ca takas sonucu önemli oyuncuların kaybedilmesiyle hem moral olarak hem de güç olarak inanılmaz düşen SuperSonics koç PJ Carlesimo ile birlikte sezona üst üste 8 mağlubiyetle başladı. Sezon sonunda Durant maç başına 20.3 sayı ortalamasıyla beklentileri karşılayıp Yılın Çaylağı ve Yılın Birinci Çaylak Beşi ödüllerini kazansa da takımı yılı 20 galibiyet 62 mağlubiyet ile tamamlayarak kulüp tarihinin en kötü sezonunu geçirdi. Bu takımın final sezonu olmuştu, çünkü takımı 2006'da satın alan Clay Bennett SuperSonics'i başka bir şehre taşımaya karar vermişti.

2006 yılında Seattle SuperSonics kulübünün başkanı Howard Schultz takımı ve WNBA'de mücadele eden Seattle Storm'u Oklahoma City şehrinde bulunan Clay Bennett'in başkanlığını yaptığı bir grup yatırımcıya NBA yöneticilerininde onayıyla 350 milyon dolar karşılığında sattığını açıkladı. 2007 yılında kulübün yeni sahibi Bennett takımın salonlarının bomboş kalması nedeniyle bir sene sonra Washington'dan taşınıp Oklahoma şehrine gideceğini açıkladı.

Takımın salonu Süpersonics'kenki salonu Key Arena'da ekibin kullandığı salon olarak iptal edilmeye çalışılıyordu. Başkan Bennett Seattle kent yönetimiyle uzun süren pazarlıkları sonucu Key Arena'yla kalan 2 yıllık leasing anlaşmasının iptal edilmesi için 45 milyon dolar ödemeyi kabul etti. Belirli koşullar sağlandığı takdirde 2013 yılında Seattle'a 30 milyon dolar daha kazanç sağlanabilir. Takımın sahipleri gelecekteki olası bir NBA takımı için Seattle SuperSonics adını, logosunu ve renklerinden ayırmayı kabul etti. Yani SuperSonics'in logosu, renkleri ve hakları Seattle şehrinde kalacaktı. Ancak olası bir şampiyonluk durumunda afiş ve kupa dahil olmak üzere Oklahoma City takımının tüm özellikleri olacaktı. 3 Eylül 2008 tarihinde takımın rekleri ve daha sonra ismi Oklahoma City Thunder olarak kamuoyuna açıklandı. Takımın 2. isminin Thunder olmasının sebebi şehirde çok sık yıldırım ve kasırga olmasındandı.

Takım 2008-09 sezonuna 2008 NBA Seçmeleri'nde 4. sıradan Russell Westbrook'u draft ederek başlamıştır. Birçok kişi bu seçimi çok ciddi biçimde eleştirip bu draftta kendisinden daha potansiyelli oyuncuların olduğunu söyleyip beğenmese de Westbrook gösterdiği performansla eleştirilerin haksız olduğunu göstermiştir. Ayrıca aynı drafttan 1. tur 24. sıradan Serge Ibaka draft edilse de 1 sezon daha Avrupa'da oynaması için çağrılmadı. Free agent'tan ise Sırp Pivot Nenad Krstić ile de anlaşılıp sözleşme imzalandı. Thunder 2008-09 sezonu başlamadan önce birçok hazırlık maçı yapmıştır. Hazırlık turnuvalarında görücüye ilk kez Minnesota Timberwolves'e 88-82 kaybettikleri maçta çıkmışlardır. Thunder takımı Ford Center'da ilk kez 14 Ekim'de Los Angeles Clippers'la oynadıkları hazırlık maçında oynamışlardır.

Oklahoma City 2008-09 normal sezonunda görücüye ilk kez 29 Ekim, 2008'de oynanan ve kendi evlerinde 87-98 kaybedilen Milwaukee Bucks maçında çıktı. Takımın bu maçta ve NBA tarihindeki ilk sayısını turnikeyle Earl Watson attı. Oklahoma takımı bu maçtan 3 gün sonra Minnesota Timberwolves'ı 88-85 skorla yenerek sezondaki ilk galibiyetiyle tanıştı. Sezona 1-10 gibi kötü dereceyle başladıktan sonra ekip daha sonra baş antrenörü PJ Carlesimo ve yardımcısı Paul Westhead'ı 22 Kasım tarihinde görevinden kovdu. Daha sonra baş antrenörlük görevine yardımcılardan geçici olarak Scott Brooks getirildi. 19 Şubat 2009 tarihinde Chicago Bulls ile yaptıkları takasta 2009 NBA Seçmeleri 1. tur draft hakkını Bulls'a vererek karşılığında swingman Thabo Sefolosha'yı aldılar. Bulls o hakkını 19. sıradan Taj Gibson'u seçerek kullandı.

