saat bernama kodam xvi/raksabuana:
letnan kolonel inf minggu (1957 - 25 mei 1959)
kolonel inf supardi (25 mei 1959 - 20 maret 1963)
saat bernama kodam xvi/udayana (mulai tahun 1962):
brigadir jenderal tni sjafiudin (20 maret 1963 - 21 juni 1966)
brigadir jenderal tni sukertijo (21 juni 1966 - 23 maret 1970)
brigadir jenderal tni r. suprapto (26 maret 1970 - 25 maret 1972)
brigadir jenderal tni jogi supardi (25 maret 1972 - 1 februari 1974)
brigadir jenderal tni ignatius pranotokusumo (1 februari 1974 - 3 maret 1976)
brigadir jenderal tni soeweno (3 maret 1976 - 14 oktober 1978)
brigadir jenderal tni dading kalbuadi (14 oktober 1978 - 18 mei 1983)
brigadir jenderal tni soetarto (18 mei 1983 - 6 maret 1986)
saat bernama kodam ix/udayana:
mayor jenderal tni adolf sahala rajagukguk (6 maret 1986 - 12 agustus 1987)
mayor jenderal tni djoko pramono (12 agustus 1987 - 12 agustus 1988)
mayor jenderal tni sintong panjaitan (12 agustus 1988 - 1 januari 1992)
mayor jenderal tni hbl mantiri (1 januari 1992 - 15 juli 1992)
mayor jenderal tni soewardi (15 juli 1992 - 20 maret 1993)
mayor jenderal tni theo syafei (20 maret 1993 - 8 februari 1994)
mayor jenderal tni r adang ruchiatna purwadirdja (8 februari 1994 - 15 agustus 1995)
mayor jenderal tni ha rivai (15 agustus 1995 - 24 juli 1997)
mayor jenderal tni syahrir ms (24 juli 1997 - 27 mei 1998)
mayor jenderal tni yudhomo s (27 mei 1998-4 juni 1988) meninggal dalam tugas kecelakaan helikopter
mayor jenderal tni adam damiri (16 juni 1998 - 1 nopember 1999)
mayor jenderal tni kiki syahnakri (5 nopember 1999 - 1 nopember 2000)
mayor jenderal tni william t da costa (1 nopember 2000 - 1 juli 2002)
mayor jenderal tni agus suyitno (1 juli 2002 - 20 agustus 2003)
mayor jenderal tni supiadin as (20 agustus 2003 - 15 maret 2005)
mayor jenderal tni herry tjahjana (15 maret 2005 - 20 oktober 2005)
mayor jenderal tni zamroni (20 oktober 2005 - 7 september 2006)
mayor jenderal tni syaiful rizal, psc, s.ip (7 september 2006 - januari 2008)
mayor jenderal tni gr situmeang (januari 2008 - 26 juni 2008)
mayor jenderal tni hotmangaraja panjaitan (26 juni 2008 - 1 april 2010)
mayor jenderal tni rahmat budiyanto (1 april 2010 - 27 mei 2011)
mayor jenderal tni leonard (27 mei 2011 - 15 juni 2012)
mayor jenderal tni wisnu bawa tenaya (15 juni 2012 - 3 oktober 2014)
mayor jenderal tni torry djohar banguntoro (3 oktober 2014 - 15 september 2015)
mayor jenderal tni m. setyo sularso (15 september 2015 - 25 april 2016)
mayor jenderal tni kustanto widiatmoko (4 mei 2016 - sekarang)
satuan dibawah kendali kodam ix/udayana
tingkat komando satuan pelaksana kodam
korem 161/wira sakti
kodim 1601/sumba timur
kodim 1613/sumba barat
kodim 1618/timor tengah utara
kodim 1621/timor tengah selatan
korem 162/wira bhakti
kodim 1606/lombok barat
kodim 1615/lombok timur
kodim 1620/lombak tengah
yonif 742/satya wira yudha
korem 163/wira satya
resimen induk militer kodam ix/udayana
secaba rindam ix/udayana
secata rindam ix/udayana
dodiklatpur rindam ix/udayana
dodikjur rindam ix/udayana
dodikbelanegara rindam ix/udayana
satuan tempur dan banpur
yonif 743/pradnya samapta yudha
yonif 744/satya yudha bhakt
yonif 746/nitya yudha bhakti
yonif mekanis 741/satya bhakti wirottama
yonif 742/satya wira yudha
kokavser ix/shima pasupati
yonzipur 18/yudha karya raksaka