species_800 · Datasets at Hugging Face

id stringlengths 1 4	tokens sequence	ner_tags sequence
100	[ "is", "proposed", "." ]	[ 0, 0, 0 ]
101	[ "The", "type", "strain", "is", "OU", "-", "40", "(", "T", ")", "(", "=", "CCTCC", "AA", "209024", "(", "T", ")", "=", "PCM", "2692", "(", "T", ")", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
102	[ "Gordonia", "humi", "sp", ".", "nov", ".", ",", "isolated", "from", "soil", "." ]	[ 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0 ]
103	[ "A", "Gram", "-", "stain", "-", "positive", ",", "non", "-", "endospore", "-", "forming", "actinobacterium", "(", "CC", "-", "12301", "(", "T", ")", ")", "was", "isolated", "from", "soil", "attached", "to", "a", "spawn", "used", "in", "the", "laboratory", "to", "grow", "the", "edible", "mushroom", "Agaricus", "brasiliensis", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0 ]
104	[ "Based", "on", "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "similarities", ",", "strain", "CC", "-", "12301", "(", "T", ")", "was", "shown", "to", "belong", "to", "the", "genus", "Gordonia", "and", "was", "most", "closely", "related", "to", "the", "type", "strains", "of", "Gordonia", "hydrophobica", "(", "97", ".", "6", "%", "similarity", ")", ",", "Gordonia", "terrae", "(", "97", ".", "5", "%", ")", ",", "Gordonia", "amarae", "(", "97", ".", "5", "%", ")", "and", "Gordonia", "malaquae", "(", "97", ".", "4", "%", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
105	[ "The", "quinone", "system", "was", "determined", "to", "consist", "predominantly", "of", "menaquinone", "MK", "-", "9", "(", "H", "(", "2", ")", ")", ",", "minor", "amounts", "of", "MK", "-", "8", "(", "H", "(", "2", ")", ")", "and", "MK", "-", "7", "(", "H", "(", "2", ")", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
106	[ "The", "polar", "lipid", "profile", "consisted", "of", "the", "major", "compounds", "diphosphatidylglycerol", "and", "phosphatidylethanolamine", ",", "moderate", "amounts", "of", "two", "phosphatidylinositol", "mannosides", "and", "phosphatidylinositol", "and", "minor", "amounts", "of", "phosphatidylglycerol", ",", "three", "unidentified", "glycolipids", ",", "two", "phosphoglycolipids", "and", "a", "phospholipid", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
107	[ "Mycolic", "acids", "were", "present", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0 ]
108	[ "These", "chemotaxonomic", "traits", "and", "the", "major", "fatty", "acids", ",", "which", "were", "C", "(", "16", ":", "1", ")", "cis9", ",", "C", "(", "16", ":", "0", ")", ",", "C", "(", "18", ":", "1", ")", "and", "tuberculostearic", "acid", "(", "10", "-", "methyl", "C", "(", "18", ":", "0", ")", ")", ",", "supported", "the", "affiliation", "of", "strain", "CC", "-", "12301", "(", "T", ")", "to", "the", "genus", "Gordonia", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0 ]
109	[ "The", "results", "of", "physiological", "and", "biochemical", "tests", "allowed", "clear", "phenotypic", "differentiation", "of", "strain", "CC", "-", "12301", "(", "T", ")", "from", "the", "most", "closely", "related", "Gordonia", "species", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
110	[ "Strain", "CC", "-", "12301", "(", "T", ")", "therefore", "represents", "a", "novel", "species", ",", "for", "which", "the", "name", "Gordonia", "humi", "sp", ".", "nov", "." ]	[ 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2 ]
111	[ "is", "proposed", ",", "with", "the", "type", "strain", "CC", "-", "12301", "(", "T", ")", "(", "=", "DSM", "45298", "(", "T", ")", "=", "CCM", "7727", "(", "T", ")", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
112	[ "Methanoregula", "boonei", "gen", ".", "nov", ".", ",", "sp", ".", "nov", ".", ",", "an", "acidiphilic", "methanogen", "isolated", "from", "an", "acidic", "peat", "bog", "." ]	[ 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
113	[ "A", "novel", "acidiphilic", ",", "hydrogenotrophic", "methanogen", ",", "designated", "strain", "6A8", "(", "T", ")", ",", "was", "isolated", "from", "an", "acidic", "(", "pH", "4", ".", "0", "-", "4", ".", "5", ")", "and", "ombrotrophic", "(", "rain", "-", "fed", ")", "bog", "located", "near", "Ithaca", ",", "NY", ",", "USA", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
114	[ "Cultures", "were", "dimorphic", ",", "containing", "thin", "rods", "(", "0", ".", "2", "-", "0", ".", "3", "mum", "in", "diameter", "and", "0", ".", "8", "-", "3", ".", "0", "mum", "long", ")", "and", "irregular", "cocci", "(", "0", ".", "2", "-", "0", ".", "8", "mum", "in", "diameter", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
115	[ "The", "culture", "utilized", "H", "(", "2", ")", "/", "CO", "(", "2", ")", "to", "produce", "methane", "but", "did", "not", "utilize", "formate", ",", "acetate", ",", "methanol", ",", "ethanol", ",", "2", "-", "propanol", ",", "butanol", "or", "trimethylamine", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
116	[ "Optimal", "growth", "conditions", "were", "near", "pH", "5", ".", "1", "and", "35", "^", "0C", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
117	[ "The", "culture", "grew", "in", "basal", "medium", "containing", "as", "little", "as", "0", ".", "43", "mM", "Na", "(", "+", ")", "and", "growth", "was", "inhibited", "completely", "by", "50", "mM", "NaCl", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
118	[ "To", "our", "knowledge", ",", "strain", "6A8", "(", "T", ")", "is", "one", "of", "the", "most", "acidiphilic", "(", "lowest", "pH", "optimum", ")", "and", "salt", "-", "sensitive", "methanogens", "in", "pure", "culture", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
119	[ "Acetate", ",", "coenzyme", "M", ",", "vitamins", "and", "yeast", "extract", "were", "required", "for", "growth", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
120	[ "It", "is", "proposed", "that", "a", "new", "genus", "and", "species", "be", "established", "for", "this", "organism", ",", "Methanoregula", "boonei", "gen", ".", "nov", ".", ",", "sp", ".", "nov", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2 ]
121	[ "The", "type", "strain", "of", "Methanoregula", "boonei", "is", "6A8", "(", "T", ")", "(", "=", "DSM", "21154", "(", "T", ")", "=", "JCM", "14090", "(", "T", ")", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
122	[ "Marinobacterium", "coralli", "sp", ".", "nov", ".", ",", "isolated", "from", "mucus", "of", "coral", "(", "Mussismilia", "hispida", ")", "." ]	[ 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0 ]
123	[ "A", "Gram", "-", "negative", ",", "aerobic", "bacterium", ",", "designated", "R", "-", "40509", "(", "T", ")", ",", "was", "isolated", "from", "mucus", "of", "the", "reef", "builder", "coral", "(", "Mussismilia", "hispida", ")", "located", "in", "the", "Sao", "Sebastiao", "Channel", ",", "Sao", "Paulo", ",", "Brazil", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
124	[ "The", "strain", "was", "oxidase", "-", "positive", "and", "catalase", "-", "negative", ",", "and", "required", "Na", "(", "+", ")", "for", "growth", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
125	[ "Its", "phylogenetic", "position", "was", "in", "the", "genus", "Marinobacterium", "and", "the", "closest", "related", "species", "were", "Marinobacterium", "sediminicola", ",", "Marinobacterium", "maritimum", "and", "Marinobacterium", "stanieri", ";", "the", "isolate", "exhibited", "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "similarities", "of", "97", ".", "5", "-", "98", ".", "0", "%", "with", "the", "type", "strains", "of", "these", "species", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
