da Avrupa’da ön eleme turları geçilmesine karşın gruplarda kupalara veda edilmiştir. 
1982-83 sezonunda lig 16 takımın 2 gruba ayrılmasıyla oynanmıştır (Kırmızı ve Beyaz Grup). Beyaz Grubu lider bitiren Efes, final grubunu da rahatça lider bitirerek, koç Rıza Erverdi ile 2. şampiyonluğuna ulaşmıştır. 
1983-84 sezonundaki en büyük hamle, Eczacıbaşı’nın efsane koçu Aydan Siyavuş’un takıma getirilmesidir. O sezon normal sezonu 2. Bitiren Efes, play-off’larda istediği sonuçları alarak üst üste 2. kez, toplamda ise 3. kez şampiyon olmuştur.

1983-84 şampiyonluğundan sonra 7 sezon boyunca istediği sonuçları almamasına ve şampiyonluğa hasret kalmasına rağmen Efes Pilsen, Avrupa kupalarında, elemeleri geçip grup maçlarında varlık göstermeye başlamıştır. 1989-90 sezonunda yine Aydan Siyavuş önderliğinde Koraç Kupasında oynanan çeyrek final ise o zamanlar kulüp açısından Avrupa Kupalarında zirve sezon olmuştur. Yine bu sezonda Koraç Kupası 1. Ön Eleme Turu’nda Avusturya’nın Win Wat Wieden takımına karşı İstanbul'da 111-47 kazanan Efes için bu galibiyet hala Avrupa'da aldığı en farklı galibiyettir. Öte yandan, 1986 yılında takım ilk kez Cumhurbaşkanlığı Kupasını kazanmıştır.

1991-92 sezonu Efes Pilsen için önemli bir dönemin başlangıcı olmuştur. Sezon ortasında antrenör Halil Üner ile yollar ayrılmış ve takımın başına, altyapı takımını çalıştıran ve daha sonra Türk basketbol tarihine damga vuracak olan Aydın Örs gelmiştir. Bu sezonda Efes, normal sezonu 4. bitirmesine karşın play-off’larda istediği sonuçları almış ve 7 yıllık aranın ardından yeniden şampiyon olmuştur. Ayrıca 1992 yılında Efes Pilsen, Avrupa Ligi final-four'unu İstanbul'da düzenleyerek, Türk basketbolseverlerin ilk kez bu heyecanı yaşamasını sağlamıştır. 
1992-93 sezonunda takıma, daha sonra efsaneleşecek olan Petar Naumoski katılmış ve normal sezonu (30 maç) yenilgisiz tamamlayan Efes, play-off’larda da hiç yenilmemiş ve sezonu toplam 40 galibiyet ve 0 yenilgi ile "tulum çıkartarak" şampiyon tamamlamıştır. Aynı sezon önce Avrupa Liginde, sonrasında ise Avrupa Kupasında mücadele eden Efes, Avrupa Kupasında final oynamış ve olaylı geçen maçta Yunanistan'ın Aris takımına Torino'da oynadığı maçı 50-48 kaybetmesine karşın, Türk Basketbolunda bir devrim yapmayı başarmıştır. Efes Pilsen 16 Mart 1993 günü Avrupa Kulüpler Kupası'nda final oynayarak bir Avrupa Kupası'nda final oynayan ilk Türk Kulübü olmuştur. Bu ilk Avrupa finali başarısı o güne kadar Türk basketbolu için en önemli başarı olarak kayıtlara geçmiştir. 
1993-94 sezonu başında Cumhurbaşkanlığı kupasını kazanan Efes bu sezonu da şampiyon tamamlamış ve üst üste 3. kez şampiyon olmuştur. Efes ayrıca Avrupa’nın 1 numaralı kupası olan EuroLeague'de çeyrek final oynama başarısını göstermiştir. Barcelona eşleşmesinden 2-1 yenik ayrılan Efes, ilk kez elde ettiği final-four şansını değerlendirememiştir. Ayrıca o sezon takım, 1973'ten sonra verilen aranın ardından 1992'de yeniden düzenlenmeye başlanan Türkiye Kupasını ilk kez müzesine götürmeyi başarmıştır. 
1994-95 sezonunda Naumoski’nin Benetton’a transferi takımı olumsuz etkilemiş ve takım Türkiye'de play-off’lara yarı finalde veda etmiştir. Avrupa’da da Avrupa Ligi’ne grup aşamasında veda edilmiştir. Efes Pilsen 1995'te, 1992'deki final-four organizasyonundan sonra, bu kez FIBA Avrupa Kupası (Saporta Kupası) finalini İstanbul'da organize etmiştir. 
