komando daerah militer xvi/pattimura merupakan komando kewilayahan pertahanan yang meliputi provinsi maluku dan maluku utara.
wilayah teritorial kodam xvi/pattimura meliputi 2 (dua) provinsi, yaitu provinsi maluku dan provinsi maluku utara serta 20 (dua puluh) wilayah kabupaten/kota, yaitu 11 kabupaten/kota di provinsi maluku dan 9 kabupaten/kota di provinsi maluku utara dan 171 wilayah kecamatan, yaitu 60 kecamatan di provinsi maluku dan 111 kecamatan di provinsi maluku utara.
kodam xvi/pattimura memiliki 2 (dua) komando resort militer (korem) yaitu korem 151/binaiya terdiri dari 5 kodim mencakup wilayah provinsi maluku serta korem 152/babullah terdiri dari 4 kodim mencakup wilayah provinsi maluku utara.
pangdam xvi/pattimura yang sekarang menjabat adalah mayjen tni doni monardo, s.ip mantan danjen kopassus.
tugas-tugas kodam xvi/pattimura
sebagai kotama pembinaan, kotama operasi dan komando kewilayahan, maka kodam xvi/pattimura mengemban tugas-tugas, sebagai berikut :
melaksanakan tugas-tugas tni matra darat di wilayah maluku dan maluku utara.
melaksanakan pengamanan wilayah maluku dan maluku utara yang berbatasan dengan negara lain.
melaksanakan pembangunan dan pembinaan kekuatan tni matra darat di wilayah maluku dan maluku utara.
melaksanakan pemberdayaan wilayah pertahanan darat sesuai peran dan wewenangnya serta mewujudkan kemanunggalan tni-rakyat.
melaksanakan tugas-tugas lain sesuai dengan peraturan perundang-undangan.
untuk menumpas dan menghancurkan yang menamakan diri republik maluku selatan atau rms di maluku, komando tentara dan territorium vii indonesia timur mulai menyusun rencana gerakan operasi militer yang diberi nama komando pasukan maluku selatan dengan komandan operasi kolonel a,e. kawilarang (panglima tt vii indonesia timur), yang kemudian diserahkan kepada letkol slamet riyadi.
komando pasukan maluku selatan pada tahun 1950 mulai melakukan gerakan operasi militer di pulau buru, pulau seram, pulau ambon dan pulau-pulau lease untuk merebut kembali pulau-pulau itu dari tangan rms. setelah berhasil dalam gerakan operasinya, maka berdasarkan penetapan kasad tanggal 30 agustus 1950 komando pasukan maluku selatan diubah menjadi komando pasukan d atau kompas d dibawah pimpinan letkol j.f.
kemudian pada tanggal 5 juli 1952 kompas d diubah menjadi resimen infanteri 25 atau ri 25 dengan komandannya letkol.
pada tanggal 27 mei 1957 kasad menetapkan komando daerah militer maluku dan irian barat disingkat kdm-mib, dengan pejabat pangdam pertama kolonel herman pieters dan pada tanggal 24 oktober 1959 komando daerah militer maluku dan irian barat diubah menjadi kodam maluku irian barat disingkat kodam mib dengan nama pattimura.
di dalam proses perkembangannya irian barat yang sekarang dikenal dengan papua dibentuk kodam tersendiri, maka kdm-mib diubah namanya menjadi kodam xv/pattimura. pemberian nama pattimura dilatar belakangi pada sejarah perjuangan pahlawan nasional pattimura yang berjuang menentang belanda pada tahun 1817.
pada tanggal 5 agustus 1960, dalam upacara resmi pataka kodam xv/pattimura diserahkan oleh mkn/kasad mayjen a.h.nasution kepada panglima kodam xv/pattimura (waktu itu kdm-mib).
kodam xv/pattimura yang wilayah hukumnya meliputi seluruh kepulauan maluku.
fakta-fakta sejarah sebagaimana telah diungkap terdahulu menunjukkan bahwa rakyat dan prajurit kodam xv/pattimura secara nyata turut aktif dan tidak pernah ketinggalan dalam berjuang menegakkan, mempertahankan dan mengisi semua aspek perjuangan bangsa, baik perjuangan sebelum proklamasi maupun sesudah proklamasi.
terjadinya keterperpaduan dan kebersamaan dalam perjuangan antara prajurit-prajurit kodam xv/pattimura dengan rakyatnya karena adanya persamaan tujuan perjuangan di dalam kehidupan bangsa dan nilai hidup yang luhur berdasarkan pancasila dan uud 45, sehingga kodam xv/pattimura dianugerahi suatu penghargaan tertinggi oleh negara, yaitu  sam karya nugraha  ( sam= tertinggi, karya= kerja, nugraha= hadiah ).
periode korem 174/pattimura
sesuai dengan perkembangan konsepsi strategis hankam umumnya dan tni ad khususnya, serta berdasarkan kebijakan panglima abri tentang reorganisasi angkatan darat maka beberapa komando utama (kotama) tni ad termasuk kodam xv/pattimura mengalami likuidasi sesuai tuntutan kebutuhan organisasi yang dilaksanakan pada tanggal 22 september 1984.
