urseya Dağı'nın yanı sıra Kilis sınırının karşısındaki önemli bölgeleri ele geçirdi ve YPG'nin kilis bağlantısı kesildi. Türkiye Genel Kurmay Başkanlığı 19 Şubat itibarıyla aralarında bir belde merkezi ve 52 köyün de bulunduğu 78 noktanın ele geçirildiğini duyurdu. Suriye İnsan Hakları Gözlemevi (SOHR) de TSK ve ÖSO'nun Afrin'de bulunan köylerden yüzde 10'luk bir bölümünü ele geçirdiğini açıkladı.
2018 Şubat ayı itibarıyla çatışmadaki kayıplar arttı. Bir aylık periyotta TSK'dan 32 asker hayatını kaybederken, 170 asker yaralandı. ÖSO'nun da 60'dan fazla kayıp verdiği bilgisi 17 Şubat 2018 günü Recep Tayyip Erdoğan tarafından paylaşıldı. ÖSO kayıpları hakkında net bir bilgi açıklanmasa da Suriye Gözlemevi 200 civarında ÖSO'lunun öldüğünü iddia etti, YPG ve SDG ise 400'den fazla ÖSO kuvvetini öldürdüklerini öne sürdü. Açıklamalarda kayıplar konusunda büyük farklar gözükse bile Genelkurmay Başkanlığı 19 Şubat 2018 tarihine kadar 1641 YPG militanın etkisiz hale getirildiğini paylaştı. SDG ve Suriye Gözlemevi ise bu sayının çok daha altında olan kayıp bilgisi paylaştı. Buna göre SDG ve YPG açıklamalarına göre kendi kayıpları 100, Suriye Gözlemevi'ne göre de 197 YPG militanı öldü.

TSK tarafından düzenlenen hava harekatlarında bir aylık süreçte azalmalar gözüktü. 20-26 Ocak arasında 340, 27 Ocak-2 Şubat arasında 198, 3-11 Şubat arasında 89 ve 12-16 Şubat tarihleri arasında 47 hava harekatının düzenlendiği bilgisi Genelkurmay Başkanlığı tarafından paylaşıldı. Rusya jetinin şubat ayı içerisinde bölgedeki milis güçlerce düşürülmesi hava harekatların azalmasındaki ana sebep olarak görüldü.
Harekât Suriye ordusu veya Esad rejimi yanlısı milis güçler ile TSK ve ÖSO'nun çatışmasına da neden oldu. İlk olarak Suriye'nin YPG'lilere lojistik destek sağladığı bilgisi paylaşılırken, daha sonra bu doğu kısımdan gelen YPG militanlarına güneyden koridor açılmasıyla devam etti. Aynı zaman da PKK'nın Sincar bölgesinden Afrin'e birçok militanını gönderdiği iddia edildi. Harekâtın 31. gününde Suriye devlet televizyonu Suriye ordusuna bağlı güçlerin Afrin'e gireceğini duyurdu. Bunun üstüne Türkiye Dışişleri Bakanı Mevlüt Çavuşoğlu, Suriye ordusunun Afrin'e YPG'yi arındırmak için girmesinde problem görmediklerini fakat destek için girilirse Türkiye'nin tavrının ağır olacağını açıkladı. 20 Şubat 2018'de Halep'ten Afrin'e Suriye Ulusal Savunma Kuvvetleri, Şabi milisleri ve Bakır Tugayı konvoyunun hareket etti. Türk Silahlı Kuvvetleri bu konvoya uyarı olarak top atışlarında bulundu. İddialara göre konvoy bu uyarı atışları sonrası 10 kilometre geri çekildi. Afrin'e girmek isteyenler arasında Suriye Direnişi lideri Mihraç Ural'ın da olduğu iddia edildi. Sputnik'in haberine göre ise konvoy geri çekilmedi, Afrin'e giriş yaptı. Giden ilk grubun ardından Suriye hükûmeti yanlısı başka gruplarında Afrin'e giriş yaptığını duyuruldu.

