ık sözleşmesi biten Morgan De Sanctis kiralandığı kulübe geri dönmüştür. Sezon başında ise başta Gaziantepspor olmak üzere birçok kulüp Aykut'u istemiş ancak bu Aykut takımda kalmıştır. Sezon başında Frank Rijkaard'ı teknik direktörlüğe ve Abdul Kader Keita ve Elano Blumer gibi isimleri A takım kadrosuna kazandıran Galatasaray, kaleye ise bir dönem Atlético Madrid'in kalesini korumuş Arjantinli Leo Franco'yu transfer etmiştir. Hatta bu oyuncunun ardından Manisaspor'un genç kalecisi Ufuk Ceylan'da alınmış Aykut ise takımın neredeyse 3. kalecisi konumuna düşmüştür. 2009-10 sezonunda ilk 4 hafta kadroya dahi giremeyen Aykut, o sezon ilk maçına 28 Ekim 2009'da Bucaspor karşısında çıkmış ve 2-1 kazanılan bu maçta yaptığı kurtarışlarla takımının en dikkat çeken oyuncusu olmuştur. O sezon tek UEFA Avrupa Ligi maçına ise Leo Franco'nın forma giyemediği 16 Aralık 2009'daki Sturm Graz karşısında çıkmıştır. Ancak 21.dakikada Beichler'in golüne engel olamamış ve takımı 1-0 kaybeymiştir. Ancak takımı bir üsttura yükselme başarısı göstermiştir. O sezon 2009-10 sezonunda transfer edilen Leo Franco'nun yeterli performansı gösterememesi üzerine tekrar Galatasaray as kalecisi olarak görev yapmaya başlayan Aykut Süper Lig'de ilk maçına ise 5 Nisan 2010'da Sivasspor karşısında çıkmış ve bu maçla birlikte tüm maçlarda forma giymiştir. Aykut sezon boyunca Türkiye Kupası'nda ise 4 maça çıkmıştır. 10 Temmuz 2010'da ise Özellikle rakip forvetlerle karşı karşıya kaldığı pozisyonlar ve yaptığı cesur çıkışlarla adından söz ettiren Aykut Erçetin'in gösterdiği başarılı performansın ardından sözleşmesinin 2012 yılına kadar uzatıldığı açıklandı. 

2010-2011 sezonunda ilk resmi maçına Beograd karşısında çıkan Aykut, iki aşamalı eleme maçlarının ikisinde de yer aldı ve bu iki maçta kalesinde 3 gol görse de takımı rakip ağlara 6 gol bırakınca bir üsttura çıktı ve Karpaty Lviv ile eşleşti iki aşamalı olan maçın ilkinde 90 dakika forma giyen Aykut, ikinci maçta ise formasını Ufuk Ceylan'a kaptırdı ancak ilk maçta kendi evinde 2-2 berabere kalan Galatasaray, bu maçta da 1-1 berabere kalınca averajla elendi. Aykut ligde ise ilk maçına Süper Lig'in 1. haftasında Sivasspor karşılaşmasında çıkmış, ancak takımı 2-1 mağlup olmuştur. Bu maç ile birlikte sezon başında defans hatalarının kurbanı olan ve teknik direktör Frank Rijkaard tarafından yedek kulübesine çekilen Erçetin, bir süre Ufuk Ceylan'ın arkasında yedek kalmış ve yerine oynayan genç kaleci Ufuk Ceylan'ın MKE Ankaragücü maçında kırmızı kartla oyun dışı kalmasından sonra kaleyi tekrar teslim almıştır. Bu maçın ardından ise takımın başına Gheorghe Hagi getirilmiştir. Hagi yönetimindeki ilk maçına 24 Ekim 2010'da oynanan Fenerbahçe derbisinde çıkan Aykut, deplasmanda kalesini gol görmeyerek birçok pozisyonda rakibin Mamadou Niang, Alex de Souza ve Issiar Dia gibi silahlarına karşın kalesini gole kapamıştır. Bu maçın ardından ise Galatasaray'da, 1982 yılından bu yana Kadıköy'deki 27 lig maçında da kaleyi koruyup gol yemeyen ilk kaleci olmuştur. Sezonun ikinci yarısında ise teknik direktör Gheorghe Hagi'nin isteğiyle Kolombiyalı Róbinson Zapata getirilmiştir. Zapata bir süre forma giymiş hatta Aykut bu maçlarda kadroya dahi girememiş ancak Fenerbahçe maçında yediği goller sonrası bu oyuncunun bileti kesilmiştir. Bu maçla birlikte takımın hocası Gheorghe Hagi ile de yollar ayrılmış yerine Bülent Ünder getirilmiştir. Bu teknik adamın gelmesiyle kadroya dahi giremeyen oyuncu kadroya girmeye başlamış, hatta 31. hafta BJK İnönü Stadyumu'nda oynanan Beşiktaş maçında 90 dakika sahada kalmıştır ve takımı 2-1 mağlup olmuştur. Sonraki haftada ise Kasımpaşa SK deplasmanında forma giyen Erçetin sonraki 2 maçtaysa formasını Ufuk Ceylan'a kaptırmıştır. 
