waropen merupakan pemekaran dari kabupaten yapen waropen pada tahun 2003, dengan pusat pemerintahan sebelumnya di serui, pulau yapen.
dengan kondisi yang serba terbatas, tugas pemerintah kabupaten waropen pada masa depan sangat menantang.
apalagi alat-alat komunikasi, seperti telepon, jarang ditemui di kabupaten ini di samping sulitnya transportasi.
tak heran, berbagai dinas dan instansi pemerintah di waropen sulit dihubungi.
berdasarkan letak astronomis, kabupaten waropen terletak pada posisi 1350 93 00  1370 42 00bt dan 30 35 00  20 12 00 ls.
kabupaten waropen di provinsi papua dibentuk sebagai hasil pemekaran dari kabupaten yapen waropen pada sekitar tahun 2003.
ibukota kabupaten ini terletak di kota botawa .
dalam sebutan "waropen" terdapat hubungan yang erat dengan kata "oropong" yang mula-mula dipakai oleh jacob weyland (tahun 1705), sedangkan kata "waropen" menurut penduduk asli waropen artinya "orang yang berasal dari pedalaman" yaitu dari gunung tonater, wamusopedai.
dengan demikian mungkin dapat dibenarkan, karena apabila dihubungkan dengan mite-mite yang hidup dimasyarakat hukum adat waropen bawha orang waropen adalah orang yang bermigran ke pantai akibat adanya air ampuhan, di mana orang-orang waropen terhanyut sampai ke waropen ambumi dan roon di kabupaten nabire dan manokwari di sebelah barat, dan waropen ronari di sebelah timur, sedangkan yang tersisalah yang tinggal di pesisir waropen kai. orang waropen secara resmi dalam administrasi pemerintahan mendiami daerah kecamatan waropen atas, kecamatan masirei dan kecamatan waropen bawah.
dikaji dari perspektif sejarah social budaya, held (tahun 1974) telah membagi wilayah waropen atas ada 3 (tiga) wilayah hukum adat yang tercermin dalam perbedaan penggunaan bahasa sehari-hari.
wilayah tersebut adalah wilayah waropen ambumi, wilayah waropen kai dan wilayah waropen ronari.
masyarakat hukum adat waropen ambumi yang terbagi dalam 2 (dua) kelompok yaitu kelompok yang masuk ke wilayahkabupaten nabire yang mendiami kampong-kampung napan, wenami,masipawa, makimi, moor, mambor dan ambumi.
serta kelompok yang masuk wilayah kabupaten manukwari dan mendiami kampung-kampung yendeman, saybes,war, kayob dan menarbu.
masyarakat hukum adat waropen kai, yaitu masyarakat yang mendiami kampung-kampung semanui, wapoga, desawa, waren, sedangkan kampung-kampung paradoi, sanggei, mambui dan nubuai yang kini tergabung dalam satu pemukiman yang disebut urei faisei, risei sayati , wonti, bokaro, dan koweda.
waropen inilah yang dikatakan sebagai orang waropen asli.
masyarakat hukum adat waropen kai, yaitu masyarakat yang mendiami kampong-kampung barapasi, sosora, sorabi, kerema, tamakuri, teba, janke dan baitanisa, yaitu yang mendiami daerah pedalaman waropen sebelah timur sampai pegunungan van ress.
kampung-kampung didaerah pesisir waropen umumnya dibangun diatas sungai pada hutan bakau dan ada pula yang dibangun di lidah pasir dan muara-muara sungai.
ada pula beberapa kampung yang sudah dibangun atau didaratkan pada tanah kering.
kampung-kampung yang didaratkan kebanyakan terdapat di daerah waropen atas.
usaha pendaratan kampung tersebut sudah dimulai sejak tahun 1969, realisasi dari usaha tersebut terwujud pada tahun 1970 oleh bupati yapen waropen secara resmi mengesahkan pendaratan beberapapemukiman menjadi 1 (satu), yaitu kampung urei faisey yang merupakan kampung besar yang terdiri dari 50  75 rumah dan umnya merupakan pemukiman yang sudah menetap.
keadaan penduduk di kabupaten waropen pada setiap distrik persebarannya tidak merata.
pada kampung-kampung di wilayah terpencil dan pedalaman jumlah penduduk pada setiap kampung antara 150 sampai 250 jiwa dengan jarak antar kampung sangat jauh.
keadaan penduduk pada setiap distrik sebagaimana tabel berikut: gambaran umum - kab waropen - diunggah 2 desember 2015
jika ditinjau dari keadaan penduduk berdasarkan golongan umur maka penduduk usia 0  39 tahun merupakan merupakan jumlah terbanyak yaitu 20.216 jiwa atau 69,63% sedangkan jumlah penduduk usia 40  75 tahun keatas hanya 8.816 jiwa atau 30,37%.
suku-suku terasing yang biasa hidup berpindah-pindah masih banyak dijumpai jauh di dalam hutan.
suku-suku yang populasinya relatif besar antara lain suku baudi di kecamatan waropen atas serta suku demisa dan suku wairate di kecamatan waropen bawah.
sampai tahun 2002, berbagai komoditas dari hutan memacu sektor pertanian menjadi tulang punggung ekonomi.