22 Şubat'ın akşam saatlerinde Afrin'e silah ve mühimmat taşıyan 30-40 araçlık YPG konvoyu Türk Silahlı Kuvvetleri tarafından imha edildi. 26 Şubat 2018'de toplamda ele geçirilen 115 nokta ile YPG'nin Türkiye sınırıyla bağlantısı tümüyle kesildi. Daha sonra çatışmalar Raco ve Cinderes'te yoğunlaştı. TSK ve ÖSO 6 Mart 2018'de Roco'da kontrolü sağladı. Raco ve Cinderes’ten Afrin’e ulaşan kara yollarının da ele geçirildiği bilgisi paylaşıldı. 6 Mart tarihinde Suriye Demokratik Güçleri bileşenleri Rakka'da yaptıkları basın toplantısında Afrin dışında yer alan ve Fırat Nehri'nin doğusunda IŞİD'e karşı koalisyon güçleriyle birlikte görev yapan güçlerini Afrin'e gönderme kararı aldığını duyurdu. Bu gelişmeden birkaç gün önce ABD Savunma Bakanlığı yetkilileri çok sayıda SDG mensubunun operasyonları terk ettiğini ve Afrin'e gittiğini belirtmişti. Afrin'e geçen Devrimciler Ordusu'na bağlı yaklaşık 1.700 kişinin Deyrizor'dan hareket ettiği bildirildi. Raco beldesinin ele geçirilmesinin ardından 8 Mart 2018 günü Afrin'in güneyindeki Cinderes beldesi de TSK ve ÖSO tarafından ele geçirildi. Böylelikle harekâtın 47’nci gününde Afrin merkezine güneybatı ve kuzeydoğudan 8–10 km kadar yaklaşıldı.

TSK 13 Mart'ta yaptığı açıklamada 12 Mart günü Afrin kent merkezinin tamamen kuşatıldığını ve civardaki önemli bölgelerin ele geçirildiğini açıkladı. Takip eden günlerde civardaki çok sayıda köy ele geçirildi. 17 Mart günü doğudan batıya ve batıdan doğuya ilerleyen TSK birlikleri Afrin'in kuzeyinde buluştu. Afrin ilçe merkezine ilk olarak 23:45'te TSK Özel Kuvvetleri girdi. 18 Mart 2018'de Afrin ilçe merkezi Türk Silahlı Kuvvetleri ve Türkiye destekli Özgür Suriye Ordusu tarafından kontrol altına alındı. TSK yaptığı açıklamada harekatın devam ettiğini ve kontrol altına alınan bölgelerde operasyonların sürdürülmekte olduğunu açıkladı. Başbakan Yardımcısı ve Hükümet Sözcüsü Bekir Bozdağ da bölgede hayatın normalleşmesi için adımlar atılacağı, imar faaliyetlerine girileceği, gıdaya ve sağlığa erişimde sorun yaşanmaması için adımlar atılacağını açıkladı.

Afrin şehir merkezi 48 saatten daha kısa bir sürede düştü ve merkezin uzun ve zorlu bir abluka ile ele geçirileceği beklentisi gerçekleşmedi. TSK daha önce şehir merkezinde düzenlenecek operasyonlar için Özel Kuvvetlerini göndermiş, aynı zamanda hendek, mayın ve çeşitli patlayıcı tuzaklar için insansız araçlarını da bölgeye sevk etmişti. Kürt güçleri yaptığı açıklamada çekilmelerine gerekçe olarak sivillerin zarar görmemesini engellemek şeklinde açıkladı. Afrin Kantonu idari meclisi eş başkanı Osman Şeyh İsa "Türkiye ile savaşta yeni bir evreye girdiklerini" öne sürerken bundan sonra vur-kaç tekniği ile mücadele edeceklerini açıkladı. PYD eski eşbaşkanı Salih Müslim "Geri çekilmek savaşı kaybetmek anlamına gelmez" ifadelerini kullandı ve çatışmaların gerilla savaşı tarzında devam edeceğini iddia etti. Kent merkezinin ele geçirildiği gün ilçe merkezinde bulunan, Zerdüştlük inancında kutsal kabul edilen Demirci Kava heykeli Türkiye destekli Özgür Suriye Ordusu mensupları tarafından yıkıldı.

Merkezde sağlanan kontrol sonrasında özellikle Fransız haber ajansı AFP'nin geçtiği fotoğraflar ile ÖSO'dan bazı kişilerin kapalı durumdaki bazı iş yerlerinde evlerde yağma faaliyetinde bulundukları iddia edildi. Türkiye Cumhurbaşkanlığı Sözcüsü İbrahim Kalın yağma haberlerini dikkate aldıklarını ve olayın incelendiğini açıkladı. ÖSO yaptığı açıklamada yağmaya karışan iki mensubuyla ilişilerinin kestiğini ve yaptırımlara devam edileceği açıklandı. Türkiye Dışişleri Bakanı Mevlüt Çavuşoğlu "Buralarda bir şikayet veya talep gelirse titizlikle inceleriz." diyerek yağmaya ve insanlık suçlarına müsaade etmeyeceklerini ve bu konuda hassas oldukları açıkladı. Recep Tayip Erdoğan da bazı gruplarda ganimet anlayışının olduğu ve duruma hemen müdahele edildiğini söyledi.

