Anakin Skywalker

Darth Vader

- Jedi High Council

Galactic Republic

- 501st Legion

Sith

Galactic Empire

- Imperial High Command

- Death Squadron

Yoda (Force Spirit Leeraar)

*"It is your destiny. Join me and together we can rule the galaxy as father and son." -* Darth Vader tegen zoon Luke Skywalker

**Anakin Skywalker**, later bekend als **Darth Vader**, was één van de machtigste Jedi en Sith aller tijden.

## Jeugdjaren

Anakin Skywalker was geboren in 41 BBY op de afgelegen woestijnplaneet Tatooine. Anakin werd gebaard en grootgebracht door zijn moeder en slaaf Shmi Skywalker. Anakin had geen vader en was sinds zijn geboorte zeer krachtig afgestemd op de Force. Zo krachtig dat sommigen geloofden dat zijn geboorte tot stand is gekomen doordat hij verwekt zou zijn door de wil van de Force. Anakin en zijn moeder Shmi waren slaven van Gardulla The Hutt, totdat Gardulla ze verloor aan junkdealer Watto in een weddenschap bij het podracen toen Skywalker drie jaar jong was.

In het bezit van Watto, liet de Toydarian Anakin in zijn winkel werken. Door Anakin’s sterke affiniteit met de Force was Anakin een meer dan nuttige werknemer voor Watto. Anakin was als kind bevriend geraakt met Kitster en de Rodian Wald alsook de oude Jira. Skywalker had veel talent in het in mekaar zetten van dingen. Zo was Skywalker bezig met het maken van een protocol droid, genaamd C-3PO, om zijn mama te assisteren. De fotoreceptoren die hij nodig had voor 3PO, bemachtigde Anakin in een marktje op Mos Espa. Skywalker werd wel achtervolgd door een Gran die ook de fotoreceptoren wou. Skywalker wist de Gran af te schudden door een verkoperskraam van een Ithorian te vernietigen, dat de achtervolging van de Gran had geblokkeerd. Nog voor hij negen was, slaagde Anakin erin 3PO operationeel te maken voor assistentie.

Daarnaast was Anakin ook een uitstekende piloot en toonde hij  een sterke interesse in podracen. Anakin nam al op jonge leeftijd deel aan podraces. Hij was echter de enige mens die podracete wegens het gevaar van de sport. Maar onwetend bij hemzelf had Anakin de gave om dingen te zien voor ze gebeuren waardoor hij zeer snelle reflexen had en in staat was te podracen. Wegens zijn talenten en bouwcapaciteiten, was Anakin in staat zijn eigen podrace te maken waar hij toch een lange tijd aan bezig was.

Op een normale werkdag vond Skwywalker in het afval dat hij van Watto moest weggooien een ultra power cell. Een attribuut dat hij ozo nodig had om zijn pod af te werken. Echter later die dag werd een medisch center onder vuur genomen door een swoop gang. De ravage leidde tot een defecte generator van het medisch center. Anakin wou helpen en zag in dat de generator nood had aan een power cell om het center terug operationeel te maken. Hij offerde zijn power cell op en was in staat het center te redden. Een week later nam Skywalker deel aan een podrace met de podrace van Watto aangezien zijn pod nog niet af was door zijn opoffering vorige week. Anakin werd in die race gesaboteerd door Sebulba doordat Sebulba hem had geflasht met zijn uitlaatgassen en crashte als gevolg daarvan. Anakin was er echter wel van overtuigd dat hij de race gewonnen zou hebben als hij de power cell in zijn pod had ingevoerd.

## Ontdekking

### In Contact met een Jedi

Later kregen de negenjarige Anakin en Watto bezoek van Jedi Qui-Gon Jinn en Padmé Amidala, de Queen of Naboo, die op zoek waren naar een nieuwe hyperdrive. Met die laatste maakte Skywalker kennis. Anakin vroeg of Padmé een engel was omdat ze haar zo mooi vond. Anakin vertelde haar dat hij een piloot is en dat hij hier ooit zal wegvliegen. Daarnaast vertelde Anakin ook over zijn verleden dat hij en zijn moeder het bezit waren van Gardulla The Hutt, maar dat Gardulla hen had verloren aan Watto met het gokken. Toen Jinn en co vertrokken, mocht Skywalker naar huis als hij de rekken eerst ging schoonmaken.

Wanneer de klungelige Binks het aan de stok kreeg met podracer Sebulba in de straten van Mos Espa, kwam Anakin tussenbeide en hield hij hen uit elkaar. Hij waarschuwde dat Binks een belangrijke buitenlander was en daagde zijn collega podracer Sebulba wat uit. Jinn bedankte de jonge knaap voor het tegenhouden van de herrie. Maar wanneer een zandstorm Mos Espa bereikte moest Skywalker en zijn nieuwe vrienden schuilen. Amidala en co besloten terug te keren naar het schip maar aangezien dat nog zo ver was, bood Anakin aan om te schuilen bij hem en zijn moeder.

Thuis liet Anakin zijn prtocoldroid C-3PO zien aan Padmé. Padmé was verwonderd dat Anakin zo’n droid kon maken op die leeftijd. Anakin vertelde later aan tafel over hun slavenleven en over het feit dat er bij elke slaaf een zender ingeplant is in hun lichaam. Anakin zei dat hij een scanner aan het maken is om zijn zender te lokaliseren en weg te halen. Padmé was verrast over de slavernij op Tatooine; gezien het anti-slavernij beleid van de Republiek. Anakin’s moeder, Shmi, vertelde Padmé dat de republiek niet bestaat op het afgelegen Tatooine en dat de Hutts het hier in handen hebben. Anakin had het ook over zijn passie podracen en beweerde dat Qui-Gon een Jedi was aangezien hij zijn lichtzwaard had gezien. Jinn was verbaast dat Anakin podracet aangezien het heel gevaarlijk is en je reflexen van een Jedi moet hebben.

Qui-Gon merkte al rap dat Anakin geen normale jongen was en hij vertelde over hun belangrijke missie dat ze zo spoedig mogelijk naar Coruscant moesten. Shmi vertelde haar gezelschap dat er misschien wel een andere manier was om aan de hyperdrive te komen: met het gokken op de podraces, waar de handelaren zich constant aan wagen. Toen stelde Anakin voor om hem in te schrijven voor de race van morgen. Shmi vond dit geen goed plan en Jinn gaf Shmi gelijk. Anakin probeerde zijn mama te overtuigen en Shmi zag in dat het podracen echt wel de enige optie was en dus gingen Jinn en co de volgende dag terug naar Watto, hoewel Padmé het afkeurde om het lot van de queen in handen van een negenjarige slaaf te leggen. Aangekomen bij Watto, sloot Jinn een deal met de toydarian waarbij dat Jinn de podrace, heimelijk die van Anakin, zou regelen en dat Watto Anakin zou regelen en Skywalker's inschrijfgeld zou betalen en alle winst van een mogelijke overwinning zou innen, behalve het geld dat Jinn nodig had om zijn schip te repareren. Als Skywalker verloor, zou Watto het schip van de koningin houden. Watto ging akkoord met de voorwaarde, en Skywalker begon zijn pod raceklaar te maken.

De avond voor de race checkte Jinn Anakin op mogelijke wonden en nam hij een afname van zijn bloed. Jinn wou het midi-chlorian aantal weten van Anakin en vroeg Obi-Wan om het bloed te analyseren. In de Analyse bleek dat Skywalker een extreem hoog midi-chlorian gehalte had over 20.000, wat zelfs hoger was dan meester Yoda. Waardoor gedacht werd dat zijn hoge midi-chlorian gehalte de reden was van zijn geboorte zonder vader. Terwijl Anakin zijn podrace raceklaar aan het maken was, werd hij bezocht door zijn vrienden. Zijn vrienden geloofde echter niet in Anakin. Padmé kwam net voor de race te weten dat Anakin nog nooit een race had gefinisht, laat staan had gewonnen. En was nu nog meer bezorgd om dit roekeloos plan. Onwetend bij Anakin had Qui-Gon voor de race nog een bijkomende weddenschap met Watto gesloten. Jinn zou ‘zijn’ podrace geven aan Watto als Anakin niet zou winnen, echter als Anakin wel zou winnen zou Jinn de vrijheid van Anakin garanderen zodat hij hem kon meenemen naar Coruscant om hem op te leiden tot Jedi. Jinn probeerde ook zijn moeder Shmi vrij te krijgen, maar Watto weigerde.

### Boonta Eve Classic

Later de dag maakten de deelnemers hun racers klaar voor de race. Sebulba had net voor de race stiekem een koppeling van Anakin’s pod losgemaakt. Net voor de start van de race adviseerde Jinn Anakin om te concentreren op het moment en zijn instincten te gebruiken. Het was de beruchte Jabba The Hutt, die eregast was voor de race, die het startshot moogt geven. Echter Anakin kende meteen een desastreuze start, hij kreeg de motoren niet aan de praat. Anakin panikeerde niet en na een paar knoppen in te drukken kon Anakin vertrekken.

Anakin moest aan een inhaalrace beginnen, maar geleid door zijn talenten en de force, stak Anakin racer na racer voorbij. De valse Sebulba had intussen enkele van zijn concurrenten uitgeschakeld en leidde de race. Anakin slaagde erin om als tweede de laatste ronde in te gaan achter Sebulba. In een poging hem in te halen, moest Skywalker uitwijken waardoor hij een helling op moest en tijdelijk in de lucht zat. De vindingrijke Anakin probeerde dit in zijn voordeel uit te spelen en dat deed hij want terug aan grond kwam hij net voor Sebulba te staan. Echter de koppeling die Sebulba voor de race had losgemaakt begaf het en opnieuw moest Anakin inventief zijn om het probleem op te lossen. Hij slaagde erin zijn podrace heel te houden en net voor de finish haakte de pod van Sebulba in die van Skywalker. Anakin slaagde er opnieuw in er heelhuids uit te komen, terwijl Sebulba’s pod het begaf. Skywalker won de race tot ieders verbazing na zijn valse start. Anakin werd gefeliciteerd door de toeschouwers en later door Padmé en mama Shmi.

