biologi mempelajari berbagai jenis organisme.
searah jarum jam dari kiri atas: e. coli, tumbuhan paku, gazel, kumbang goliath
biologi adalah kajian tentang kehidupan, dan organisme hidup, termasuk struktur, fungsi, pertumbuhan, evolusi, persebaran, dan taksonominya.berdasarkan definisi dari aquarena wetlands project glossary of terms.
ilmu biologi modern sangat luas, dan eklektik, serta terdiri dari berbagai macam cabang, dan subdisiplin.
namun, meskipun lingkupnya luas, terdapat beberapa konsep umum yang mengatur semua penelitian, sehingga menyatukannya dalam satu bidang.
biologi umumnya mengakui sel sebagai satuan dasar kehidupan, gen sebagai satuan dasar pewarisan, dan evolusi sebagai mekanisme yang mendorong terciptanya spesies baru.
selain itu, organisme diyakini bertahan dengan mengonsumsi, dan mengubah energi serta dengan meregulasi keadaan dalamnya agar tetap stabil, dan vital.
subdisiplin biologi didefinisikan berdasarkan skala organisme yang dipelajari, jenis organisme yang dipelajari, dan metode yang digunakan untuk mempelajarinya antara lain: life science, weber state museum of natural science
biokimia mempelajari kimia kehidupan.
biologi molekuler terkait dengan interaksi antar molekul biologis.
botani mempelajari biologi tumbuhan
biologi seluler meneliti satuan dasar semua kehidupan, yaitu sel
fisiologi mempelajari fungsi fisik, dan kimia jaringan organ, dan sistem organ suatu organisme
biologi evolusioner meneliti proses yang menghasilkan keanekaragaman hayati; dan ekologi mempelajari interaksi antara organisme dengan lingkungannya.
ilmuwan islam abad pertengahan yang mempelajari biologi meliputi al-jahiz (781869), ad-dinawari (828896), yang menulis tentang botani,, in dan ar-razi (865925), yang menulis tentang anatomi, dan fisiologi.
kedokteran dipelajari berdasarkan tradisi filsuf yunani, sementara ilmu alam sangat dipengaruhi oleh pemikiran aristoteles, terutama perihal hierarki kehidupan.
biologi mulai berkembang pesat setelah antony van leeuwenhoek memperbaiki mikroskopnya.
berkatnya, spermatozoa, bakteri, infusoria, dan berbagai macam kehidupan mikroskopik lain berhasil ditemukan.
penyelidikan yang dilakukan oleh jan swammerdam membangkitkan ketertarikan terhadap bidang entomologi, dan membantu mengembangkan teknik pembedahan, dan pewarnaan (staining) mikroskopik.magner, a history of the life sciences, pp 133144
kemajuan mikroskop juga sangat memengaruhi pemikiran tentang biologi.
pada awal abad ke-19, sejumlah ahli biologi mulai menyadari pentingnya konsep sel.
kemudian, pada tahun 1838, schleiden, dan schwann mulai menganjurkan gagasan (yang kini diterima secara luas) bahwa (1) satuan dasar organisme adalah sel, dan (2) masing-masing sel memiliki karakteristik kehidupan, walaupun mereka menentang gagasan bahwa (3) semua sel berasal dari pembagian sel lain.
akan tetapi, berkat karya robert remak, dan rudolf virchow, pada tahun 1860-an sebagian besar ahli biologi menerima ketiga hal tersebut yang kini disebut teori sel.sapp, genesis, chapter 7; coleman, biology in the nineteenth century, bab 2
sementara itu, taksonomi, dan klasifikasi menjadi pusat perhatian sejarawan alam.
carl linnaeus menerbitkan taksonomi dasar pada tahun 1735 (berbagai macam variasi telah digunakan semenjak itu), dan pada tahun 1750-an memperkenalkan nama ilmiah untuk spesies.mayr, the growth of biological thought, chapter 4 georges-louis leclerc, comte de buffon, menganggap spesies sebagai kategori buatan, dan menyatakan bahwa kehidupan dapat berubahbahkan mengusulkan kemungkinan adanya nenek moyang bersama.
