【鸟类分类系统】
2014年，基于全基因组测序（Whole-genome analyses）的鸟类分类系统公布，目前已经取代1980年代的鸟类DNA分类系统并广泛使用。
== 系统发育树 ==
=== IOC v12.2（2019）===
下图基于国际鸟类学大会（IOC）于2019年公布的鸟类发育树，括号内的数字为该目下的物种总数（基于IOC World Bird List, v12.1）。
=== Jarvis（2014）===
下图基于Jarvis, E.D. et al. (2014)的现代鸟类分支图，部分演化支的名称来自Yuri, T. et al. (2013)Prum2015。
== 鸟翼类 Avialae ==
* †Alcmonavis Alcmonavis
* †巴拉乌尔龙属? Balaur
* †热河鸟属 Jeholornis
* †胁空鸟龙属? Rahonavis
* †近鸟龙科? Anchiornithidae
** †近鸟龙属? Anchiornis
** †晓廷龙属? Xiaotingia
** †始中国羽龙属? Eosinopteryx
** †彩虹龙属? Caihong
** †曙光鸟属? Aurornis
** †Ostromia? Ostromia
** †足羽龙属? Pedopenna
** †丝鸟龙属? Serikornis
** †义县龙属? Yixianosaurus
* †始祖鸟科 Archaeopterygidae
** †始祖鸟属 Archaeopteryx
** †乌禾尔龙属 Wellnhoferia
* †擅攀鸟龙科? Scansoriopterygidae
** †擅攀鸟龙属? Scansoriopteryx
** †耀龙属? Epidexipteryx
** †奇翼龙属? Yi
** †浑元龙属? Ambopteryx
* † 雁荡鸟科 Yandangithiformes
** †Yandangornis? Yandangornis
=== 真鸟翼类 Euavialae ===
* †吉祥鸟属 Jixiangornis
*短尾鸟类 Avebrevicauda
** †杂食鸟形类 Omnivoropterygiformes
*** †Omnivoropteryx Omnivoropteryx
*** †Sapeornis Sapeornis
**尾综骨鸟类 Pygostylia
*** †中鸟属 Zhongornis?
*** †叶夫根鸟属 Evgenavis
*** †前鸟属 "Proornis"
*** †巾帼鸟科 Jinguofortisidae
**** †巾帼鸟属 Jinguofortis
**** †重明鸟属 Chongmingia
*** †孔子鸟目 Confuciusornithiformes
**** †孔子鸟属 Confuciusornis
**** †长城鸟属 Changchengornis
**** †始孔子鸟属 Eoconfuciusornis
**** †杨氏鸟属 Yangavis
*** †鸟胸骨类 Ornithothoraces
**** †反鸟亚纲 Enantiornithes
****真鸟类 Euornithes
*****今鸟形类 Ornithuromorpha
******扇尾类 Ornithurae
=== †反鸟亚纲 Enantiornithes ===
* †大凌河鸟 Dalingheornis
* †沙鸟 Elsornis
* †始小翼鸟 Eoalulavis
* †始华夏鸟 Eocathayornis?
* †飞天鸟 Feitianius
* †侯氏鸟 Houornis
* †辽宁鸟 Liaoningornis
* †辽西鸟 Liaoxiornis?