### Afscheid van zijn Thuis

Na de race werd Skywalker benaderd door de jonge Greedo die hem zei dat hij had valsgespeeld tijdens de race. Woedend door de valse beschuldiging, begon hij met Greedo te vechten. Skywalker werd door Jinn tegengehouden die hem zei dat vechten niets zou oplossen. Skywalker en Jinn wandelde naar huis waar Skywalker tegen Shmi zei dat ze veel geld had gewonnen met zijn overwinning en met de verkoop van zijn pod. Jinn onthulde dan aan Shmi en Anakin dat Anakin nu ook vrij is en geen slaaf meer is. Shmi vroeg of Qui-Gon zijn zoon nu ging meenemen om op te leiden tot Jedi, waarop Jinn antwoord dat het geen toeval was maar de wil van de Force dat hun paden kruisten. Anakin geloofde zijn oren niet, maar Jinn waarschuwde hem wel dat de opleiding en het leven van een Jedi heel zwaar is. Maar Skywalker wou mee, het was zijn droom om mee te vliegen in een starship en een Jedi te worden.

Toen vroeg Skywalker zich echter af of Shmi ook vrij was en meegingen met de Jedi. Dat was niet het geval en Skywalker begon plots te twijfelen of hij mee zou gaan. Skywalker had besloten toch mee te gaan en maakte zijn zak klaar om te vertrekken. Skywalker nam afscheid van 3PO, die het spijtig vond dat hij hem niet meer had aangekleed. Skywalker verontschuldigde zich en beloofde hem dat Shmi haar niet zou verkopen. Voor definitief te vertrekken gaf hij zijn mama nog een knuffel en wist niet of hij dit wel zou aankunnen. Hij vroeg Shmi of hij haar ooit nog zou terugzien. Shmi vroeg hem naar zijn hart te luisteren, die hem zei dat hij denkt Shmi ooit nog terug te zien.

Net voordat Anakin en Qui-Gon het schip konden bereiken, kwam een mysterieus individu aan in een speeder, die Skywalker net op tijd kon ontwijken. Het was Darth Maul de Sith-leerling van Darth Sidious die zich kwam openbaren aan de Jedi en daarna de Queen ging meenemen. Maul had Jinn kunnen lokaliseren via één van zijn Sith probe droids die hij losliet op Tatooine. Maul sprong van zijn speeder in een salto-beweging en viel meteen Jinn aan. In het intens gevecht droeg Jinn Skywalker op naar het schip te lopen en de bemanning te zeggen om op te stijgen. In het duel moest Jinn alle zeilen bij zetten om de snelle slagen van de wraaklustige Maul te pareren. Kenobi vroeg piloot Ric Olié op te stijgen en laag te vliegen met het landingsgestel nog aan zodat Qui-Gon op het gestel kon springen voor een snelle ontsnapping. Qui-Gon ondervond veel last met de kwikse Maul, maar hij zag het schip richting hem naderen en zag zijn kans om op het gestel te springen. Jinn slaagde daarin en wist te ontsnappen van Darth Maul, die met lege handen op Tatooine bleef. Opgestegen liet Jinn Anakin kennis makken met zijn Padawan Obi-Wan Kenobi.

In hyperspace op weg naar Coruscant had Anakin last van de kou en Padmé merkte dat en gaf hem een deken en merkte dat Anakin zijn moeder miste. Anakin merkte op zijn beurt dat Padmé droevig was. Padmé begon dan over haar volk dat aan het verhongeren was en dat de Queen de senaat moet overtuigen om in te grijpen. Anakin gaf Padmé een ketting als aandenken voor dat hun wegen zouden scheiden als Anakin een Jedi zou worden. Padmé zei hem dat hij dit nodig had om aan hem te denken en zei dat ze veel om hem gaf.

### Getest door de Raad

Aangekomen op Coruscant ging Anakin meemet de Queen, terwijl Kenobi en Jinn op weg naar de tempel gingen om hun ontwikkelingen te bespreken. Jinn besprak met de raad over zijn ontdekking van Skywalker en kon regelen dat Skywalker voor de raad mocht komen om testen af te leggen. Voordat Skywalker vertrok naar de tempel wou hij nog afscheid nemen van Padmé omdat hij hoogstwaarschijnlijk Padmé niet meer zal zien voor een lange tijd, maar het was de koningin Sabé die Skywalker binnenliet in haar suite en meegaf dat Padmé een boodschap aan het doen was. De Queen beloofde wel het afscheid door te geven aan Padmé.

Later die dag werd Anakin door de Jedi raad getest. De raad was verbaast met Skywalkers capaciteiten, maar namen veel angst waar bij de jongen. De angst om haar moeder te kwijtraken. Skywalker vond het raar dat ze over zijn gevoelens voor zijn moeder begonnen. Maar Yoda wees de jongen erop dat angst leidt naar de weg van de Dark Side of the Force; dat het  leidt tot woede dat leidt tot haat en dat op zijn beurt tot leed zou leiden.

In de tempel kregen Skywalker en Jinn te horen van de raad dat Skywalker niet opgeleid zou worden omdat er te veel angst in hem werd waargenomen waardoor zijn toekomst onzeker is en daarbij was hij ook te oud om nog opgeleid te worden. Jinn stelde dan voor om hem zelf op te leiden, maar dat was verboden volgens de code omdat hij al een Padawan had. Jinn stelde dan voor dat Kenobi hem zou trainen, maar hij was zelf nog Padawan en moest zijn trials nog afleggen. Echter Windu zei dat het lot van Skywalker nu ongelegen komt. Windu deelde mee dat er een nieuwe kanselier wordt gekozen en dat Amidala had besloten terug te keren naar Naboo. Windu legde uit dat Amidala’s terugkeer naar Naboo ervoor zou zorgen dat de Federation terug alle zeilen zou moeten bij zetten om de koningin gevangen te nemen, waardoor de raad geloofde dat de mysterieuze krijger mogelijk tevoorschijn zou kunnen komen om Amidala’s gevangenneming te verzekeren. Windu beval Jinn en Kenobi de Queen te vergezellen naar Naboo om haar te beschermen en om zo de identiteit van de krijger te identificeren om te weten te komen of het nu wel degelijk om een Sith Lord gaat. Anakin ging mee met Qui-Gon en Obi-Wan.

Voordat ze aan boord gingen in Amidala's schip, vroeg Anakin Jinn wat midi-chlorians waren. Jinn zei hem dat het levensvormen zijn in je cellen in symbiose met het leven die ervoor zorgen dat leven mogelijk is en dat de Force bestaat en het leven de wil van de Force vertelt. Skywalker begreep het niet echt en stapte in het schip. De Queen kwam aan op het landingspad en was verheugd dat Jinn en Kenobi hen opnieuw gingen bijstaan. Op het schip leerde Skywalker al snel de besturingen van het schip bij met Ric Olié, terwijl Panaka en Jinn niet begrepen wat Amidala ging doen op Naboo. De Queen onthulde dan haar plan om een alliantie te vormen met de Gungans en hun leger te gebruiken om terug te nemen wat van hun is en een einde te maken aan deze crisis.

### Naboo Redden

Skywalker zag toe hoe de Queen de Gungan leider Boss Nass probeerde te overtuigen om een alliantie te vormen. Skywalker was verrast toen Padmé onthulde dat zij de Queen was en dat de Queen diende als haar bescherming en stand-in in situaties van gevaar. Amidala slaagde erin een alliantie te vormen met de Gungans en bereidde haar plan voor om Naboo te bevrijden.

Skywalker volgde mee met de groep van Amidala en de Jedi en bleef zo dicht mogelijk bij Qui-Gon. De groep wist het paleis binnen te dringen waar ze op weg gingen naar de hangaar om de piloten in hun starfighters te krijgen. Jinn beval Skywalker zich op een veilige plek te verstoppen. Skywalker besloot zich in de cockpit van een Starfighter te verstoppen. Jinn beval Skywalker in de cockpit te blijven gezien hij daar veilig zat. De Jedi en Amidala werden echter gehinderd door Darth Maul. Jinn en Kenobi gingen Maul bekampen, terwijl Amidala en haar mannen via een andere weg naar de troonzaal gingen. Amidala en co kregen het te bekampen met enkele gevaarlijke droideka’s. Skywalker zag toe hoe de droideka’s Amidala’s mannen overmeesterden. Skywalker besloot te helpen en de wapens van zijn Starfighter te gebruiken, maar drukte aanvankelijke op de verkeerde knoppen die de automatische piloot deed inschakelen. Voor de Starfighter opsteeg wist Skywalker wel de droideka’s uit te schakelen.

De automatische piloot bracht Skywalker naar de rest van het squadron bij het droid control ship. De piloten ondervonden dat het schild rond het control ship te sterk was en het squadron verloor aan piloten. Skywalker vroeg zijn astromach, R2-D2, de automatische piloot af te zetten omdat hij geen controle had over zijn Starfighter. Ontkoppeld van de automatische piloot werd Skywalker achtervolgd door veel droid fighters. Skywalker begon te spinnen in de hoop de fighters af te stoppen. In de space battle boven Naboo werd Skywalker geraakt door droid fighters, maar was in staat de crash te minimaliseren en te landen binnen het droid control ship. Skywalker zijn schip kreeg terug energie en kon hij zijn schilden terug aanzetten. Skywalker wist onbewust de hoofdreactor te raken met zijn ionenkanon en kon op tijd ontsnappen voordat het control schip helemaal werd opgeblazen als gevolg van Skywalker’s acties die voor een kettingreactie zorgden. Het droidleger dat de Gungans omsingelde viel als gevolg van de vernietiging van het droid controlship uit. En ook Amidala en haar mannen wisten de Viceroy te arresteren. Echter Anakin's mentor en bevrijder Qui-Gon Jinn stierf in de handen van de Sith Lord Darth Maul.