126	[ "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "similarities", "with", "other", "type", "strains", "of", "the", "genus", "Marinobacterium", "were", "below", "96", "%", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
127	[ "DNA", "-", "DNA", "hybridizations", "between", "strain", "R", "-", "40509", "(", "T", ")", "and", "the", "type", "strains", "of", "the", "phylogenetically", "closest", "species", "of", "the", "genus", "Marinobacterium", "revealed", "less", "than", "70", "%", "DNA", "-", "DNA", "relatedness", ",", "supporting", "the", "novel", "species", "status", "of", "the", "strain", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
128	[ "Phenotypic", "characterization", "revealed", "that", "the", "strain", "was", "able", "to", "grow", "at", "15", "-", "42", "^", "0C", "and", "in", "medium", "containing", "up", "to", "9", "%", "NaCl", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
129	[ "The", "isolate", "could", "be", "differentiated", "from", "phenotypically", "related", "species", "by", "several", "features", ",", "including", "its", "ability", "to", "utilize", "d", "-", "alanine", ",", "l", "-", "alanine", ",", "bromosuccinic", "acid", ",", "Beta", "-", "hydroxybutyric", "acid", "and", "alpha", "-", "ketovaleric", "acid", ",", "but", "not", "acetate", "or", "l", "-", "arabinose", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
130	[ "It", "produced", "acetoin", "(", "Voges", "-", "Proskauer", ")", ",", "but", "did", "not", "have", "esterase", "lipase", "(", "C8", ")", "or", "catalase", "activities", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
131	[ "It", "possessed", "C", "(", "18", ":", "1", ")", "omega7c", "(", "35", "%", ")", ",", "summed", "feature", "3", "(", "iso", "-", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "2", "-", "OH", "and", "/", "or", "C", "(", "16", ":", "1", ")", "omega7c", ";", "25", "%", ")", "and", "C", "(", "16", ":", "0", ")", "(", "22", "%", ")", "as", "major", "cellular", "fatty", "acids", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
132	[ "The", "DNA", "G", "+", "C", "content", "was", "58", ".", "5", "mol", "%", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
133	[ "The", "name", "Marinobacterium", "coralli", "sp", ".", "nov", "." ]	[ 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2 ]
134	[ "is", "proposed", "to", "accommodate", "this", "novel", "isolate", ";", "the", "type", "strain", "is", "R", "-", "40509", "(", "T", ")", "(", "=", "LMG", "25435", "(", "T", ")", "=", "CAIM", "1449", "(", "T", ")", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0 ]
135	[ "Amnibacterium", "kyonggiense", "gen", ".", "nov", ".", ",", "sp", ".", "nov", ".", ",", "a", "new", "member", "of", "the", "family", "Microbacteriaceae", "." ]	[ 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
136	[ "A", "Gram", "-", "positive", ",", "non", "-", "motile", "bacterium", ",", "designated", "KSL51201", "-", "037", "(", "T", ")", ",", "was", "isolated", "from", "Anyang", "stream", ",", "Republic", "of", "Korea", ",", "and", "was", "characterized", "using", "a", "polyphasic", "taxonomic", "approach", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
137	[ "Comparative", "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "analysis", "showed", "that", "strain", "KSL51201", "-", "037", "(", "T", ")", "belonged", "to", "the", "family", "Microbacteriaceae", "of", "the", "class", "Actinobacteria", "and", "exhibited", "96", ".", "9", "%", "gene", "sequence", "similarity", "to", "Labedella", "gwakjiensis", "KSW2", "-", "17", "(", "T", ")", ",", "96", ".", "0", "%", "to", "Leifsonia", "ginsengi", "wged11", "(", "T", ")", "and", "95", ".", "9", "%", "to", "Microterricola", "viridarii", "KV", "-", "677", "(", "T", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0 ]
138	[ "The", "G", "+", "C", "content", "of", "the", "genomic", "DNA", "was", "72", ".", "7", "mol", "%", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
139	[ "Strain", "KSL51201", "-", "037", "(", "T", ")", "had", "l", "-", "2", ",", "4", "-", "diaminobutyric", "acid", "as", "the", "diagnostic", "cell", "-", "wall", "diamino", "acid", ",", "MK", "-", "11", "and", "MK", "-", "12", "as", "the", "major", "menaquinones", ",", "anteiso", "-", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "(", "47", ".", "8", "%", ")", "and", "iso", "-", "C", "(", "16", ":", "0", ")", "(", "24", ".", "0", "%", ")", "as", "the", "major", "fatty", "acids", "and", "phosphatidylglycerol", "and", "three", "unknown", "phospholipids", "as", "the", "major", "polar", "lipids", "." ]	[ 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
140	[ "On", "the", "basis", "of", "phenotypic", "and", "genotypic", "properties", "and", "phylogenetic", "distinctiveness", ",", "it", "is", "suggested", "that", "strain", "KSL51201", "-", "037", "(", "T", ")", "represents", "a", "novel", "species", "of", "a", "new", "genus", "in", "the", "family", "Microbacteriaceae", "for", "which", "the", "name", "Amnibacterium", "kyonggiense", "gen", ".", "nov", ".", ",", "sp", ".", "nov", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2 ]
141	[ "is", "proposed", "." ]	[ 0, 0, 0 ]
142	[ "The", "type", "strain", "of", "the", "type", "species", "is", "KSL51201", "-", "037", "(", "T", ")", "(", "=", "KEMC", "51201", "-", "037", "(", "T", ")", "=", "JCM", "16463", "(", "T", ")", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
143	[ "Miniimonas", "arenae", "gen", ".", "nov", ".", ",", "sp", ".", "nov", ".", ",", "an", "actinobacterium", "isolated", "from", "sea", "sand", "." ]	[ 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
144	[ "A", "Gram", "-", "positive", ",", "non", "-", "motile", ",", "coccoid", "-", "to", "rod", "-", "shaped", ",", "non", "-", "spore", "-", "forming", "bacterium", ",", "designated", "strain", "YM18", "-", "15", "(", "T", ")", ",", "was", "isolated", "from", "sea", "sand", "and", "studied", "using", "a", "polyphasic", "taxonomic", "approach", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
145	[ "Strain", "YM18", "-", "15", "(", "T", ")", "grew", "under", "both", "aerobic", "and", "anaerobic", "conditions", "." ]	[ 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
146	[ "The", "cell", "-", "wall", "peptidoglycan", "type", "was", "A4Beta", "and", "ornithine", "was", "the", "diagnostic", "diamino", "acid", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
147	[ "The", "polar", "lipids", "were", "phosphatidylglycerol", ",", "diphosphatidylglycerol", ",", "phosphatidylinositol", "and", "an", "unknown", "phospholipid", ",", "MK", "-", "8", "(", "H", "(", "4", ")", ")", "was", "the", "major", "menaquinone", "and", "the", "predominant", "fatty", "acids", "were", "anteiso", "-", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "and", "C", "(", "16", ":", "0", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
148	[ "The", "DNA", "G", "+", "C", "content", "was", "74", ".", "2", "mol", "%", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
149	[ "High", "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "similarities", "(", "96", ".", "3", "-", "97", ".", "3", "%", ")", "were", "found", "with", "the", "sequences", "of", "the", "type", "strains", "of", "the", "three", "genera", "of", "the", "family", "Beutenbergiaceae", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