* †小反鸟 Microenantiornis
* †副原羽鸟属 Paraprotopteryx
* †原羽鸟 Protopteryx
* †原家洼鸟 Yuanjiawaornis
* †伊比利亚鸟科 Iberomesornithidae
** †伊比利亚鸟 Iberomesornis
** †诺盖尔鸟 Noguerornis
* †长翼鸟科 Longipterygidae
** †波罗赤鸟? Boluochia
** †弯齿鸟 Camptodontornis
** †长翼鸟 Longipteryx
** †长嘴鸟 Longirostravis
** †抓握鸟 Rapaxavis
** †扇尾鸟 Shanweiniao
** †盛京鸟 Shengjingornis
** †大平房鸟 Dapingfangornis
* †鹏鸟科 Pengornithidae
** †始鹏鸟属 Eopengornis
** †鹏鸟属 Pengornis
** †副鹏鸟属 Parapengornis
** †契氏鸟属 Chiappeavis
==== †真反鸟类 Euenantiornithes ====
* †曾祖鸟属 Abavornis
* †真翼鸟属 Alethoalaornis
* †慈母鸟属 Avimaia
* †续存鸟属 Catenoleimus
* †克拉图鸟属 Cratoavis
* †胫羽鸟 Cruralispennia
* †尖嘴鸟 Cuspirostrisornis
* †敦煌鸟属 Dunhuangia
* †埃尔布雷特鸟属 Elbretornis
* †琥珀鸟属 Elektorornis
* †始反鸟 Eoenantiornis
* †发现鸟属 Explorornis
* †曲肩鸟属 Flexomornis
* †葛利普鸟属 Grabauornis
* †纤细鸟属 Gracilornis
* †格日勒鸟 Gurilynia
* †赫伯鸟属 Holbotia
* †火山鸟 Huoshanornis
* †栖息鸟属 Incolornis
* †俊鸟属 Junornis
* †银河鸟 Kuszholia
* †大嘴鸟 Largirostrornis
* †勒库鸟 Lectavis
* †利尼斯鸟 Lenesornis
* †龙城鸟 Longchengornis
* †马丁鸟 Martinavis
* †孤反鸟 Monoenantiornis
* †侏儒鸟 Nanantius
* †黎明鸟属 Orienantius
* †鄂托克鸟属 Otogornis
* †微鸟属 Parvavis
* †食鱼反鸟属 Piscivorenantiornis
* †翼鸟属 Pterygornis
* †祁连鸟属 Qiliania
* †上羊鸟属 Shangyang
* †翔鸟属 Xiangornis
* †云加鸟 Yungavolucris
* †华夏鸟目 Cathayornithiformes
** †华夏鸟科 Cathyornithidae
*** †中国鸟属 Sinornis
*** †华夏鸟 Cathayornis
* †阿克西鸟目 Alexornithiformes
** †阿克西鸟科 Alexornithidae
*** †阿克西鸟 Alexornis
*** †土鸟 Sazavis
*** †克孜勒库姆鸟 Kizylkumavis
* †反鸟目 Enantiornithiformes
** †反鸟科 Enantiornithidae
*** †反鸟 Enantiornis
** †鸟龙鸟科 Avisauridae
*** †鸟龙鸟 Avisaurus
*** †矾鸟属 Bauxitornis
*** †昆卡鸟 Concornis
*** †反凰鸟属 Enantiophoenix
*** †海积鸟 Halimornis
*** †太阳鸟 Intiornis
*** †姐妹鸟龙鸟 Soroavisaurus
*** †内乌肯鸟 Neuquenornis
*** †妙阿尔刻鸟 Mirarce
*** †神秘鸟 Mystiornis
*** †盖帝鸟 Gettyia
* †渤海鸟科 Bohaiornithidae
** †渤海鸟 Bohaiornis
** †强壮爪鸟 Fortunguavis?
** †临沂鸟 Linyiornis?
** †长爪鸟 Longusunguis
** †副渤海鸟 Parabohaiornis
** †神七鸟 Shenqiornis
** †齿槽鸟 Sulcavis
** †周鸟 Zhouornis
* †戈壁鸟目 Gobipterygiformes
** †戈壁鸟科 Gobipterygidae
*** †戈壁鸟 Gobipteryx
*** †细弱鸟? Vescornis
*** †冀北鸟? Jibeinia
=== 真鸟类 Euornithes ===
* †古喙鸟属 Archaeorhynchus
* †卡冈杜亚鸟属 Gargantuavis?
* †花剌子模鸟属 Horezmavis?
* †建昌鸟属 Jianchangornis
* †普拉坦鸟属 Platanavis
* †叉尾鸟属 Schizooura
* †威利鸟属 Wyleyia?