1995-96 sezonu Efes Pilsen için efsane olarak nitelendirilebilecek bir sezondur. Sezon başında Naumoski 1 senelik Benetton macerasından sonra sezon başında takıma geri dönmüştür. Normal sezonu 28-2 ile lider bitiren Efes, play-off’larda hiç maç kaybetmemiş (finalde Ülkerspor’u 4-0’la süpürerek) ve ligi şampiyon tamamlamıştır. Bu başarıya Türkiye Kupası da eklenmiştir. Ancak asıl önemli olansa, takımın Petar Naumoski önderliğinde o sezon Koraç Kupasını kazanmasıdır. Eleme ve grup maçlarından sonra çeyrek finalde Fenerbahçe'yi, yarı finalde ise Teamsystem Bologna'yı eleyen Efes Pilsen finale yükselmiştir. O dönem iki maç üzerinden oynanan finalde, Bogdan Tanjevic yönetimindeki ve Dejan Bodiroga, Gregor Fucka, Ferdinando Gentile ve Rolando Blackman gibi yıldızları olan İtalyan Stefanel Milano ile karşılaşan Efes Pilsen, 6 Mart 1996'da İstanbul'da oynanan ilk maçı 76-68 kazanmıştır. Efes Pilsen, 13 Mart 1996'da Milano'da oynanan ikinci maçı 77-70 kaybederek, 1 sayı farkla da olsa kupayı kazanmayı başarmıştır. Maçın son saniyelerine 74-69 geride giren Efes Pilsen, Murat Evliyaoğlu ile kazandığı 2 serbest atıştan birini sayıya çevirerek maçı 74-70'e getirmiş ve maçın bitimine çok az bir süre kala önemli bir avantaj elde etmiştir. Son Stefanel hücumunda Efes Pilsen faul yapmamış, Gentile'nin üçlüğü ile maç 77-70 sonucu ile tamamlanmıştır. (Gentile'nin son hücumu formaliteden ibaretti.) Efes o sezon Koraç Kupasında aynı zamanda rakiplerini maç başına en az sayıda tutan (68.5 sayı) takım olmuştur. Stefanel, Tanjevic yönetiminde üst üste 3. kez finalde kaybederken, Efes Pilsen kupayı kazanarak Türk spor tarihinde yeni bir sayfa açmıştır. Böylece bir Avrupa Kupası kazanan ilk Türk Kulübü Efes Pilsen olmuştur. Bu başarı Türk Spor Tarihi bakımından bir devrim niteliğindedir ve bu devrimin altında imzası olan yine Efes Pilsen’dir. Efes bu sezonda Türkiye Ligi ve Kupasında 41 maçın 39’unu kazanırken, Koraç Kupasında da 16 maçın 12’sini kazanmıştır. Efes bu altın sezonu 3 kupa ile kapatmış ve kulüp tarihinin ve Türk basketbol tarihinin o güne kadarki en başarılı sezonuna imzasını atmıştır. Özellikle Koraç Kupasının kazanılması ile başta koç Aydın Örs olmak üzere, Petar Naumoski, Volkan Aydın, Ufuk Sarıca, Conrad McRae, Mirsad Türkcan, Tamer Oyguç ve Murat Evliyaoğlu gibi oyuncular efsaneleşmiştir. Efes’in o sezon sadece 2 yabancı basketbolcu ile bu kupayı kaldırması da önemli bir nottur. Bu kupa ile Efes artık Avrupa’nın elit takımları arasındaki yerini netleştirmiş ve güçlü bir “savunma” takımı olarak (özellikle alan savunması ile) tarihe geçmiştir. 
1996-97 sezonuna Vasily Karasev transferi ile giren Efes, sezon başında Cumhurbaşkanlığı Kupasının kazanmıştır. Bu sezonda da ligi ve Türkiye Kupasını kazanmıştır. Efes Avrupa Liginde de çeyrek final oynamış ve saha avantajına rağmen Asvel’e 2-1 ile elenerek final-four’un kapısından dönmüştür. Özellikle 3 Nisan 1997 günü Türk basketbolu için kara perşembe olarak bilinmektedir. 
1997-98 sezonunda ligi finalde kaybeden Efes, Türkiye Kupası ile teselli bulsa da, Avrupa’da geçen sezonki durum tekrarlanmış ve takım yine Avrupa Ligi çeyrek finalinde, bu kez Benetton’a 2-1’le geçirerek toplamda 3. kez final-four’u kaçırmıştır. Sezon sonunda altyapıdan yetişen Mirsad Türkcan’ın draft edilmesiyle ilk kez bir Türk oyuncu NBA’de oynama şansı kazanmıştır. Böylece NBA'e oyuncu gönderen ilk Türk takımı Efes Pilsen olmuştur. 