150	[ "Phylogenetic", "analysis", "based", "on", "16S", "rRNA", "gene", "sequences", "showed", "that", "strain", "YM18", "-", "15", "(", "T", ")", "formed", "a", "clade", "with", "Serinibacter", "salmoneus", ",", "Salana", "multivorans", "and", "Beutenbergia", "cavernae", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0 ]
151	[ "Strain", "YM18", "-", "15", "(", "T", ")", "differed", "from", "these", "three", "type", "strains", "in", "chemotaxonomic", "characteristics", "and", "in", "16S", "rRNA", "gene", "signature", "nucleotides", "." ]	[ 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
152	[ "Based", "on", "genetic", "and", "chemotaxonomic", "evidence", ",", "it", "is", "suggested", "that", "strain", "YM18", "-", "15", "(", "T", ")", "represents", "a", "novel", "species", "of", "a", "new", "genus", "within", "the", "family", "Beutenbergiaceae", ",", "for", "which", "the", "name", "Miniimonas", "arenae", "gen", ".", "nov", ".", ",", "sp", ".", "nov", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
153	[ "is", "proposed", "." ]	[ 0, 0, 0 ]
154	[ "The", "type", "strain", "of", "the", "type", "species", "is", "YM18", "-", "15", "(", "T", ")", "(", "=", "NBRC", "106267", "(", "T", ")", "=", "KCTC", "19750", "(", "T", ")", "=", "MBIC", "08348", "(", "T", ")", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
155	[ "Anoxybacillus", "tengchongensis", "sp", ".", "nov", ".", "and", "Anoxybacillus", "eryuanensis", "sp", ".", "nov", ".", ",", "facultatively", "anaerobic", ",", "alkalitolerant", "bacteria", "from", "hot", "springs", "." ]	[ 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
156	[ "Two", "novel", "thermophilic", ",", "spore", "-", "forming", "bacterial", "strains", ",", "T", "-", "11", "(", "T", ")", "and", "E", "-", "112", "(", "T", ")", ",", "were", "isolated", "from", "hot", "springs", "in", "Tengchong", "and", "Eryuan", "counties", "of", "Yunnan", "province", "in", "south", "-", "west", "China", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
157	[ "The", "strains", "were", "Gram", "-", "stain", "-", "positive", "rods", ",", "occurring", "singly", "or", "in", "chains", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
158	[ "Growth", "of", "strain", "T", "-", "11", "(", "T", ")", "was", "observed", "between", "30", "and", "75", "^", "0C", "(", "optimum", "50", "^", "0C", ")", "and", "at", "pH", "7", "-", "11", "(", "optimum", "pH", "8", ".", "5", ")", ",", "while", "the", "temperature", "range", "for", "strain", "E", "-", "112", "(", "T", ")", "was", "35", "-", "70", "^", "0C", "(", "optimum", "55", "^", "0C", ")", "and", "the", "pH", "range", "was", "7", ".", "0", "-", "11", ".", "0", "(", "optimum", "pH", "8", ".", "0", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
159	[ "The", "DNA", "G", "+", "C", "contents", "of", "strains", "T", "-", "11", "(", "T", ")", "and", "E", "-", "112", "(", "T", ")", "were", "41", ".", "1", "and", "42", ".", "6", "mol", "%", ",", "respectively", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
160	[ "On", "the", "basis", "of", "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "similarity", ",", "the", "two", "strains", "were", "shown", "to", "be", "related", "most", "closely", "to", "Anoxybacillus", "species", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
161	[ "The", "chemotaxonomic", "characteristics", "[", "predominant", "isoprenoid", "quinone", "menaquinone", "7", "(", "MK", "-", "7", ")", ";", "major", "fatty", "acids", "iso", "-", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "and", "iso", "-", "C", "(", "17", ":", "0", ")", "]", "also", "supported", "the", "affiliation", "of", "strains", "T", "-", "11", "(", "T", ")", "and", "E", "-", "112", "(", "T", ")", "to", "the", "genus", "Anoxybacillus", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
162	[ "The", "results", "of", "DNA", "-", "DNA", "hybridization", "and", "physiological", "and", "biochemical", "tests", "allowed", "genotypic", "and", "phenotypic", "differentiation", "of", "strains", "T", "-", "11", "(", "T", ")", "and", "E", "-", "112", "(", "T", ")", "from", "Anoxybacillus", "species", "with", "validly", "published", "names", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
163	[ "Strains", "T", "-", "11", "(", "T", ")", "and", "E", "-", "112", "(", "T", ")", "therefore", "represent", "two", "novel", "species", ",", "for", "which", "the", "names", "Anoxybacillus", "tengchongensis", "sp", ".", "nov", "." ]	[ 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0 ]
164	[ "(", "type", "strain", "T", "-", "11", "(", "T", ")", "=", "CCTCC", "AB209237", "(", "T", ")", "=", "KCTC", "13721", "(", "T", ")", ")", "and", "Anoxybacillus", "eryuanensis", "sp", ".", "nov", "." ]	[ 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0 ]
165	[ "(", "type", "strain", "E", "-", "112", "(", "T", ")", "=", "CCTCC", "AB209236", "(", "T", ")", "=", "KCTC", "13720", "(", "T", ")", ")", "are", "proposed", "." ]	[ 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
166	[ "Neisseria", "wadsworthii", "sp", ".", "nov", ".", "and", "Neisseria", "shayeganii", "sp", ".", "nov", ".", ",", "isolated", "from", "clinical", "specimens", "." ]	[ 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
167	[ "An", "analysis", "of", "16S", "rRNA", "gene", "sequences", "from", "archived", "clinical", "reference", "specimens", "has", "identified", "two", "novel", "Neisseria", "species", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
168	[ "For", "each", "species", ",", "two", "strains", "from", "independent", "sources", "were", "identified", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
169	[ "Amongst", "species", "with", "validly", "published", "names", ",", "the", "closest", "species", "to", "the", "newly", "identified", "organisms", "were", "Neisseria", "canis", ",", "N", ".", "dentiae", ",", "N", ".", "zoodegmatis", ",", "N", ".", "animaloris", "and", "N", ".", "weaveri", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 0 ]
170	[ "DNA", "-", "DNA", "hybridization", "studies", "demonstrated", "that", "the", "newly", "identified", "isolates", "represent", "species", "that", "are", "distinct", "from", "these", "nearest", "neighbours", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
171	[ "Analysis", "of", "partial", "23S", "rRNA", "gene", "sequences", "for", "the", "newly", "identified", "strains", "and", "their", "nearest", "neighbours", "provided", "additional", "support", "for", "the", "species", "designation", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
172	[ "Bayesian", "analysis", "of", "16S", "rRNA", "gene", "sequences", "suggested", "that", "the", "newly", "identified", "isolates", "belong", "to", "distinct", "but", "related", "species", "of", "the", "genus", "Neisseria", ",", "and", "are", "members", "of", "a", "clade", "that", "includes", "N", ".", "dentiae", ",", "N", ".", "bacilliformis", "and", "N", ".", "canis", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 0 ]
173	[ "The", "predominant", "cellular", "fatty", "acids", "[", "16", ":", "0", ",", "summed", "feature", "3", "(", "16", ":", "1omega7c", "and", "/", "or", "iso", "-", "15", ":", "0", "2", "-", "OH", ")", "and", "18", ":", "1omega7c", "]", ",", "as", "well", "as", "biochemical", "and", "morphological", "analyses", "further", "support", "the", "designation", "of", "Neisseria", "wadsworthii", "sp", ".", "nov", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0 ]