walaupun menentang teori evolusi, buffon merupakan tokoh penting dalam sejarah pemikiran evolusi; karyanya memengaruhi teori evolusi lamarck, dan darwin.mayr, the growth of biological thought, bab 7
pada tahun 1940-an, dan awal tahun 1950-an, penelitian berhasil membuktikan bahwa asam deoksiribonukleat (adn) merupakan komponen kromosom yang mengandung satuan pewarisan yang kini disebut gen.
pemusatan perhatian pada model organisme baru seperti virus, dan bakteri serta penemuan struktur untai ganda adn pada tahun 1953 menandai jalannya peralihan ke masa genetika molekuler.
kode genetik berhasil dipecahkan oleh har gobind khorana, robert w. holley, dan marshall warren nirenberg setelah memahami bahwa adn mengandung kodon.
akhirnya, proyek genom manusia diluncurkan pada tahun 1990 dengan tujuan untuk memetakan semua genom manusia dna. proyek ini selesai pada tahun 2003, dan merupakan langkah pertama dalam menggabungkan pengetahuan biologi dengan definisi tubuh manusia, dan organisme lain secara fungsional, dan molekuler.
dasar biologi modern
walaupun diperkenalkan dalam kamus ilmiah oleh jean-baptiste de lamarck pada tahun 1809, evolusi baru dikukuhkan sebagai teori ilmiah lima puluh tahun kemudian oleh charles darwin dengan menjelaskan mekanisme pendorongnya: seleksi alam the complete works of darwin online  biography. darwin-online.org.uk. retrieved on 2006-12-15as darwinian scholar joseph carroll of the university of missourist.
louis puts it in his introduction to a modern reprint of darwin's work: "the origin of species has special claims on our attention.
it is one of the two or three most significant works of all timeone of those works that fundamentally and permanently alter our vision of the world ... it is argued with a singularly rigorous consistency but it is also eloquent, imaginatively evocative, and rhetorically compelling." (alfred russel wallace juga diakui sebagai salah satu penemu evolusi karena ia membantu penelitian, dan percobaan yang terkait dengan konsep ini).shermer hal. 149. darwin menjelaskan bahwa spesies, dan ras berkembang melalui proses seleksi alam, dan seleksi buatan atau pengembangbiakan selektif.darwin, charles (1859).
on the origin of species, 1st, john murray hanyutan genetik dianggap sebagai mekanisme tambahan dalam sintesis modern teori evolusi.
evolusi kini digunakan untuk menjelaskan keanekaragaman kehidupan di bumi.
sejarah evolusioner spesies, dan hubungan genealogisnya dengan spesies lain disebut filogeni.
informasi tentang filogeni dihasilkan dari berbagai macam pendekatan, seperti perbandingan rangkaian adn yang dilakukan dalam bidang biologi molekuler atau genomika, dan perbandingan fosil dalam bidang paleontologi.
phylogeny on bio-medicine.org untuk memperkirakan jangka waktu terjadinya evolusi, ilmuwan juga menggunakan berbagai metode, seperti penanggalan radiokarbon.
ahli biologi menganalisis hubungan evolusioner dengan metode filogenetika, fenetika, dan kladistika.
adn biasanya berbentuk kromosom linear dalam eukariota, dan kromosom lingkaran dalam prokariota.
kromosom adalah struktur yang terdiri dari adn, dan histon.
rangkaian kromosom dalam sel, dan satuan pewarisan lain yang dapat ditemui dalam mitokondria, kloroplas, dan tempat lain secara kolektif disebut genom.
dalam eukariota, adn genomik terletak di nukleus sel, bersama dengan sejumlah mitokondria, dan kloroplas.
dalam prokariota, adn ada di dalam sitoplasma yang disebut nukleoid.
informasi genetik dalam sebuah genom disimpan dalam gen, dan himpunan informasi tersebut dalam suatu organisme disebut genotip.
genotype definition  medical dictionary definitions
untuk menjaga keseimbangan dinamika, dan melakukan fungsi tertentu secara efektif, suatu sistem harus melacak, dan menanggapi gangguan.
setelah melacak gangguan, sistem biologis biasanya menanggapi melalui proses umpan balik negatif.
artinya, sistem tersebut menstabilkan keadaan dengan mengurangi atau meningkatkan aktivitas suatu organ atau sistem.