## Jedi Loopbaan

### Geaccepteerd in de Jedi Order

Terwijl Viceroy Gunray en zijn rechterhand Rune Haako van de Trade Federation werden afgevoerd, kwamen de leden van de Jedi Raad aan op Naboo om de begrafenis van Qui-gon bij te wonen alsook senator Palpatine van Naboo, die ondertussen verkozen werd als opperkansier, om de overwinning van Naboo te vieren. Palpatine bedankte Kenobi en Skywalker voor hun moed en kreeg te horen dat Skywalker een speciale jongen was waardoor hij benieuwd was naar zijn loopbaan.

In het paleis van Theed werd Kenobi door Yoda benoemd tot Jedi Knight. Maar Yoda voelde teveel gevaar in Skywalker’s opleiding en was het er niet mee eens om Skywalker tot Jedi op te leiden, ook al was hij misschien de uitverkorene. Kenobi stond erop de belofte van Qui-Gon na te komen, ook al was dat tegen de verzoeken van de raad. Yoda zag in dat hij al even eigenzinnig werd als Qui-Gon, maar ging met veel twijfel toch akkoord en Skywalker zou Kenobi’s Padawan worden. Die avond werd de begrafenis van Qui-Gon gehouden in Theed. Tijdens de begrafenis vroeg Skywalker zich af wat er nu met hem ging gebeuren. Kenobi vertelde hem dat hij hem mocht opleiden van de raad.

De volgende dag werd een prestigieuze ceremonie gehouden in de straten van Theed om de overwinning van Naboo te vieren. Skywalker was gekleed in Jedi uniform en had het gekende staartje van een Padawan.

### Padawan van Kenobi

#### Een Eerste Missie

Later was Anakin met zijn meester aan het mediteren in de tempel. Tijdens het mediteren bedacht Kenobi of hij wel een goede leeraar is aangezien Anakin vaak niet luistert en eigenwijs deed en aangezien hij altijd gedacht had dat als hij een padawan had dat hij steeds advies kon vragen aan zijn meester, maar die is dood. Tijdens de meditatie werden de twee door meester Tosan onderbroken. Tosan vertelde Kenobi dat de raad een missie voor hem had. Op de planeet Dallenor beweert een team archeologen een Jedi holocron opgegraven te hebben. Kenobi zou naar Dallenor gaan om de holocron te verifiëren en terug te brengen naar de tempel waar het behoort en informatie uit te halen. Skywalker was teleurgesteld dat Kenobi weer op missie ging waardoor hij zou moeten achterblijven en onder Yoda met de initiates te trainen, waar Skywalker al veel gevorderder was dan hen. Echter, om zijn missie voor te bereiden ging hij in de archieven op zoek naar meer info over Dallenor en mogelijke Jedi op Dallenor waaraan het holocron zou kunnen toebehoren, kwam Kenobi Yoda tegen het lijf die hem indirect adviseerde om Skywalker mee te nemen naar Dallenor omdat hij erin geloofde dat Skywalker nood heeft aan het geloof van zijn meester om te kunnen slagen in zijn opleiding. Omdat Yoda de meest wijze Jedi is besloot Kenobi zijn leerling mee te nemen. Op weg naar Dallenor was Skywalker tevreden dat hij eindelijk mee op missie mocht, terwijl Kenobi aan het bedenken was dat hij Skywalker niet moest aanpakken als de doorsnee Jedi Padawan; Zijn pad was anders en was al heel oud in tegenstelling met de andere Padawans. Skywalker begon over zijn leven dat in tegenstelling tot alle andere Jedi anders was met een onzekere toekomst omdat hij een slaaf was. Hij concludeerde dat dit de reden moest zijn waarom de Jedi Raad zo sceptisch was om hem te laten opleiden. Obi-Wan probeerde hem opnieuw gerust te stellen door te zeggen dat de Raad niet perfect was en dat Qui-Gon Jinn hem koos, net zoals hij Kenobi koos. Skywalker was boos dachtende dat  Kenobi nu met hem opgescheept zat omdat Qui-Gon dood was. Voordat Kenobi Anakin kon geruststellen, liep hij weg...

Aangekomen werden ze door de leider van het archeologisch team begroet, die blij was dat ze de holocron eindelijk gingen ophalen. De leider legde uit dat lokale piraten het wouden hebben en dat ze mankracht moest inhuren om het holocron te beschermen. Terwijl Kenobi het artefact ging onderzoeken, bleef Skywalker op de wacht staan voor de mogelijke komst van de piraten. Kenobi leidde af dat het inderdaad een holocron was, maar werd onderbroken door Skywalker, die zei dat de piraten waren teruggekomen. De piraten wisten dat het artefact veel waard was nu dat buitenlanders zelfs naar hier komen om het te bemachtigen. De piraten wouden niet onderhandelen en Kenobi beval Skywalker achter hem te blijven. Een vuurgevecht brak uit en de piratenleider kon Skywalker gijzelen. Hij stelde voor Skywalker in te ruilen voor Kenobi’s lightsaber. Echter, Skywalker gebruikte de Force om stenen tegen zijn gijzelaar te gooien. De piraten gaven zich na dit machtsvertoon over aan de Jedi. Anakin verontschuldigde zich later omdat hij onoplettend was en zich heeft laten gijzelen en dacht dat hij inderdaad nog niet klaar was om op missie te gaan, maar Kenobi zei hem dat hij het geweldig had aangepakt en dat het zijn fout was dat hij hem tot dan toe had belemmerd om op missie te gaan. Kenobi liet Skywalker het schip terug naar Coruscant piloteren tot groot jolijt van Skywalker.

#### Toenadering van Palpatine

Zijn beginjaren als Padawan was het aanpassen voor Anakin, die een totaal ander soort leven gewoon was in tegenstelling tot zijn mede-padawans. Maar door zijn unieke speciale talenten werd Skywalker ondanks zijn achtergrond al snel de machtigste padawan van zijn leeftijd en zelfs van de oudere leeftijden. In een sparsessie met een droid, die hij had omgetoverd tot Darth Maul zodat hij Qui-Gon’s dood kon verzachten, waren Windu en Kenobi, die toekeken, geschokt van wat de twaalfjarige Skywalker met de droid had gedaan, terwijl kanselier Palpatine, die ook toekeek, het gewoonweg indrukwekkend vond. Jaloerse padawans roddelden over Skywalker en Sywalker had dat door en kon zijn gevoelens niet bedwingen en bedreigde hen waarna hij besefte dat hij fout was en zijn verontschuldigingen bood. Palpatine zag Skywalker’s worstelingen en omdat hij een speciale band met hem had ontwikkeld sinds hij zijn thuisplaneet hielp bevrijden vroeg hij Windu of hij Skywalker naar zijn bureau kon sturen omdat hij hem wou “helpen”.

In een andere trainingssessie liet Kenobi Skywalker zich verbinden met een beest. Skywalker was niet direct in staat het beest met de Force te kalmeren, maar stond erop geduld uit te oefenen en te wachten tot hij het zou kalmeren. Echter, daar was geen tijd over want Kenobi vertelde Skywalker dat hij een afspraak had met Palpatine. Skywalker was zeer verbaasd dat Palpatine hem wou spreken.

Vermomd nam Palpatine Skywalker mee naar de onderwereld van Coruscant tot aan de beruchte Club Kasakar. Skywalker vroeg zich af wat ze hier deden en Palpatine legde uit dat hij pogingen deed de gruwel en corruptie in de onderwereld aan te pakken als zijn drukke agenda het hem toeliet. Hij legde uit dat in de Club slavernij en corruptie aanwezig was. Zo haalde hij het voorbeeld van senator Colandrus boven; een corrupte senator die geld vraagt aan de werelden onder zijn invloed in ruil voor zijn diensten voor die volkeren als senator. Het geld liet hij in kleine sommen opsturen zodat zijn corruptie zeer moeilijk te bewijzen was. Palpatine wist dat de gokkende en hebzuchtige Colandrus smeergeld zou vragen als hij al zijn geld zou vergokt hebben en vroeg Skywalker de force te gebruiken om de dobbelstenen tegen Colandrus te keren zodat hij zou verliezen en zodat zijn geld op zou zijn zodat hij smeergeld zou vragen dat sporen zou nalaten en makkelijker te bewijzen is als corruptie. Skywalker deed dat en was later in Palpatine’s kantoor verheugd dat Palpatine in staat zou zijn de corrupte senator af te zetten, maar Palpatine legde uit dat het niet zo makkelijk ging, maar bedankte Skywalker dat hij meeging en begon hem steeds meer te bewonderen en te prijzen in de hoop hem ooit naar zich toe te trekken als de tijd rijp is.

#### Missie naar Carnelion IV

Skywalker merkte toch dat hij zich niet helemaal thuis voelde in de Jedi Orde en had het onder meer moeilijk met geduld, belemmeringen van de Jedi en aanpassingen die hij moest maken. Skywalker vertelde Kenobi dan dat hij had besloten een stap opzij te zetten door de Orde (tijdelijk) te verlaten. Kenobi wees hem erop dat dit een beslissing was waar je goed bij moest nadenken, maar Skywalker leek zeker te zijn. Kenobi vertelde het nieuws aan Yoda en dacht dat hij Skywalker had gefaald en nam de schuld op zich. Yoda vond het niet raar dat Skywalker vragen had rond het Jedi-leven gezien zijn achtergrond en stelde Kenobi voor hem met Skywalker op missie te sturen om een noodsignaal te onderzoeken op Carnelion IV. Als Skywalker na die missie nog steeds vastbesloten was om te vertrekken, kon hij gaan.

Skywalker en Kenobi vertrokken dan op missie om een noodsignaal, expliciet naar de Jedi door de unieke frequentie van het signaal, op het afgelegen Carnelion IV na te gaan. Kenobi kon een crash niet voorkomen door het debris field rond de planeet en gebruikten hun schietstoel om veilig te landen. Op zoek naar de bron van het signaal, merkten de Jedi de verlatenheid van de planeet en de ravage van een oorlog vele generaties geleden. Skywalker vroeg waarom de Republiek toen niet had ingegrepen en Kenobi legde uit dat de planeet niet tot de republiek behoorde. Skywalker vroeg zich dan af waarom de Jedi niets deden waarop Kenobi uitlegde dat de Jedi onder de jurisdictie valt van de senaat van de Republiek en dus theoretisch gezien niets konden doen en hij voegde er nog aan toe dat de Jedi moeilijk iedereen in het sterrenstelsel konden helpen.