* †星海鸟属 Xinghaiornis
* †钟健鸟属 Zhongjianornis
* †朝阳鸟目 Chaoyangiformes
** †朝阳鸟属 Chaoyangia
* †者勒鸟目 Zhyraornithi
** †者勒鸟属 Zhyraornis
* 今鸟形类 Ornithuromorpha
** †丽鸟属 Bellulornis
** †昌马鸟属 Changmaornis
** †丁氏鸟属 Dingavis
** †古食种鸟属 Eogranivora
** †甘肃鸟属 Gansus
** †旅鸟属 Iteravis
** †酒泉鸟属 Jiuquanornis
** †觉华鸟属 Juehuaornis
** †兴安鸟属 Khinganornis
** †乌如那鸟属 Vorona
** †玉门鸟属 Yumenornis
** †孟子鸟属 Mengciusornis
** †燕鸟目 Yanornithiformes
*** †红山鸟科 Hongshanornithidae
**** †始今鸟属 Archaeornithura
**** †红山鸟属 Hongshanornis
**** †长腿鸟属 Longicrusavis
**** †副红山鸟属 Parahongshanornis
**** †天宇鸟属 Tianyuornis
*** †松岭鸟科 Songlingornithidae
**** †松岭鸟 Songlingornis
**** †燕鸟 Yanornis
**** †义县鸟 Yixianornis
**** †食鱼鸟属 Piscivoravis
**** †霍兰鸟属? Hollanda
** †Patagopterygiformes Patagopterygiformes
*** †阿拉米托斯鸟属 Alamitornis
*** †巴塔哥尼鸟属 Patagopteryx
*** †银河鸟属 Kuszholia
===== 扇尾类 Ornithurae =====
*†虚椎鸟属 Apatornis
*†脑鸟属 Cerebavis
*†工会鸟属 Guildavis
*†忽视鸟属 Iaceornis
*†阈鸟属 Limenavis
*†秦鸟属 Qinornis
*†甘肃鸟属 Gansus
*†长嘴鸟属 Changzuiornis
*†飞翔鸟属 Tingmiatornis
*†加尔鸟属 Gallornis
*†鱼鸟类 Ichthyornithes
**†鱼鸟属 Ichthyornis
**†雅努斯鸟属 Janavis
*†Ambiortiformes Ambiortiformes
** †渐始鸟属 Ambiortus
**†神翼鸟属 Apsaravis
**†后弯鸟属? Palintropus
*†黄昏鸟目 Hesperornithes
** †烟山鸟属 Fumicollis
** †帕斯基亚鸟属 Pasquiaornis
** †河流鸟属 Potamornis
** †东方鸟属 Chupkaornis
** †潜水鸟属 Baptornis
** †布氏鸟属 Brodavis
** †大洋鸟属 Enaliornis
** †尤金鸟属 Judinornis
** †黄昏鸟科 Hesperornithidae
*** †亚洲黄昏鸟属 Asiahesperornis
*** †加拿大鸟属 Canadaga
*** †黄昏鸟属 Hesperornis
*** †副黄昏鸟属 Parahesperornis
*新鸟亚纲 Neornithes
== 新鸟亚纲 Neornithes ==
==== 古颚下纲 Palaeognathae ====
*†石板鸟目 Lithornithiformes （可能为并系群）
**†石板鸟科 Lithornithidae
***†属 Calciavis
***†副美洲鹫属 Paracathartes
***†裂缝鸟属 fissuravis
***†假䳍属 Pseudocrypturus
***†石板鸟属 Lithornis
*鸵鸟目 Struthioniformes
**鸵鸟科 Struthionidae
***鸵鸟属 Struthio
***†厚鸵属 Pachystruthio
***†?走隐士鸟属 Eremopezus
***†东方鸵鸟属 Orientornis
***†?古鸨属 Palaeotis
***†?雷米鸟属 Remiornis
*南方古颚类 Notopalaeognathae
**美洲鸵鸟目 Rheiformes
***美洲鸵鸟科 Rheidae
****鶆䴈属 Rhea
****†异美洲鸵属 Heterorhea
****†属 Hinasuri
***†后指鸵科 Opisthodactylidae
****†后指鸵属 Opisthodactylus
**†恐鸟目 Dinornithiformes
***†恐鸟科 Dinornithidae
****†巨恐鸟属 Dinornis
***†东部恐鸟科 Emeidae
****†灌木恐鸟属 Anomalopteryx
****†东部恐鸟属 Emeus
****†沿海恐鸟属 Euryapteryx
****†厚恐鸟属 Pachyornis
***†高原恐鸟科 Megalapterygidae
****†高原恐鸟属 Megalapteryx
**䳍形目 Tinamiformes
***䳍科 Tinamidae
****†克兰迪䳍属 Querandiornis
****䳍亚科 Tinaminae
*****䳍属 Tinamus
*****林䳍属 Nothocercus
*****穴䳍属 Crypturellus
****拟䳍亚科 Nothurinae
*****红翅䳍属 Rhynchotus
*****鸨尾䳍属 Nothoprocta
*****拟䳍属 Nothura
*****侏䳍属 Taoniscus
*****凤头䳍属 Eudromia
*****高原䳍属 Tinamotis
**新平胸类 Novaeratitae
***鹤鸵目 Casuariiformes
****†第欧根尼鹤鸵属 Diogenornis
****?