kemudian, berdasarkan keputusan kasad tanggal 26 desember 1984 dan direalisasikan dengan surat keputusan pangdam xv/pattimura tanggal 8 januari 1985, maka terbentuklah korem 174/pattimura yang wilayahnya meliputi keseluruhan wilayah kodam xv/pattimura.
pada tanggal 6 mei 1985 bertempat di ambon secara resmi kodam xv/pattimura dilikuidasi dengan penyerahan kembali pataka kodam xv/pattimura oleh brigjen tni h. simanjuntak kepada kasad jenderal tni rudini.
dengan pertimbangan psikologis dan historis, nama pattimura tetap dipertahankan sebagai nama korem yang baru dibentuk dengan melantik kolonel inf soeharsono s sebagai danrem 174 / pattimura yang pertama.
selanjutnya korem 174/pattimura berada di bawah komando kodam yang baru dibentuk, yaitu kodam viii/trikora, yang berkedudukan di jayapura.
periode kodam xvi/pattimura
konflik bernuansa sara yang terjadi di maluku pada tanggal 19 januari 1999 telah menimbulkan instabilitas dan kekacauan sosial bersifat horisontal yang skalanya semakin meningkat dan sulit untuk dikendalikan.
menyikapi kondisi daerah tersebut dan dalam rangka menata kembali organisasi tni, pada tanggal 7
mei 1999 dilaksanakan likuidasi korem 174/pattimura, dan dibentuk kodam xvi/pattimura pada tanggal 15 mei 1999 di ambon dalam suatu upacara militer dengan irup kasad jenderal tni subagyo hs. pada kesempatan upacara tersebut kasad secara resmi melantik brigjen tni max m.tamaela sebagai pangdam xvi/pattimura yang pertama dan hari yang bersejarah tersebut selanjutnya dirayakan sebagai hari ulang tahun kodam xvi/pattimura.
sebagai kodam yang dibentuk dan diresmikan dalam suasana konflik yang terjadi di maluku dan maluku utara, maka tuntutan tugas pengabdian yang harus diemban cukup berat.
wilayah kodam xvi/pattimura yang sangat luas dan memiliki garis perbatasan dengan negara tetangga menuntut segenap prajurit kodam xvi/pattimura bekerja keras, melebihi panggilan tugas dalam melindungi segenap bangsa dan seluruh tumpah darah indonesia di wilayah maluku dan maluku utara dari ancaman dan gangguan terhadap keutuhan bangsa dan negara.
saat bernama kodam xv/pattimura:
kolonel inf herman pieters (26 juni 1957)
brigadir jenderal tni busjiri (4 januari 1961)
brigadir jenderal tni r. djohari (15 februari 1966)
brigadir jenderal tni poniman (28 agustus 1968)
brigadir jenderal tni wing wirjawan wirjodiprodjo (17 maret 1970)
brigadir jenderal tni harun suwardi (19 januari 1974)
brigadir jenderal tni abdul rahman suhodo (2 maret 1976)
brigadir jenderal tni bagus sumitro (11 februari 1978)
brigadir jenderal tni sebastian sukoso (24 april 1981)
brigadir jenderal tni hasundungan simanjuntak (17 mei 1983)
dibekukan tahun 1985-1999
saat diaktifkan sebagai kodam xvi/pattimura:
brigjen tni max m. tamaela (15 mei 1999 - 26 juni 2000)
brigjen tni i made yasa (26 juni 2000 - 2 juli 2001)
brigjen tni mustopo (2 juli 2001 - 30 mei 2002)
mayjen tni djoko santoso (30 mei 2002 - 18 maret 2003)
mayjen tni agustadi sasongko purnomo (18 maret 2003 - 29 desember 2003)
mayjen tni syarifuddin sumah (29 desember 2003 - 21 maret 2006)
mayjen tni sudarmaidy subandi (21 maret 2006 - 2 agustus 2007)
mayjen tni rasyid qurnuen aquary (2 agustus 2007 - 7 november 2008)
mayjen tni m noer muis (7 november 2008 - januari 2010)
mayjen tni hatta syarifuddin (januari 2010 - februari 2011)
mayjen tni suharsono (februari 2011 - september 2012)
mayjen tni eko wiratmoko (september 2012 - mei 2014)
mayjen tni meris wiryadi (mei 2014) - januari 2015)
mayjen tni wiyarto, s.sos.
(januari 2015 - 7 agustus 2015)
mayjen tni doni monardo (7 agustus 2015 - sekarang)
satuan pelaksana pusat
resimen induk kodam xvi/pattimura
secaba rindam xvi/pattimura
secata rindam xvi/pattimura
dodiklatpur rindam xvi/pattimura
dodikjur rindam xvi/pattimura
dodikbelanegara rindam xvi/pattimura
korem 151/binaiya (ambon)
kodim 1506/pulau buru
korem 152/baabullah (ternate)
satuan tempur &
batalyon infanteri raider khusus 731/kabaresi
batalyon infanteri raider khusus 732/banau
batalyon infanteri 733/raider
batalyon infanteri raider khusus 734/satria nusa samudra
detasemen kavaleri 5/birgus latro cakti
denzipur 5/chakti mandra guna