contohnya adalah pelepasan glukagon ketika kadar gula dalam tubuh terlalu rendah.
organisme yang berperan dalam menghantarkan energi ke suatu ekosistem disebut autotrof.
hampir semua organisme autotrof memperoleh energi dari matahari.
tumbuhan, dan fototrof lainnya menggunakan energi matahari melalui proses fotosintesis yang mengubah bahan baku menjadi molekul organik, seperti atp, yang dapat dipecahkan ikatannya untuk menghasilkan energi.
namun, beberapa ekosistem hanya bergantung pada kemotrof yang mendapatkan energi dari metana, sulfida, atau sumber energi non-matahari lainnya.katrina edwards.
microbiology of a sediment pond and the underlying young, cold,
hydrologically active ridge flank.
woods hole oceanographic institution.
beberapa energi yang diperoleh digunakan untuk menghasilkan biomassa yang dapat mempertahankan kehidupan, dan mendukung pertumbuhan, dan perkembangan.
kebanyakan sisa energi hanya menjadi panas, dan molekul buangan.
proses penting yang mengubah energi yang terperangkap dalam substansi kimia menjadi energi yang berguna untuk kehidupan disebut metabolisme, dan respirasi sel.bartsch/colvard, the living environment.
(2009) new york state prentice hall regents review.
diakses 16 oktober 2009.
biologi molekuler mempelajari biologi dalam tingkatan molekul.
molecular biology  definisi dari biology-online.org bidang ini bersentuhan dengan bidang biologi lainnya, terutama genetika, dan biokimia.
biologi molekuler mencoba memahami interaksi antara berbagai sistem sel, termasuk hubungan antar adn, arn, dan sintesis protein.
selain itu, bidang ini juga membelajari bagaimana interaksi tersebut diatur.
biologi sel adalah ilmu yang terkait dengan properti struktural, dan fisiologis sel, termasuk perilaku, interaksi, dan lingkungan.
hal ini dilakukan dalam tingkatan mikroskopik, dan molekuler untuk mempelajari organisme bersel satu seperti bakteri serta sel dalam organisme multiseluler seperti manusia.
pemahaman akan fungsi, dan struktur sel berperan penting dalam ilmu biologi.
kemiripan, dan pebedaan antara berbagai jenis sel juga sangat terkait dengan bidang biologi molekuler.
anatomi mempelajari struktur makroskopik seperti organ, dan sistem organ, "anatomy of the human body".
henry gray. sementara genetika merupakan ilmu gen, pewarisan, dan variasi dalam organisme.hartl d, jones e (2005)
gen menyandikan informasi yang penting untuk mensintesiskan protein, yang kemudian membentuk fenotip organisme.
dalam penelitian modern, genetika juga menyelidiki fungsi gen tertentu, dan menganalisis interaksi genetik.
di dalam tubuh organisme, informasi genetik biasanya ada di dalam kromosom, di dalam struktur kimia molekul adn tertentu.
biologi perkembangan mempelajari proses pertumbuhan, dan perkembangan organisme.
bidang ini berasal dari embriologi, dan menyelidiki kuasa genetik atas pertumbuhan sel, diferensiasi sel, dan morfogenesis, yang merupakan proses yang menghasilkan jaringan, organ, dan anatomi.
organisme yang biasanya menjadi model dalam bidang ini meliputi cacing caenorhabditis elegans, lalat buah drosophila melanogaster, ikan zebra danio rerio, tikus mus musculus,, dan tumbuhan arabidopsis thaliana.
organisme-organisme tersebut dipelajari untuk memahami fenomena biologi tertentu, dengan harapan penemuan pada organisme tersebut dapat menambah pengetahuan tentang cara kerja organisme lain.
fisiologi menyelidiki proses mekanik, fisik, dan biokimia organisme hidup dengan mencoba memahami bagaimana semua struktur bekerja secara keseluruhan.
gagasan dari struktur ke fungsi merupakan gagasan yang penting dalam bidang biologi.
penelitian fisiologis secara tradisional terbagi menjadi fisiologi tumbuhan, dan hewan, namun beberapa prinsip fisiologi berlaku untuk semua organisme.
misalnya, fisiologi sel ragi mungkin juga berlaku untuk sel manusia.