†高鹤鸵属 Hypselornis （可能是鳄鱼）
****鹤鸵科 Casuariidae
*****鹤鸵 Casuarius
*****†拟鸸鹋属 Emuarius
*****鸸鹋属 Dromaius
***无翼鸟目 Apterygiformes
****无翼鸟科 Apterygidae
*****奇异鸟 Apteryx
*****†原奇异鸟属 Proapteryx
***†隆鸟目 Aepyornithiformes
****†象鸟科 Aepyornithidae
*****†象鸟属 Aepyornis
*****†穆氏象鸟属 Mullerornis
*****†巨象鸟属 Vorombe
==== 今颚下纲 Neognathae ====
===== 鸡雁小纲 Galloanserae =====
====== 齿雁类 Odontoanserae ======
* †齿翼鸟目 Odontopterygiformes
**†远洋鸟科 Pelagornithidae
***†原齿翼鸟属 Protodontopteryx
***†拟齿鸟属 Pseudodontornis
***†齿翼鸟属 Odontopteryx
***†森林鸟属 Dasornis
***†巨齿翼鸟属 Macrodontopteryx
***†巨齿鸟属 Gigantornis
***†卡斯皮齿翼鸟属 Caspiodontornis
***†拟古鹅属 Palaeochenoides
***†鼓岛鸟属 Tympanonesiotes
***†曲鸟属 Cyphornis
***†卢特齿翼鸟属 Lutetodontopteryx
***†骨齿鸟属 Osteodontornis
***†远洋鸟属 Pelagornis
* 雁形类 Anserimorphae
**†加斯顿鸟形目 Gastornithiformes
***†加斯顿鸟科 Gastornithidae
***?†驰鸟科 Dromornithidae
****†驰鸟属 Dromornis
****†巴拉沃地鸟属 Barawertornis
****†牛鸟属 Bullockornis
****†巨鸟属 Genyornis
****†伊班地鸟属 Ilbandornis
**†维加鸟形目 Vegaviiformes
***†维加鸟科 Vegaviidae
****†维加鸟属 Vegavis
****†极地鸟属 Polarornis
****†新潜鸟属 Neogaeornis
****†南鸟属 Australornis
****†水鸟属 Maaqwi
**雁形目 Anseriformes
***†冲突鸟属 Conflicto
***†鸭翼鸟属 Anatalavis
***†属 Naranbulagornis
***†普瑞斯比鸟科 Presbyornithidae
****†普瑞斯比鸟属 Presbyornis
****†属 Telmabates
****†雄化鸟属 Teviornis
****†属 Proherodius
****†属 Zhylgaia
****†拟石鸻属 Wilaru
***叫鸭科 Anhimidae
***鹊鹅科 Anseranatidae
***†副白眼鸭科 Paranyrocidae
***鸭科 Anatidae
====== 泛鸡形类 Pangalliformes ======
*†奥斯汀鸟属 Austinornis
*†拟鸡科 Gallinuloididae
**†拟鸡属 Gallinuloides
**†似副鹑属 Paraortygoides
*†副鹑科 Paraortygidae
**†副鹑属 Paraortygoides
**†火鹑属 Pirortyx
**†斯科派洛鹑属 Scopelortyx
**†花剌子模鹑属 Xorazmortyx
*†凯尔西冢雉科 Quercymegapodiidae
**†凯尔西冢雉属 Quercymegapodius
**†陶巴秧鸡属 Taubacrex
**†属 Ameripodius
*†森鸡科 Sylviornithidae
**†森鸡属 Sylviornis
**†斐济巨鸡属 Megavitiornis
*鸡形目 Galliformes
**冢雉科 Megapodidae
**凤冠雉科 Cracidae
**雉总科 Phasianoidea
***珠鸡科 Numididae
***齿鹑科 Odontophoridae
***雉科 Phasianidae
===== 新鸟小纲 Neoaves  =====
====== 夜鹰总目 Cypselomorphae  ======
*†古咬鹃科 Archaeotrogonidae
*夜鹰目 Caprimulgiformes
**油鸱科 Steatornithidae
**裸鼻鸱科 Aegothelidae
**蟆口鸱科 Podargidae
**林鸱科 Nyctibiidae
**夜鹰科 Caprimulgidae
*雨燕目 Apodiformes
