 竿𫚥虎鱼 - Luciogobius guttatus (ミミズハゼ，蚯蚓鲨) ※复数种存在
# Luciogobius sp.  (ミナミヒメミミズハゼ)
# 浅色竿𫚥虎鱼 - Luciogobius pallidus (イドミミズハゼ) ※固有种 ※复数种存在
# 白竿𫚥虎鱼 - Luciogobius albus (ドウクツミミズハゼ) ※固有种
# 长头竿𫚥虎鱼 - Luciogobius dormitoris (ネムリミミズハゼ) ※固有种
# 带𫚥虎鱼 - Eutaeniichthys gilli (ヒモハゼ)
# 眼瓣沟𫚥虎鱼 - Oxyurichthys ophthalmonema (マツゲハゼ)
# Oxyurichthys sp.  (カマヒレマツゲハゼ)
# 南方沟𫚥虎鱼 - Oxyurichthys visayanus (ミナミサルハゼ)
# Oxyurichthys sp.  (シマサルハゼ)
# 小鳞沟𫚥虎鱼 - Oxyurichthys microlepis (タテガミハゼ)
# Stenogobius sp.  (タネカワハゼ)
# 眼带狭𫚥虎鱼 - Stenogobius ophthalmoporus (ドウケハゼ)
# 黑首阿胡𫚥虎鱼 - Awaous melanocephalus (クロミナミハゼ，黒南鲨)
# 睛斑阿胡𫚥虎鱼 - Awaous ocellaris  (ミナミハゼ，南鲨)
# 栗色裸头𫚥虎鱼 - Gymnogobius castaneus  (ジュズカケハゼ)
# 塔氏裸头𫚥虎鱼 - Gymnogobius taranetzi (シンジコハゼ)
# Gymnogobius breunigii (ビリンゴ，微伦吾)
# 疣舌裸头𫚥虎鱼 - Gymnogobius isaza   (イサザ，𫚌) ※固有种
# 条尾裸头𫚥虎鱼 - Gymnogobius urotaenia (ウキゴリ)
# Gymnogobius opperiens  (シマウキゴリ)
# Gymnogobius petschiliensis  (スミウキゴリ)
# Gymnogobius macrognathos (エドハゼ，江戸鲨)
# 网纹裸身𫚥虎鱼 - Gymnogobius mororanus (ヘビハゼ)
# 颐突裸头𫚥虎鱼 - Gymnogobius uchidai (チクゼンハゼ) ※固有种
# 圆裸头𫚥虎鱼 - Gymnogobius cylindricus  (キセルハゼ) ※固有种
# 沟裸头𫚥虎鱼 - Gymnogobius scrobiculatus (クボハゼ) ※固有种
# Gymnogobius heptacanthus (ニクハゼ)
# 尾纹裸头𫚥虎鱼 - Chaenogobius annularis (アゴハゼ)
# Chaenogobius gulosus (ドロメ)
# 黄鳍刺𫚥虎鱼 - Acanthogobius flavimanus (マハゼ，真鲨)
# 矛尾刺𫚥虎鱼 - Acanthogobius hasta (ハゼクチ)
# 乳色刺𫚥虎鱼 - Acanthogobius lactipes (アシシロハゼ，足白鲨)
# 岛栖刺𫚥虎鱼 - Acanthogobius insularis  (ミナミアシシロハゼ，南足白鲨) ※固有种
# 爪哇拟𫚥虎鱼 - Pseudogobius javanicus (スナゴハゼ)
# 小口拟𫚥虎鱼 - Pseudogobius masago  (マサゴハゼ，真砂鲨)
# Pseudogobius sp.  (コクチスナゴハゼ)
# 罗氏裂身𫚥虎鱼 - Schismatogobius roxasi  (エソハゼ)
# 宽带裂身𫚥虎鱼 - Schismatogobius ampluvinculus  (シマエソハゼ)
# 颌鳞𫚥虎鱼 - Gnatholepis anjerensis (オオモンハゼ)
# 尖鳍寡鳞𫚥虎鱼 - Oligolepis acutipennis (ノボリハゼ)
# 大口寡鳞𫚥虎鱼 - Oligolepis stomias (クチサケハゼ)
# 斑纹雷𫚥虎鱼 - Redigobius bikolanus (ヒナハゼ，雏鲨)
# 环带雷𫚥虎鱼 - Redigobius balteatus (タスキヒナハゼ)
# 阿部鲻𫚥虎鱼 - Mugilogobius abei (アベハゼ，安倍鲨)
# Mugilogobius sp.  (イズミハゼ)
# 诸氏鲻𫚥虎鱼 - Mugilogobius chulae (ナミハゼ)
# 灰鲻𫚥虎鱼 - Mugilogobius fusca (フタホシハゼ)
# 小鲻𫚥虎鱼 - Mugilogobius parvus (ホホグロハゼ)
# Mugilogobius sp.  (タヌキハゼ)
# Mugilogobius sp.  (ムジナハゼ)
# 莱氏矮𫚥虎鱼 - Pandaka lidwilli (ゴマハゼ)
# 三斑矮𫚥虎鱼 - Pandaka trimaculata (ミツボシゴマハゼ)
# Pandaka sp. (マングローブゴマハゼ)
# 子陵吻𫚥虎鱼 - Rhinogobius giurinus (ゴクラクハゼ)
# Rhinogobius sp.  cross-band type (シマヨシノボリ，缟苇登)
# Rhinogobius sp.  depressed large-dark type (ヒラヨシノボリ)
# Rhinogobius sp.  large dark type (オオヨシノボリ，大苇登)
# Rhinogobius sp.  cobalt type (ルリヨシノボリ，瑠璃苇登)
# Rhinogobius sp.  Bonin Island type (オガサワラヨシノボリ，小笠原苇登) ※固有种
# Rhinogobius sp.  dark type (クロヨシノボリ，黒苇登)
# Rhinogobius sp.  yellow-belly type (キバラヨシノボリ，黄腹苇登) ※固有种
# Rhinogobius sp.  mozaic type (アヤヨシノボリ)
# Rhinogobius sp.  blue-belly type (アオバラヨシノボリ，青腹苇登) ※固有种
# Rhinogobius sp.  orange type (トウヨシノボリ，橙苇登)
# 河川吻𫚥虎鱼 - Rhinogobius flumineus  (カワヨシノボリ，川苇登) ※固有种
# Rhinogobius sp.  Tokai type (ウシヨシノボリ，东海苇登)
# Rhinogobius sp.  Biwa lake type (ビワヨシノボリ，琵琶苇登) ※固有种
# 暗缟𫚥虎鱼 - Tridentiger obscurus (チチブ，知知武)
# 短棘缟𫚥虎鱼- Tridentiger brevispinis (ヌマチチブ)
# 黄斑缟𫚥虎鱼 - Tridentiger kuroiwae (ナガノゴリ)
# 双带缟𫚥虎鱼 - Tridentiger bifasciatus (シモフリシマハゼ)
# 纹缟𫚥虎鱼 - Tridentiger trigonocephalus (アカオビシマハゼ)
# 裸项缟𫚥虎鱼 - Tridentiger nudicervicus (シロチチブ)
# 髭缟𫚥虎鱼 - Tridentiger barbatus (ショウキハゼ)
# 韧𫚥虎鱼 - Lentipes armatus (ヨロイボウズハゼ) ※固有种
# 环带瓢眼𫚥虎鱼 - Sicyopus zosterophorum  (アカボウズハゼ)
# 糙体瓢眼𫚥虎鱼 - Sicyopus leprurus (カエルハゼ，蛙鲨)
# 日本瓢鳍𫚥虎鱼 - Sicyopterus japonicus (ボウズハゼ，坊主鲨)
# 兔头瓢鳍𫚥虎鱼 - Sicyopterus lagocephalus (ルリボウズハゼ)
# 明仁枝牙𫚥虎鱼 - Stiphodon imperiorientis (ハヤセボウズハゼ) ※固有种
# 黑鳍枝牙𫚥虎鱼 - Stiphodon percnopterygionus (ナンヨウボウズハゼ，南洋坊主鲨)
# 菲律宾枝牙𫚥虎鱼 - Stiphodon atropurpureus (コンテリボウズハゼ)
# 桔红枝牙𫚥虎鱼 - Stiphodon surrufus (カキイロヒメボウズハゼ)
# 大弹涂鱼 - Boleophthalmus pectinirostris (ムツゴロウ，鯥五郎)
# 青弹涂鱼 - Scartelaos histophorus (トカゲハゼ)
# 斑叉牙𫚥虎鱼 - Apocryptodon punctatus (タビラクチ) ※固有种
# 弹涂鱼 - Periophthalmus modestus (トビハゼ，跳鲨)
# 银线弹涂鱼 - Periophthalmus argentilineatus (ミナミトビハゼ，南跳鲨)
# 高体盲𫚥虎鱼 - Brachyamblyopus anotus (アサガラハゼ)
# 等颌鳗𫚥虎鱼 - Taenioides limicola (ヒゲワラスボ)
# 须鳗𫚥虎鱼 - Taenioides cirratus (チワラスボ)
# Odontamblyopus lacepedii (ワラスボ，藁素坊)
* 凹尾塘鳢科 Ptereleotridae
# 纵带舌塘鳢 - Parioglossus lineatus (マイコハゼ)
# 带状舌塘鳢 - Parioglossus taeniatus (コマチハゼ)
# 背斑舌塘鳢 - Parioglossus raoi (ミヤラビハゼ)
# 台湾舌塘鳢 - Parioglossus formosus (ヨスジハゼ)
# 尾斑舌塘鳢 - Parioglossus dotui (サツキハゼ)
# 菲律宾舌塘鳢 - Parioglossus philippinus (ベニツケサツキハゼ)
# 横斑舌塘鳢 - Parioglossus rainfordi (コビトハゼ)
# 沼泽舌塘鳢 - Parioglossus palustris (ボルネオハゼ)
# 断带舌塘鳢 - Parioglossus interruptus (ヒメサツキハゼ)
# Parioglossus sp.  (ムスメハゼ)
* 沙𫚥虎科 Kraemeriidae
# 盘鳍塘鳢 - Gobitrichinotus radiocularis (ナミノコハゼ)
# 穴沙鳢 - Kraemeria cunicularia (スナハゼ)
# 汤加沙鳢 - Kraemeria tongaensis (トンガスナハゼ)
* 蚓𫚥虎科 Microdesmidae
# 纵带鱼尉𫚥虎鱼 - Gunnellichthys pleurotaenia (オオメワラスボ)
== 鲽形目 Pleuronectiformes ==
* 牙鲆科 Paralichthyidae
# 大牙斑鲆 - Pseudorhombus arsius (テンジクガレイ，天竺鲽)
# 牙鲆 - Paralichthys olivaceus (ヒラメ，鲆)
* 鲽科 Pleuronectidae
# 石鲽 - Kareius bicoloratus (イシガレイ，石鲽)
# 星斑川鲽 - Platichthys stellatus (ヌマガレイ，沼鲽)
# Pleuronectes pinnifasciatus (トウガレイ)
# 暗鲽 - Pleuronectes obscurus (クロガレイ)
# 横滨鲽 - Pleuronectes yokohamae (マコガレイ，真子鲽)
== 鲀形目 Tetraodontiformes ==
* 三棘鲀科 Triacanthidae
# 双棘三刺鲀 - Triacanthus biaculeatus (ギマ)
* 四齿鲀科 Tetraodontidae
