alih teori kritis
operon ara adalah sekelompok protein yang berfungsi dalam meregulasi katabolisme arabinosa.
komponen-komponen dalam operon ara
protein yang berfungsi secara langsung dalam regulasi positif gellissen g.2005.production of recombinant protein:novel microbial and eukaryotic expression systems.wiley-vch gmbh & co:weinheim.
dan negatif arabinosa dalam operon ara adalah araa, arab, arac, dan arad.caspari ew.1976.advances in genetics,jilid 18.academic press,inc.:new york.
araa merupakan l-arabinosa isomerase yaitu suatu isomerase yang berguna dalam perubahan l-arabinosa menjadi isomernya yaitu l-ribulosa.
araa dikodekan oleh gen araa.nogueira is, nogueire tv,soares s, lencastre h.1997.the bacillus subtilis l-arabinose (ara) operon: nucleotide sequence, genetic organization and expression.
arab merupakan l-ribulokinase yaitu suatu ribulokinase yang berguna dalam penambahan gugus fosfat pada l-ribulosa sehingga menjadi l-ribulosa-5-fosfat.arab.nogueira is, nogueire tv,soares s, lencastre h.1997.the bacillus subtilis l-arabinose (ara) operon: nucleotide sequence, genetic organization and expression.
arad merupakan l-ribulosa-5-fosfat-4-epimerase yaitu suatu epimerase yang berfungsi dalam perubahan l-ribulosa-5-fosfat menjadi d-xilulosa-5-fosfat yang selanjutnya dapat masuk kedalam dalam xylulose phosphate pathway yang merupakan salah satu jalur katabolisme untuk menghasilkan energi.arad.nogueira is, nogueire tv,soares s, lencastre h.1997.the bacillus subtilis l-arabinose (ara) operon: nucleotide sequence, genetic organization and expression.
arac merupakan suatu protein regulator yang berfungsi untuk meregulasi transkripsi araa, arab, dan arad yang diinduksi dengan keberadaan arabinosa.arac. nogueira is, nogueire tv,soares s, lencastre h.1997.the bacillus subtilis l-arabinose (ara) operon: nucleotide sequence, genetic organization and expression.
operator yang terdapat dalam operon ini ada4 yaitu o1,o2,i1,dan i2 (i berarti induction
macam konformasi protein regulator
arac memiliki tiga bentuk konformasi yaitu satu sebagai monomer dan dua bentuk sebagai dimer.c-terminal dna binding domain yang terikat dengan n-terminal dimerization domain.n-terminal dimerization domain terdapat n-terminal arm yang dapat terikat pada c-terminal dna binding domain pada molekul yang sama atau n-terminal dimerization domain pada partner molekul bergantung dengan keberadaan arabinosa.moat ag, et al.2002.microbial physiology.wiley-liss,inc:new york.
bila tidak ada arabinosa yang menempel pada arabinosa binding site maka n-terminal arm akan menempel pada
bila terdapat arabinosa yang menempel pada arabinosa binding site maka n-terminal arm akan menempel pada n-terminal dimerization
jika terdapat arabinosa yang berikatan pada arabinosa binding site maka arac dimer akan lebih fleksibel sehingga dapat berikatan dengan i1 dan i2.transkripsi arabad melalui promotor pbad dan arac melalui promotor pc.moat ag, et al.2002.microbial physiology.wiley-liss,inc:new york.
jika tidak terdapat arabinosa maka arac dimer yang berbentuk kaku hanya dapat berikatan pada o2, dan i1 membentuk hairpin loop yang menghambat trankripsi arabad karena rna polimerase tidak dapat menempel pada promotor.moat ag, et al.2002.microbial physiology.wiley-liss,inc:new york.
transkripsi yang melalui promotor pbad juga dipengaruhi dengan interaksi camp-crp melalui interaksi antar protein dengan rna polimerasewilcox g, et al.1974.regulation of the l-arabinose operon bad in vitro.j biol chem.(249):2946-2952