**†崖雨燕科 Aegialornithidae
***崖雨燕属 Aegialornis
***首足鸟属 Primapus
**雨燕亚目 Apodi
***†原黑雨燕属 Procypseloides
***†Laputavis
***†斯科讷雨燕属 Scaniacypselus
***†始黑雨燕科 Eocypselidae
***雨燕科 Apodidae
***凤头雨燕科 Hemiprocnidae
**蜂鸟亚目 Trochili
***†Palescyvus
***†科 Cypselavidae
***†科 Jungornithidae
***蜂鸟科 Trochilidae
====== 鸽鸨类 Columbaves  ======
*鸨形总目 Otidimorphae
**蕉鹃目 Musophagidae
***蕉鹃科 Musophagidae
**鸨形目 Otidiformes
***鸨科 Otididae
**鹃形目 Cuculiformes
***杜鹃科 Cuculidae
*鸽形总目 Columbimorphae
**鸽形目 Columbiformes
***鸠鸽科 Columbidae
**沙鸡目 Pteroclidiformes
***沙鸡科 Pteroclidae
**拟鹑目 Mesitornithiformes
***拟鹑科 Mesitornithidae
====== 鹤形目 Gruiformes ======
*†松滋鸟科 Songziidae
*鹤亚目 Grui
**鹤总科 Gruoidea
***†科 Geranoididae
***†科 Parvigruidae
***秧鹤科 Aramidae
***喇叭鸟科 Psophiidae
***†始鹤科 Eogruidae
***鹤科 Gruidae
*秧鸡亚目 Ralli
**†镐嘴秧鸡科 Aptornithidae
**侏秧鸡科 Sarothruridae
**日䴘科 Heliornithidae
**秧鸡科 Rallidae
====== 水滨鸟类 Aequorlitornithes ======
*鸻形目 Charadriiformes
**鹬亚目 Scolopaci
***鹬科 Scolopacidae
**籽鹬亚目 Thinocori
***彩鹬科 Rostratulidae
***雉鸻科 Jacanidae
***籽鹬科 Thinocoridae
***领鹑科 Pedionomidae
**鸥亚目 Lari
***鸥科 Laridae
***贼鸥科 Stercorariidae
***燕鸻科 Glareolidae
***蟹鸻科 Dromadidae
***蓝腿燕鸻科 Pluvianidae
***泛海雀类 Pan-Alcidae
****海雀科 Alcidae
****†弱翅海雀亚科 Mancallinae
**三趾鹑亚目 Turnici
***三趾鹑科 Turnicidae
**鞘嘴鸥亚目 Chionidi
***石鸻科 Burhinidae
***鞘嘴鸥科 Chionididae
***麦哲伦鸻科 Pluvianellidae
**鸻亚目 Charadrii
***鹮嘴鹬科 Ibidorhynchidae
***蛎鹬科 Haematopodidae
***鸻科 Charadriidae
***反嘴鹬科 Recurvirostridae
*奇迹鸟类 Mirandornithes
**火烈鸟目 Phoenicopteriformes
***†江沙提克鸟 Juncitarsus
***†科 Palaelodidae
***火烈鸟科 Phoenicopteridae
**䴙䴘目 Podicipediformes
***䴙䴘科 Podicipedidae
*鹭形类 Ardeae
**日𫛚总目 Eurypygimorphae
***日𫛚目 Eurypygiformes
****鹭鹤科 Rhynochetidae
****日𫛚科 Eurypigidae
***鹲形目 Phaethontiformes
****†原鹲科 Prophaethontidae
****鹲科 Phaethontidae
**水鸟类 Aequornithes
***潜鸟目 Gaviiformes
****†属 Gaviella
****†科 Colymboididae
****潜鸟科 Gaviidae
***南极鸟类 Austrodyptornithes
****鹱形目 Procellariiformes
*****†拟信天翁科 Diomedeoididae
*****信天翁科 Diomedeidae
*****鹱科 Procellariidae
*****鹈燕科 Pelecanoididae
*****海燕科 Hydrobatidae
****企鹅目 Sphenisciformes
*****基干种类和未定种
******†人鸟企鹅属 Anthropodyptes
******†奇企鹅属 Aprosdokitos
******†鱼翼企鹅属 Ichthyopteryx
******†因古萨企鹅属 Inguza
******†凯因卡企鹅属 Kaiika
******†科罗拉企鹅属 Korora
******†核企鹅属 Nucleornis
******†直企鹅属 Orthopteryx
******†古王企鹅属 Palaeoapterodytes
******†属 Tasidyptes
******†雷恩加企鹅属 Tereingaornis
******†塔托尼欧企鹅属 Tonniornis
******†维曼企鹅属 Wimanornis
******†伪王企鹅属 Pseudaptenodytes
*****企鹅科 Spheniscidae
******†威马奴企鹅属 Waimanu
******†后威马奴企鹅属 Muriwaimanu
******†副威马奴企鹅属 Sequiwaimanu
******†凯鲁库企鹅属 Kairuku
******†巨鸟企鹅属 Kumimanu
******†横谷企鹅属 