174	[ "(", "type", "strain", "9715", "(", "T", ")", "=", "DSM", "22247", "(", "T", ")", "=", "CIP", "109934", "(", "T", ")", ")", "and", "Neisseria", "shayeganii", "sp", ".", "nov", "." ]	[ 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0 ]
175	[ "(", "type", "strain", "871", "(", "T", ")", "=", "DSM", "22246", "(", "T", ")", "=", "CIP", "109933", "(", "T", ")", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
176	[ "Spirochaeta", "perfilievii", "sp", ".", "nov", ".", ",", "an", "oxygen", "-", "tolerant", ",", "sulfide", "-", "oxidizing", ",", "sulfur", "-", "and", "thiosulfate", "-", "reducing", "spirochaete", "isolated", "from", "a", "saline", "spring", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
177	[ "A", "novel", "strain", "of", "fermenting", ",", "aerotolerant", ",", "chemo", "-", "organoheterotrophic", "spirochaete", "designated", "P", "(", "T", ")", "was", "isolated", "from", "a", "sulfur", "'", "Thiodendron", "'", "mat", "in", "a", "saline", "spring", "at", "the", "Staraya", "Russa", "resort", "(", "Novgorod", "Region", ",", "Russia", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
178	[ "Cells", "of", "strain", "P", "(", "T", ")", "exhibited", "a", "helical", "shape", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
179	[ "The", "spirochaete", "required", "sulfide", "in", "the", "growth", "medium", "and", "was", "able", "to", "oxidize", "it", "non", "-", "enzymically", "to", "elemental", "sulfur", "via", "the", "interaction", "of", "H", "(", "2", ")", "O", "(", "2", ")", "with", "sulfide", "and", "deposit", "it", "in", "the", "periplasmic", "space", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
180	[ "Growth", "occurred", "at", "4", "-", "32", "^", "0C", "(", "optimum", "at", "28", "-", "30", "^", "0C", ")", ",", "pH", "6", ".", "0", "-", "8", ".", "5", "(", "optimum", "pH", "7", ".", "0", "-", "7", ".", "5", ")", ",", "and", "in", "0", ".", "1", "-", "1", "M", "NaCl", "(", "optimum", "0", ".", "35", "M", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
181	[ "The", "isolate", "used", "several", "sugars", "and", "polysaccharides", "as", "carbon", "or", "energy", "sources", "but", "did", "not", "use", "peptides", ",", "amino", "acids", ",", "organic", "acids", "or", "alcohols", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
182	[ "The", "products", "of", "glucose", "fermentation", "were", "formate", ",", "acetate", ",", "ethanol", ",", "pyruvate", ",", "CO", "(", "2", ")", "and", "H", "(", "2", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
183	[ "The", "genomic", "DNA", "G", "+", "C", "content", "was", "41", ".", "7", "mol", "%", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
184	[ "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "analysis", "showed", "that", "strain", "P", "(", "T", ")", "fell", "within", "a", "group", "of", "species", "in", "the", "genus", "Spirochaeta", ",", "including", "Spirochaeta", "litoralis", ",", "S", ".", "isovalerica", "and", "S", ".", "cellobiosiphila", ",", "with", "which", "it", "shared", "less", "then", "89", "%", "sequence", "similarity", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
185	[ "On", "the", "basis", "of", "its", "morphology", ",", "physiology", "and", "other", "phenotypic", "properties", ",", "as", "well", "as", "its", "phylogenetic", "position", ",", "the", "new", "isolate", "is", "considered", "to", "represent", "a", "novel", "species", "of", "the", "genus", "Spirochaeta", ",", "for", "which", "the", "name", "Spirochaeta", "perfilievii", "sp", ".", "nov", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
186	[ "is", "proposed", "." ]	[ 0, 0, 0 ]
187	[ "The", "type", "strain", "is", "P", "(", "T", ")", "(", "=", "DSM", "19205", "(", "T", ")", "=", "VKM", "B", "-", "2514", "(", "T", ")", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
188	[ "Sporosalibacterium", "faouarense", "gen", ".", "nov", ".", ",", "sp", ".", "nov", ".", ",", "a", "moderately", "halophilic", "bacterium", "isolated", "from", "oil", "-", "contaminated", "soil", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
189	[ "A", "novel", "strictly", "anaerobic", ",", "moderately", "halophilic", "and", "mesophilic", "bacterium", ",", "designated", "strain", "SOL3f37", "(", "T", ")", ",", "was", "isolated", "from", "a", "hydrocarbon", "-", "polluted", "soil", "surrounding", "a", "deep", "petroleum", "environment", "located", "in", "south", "Tunisia", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
190	[ "Cells", "of", "strain", "SOL3f37", "(", "T", ")", "stained", "Gram", "-", "positive", "and", "were", "motile", ",", "straight", "and", "spore", "-", "forming", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
191	[ "Strain", "SOL3f37", "(", "T", ")", "had", "a", "typical", "Gram", "-", "positive", "-", "type", "cell", "-", "wall", "structure", ",", "unlike", "the", "thick", ",", "multilayered", "cell", "wall", "of", "its", "closest", "relative", "Clostridiisalibacter", "paucivorans", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0 ]
192	[ "The", "major", "fatty", "acids", "were", "iso", "-", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "(", "41", "%", ")", ",", "iso", "-", "C", "(", "14", ":", "0", ")", "3", "-", "OH", "and", "/", "or", "iso", "-", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "dimethyl", "acetal", "(", "21", ".", "6", "%", ")", ",", "iso", "-", "C", "(", "13", ":", "0", ")", "(", "4", ".", "4", "%", ")", ",", "anteiso", "-", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "(", "3", ".", "9", "%", ")", "and", "iso", "-", "C", "(", "15", ":", "1", ")", "(", "2", ".", "8", "%", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
193	[ "Strain", "SOL3f37", "(", "T", ")", "grew", "between", "20", "and", "48", "^", "0C", "(", "optimum", "40", "^", "0C", ")", "and", "at", "pH", "6", ".", "2", "-", "8", ".", "1", "(", "optimum", "pH", "6", ".", "9", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
194	[ "Strain", "SOL3f37", "(", "T", ")", "required", "at", "least", "0", ".", "5", "NaCl", "l", "(", "-", "1", ")", "and", "grew", "in", "the", "presence", "of", "NaCl", "concentrations", "up", "to", "150", "g", "l", "(", "-", "1", ")", "(", "optimum", "40", "g", "l", "(", "-", "1", ")", ")", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
195	[ "Yeast", "extract", "(", "2", "g", "l", "(", "-", "1", ")", ")", "was", "required", "for", "degradation", "of", "pyruvate", ",", "fumarate", ",", "fructose", ",", "glucose", "and", "mannitol", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
196	[ "Also", ",", "strain", "SOL3f37", "(", "T", ")", "grew", "heterotrophically", "on", "yeast", "extract", ",", "peptone", "and", "bio", "-", "Trypticase", ",", "but", "was", "unable", "to", "grow", "on", "Casamino", "acids", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
197	[ "Sulfate", ",", "thiosulfate", ",", "sulfite", ",", "elemental", "sulfur", ",", "fumarate", ",", "nitrate", "and", "nitrite", "were", "not", "reduced", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
198	[ "The", "DNA", "G", "+", "C", "content", "was", "30", ".", "7", "mol", "%", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]
199	[ "Phylogenetic", "analysis", "based", "on", "16S", "rRNA", "gene", "sequences", "revealed", "that", "strain", "SOL3f37", "(", "T", ")", "was", "a", "member", "of", "the", "family", "Clostridiaceae", "in", "the", "order", "Clostridiales", ";", "strain", "SOL3f37", "(", "T", ")", "was", "related", "to", "members", "of", "various", "genera", "of", "the", "family", "Clostridiaceae", "." ]	[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