De Jedi zagen dan een Battle tussen de twee volkeren van de planeet: De Open en de Closed, die al generaties lang in oorlog waren beiden mekaar de schuld gevend van de oorlog. Skywalker wou helpen en Kenobi ging daarmee akkoord, maar stond erop zijn lightsaber te gebruiken gezien het gevaar van de situatie. Skywalker ging aarzelend akkoord en de twee konden met de Force een crashend schip redden waar twee Open mensen inzaten. De twee leken niet dankbaar op de Jedi’s hielp toen ze de Jedi onder schot hielden en vroegen of ze Open of Closed waren. Skywalker legde uit dat ze Jedi waren, maar daar hadden ze nog nooit van gehoord. Net dan viel een Closed ship hen aan en terwijl de anderen zich verstopten kon Kenobi het schip neutraliseren. Skywalker kon de piloot van het schip gelukkig redden, De Closed Grecker waardoor Skywalker Grecker bij Pran en Kolara van de Closed liet brengen. De twee facties hielden elkaar onder schot, maar Skywalker, onder toezicht van Kenobi, sneed hun wapens in twee en Kenobi deed later hun messen weg met de Force, toen ze opnieuw mekaar wouden bekampen. Kenobi besloot met Skywalker de anderen te verlaten in de gedachte dat ze mekaar niet zouden doden zonder wapens en verder op te zoek gaan naar de bron van het signaal. Echter, dat wou zeggen dat ze hen voor dood zouden achterlaten want ofwel zouden ze bevriezen of ze zouden een poging doen zonder wapens de giftige Celadon Zee over te steken: Beiden dodelijk. De Jedi besliste hen te helpen en stelden voor een schip te maken met de nog intacte onderdelen van de gecrashte schepen.

Hoewel het nieuwe schip zowel Open als Closed onderdelen nodig had, gingen beide facties hiermee toch akkoord. Net dan kwamen inheemse lijkenzuigers tevoorschijn die Skywalker doodde, hoewel hij eerst tevergeefs had geprobeerde ze met de Force weg te jagen. Een schip kon gemaakt worden en onderweg naar de bron van het signaal viel het Kenobi op dat het moment dat ze de Open en de Closed hadden gezegd waarom ze hier waren, dat ze plots hulpvol waren. Terwijl Kenobi en Grecker het onderweg hadden over de kwaliteiten van Anakin, het Jedi-leven en Skywalker’s redenen om de Order te verlaten, begonnen Kolara en Pran van de Open in te zien dat Anakin uitzonderlijk goed was in het maken van dingen en het bezig zijn met technologie. Zo liet Pran Skywalker een paar processors maken dat ze nodig had voor haar moordmachine. Skywalker slaagde erin het te maken en Kolara & Pran besloten om Skywalker mee te nemen naar hun hoofdkwartier zodat ze hem konden gebruiken technologie te maken om de oorlog naar zich toe te trekken.

Dat moment kwam er toen het schip in chaos vertoefde toen het door vissers werd aangevallen en geboard. In het tumult konden de twee van de Open Skywalker kidnappen en konden ze in een speeder vluchten. Kenobi, die de vissers probeerde af te houden, zag te laat dat de Open hen had verraden en Skywalker hadden gekidnapt. Pran besloot ook het schip waar Grecker en Kenobi nog in zaten aan flarden te schieten zodat ze hen niet zouden volgen om wraak te nemen. Kenobi en Grecker konden zich echter van het schip redden en gingen te voet verder. Kenobi vroeg Grecker  waar ze Anakin hadden meegenomen, maar Grecker zei hem dat het onmogelijk is hem terug te vinden in alle bases van de Open. Kenobi was er dan van overtuigd dat hij Skywalker niet moest zoeken omdat Anakin ook de coordinaten had van de bron van het signaal en dat hij naar daar zou gaan. Ondertussen in de thuishaven van de Open deelde Pran met de rest van haar mannen mee dat haar moordmachine operationeel is door het toedoen van Anakin en dat ze de oorlog zullen winnen.

Ondertussen in de thuishaven van de Open deelde Pran met de rest van haar mannen mee dat haar moordmachine operationeel is door het toedoen van Anakin en dat ze de oorlog zullen winnen. Ondertussen kwamen Grecker en Kenobi aan bij de oorsprong van het signaal, maar werden aangevallen door twee reusachtige beesten. Grecker had een vuurpijl in de lucht geschoten om zijn mannen de locatie van degene die het signaal had verstuurd te geven zodat ze haar konden doden. Zowel de Open en Closed wisten op het moment dat Kenobi over een signaal begon dat het de “verzamelaar” was die het signaal had verstuurd. Beide facties wouden deze verzamelaar doden want zij wou de oorlog doen stoppen en hun land terug te herstellen door de jongeren hoop te geven door ze steeds kunst en mooie objecten te sturen. De ouderen van de Open en de Closed wouden natuurlijk niet dat hun kinderen afgeleid werden door deze kunst omdat het cruciaal kon zijn in het winnen of verliezen van de oorlog. De facties wisten niet waar de verzamelaar haar schuilplaats gelegen was en daar kwam nu verandering in. De verzamelaar heette Sera en legde Kenobi later haar motieven uit en zei hem dat ze opnames had gevonden van machtige krijgers met lichtzwaarden die veel konden doden en instructies over de Jedi Order en hoe ze op te roepen. Ze zei Kenobi dat zij te oud is om nog verandering te brengen in de wereld en riep daarom de hulp in van de Jedi om hen te overtuigen deze wereld terug te redden.

Ondertussen werd Anakin door moeder Plan overtuigd de locatie van het noodsignaal te onthullen in de hoop dat hij mee kon om Kenobi te redden. Echter, Anakin moest met de jongeren bij de base blijven. De jongeren twijfelden of dat ze niet in actie moesten schieten en de “verzamelaar” te redden aangezien de jongeren in de ban waren van de kunst en niet wouden dat de “verzamelaar” gedood werd. Anakin overtuigde hem dat te doen en hem los te maken zodat hij een schip kon maken om naar de verzamelaar’s schuilplaats te gaan aangezien al de schepen meegenomen werden door de ouderen. Sera vroeg intussen Kenobi haar taak over te nemen, maar Kenobi had door dat de opnames gingen over de Sith aangezien de Jedi niet moorden en de Sith wel. Dan werden ze aangevallen door de Closed die de vuurpijl hadden gevolgd. Kenobi probeerde de aanval te stoppen, maar dan kwamen de Open aan die zich in de strijd gooide. Even later kwamen Anakin en de jongeren aan en gingen naar Kenobi en Sera. Kenobi nam Anakin mee naar binnen in de schuilplaats van Sera, waar hij hem vroeg een communicatie-module te repareren zodat Kenobi de Jedi Order kon contacteren om hen te helpen een eind te maken aan deze oorlog. Kenobi contacteerde de Republiek met als reden dat ze een hoge concentratie aan Tibanna-gas hadden ontdekt zodat de Orde en de Republiek zou komen om het gas te onderzoeken en te verzekeren. Kenobi wist dat het onderzoek van Tibanna gas tijd in beslag zou nemen en dat in de tussentijd de Orde niet zou toestaan deze oorlog verder te laten gaan. De Jedi en de Republiek konden de oorlog beëindigen en de missie had Skywalker op andere gedachten gebracht en besloot de Orde toch niet te verlaten.

#### Les over het Lightsaber

Een paar jaar na de missie op Canrnelion IV, waren Skywalker en Kenobi aan het sparren in de tempel voor de Great Tree. Skywalker vroeg zich af waarom de Jedi enkel het ligbhstaber als wapen hadden en niet bijvoorbeeld blisters of bommen gevoed met kyber cristals. Kenobi nam met de Force Skywalker’s lightsaber en vertelde hem dat, toen hij jong was, het idee had om twee korte lichtzwaarden met elkaar te verbinden door een ketting. leerling Kenobi vertelde Skywalker dan hetzelfde wat Qui-Gon Jinn aan Kenobi had verteld toen hij Qui-Gon zijn speciaal lightsaber liet zien; dat het hanteren van een lichtzwaard intentie toont, waarmee hij bedoelde dat terwijl ze veel schade konden aanrichten met het lightsaber, dat de precisie van het wapen hen in staat stelde dat niet te doen en doelbewust te handelen, dat de gebruiker nadenkt over het hanteren van het wapen voordat hij het trekt, wat het idee versterkt dat Jedi beschermers zijn in plaats van vernietigers, dat het wapen geen moordmachine is zodat het het algemene doel van de Jedi refelcteert; geen macht uitstralen, maar het beschermen van het licht.

### Senator Amidala Beschermen

#### Weerzien met de Senator

Tien jaar na de Slag om Naboo, toen de Separatistische Crisis de Galactische Republiek uit elkaar dreigde te scheuren, werden de ondertussen de 19-jarige Skywalker en zijn meester Obi-Wan Kenobi naar Ansion gestuurd om een grensgeschil op de planeet op te lossen. De Jedi slaagde erin het geschil op te lossen en toen ze terugkeerde naar Coruscant werden de twee op aanvraag van kanselier Palpatine gevraagd om senator Amidala te beschermen, die bijna slachtoffer was van een aanslag op haar leven.

Kenobi en Skywalker werden naar senator Amidala’s appartement gestuurd als extra bescherming voor de geviseerde senator. Skywalker had veel stress Padmé na 10 jaar terug te zien. Skywalker had elke dag aan haar gedacht en zou haar eindelijk terug zien. De twee werden door de vertegenwoordiger van Amidala Jar Jar Binks begroet, die blij was de Jedi terug te zien na 10 jaar. Binks bracht hen naar Amidala, die verheugd was Kenobi terug te zien. Amidala herkende toen Skywalker, die haar complimenteerde. Kenobi verzekerde Amidala dat ze geen last zal ondervinden met hun aanwezigheid. Amidala wou niet dat er gefocust werd op haar beveiliging, maar eerder op wie haar wil doden. Kenobi zei Amidala dat ze hier uitsluitend waren om Amidala te beschermen en niet om een onderzoek te starten. Skywalker verzekerde Padmé echter dat ze zullen uitzoeken wie achter de aanslag zat. Kenobi protesteerde en wees zijn padawan erop binnen hun mandaat te blijven. Skywalker vroeg waarom zei enkel zouden moeten beschermen. Bescherming was volgens Anakin geen taak voor de Jedi maar voor de lokale veiligheidsdiensten. Kenobi wees Skywalker erop exact te doen wat de raad hen had gevraagd. Amidala trok zich terug in haar vertrekken. Anakin geloofde dat Amidala haar amper zag staan, maar Kenobi droeg Skywalker op zich niet op het negatieve te focussen en verzekerde hem dat Amidala meer dan blij was hen te zien alvorens de beveiliging te checken.