Crossvallia
******†秘鲁企鹅属 Perudyptes
******†伊卡企鹅属 Icadyptes
******†海皇企鹅属 Inkayacu
******†古环企鹅属 Archaeospheniscus
******†邓特伦企鹅属 Duntroonornis
******†古冠企鹅亚科 Palaeeudyptinae
*******†豚企鹅属 Delphinornis
*******†马兰比奥企鹅属 Marambiornis
*******†似马兰比奥企鹅属  Marambiornopsis
*******†梅塞塔企鹅属 Mesetaornis
*******†剑喙企鹅属 Anthropornis
*******†古冠企鹅属 Palaeeudyptes
*******†扁肱企鹅属Platydyptes
*******†厚企鹅属 Pachydyptes
*******†马普斯企鹅属 Marplesornis
******†古企鹅亚科 Palaeospheniscinae
*******†古企鹅属 Palaeospheniscus
*******†桨手企鹅属 Eretiscus
******†副王企鹅亚科 Paraptenodytinae
*******†副王企鹅属 Paraptenodytes
*******†节企鹅属 Arthrodytes
******企鹅亚科 Spheniscinae
*******王企鹅属 Aptenodytes
*******阿德利企鹅属 Pygoscelis
*******冠企鹅属 Eudyptes
*******黄眼企鹅属 Megadyptes
*******小蓝企鹅属 Eudyptula
*******环企鹅属 Spheniscus
***鹳形目 Ciconiiformes
****鹳科 Ciconiidae
***鲣鸟目 Suliformes
****鲣鸟科 Sulidae
****军舰鸟科 Fregatidae
****鸬鹚科 Phalacrocoracidae
****蛇鹈科 Anhingidae
****†泳翼鸟科 Plotopteridae
*****桨翼鸟属 Copepteryx
*****†北海道鸟属 Hokkaidornis
*****†卡拉兰姆鸟属 Klallamornis
*****†奥林匹克鸟属 Olympidytes
*****†海豹鸟属 Phocavis
*****†泳翼鸟属 Plotopterum
*****†属 Stemec
*****†属 Tonsala
***鹈形目 Pelecaniformes
****鹈鹕科 Pelecanidae
****鹭科 Ardeidae
****鲸头鹳科 Balaenicipitidae
****锤头鹳科 Scopidae
****鹮科 Threskiornithidae
====== 望外鸟类 Inopinaves ======
*麝雉目 Strigiformes
**麝雉科 Opisthocomidae
*陆鸟类 Telluraves
**非洲禽类 Afroaves
***鹰形总目 Accipitrimorphae
****美洲鹫目 Cathartiformes
*****†异鹫科 Teratornithidae
*****美洲鹫科 Cathartidae
****鹰形目 Accipitriformes
*****鹰科 Accipitridae
*****蛇鹫科 Sagittaridae
*****鹗科 Pandionidae
***鸮形目 Strigiformes
****智鸮科 Sophiornithidae
****†原鸮科 Ogygoptyngidae
****†科 Palaeoglaucidae
****†原鸱鸮科 Protostrigidae
****草鸮科 Tytonidae
****鸱鸮科 Strigidae
***佛法僧总目 Coraciimorphae
****鼠鸟目 Coliiformes
*****鼠鸟科 Coliidae
****穴鸟类 Cavitaves
*****鹃𫁡目 Leptosomiformes
******鹃𫁡科 Leptosomidae
*****真穴鸟类 Eucavitaves
******咬鹃目 Trogoniformes
*******咬鹃科 Trogonidae
******䴕翠鸟类 Picocoraciae
*******犀鸟目 Bucerotiformes
********戴胜亚目 Upupi
*********戴胜科 Upupidae
*********林戴胜科 Phoeniculidae
********犀鸟亚目 Buceroti
*********犀鸟科 Bucerotidae
*********地犀鸟科 Bucorvidae
*******演化支 Picodynastornithes
********佛法僧目 Coraciiformes
*********蜂虎科 Meropidae
*********地𫁡科 Brachypteraciidae
*********短尾𫁡科 Todidae
*********佛法僧科 Coraciidae
*********翠𫁡科 Momotidae
*********翠鸟科 Alcedinidae
**********翠鸟亚科 Alcedininae
**********翡翠亚科 Halcyoninae
**********鱼狗亚科 Cerylinae
********䴕形目 Piciformes
*********鹟䴕亚目 Galbuli
**********鹟䴕科 Galbulidae
**********喷䴕科 Bucconidae
*********䴕亚目 Pici