100

[ "is", "proposed", "." ]

[ 0, 0, 0 ]

101

[ "The", "type", "strain", "is", "OU", "-", "40", "(", "T", ")", "(", "=", "CCTCC", "AA", "209024", "(", "T", ")", "=", "PCM", "2692", "(", "T", ")", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

102

[ "Gordonia", "humi", "sp", ".", "nov", ".", ",", "isolated", "from", "soil", "." ]

[ 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0 ]

103

[ "A", "Gram", "-", "stain", "-", "positive", ",", "non", "-", "endospore", "-", "forming", "actinobacterium", "(", "CC", "-", "12301", "(", "T", ")", ")", "was", "isolated", "from", "soil", "attached", "to", "a", "spawn", "used", "in", "the", "laboratory", "to", "grow", "the", "edible", "mushroom", "Agaricus", "brasiliensis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0 ]

104

[ "Based", "on", "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "similarities", ",", "strain", "CC", "-", "12301", "(", "T", ")", "was", "shown", "to", "belong", "to", "the", "genus", "Gordonia", "and", "was", "most", "closely", "related", "to", "the", "type", "strains", "of", "Gordonia", "hydrophobica", "(", "97", ".", "6", "%", "similarity", ")", ",", "Gordonia", "terrae", "(", "97", ".", "5", "%", ")", ",", "Gordonia", "amarae", "(", "97", ".", "5", "%", ")", "and", "Gordonia", "malaquae", "(", "97", ".", "4", "%", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

105

[ "The", "quinone", "system", "was", "determined", "to", "consist", "predominantly", "of", "menaquinone", "MK", "-", "9", "(", "H", "(", "2", ")", ")", ",", "minor", "amounts", "of", "MK", "-", "8", "(", "H", "(", "2", ")", ")", "and", "MK", "-", "7", "(", "H", "(", "2", ")", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

106

[ "The", "polar", "lipid", "profile", "consisted", "of", "the", "major", "compounds", "diphosphatidylglycerol", "and", "phosphatidylethanolamine", ",", "moderate", "amounts", "of", "two", "phosphatidylinositol", "mannosides", "and", "phosphatidylinositol", "and", "minor", "amounts", "of", "phosphatidylglycerol", ",", "three", "unidentified", "glycolipids", ",", "two", "phosphoglycolipids", "and", "a", "phospholipid", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

107

[ "Mycolic", "acids", "were", "present", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0 ]

108

[ "These", "chemotaxonomic", "traits", "and", "the", "major", "fatty", "acids", ",", "which", "were", "C", "(", "16", ":", "1", ")", "cis9", ",", "C", "(", "16", ":", "0", ")", ",", "C", "(", "18", ":", "1", ")", "and", "tuberculostearic", "acid", "(", "10", "-", "methyl", "C", "(", "18", ":", "0", ")", ")", ",", "supported", "the", "affiliation", "of", "strain", "CC", "-", "12301", "(", "T", ")", "to", "the", "genus", "Gordonia", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0 ]

109

[ "The", "results", "of", "physiological", "and", "biochemical", "tests", "allowed", "clear", "phenotypic", "differentiation", "of", "strain", "CC", "-", "12301", "(", "T", ")", "from", "the", "most", "closely", "related", "Gordonia", "species", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

110

[ "Strain", "CC", "-", "12301", "(", "T", ")", "therefore", "represents", "a", "novel", "species", ",", "for", "which", "the", "name", "Gordonia", "humi", "sp", ".", "nov", "." ]

[ 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2 ]

111

[ "is", "proposed", ",", "with", "the", "type", "strain", "CC", "-", "12301", "(", "T", ")", "(", "=", "DSM", "45298", "(", "T", ")", "=", "CCM", "7727", "(", "T", ")", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

112

[ "Methanoregula", "boonei", "gen", ".", "nov", ".", ",", "sp", ".", "nov", ".", ",", "an", "acidiphilic", "methanogen", "isolated", "from", "an", "acidic", "peat", "bog", "." ]

[ 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

113

[ "A", "novel", "acidiphilic", ",", "hydrogenotrophic", "methanogen", ",", "designated", "strain", "6A8", "(", "T", ")", ",", "was", "isolated", "from", "an", "acidic", "(", "pH", "4", ".", "0", "-", "4", ".", "5", ")", "and", "ombrotrophic", "(", "rain", "-", "fed", ")", "bog", "located", "near", "Ithaca", ",", "NY", ",", "USA", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

114

[ "Cultures", "were", "dimorphic", ",", "containing", "thin", "rods", "(", "0", ".", "2", "-", "0", ".", "3", "mum", "in", "diameter", "and", "0", ".", "8", "-", "3", ".", "0", "mum", "long", ")", "and", "irregular", "cocci", "(", "0", ".", "2", "-", "0", ".", "8", "mum", "in", "diameter", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

115

[ "The", "culture", "utilized", "H", "(", "2", ")", "/", "CO", "(", "2", ")", "to", "produce", "methane", "but", "did", "not", "utilize", "formate", ",", "acetate", ",", "methanol", ",", "ethanol", ",", "2", "-", "propanol", ",", "butanol", "or", "trimethylamine", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

116

[ "Optimal", "growth", "conditions", "were", "near", "pH", "5", ".", "1", "and", "35", "^", "0C", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

117

[ "The", "culture", "grew", "in", "basal", "medium", "containing", "as", "little", "as", "0", ".", "43", "mM", "Na", "(", "+", ")", "and", "growth", "was", "inhibited", "completely", "by", "50", "mM", "NaCl", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

118

[ "To", "our", "knowledge", ",", "strain", "6A8", "(", "T", ")", "is", "one", "of", "the", "most", "acidiphilic", "(", "lowest", "pH", "optimum", ")", "and", "salt", "-", "sensitive", "methanogens", "in", "pure", "culture", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

119

[ "Acetate", ",", "coenzyme", "M", ",", "vitamins", "and", "yeast", "extract", "were", "required", "for", "growth", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

120

[ "It", "is", "proposed", "that", "a", "new", "genus", "and", "species", "be", "established", "for", "this", "organism", ",", "Methanoregula", "boonei", "gen", ".", "nov", ".", ",", "sp", ".", "nov", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2 ]

121

[ "The", "type", "strain", "of", "Methanoregula", "boonei", "is", "6A8", "(", "T", ")", "(", "=", "DSM", "21154", "(", "T", ")", "=", "JCM", "14090", "(", "T", ")", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

122

[ "Marinobacterium", "coralli", "sp", ".", "nov", ".", ",", "isolated", "from", "mucus", "of", "coral", "(", "Mussismilia", "hispida", ")", "." ]

[ 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0 ]

123

[ "A", "Gram", "-", "negative", ",", "aerobic", "bacterium", ",", "designated", "R", "-", "40509", "(", "T", ")", ",", "was", "isolated", "from", "mucus", "of", "the", "reef", "builder", "coral", "(", "Mussismilia", "hispida", ")", "located", "in", "the", "Sao", "Sebastiao", "Channel", ",", "Sao", "Paulo", ",", "Brazil", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

124

[ "The", "strain", "was", "oxidase", "-", "positive", "and", "catalase", "-", "negative", ",", "and", "required", "Na", "(", "+", ")", "for", "growth", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

125

[ "Its", "phylogenetic", "position", "was", "in", "the", "genus", "Marinobacterium", "and", "the", "closest", "related", "species", "were", "Marinobacterium", "sediminicola", ",", "Marinobacterium", "maritimum", "and", "Marinobacterium", "stanieri", ";", "the", "isolate", "exhibited", "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "similarities", "of", "97", ".", "5", "-", "98", ".", "0", "%", "with", "the", "type", "strains", "of", "these", "species", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

