alih argaios i dari makedonia
alih periode hellenistik
alih kerajaan ptolemaik
alih ptolemaios i soter
berdirinya sekolah ini berawal dari hibah yayasan bahari ( stm baita cipta ) pada 8 januari 1977.
semula stm baita cipta, mempunyai dua jurusan yaitu mesin kapal dan listrik.
setelah diserahterimakan berubah nama menjadi stm muhammadiyah pekalongan.
smk muhammadiyah pekalongan pertama kali di bawah pimpinan kepala sekolah bapak sugiri(1977  1983 ).
jurusan yang dimiliki diubah menjadi mekanik umum dan listrik.
jurusan ini berlangsung sampai tahun 1995.
tampuk pimpinan kepala sekolah yang kedua di bawah pimpinan bapak ir. abu bakar ( 1983  1990 ) dan dilanjutkan periode ketiga oleh bapak drs. roes kamto ( 1990  1995 ), selanjutnya mulai tahun 1995 di bawah pimpinan bapak wardhiyanto ( 1995  2005 sesuai perkembangan kurikulum nasional penjurusan di smk muhammadiyah pekalongan berubah menjadi tiga program studi ( jurusan ) yaitu : mekanik otomotif, mesin perkakas, dan listrik instalasi.
smk muhammadiyah pekalongan sebelum tahun 1993 berada dilokasi proliman bendan (sekarang stie muhammadiyah pekalongan).
segala aktivitasnya berpindah di jalan pramuka no 1 kramatsari sejak tahun 1993.
perpindahan bertahap dan pembangunan yang dilakukan berkesinambungan menjadikan gedung di smk muhammadiyah pekalongan saat ini terdiri dari empat gedung lantai dua sebagai gedung teori dan kantor serta laboratorium komputer, bahasa dan ipa.
sementara memiliki dua gedung yang difungsikan sebagai bengkel teknik bodi otomotif, pemesinan dan teknik kendaraan ringan (otomotif).
saat ini smk muhammadiyah pekalongan diakses melalui jl.
amd no. 1 kramatsari dengan pintu gerbang sendiri.
tahun 2005 atas prakarsa pimpinan yang baru bapak drs. indrato bertambah satu program keahlian yaitu bodi otomotf.
pada tahun 2010 ditambah lagi dengan satu program keahlian yaitu teknik rekayasa perangkat lunak (rpl/komputer).
pada tahun 2013 bertambah satu jurusan lagi yaitu teknik sepeda motor (tsm).sehingga total saat ini program keahlian / kompetensi keahlian yang dimiliki ada 5 yaitu : teknik instalasi tenaga listrik, teknik pemesinan, teknik kendaraan ringan, teknik bodi otomotif, teknik rekayasa perangkat lunak, dan teknik sepeda motor.
tidak hanya dari segi sarana prasarana saja yang meningkat, tapi dari segi manajemen juga tidak ketinggalan, terbukti dari hasil akreditasi yang cukup menggembirakan.
akreditasi i ( 10 februari 1989 ) hasilnya diakui.
akreditasi ii ( 17 januari 1994 ) hasilnya diakui.
akreditasi iii (28 april 2004) hasilnya b (baik).
akreditasi iv (oktober 2007) hasilnya a (sangat baik) untuk program keahlian teknik otomotif dan teknik pemesinan , nilai b ( baik ) untuk program pemanfaatan tenaga listrik dan teknik body otomotif.
terakhir pada akreditasi seluruh kompetensi keahlian telah memperoleh nilai a..
dan sebagai jurusan baru teknik rekayasa perangkat lunak juga sudah mendapat akreditasi b pada november 2013.
disamping itu tahun ajaran 2004  2005 dinominasikan oleh dirjen pendidikan pusat sebagai sekolah berstandar nasional ( sbn ).
pada tahun ini pula dibuka kelas unggulan ( kelas model ) kewirausahaan.
untuk mewujudkan sistem manajemen mutu sekolah yang baik maka smk muhammadiyah pekalongan telah memulai ber iso 9001 sejak tahun 2005 dari mulai iso 9001:2000 hingga saat ini telah bersertifikat iso 9001:2008.
pada tahun 2008  2009 dinominasikan sebagai rintisan sekolah bertaraf internasional hingga saat ini.
pada tahun 2013 smk muhammadiyah pekalongan menambah kompetensi keahlian baru yaitu teknik sepeda motor (tsm).
dengan kerja sama bengkel terkenal dari honda, ahas menjadi salah satu bagian untuk memberikan pelatihan sesuai dengan kompetensi sepeda motor.
memasuki tahun pelajaran 2013/2014, smk muhammadiyah pekalongan dipercaya oleh kementrian pendidikan nasional untuk turut menjadi pilot projek kurikulum 2013.
kurikulum 2013 sebagai kurikulum baru akan dijalankan untuk kelas x atau kelas satu pada tahun pelajaran 2013/2014, semoga berhasil.
pergantian kepala sekolah untuk periode 2013 - 2017 dilaksanakan pada sabtu, 21 september 2013, dengan terpilihnya drs. hm. ghozali.
tahun pelajaran 2014/2015 menjadi tonggak dimulainya smk muhammadiyah pekalongan boarding school.
boarding school smk muhammadiyah pekalongan untuk menjawab kebutuhan orang tua siswa yang berasal dari luar kota.
selain itu, sebagai program baru yang akan menempa peserta didik untuk memiliki kompetensi yang lebih.
terutama kompetensi bahasa asing ( bahasa arab dan inggris).
smk muhammadiyah pekalongan sampai dengan tahun 2014 tercatat memiliki kerja sama sebagai sekolah binaan secara resmi dengan pt daihatshu (program daihatsu pintar), pt astra honda motor dan pt akzonobel (cat internasional sikkens, oracle academy untuk kompetensi keahlian teknik komputer rpl.