# 星点多纪鲀 - Takifugu niphobles (クサフグ，草河豚)
# Takifugu snyderi (ショウサイフグ，潮际河豚)
# 豹纹多纪鲀 - Takifugu pardalis (ヒガンフグ，彼岸河豚)
# 凹鼻鲀 - Chelonodon patoca (オキナワフグ，冲縄河豚)
# 网纹叉鼻鲀 - Arothron reticularis (ワモンフグ)
# 线纹叉鼻鲀 - Arothron manilensis (スジモヨウフグ)
# 纹腹叉鼻鲀 - Arothron hispidus (サザナミフグ)
# 无斑叉鼻鲀 - Arothron immaculatus (カスミフグ)
* 二齿鲀科 Diodontidae
# 六斑刺鲀 - Diodon holocanthus (ハリセンボン)
== 合鳃鱼目 Synbranchiformes ==
* 合鳃鱼科 Synbranchidae
# 黄鳝 - Monopterus albus (タウナギ，田鳗)
== 地位未定 Incertae sedis ==
* 蓝子鱼科 Siganidae
# 褐蓝子鱼 - Siganus fuscescens (アイゴ)
# 蠕纹蓝子鱼 - Siganus vermiculatus (ムシクイアイゴ)
# 星蓝子鱼 - Siganus guttatus (ゴマアイゴ)
* 金钱鱼科 Scatophagidae
# 金钱鱼 - Scatophagus argus  (クロホシマンジュウダイ)
* 海鲫科 Embiotocidae
# 海鲋 - Ditrema temmincki (ウミタナゴ)
* 雀鲷科 Pomacentridae
# 五带豆娘鱼 - Abudefduf vaigiensis (オヤビッチャ)
# 条尾新雀鲷 - Neopomacentrus taeniurus (リボンスズメダイ)
# 紫色新雀鲷 - Neopomacentrus violascens (スミゾメスズメダイ)
* 石首鱼科 Sciaenidae
# 箕作黄姑鱼 - Nibea mitsukurii (ニベ，石持)
# 棘头梅童鱼 - Collichthys lucidus (カンダリ)
* 沙鮻科 Sillaginidae
# 细鳞𬶮 - Sillago parvisquamis (アオギス，青𬶮)
# 多鳞𬶮 - Sillago sihama (モトギス，元𬶮)
# 大鳞𬶮 - Sillago macrolepis (アトクギス，海鹈𬶮)
* 银鳞鲳科 Monodactylidae
# 银大眼鲳 - Monodachtylus argenteus (ヒメツバメウオ，姫燕鱼)
* 射水鱼科 Toxotidae
# 射水鱼 - Toxotes jaculatorix (テッポウウオ，鉄砲鱼)
* 金梭鱼科 Sphyraenidae
# 大鳞魣 - Sphyraena barracuda (オニカマス)
* 双边鱼科 Ambassidae
# 少棘双边鱼 - Ambassis miops (セスジタカサゴイシモチ)
# 断线双边鱼 - Ambassis interrupta (ナンヨウタカサゴイシモチ)
# 尾纹双边鱼 - Ambassis urotaenia (タカサゴイシモチ，高砂石持)
# 弯线双边鱼 - Ambassis buruensis (トゲナガタカサゴイシモチ)
# Ambassis commersoni (ハナダカタカサゴイシモチ)
# 兰副双边鱼 - Pseudambassis ranga (インディアングラスフィッシュ) ※移入种
* 梦鲈科 Moronidae
Lateolabrax japonicus
# 宽花鲈 - Lateolabrax latus (ヒラスズキ，平鲈)
# 花鲈 - Lateolabrax japonicus (スズキ，鲈)
# Lateolabrax sp. (タイリクスズキ，大陆鲈) ※移入种
* 尖嘴鲈科 Latidae
Lates japonicus
# 日本尖吻鲈 - Lates japonicus (アカメ，赤目) ※固有种