2011-12 sezonunun başında Galatasaray'da başkanlığa Ünal Aysal, teknik direktörlüğe ise Fatih Terim getirilmiştir. Fatih Terim gelir gelmez kaleci antrenörlüğüne uzun süre kalecileri çalıştıran Nezih Ali Boloğlu yerine Cláudio Taffarel'i getirmiştir. Bu dönemde Galatasaray A2 takımından ise Eray İşcan A takıma alınmıştır. Takımıyla FC Internazionale Milano, Liverpool FC ve FC Twente gibi rakipler karşısında forma giyen Aykut performansıyla beğeni toplasa da Galatasaray takımı gündemine Gianluigi Buffon ve Fernando Muslera gibi isimleri almıştır. Ancak Buffon'un ilerleyen yaşı ve takımdan ayrılmak istememesi nedeniyle o sezon millî takımıyla Copa America'nın sahibi olan Uruguaylı genç file bekçisi Fernando Muslera kadroya katılmıştır. Bu gelişmelerin üstüne ise Aykut takımın 2. hatta 3. kalecisi konumuna düşmüştür. O sezon Süper Lig'de ilk maçına Eskişehirspor karşısında Süper Lig'in 4. haftasında çıkan Aykut, sezon boyunca başka hiçbir karşılaşmada forma giyememiştir. Normal sezon boyunca ise 34 maçın 15'inde kulübede oturmuştur. Normal sezonu Galatasaray şampiyon bitirmiş ve takımın kalecisi Fernando Muslera kulüp tarihinin sezon boyunca en çok clean sheet yapan oyuncusu olmuştur. O sezon statü gereği Süper Final'e geçilmiş ve Galatasaray son maçta rakibi Fenerbahçe ile Fenerbahçe Şükrü Saracoğlu Stadyumu'nda 0-0 berabere kalarak rakibinin sahasında Şampiyonluğunu ilan etmiştir. Bu 6 maçın üçünde kadroda olan Aykut ise Galatasaray formasıyla 3. Şampiyonluğunu yaşamıştır. Sezon sonunda ise sözleşmesi bitmiştir. 

2012-13 sezonunda "Galatasaray'la bağımı koparmadan başka kulüple görüşmem" ifadelerinde bulunan Aykut, kulübü Galatasaray ile anlaşmamış ve bu gelişmelerin üstüne bu oyuncuya adeta tekilf yapmıştır. Başta Elazığspor'un sözleşme önerdiği oyuncu İstanbul dışında oynamamak istemesi nedenilye bu teklifleri geri çevirmiş ve 2012-13 sezonunun ilk yarısını kulüpsüz geçirmiştir. Aykut bu dönemde bazı mankenlik ajanslarıyla anlaşmış ve bir süre mankenlik yapmıştır. Aykut 2012-13 devre arası transfer döneminde ise Fatih Terim'in isteğiyle kulübe geri çağırılmış ve kulübüyle yarım sezonluk sözleşme imzalanmıştır. Kulüp ise " Aykut Erçetin ile 2012-2013 futbol sezonu 2.yarısı için anlaşmaya varılmıştır. Buna göre futbolcuya, 200.000 TL sabit transfer ücreti ve 12.000 TL maç başı ücreti ödenecektir." ifadelerinde bulunmuştur. Kulüple antrenmanlara başlatan Aykut'un dönmesinin ardından Sponsor hastanede sağlık kontrolünden geçen Aykut’a kapsamlı check-up’tan sonra sağlam raporu verilse de Tecrübeli kaleci, 3 gün sonra, ‘Belimde ağrılar var’ diyerek antrenmana çıkamamıştır ve Almanya’da doktor kontrolünden geçen kaleci, Sağlık sponsoru olan hastane tarafından bel fıtığı teşhisi konulmuş ve uzun süre iğne tedavisi görmüştür. Sezon boyunca kadroya dahi giremeyen Aykut, 2013-14 sezonu sonrasında kulübüyle 4. Süper Lig Şampiyonluğunu yaşamıştır. 