bidang fisiologi hewan menggunakan alat, dan metode dalam fisiologi manusia untuk spesies non-manusia.
fisiologi tumbuhan meminjam teknik dari kedua bidang tersebut.
fisiologi juga mempelajari bagaimana sistem saraf, kekebalan, endokrin, pernapasan, dan peredaran darah bekerja, dan berinteraksi.
penelitian sistem tersebut juga dilakukan oleh bidang yang berorientasi pada kedokteran seperti neurologi, dan imunologi.
penelitian evolusioner terkait dengan asal usul dan nenek moyang spesies, dan juga perubahannya seiring berjalannya waktu.
bidang ini juga meliputi ilmuwan dari berbagai bidang yang terkait dengan taksonomi.
contohnya adalah ilmuwan yang berspesialisasi dalam organisme tertentu seperti mamalogi, ornitologi, botani dan herpetologi.
organisme-organisme tersebut digunakan untuk menjawab pertanyaan-pertanyaan evolusi yang umum.
biologi evolusioner sebagian didasarkan dari paleontologi (yang menggunakan catatan fosil untuk menjawab pertanyaan tentang cara dan tempo evolusi), dan sebagian lagi dari genetika populasijohn h. gillespie population genetics: a concise guide, johns hopkins press, 1998.
isbn 0-8018-5755-4. , dan teori evolusioner.
pada tahun 1980-an, biologi perkembangan memasuki kembali bidang biologi evolusioner setelah sebelumnya dikeluarkan dari sintesis modern akibat penelitian biologi perkembangan evolusioner.vassiliki betta smocovitis unifiying biology: the evolutionary synthesis and evolutionary biology isbn 0-691-03343-9.
bidang lain yang terkait, dan sering dianggap sebagai bagian dari biologi evolusioner adalah filogenetika, sistematika dan taksonomi.
secara tradisional, kehidupan dibagi menjadi lima kingdom: monera; protista; fungi; plantae; animalia.
namun, banyak ilmuwan yang menganggap sistem lima kingdom ini sudah ketinggalan zaman.
sistem klasifikasi modern biasanya dimulai dengan sistem tiga domain: archaea (awalnya archaebacteria); bacteria (awalnya eubacteria), dan eukaryota (termasuk protista, fungi, tumbuhan, dan hewan) domain tersebut didasarkan pada keberadaan nuklei pada sel, dan perbedaan komposisi kimia bagian luar sel.
selain itu, setiap kingdom dibagi hingga pada tingkatan spesies.
domain; kingdom; filum; kelas; ordo; famili; genus; spesies.
di luar kategori ini terdapat sejumlah parasit intraseluler yang ada di tepi kehidupan", yang berarti banyak ilmuwan yang tidak mengklasifikasikan struktur tersebut sebagai kehidupan karena ketiadaan satu atau lebih fungsi atau ciri kehidupan (contohnya ketiadaan aktivitas metabolisme).
struktur tersebut diklasifikasikan sebagai virus, viroid, prion, atau satelit.
nama ilmiah organisme berasal dari genus, dan spesiesnya.
misalnya, nama ilmiah spesies manusia adalah homo sapiens.
homo adalah genusnya, dan sapiens adalah spesiesnya.
ketika menulis nama ilmiah suatu organisme, huruf pertama harus ditulis dengan menggunakan huruf besar, dan selebihnya dalam huruf kecil.
selain itu, nama ilmiah dapat dimiringkan atau digarisbawahi.
sistem klasifikasi yang banyak digunakan saat ini adalah taksonomi linnaeus.
sistem ini meliputi tingkatan, dan tatanama binomial.
cara penamaan organisme diatur oleh persetujuan internasional seperti international code of botanical nomenclature (icbn), international code of zoological nomenclature (iczn), dan international code of nomenclature of bacteria (icnb).
klasifikasi virus, viroid, prion, dan agen sub-viral ditentukan oleh international committee on taxonomy of viruses (ictv), dan sistemnya disebut international code of viral classification and nomenclature (icvcn).
ictv virus taxonomy 2009 "80.001 popsiviroidae  ictvdb index of viruses."
national institutes of health website.
retrieved on 2009-10-28.
prions  ictvdb index of viruses."
national institutes of health website.