126

[ "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "similarities", "with", "other", "type", "strains", "of", "the", "genus", "Marinobacterium", "were", "below", "96", "%", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

127

[ "DNA", "-", "DNA", "hybridizations", "between", "strain", "R", "-", "40509", "(", "T", ")", "and", "the", "type", "strains", "of", "the", "phylogenetically", "closest", "species", "of", "the", "genus", "Marinobacterium", "revealed", "less", "than", "70", "%", "DNA", "-", "DNA", "relatedness", ",", "supporting", "the", "novel", "species", "status", "of", "the", "strain", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

128

[ "Phenotypic", "characterization", "revealed", "that", "the", "strain", "was", "able", "to", "grow", "at", "15", "-", "42", "^", "0C", "and", "in", "medium", "containing", "up", "to", "9", "%", "NaCl", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

129

[ "The", "isolate", "could", "be", "differentiated", "from", "phenotypically", "related", "species", "by", "several", "features", ",", "including", "its", "ability", "to", "utilize", "d", "-", "alanine", ",", "l", "-", "alanine", ",", "bromosuccinic", "acid", ",", "Beta", "-", "hydroxybutyric", "acid", "and", "alpha", "-", "ketovaleric", "acid", ",", "but", "not", "acetate", "or", "l", "-", "arabinose", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

130

[ "It", "produced", "acetoin", "(", "Voges", "-", "Proskauer", ")", ",", "but", "did", "not", "have", "esterase", "lipase", "(", "C8", ")", "or", "catalase", "activities", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

131

[ "It", "possessed", "C", "(", "18", ":", "1", ")", "omega7c", "(", "35", "%", ")", ",", "summed", "feature", "3", "(", "iso", "-", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "2", "-", "OH", "and", "/", "or", "C", "(", "16", ":", "1", ")", "omega7c", ";", "25", "%", ")", "and", "C", "(", "16", ":", "0", ")", "(", "22", "%", ")", "as", "major", "cellular", "fatty", "acids", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

132

[ "The", "DNA", "G", "+", "C", "content", "was", "58", ".", "5", "mol", "%", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

133

[ "The", "name", "Marinobacterium", "coralli", "sp", ".", "nov", "." ]

[ 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2 ]

134

[ "is", "proposed", "to", "accommodate", "this", "novel", "isolate", ";", "the", "type", "strain", "is", "R", "-", "40509", "(", "T", ")", "(", "=", "LMG", "25435", "(", "T", ")", "=", "CAIM", "1449", "(", "T", ")", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0 ]

135

[ "Amnibacterium", "kyonggiense", "gen", ".", "nov", ".", ",", "sp", ".", "nov", ".", ",", "a", "new", "member", "of", "the", "family", "Microbacteriaceae", "." ]

[ 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

136

[ "A", "Gram", "-", "positive", ",", "non", "-", "motile", "bacterium", ",", "designated", "KSL51201", "-", "037", "(", "T", ")", ",", "was", "isolated", "from", "Anyang", "stream", ",", "Republic", "of", "Korea", ",", "and", "was", "characterized", "using", "a", "polyphasic", "taxonomic", "approach", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

137

[ "Comparative", "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "analysis", "showed", "that", "strain", "KSL51201", "-", "037", "(", "T", ")", "belonged", "to", "the", "family", "Microbacteriaceae", "of", "the", "class", "Actinobacteria", "and", "exhibited", "96", ".", "9", "%", "gene", "sequence", "similarity", "to", "Labedella", "gwakjiensis", "KSW2", "-", "17", "(", "T", ")", ",", "96", ".", "0", "%", "to", "Leifsonia", "ginsengi", "wged11", "(", "T", ")", "and", "95", ".", "9", "%", "to", "Microterricola", "viridarii", "KV", "-", "677", "(", "T", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0 ]

138

[ "The", "G", "+", "C", "content", "of", "the", "genomic", "DNA", "was", "72", ".", "7", "mol", "%", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

139

[ "Strain", "KSL51201", "-", "037", "(", "T", ")", "had", "l", "-", "2", ",", "4", "-", "diaminobutyric", "acid", "as", "the", "diagnostic", "cell", "-", "wall", "diamino", "acid", ",", "MK", "-", "11", "and", "MK", "-", "12", "as", "the", "major", "menaquinones", ",", "anteiso", "-", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "(", "47", ".", "8", "%", ")", "and", "iso", "-", "C", "(", "16", ":", "0", ")", "(", "24", ".", "0", "%", ")", "as", "the", "major", "fatty", "acids", "and", "phosphatidylglycerol", "and", "three", "unknown", "phospholipids", "as", "the", "major", "polar", "lipids", "." ]

[ 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

140

[ "On", "the", "basis", "of", "phenotypic", "and", "genotypic", "properties", "and", "phylogenetic", "distinctiveness", ",", "it", "is", "suggested", "that", "strain", "KSL51201", "-", "037", "(", "T", ")", "represents", "a", "novel", "species", "of", "a", "new", "genus", "in", "the", "family", "Microbacteriaceae", "for", "which", "the", "name", "Amnibacterium", "kyonggiense", "gen", ".", "nov", ".", ",", "sp", ".", "nov", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2 ]

141

[ "is", "proposed", "." ]

[ 0, 0, 0 ]

142

[ "The", "type", "strain", "of", "the", "type", "species", "is", "KSL51201", "-", "037", "(", "T", ")", "(", "=", "KEMC", "51201", "-", "037", "(", "T", ")", "=", "JCM", "16463", "(", "T", ")", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

143

[ "Miniimonas", "arenae", "gen", ".", "nov", ".", ",", "sp", ".", "nov", ".", ",", "an", "actinobacterium", "isolated", "from", "sea", "sand", "." ]

[ 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

144

[ "A", "Gram", "-", "positive", ",", "non", "-", "motile", ",", "coccoid", "-", "to", "rod", "-", "shaped", ",", "non", "-", "spore", "-", "forming", "bacterium", ",", "designated", "strain", "YM18", "-", "15", "(", "T", ")", ",", "was", "isolated", "from", "sea", "sand", "and", "studied", "using", "a", "polyphasic", "taxonomic", "approach", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

145

[ "Strain", "YM18", "-", "15", "(", "T", ")", "grew", "under", "both", "aerobic", "and", "anaerobic", "conditions", "." ]

[ 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

146

[ "The", "cell", "-", "wall", "peptidoglycan", "type", "was", "A4Beta", "and", "ornithine", "was", "the", "diagnostic", "diamino", "acid", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

147

[ "The", "polar", "lipids", "were", "phosphatidylglycerol", ",", "diphosphatidylglycerol", ",", "phosphatidylinositol", "and", "an", "unknown", "phospholipid", ",", "MK", "-", "8", "(", "H", "(", "4", ")", ")", "was", "the", "major", "menaquinone", "and", "the", "predominant", "fatty", "acids", "were", "anteiso", "-", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "and", "C", "(", "16", ":", "0", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

148

[ "The", "DNA", "G", "+", "C", "content", "was", "74", ".", "2", "mol", "%", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

149

[ "High", "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "similarities", "(", "96", ".", "3", "-", "97", ".", "3", "%", ")", "were", "found", "with", "the", "sequences", "of", "the", "type", "strains", "of", "the", "three", "genera", "of", "the", "family", "Beutenbergiaceae", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

