3-4 kişiyi daha yenerek bir yenilmezlik serisi oluşturdu.
Mike Knox'un sevgilisi Kelly Kelly, CM Punk'dan hoşlanmaya başladığı belli etti ve ikili bir ilişkiye başladılar. Bunun sonucunda Punk, Mike Knox ile bir ilişkiye girdi. Punk, Mike Knox'u yendi ve December to Dismember 2006 adlı PPV'deki EC maçına katılmaya hak kazandı. Punk bu maçın rövanşını yenerek, yenilmezliğini sürdürdü. Survivor Series'te DX ve Hardyz ile takım olarak Mike Knox'u, Rated RKO'yu, Gregory Helms'i ve Johnny Nitro'yu yendiler. Team DX'te hiçbir üye elenmedi. Punk December to Dismamber adlı PPV'deki EC maçında başarıya ulaşamadı ve en erken elenen isim oldu. Bu PPV'den sonra Hardcore Holly Punk'ı yenerek onun yenilmezlik serisine son verdi. Punk bu maçtan sonra Matt Strike ile yaptığı maçı da kaybetti. Punk iki maçlık yenilgiden sonra hem Jonny Nitro'yu yenerek moral buldu hem de Wrestlemania 23'teki MITB maçına katılmaya hak kazandı. Wrestlemania 23'ten önceki haftalarda Raw ve Smackdown'da önemli galibiyetler aldı. WM 23'de çok iyi bir performans gösterse de çantayı kazanamadı.

ECW'da New Breed ve ECW Originals adında iki takım çekişiyordu ve ikisi de Punk gibi güçlü bir ismi yanlarına almak istiyorlardı. Punk New Breed'e katıldığını duyurdu ve New Breed'in lideri Elijah Burke ile araları pek iyi değildi. Olan takım maçını kaybettiken sonra Punk, Elijah'a GTS vurarak olayları alevlendirdi. Bu olayların sonucundan ikili Elijah Burke ile Judgment Day'de karşılaştı ve ilk PPV galibiyetini aldı. 2007 Draftta ECW Şampiyonu Bobby Lashley Raw'a Draft edildi ve bunun sonucunda kemer boşta kaldı. Turnuva düzenlendi ve turnuvanın finalinde CM Punk ile Chris Benoit Night Of Champions'ta karşılaşacaklardı. Chris ailevi sorunlar nedeniyle, şova katılamadı onun yerine katılan Jonny Nitro, Punk'ı yendi ve kemeri kazandı. Bu zamandan sonra Jonny Nitro adını John Morrison diye değiştirdi. İkili kemer için Great American Bash'te karşılaştılar, kazanan yine John Morrison oldu. İkilinin arasındaki feud Summerslam'e kadar gitti, Summerslam'de yine galip gelen John Morrison oldu.

4 Eylül'deki ECW'da Punk John Morrison ile son bir kez kemer için karşılaştı ve kemeri en sonunda kazandı. Punk kemerini Unforgiven'da Elijah Burke'a karşı, No Mercy'de Big Daddy'ye karşı, Cyber Sunday'de The Miz'e karş korudu. Survivor Series'de kemerini John Morrison'a ve The Miz'e karşı korudu. 22 Ocak 2008'deki ECW şovunda rakibi Chavo Guerrero'ydu, maça Edge'in karışması ile Punk kemeri kaybetti. Chavo'dan kemeri almak için çok uğraşsa da başarılı olamadı.