retrieved on 2009-10-28.
satellites  ictvdb index of viruses."
national institutes of health website.
retrieved on 2009-10-28.
sebuah usulan yang disebut biocode diterbitkan pada tahun 1997 dengan maksud untuk menstandardisasi tata nama di tiga bidang tersebut, namun usulan ini masih belum diterapkan.
biocode tidak banyak diperhatikan semenjak tahun 1997; rencana penerapannya pada tahun 1 januari 2000 tidak banyak disadari.
revisi biocode yang tidak mengganti kode yang ada, dan hanya menyediakan konteks pemersatu diusulkan pada tahun 2011.
greuter, w.; garrity, g.; hawksworth, d.l.; jahn, r.; kirk, p.m.; knapp, s.; mcneill, j.; michel, e.; patterson, d.j.; pyle, r.; tindall, b.j. (2011).
draft biocode (2011): principles and rules regulating the naming of organisms.
and hawksworth, d.l. (2011).
introducing the draft biocode (2011).
namun, international botanical congress pada tahun 2011 menolak mempertimbangkan usulan biocode.
icvcn berada di luar ranah biocode karena biocode tidak meliputi klasifikasi virus.
animalia - bos primigenius taurusplanta - triticumfungi - morchella esculentastramenopila/chromista - fucus serratusbacteria - gemmatimonas aurantiaca (- = 1 micrometer)archaea - halobacteriavirus - gamma phage
ekologi dan lingkungan
ekologi mempelajari persebaran, dan berlimpahnya kehidupan, serta interaksi antara organisme dengan lingkungannya.
habitat suatu organisme dapat dideskripsikan sebagai faktor abiotik lokal seperti iklim, di samping keberadaan organisme, dan faktor biotik lainnya.
sistem biologis cukup sulit dipelajari karena ada sangat banyak interaksi yang mungkin terjadi antara organisme dengan lingkungan, bahkan dalam skala kecil.
bakteri di dalam gradien gula memberikan tanggapan terhadap lingkungan sama seperti seekor singa yang sedang mencari makanan di sabana afrika.
spesies apapun juga dapat menunjukkan berbagai macam perilaku, seperti kerjasama, agresi, parasitisme, atau mutualisme.
masalah menjadi semakin rumit ketika dua atau lebih spesies berinteraksi dalam suatu ekosistem.
sistem ekologi dipelajari dalam beberapa tingkatan yang berbeda, dari individu hingga populasi, ekosistem, dan biosfer.
istilah biologi populasi sering digunakan bergantian dengan ekologi populasi, meskipun istilah biologi populasi lebih sering digunakan ketika mempelajari penyakit, virus, dan mikroba, sementara ekologi populasi lebih sering dipakai ketika mempelajari tumbuhan, dan hewan.
ekologi juga mengacu pada berbagai subdisiplin yang ada.
etologi menyelidiki perilaku hewan (terutama hewan sosial seperti primata, dan canid), dan kadang-kadang dianggap sebagai cabang zoologi.
etolog juga mempelajari evolusi perilaku, dan mencoba memahami perilaku dalam konteks seleksi alam.
salah satu etolog modern pertama adalah charles darwin, karena bukunya yang berjudul the expression of the emotions in man and animals memengaruhi etolog-etolog penerusnya.
biogeografi terkait dengan persebaran organisme di bumi,wiley, 1981, dan memusatkan perhatian pada topik seperti tektonika lempeng, perubahan iklim, persebaran, migrasi, dan kladistika.
animalia - bos primigenius taurusplanta - triticumfungi - morchella esculentastramenopila/chromista - fucus serratusbacteria - gemmatimonas aurantiaca (- = 1 mikrometer)archaea - halobacteriavirus - gamma phage
plos biology jurnal terbuka yang diterbitkan oleh public library of science
current biology jurnal yang menerbitkan riset asli dari berbagai bidang biologi
biology letters jurnal royal society yang menerbitkan tulisan-tulisan tentang biologi
science magazine publikasi sains aaas yang terkenal  lihat bagian ilmu kehidupan
international journal of biological sciences jurnal biologi yang menerbitkan beberapa karya ilmiah
perspectives in biology and medicine jurnal interdisipliner yang menerbitkan esai-esai
life science log