#### Tweede Aanslag op Amidala

Diezelfde avond wordt alles sterk beveiligd in Padmé's appartement wanneer Padmé gaat slapen. Obi-Wan merkt dat Padmé de camera’s van haar kamer heeft uitgezet omdat Anakin steeds naar haar keek door de camera’s. In de plaats daarvan liet Padmé R2 in haar kamer plaatsen om alarm te slaan bij gevaar. Obi-Wan merkte dat Padmé zichzelf als lokaas wou gebruiken om de moordenaar te identificeren en vond het plan te riskant om Kenobi en Skywalker buiten te houden ook al konden ze zo goed als alles voelen in Padmé’s slaapkamer. De wacht houdend, had Anakin het over zijn nachtmerries van zijn moeder. Anakin droomde veel liever over Padmé, maar Kenobi wees hem erop op zijn gevoelens te letten want anders zouden deze gevoelens hem verraden en de Jeci Code te breken doordat zijn gevoelens hem verliefd maakte op Padmé. Skywalker en Kenobi begonnen dan over politiek waar Kenobi zei dat senators, zoals Padmé is, enkel de individuen bekoren die hun campagnes financieren en dat ze de democratie in de senaat vaak laten voor wat het is om die financieringen te verkrijgen. Skywalker vond dat Kenobi de politici te hard aan het veralgemenen was omdat hij vond dat Amidala niet zo’n senator was en dat ook Palpatine, waarmee Skywalker ondertussen een goede band mee had, niet corrupt was en dat hij een goede man is voordat hij een verstoring in de Force voelde in Padmé’s kamer. Skywalker dook de kamer binnen en kon net op tijd doodgiftige beesten genaamd kouhuns neutraliseren die Padmé naderden, terwijl Kenobi de vliegdroide zag die de kouhuns had losgelaten en op hem sprong zodat hij de droide kon volgen naar Padmé’s moordenaar. Amidala werd door haar gevolg bijgestaan terwijl Anakin een speeder nam om Kenobi te helpen.

De vliegdroide leidde Kenobi door de drukte van Coruscant heen naar de premiejager Zam Wessel die verantwoordelijk was voor beide aanslagen op Amidala. Wessel zag met haar verrekijker haar droide naderen met Kenobi eraan hangend en schoot met haar sniper de droide kapot waardoor Kenobi naar beneden viel. Gelukkig had Skywalker Kenobi al bijgehaald en kon hem op tijd opvangen in zijn speeder, terwijl Wessel in haar speeder vluchtte. Kenobi vroeg zich af waar Anakin bleef en Skywalker zei dat hij aan het zoeken was naar een snelle speeder met een open cockpit om hem te kunnen opvangen. In de achtervolging toonde Skywalker zijn vliegcapaciteiten, tot ongenoegen van Kenobi die hem te gevaarlijk vond vliegen. Skywalker besloot een binnenweg te nemen om Wessel af te snijden. Door de binnenweg was Skywalker in staat Wessel op te wachten en op haar speeder te springen, terwijl Kenobi in de speeder bleef achtervolgen. Skywalker slaagde erin met zijn lightsaber het glas van de cockpit te breken en de besturing van de speeder te vernietigen waardoor het op ramkoers lag met het oppervlak. Hij verloor wel zijn lightsaber maar die kon de achtervolgende Kenobi grijpen. Voordat het schip de oppervlakte raakte, viel Skywalker van het schip en Wessels speeder crashte verderop. Wessel kon zich verstoppen in de menigte, maar Skywalker kon haar volgen tot aan een club. Daar kwam Kenobi tegemoet die Skywalker zei geduldig te zijn en de Force te gebruiken om Wessel’s acties te voorspellen. Terwijl Kenobi iets ging drinken, zocht Skywalker naar de premiejager. Echter, Wessel had Kenobi in de mot en begon hem te naderen om hem dood te schieten. Kenobi had dit immers door en ontwapende haar om haar vervolgens buiten te ondervragen met Skywalker. Kenobi en Skywalker vroegen wie haar had ingehuurd en nadat ze door Anakin bedreigd werd, was ze van plan te vertellen dat ze werd ingehuurd door de premiejager Jango Fett, maar echter Fett zelf schoot een gifpijl naar Wessel waarin ze instant stierf waardoor de Jedi niet zouden te weten komen over Fett en Dooku.

#### Eerste Individuele Opdracht

De volgende dag werd Kenobi door de raad opgedragen de premiejager op te sporen en achterhalen voor wie hij werkte, terwijl Skywalker zijn eerste individuele opdracht kreeg toegewezen. Windu beval de jonge Skywalker Amidala terug naar haar thuisplaneet Naboo te escorteren en haar daar te beschermen. Windu was ervan overtuigd dat ze daar een stuk veiliger is dan op de hoofdstad van de Republiek. Hij droeg Skywalker op om geen geregistreerd vervoer te gebruiken, maar te reizen als vluchteling. Skywalker was er wel van overtuigd dat het niet simpel zou zijn om Amidala te overtuigen Coruscant te verlaten vanwege de stemming van de Military Creation Act, waar ze de leider is van de oppositie en dus veel invloed zal hebben in de beslissing. Yoda zei Skywalker dat totdat de moordenaar gearresteerd is dat ze het oordel van de raad moet respecteren. Windu wist dat Skywalker een goed punt maakte en droeg daarom Skywalker op om met kanselier Palpatine te praten over deze gecompliceerde zaak en hem te vragen met haar goede vriendin Amidala te praten in de hoop haar te overtuigen om naar Naboo te reizen.

Later in het kantoor van Palpatine beloofde de kanselier dat hij met Amidala ging praten en was hij ervan overtuigd dat Amidala hem niet zou weigeren vanwege hun verleden. Palpatine feliciteerde Skywalker met zijn eerste individuele opdracht en vertelde hem dat hij in Skywalker de meest getalenteerde Jedi zag, nog machtiger dan Yoda.

Op Palpatine’s aanvraag nam Amidala het besluit om het oordeel van de raad op te volgen en dus om naar Naboo te gaan ook al zag ze niet zitten om zich te verschuilen. Terwijl ze haar koffers maakte, liet Amidala haar ongenoegen van het besluit van de Jedi Raad uitschijnen bij Skywalker, die haar op haar gemak wou stellen door te zeggen dat Kenobi rap de premiejager ging ontmaskeren waardoor ze snel kon terugkeren naar Coruscant. Amidala was al een jaar bezig met het verslaan van het senaatsvoorstel en zag niet zitten om op Naboo onder te duiken nu de stemming eindelijk ging plaatsvinden. Padmé zag dat Skywalker volwassen was geworden, terwijl Skywalker vond dat Kenobi dat negeerde. Voor Amidala en Skywalker vertrokken, beloofde Kenobi dat hij de moord zo rap mogelijk ging uitzoeken zodat ze snel terug kon keren. Amidala bedankte Kenobi en vertrok met Skywalker naar de ruimtehaven.

#### Onderduiken op Naboo

Onderweg naar Naboo hadden Amidala en Skywalker over het Jedi-leven. Amidala zou het moeilijk gevonden hebben om niet te gaan waar je wilt of om niet verliefd te mogen zijn. Skywalker zei Amidala echter dat bezit en gehechtheid verboden is, maar dat onvoorwaardelijke liefde de kern van het leven is zowel voor Jedi als niet-Jedi. Amidala zag dat Skywalker hard veranderd is tegenover de laatste keer dat ze hem zag tien jaar geleden.

Amidala en Skywalker kwamen later aan op Naboo. Op weg naar Theed Royal Palace reflecteerde Amidala over haar termijn als koningin en het feit dat ze het aanbod van haar opvolger om senator te worden niet kon weigeren. Skywalker vond dat Reilata gelijk had. Hij vond dat de Republiek nood had aan mensen zoals Padmé en was blij dat Amidala het aanbod accepteerde. In het paleis van Theed besprak Amidala met de koningin en de Royal Advisary Council de crisissituatie  in de Republiek. Toen ze het dan hadden over Padmé's veiligheid vroeg gouverneur Bibble aan Anakin wat hij voorstelde, maar Amidala onderbrak de gouverneur en zei hem dat Skywalker nog maar een padawan was waarna ze zelf voorstelde naar het Lake Country te gaan omdat het redelijk afgelegen is. Skywalker voelde zich op zijn tenen getrapt en zei Amidala dat hij verantwoordelijk was voor haar beveiliging. Amidala vertelde Anakin dat ze op haar thuiswereld onderduiken juist omdat ze het hier zo goed kende en dat het wijs zou zijn om van Amidala's kennis van Naboo gebruik te maken. Een geagiteerde Skywalker ging akkoord met haar en het duo reisde naar het Lake Country.

Padmé en Anakin kwamen later aan in het Lake Country waar ze verbleven in Varykino Villa. Padmé vertelde dat ze hier vroeger op schoolretraite gingen en dat ze hier mooie tijden had beleefd. Skywalker begon Padmé te muilen, maar Padmé vond het verkeerd en trok weg. Later genoten Amidala en Skywalker van het prachtige landschap van Naboo. Amidala vertelde over haar eerste liefde Palo toen ze twaalf was en dat hun wegen scheidden toen Palo besloot zijn carrière in de politiek op te geven en in plaats daarvan kunstenaar te worden. Verder hadden ze het ook over de politiek en het systeem ervan waarbij Skywalker Amidala wat aan het plagen was.