kayu bulat hingga hasil hutan bukan kayu, seperti damar, rotan, kulit mahoni, gaharu dan nipah menjadi komponen utama dalam sumbangan pertanian, yaitu 56,79 persen terhadap kegiatan ekonomi.
apabila perhitungan kegiatan ekonomi waropen tahun 2003 telah selesai, diharapkan persentase yang dihasilkan akan berubah, mengingat sektor kehutanan mengalami perubahan kondisi.
karena keterbatasan prasarana jalan raya, sampai saat ini masih digunakan transportasi air untuk mencapai kecamatan waropen atas ataupun masirei.
melewati selat saireri terlebih dahulu kemudian masuk melalui sungai membramo untuk sampai ke kecamatan waropen atas, ataupun melalui sungai-sungai kecil menuju kecamatan masirei.
sulitnya transportasi inilah yang juga menghambat perdagangan hasil bumi penduduk transmigran.
keluarga-keluarga yang bermukim di dekat botawa, kecamatan waropen bawah, harus membawa hasil panen ke pelabuhan di kecamatan yang sama, lalu menumpang kapal bermesin 60-80 pk selama tiga jam untuk sampai ke pulau yapen.
barang-barang dagangan dipasarkan di serui.
kebutuhan pokok, seperti beras yang didatangkan dari pulau jawa dan sulawesi harus melewati serui, baru dikapalkan lagi melintasi selat saireri ke daratan waropen.
tak heran, harga berbagai komoditas di kabupaten ini lebih mahal dibanding di serui.
bila harga beras jenis bagus di ibu kota kabupaten yapen waropen rp 4.000-rp 6.000 per kilogram, di waropen harganya rp 6.000 hingga rp 8.000 untuk jenis yang sama.
beras memang harus didatangkan dari luar papua.
maklum, padi tak banyak dibudidayakan penduduk.
tanaman yang tak banyak memerlukan air justru lebih populer, mengingat ketiadaan pengairan intensif.
ubi kayu, ubi jalar dan tanaman palawija lebih diminati di daerah pinggir selat seruri ini.
kacang merah merupakan salah satu komoditas terbesar yang dihasilkan petani.
produksi kacang merah lebih banyak untuk konsumsi sehari-hari penduduk lokal.
lahan persawahan teknis tidak ada.
padahal, dari segi pengairan, peluang pengembangan persawahan cukup besar.
kehadiran sungai membramo dan sungai wapoga bisa menjadi sumber irigasi.
padi ladang yang ditanam penduduk hanya 21 hektare dengan produksi 53 ton pada tahun 2003.
memang, padi bukan satu-satunya sumber karbohidrat bagi penduduk, masih ada sagu, ubi kayu dan ubi jalar.
apabila dilihat dari luas wilayah serta jenis tanah, waropen berpotensi mengembangkan tanaman perkebunan.
menurut catatan pemerintah kabupaten induk, masih ada lahan potensial 196.000 hektare.
namun, areal yang diusahakan untuk menanam komoditas, seperti kelapa, kakao, kopi, kelapa sawit, lada dan vanili sebesar 1.317 hektare.
angka itu kurang dari satu persen lahan potensial.
tanaman perkebunan yang saat ini banyak dibudidayakan penduduk adalah kakao.
areal penanamannya mencapai 800 hektare dengan produksi 200 ton per tahun.
pemeliharaan kakao ini diusahakan oleh sekitar 1.400 petani.
daerah pemasaran telah berkembang, tidak hanya wilayah waropen dan kabupaten yapen waropen, tetapi telah mencapai surabaya dan makassar di sulawesi selatan.
komoditas lain yang juga diminati penduduk adalah kelapa.
terdapat lebih dari 2.000 keluarga yang memiliki kebun kelapa.
sayangnya produksi kelapa belum mengalahkan produksi kakao.
perdagangannya pun hanya di waropen dan pulau yapen.
alternatif menanam kopi, lada dan cengkeh telah dicoba penduduk untuk meningkatkan pendapatan rumah tangga, namun produksinya masih di bawah satu ton setahun.
tanaman vanili pun mulai dilirik petani untuk dikembangkan.
pada tahun 2003 ditanam 10 hektare vanili oleh 99 keluarga.
peluang menggarap sektor perikanan di laut di depan mata.
tak kurang dari 2.000 rumah tangga nelayan tersebar di tiga kecamatan yang menggantungkan sumber nafkah di laut.
sampai saat ini, alat tangkap mereka masih sederhana dan hasilnya umumnya hanya untuk konsumsi rumah tangga atau pasar lokal.
suatu saat nanti, bila alat tangkap dan perahu nelayan dapat dimutakhirkan, bukan tak mungkin nelayan memperoleh hasil lebih banyak.
kabupaten waropen terbagi atas 10 distrik.
kabupaten ghondumi sisare
kecamatan yang mungkin bergabung ke dalam kabupaten ini meliputi:
rencananya ibukota kabupaten ini berada di masirei
kabupaten lembah roufaer
kabupaten ini akan dimekarkan dari kabupaten mamberamo raya, kabupaten waropen dan kabupaten puncak jaya. distrik yang mungkin bergabung ke dalam kabupaten ini meliputi:
dari kabupaten mamberamo raya
mamberamo tengah timur
dari kabupaten waropen
dari kabupaten puncak jaya