jika dilihat dari angkutan antarmodanya, jarak antara terminal kebumen dengan stasiun ini dibilang cukup jauh.
lokasinya berdekatan dengan markas kodim 0809 kebumen dan wisata terpadu mexolie land.
stasiun ini dahulu memiliki lima jalur dengan jalur 2 sebagai sepur lurus, akan tetapi jalur 4 dan 5 dibongkar karena masih menggunakan rel berukuran kecil sehingga tinggal jalur 1-3 saja yang aktif.
dulu jalur 5 terhubung dengan jembatan timbang yang kini menjadi cagar budaya.
ada pula percabangan menuju sungai luk ulo untuk mempermudah pengangkutan pasir yang kini sudah ditutup.
sejak awal juni 2016 stasiun ini telah menerapkan sistem check-in dan boarding pass seperti yang berlaku di bandara.
layanan kereta api
gajayana, tujuan malang
bima, tujuan surabaya bersambung malang
taksaka pagi, tujuan jakarta dan yogyakarta
lodaya, tujuan solo (jadwal malam) dan tujuan bandung (jadwal pagi) (eksekutif-bisnis)
malabar, tujuan malang
sawunggalih, tujuan kutoarjo dan tujuan jakarta (eksekutif-bisnis)
mutiara selatan, tujuan bandung dan tujuan surabaya bersambung malang
senja utama yogya, tujuan jakarta
sawunggalih, tujuan kutoarjo dan tujuan jakarta
kelas ekonomi ac plus
jaka tingkir, tujuan solo
bogowonto, tujuan yogyakarta dan tujuan jakarta
gajah wong, tujuan yogyakarta dan tujuan jakarta
krakatau, tujuan jakarta bersambung merak
joglokerto, tujuan solo dan tujuan purwokerto
kelas ekonomi ac
pasundan, tujuan surabaya
bengawan, tujuan solo
progo, tujuan yogyakarta
logawa, tujuan surabaya bersambung jember dan tujuan purwokerto
kutojaya utara, tujuan kutoarjo dan tujuan jakarta
kutojaya selatan, tujuan kutoarjo dan tujuan bandung
persilangan atau persusulan
ka sawunggalih malam tujuan kutoarjo (ka 142) bersilang dengan ka malabar tujuan bandung (ka 99) yang melintas langsung
ka mutiara selatan tujuan bandung (ka 131a) bersilang dengan ka argo lawu tujuan solo (ka 8) yang melintas langsung
ka kutojaya utara tujuan kutoarjo (ka 192) bersilang dengan ka argo wilis tujuan bandung (ka 5) yang melintas langsung
ka krakatau tujuan jakarta bersambung merak (ka 165/168) bersilang dengan ka argo wilis tujuan surabaya (ka 6) yang melintas langsung
ka malabar tujuan malang (ka 100l) bersilang dengan ka turangga tujuan bandung (ka 49) yang melintas langsung
ka bima tujuan surabaya bersambung malang (ka 44/45) bersilang dengan sesamanya tujuan jakarta (ka 46/43) yang melintas langsung
jadwal kereta api
berikut ini adalah jadwal kereta api di stasiun kebumen per 22 oktober 2016 (revisi gapeka 2015).
surabaya gubeng (sgu) bersambung malang (ml)
malang kotabaru (ml)
solo balapan (slo)
bandung hall (bd)
yogyakarta lempuyangan (lpn)
ekonomi ac plus
surabaya gubeng (sgu) bersambung jember (jr)
jakarta pasar senen (pse)
ekonomi ac plus
jakarta gambir (gmr)
bandung hall (bd)
bandung kiaracondong (kac)
jakarta pasar senen (pse)
ekonomi ac plus
solo balapan (slo)
surabaya gubeng (sgu)
yogyakarta lempuyangan (lpn)
ekonomi ac plus
jakarta pasar senen (pse) bersambung merak (mer)
yogyakarta tugu (yk)
jakarta pasar senen (pse)
solo purwosari (pws)
ekonomi ac plus
senja utama yogya
jakarta pasar senen (pse)
ekonomi ac plus
eksekutif, bisnis, &
surabaya gubeng (sgu) bersambung malang (ml)
berkas:km 03.jpg|stasiun kebumenberkas:reynan-stasiun-kebumen-pagar-batas-2014-07-31-490 result.jpg|bagian dalam stasiun kebumen dan pagar beton pembatas stasiun yang telah terpasang (2014)berkas:reynan-stasiun-kebumen-fasilitas-ruang-laktasi.jpg|fasilitas stasiun kebumen: ruang laktasiberkas:reynan-stasiun-kebumen-fasilitas-posko-kesehatan.jpg|fasilias stasiun kebumen: posko kesehatan puskesmas kebumenberkas:reynan-stasiun-kebumen-fasilitas-pramuantar.jpg|fasilitas stasiun kebumen: para pramuantar (portir)berkas:reynan-stasiun-kebumen-ruko-timur.jpg|ruko sisi timur stasiun kebumenberkas:reynan-stasiun-kebumen-sisi-timur.jpg|perbukitan seribu yang terlihat dari sisi timur stasiun kebumen.