Diezelfde avond gaf Skywalker zijn gevoelens voor Amidala toe aan de senator. Hij legde uit dat de kus hem achtervolgde en dat het hem kwelde niet bij haar te zijn. Ook al had Padmé gevoelens voor Skywalker legde ze uit dat het niet mogelijk was; zij was een senator, Anakin een jedi in opleiding. Ze wou niet dat Anakin zijn toekomst zou opgeven voor haar door zich toe te geven aan zijn gevoelens en dus de jedi code te negeren. Anakin stelde voor hun liefde voor elkaar geheim te houden, maar Padmé vertelde dat ze niet zou kunnen leven met zo’n onmogelijke leugen. Skywalker had door dat Padmé gelijk had.

#### Shmi Redden

Skywalker kon die nacht niet slapen omdat hij een visioen kreeg van zijn moeder. Ze zag dat haar moeder aan het lijden was. Die ochtend vertelde hij Padmé, die doorhad dat Skywalker weer een nachtmerrie had, dat ze haar moeder zag lijden. Ook al hoorde hij Amidala op Naboo te beschermen, voelde Anakin dat hij geen keus had en besloot naar Tatooine te gaan om haar mama te redden en dus zijn mandaat van de jedi raad te negeren. Padmé besloot mee te gaan met Skywalker naar Tatooine.

Op Tatooine gingen de twee naar de eigenaar van Shmi en voormalige eigenaar van Skywalker Watto om te vragen waar Shmi was. Watto had Shmi echter jaren geleden verkocht aan een vochtboer Cliegg Lars, die Shmi dus had bevrijd en ermee was gehuwd. Na Watto hem de locatie gaf, vertrokken Padmé en Skywalker naar het verre Mos Eisley. Skywalker en Amidala kwamen later aan bij de woning van Cliegg Lars. Het duo kwam C-3PO tegen, de droide die Skywalker jaren geleden had gemaakt. 3PO was verheugd om Skywalker en Padmé, die ze nog herkende van 10 jaar geleden, terug te zien en begeleidde hen naar binnen waar Skywalker kennis maakte met zijn stiefbroer Owen Lars. Wanneer Skywalker vroeg achter zijn moeder onderbrak Cliegg Lars hen en vertelde hij het treurige nieuws dat Shmi een maand geleden gekidnapt werd door Tusken Raiders toen ze paddenstoelen aan het plukken was. Lars zei dat hij er alles aan deed haar terug te brengen, maar na zijn been verloren te hebben alsook een twintigtal van zijn mannen had hij de moed opgegeven. Een wanhopige Skywalker besloot zelf dan maar zijn moeder te zoeken. Skywalker zei Amidala hier te blijven, maar verzekerde haar dat ze hier veilig is en omringd is met vreedzame mensen.

In de zanden van Tatooine reisde Skywalker met een speeder op zoek naar Shmi. Skywalker wist tegen de avond door hulp van Jawas het tuskenkamp te vinden waar Shmi vast werd gehouden. Skywalker voelde met de Force de aanwezigheid van haar moeder en sneed met zijn lightsaber één van de tenten door. Daar zag ze haar moeder lijden en ze verloste haar. Maar het was te laat; Shmi herkende zijn zoon en was trots op hem, maar stierf enkele momenten later. Skywalker werd gevoed door woede en haat en slachtte alle Tusken Raiders af zelfs de moeders en de kinderen waarbij hij vol overgave toegaf aan de Dark Side of the Force.

Skywalker bracht Shmi’s lichaam terug naar Lars’ Homestead om het te begraven. Amidala probeerde Skywalker te troosten en gaf hem te eten. Skywalker was teleurgesteld in zichzelf dat hij Shmi niet kon redden en ging vervolgens helemaal tekeer waarbij hij Obi-Wan de schuld gaf en zei dat hij de machtigste jedi aller tijden ging worden en de mensen ging laten stoppen van doodgaan. Amidala zag Skywalker’s worstelingen en vroeg wat er in zich speelde. Skywalker gaf dan toe dat hij uit haat en verdriet alle tusken raiders had gedood inclusief vrouwen en kinderen. Amidala zei dat het menselijk was om woedend te zijn, maar Skywalker was een jedi en zag in dat hij beter had moeten weten.

Op de begrafenis beloofde Skywalker zijn moeder dat hij ondanks zijn onkunde haar te redden niet meer ging falen. R2-D2 verstoorde echter de begrafenis; hij kwam met een urgent bericht van Obi-Wan. Skywalker en Amidala beluisterde het bericht van Kenobi op het schip. In het bericht droeg Kenobi zijn padawan op dit bericht door te sturen naar de republiek op Coruscant aangezien zijn zender beschadigd was en het zelf niet kon versturen. In het bericht informeerde Kenobi dat viceroy Nute Gunray de moord op Amidala had bevolen en dat de grote galactische corporaties zoals de Commerce Guild en de Corporate Alliance via een verdrag akkoord zijn gegaan om hun legers in dienst te stellen aan Dooku en de separatisten. In het bericht werd gezien dat Kenobi vervolgens aangevallen werd door droideka’s.

#### Kenobi Redden

Windu besloot met een groep Jedi naar Geonosis te gaan om Kenobi te redden en om Dooku’s intenties te achterhalen. Windu droeg Skywalker op Amidala verder te beschermen en te blijven waar hij was. Amidala was het niet eens met Windu’s orders aan Skywalker aangezien Windu nooit op tijd ging zijn om Kenobi te redden omdat hij het halve sterrenstelsel moest doorreizen om Geonosis te bereiken, terwijl zij en Skywalker niet eens een parsec verwijderd zijn van Geonosis. Hoe graag Skywalker Kenobi wou redden, bleef hij rationeel en was hij van plan Windu’s orders op te volgen. Een koppige Amidala was vastberaden om Kenobi te redden en zei Skywalker dat hij wel mee moest als hij Amidala wou beschermen en zijn bevel ging opvolgen.

Amidala en Skywalker maakten de korte reis naar Geonosis en landden hun schip in een uitlaatklep van stoom zodat hun schip ongedetecteerd bleef. In de hoop nog een diplomatische oplossing te vinden droeg Amidala Skywalker op haar leiding te volgen. Amidala en Skywalker werden al snel aangevallen door lokale en vijandige Geonosians. Dit leidde het paar verderop te vluchten tot ze uitkwamen op één van de droidfabrieken van Geonosis. In het tumult werden de twee van elkaar gescheiden. Skywalker probeerde zich koste wat kost terug naar Padmé te begeven om haar te beschermen van de gevaren van de fabrieken, maar had zelf zijn handen vol met de fabrieksmechanismen. Skywalker's lightsaber werd beschadigd door de fabrieksmechanismen en werd later omsingeld door Jango Fett en droideka's. Ook Amidala werd omsingeld door geonosians.

Amidala en Skywalker werden net zoals Obi-Wan door aartshertog Poggle the Lesser ter dood veroordeeld voor spionage. Voor de executie verklaarde Amidala haar liefde aan Skywalker, die dacht dat ze hadden afgesproken niet verliefd te worden aangezien het leven met een leugen hun leven zou kapotmaken. Amidala zei Skywalker dat ze weldra toch gingen sterven en wou voordat ze stierf Anakin laten weten dat ze met heel haar hart van Skywalker hield.

De twee werden klaargezet voor hun executie waar Kenobi ook aanwezig was en gepland was voor executie. Kenobi maakte op dat Skywalker zijn bericht had ontvangen door het feit dat hij hier plots op Geonosis opdook. Skywalker legde uit dat hij zijn bericht had doorgestuurd naar de Republiek zoals hij had verzocht en dat Amidala en hij besloten hadden om hem te redden omdat ze in tegenstelling tot de Republiek op Coruscant in de buurt waren. Amidala was in staat haar handboeien door middel van een handigheidje los te maken voordat drie levensgevaarlijke beesten de arena betraden, die ingezet gingen worden voor de executie om Amidala en de Jedi aan te vallen zodat het naast een executie ook volgens de geonosiaanse traditie een spektakel zou worden voor de toeschouwers. De executie werd toegezien door Poggle, Dooku en Gunray.

#### Van Executie naar Oorlog

De Jedi en de vindingrijke Amidala wisten allen op hun eigen, creatieve manier stand te houden tegen de beesten, tot ongenoegen van Gunray die Amidala maar al te graag dood wou en beval Fett Amidala te doden. Dooku zei hem geduld uit te oefenen en verzekerde hem dat Amidala heus ging sterven. Het einde leek voor de drie nabij toen droideka’s de arena binnenstormde en het drietal omsingelde. Maar de Jedi Task Force onder leiding van Windu waren in de tussentijd op Geonosis gearriveerd en waren in de arena geïnfiltreerd. In een poging Kenobi en co te redden, hield Windu Fett gegijzeld en benaderde Dooku om hem te arresteren en een eind te maken aan dit alles. Dooku was verrast van zijn présence en vond het een dwaze zet van Windu om tot hier te komen omdat hij ervan overtuigd was dat Windu in de minderheid zou zijn alvorens Windu aangevallen werd door super battle droids en Jango Fett.

De aanval op Windu was de start van een enorme veldslag. Bataljons van battle droids betraden de arena en namen het op tegen een tweehonderdtal jedi. Skywalker en Kenobi kregen van hun jedi-collegas een nieuw lightsaber en mengden zich net zoals Amidala, die een blaster bemachtigde, mee in de strijd. Amidala stond haar mannetje tussen de Jedi en werkte goed samen met Skywalker tijdens het gevecht. Dooku bleek gelijk te hebben wanneer zijn droidleger de Jedi begonnen te overrompelen. De tweehonderd jedi werden na verloop van tijd in het nauw gedreven; van het tweehonderdtal dat was afgereisd naar Geonosis bleven nog een vijftiental over. De jedi en Amidala werden omsingeld en Dooku liet het gevuur ophouden om de overlevende Jedi de mogelijkheid te geven om zich aan Dooku over te geven. De moedige Windu wist dat overgeven aan Dooku’s beweging inhield dat Dooku hen als gijzelaars ging gebruiken om eisen aan de Republiek te stellen. Maar net dan arriveerde master Yoda met de eerste eenheden van het cloneleger en wist hij de overlevende Jedi in de Republic Gunships te evacueren weg van de overvolle executie arena.