1998-99 sezonunda şampiyonluğu yine finalde kaybeden Efes, Avrupa Ligine de yine çeyrek finalde veda etmiştir. O sezonu şampiyon bitirecek olan Zalgiris’e 2-0’la geçilen Efes, 4. kez final four şansını değerlendirememiştir.

1999-2000 sezonunun başında takımın efsaneleri Petar Naumoski, Ufuk Sarıca ve Volkan Aydın ile yollar ayrılmıştır. Ekim ortasında da Aydın Örs istifa etmiş ve Efes Pilsen’de bir dönem böylece noktalanmıştır. Ancak sezon başında Naumoski yerine takıma Damir Mulaömerovic katılmıştır. Ayrıca transferde gelen İbrahim Kutluay ve kadroda bulunan Hidayet Türkoğlu, Predrag Drobnjak ve Ömer Onan gibi oyuncularla ile yine iddialı bir takım kurulmuştur. Takımı geçici olarak Oktay Mahmuti çalıştırmış ancak Ekim sonunda takımı baş antrenör olarak Ergin Ataman devralmıştır. Bu iki koç da Aydın Örs’ün yetiştirdiği koçlardır. Ataman yönetiminde Efes ligi finalde Tofaş’a kaybetse de, Avrupa’da yıllardır peşinden koştuğu hedefe ulaşmıştır. Avrupa Ligi’nde grup maçlarını 1. sırada tamamlayan Efes, 1/8 finalde Alba Berlin’i 2-0’la geçmiştir. Final-four’dan önceki son rakip, daha önce yine aynı seviyede karşılaşılan Asvel’dir. Saha avantajı Efes’tedir. Abdi İpekçi’deki ilk maçı Efes 93-85 kazanmıştır. Fransa’da ise 77-60’la gülen taraf Asvel’dir. Son maç ise ciddi gerginlikle geçmesine rağmen Efes bu kez 68-66 ile kazanmasını bilmiş ve tarihinde ilk kez final-four’a kalmıştır. 2000 yılında Selanik'te düzenlenen final-four'da yarı final’de Panathinaikos’a kaybeden Efes Pilsen, 3.lük maçında Efthimios Rentzias ve Milan Gurovic gibi yıldız oyuncuları olan Barcelona’yı devirmiş ve ilk kez Avrupa 3.sü olmuştur. Bu sonuçla Efes Pilsen, “Türk basketbolunda ilkler” hanesine yeni bir sonuç eklemiştir. 
2000-01 sezonuna da yine iddialı girilmiştir. Sezon başında Ülkerspor’u yenen Efes, Cumhurbaşkanlığı Kupasını kazanmıştır. Bu arada yine altyapıdan yetişen Hidayet Türkoğlu’nun NBA’e gitmesiyle, Efes NBA’e 2. kez oyuncu göndermiştir. 2001 Şubat sonunda Ergin Ataman’ın istifası ile baş antrenör Oktay Mahmuti olmuştur.

Aydın Örs ekolünden gelen Oktay Mahmuti yönetimindeki Efes Pilsen, 2000-2001 sezonunda ligi finalde kaybetmesine rağmen Türkiye Kupasını kazanmış ve Avrupa’da başarılı sonuçlar almıştır. Bu sezonda Avrupa Basketbolunda çıkan anlaşmazlıklar nedeniyle 2 adet 1 numaralı turnuva düzenlenmiştir (ULEB ve FIBA turnuvası). Türkiye’nin FIBA Suproleague’de yer alma kararı ile bu kupada mücadele eden Efes, yine final-four’a kalma başarısını göstermiştir. Paris'te düzenlenen final-four'da yarı finalde geçen sezonki gibi Panathinaikos’a yenilen Efes, 3.lük maçında CSKA Moskova’yı geçmiş ve art arda 2. kez Avrupa 3.sü olma onuruna erişmiştir. 
2001-2002 ve 2004-2005 sezonları arasında Mahmuti yönetiminde, tıpkı Aydın Örs döneminde olduğu gibi, güçlü bir savunma takımı olan Efes Pilsen üst üste 4 kez Türkiye Basketbol Ligi şampiyonu olmuştur. Bu sezonlarda, finallerde 3 kez Ülkerspor'a, 1 kez de Beşiktaş'a karşı üstünlük kurulmuştur. Yine 2001-2002 sezonunda Türkiye Kupası da kazanılmıştır. Bu süreçte 2001'de draft olan Mehmet Okur'un 2002'de NBA'e gitmesiyle, Efes 3. kez NBA'e oyuncu göndermiştir. 2001-02, 2002-03 ve 2003-04 sezonlarında da Avrupa'nın (artık tek başına) bir numaral