Hârekatın başlamasını takip eden günlerde çeşitli sivil kayıplar yaşanırken farklı sayılarda sivil kayıp iddiaları da ortaya atıldı. Sınırın Suriye tarafındaki YPG kontrolündeki alandan Türkiye'ye yönelik olarak çok sayıda roket saldırısı gerçekleşti. Gece veya gündüz vakitlerinde Kilis ve Hatay'daki evlere
, çeşitli yerleşim yerlerine, tarihi Çalık Camisi'ne, iş yeri ve insanların toplu olarak bulunduğu alanlara isabet eden roket saldırıları yaşandı. Türkiye başbakanı Binali Yıldırım 15 günde 94 roket ve füze saldırısının yapıldığını, 7 sivilin hayatını kaybettiğini ve 113 kişinin yaralandığını açıkladı. TSK bu roketlere ÇNRA ve top atışlarıyla karşılık verdi. Afrin'deki YPG milis güçlerince sadece Türkiye'ye değil, Fırat Kalkanı Harekâtı ile kontrol altına alınan Azez'e ve El-Bab'a yönelik roket saldırılarında da onlarca sivil zaviyat yaşandı. YPG bu saldırılarının kendilerince gerçekleştirilmediğini öne sürdü. ABD Dışişleri Bakanı Rex Tillerson da YPG'den aldığı bilgilere dayanarak Türkiyeli mevkidaşı Mevlüt Çavuşoğlu'na YPG mevzilerinden Türkiye tarafına roket atılmadığını iddia etti. Çavuşoğlu da Tillerson’a “Kaynaklarını check et, bizimle onların ağzıyla konuşmayın” cevabını verdiğini ifade etti.

Afrin'de sivillerin, çocukların ve kadınların YPG milis güçlerinde canlı kalkan olarak kullanıldığını öne süren Türkiye, bu konuda Cenevre Sözleşmeleri gereğince neler yapılabileceği hükûmetçe ele aldı. Bu doğrultuda milis güçlerin olduğu bölgelerden halkın uzaklaşması için olanak sağlanıp, duyuru ve anonslar yapılacağı, uluslararası yasalar gereği süre tanıma uygulaması gibi farklı yöntemlerin gerçekleştirileceği bildirildi. Kuşatma sonrasında ise halka “teröristlerin kalkanı olmamaları, terör mevzi ve barınaklarından uzak durmaları”; PYD/PKK’lı teröristlere de “teslim olmaları” yönünde havadan Arapça ve Kürtçe bildiriler atıldı.

YPG kaynakları da Türk Silahlı Kuvvetleri'nin sivil kayıplara ve yaralanmalara neden olduğunu öne sürdü. "The Independent" Orta Doğu muhabiri Robert Fisk ve The Guardian muhabiri Martin Chulov operasyonun Afrin'de yaşayan mültecileri, kadınları, çocukları ve bebekleri etkilediğini ifade ederek çatışmalar ile yaşanan sivil kayıplara ilişkin bilgi verdiler. Rusya Dışişleri Bakanlığı Sözcüsü Mariya Zaharova, UNICEF ve Birleşmiş Milletler Genel Sekreteri António Guterres'in sözcüsü Stephane Dujarric de benzer görüşler paylaştı. Uluslararası Af Örgütü hem TSK hem YPG kaynaklı saldırılarda sivil kayıpların olduğunu aktardı. "İki tarafın da sivilleri ayırmaksızın bombardıman yaptığını" bildiren kuruluş, YPG ve TSK sorumluluğunda olduğu iddia edilen saldırıları raporladı.

Suriye resmi haber ajansı SANA, YPG ve Suriye İnsan Hakları Gözlemevi 17 Şubat 2018'de Türkiye'nin Afrin'de zehirli gaz kullandığını ve 6 sivilin etkilendiğini iddia etti. Fakat bu iddialar doğrulanamayarak dezenformasyon olarak kaldı. ABD öncülüğündeki IŞİD karşıtı koalisyon bu konuda doğrulanmış bilgiye sahip olmadıklarını açıklarken, Beyaz Saray bunu 'son derece olasılık dışı' olarak gördü. Konu Birleşmiş Milletler gündemine de geldi ve BM’nin Suriye Özel Temsilcisi Staffan de Mistura iddianın şu an için doğrulanamadığını açıkladı. Benzer şekilde iddianın doğrulanamadığı bilgisi Müzakere Yüksek Komitesi (HNC) tarafından da paylaşıldı. Lahey merkezli Kimyasal Silahla