Cm Punk Wrestlemania 24'te gerçekleşen MITB mücadelesini kazanarak istediği yerde, istediği şekilde, istediği bir ana kemere maç yapma hakkı kazandı. Punk 23 Haziran 2008'de olan Draftta Raw'a draft edildi. Bir hafta sonra olan Raw'da, Batista Night Of Champions'ta Edge'e hile ile kaybettiği için sinirliydi ve gelip Edge'i dövmüştü. Bunu fırsat bilen Punk geldi ve MITB hakkını Edge'e karşı kullanarak WHC kemerini kazanmış oldu! Punk, Batista ile Great American Bash'te karşılaştı ve kemerini DQ ile korudu. Ardından Summerslam'de JBL ile karşılaştı, bu sefer kemerini başarı ile korumayı bildi. Unforgiven 2008'de CM Punk kemerini bir Scramble maçta koruyacaktı. Arka alanda Kofi Kingston ile birlikte röportaj verirken Randy Orton ve Legacy gelerek onu sakatladı ve maça çıkamadı, onun yerine Chris Jericho maça çıktı ve kemerin sahibi oldu. Punk, Jericho ile kemer için karşılaşsa da kemeri kazanamadı.
27 Ekim'de gerçekleşen Raw'da; Punk, Kofi ile takım olarak Legacy'yi yendi ve World TT Championship kemerlerini kazandılar. Survivor Series 2008'de Team Batista'da yer aldı ama elendi ve takımı maçı kaybetti. Punk, William Regal'ın sahibi olduğu İC kemeri için düzenlenen bir turnuvaya katıldı. Punk turnuvanın finaline kadar çıktı. O sırada Punk ve Kofi kemerlerini bir House Show'da John Morrison ve The Miz'e (Dirt Sheet'e) kaybettiler. İC için düzenlenen turnuvanın finalinde Armageddon adlı PPV'de Rey Mysterio ile karşılaştı ve kazandı. 5 Ocak Raw'da Punk Regal ile kemer için karşılaştı, Regal DQ ile kemerini korudu. Raw GM Stephanie Mcmahon, Punk'a bir şans daha verdi bu sefer Punk DQ oldu. Stephanie bir kez daha ona şans verdi ve bu sefer Punk kemeri kazanarak büyük bir başarı elde etti. Punk en hızlı Triple Crown yapan güreşçi oldu, Punk kemerini JBL'e kaybetti.

WrestleMania 25'te düzenlenen Money in the Bank maçından galip çıktı ve Punk ikinci kez MITB'i almış oldu. Punk 2009 Draftta Smackdown'a gitti. Punk, Kane ile kısa süreli bir feuda girdi, ikili Backlash'te karşılaştı ve kazanan Kane oldu. Punk bir Smackdown şovunda Edge ile karşılaştı, Punk tam hakkını kullanacakken, Umaga geldi ve onu önledi. Punk birkaç kez Cash-in yapmaya çalışsa da Umaga hep onu durdurdu. Umaga, Punk'ı Judgment Day'de yendi. İkili bir kez daha Extreme Rules'ta bir Strap maçta karşılaştılar, maçı kazanan Punk oldu. Aynı gece Jeff Hardy bir Ladder maçta uzun süredir kovaladığı WHC kemerini kazanmıştı, Punk MITB hakkını Jeff'e karşı kullandı ve WHC kemerini ikinci kez kazanmış oldu.

Punk Jeff'e Cash-in yaptıktan sonra tam Heel olmamıştı ama artık eskisi kadar iyi reaksiyon almıyordu. Punk 3 saatlik bir Raw şovunda Edge ve Jeff Hardy'yi yenerek kemerini korudu. The Bash'te Punk, Jeff Hardy ile kemer için karşılaştı. Punk maç sırasında Jeff'den aldığı darbe yüzünden gözünü tuttu ve bilmeden hakeme tekme atarak DQ oldu, böylece kemerini kazanmış oldu, maçtan sonra Jeff, Punk'a saldırdı. The Bash'ten sonraki Smackdown şovlarında Punk tam olarak Heel Turn'unu gerçekleştiriyordu. Punk ve Jeff Night Of Champions 2009'da kemer için karşılaştılar ve Punk kemeri kaybetmiş oldu. Summerslam'de ikili bir Ladder maçta karşılaştılar, maçı kazanan Cm Punk oldu ve Punk üçüncü kez ana kemeri kazanmış oldu. Maçtan sonra Undertaker sürpriz bir şekilde Punk'a saldırdı. Bu olaydan bir hafta sonra gerçekleşen Smackdown'da, Punk bir Steel Cage maçta Jeff ile güreşti ve kazanarak Jeff'in WWE'den ayrılmasına sebep oldu.

CM Punk Breaking Point adlı şovda Undertaker ile WHC kemeri için karşılaştı, Taker maçı Hell's Gate adlı hareketi ile kazandı. Maçtan sonra Smackdown GM Teddy Long geldi ve Hells's Gate'in yasaklandığını bu sebepten dolayı maçı tekrar başlattı. Maç sırasında Punk, Anaconda Vice hareketini bağladı, Taker pes etmemesine rağmen maçı kazanan Punk oldu. Bundan sonraki Smackdown şovlarında Undertaker, Punk ile ve Teddy ile akıl oyunları oynamaya başladı, bu olayların sonucunda Punk ve Taker Hell In A Cell adlı bir PPV'de HİAC maçında karşılaştılar ve kazanan Taker oldu. Punk Braggin Rights'da kemer için olan Fatal 4 Way maça katıldı ama kazanamadı.

