disini öldürmesini ister. Alexiel bunu kabul eder ama tam öldürecekken Rociel "Ne yani, kendi ikiz kardeşini mi öldüreceksin, Alexiel?" der. Alexiel bunun üzerine Rociel'in haline acır ve onu yasak bir büyü kullanarak dünyaya hapseder. Bunu yaparken tüm gücünü kullanmıştır, ayrıca melek Uriel tarafından da yargılanır.
Suçlarından dolayı Alexiel'e verilebilecek en ağır ceza verilir: Bedeni cennette saklanır, ruhu da sürekli dünyada insandan insana geçmeye mahkûm edilir. Ve Alexiel'in ruhu döne dolaşa 16 yaşındaki lise öğrencisi Setsuna Mudou'da hayat bulur.
Setsuna Mudou, sürekli sorun yaşayan biridir, olmadık nedenlerden dolayı kavga çıkarır, ve de bir güzel de dayak yer. Alexiel'in yeniden hayat bulduğu tüm insanlar gibi kötü bir hayat yaşamaktadır, üstelik kızkardeşine aşıktır. Etrafındaki kimse onu sevmemektedir, bir ağabey olarak gördüğü Kira Sakuya hariç.

Cehennem (Gehenna):


Cennet (Yatzirah):


Setsuna'nın öyküsü, üç kişiden dayak yiyerek başlar. Setsuna öldüresiye dövülürken, o anda Kira ve Sara gelir ve kavga biter. Önce Kira'dan, sonra da Sara'dan azar işiten Setsuna, evine sıkıntılı bir şekildeyken Arakune ve Kurai ile karşılaşır. Kurai, sonunda Alexiel'i bulduğu için sevinmektedir, ama Setsuna, Alexiel'in reenkarnasyonu olduğuna inanmak istemez. Ama Kurai pes etmeye niyetli değildir:
Setsuna'nın geçemeyeceği, ama Alexiel'in rahatça geçeceği sınavlar hazırlamıştır, üstüne kaya fırlatır vs. Fakat bunlar Setsuna'yı uyandırmaya yetmemiştir. Eve geldiğinde Sara'yı bulamaz ve kendisine bir not bırakılmıştır: Sara, okuldaki arkadaşları tarafından terkedilmiş bir mal deposuna kaçırılmıştır. Setsuna, Sara'yı kurtarmak üzere gider, Arakune ve Kurai da orada beklemektedir. Setsuna'nın okul arkadaşları birer golem'e dönüşüp Setsuna'nın kolunu kopardığını görmelerine rağmen kıllarını kıpırdatmazlar. Hepsinden daha kötüsü, o anda Rociel gelir ve tüm golemler yok olurlar. Rociel'in niyeti bellidir: Alexiel'i bir kez daha öldürmenin zevkini tek başına tatmaktır, fakat o anda Adam-Kadamon gelir ve Rociel'e engel olduğu gibi Setsuna'nın kolunu da iyileştirir. Setsuna kendine geldiğinde Rociel gitmiştir, Sara ise baygın haldedir. Setsuna, Sara'yı eve getirir, yatağına yatırır, ona sevgi sözcükleri söyler ve onu dudağından öper. Annesi bunu görmüştür, ve o anda Setsuna'yı evden atmaya karar verir, kapı dışarı ederken de kızkardeşiyle böyle bir ilişki yaşadığından dolayı da azarlar. Sara olanları görür, Setsuna ise Sara'nın kendisini unutması için onu kandırdığını ve onun gibi salak kızlardan nefret ettiğini söyler. Ertesi gün Sara kendisi Setsuna'nın yanına gelip aslında o anda ayık olduğunu ve onun da aslında ağabeyini öpmek istediğini söyledikten sonra ağabeyinin dudağından öper. Bu, bütün okulda kısa sürede yayılır, Setsuna ile alay edilir, dışlanır, ikisinin öpüşürken çekilmiş fotoğafları okulun her yerine yayılır, ta ki Kira hepsini toplatana kadar. Toplatılmasının üzerinden fazla zaman geçmeden Setsuna'nın iyi arkadaşı olan Katou, onu yalnız yakalamıştır ve Rociel'in bir hizmetkarına dönüşerek Setsuna'ya saldırır. O anda Setsuna'nın içindeki Alexiel'in ruhu uyanır ve Tanrı'nın kılıcı olarak da adlandırılan Nanatsusaya'yı kullanarak Katou'yu öldürür. Sürekli Setsuna'yı takip eden Kurai ve Arakune da bunu görmüştür; Setsuna ise Alexiel'in bilinciyle onun öldürülmekten başka kurtuluş yolu olmadığını söyler ve Katou'yu okul bahçesine gömer. Katou'nun ölüm haberi kısa sürede yayılır ve ilk şüpheli olarak Setsuna'nın peşine düşülür. Olanları gören bir kişi de Kira'dır ve neler döndüğünü anlamıştır. Çünkü Kira da Setsuna gibi yüksek bir ruhani güce sahiptir, kendini üstüne melek kanı damlamış güçlü bir ruh olarak tanıtır ve Setsuna'nın peşine düşmesinin nedenini onun Alexiel olması olarak açıklar. Aynı anda Sara ve annesi Tokyo'yu terk etme hazırlıkları yapıyordur, Londra'ya taşınıp Sara'yı nişanlayacaklardır, Sara ve Setsuna birbirini bir daha asla görmemelidir. Kurai'dan bunu öğrenen Setsuna, tamamen hayal kırıklığına uğramıştır, Sara'yı kaçırmak üzere havaalanına gider. Hem aranan bir şüpheli, hem de barikatları aşan bir kaçak olarak Sara'nın yanına kadar gelmeyi başarabilir. Sara'nın ona dönmemesi üzerine polis Setsuna'yı yaka paça götürürken Sara, aslında ağabeyinin kendisini gerçekten sevdiğini anlayıp ona döner, o anda da Kira ortaya çıkıp Katou cinayeti ile ilgili tüm suçu üstlenir ve hapse girer. Setsuna ve Sara, uzaklara kaçmayı başarırlar, bir süre herkesten uzak yaşarlar, birbirleriyle olurlar ve ilişkiye girerler. Ama Kira'nın Setsuna için kendini feda etmesi, Setsuna'nın içine işler ve olanları düzeltmek için geri dönmeye karar verirler. Tokyo'ya geri döndüklerinde ise Setsuna, Rociel'in hizmetkarlarının saldırısına uğrar. Bu sefer Setsuna'nın sonu kaçınılmazdır, fakat Sara, ağabeyini korur ve onu korurken ölür. Sara'nın ölümüyle beraber Alexiel uyanır, öfkesiyle de tüm Tokyo'yu yok eder. Sadece Kira, Arakune ve Kurai kalmıştır, Kira'nın çağrısıyla Setsuna onu bulur. Arakune ve Kurai da oradadır, Adam-Kadamon da o anda çıkıp Sara'nın ölümünden sonraki anı geri getirir ve zamanı durdurur. Sara kurtarılmaz, çünkü Adam-Kadamon'a göre Sara'nın ölmesi gerekmektedir. Setsuna bu cevabı kabul etmez ve yandaşlarından Sara'nın Hades'te olduğunu öğrenir. Kendisi de Hades'e gidip Sara'nın ruhunu tekrar bulmaya karar verir ve kendisine ruhu ile bedenini yedi gün boyunca hayatta tutabilecek bir hançer saplatır. Yedi gün içinde dönemez veya hançer çıkarılırsa, o da tamamen ölecektir.