2012-13 sezonu sonrası tecrübeli kalecinin takım ile yolları ayıracağı iddia edilse de bu oyuncu takımın İngiltere kampına katıldı hatta lisansı olmamasına rağmen Notts County ve Shrewsbury Town maçlarında forma giydi. O sezon beklediği teklifleri alamayan Aykut ile transfer döneminin bitimine saatler kala ise tıpkı Aydın Yılmaz gibi sözleşme uzatılmıştır. Açıklamada 1 sezonluk sözleşme imzalayan Aykut Erçetin ile 500 bin lira sabit transfer ücreti ve 12 bin lira maç başı ücreti ödeneceği kaydedildi. O sezon Türkiye Süper Kupası'nı kazanan Galatasaray'ın maç kadrosunda bulunmasa da 2. Süper Kupa şampiyonluğunu yaşadı. Ayrıca sezon öncesindeki Emirates Cup maçlarında da Galatasaray takımında yer aldı. Süper Lig'de ise ilk 10 haftada kadroya giremeyen Aykut, Fernando Muslera'nın sakatalnıp kaleye Eray İşcan'ın geçmesiyle 11. haftada oynanan Fenerbahçe maçında ilk defa kadroya gimriştir. Daha sonra Sivasspor ve Kasımpaşa SK maçlarında da kadroya giren Aykut, Fernando Muslera'nın iyileşmesiyle tekrar kadroya girememeye başladı. O sezon ilk resmi maçına ise 4-0 yenilen Balıkesirspor maçının 79. dakikasında Ufuk Ceylan'ın yerine Türkiye Kupası maçında çıktı. Aykut ayrıca takımının devre arası kampı için Antalya'ya giderken bu takımla Turkish Airlines Antalya Kupası'nda ilk maç olan AFC Ajax maçına ilk 11'de başlamıştır ve kalesini gole kapamıştır. Maçın ikinci yarısında ise yerini Ufuk Ceylan'a bırakmıştır ve takımı 2-1 galip gelmiştir. Aykut ikinci maçta Celtic karşısında finalde forma giyemese de takımı penaltılarda rakibini 5-4 mağlup etmiş ve bu kupayı da müzesine götürmüştür. Aykut ise tunuva boyunca 45 dakika şans bulmuş ve kupa sahibi takımın bir parçası olmuştur. 22 Ocak 2014'te ise hafif sakatlığı bulunan Fernando Muslera ve Eray İşcan, Galatasaray'ın Türkiye Kupası maçı kadrosuna alınmamış, Roberto Mancini ise Aykut Erçetin'i Elazığspor maçı ilk onbirine almıştır. Aykut böylelikle tam 2 yıl 3 ay sonra bir resmi maçta ilk kez ilk 11'de başlamıştır. Bu maçta Serdar Özkan ve Serdar Gürler'in çok net pozisyonlarını ustaca kurtaran Aykut, maçın 51. dakikasında ise köşeyi bilse de Serdar Özkan'ın penaltı golüne engel olamamış ve takımı 1-0 mağup olmuştur. Ayrıca Aykut tam 989 gün sonra kalesinde gol gördü.3 Mart 2014'te ise Galatasaray A2 takımının İstanbul BB maç kadrosuna alındı. Bu maçta Lucas Ontivero, Guillermo Burdisso ve Berk İsmail Ünsal gibi isimlerle 90 dakika mücadele etti. Sezon sonunda toplam 3 Türkiye Kupası müsabakasında forma giyen Erçetin, takımıyla Türkiye Kupası şampiyonluğu yaşadı.
2014-15 sezonu başında kadrosuna Sinan Bolat'ı katan Galatasaray ile sözleşmesi uzatılmayan Erçetin, İstanbul Başakşehir FK, Konyaspor, Mersin İdman Yurdu, Adanaspor ve Elazığspor gibi kulüplerle görüşse de 18 Ağustos 2014 günü Mehmet Özdilek'in çalıştırdığı Çaykur Rizespor'a transfer oldu.

Almanya doğumlu olan futbolcu, Türkiye U-17 ve U-18 takımlarında oynadı, birçok kez U-21 ve B millî takımlarında da görev aldı. Uluslararası millî kariyerine 12 Nisan 2006 tarihinde Azerbaycan takımı ile yapılan karşılaşmayla başladı.

Aykut'un Annesi Sakarya, babası ise Marmara Ereğlisi'nde doğsa da daha sonra Almanya'ya göç ettikleri için Aykut, Almanya'da doğmuş ve bu ülkenin de pasaportuna sahip olmuştur. Ayrıca Aykut kaleci olduğu dönemde eğitimini sürdürmüş ve hem diller hem de spor yüksek okulunu bitirmiştir. Babası eski bir Hentbol kaleci