pada tahun pelajaran 2016-2017 smk muhammadiyah pekalongan dinobatkan sebagai smk rujukan.
dengan smk rujukan ini maka sekolah mendapatkan kesempatan untuk meningkatkan kualitasnya dengan ditunjang bantuan dari pemerintah pusat.
prestasi yang diraih smk muhammadiyah pekalongan untuk wilayah kota pekalongan tidak diragukan lagi.
sementara untuk tingkat provinsi jawa tengah smk muhammadiyah pekalongan telah meraih juara iii lomba ketrampilan siswa (lks) tahun 2008 untuk kompetensi lomba otomotif, selanjutnya pada lks tahun 2009 wakil dari teknik bodi otomotif mampu meraih juara ii, disusul pada lks tahun 2010 tingkat jawa tengah berhasil meraih prestasi juara i untuk komptensi teknik instalasi listrik dan juara iii untuk teknik bodi otomotif.
terakhir pada lks tahun 2011 memboyong piala juara iii untuk teknik instalasi listrik dan juara iii teknik bodi otomotif.
torehan yang membanggakan dipersembahkan oleh andy saputra yang mampu meraih juara harapan i bidang lomba teknik instalasi listrik di lks tingkat nasional pada ajang lks smk di jakarta tahun 2011.
serta menjadi peserta seleksi calon peserta lks teknik instalasi listrik tingkat asia tenggara.
dalam rangka milad muhammadiyah yang ke 103, smk muhammadiyah pekalongan menyelenggarakan kegiatan spektakuler berupa perakitan 1000 lampu hemat energi yang memecahkan rekor muri (musium rekor dunia indonesia).
kegiatan perakitan 1000 lampu hemat energi yang diselenggarakan pada tanggal 25 november 2012 ini telah tercatat di muri ini sekaligus sebagai wahana siswa untuk berkegiatan wirausaha (kewarausahaan / entreprenur.
smk muhammadiyah pekalongan selalu berusaha meningkatkan kualitas.
untuk itu, dalam rangka menjalin kerja sama luar negeri.
smk muhammadiyah pekalongan membuat program sister school.
kegiatan sister school ini telah ditanda tangani mou-nya pada hari rabu 23 januari 2013 dengan smk aminuddin baki kualalumpur malaysia.
kerja sama yang dilakukan juga di smk maxwell kualalumpur malaysia.
kegiatan penandatangan dilakukan langsung oleh kepala sekolah smk muhammadiyah pekalongan dengan pengetua dari smk aminuddin baki dan smk maxwell di malaysia.
sekolah yang ketiga dikunjungi sekaligus mou berada di singapura yaitu madrasah al junaed singapura.
smk muhammadiyah pekalongan pada tanggal 16 - 27 oktober 2013 bersama dengan tim study exchange to japan mengikuti kunjungan ke sekolah-sekolah di jepang.
bersama delapan pimpinan dari sd, smk dan pimpinan wilayah yang diwakili dari sidoarjo, pekanbaru, salatiga, muntilan dan pekalongan beranjangsana untuk menimba ilmu ke sekolah-sekolah di jepang.
program keahlian teknik instalasi tenaga listrik smk muhammadiyah pekalongan telah dipercaya oleh kementrian pendidikan nasional untuk menjadi panitia teknik pelaksanaan lomba keterampilan siswa (lks) tingkat nasional selama tiga kali berturut-turut (tahun 2011 di jakarta, 2012 di bandung, 2013 di jakarta).
diakhir tahun 2013 ini smk muhammadiyah pekalongan mendapat kehormatan sebagai smk berprestasi yang berhak untuk mendapatkan pengembangan prestasi dari pemerintah pusat.
awal tahun 2014 smk muhammadiyah pekalongan di percaya pemerintah untuk membuka bisnis center.
bisnis center ini diharapkan menjadi tempat usaha yang menghasilkan dan bermanfat.
menghasilkan secara materi untuk menambah pendapatan bagi sekolah.
bermanfaat sebagai tempat untuk belajar berwirausaha dan pengelolaan bisnis bagi siswa dan guru.
pada tahun 2014 smk muhammadiyah pekalongan memperoleh kejuaraan di busines plan. juara i di ajang lomba bussines plan di universitas muhammadiyah purwokerto dan juara ii di lomba bussines plan di olimpicad di malang.
prestasi yang ditorehkan pada tahun 2014 ini adalah juara ii lomba ketrampilan siswa (lks) smk ke xxiii tingkat provinsi jawa tengah di magelang mata lomba bodi repair.
juara i penulisan artikel batik tingkat jawa tengah pada acara pameran batik nusantara.
selain prestasi siswa diperoleh prestasi guru pai, atas nama bapak slamet tohirin yang meraih peringkat ii lomba guru pai se provinsi jawa tengah.
dan menjadi finalis best practice pembelajaran tingkat nasional tahun 2014 yang diikuti oleh widoyo, s.pd.
prestasi membanggakan diberikan tim sepak bola di ajang liga pelajar indonesia tahun 2014 yang pertama digelar di pekalongan dengan merebut juara 1.
pada bulan februari 2015 smk muhammadiyah pekalongan yang di dalamnya terdapat cv surya utama teknika berhasil menjadi tenant yang mendapat penghargaan dari balai inkubator teknologi (bit) badan pengkajian dan penerapan teknolgi (bppt)jakarta.
1977 - 1983 : sugiri
1983 - 1990 : ir. abu bakar
1990 - 1995 : drs. roeskamto
1995 - 2005 : drs. wardhiyanto
2005 - 2013 : drs. indrato, msi
2013 - 2017 : drs. ghozali