**********†鲁珀尔鵎鵼属 Rupelramphastoides
**********†科 Picavidae
**********鵎鵼下目 Ramphastides
***********拟啄木鸟科 Megalaimidae
***********非洲拟啄木鸟科 Lybiidae
***********须䴕科 Capitonidae
***********巨嘴拟䴕科 Semnornithidae
***********鵎鵼科 Ramphastidae
**********䴕下目 Picides
***********响蜜䴕科 Indicatoridae
***********啄木鸟科 Picidae
**南鸟类 Australaves
***叫鹤目 Cariamiformes
****†未定属 Elaphrocnemus
****叫鹤科 Cariamidae
****†骇鸟科 Phorusrhacidae
****†阿氏鸟科 Ameghinornithidae
****†高鸟科 Bathornithidae
****†异形鸟科 Idiornithidae
****†萨米拉鸟科 Salmilidae
****?†潜山鸟科 Qianshanornithidae
***真隼形类 Eufalconimorphae
****隼形目 Falconiformes
*****隼科 Falconidae
****鹦雀总目 Psittacopasserae
*****鹦形目 Psittaciformes
****** 科属种详见鹦形目分类表
*****雀形目 Passeriformes
******刺鹩亚目 Acanthisitti
*******刺鹩科 Acanthisittidae
******霸鹟亚目 Tyranni
*******阔嘴鸟下目 Eurylaimides
********阔嘴鸟科 Eurylaimidae
********阔嘴霸鹟科 Sapayoidae
********裸眉鸫科 Philepittidae
********八色鸫科 Pittidae
*******霸鹟下目 Tyrannides
********霸鹟科 Tyrannidae
********灶鸟科 Furnariidae
********蚁鵙科 Thamnophilidae
********蚁鸟科 Formicariidae
********蚁鸫科 Grallariidae
********窜鸟科 Rhinocryptidae
********食蚊鸟科 Conopophagidae
********蒂泰雀科 Tityridae
********伞鸟科 Cotingidae
********侏儒鸟科 Pipridae
******鸣禽亚目 Passeri
*******琴鸟总科 Menuroidea
********琴鸟科 Menuridae
********薮鸟科 Atrichornithidae
********短嘴旋木雀科 Climacteridae
********园丁鸟科 Ptilonorhynchidae
*******吸蜜鸟总科 Meliphagoidea
********细尾鹩莺科 Maluridae
********吸蜜鸟科 Meliphagidae
********刺莺科 Dasyornithidae
********斑啄果鸟科 Pardalotidae
********刺嘴莺科 Acanthizidae
*******弯嘴鹛科 Pomatostomidae
*******木鸫科 Orthonychidae
*******其他基础谱系
********冠极乐鸟科 Cnemophilidae
********啄果鸟科 Melanocharitidae
********垂耳鸦科 Callaeidae
********须吸蜜鸟科 Notiomystidae
*******鸦总科 Corvoidea
********冠啄果鸟科 Paramythiidae
********啸冠鸫科 Psophodidae
********疣眼鹟科 Platysteiridae
********丛鵙科 Malaconotidae
********科 Machaerirhynchidae
********钩嘴鵙科 Vangidae
********科 Pityriaseidae
********燕鵙科 Artamidae
********斑啸鹟科 Rhagologidae
********雀鹎科 Aegithinidae
********山椒鸟科 Campephagidae
********科 Mohouidae
********科 Neosittidae
********科 Eulacestomidae
********科 Oreoicidae
********啸鹟科 Pachycephalidae
********伯劳科 Laniidae
********绿鹃科 Vireonidae
********黄鹂科 Oriolidae
********卷尾科 Dicruridae
********扇尾鹟科 Rhipiduridae
********王鹟科 Monarchidae
********鸦科 Corvidae
********拟鸦科 Corcoracidae
********科 Melampittidae
********科 Ifritidae
********极乐鸟科 Paradisaeidae
*******雀下目 Passerida
********莺总科 Sylvioidea
*********噪眉科 Leiothrichidae
*********雀眉科 Pellorneidae
*********画眉科 