orun yokluğunda, barış sadece müzakere edildiğinde rapor edilmez, müzakere edilmiş olarak emanet edilir." (Epist. 7.7.4). Sonradan, piskoposlardan oluşan elçilerin Provence'den çekilmeleri karşılığında Auvergne'yi Gotlara terkettiğini öğrendiğinde Sidonius şok olmuştu.

Jordanes, Nepos'un Galya manevralarının akıbeti hakkında daha karışık bir hikâye anlatır:

"Bu yüzden, Vizigotlar'la bir süre savaşan ancak zafer kazanamayan Ecdicius, kendi ülkesinde özellikle Clermont şehrini de düşmana kaptırarak yenilmiş ve sonra daha güvenli bir yere gitmişti. İmparator Nepos bunu duyunca, Ecdicius'tan Galyayı terk ederek ona gelmesini emretmiş ve onun yerine magister militum olarak Orestes'i atamıştı... ("Ergo... Ecdicius, diu certans cum Vesegothis nec valens antestare, relicta patria maximeque urbem Arvernate hosti ad tutiora se loca collegit. quod audiens Nepus imperator praecepit Ecdicium relictis Galliis ad se venire loco eius Orestem mag. mil. ordinatum...": Getica 240-241).

Jordanes'in de anlattığı gibi Auvergne'nin kaybedilmesinden dolayı Ecdicius'a kızgındı ancak bu şehrin teslim edilmesi Nepos'un kendi politikasının bir parçasıydı. Ayrıca, bir Galyalı olan Ecdicius'un yerine bir başkası atanacaksa neden İtalya'ya çağırıldığıda dikkat edilmesi geren bir başka konudur.

Bu arada başka bir yerde, Nepos yeniden Vandal korsanların saldırılarıyla yüz yüze kaldı ve aynı şekilde bir anlaşma müzakere etme girişiminde bulundu. Ancak konumunun güçsüzlüğü nedeniyle, Vandalların Afrika, Sicilya, Sardunya, Korsika ve Balear Adalarında işgal ettikleri topraklardaki egemenliklerini tanımaktan fazlasını yapamadı.

İmparator olarak Nepos, imparatorluğun Batıda kalan ve İtalya, Balkanlar'ın bir kısmı ve Kuzey ve Güney Galyadaki son ayak basılabilecek topraklardan oluşan varlıklarını bir arada tutmaya çalıştı. Vizigotlar'ın kralı Euric ile yaptığı müzakereler neticesinde, kontrolü güç küçük toprakları değiş tokuş ederek Galya'daki Provence bölgesi üzerindeki İmparatorluk hakimiyetini sağlamlaştırdı. Ancak, yeniden İtalya kıyılarına karşı korsan saldırılara başlayan Vandalların kralı Genseric'le yapmış olduğu müzakereler konusunda başarılı olduğu söylenemez. Doğu Roma imparatoruluğu ile zaten bir barış anlaşması yapmış olan Genseric, Nepos'a yeni imtiyazlar verme gereği görmedi.

Nepos, tüm hikâyelerde Batı Roma'nın son dönemlerinde tahta çıkmış olan imparatorlar arasında en yetenekli olanlarından birisi olarak anılır ancak Doğu Roma ile olan yakın bağları nedeniyle Roma Senatosu tarafından sevilmemiştir. Nepos'un, güvenilmeyen bir asker olan Orestes'i magister militum olarak atama hatasına düşmesi, Batı Roma'nın göbeğinde destek konusunda hissettiği eksikliği kendisine sık sık hatırlatacaktı.

Nepos'un yeni Patricii'si, Orestes (Hun lideri Atilla'nın yanında sekreter olarak çalıştığına dair meşhur bir idiaa vardır), kısa bir süre sonra ona karşı taraf değiştirdi. Jordanes şöyle devam eder:

"Bu Orestes, orduyu komuta yetkisi aldıktan ve düşmanlara karşı Roma'dan ayrıldıktan sonra Ravenna'ya geldi ve orada kalarak oğlu Augustulus'u imparator yaptı. Nepos bunu öğrendiğinde Dalmaçyaya kaçtı ve saltanatından mahrum kalarak bir zamanlar imparator Glycerius'un ele geçirildiği Salona denizinde sıradan birisi olarak zayıf düştü.("qui Orestes suscepto exercitu et contra hostes egrediens a Roma Ravenna pervenit ibique remoratus Augustulum filimum suum imperatorem efficit. quo conperto Nepus fugit Dalmatias ibique defecit privatus a regno, ubi iam Glycerius dudum imperator episcopatum Salonitanus habebat": Jordanes, Getica 241).