150

[ "Phylogenetic", "analysis", "based", "on", "16S", "rRNA", "gene", "sequences", "showed", "that", "strain", "YM18", "-", "15", "(", "T", ")", "formed", "a", "clade", "with", "Serinibacter", "salmoneus", ",", "Salana", "multivorans", "and", "Beutenbergia", "cavernae", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0 ]

151

[ "Strain", "YM18", "-", "15", "(", "T", ")", "differed", "from", "these", "three", "type", "strains", "in", "chemotaxonomic", "characteristics", "and", "in", "16S", "rRNA", "gene", "signature", "nucleotides", "." ]

[ 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

152

[ "Based", "on", "genetic", "and", "chemotaxonomic", "evidence", ",", "it", "is", "suggested", "that", "strain", "YM18", "-", "15", "(", "T", ")", "represents", "a", "novel", "species", "of", "a", "new", "genus", "within", "the", "family", "Beutenbergiaceae", ",", "for", "which", "the", "name", "Miniimonas", "arenae", "gen", ".", "nov", ".", ",", "sp", ".", "nov", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

153

[ "is", "proposed", "." ]

[ 0, 0, 0 ]

154

[ "The", "type", "strain", "of", "the", "type", "species", "is", "YM18", "-", "15", "(", "T", ")", "(", "=", "NBRC", "106267", "(", "T", ")", "=", "KCTC", "19750", "(", "T", ")", "=", "MBIC", "08348", "(", "T", ")", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

155

[ "Anoxybacillus", "tengchongensis", "sp", ".", "nov", ".", "and", "Anoxybacillus", "eryuanensis", "sp", ".", "nov", ".", ",", "facultatively", "anaerobic", ",", "alkalitolerant", "bacteria", "from", "hot", "springs", "." ]

[ 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

156

[ "Two", "novel", "thermophilic", ",", "spore", "-", "forming", "bacterial", "strains", ",", "T", "-", "11", "(", "T", ")", "and", "E", "-", "112", "(", "T", ")", ",", "were", "isolated", "from", "hot", "springs", "in", "Tengchong", "and", "Eryuan", "counties", "of", "Yunnan", "province", "in", "south", "-", "west", "China", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

157

[ "The", "strains", "were", "Gram", "-", "stain", "-", "positive", "rods", ",", "occurring", "singly", "or", "in", "chains", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

158

[ "Growth", "of", "strain", "T", "-", "11", "(", "T", ")", "was", "observed", "between", "30", "and", "75", "^", "0C", "(", "optimum", "50", "^", "0C", ")", "and", "at", "pH", "7", "-", "11", "(", "optimum", "pH", "8", ".", "5", ")", ",", "while", "the", "temperature", "range", "for", "strain", "E", "-", "112", "(", "T", ")", "was", "35", "-", "70", "^", "0C", "(", "optimum", "55", "^", "0C", ")", "and", "the", "pH", "range", "was", "7", ".", "0", "-", "11", ".", "0", "(", "optimum", "pH", "8", ".", "0", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

159

[ "The", "DNA", "G", "+", "C", "contents", "of", "strains", "T", "-", "11", "(", "T", ")", "and", "E", "-", "112", "(", "T", ")", "were", "41", ".", "1", "and", "42", ".", "6", "mol", "%", ",", "respectively", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

160

[ "On", "the", "basis", "of", "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "similarity", ",", "the", "two", "strains", "were", "shown", "to", "be", "related", "most", "closely", "to", "Anoxybacillus", "species", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

161

[ "The", "chemotaxonomic", "characteristics", "[", "predominant", "isoprenoid", "quinone", "menaquinone", "7", "(", "MK", "-", "7", ")", ";", "major", "fatty", "acids", "iso", "-", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "and", "iso", "-", "C", "(", "17", ":", "0", ")", "]", "also", "supported", "the", "affiliation", "of", "strains", "T", "-", "11", "(", "T", ")", "and", "E", "-", "112", "(", "T", ")", "to", "the", "genus", "Anoxybacillus", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

162

[ "The", "results", "of", "DNA", "-", "DNA", "hybridization", "and", "physiological", "and", "biochemical", "tests", "allowed", "genotypic", "and", "phenotypic", "differentiation", "of", "strains", "T", "-", "11", "(", "T", ")", "and", "E", "-", "112", "(", "T", ")", "from", "Anoxybacillus", "species", "with", "validly", "published", "names", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

163

[ "Strains", "T", "-", "11", "(", "T", ")", "and", "E", "-", "112", "(", "T", ")", "therefore", "represent", "two", "novel", "species", ",", "for", "which", "the", "names", "Anoxybacillus", "tengchongensis", "sp", ".", "nov", "." ]

[ 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0 ]

164

[ "(", "type", "strain", "T", "-", "11", "(", "T", ")", "=", "CCTCC", "AB209237", "(", "T", ")", "=", "KCTC", "13721", "(", "T", ")", ")", "and", "Anoxybacillus", "eryuanensis", "sp", ".", "nov", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0 ]

165

[ "(", "type", "strain", "E", "-", "112", "(", "T", ")", "=", "CCTCC", "AB209236", "(", "T", ")", "=", "KCTC", "13720", "(", "T", ")", ")", "are", "proposed", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

166

[ "Neisseria", "wadsworthii", "sp", ".", "nov", ".", "and", "Neisseria", "shayeganii", "sp", ".", "nov", ".", ",", "isolated", "from", "clinical", "specimens", "." ]

[ 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

167

[ "An", "analysis", "of", "16S", "rRNA", "gene", "sequences", "from", "archived", "clinical", "reference", "specimens", "has", "identified", "two", "novel", "Neisseria", "species", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

168

[ "For", "each", "species", ",", "two", "strains", "from", "independent", "sources", "were", "identified", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

169

[ "Amongst", "species", "with", "validly", "published", "names", ",", "the", "closest", "species", "to", "the", "newly", "identified", "organisms", "were", "Neisseria", "canis", ",", "N", ".", "dentiae", ",", "N", ".", "zoodegmatis", ",", "N", ".", "animaloris", "and", "N", ".", "weaveri", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 0 ]

170

[ "DNA", "-", "DNA", "hybridization", "studies", "demonstrated", "that", "the", "newly", "identified", "isolates", "represent", "species", "that", "are", "distinct", "from", "these", "nearest", "neighbours", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

171

[ "Analysis", "of", "partial", "23S", "rRNA", "gene", "sequences", "for", "the", "newly", "identified", "strains", "and", "their", "nearest", "neighbours", "provided", "additional", "support", "for", "the", "species", "designation", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

172

[ "Bayesian", "analysis", "of", "16S", "rRNA", "gene", "sequences", "suggested", "that", "the", "newly", "identified", "isolates", "belong", "to", "distinct", "but", "related", "species", "of", "the", "genus", "Neisseria", ",", "and", "are", "members", "of", "a", "clade", "that", "includes", "N", ".", "dentiae", ",", "N", ".", "bacilliformis", "and", "N", ".", "canis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 0 ]

173

[ "The", "predominant", "cellular", "fatty", "acids", "[", "16", ":", "0", ",", "summed", "feature", "3", "(", "16", ":", "1omega7c", "and", "/", "or", "iso", "-", "15", ":", "0", "2", "-", "OH", ")", "and", "18", ":", "1omega7c", "]", ",", "as", "well", "as", "biochemical", "and", "morphological", "analyses", "further", "support", "the", "designation", "of", "Neisseria", "wadsworthii", "sp", ".", "nov", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0 ]

174

[ "(", "type", "strain", "9715", "(", "T", ")", "=", "DSM", "22247", "(", "T", ")", "=", "CIP", "109934", "(", "T", ")", ")", "and", "Neisseria", "shayeganii", "sp", ".", "nov", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0 ]

