berbeda dengan kebanyakan jalur kereta api di pulau jawa, jalur ini menembus daerah pegunungan (di antara pegunungan pembarisan di sisi barat dan kaki gunung slamet di sisi timur) dengan jalur yang berliku-liku dan pemandangan yang menarik.
tanjakan yang cukup terjal membuat beberapa rangkaian panjang atau berat memerlukan traksi ganda (loko dobel) untuk memudahkan pergerakan.
terdapat banyak jembatan tinggi dan panjang di jalur ini, salah satunya adalah jembatan kali serayu di selatan stasiun notog dan terowongan di utara stasiun kebasen.
jalur kereta api yang terhubung oleh jalur ini adalah
jalur kereta api cirebon-prupuk
jalur kereta api tegal-prupuk
jalur kereta api kroya-kutoarjo
jalur kereta api maos-kroya
jalur kereta api maos-cilacap
jalur kereta api purwokerto-wonosobo
serajoedal stoomtram maatschappij
dari arah utara, stasiun-stasiun yang berada di jalur ini adalah sebagai berikut:
stasiun prupuk stasiun ini hanya melayani kereta api lokal jurusan purwokerto-cirebon prujakan, kereta api kamandaka jurusan purwokerto-semarang tawang, kereta api gaya baru malam selatan jurusan pasar senen-surabaya gubeng, kereta api bbm jurusan maos-cilacap dan persusulan antar ka, serta pemberangkatan krd ciayumajakuning jurusan prupuk-cirebon-jatibarang per 1 april 2015. (ppk, +36 m dpl)
stasiun linggapura (lg, +156 m dpl)
stasiun bumiayu (bma, +236,45 m dpl)
stasiun kretek (krt, +285 m dpl)
stasiun patuguran (pat, +328 m dpl, stasiun tertinggi di jalur prupuk-purwokerto)
stasiun legok (lgk, +299 m dpl, nonaktif sejak double track aktif)
stasiun karangsari (krr, +233 m dpl)
stasiun karanggandul (kgd, +142 m dpl)
stasiun purwokerto (pwt, +75 m dpl)
stasiun notog (ntg, +25 m dpl)
stasiun kebasen (kbs, +14 m dpl)
stasiun randegan (rdn, +11 m dpl)
stasiun kroya (kya, +11m dpl)
semenjak ruas prupuk-purwokerto menjadi jalur ganda, satu stasiun telah dinonaktifkan, yaitu stasiun legok (lgk, +299 m) yang terletak di antara patuguran dan kretek.
stasiun yang dicetak tebal merupakan stasiun besar
stasiun yang tidak dicetak tebal merupakan stasiun kecil
perubahan dalam perkeretaapian
setelah pembangunan jalur ganda kereta api antara cirebon prujakan-prupuk-purwokerto-kroya mulai tanggal 14 mei 2016, 5 stasiun kereta api di lintas kereta api cirebon-cirebon prujakan-prupuk-purwokerto-kroya tidak melayani naik-turun penumpang dan persilangan.
stasiun kereta api yang tidak melayani naik-turun penumpang dan persilangan tersebut mulai tanggal 14 mei 2016 adalah stasiun karangsuwung dan ketanggungan barat (lintas cirebon-prupuk, daerah operasi iii cirebon), stasiun prupuk, legok, dan notog (lintas prupuk-kroya, daerah operasi v purwokerto).
sehingga ini pelayanan naik-turun penumpang dan persilangan kereta api hanya dapat dilakukan di stasiun kereta api cirebon, cirebon prujakan dan ciledug (daerah operasi iii cirebon), bumiayu, purwokerto, dan kroya (daerah operasi v purwokerto).
terowongan notog (900 m)
jembatan sakalibel (950 m)
jalur kereta api cirebon-prupuk
lihat saja di daerah operasi v purwokerto
lihat saja di daftar kereta api yang melewati jalur kereta api prupuk-kroya
staatsspoorwegen (1917-1945)dka, pnka, pjka, perumka, ptka dan pt kereta api indonesia (persero (1945-sekarang)pt kereta api indonesia (persero) daerah operasi v purwokerto
jalur kereta api prupuk-kroya
jalur kereta api maos-purwokerto timur
jalur kereta api prupuk-kroya
kategori:jalur kereta api di indonesia
kategori:jalur kereta api di indonesia