Anonymous Valesianus, Orestes tarafından aranan "düşmanın" Nepos'tan başkası olmadığını iddia eder: "Bir süre sonra Nepos, Orestes ve ordu tarafından takip edildiği halde Ravenna'ya vardı ve Orestes'in geleceği korkusuyla bir gemiye binerek Salona'ya kaçtı" ("mox veniens Ravennam, quem persequens Orestes patricius cum exercitu, metuens Nepos adventum Orestis, ascendens navem fugam petit ad Salonam": 7.36 s.a.474). Önceki Auctuarii Hauniensis ordo kendisin de birkaç ayrıntı ekler;

"Nepos'un şehirde olduğu sıralarda Orestes ona karşı ordusunun asıl kuvvetini gönderdi. Ancak Nepos böyle umutsuz bir durumda karşı koyma cüretini göstermedi ve gemisiyle Dalmaçyaya kaçtı. Nepos İtalyadan kaçıp şehirden ayrıldığında, Orestes tüm otorite ve yetkileri üstlenerek oğlu Augustulus'u Ravenna'da imparator ilan etti." ("Nepote apud urbem residente Orestes patricius cum robore exercitus contra eum mittitur. sed cum desperatae rei negotium resistendo sumere non auderet, ad Dalmatias navigiis fugit. cum Nepos fugiens Italiam ac urbem reliquisset, Orestes primatum omnemque sibi vindicans dignitatem Augustulum filium suum apud Ravennam positum imperatorem facit, ipse vero omnem curam externorum praesidiorum gerit": s.a.475; cf. Auctarii Hauniensis ordo posterior: "Nepos cum ab Oreste patricio cum exercitu persequeretur, fugiens ad Dalmatias usque navigavit": s.a.475).

Eğer bu metindeki "urbs" sözcüğüne karşılık olarak genellikle yapıldığı gibi Roma anlaşılmak yerine Ravenna'nın kastedildiği dikkate alınırsa, bir kez daha Orestes'in isyanını gören Nepos'un Ravenna'dan kaçtığı anlaşılır.

Bu hikâyeler bir araya getirildiğinde cevap verdiklerinden daha fazla soruya yol açarlar. Neden Nepos Ecdicius yerine, Ravennayı ele geçiren ve taht için niyetini belli eden Orestes'i seçti? Orestes'in kendilerine karşı gönderildiği "düşmanlar" kimlerdi (Jordanes)? Orestes'i Nepos'a karşı kim gönderdi (Auctuarium Hauniensis)? Eklenen ilave bilgiler sadece spekülasyon olabilir. Olası bir yeniden kurma denemesi, Roma Senatosu tıpkı Avitus (455-456) zamanında yaptığı gibi eski numaralarından birisine baş vurmuş ve yabancı imparatora girişilen ayaklanmaya karışmış şeklinde olabilir. Avitus gibi Nepos'da Kuzeyden tehdit edilmiş ve Ravennada kuşatılmıştır. Henüz gözden düşmemiş olan Ecdicius 'u, tıpkı Anthemius'un Ricimer'e karşı Bilimer'i çağırdığı gibi, bir iç rakip için Galyadan geri çağırmıştır. Ravenna'nın kaybedilmesinden sonra Nepos, Avitus'un yaptığı gibi ülkeden kaçmıştır. Bu sırada Ecdicius'da tarih sahnesinden çekilmiştir.

28 Ağustos 475 tarihinde, Orestes Ravenna'daki yönetim üzerinde kontrolü sağladı ve Nepos'u gemiyle Dalmaçya'ya kaçmak zorunda bıraktı. Bir Germen kabilesinden geldiği için kendisi imparator olamayan Orestes, yeni imparator olarak Romalı karısından doğan oğlu Romulus'u atadı. Romulus Augustulus olarak tanınan bu çocuk İmparator, tahta çıktığında belki de henüz 10 yaşında bile yoktu ve tarihe Batı Roma'nın son imparatoru olarak geçecekti.