De strijd woedde verder buiten de arena op verschillende fronten. Om de net ontketende oorlog al meteen te beëindigen was het voor de Republiek zaak om ofwel de ganse separatistische strijdmacht uit te schakelen dan wel om het hoofd van de separatisten Count Dooku gevangen te nemen. De enorme republikeinse strijdmacht slaagde erin tal van commandoschepen van onder meer de Federation en de Techno Union te vernietigen, terwijl de geschokte separatistenleiders in het commandocenter het plots enorme leger van de Republiek bespraken. Hoewel beide partijen zware verliezen leden, was het na verloop van tijd toch de Republiek dat de overhand kreeg en de separatisten terugdrong. De separatistenleiders beseften het overwicht van de Republiek en Poggle beval de aftocht van hun strijdkrachten in de hoop zoveel mogelijk van hun schepen en artillerie te recupereren.

Terwijl het cloneleger de separatisten verder terugdrong, zag het gunship met Amidala, Skywalker en Kenobi erin plots Dooku op een speeder begeleid door twee escortes. In een poging Dooku aan te houden achtervolgden ze Dooku, maar konden Dooku niet uitschakelen want de artillerie was op. Dooku liet zijn twee escortschepen het gunship onder vuur nemen, waardoor Amidala de controle verloor en van het schiep viel. Gelukkig voor haar kon ze zacht landen op het zand en werd ze meteen door een clone bijgestaan. Skywalker’s persoonlijke gevoelens voor Amidala namen de overhand en beval de piloot het schip te landen zodat hij haar kon redden, maar Kenobi wees dit af omdat Kenobi Dooku niet alleen aan zou kunnen en Anakin dus nodig had om Dooku te stoppen en meteen een einde te maken aan de net begonnen oorlog.

#### Duel met Dooku en Huwelijk

Het gunship volgde Dooku tot aan de hangar, waar Dooku zijn schip klaarmaakte voor vertrek. Dooku’s vertrek werd verstoord door Skywalker en Kenobi. Kenobi stelde Anakin een aanvalstactiek voor, maar Anakin was te woedend op Dooku die hem terecht de schuld gaf van alle gesneuvelde Jedi tijdens de strijd en viel hem meteen aan. Dooku gebruikte force Lightning en Skywalker viel buiten strijd. Dooku waarschuwde Kenobi over zijn sterke krachten en adviseerde Kenobi zich terug te trekken, terwijl hij opnieuw force Lightning gebruikte. Kenobi pareerde de bliksem met zijn lightsaber en begon Dooku vervolgens aan te vallen.

Dooku had duidelijk de overhand en blesseerde Kenobi aan de arm en aan zijn been. Net wanneer Dooku hem de genadeslag ging geven, kwam de herstellende Skywalker tussenbeide. Dooku was verrast van deze wending en duelleerde met Skywalker, die met twee lightsabers duelleerde. Dooku kon al snel één van Skywalker’s lightsabers uitschakelen, maar Skywalker leek niet meteen onder de indruk. Hoewel Skywalker moedig vocht, kon hij niet verhinderen dat Dooku zijn rechterarm afsneed. Echter, Yoda kwam opnieuw Dooku’s feest verstoren. De geblesseerde Skywalker en Kenobi keken toe hoe Yoda een intens duel met Dooku uitvocht. Beseffend dat hij Yoda niet zou kunnen verslaan, gebruikte Dooku de force om een pilaar over Kenobi en Skywalker te stoten zodat Yoda afgeleid werd van het duel om Kenobi en Skywalker te redden van de vallende pilaar. Dit stelde Dooku in staat te ontsnappen in zijn schip. Yoda kon de twee jedi redden, maar Dooku was ontkomen. Yoda zag in hoe ver zijn ex-padawan gevallen was.

Ook al kwam de Republiek er op Geonosis als overwinnaar uit, konden ze de uitbraak van de oorlog niet vermijden. Na de hectische gebeurtenissen op Geonosis keerde senator Amidala terug naar haar thuisplaneet Naboo. Skywalker was mee gegaan met Amidala onder het mom dat hij als escorte diende van Amidala. Maar in werkelijkheid was Skywalker mee met Amidala gegaan om op Naboo stiekem te trouwen en hun liefde tegenover elkaar te vereeuwigen, wat natuurlijk sterk in strijd was met de Jedi-code. Skywalker kon een paar dagen op Naboo blijven om van zijn verwondingen die hij opliep op Geonosis te herstellen. Het stel maakte van de tijd gebruik om op huwelijksreis te gaan alvorens terug te keren naar hun jobs in de tijd van oorlog.

### Clone Wars

#### Jedi Knight

Nog in het prille begin van de oorlog werd Skywalker gepromoveerd tot jedi knight. Aanvakelijk werd dit gedaan omdat er meer jedi generalen nodig waren aan het front van de oorlog, maar uiteindelijk kreeg Skywalker een officiele knighting ceremony. Skywalker had als knight nu de titel van jedi generaal op het slagveld. Als generaal kreeg Skywalker het bevel over het 501st legion met clone captain Rex als zijn first-in-command. De republikeinse kruiser *Resolute* werd Skywalker's persoonlijke vlaggenschip met admiral Wullf Yularen als zijn first-in-command.

#### Bombardement op Cato Neimodia

Skywalker's voormalige meester nu Obi-Wan Kenobi krijgt de opdracht een bomaanslag op Cato Neimodia te onderzoeken en ontdekt dat de aanval de kenmerken draagt van zowel een republiek als een separatistische operatie. Hij brengt deze verontrustende bevinding dat iemand beide kanten van de oorlog manipuleert terug naar Coruscant.

Skywalker vervoegt zich later met zijn voormalige meester naar Cato Neimodia. Op de planeet maakt Skywalker kennis met Asajj Ventress, de nieuwe leerlinge van Count Dooku. De twee duelleren op de neimodiaanse wereld.

#### Battle of Arantara

In het prille begin van de clone war, leidde de oorlog zich naar Arantara waar een helse veldslag werd gestreden tussen de separatisten en de Republiek onder leiding van general Skywalker en clone captain Rex. Rex raakte ernstig gewond, maar Skywalker kwam ter hulp.

#### Siege of Devalok

De oorlog trof ook de planeet Devalok. Hoewel Devalok niets van strategishce waarde te bieden had voor de separatisten, vielen ze toch de planeet binnen en verwoesten ze de planeet en de lokale bevolking die zich hadden verzet tegen de separatisten. De Republiek kwam tussenbeide om deze belegering te stoppen. Jedi generaals Obi-Wan Kenobi en Anakin Skywalker voerden de republikeinse aanval aan op Devalok tegen de separatisten. Maar het bleek al snel duidelijk dat de separatisten de overmacht hadden, waardoor de Republiek werd gedwongen zich terug te trekken. In de hoop zo veel mogelijk van de bevolking te redden, probeerde de Republiek zo veel mogelijk lokale burgers te evacueren en hen in hun schepen in veiligheid te brengen. De Republiek slaagde erin duizenden burgers succesvol te evacueren en hen later vermoedelijk naar vluchtelingenkampen te brengen.

#### Missie op Benglor

Later werd Skywalker met zijn 501st legion ingezet om separatistenactiviteit te onderzoeken op de stikhete planeet Benglor. Het team probeerde te achterhalen wat de separatisten uitstaken op de planeet, maar kregen enorm veel last van de hitte en vroegen zich daarom af waarom de separatisten een planeet als deze zouden kiezen om een operatie te voeren. Rex’s clones vonden één voor één delen van battle droids, zo ook de clone Bellow, die plots door een gevaarlijk wezen aangevallen werd en opgegeten. De clones vuurden op het beest, maar Skywalker, die bemerkte dat het een val was van het beest om de clones via de delen van de droids te lokken en hen zo op te kunnen eten, zag het gevaar in het wezen en beval zijn mannen zich terug te trekken. Rex bracht zijn mannen in veiligheid op Hardase na die Bellow per se wou wreken. Skywalker redde Hardcase van ondergang en confronteerde het beest. Skywalker slaagde er niet in het beest eigenhandig uit te schakelen, maar gelukkig kwam Rex, die zijn mannen ondertussen in veiligheid had gebracht, ter hulp en samen konden ze het beest doden. Rex was Skywalker dankbaar voor het redden van Hardcase waarop Skywalker zei dat onder zijn leiding niemand achtergelaten wordt.

#### Siege of Hisseen

De oorlog bereikte ook de Mid Rim planeet Hisseen. De separatisten onder leiding van Dooku belegerde de planeet op zoek naar het parlement, dat de planeet regeerde. Om de volledige controle over de planeet te bemachtigen, moest Dooku de parlementsleden opzij schuiven. Dooku wist de locatie van de leden te achterhalen door de premier te dwingen onthullen waar ze waren. Als reactie op deze grootschalige belegering, werd Skywalker samen met jedi generals Plo Koon en Obi-Wan Kenobi met hun respectievelijke clone-eenheden naar Hisseen gezonden om een einde te maken aan deze belegering van de separatisten.

De clonetroepen onder leiding van Cody, Wolffe en Rex wisten met de hulp van de jedi een golf separatistendroids te overmeesteren waardoor ze een rustmoment kregen en de huidige situatie konden bespreken. Koon vertelde dat ze te weten waren gekomen dat Dooku met haar leerling Ventress een ontmoeting hadden geregeld met de premier van Hisseen. Kenobi wist dat waneer de premier de locatie van het Hisseen Parliament zou onthullen aan Dooku, dat Dooku de regering zou ontbinden en dus controle zou krijgen over de planeet. Terwijl de Jedi een poging waagden Dooku te stoppen, werden de clones opgedragen ter plaatse te blijven om de burgers te beschermen van separatisten.

