giri kedaton didirikan oleh raden paku, seorang anggota walisongo tahun 1487.
suatu ketika dikisahkan, raden paku pergi menemui ayahnya yang menjadi ulama di pasai, bernama maulana ishak.
ayahnya itu menyuruhnya untuk membangun sebuah pondok pesantren di daerah gresik.
raden paku menemukan tanah yang mirip dengan tempat tinggal ayahnya.
tanah tersebut terletak di bukit giri (sekarang masuk kecamatan kebomas, gresik).
di atas bukit itu didirikan sebuah pesantren bernama giri kedaton.
raden paku sebagai pemimpin bergelar prabu satmata, atau sunan giri i.
meskipun hanya sekolah agama, namun murid-murid giri kedaton berdatangan dari segala penjuru, bahkan dari ternate.
murid-murid giri kedaton ini tidak hanya kalangan rakyat kecil, namun juga para pangeran dan bangsawan.
kerajaan majapahit yang sudah rapuh merasa khawatir melihat perkembangan giri kedaton.
para pangeran yang telah menamatkan pendidikan mereka setelah kembali ke negeri masing-masing mengobarkan semangat baru untuk lepas dari kekuasaan majapahit.
daerah kekuasaan majapahit memang semakin berkurang sejak meletusnya perang paregreg tahun 14011406.
dikisahkan pula, majapahit menyuruh sekutunya yang masih setia, yaitu sengguruh, untuk menyerang giri. pihak giri yang hanya terdiri dari para santri tentu saja mengalami kekalahan.
pemimpinnya, yaitu sunan dalem sampai mengungsi ke desa gumena.
giri kedaton mengalami puncak kejayaan di bawah kepemimpinan sunan prapen tahun 15481605.
saat itu giri tidak hanya sekadar sekolah agama, namun juga menjadi kerajaan yang meiliki kekuatan politik.
misalnya, sunan prapen dikisahkan menjadi pelantik sultan adiwijaya raja pajang.
ia juga menjadi mediator pertemuan antara adiwijaya dengan para bupati jawa timur tahun 1568.
dalam pertemuan itu, para bupati jawa timur sepakat mengakui kekuasaan pajang sebagai kelanjutan kesultanan demak
sunan prapen juga menjadi juru damai peperangan antara panembahan senopati raja mataram melawan jayalengkara bupati surabaya tahun 1588.
peperangan itu dilatarbelakangi oleh penolakan para bupati jawa timur terhadap kekuasaan senopati yang telah meruntuhkan kesultanan pajang.
tidak hanya itu, sunan prapen hampir selalu menjadi pelantik setiap ada raja islam yang naik takhta di segenap penjuru nusantara.
kesultanan mataram di bawah pemerintahan sultan agung menghendaki agar giri kedaton tunduk sebagai daerah bawahan.
pada tahun 1630 giri kedaton di bawah pimpinan sunan kawis guwa menolak kekuasan mataram.
tidak seorang pun perwira mataram yang berani menghadapi giri. rupanya mereka masih takut akan kekeramatan walisongo meskipun dewan tersebut sudah tidak ada lagi.
sultan agung pun menunjuk iparnya, yaitu pangeran pekik putra jayalengkara dari surabaya untuk menghadapi giri. semangat pasukan mataram bangkit karena pangeran pekik merupakan keturunan sunan ampel, sementara sunan kawis guwa adalah keturunan sunan giri i, di mana sunan giri i adalah murid sunan ampel.
perang akhirnya dimenangkan oleh pihak mataram di mana giri kedaton takluk sekitar tahun 1636.
sunan kawis guwa dipersilakan untuk tetap memimpin giri dengan syarat harus tunduk kepada mataram.
sejak saat itu wibawa giri kedaton pun memudar.
pengganti sunan kawis guwa tidak lagi bergelar sunan giri, melainkan bergelar panembahan ageng giri.
gelar panembahan dan giri memengaruhi penguasa kerajaan tanjungpura di kalimantan barat ketika memeluk islam menggunakan gelar panembahan giri kusuma.
giri kedaton yang sudah menjadi bawahan mataram kemudian mendukung pemberontakan trunojoyo dari madura terhadap pemerintahan amangkurat i putra sultan agung.
panembahan ageng giri aktif mencari dukungan untuk memperkuat barisan pemberontak.
puncak pemberontakan terjadi tahun 1677 di mana kesultanan mataram mengalami keruntuhan.
amangkurat i sendiri tewas dalam pelarian.
putranya yang bergelar amangkurat ii bersekutu dengan voc melancarkan aksi pembalasan.
amangkurat ii yang menjadi raja tanpa takhta berhasil menghancurkan pemberontakan trunojoyo akhir tahun 1679.
sekutu trunojoyo yang bertahan paling akhir adalah giri kedaton.
pada bulan april 1680 serangan besar-besaran terhadap giri dilancarkan oleh vocbelanda.
murid andalan giri yang menjadi panglima para santri bernama pangeran singosari gugur dalam peperangan.
panembahan ageng giri ditangkap dan dihukum mati menggunakan cambuk.
tidak hanya itu, anggota keluarganya juga dimusnahkan.
sejak saat itu berakhirlah riwayat giri kedaton.
daftar para penguasa
berikut ini adalah daftar para pemimpin giri kedaton.
sunan giri i atau prabu satmata atau raden paku (14871506)
sunan dalem atau sunan kedul atau sunan giri ii (14871546)
sunan seda ing margi atau sunan giri iii (15461548)
sunan prapen atau sunan mas ratu pratikal atau sunan giri iv (15481605)
sunan kawis guwa atau sunan giri v (1605?)
panembahan ageng giri (?1680)
panembahan mas witana sideng rana
surabaya: terbit terang
babad tanah jawi, mulai dari nabi adam sampai tahun 1647. (terj.). 2007.
h.j. de graaf dan t.h. pigeaud. 2001.
kerajaan islam pertama di jawa. terj.
sejarah indonesia modern (terj.).
yogyakarta: gadjah mada university press
sartono kartodirdjo. 1993.
pengantar sejarah indonesia baru 1500  1900, dari emporium sampai imperium jilid 1. jakarta: gramedia