175

[ "(", "type", "strain", "871", "(", "T", ")", "=", "DSM", "22246", "(", "T", ")", "=", "CIP", "109933", "(", "T", ")", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

176

[ "Spirochaeta", "perfilievii", "sp", ".", "nov", ".", ",", "an", "oxygen", "-", "tolerant", ",", "sulfide", "-", "oxidizing", ",", "sulfur", "-", "and", "thiosulfate", "-", "reducing", "spirochaete", "isolated", "from", "a", "saline", "spring", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

177

[ "A", "novel", "strain", "of", "fermenting", ",", "aerotolerant", ",", "chemo", "-", "organoheterotrophic", "spirochaete", "designated", "P", "(", "T", ")", "was", "isolated", "from", "a", "sulfur", "'", "Thiodendron", "'", "mat", "in", "a", "saline", "spring", "at", "the", "Staraya", "Russa", "resort", "(", "Novgorod", "Region", ",", "Russia", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

178

[ "Cells", "of", "strain", "P", "(", "T", ")", "exhibited", "a", "helical", "shape", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

179

[ "The", "spirochaete", "required", "sulfide", "in", "the", "growth", "medium", "and", "was", "able", "to", "oxidize", "it", "non", "-", "enzymically", "to", "elemental", "sulfur", "via", "the", "interaction", "of", "H", "(", "2", ")", "O", "(", "2", ")", "with", "sulfide", "and", "deposit", "it", "in", "the", "periplasmic", "space", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

180

[ "Growth", "occurred", "at", "4", "-", "32", "^", "0C", "(", "optimum", "at", "28", "-", "30", "^", "0C", ")", ",", "pH", "6", ".", "0", "-", "8", ".", "5", "(", "optimum", "pH", "7", ".", "0", "-", "7", ".", "5", ")", ",", "and", "in", "0", ".", "1", "-", "1", "M", "NaCl", "(", "optimum", "0", ".", "35", "M", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

181

[ "The", "isolate", "used", "several", "sugars", "and", "polysaccharides", "as", "carbon", "or", "energy", "sources", "but", "did", "not", "use", "peptides", ",", "amino", "acids", ",", "organic", "acids", "or", "alcohols", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

182

[ "The", "products", "of", "glucose", "fermentation", "were", "formate", ",", "acetate", ",", "ethanol", ",", "pyruvate", ",", "CO", "(", "2", ")", "and", "H", "(", "2", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

183

[ "The", "genomic", "DNA", "G", "+", "C", "content", "was", "41", ".", "7", "mol", "%", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

184

[ "16S", "rRNA", "gene", "sequence", "analysis", "showed", "that", "strain", "P", "(", "T", ")", "fell", "within", "a", "group", "of", "species", "in", "the", "genus", "Spirochaeta", ",", "including", "Spirochaeta", "litoralis", ",", "S", ".", "isovalerica", "and", "S", ".", "cellobiosiphila", ",", "with", "which", "it", "shared", "less", "then", "89", "%", "sequence", "similarity", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

185

[ "On", "the", "basis", "of", "its", "morphology", ",", "physiology", "and", "other", "phenotypic", "properties", ",", "as", "well", "as", "its", "phylogenetic", "position", ",", "the", "new", "isolate", "is", "considered", "to", "represent", "a", "novel", "species", "of", "the", "genus", "Spirochaeta", ",", "for", "which", "the", "name", "Spirochaeta", "perfilievii", "sp", ".", "nov", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

186

[ "is", "proposed", "." ]

[ 0, 0, 0 ]

187

[ "The", "type", "strain", "is", "P", "(", "T", ")", "(", "=", "DSM", "19205", "(", "T", ")", "=", "VKM", "B", "-", "2514", "(", "T", ")", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

188

[ "Sporosalibacterium", "faouarense", "gen", ".", "nov", ".", ",", "sp", ".", "nov", ".", ",", "a", "moderately", "halophilic", "bacterium", "isolated", "from", "oil", "-", "contaminated", "soil", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

189

[ "A", "novel", "strictly", "anaerobic", ",", "moderately", "halophilic", "and", "mesophilic", "bacterium", ",", "designated", "strain", "SOL3f37", "(", "T", ")", ",", "was", "isolated", "from", "a", "hydrocarbon", "-", "polluted", "soil", "surrounding", "a", "deep", "petroleum", "environment", "located", "in", "south", "Tunisia", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

190

[ "Cells", "of", "strain", "SOL3f37", "(", "T", ")", "stained", "Gram", "-", "positive", "and", "were", "motile", ",", "straight", "and", "spore", "-", "forming", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

191

[ "Strain", "SOL3f37", "(", "T", ")", "had", "a", "typical", "Gram", "-", "positive", "-", "type", "cell", "-", "wall", "structure", ",", "unlike", "the", "thick", ",", "multilayered", "cell", "wall", "of", "its", "closest", "relative", "Clostridiisalibacter", "paucivorans", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0 ]

192

[ "The", "major", "fatty", "acids", "were", "iso", "-", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "(", "41", "%", ")", ",", "iso", "-", "C", "(", "14", ":", "0", ")", "3", "-", "OH", "and", "/", "or", "iso", "-", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "dimethyl", "acetal", "(", "21", ".", "6", "%", ")", ",", "iso", "-", "C", "(", "13", ":", "0", ")", "(", "4", ".", "4", "%", ")", ",", "anteiso", "-", "C", "(", "15", ":", "0", ")", "(", "3", ".", "9", "%", ")", "and", "iso", "-", "C", "(", "15", ":", "1", ")", "(", "2", ".", "8", "%", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

193

[ "Strain", "SOL3f37", "(", "T", ")", "grew", "between", "20", "and", "48", "^", "0C", "(", "optimum", "40", "^", "0C", ")", "and", "at", "pH", "6", ".", "2", "-", "8", ".", "1", "(", "optimum", "pH", "6", ".", "9", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

194

[ "Strain", "SOL3f37", "(", "T", ")", "required", "at", "least", "0", ".", "5", "NaCl", "l", "(", "-", "1", ")", "and", "grew", "in", "the", "presence", "of", "NaCl", "concentrations", "up", "to", "150", "g", "l", "(", "-", "1", ")", "(", "optimum", "40", "g", "l", "(", "-", "1", ")", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

195

[ "Yeast", "extract", "(", "2", "g", "l", "(", "-", "1", ")", ")", "was", "required", "for", "degradation", "of", "pyruvate", ",", "fumarate", ",", "fructose", ",", "glucose", "and", "mannitol", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

196

[ "Also", ",", "strain", "SOL3f37", "(", "T", ")", "grew", "heterotrophically", "on", "yeast", "extract", ",", "peptone", "and", "bio", "-", "Trypticase", ",", "but", "was", "unable", "to", "grow", "on", "Casamino", "acids", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

197

[ "Sulfate", ",", "thiosulfate", ",", "sulfite", ",", "elemental", "sulfur", ",", "fumarate", ",", "nitrate", "and", "nitrite", "were", "not", "reduced", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

198

[ "The", "DNA", "G", "+", "C", "content", "was", "30", ".", "7", "mol", "%", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

199

[ "Phylogenetic", "analysis", "based", "on", "16S", "rRNA", "gene", "sequences", "revealed", "that", "strain", "SOL3f37", "(", "T", ")", "was", "a", "member", "of", "the", "family", "Clostridiaceae", "in", "the", "order", "Clostridiales", ";", "strain", "SOL3f37", "(", "T", ")", "was", "related", "to", "members", "of", "various", "genera", "of", "the", "family", "Clostridiaceae", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]