Sezon devam ederken Thunder takımı düzelmeye başladı. 3 galibiyet 29 mağlubiyet ile devam ederlerken sonraki 50 maçın 20'sini kazandılar ve sezonu 23 galibiyet 59 mağlubiyet ile batı konferansını 11. sondan 3. sırada bitirdiler. Thunder'ın eski takımı Seattle ekibi ise önceki sezon 2007-08 sezonunda normal sezonda 82 maçta 20 galibiyet 62 mağlubiyet almıştı. Ayrıca sezon bittiğinde Scott Brooks ile takımın daima baş antrenörü olması konusunda anlaşıldı. Takımın sezona felaket başladıktan sonra biraz daha derli toplu görünmesi koçun kadroda tutulmasında etkili oldu.

Thunder takımı Seattle, Washington'dan Oklahoma City'e taşındıktan sonra takımın ekonomisinde çok ciddi bir yükselme olmuştur. Takımın toplam değeri geçen sezon 268.000.000 $'ken bu sezon %12'lik büyük bir artış olarak 300.000.000 $ milyon değere ulaştı. Bilet satışlarındada çok ciddi bir artış olduğu belirtildi. Forbes dergisinin açıkladığına göre Washington şehrinde Suppersonics takımı adında geçen sezon salon doluluğu %78'ken bu sezon Oklahoma kentinde Thunder takımıyla %100'e kadar yükseldi.

2009-10 sezonunun öncesinde birçok değişiklik yapan Thunder takımı ligdeki 2. sezonunda önceki seneye göre daha başarılı olmayı umuyordu. Oklahoma 2009 NBA Seçmeleri'nde 3. sıradan James Harden'ı draft etmesi haricinde sezon öncesi büyük bir hamle yapmadı. Aynı draftta 25. sıradan Rodrigue Beaubois'i seçselerde onu 24. sırada Dallas Mavericks'in seçtiği Byron Mullens karşılığında takas ettiler. Önceki sene draftta seçtikleri Serge Ibaka İspanya'dan takıma çağrılıp kadroya eklendi. Takım daha sonra kariyerinin son günlerini geçiren Etan Thomas ve Kevin Ollie'yi kadroya kattı. Son hamle olarak Russell Westbrook'un yedeğini arıyan Oklahoma Eric Maynor'u kadrosuna kattı.

Kevin Durant'in liderlik ettiği gelecek all-star Russell Westbrook, Serge Ibaka ve James Harden gibi genç oyuncularla artan momentumla Thunder önceki sezona göre çok büyük bir sıçrama yaptı. 2009-10 sezonu Doğu Konferansı şampiyonu Orlando Magic'e 26 sayı fark atması, son şampiyon Los Angeles Lakers'ıda 16 sayıyla yenmesi ve NBA'in en elit takımlar içinde yer alan takımlara karşı birkaç zaferler dahil, San Antonio Spurs, Utah Jazz, Miami Heat, Boston Celtics ve Dallas Mavericks galibiyetleri Oklahoma City'nin NBA'deki itibarını arttırmıştır. Art arda 9 galibiyet alarak harika bir kazanma serisi oluşturmuş birçok otoriteyi şaşırtmışlardır. Sezon sona erdiğinde Thunder'ın yıldız oyuncusu Kevin Durant 82 maçta maç başına 30.1 sayı ortalamasıyla oynayarak NBA tarihinde sayı kralı olan en genç oyuncu olma unvanına erişmiştir.

