mubyarto lahir di sleman, yogyakarta.
masa kecilnya hingga sarjana muda dihabiskan di yogyakarta.
selepas dari ugm, mubyarto melanjutkan pendidikan dan memperoleh gelar master of arts dari vanderbilt university, tennessee pada tahun 1962 dan gelar doctor of philosophy dari iowa state university, iowa pada tahun 1965, keduanya di amerika serikat.
gelar doktor diraihnya dalam usia 27 tahun dengan mempertahankan disertasi berjudul elastisitas surplus beras yang dapat dipasarkan di jawa-madura.
profesi utamanya adalah dosen di fakultas ekonomi ugm (1959-2003).
salah satu jabatan penting di dalam kariernya bersama ugm adalah pada saat menjabat sebagai kepala pusat penelitian pembangunan pedesaan dan kawasan (p3pk) ugm tahun 1983-1994.
selama dipimpin oleh mubyarto, p3pk secara intensif melakukan berbagai penelitian di bidang perdesaan dengan bekerja sama dengan pemerintah daerah di seluruh indonesia.
kemudian pada periode tahun 1987-1999, ia menjadi anggota mpr. sejak tahun 2002, dia adalah kepala pusat studi ekonomi pancasila (pustep) ugm sampai kemudian meninggal pada tahun 2005.
pustep didirikan oleh ugm di bawah pimpinan rektor sofyan effendi, untuk mendalami dan mengembangkan konsep ekonomi pancasila yang telah ramai menjadi bahan diskusi utama ekonomi indonesia sejak tahun 1980.
sebagai birokrat, mubyarto pernah menjabat sebagai penasihat menteri perdagangan pada tahun 1968-1971, asisten kepala badan perencanaan pembangunan nasional/bappenas 1993-1998, dan staf ahli menteri koordinator bidang perekonomian, keuangan, dan industri pada tahun yang sama.
dalam bukunya, apa &
siapa: sejumlah orang indonesia 1985-1986, konsep ekonomi pancasila yang dikembangkan mubyarto sempat ditertawakan sejumlah kalangan.
konsepnya yang sangat normatif dinilai sangat sulit untuk diterapkan di indonesia meskipun dikembangkan dari dasar negara indonesia pancasila.
satu hal yang selalu disampaikan mubyarto untuk menjawab kesalahpahaman yang telah terlanjur menjadi pemahaman umum adalah bahwa dia bukan penemu ekonomi pancasila.
dia hanya mengembangkan lebih lanjut konsep ekonomi pancasila setelah idenya didengungkan oleh bung karno dan bung hatta, dan untuk pertama kalinya dirumuskan oleh emil salim.
program inpres desa tertinggal (idt) adalah salah satu program pemerintah yang diluncurkan mubyarto pada tahun 1993 pada saat menjabat sebagai asisten menteri pembangunan perencanaan nasional/kepala bappenas, yaitu menghibahkan dana pemerintah kepada kelompok masyarakat miskin untuk dikelola langsung oleh masyarakat secara musyawarah dengan menggunakan konsep dana bergulir.
program idt ini adalah hasil pemikiran mubyarto bersama dengan koleganya, misalnya yang tergabung di dalam yayasan agro ekonomika (yae) seperti sosiolog pedesaan ipb sayogyo dan direktur lsm bina swadaya bambang ismawan.
program idt sebagai program pengentasan kemiskinan telah berhenti, namun konsep hibah dana bergulir yang dikembangkan oleh mubyarto dkk sampai sekarang masih digunakan dalam bentuk program-program lain di berbagai sektor pembangunan di indonesia.
pada saat meninggal pada tahun 2005, mubyarto meninggalkan seorang istri, sri hartati widayati, dan empat orang anak andianto hidayat, tantiarini hidayati, satriyantono hidayat, dan dadit gunarwanto hidayat, serta sejumlah cucu.
pada tahun yang sama, mubyarto telah menyelesaikan tugas utamanya dan memasuki masa pensiun sebagai guru besar fakultas ekonomi universitas gadjah mada.