Setsuna Hades'te kendine geldiğinde Sara'yı aramaya çıkar, orada karşılaştığı kişilere sorduğunda Yggdrasil adlı ağacın bekçisinin günah işlemiş bir kadına ihtiyacı olduğundan dolayı onu aldığını öğrenir. Sara'nın günahı da ağabeyiyle aşk yaşamış olmasıdır. Yggdrasil'e tek başına gitmek ister, ama bulunduğu yer hakkında hiçbir fikri yoktur, bu yüzden kendisine bir gardiyan verilir. Bu gardiyan, Setsuna'ya Hades'in nasıl bir yer olduğunu anlatır, Hades'te etrafta sürekli dolaşan ve ruh yiyen ghoul'lar vardır, bu ghoul'lar kanatları kesilmiş meleklerdir. Setsuna'nın gardiyanı da Hades'in asıl bekçisi olan Enra-Ou'nun en yüksek dereceli hizmetkarıdır. O sırada Rociel ve yandaşları da Setsuna'nın bedeninin peşine takılırlar, Kurai da kendilerine destek olması için Voice ve Noise diye kendi ülkesinden iki arkadaşını çağırır. Bunlar, Setsuna'nın bedenini oradan oraya taşırken aynı anda da Alexiel'in cehennemdeki bedenini aramaya koyulurlar. Setsuna en sonunda Yggdrasil'e vardığında oranın bekçisinin hizmetkarı olan Doll isminde, ve Sara'ya benzeyen (en azından Setsuna'ya göre, ki defalarca Sara'nın hayalini görüyordu) robot bir bebekle karşılaşır, cehennemin bekçisi de Sara'nın yerini ancak Setsuna onu savaşta yenerse söyleyeceğini söyler. Setsuna onunla savaşır, ve onu gücüyle değil de zekasını kullanarak alt eder. Buna rağmen Setsuna geç kalmıştır, çünkü Sara çoktan Zaphkiel isimli rahip meleğin eline geçmiştir, bu yüzden de Zaphkiel ve Rociel arasında sorunlar çıkar. Setsuna ise Uriel ile karşılaşır, Uriel de Alexiel'e yaptıklarından pişmandır ve pişmanlığından kurtulmak için Alexiel'in kendisini öldürmesini ister. Setsuna ise Uriel'in canını bağışlar, Setsuna için artık geriye sadece Hades'ten çıkmak kalıyordur. Fakat sorunlar bununla da bitmemiştir, çünkü Kurai'ın otonom arkadaşı Voice, en sonunda bu kovalamacadan sıkılıp Setsuna'ya saplanan hançeri çıkarır. Kısa sürede bundan herkesin haberi olur, hançeri Setsuna'ya geri saplarlar, ama Setsuna Hades'ten geri dönse bile eski bedeninde geri dönmeyecektir, bu yüzden de Alexiel'in bedenini bulmaya öncelik verilir ve bulunur da. Setsuna ise hançerin kendisinden çıkarıldığını hisseder, vakti de daralıyordur, hızlıca geri dönmek ister. Fakat Enra-Ou'nun Setsuna'yı bırakmaya niyeti yoktur, zar zor gardiyanıyla anlaşır, karşılığında da cennetteki Layla adlı bir kıza bir eşya götürmeyi kabul eder. Enra-Ou'nun durdurma çalışmalarına rağmen Setsuna Hades'ten zamanında kaçmayı başarır ama kendini Alexiel'in bedeninin içinde bulur.