Thunder bu sezonu önceki sezondan iki kattan daha fazla maç kazanmayla 50 galibiyet 32 mağlubiyet alarak önceki sezona göre inanılmaz bir geri dönüş yaptı. Takım batıda play-off klasmanında ise kendi grubunu 4. Batı Konferansını ise 8. sırada bitirerek ilk kez play-off'lara kalmaya hak kazandı. 2010 NBA Playoffları'ndaki ilk turda rakipleri savunma kralı ve son NBA şampiyonu Los Angeles Lakers takımı oldu. Serideki ilk 2 maçı kazanan ekip L.A. Lakers oldu ve seride 2-0 öne geçtiler. 22 Nisan'da kendi evlerindeki maçı Oklahoma 101-96 kazandı ve bu onların kendi evlerindeki ilk play-off galibiyetleri oldu. Serideki 4. maçıda Kevin Durant'in etkili oyunuyla Thunder kazandı ve seride durum 2-2 oldu. Daha sonra iyi savunma yapan ve Oklahoma'nın yıldızlarını iyi tutan Lakers sonraki 2 maçı kazanıp seriyi 4-2 kazandı ve böylece Oklahoma elenip sezonu noktalamış oldu.
Sezon öncesi 2010 NBA Seçmeleri'nde 1. tur 18. sıradan Eric Bledsoe draft edilse de daha sonra Miami Heat ve Los Angeles Clippers'ında bulunduğu 3'lü takasta takas edildi. Thunder ise bu takastan Miami'den 2009 yılında All-Star'da üçlük yarışması şampiyonu olmuş Daequan Cook'u kadrosuna kattı. Aynı drafttan 21. sıradan Craig Brackins ve Quincy Pondexter'da 26. sıradan seçilseler de New Orleans Hornets'e Cole Aldrich ve Morris Petterson karşılığında takas edildiler. Atlanta Hawks'ın draftta 31. sıradan seçtiği Alman uzun Tibor Pleiß'ın draft haklarıda takasla alındı. Free agent'tan ise Royal Ivey bench oyuncusu olarak kadroya eklendi. Emektar uzun Etan Thomas ise Atlanta'ya takas edildi.

Oklahoma sezona iyi bir giriş yaptı. 26 Aralık, 2010 tarihinde oynanan Denver Nuggets maçında Kevin Durant 44 sayı atarak kariyer rekorunu kırdı ve Oklahoma'nın bir maçta en çok sayı atan oyuncusu olarak tarihe geçti. 24 Şubat, 2011 tarihinde Thunder takımı Boston Celtics takımıyla büyük bir takasa imza attı. Ellerindeki parlayan değer Jeff Green, Sırp oyuncuları Nenad Krstić ve 2012 yılında 2. tur draft hakkını Celtics takımına vererek karşılığında Nate Robinson ve Kendrick Perkins'i aldılar. Normal sezonun sonlarına doğru 4 Nisan tarihinde oynanan Minnesota Timberwolves maçında Russell Westbrook 16 asist yaparak bir maçta en çok asist yapan Thunder'lı oyuncu olarak Oklahoma City'nin kulüp tarihine geçti. Oklahoma 2010-11 normal sezonu 55 galibiyet 27 mağlubiyet ile Batı Konferansı'nda 4. sırada kapadı ve üst üste 2. kez play-off'lara yükselme başarısı gösterdi.

2011 NBA Playoffları ilk turundaki rakipleri kendilerinin ardından sezonu hemen 5. sırada tamamlayan Denver Nuggets oldu. Kevin Durant serinin ilk maçında 41 sayı atarak play-off kariyer rekorunu kırmasının yanında play-off'larda en çok sayı atan Thunder'lı oyuncu oldu. Serinin son karşılaşması olan final maçında Serge Ibaka 9 blok yaparak Mark Eaton, Hakeem Olajuwon'un 10 bloğu ve Andrew Bynum'un 9 blokluk performanslarından sonra bir play-off maçında en çok blok yapan oyunculardan birisi oldu. Ayrıca serinin final maçında Durant yine 41 sayı atarak rekorunu egale etti ve takımının maçı 100-97 seriyide 4-1 rahatça tur atlamasına yardımcı oldu. Konferans yarı finalindeki rakipleri ise sezonu 8. sırada bitirip 1. sırada tamamlayan San Antonio Spurs'ü ilk turda eleyerek tarihe geçen Memphis Grizzlies oldu. Bir kez daha tur atlayan taraf 7 maç sonunda 4-3'lük zor bir serinin ardından Kevin Durant ve Russell Westbrook'un sürüklediği Oklahoma oldu. Takım Batı Konferansı finallerine kaldı ve finaldeki rakipleri Dallas Mavericks oldu. Seriyi 4-1 ile rahat kazanan Dallas NBA finallerine yükselen takım oldu ve böylece Thunder'ın sezonu noktalandı.

2011-12 sezonu öncesi Thunder takımı kadrosuna pek fazla hamle yapmadı. İlgi çekici olarak takım 2011 NBA Seçmeleri'nden Reggie Jackson'ı 1. tur 24. sıradan draft etti. Ayrıca free agent'tan Lakers'ın eski önemli oyuncularından kariyerinin son baharı