kabupaten puncak jaya dibentuk berdasarkan peraturan pemerintah nomor : 52 tahun 1996 tentang pembentukan kabupaten puncak jaya, paniai, mimika dan perubahan nama dan pemindahan ibu kota kabupaten daerah tingkat ii paniai di wilayah provinsi daerah tk i irian jaya. selanjutnya diperkuat dengan ditetapkannya undang-undang nomor 45 tahun 1999 tentang tentang pembentukan provinsi irian jaya tengah, irian jaya barat, kabupaten paniai, kabupaten mimika, kabupaten puncak jaya dan kota sorong.
seiring dengan perkembangan penyelenggaraan pemerintahan dan untuk memperpendek rentang kendali pelayanan, maka kabupaten puncak jaya telah dimekarkan berdasarkan undang-undang nomor 7
tahun 2008 tentang pembentukan kabupaten puncak.
saat ini kabupaten puncak jaya terdiri dari 8 distrik yaitu :
distrik torere, dan
sedangkan jumlah kampung yang semula terdiri dari 67 kampung, untuk lebih memaksimalkan pelayanan kepada masyarakat yang terisolir di pedalaman maka dalam perkembangan selanjutnya telah dilakukan pemekaran kampung dari 67 kampung menjadi 302 kampung yaitu berdasarkan peraturan daerah kabupaten puncak jaya nomor : 2 tahun 2008.
luas wilayah kabupaten
puncak jaya 6.477,65 km2 dengan jumlah penduduk 256.314 jiwa (februari 2013) yang sebagian besar tersebar dan bermukim di balik-balik gunung dan lembah dengan kondisi kehidupan yang serba terbatas.
geografis kabupaten puncak jaya
secara geografis kabupaten puncak jaya berada pada posisi 137o 15  138o15 bujur timur dan 2o0  3o 0 lintang selatan.
letak geografis kabupaten puncak jaya berada di kawasan pegunungan tengah provinsi papua dengan keginggian antara 500 s/d 4.500 m di atas permukaan laut.
95% wilayah kabupaten puncak jaya merupakan wilayah yang berbukit-bukit dan bergunung-gunung dengan struktur tanah yang berbatu-batu, dan hanya kurang lebih 5% yang merupakan dataran rendah yaitu distrik fawi dan torere.
secara administratif kabupaten puncak jaya memiliki batas-batas sebagai berikut :
sebelah utara : berbatasan dengan kabupaten mamberamo raya;
sebelah timur : berbatasan dengan distrik karubaga kabupaten tolikara;
sebelah selatan : berbatasan dengan distrik agadugume kabupaten puncak, dan distrik tiom kabupaten lanny jaya;
sebelah barat : berbatasan dengan distrik sinak, distrik pogoma dan distrik doufo kabupaten puncak.
iklim kabupaten puncak jaya
meskipun secara umum kawasan kabupaten puncak jaya termasuk beriklim tropis seperti kebanyakan daerah lainnya di provinsi papua, namun kawasan ini memiliki pula beberapa kondisi yang spesifik lokal.
menurut badan metereologi dan geofisika, curah hujan di kawasan kabupaten puncak jaya terjadi hampir sepanjang tahun dengan jumlah curah hujan setahun mencapai 3.935 mm.
jumlah hari hujan rata-rata pertahun 206 hari.
curah hujan tertinggi terjadi pada bulan januari yakni mencapai 456 mm, sedangkan curah hujan terendah terjadi pada bulan nopember yakni mencapai 203 mm.
suhu udara tertinggi 32o c, suhu udara terendah 9oc pada malam hari dan kelembaban udara rata-rata 83,7 %. kabut sering terjadi pada pagi dan sore hari, sehingga sering menghambat/mengganggu lalu lintas penerbangan.
pada malam hari suhu udara cukup dingin.
di daerah pegunungan suhu udara mendekati titik beku.
kecepatan angin rata-rata antara 1,0  2,4 knot/jam, penyinaran matahari antara 14,3  26,6, sedangkan kelembaban nisbi berkisar antara 75-85 %
karaktaristik sungai di kabupaten puncak jaya pada umumnya bermuara ke pantai utara pulau papua, dengan sungai utama adalah bagian hilir sungai mamberamo (roufear).
sungai-sungai di daerah ini pada umumnya kecil-kecil dengan kondisi air dangkal dan deras.
kondisi drainase wilayah pada umumnya cukup baik.
hal ini terlihat dari keadaan hanya sebagian kecil wilayah yang tergenang yaitu sebagian dari wilayah distrik fawi dan torere.
penduduk kabupaten puncak jaya terdiri atas suku-suku asli yang mendiami kawasan pegunungan tengah yang terdiri dari :
suku turu dan sebagian kecil suku lainnya (pendatang).
pemukiman penduduk pada umumnya terletak di lembah dan lereng perbukitan pada ketinggian antara 500  2400 m di atas permukaan laut dengan distribusi penduduk yang tidak merapa.
mata pencaharian penduduk kabupaten puncak jaya utamanya adalah pertanian, peternakan, dan kerajinan tangan.
kabupaten puncak jaya memiliki potensi alam yang sangat besar mulai dari potensi yang berupa hasil-hasil hutan, hasil tambang, kekayaan flora dan fauna maupun keindahan alam.
potensi hasil hutan
luas hutan kabupaten puncak jaya sekitar 1.453,20 ha dengan potensi hasil hutan yang bisa diandalkan terutama di wilayah dataran rendah (fawi dan torere) antara lain, kayu merbau, kayu matoa, kayu bakau, kayu gaharu, rotan, dan hasil hutan lainnya.
kekayaan flora dan fauna
di kawasan kabupaten puncak jaya terdapat aneka vegetasi seperti berbagai jenis anggrek, memiliki 20.000  25.000 jenis tanaman kayu, terdapat 350 jenis burung, 101 jenis mamalia, 150 jenis serangga serta 329 jenis reptilia dan amphibi.
khusus vegetasi jenis anggrek, kabupaten puncak jaya pernah berprestasi dengan menjadi duta provinsi papua dalam pameran anggrek tingkat nasional pada tahun 2003.
kabupaten puncak jaya selain menghadirkan alam yang terkesan ganas karena berbukit-bukit bahkan bergunung-gunung, sesungguhnya di dalamnya terdapat keindahan alam yang memiliki potensi yang sangat besar di bidang pariwisata.
karena keindahan alam yang ada di kabupaten puncak jaya maka pemerintah kabupaten puncak jaya kini mengembangkan kota mulia sebagai wisata gunung.
tembaga dan aluminium, sebagaimana hasil survei di wilayah distrik fawi dan tidak menutup kemungkinan tersebar hampir diseluruh distrik kabupaten puncak jaya.
emas, seperti yang terlihat di distrik yamo dan
batubara, yang sementara akan dilakukan survei tahap awal di distrik fawi.
dan bahan galian golongan c, seperti batu, pasir dan kerikil.
proses pembentukan calon kabupaten yamo yang merupakan pemekaran kabupaten puncak jaya.
tinjauan pemekaran daerah otonom baru kabupaten yamo distrik yang mungkin bergabung ke dalam kabupaten ini meliputi:
kabupaten lembah roufaer
kabupaten ini akan dimekarkan dari kabupaten mamberamo raya, kabupaten waropen dan kabupaten puncak jaya. distrik yang mungkin bergabung ke dalam kabupaten ini meliputi:
dari kabupaten mamberamo raya
mamberamo tengah timur
dari kabupaten waropen
dari kabupaten puncak jaya