Timaliidae
*********绣眼鸟科 Zosteropidae
*********莺科 Sylviidae
*********树莺科 Cettiidae
*********科 Scotocercidae
*********科 Erythrocercidae
*********长尾山雀科 Aegithalidae
*********科 Hyliidae
*********柳莺科 Phylloscopidae
*********鹎科 Pycnonotidae
*********燕科 Hirundinidae
*********马岛莺科 Bernieridae
*********蝗莺科 Locustellidae
*********苇莺科 Acrocephalidae
*********鹪眉科 Pnoepygidae
*********扇尾莺科 Cisticolidae
*********百灵科 Alaudidae
*********黑顶鹪鹩科 Donacobiidae
*********长嘴莺科 Macrosphenidae
*********文须雀科 Panuridae
*********斗鹎科 Nicatoridae
********鹟总科 Muscicapoidea
*********河乌科 Cinclidae
*********鹟科 Muscicapidae
*********鸫科 Turdidae
*********牛椋鸟科 Buphagidae
*********椋鸟科 Sturnidae
*********嘲鸫科 Mimidae
********雀总科 Passeroidea
*********雀科 Passeridae
*********岩鹨科 Prunellidae
*********鹡鸰科 Motacillidae
*********朱鹀科 Urocynchramidae
*********梅花雀科 Estrildidae
*********织布鸟科 Ploceidae
*********维达雀科 Viduidae
*********有9枚初级飞羽的鸣禽
**********绿森莺科 Peucedramidae
**********燕雀科 Fringillidae
**********总科 Emberizoidea
***********拟黄鹂科 Icteridae
***********森莺科 Parulidae
***********科 Icteriidae
***********科 Phaenicophilidae
***********科 Zeledoniidae
***********科 Teretistridae
***********裸鼻雀科 Thraupidae
***********科 Mitrospingidae
***********科 Rhodinocichlidae
***********科 Calyptophilidae
***********科 Nesospingidae
***********科 Spindalidae
***********美洲雀科 Cardinalidae
***********鹀科 Emberizidae
***********美洲鹀科 Passerellidae
***********铁爪鹀科 Calcariidae
********地位未定
*********可能为啄花鸟总科 Dicaeoidea
**********太阳鸟科 Nectariniidae
**********啄花鸟科 Dicaeidae
*********可能为太平鸟总科 Bombycilloidea
**********太平鸟科 Bombycillidae
**********棕榈䳭科 Dulidae
**********丝鹟科 Ptiliogonatidae
**********连雀科 Hypocoliidae
**********†夏威夷吸蜜鸟科 Mohoidae
*********可能为山雀总科 Paroidea
**********山雀科 Paridae
**********攀雀科 Remizidae
**********莺鹟科 Stenostiridae
*********可能为䴓总科 Sittoidea或旋木雀总科 Certhioidea
**********䴓科 Sittidae
**********旋壁雀科 Tichodromadidae
**********旋木雀科 Certhiidae
**********斑点旋木雀科 Salpornithidae
**********鹪鹩科 Troglodytidae
**********蚋莺科 Polioptilidae
*********可能为单型总科
**********非洲食蜜鸟科 Promeropidae
*********可能为单型总科
**********丛莺科 Hyliotidae
*********可能为戴菊总科 Reguloidea
**********戴菊科 Regulidae
********以下各科虽有时被划为雀下目，但更可能是雀形亚目的基群。
*********科 Chaetopidae
*********科 Eupetidae
*********科 Modulatricidae
*********岩鹛科 Picathartidae
*********叶鹎科 Chloropseidae
*********鸲鹟科 Petroicidae
*********林啸鹟科 Hylocitreidae
*********和平鸟科 Irenidae
*********丽星鹩鹛科 Elachuridae
*********锺雀科 Cracticidae