2009'un sonlarında Punk, Luke Gallows ile iş birliği yaparak,Straight Edge Society adı altında bir Stable kurdu. Punk ve Luke hafta hafta bazı fanları ring içine alıyorlardı ve onların kafasını kazıyorlardı, onlara yeminde ettirerek onları Straight Edge yapmış oluyorlardı.Bir hafta Serena adında bir kadına aynısını yaptılar ve bu zamandan sonra Serena'yı da takımlarına almış oldular. Punk Straight Edge ile R-Truth adlı güreşçi le kısa süreli bir feud yaşadı. Şubat 2010 yılında Punk, Rey Mysterio ile bir feuda girdi. EC'de Rey, Punk'ı elemişti. Punk, Rey'in ailesine hakaret etti, ikili bunun sonucundan WrestleMania 26'da karşılaştılar ve kazanan Rey Mysterio oldu. Extreme Rules'ta bir kez daha ikili karşılaştı, eğer Punk maçı kaybetseydi Punk'ın saçları kesilecekti, Punk bu maçı SES'e gelen yeni üyeleri sayesinde kazandı. Over The Limit'te ikili bir kez daha karşılaştı. Eğer Punk kazansaydı Rey, SES'e girecekti, Rey kazasaydı Punk'ın saçları gidecekti. Maçı roll-up ile Rey Mysterio kazandı. Maçtan sonra Punk, Rey'e saldırdı, Rey'i kurtaran Kane oldu. Rey Punk'ın saçını keserek onu rezil etti. Punk ileriki zamanlarda ringe maske ile çıktı.

Fatal 4 Way adlı PPV'deki WHC maçına katıldı, maçı kazanmaya çok yakınken Punk'a Kane saldırdı çünkü Kane, Taker'a saldıranın Punk olduğunu düşünüyordu. Punk masumluğunu kanıtladıktan sonra Big Show ile feuda girdi. Punk, Gallows ve Mercury (SES) Summerslam'de Big Show ile karşılaştılar ve kaybettiler. Bu sırada Punk SES'i başarısız olduğu sebebi ile dağıttı. Night Of Champions'ta bir kez daha Big Show ile mücadele etti ve bir kez daha kaybetti.

Punk, Ekim ayında Raw'a Draft edildi. Braggin Rights'da Raw takımında bulundu ama elendi. Punk bu olaydan sonra sakatlandı. Punk birkaç ay TV'de spiker olarak çalıştı ve spikerliğinde hep John Cena'ya laf attı.

'da John Cena Nexus lideri Wade Barrett'ı Chair maçta yenerek onun işini bitirmişti ve Raw'da bu olayı kutluyordu, o sırada onu Dolph Ziggler ve Vickie Guerrero böldü. John Cena Dolph Ziggler ile karşılaştı ve maçtan sonra Punk anlamsız bir şekilde geldi ve ona arkadan sandalye ile vurdu. Bu hareketin aynısını o haftaki Smackdown'da da yayınladı. Punk haftaya olan Raw'da büyük bir duyurusunu olacağını söyledi. O gecenin Main Event'inde Nexus Barrett'sız olarak geldi ve John Cena'ya saldırdı ve yeni bir liderlerinin olduklarını söylediler. Liderleri CM Punk'dan başkası değildi. Punk ve Cena kısa süreli bir feud yaşadı.

Royal Rumble'da Randy Orton ve The Miz arasında gerçekleşen WWE Championship maçına Punk karıştı ve Randy'nin kemeri kazanamamasına neden oldu. Punk aynı geceki RR'de 1. olarak çıktı ve 30 dakikadan fazla süre ringte kaldı. Elimination Chamber 2011'de Punk Randy Orton'ı eledi ve bunların sonucundan Punk Wrestlemania 27'de Randy Orton ile karşılaştı. Maçı Randy Orton kazandı. Extreme Rules'ta Punk ve Orton bu sefer bir Last Man Standing maçta karşılaştılar ve yine kazanan Randy oldu. Punk ve New Nexus üyesi Mason Ryan Over The Limit'te Tag Team Championsip için Big Show ve Kane ile karşılaştı ama maçı kazanamadılar. Punk şu anda Extreme Rules 2010'dan beridir hiçbir maçı kazanamamaktaydı.

Punk 1.5 yıllık PPV galibiyeti hasretine Capitol Punishment'ta Rey Mysterio'yu yenerek son verdi. Punk ertesi günkü Raw şovunda gerçekleşen WWE Championship #1 Contendership maçını kazanarak, John Cena ile WWE kemeri için Money In T