Setsuna önce olanlara inanamaz, sonrasında her şeyin farkına varır. Buna rağmen içinde bulunduğu bedenin ilerde başına bela olacağını bildiğinden, kendi bedenine dönme yolları arar. Kısa sürede, kendi bedenini yeniden canlandırmanın tek yolunun cennetteki Raphael adlı melekten geçtiğini öğrenir. Raphael kadınlara karşı zayıf olan bir melektir, ve de Setsuna bunu avantaj olarak kullanıp kendi bedenine geri dönebilecektir. Kurai ise bu planın kesinlikle işlemeyeceğini söyler, ve de başka bir yolunun olabileceğini düşünür. Planın işlemeyecek olmasının nedeni ise Alexiel'in ruhunun cennette aranıyor olmasıdır ve Alexiel, cennetin baş düşmanlarından biridir. Öbür yandan Kurai da Setsuna'nın kendi bedenine dönmesini istiyordur, çünkü Setsuna'ya aşık olmuştur. Bunu haber alan tüm cehennemden cevap, sadece Belial'dan gelir. Kurai'ı yeni gelini olarak seçmiştir, karşılığında da cehennemdeki ölüm büyücülerinin hazırladığı bir iksiri verecektir, bu iksir Setsuna'nın bedenine içirildiği zaman Setsuna kendi bedeninde geri canlanacaktır. Kurai uzun süre ikilemde kalır, çünkü Belial'a gitmesi demek, Setsuna'yı bir daha görememesi demektir; öbür yandan da Setsuna'nın kendi bedenine dönmesi lazımdır, çünkü bu kendi seçimi değildir.

Setsuna ise Raphael'e ulaşmak istemektedir ve bu yüzden Kurai ile birlikte dünyaya döner. Bunu haber alan cennetteki melekler, Ateş Meleği Michael'i gönderirler, Michael ve Setsuna savaşırlar, savaş konusunda tecrübesiz Setsuna, Michael ile baş edemez, kısa sürede safdışı kalmıştır. Michael, tam Kurai'ı öldürecekken Sara, Zaphkiel'in elinden kurtulup Michael'i engeller ve o anda ölmek üzere olan Gabriel'de tekrar hayat bulur.

Rociel'in hizmetkarları da Setsuna'nın bedenini sürekli aramaktadır, bunlar en sonunda bulunurlar. Voice ve Noise önce karşı koyarlar, Voice ölür, Kira'nın araya girmesiyle Rociel'in hizmetkarları geriye püskürtülür. Kurai ise en sonunda istemeden de olsa, Belial'ın 999uncu gelini olmayı kabul eder ve Belial'ın verdiği Pandora'nın Kutusu