Her halûkarda, Nepos Dalmaçyada hüküm sürmeye devam etti ve Galya ve Doğu Roma sarayında resmi imparator olarak tanınmaya devam edildi. Odoacer, Ravenna'yı kuşatıp Orestes'i öldürdü ve ardından 4 Eylül 476 tarihinde Romulus'u görevden aldığı zaman kendisini İtalya'nın hakimi ilan etti, ardından Doğu Roma İmparatoru Zeno'dan tüm imparatorluğun yasal yöneticisi olmayı talep etti. Zeno, Odoacer'in konumunu yasal hale getirebilmek için onu Roma İmparatorluğuna "patricius" ve ardından İtalya'da kendisine bağlı İmparator naibi yaptı. Zeno, Nepos'un iddialarını bir tarafa bıraktı ve Odoacer Zeno adına tüm İtalyada sikkeler bastırdı. Benzer bir çabayı, Kuzey Galya'da Zeno'nun 486 yılında öldürülmesine kadar onun adına sikke bastıran Roma generali Syagrius'da göstermiştir.

Julius Nepos, taleplerinden tam olarak vazgeçmemiş ve tahtı yeniden ele geçirme girişimlerinde bulunmuştur. 479 yılı civarında İtalya'da yeniden kontrolü sağlama umuduyla Odoacer'e karşı planlar yapmıştır. Aynı anda Salona'da piskopos olarak görev yapan Glycerius, Nepos'dan intikam alabilmek amacıyla Odoacer onu devirmek için karalı olduğu sırada bir plan yapmakla meşguldü.

Nepos, kendi askerleri tarafından (beklenmedik bir saldırı sonucu bıçaklanarak) şu üç tarihin birisinde — 25 Nisan, 9 Mayıs ya da 22 Temmuz 480 tarihinde— öldürüldü. 25 Nisan tarihi büyük ihtimalle doğru olanıdır. Hemen ardından, 9 Aralık tarihinde Roma generali Ovida komutasındaki bir birliği yenen Odoacer Dalmaçya'yı işgal etmiş ve kendi krallığına ilhak etmiştir. Glycerius hakkındaki şüphelerin artması üzerine Odoacer onu Mediolanum (şimdi Milano) piskoposu yapmıştır.

Nepos'un ölümüne tarihi kaynaklarda kısaca değinilmiştir ve ölüm tarihi hakkında tam bir mutabakat yoktur. Önceki Auctarii Hauniensis ordo, 480 yılında, "İmparator Nepos, Dalmaçyada hüküm sürdüğü ve gaspedilen onursal unvanlarını geri almaya uğraştığı sırada kendi taraftarlarınca, beklenmeyen bir saldırı sonucu 22 Haziranda bıçaklanarak öldürülmüştür" diye yazar ("Nepos imperator cum Dalmatis imperaret et sumpti honoris sceptra firmare conaretur, a suis improvisis ictibus confossus interiit X k. Iul."). Sonraki Auctarii Hauniensis ordo ise aynı olayların 25 Nisan'da olduğunu söyler ("Nepos imperator cum in Dalmatiis imperii sui sceptra firmare conaretur, a suis occiditur VII k. Mai"). Fasti vindobonenses priores, başka bir tarih verir: "Bu yıl da İmparator Nepos 9 Mayıs tarihinde öldürüldü" (""his cons. occiditur Nepos imp. VII idus Maias": no.626, s.a.480). Anonymus Valesianus sadece not olarak, "Ve orada beş yıl kaldı; ardından kendi taraftarlarınca öldürüldü" der ("et ibi mansit per annos quinque, postea vero a suis occidi": 7.326). Bu tarihlerin farklı olmasının nedeni, ölüm haberinin farklı yerlere farklı tarihlerde ulaşmış olması olarak açıklanabilir; eğer öyleyse en erken tarih olan 25 Nisan muhtemel en doğru tarih olacaktır.

Eğer bu kaynaklara güvenilirse, Nepos 480 yılında aslında kendisine ait olan Batı Roma tahtını yeniden ele geçirmek için uğraşmaktaydı. Eğer öyleyse Dalmaçyalı destekçilerinin bununla bir ilgisi yoktu ve yerel bir entrikanın kurbanı olmuştu. Bizans tarihçilerine ait olan bir iddiaya göre(apud. Photius 78) Glycerius'un kendisi de Nepos'u ortadan kaldırmak için bir plan yapmıştı.

Odovacar, Nepos'un ölümüyle avantajı eline geçirmiş ve hakimiyetini Dalmaçyaya kadar genişletmişti. Cassiodorus şöyle hatırlar, "Bu sırada Odovacar, Odiva'yı Dalmaçyada yendi ve öldürdü."