Bij het bereiken van de ontmoeting tussen Dooku en de premier, brak een duel uit tussen en Skwyalker Kenobi tegen Dooku en Ventress, terwijl Koon Wolffe via hologram contacteerde om hem te zeggen dat ze de coordinaten van het parlement hadden, maar dat ze hun handen vol handen met Dooku en Ventress. Koon wou Wolffe dus opdragen het Hissieen Parliament op te gaan zoeken voordat de separatisten dat deden aangezien Dooku zijn droids ook al naar het parlement liet sturen. Echter, door de bergen op de planeet werd de communicatie sterk verstoord waardoor Wollfe Koon’s boodschap niet helemaal begreep. Na dit te bespreken met zijn mede-clones kwamen ze tot de correcte bedenking dat Koon hem had opgedragen het Parliament te vinden. De clones besloten de coordinaten op te zoeken.

De clones slaagden erin de parlementsleden te vinden en te bevrijden van separatistische battle droids. De jedi dreven Dooku en Ventress terug die besloten de benen te nemen. De jedi keerden dan terug naar het front om hun clones, die op het punt van omsingelen stonden, bij te staan. Met de jedi terug keerde het tij terug in het voordeel van de Republiek. De separatisten werden helemaal teruggedreven en de clones haddden succesvol de parlementsleden in veiligheid gebracht en weg van de separatisten waardoor ze geen controle over de planeet konden hebben.

#### Plot in de Corvair Sector

Republikeinse troepen onder leiding van general Skywalker en Admiral Yularen gingen later de strijd aan met de separatisten in het Corvair Sector.  Skywalker ging de strijd aan in zijn starfighter en leidde zijn squadron tegen de separatisten. Hoewel de Republiek niet had gerekend op zo’n grote aanwezigheid van separatistische troepen, waren ze toch in staat de strijd naar zich toe te trekken en de separatisten weg te drijven en uit te schakelen.

Na de battle discussieerden Skywalker en Yularen over de strijd. Yularen vertelde dat de separatistische troepen mogelijks kwamen van een nieuwe droidgieterij op de maan Kudo III in de sector, gelokaliseerd door Republic Intelligence. Yularen vertelde dat volgens rapporten en intelligence de lokale kudon in de gieterijen werkten, hoewel ze claimden dat ze neutraal waren. Yularen stelde voor de generatoren te vernietigen dat ervoor zou zorgen dat de hele gieterij vernietigd zou worden. Skywalker was het niet eens met Yularen’s tactiek, want dat hield in dat de lokale kudon zouden sterven. Geadviseerd door Kenobi om zijn instincten te vertrouwen, reisde Skywalker in zijn starfighter naar Kudo III. Daar vernam hij dat de gieterij redelijk verlaten was en dat de kudon als slaven werden gebruikt door de separatisten. Skywalker zag toen in dat het allemaal een val was van de separatisten om de Republiek te laten lijken dat ze onschuldige burgers aanvielen en zo neutrale werelden van zich af zouden slaan door de Republiek op de hoogte te brengen van de gieterij door een space battle te enchaineren in dezelfde sector als de maan waar de gieterij gelegen lag.

#### Battle of Christophsis

Enkele maanden na de uitbraak van de oorlog werd Skywalker met zijn voormalige meester Kenobi naar Christophsis gestuurd. Christophsis werd omwille van haar strategische ligging en haar grondstoffen door de separatisten bezet en ingenomen. De Republiek had al een vreedzame hulpactie onder leiding van senator Organa gestuurd om de bevolking te helpen door voedsel en medicijnen naar het oppervlak te brengen. Een blokkade had er echter voor gezorgd dat Organa's hulpverlening werd opgehouden en kwamen ze op de planeet vast te zitten. Skywalker en Kenobi werden gestuurd om de blokkade te doordringen en de verhongerde bevolking te bevoorraden met voedsel en medicijnen.

Skywalker’s vloot kwam aan en bemerkte dat de blokkade veel groter was dan ze hadden gedacht waardoor ze veel schepen verloren en niet de blokkade konden doordringen. Kenobi kwam later aan en droeg Skywalker op zich terug te trekken en te hergroeperen achter Christophsis’ maan; Kenobi had namelijk een prototype stealth ship meegebracht, een schip dat een cloaking device had waardoor het schip onzichtbaar kon worden en ongemerkt door de blokkade kon. Kenobi beval Skywalker met het stealth ship onbemerkt door de blokkade heen te gaan en de cruciale bevoorradingen af te leveren aan het oppervlak, hoewel Anakin het schip wou gebruiken om op de verassing te spelen en de blokkade langs achteren aan te vallen.

Terwijl Skywalker met het stealth ship door de blokkade heen vloog, begon Trench het vreemd te vrienden dat de Republiek nog steeds achter de maan aan het schuilen was. In een poging de kleine Republikeinse vloot uit hun tent te lokken, liet Trench bommenwerpers naar het oppervlak sturen om Organa en de burgers te elimineren. De wanhopige Organa contacteerde Kenobi om hem te vertellen over de bombardementen en vroeg hen wanhopig om hulp. Kenobi contacteerde dan Skywalker om hem over de situatie in te lichten en zijn missie om de burgers te helpen voort te zetten, terwijl hij met de vloot Trench’s blokkade zou aanvallen om meer bombardementen te verhinderen.

Skywalker realiseerde dat Kenobi met de relatief kleine vloot de blokkade van Trench nooit zou kunnen verwoesten en dat Trench de vloot gewoon van de maan wil lokken om het te vernietigen. Skywalker besloot Kenobi’s bevelen dus te negeren en hun stealth ship te gebruiken om Trench’ slagschip te vernietigen omdat hij geloofde dat het stealth schip daar het best voor uitgerust was. Om hun torpedos te vuren moest het schip wel zijn dekmantel afzetten waardoor ze terug zichtbaar zouden worden. Na hun dekmantel afgezet te hebben vuurde het stealth ship meteen zijn torpedo’s op Trench’s schip. De schilden konden de torpedo’s afweren en Trench beval al hun geschut te concentreren op het stealth schip dat terug in camouflage-modus was.

Trench besloot zijn vijand via het open communicatie kanaal te contacteren om hem te waarschuwen dat hij al te maken had gekregen met dat soort schepen en dat ze in hun opzet zullen falen. Skywalker liet Kenobi onderzoek doen over Trench’s ervaringen en hij bleek de waarheid te spreken. Met Kenobi’s info vermoedde Skywalker dat Trench stealth schepen detecteerde aan de hand van de magnetische afdruk van het schip en dat hij ze dan vuurde met doelzoekende torpedo’s. Skywalker was van plan het schip terug zichtbaar te maken zodat Trench met doelzoekende torpedo’s ging vuren waardoor hij zijn schilden moest uitdoen. Dan zou hij met volle vaart naar de brug van Trench’s schip vliegen zodat de doelzoekende torpedo’s de brug zouden raken in plaats van het stealth schip dat net op tijd zou afwijken. Skywalker’s plan werkte toen Trench in Skywalker’s plan hapte. Anakin had het slagschip uitgeschakeld en kon door de blokkade naar het oppervlak gaan om de voorraden af te leveren, terwijl Kenobi de overige schepen van de blokkade zou aanvallen zonder leiderschap.

Skywalker keerde terug om Kenobi te helpen en samen konden ze de vloot doorduwen en de blokkade, die na Trench’s uitschakeling in complete wanorde was, doorbreken. Nu met hun troepen en artillerie aan grond en na het veroveren van het westelijke deel van de hoofdstad heeft de Republiek tijdelijk een basis opgezet op het heroverde deel van de planeet. In een poging de planeet te bevrijden van separatistische controle, planden Skywalker en Kenobi een hinderlaag om het tij in de veldslag te keren. Skywalker en Kenobi, elk in één van de wolkenkrabbers van de stad, hadden zich klaargezet om een regiment separatisten naar een positie te lokken en ze van bovenuit te beschieten. Echter, de hinderlaag vond nooit plaats toen plots battle droids Kenobi’s positie begonnen te overrompelen. Skywalker zag dat vanuit zijn raam gebeuren en beval clone pilot Hawk om met zij gunship naar Kenobi’s toren te gaan en hen te evacueren. Skywalker en zijn clones gingen dan op creatieve wijze naar Kenobi om hen te assisteren. Kenobi en Skywalker baanden zich een weg naar het dak om opgehaald te worden door Hawk. Voor ze ontsnapten kon één van de clones het hoofd van een tactical droid meenemen in de hoop informatie te vinden over hoe de separatisten van hun positie en hinderlaag afwisten.

In de base bevestigde de droide dat ze afwisten van de hinderlaag en van hun positie voordat het hoofd van het droid het begaf. Hoewel Skywalker meteen dacht aan een breuk in de beveiligingssystemen, vond Kenobi dat onwaarschijnlijk; hij dacht eerder aan een spion die de informatie aan de separatisten heeft doorgegeven. In de hoop het antwoord te vinden op wie de spion is, trokken Skywalker en Kenobi naar de base van de separatisten, terwijl Cody en Rex het beveiligingssysteem gingen verifiëren en de orders kregen om hun missie aan niemand te vertellen; iedereen kon de spion namelijk zijn.

Kenobi en Skywalker waren ondertussen onderweg naar de vijandelijke basis en merkten dat de separatisten die ze passerden hen gewoon doorlieten. De spion had de komst van de jedi aan Ventress laten weten, die van plan was hen in een val te lokken en weg te houden van hun onderzoek naar de spion. De jedi voelden een val toen ook al bij de ingang van het hoofdkwartier geen bewaking was.

In het separatistisch hoofdkwartier werden Skywalker en Kenobi opgewacht door Ventress, die met Skywalker en Kenobi duelleerde. Intussen leken alle troopers van Slick’s squad een geldig alibi te hebben behalve Chopper die met een vaag verhaal afkwam. Na een tijdrekkend duel ontsnapte Ventress aan de jedi en beval hij general Loathsom de stad aan te vallen en de Jedi daarmee op te houden, zodat ze tijd had om de volgende stap van Dooku’s plan uit te voeren. Skywalker en Kenobi waren terug aangekomen bij de base waar Cody en Rex hadden ontdekt dat luitenant Slick de verrader was, die heel de hangar in de tussentijd had vernietigd; enkel de artillerie bleef gespaard.

Zijn orders opvolgend, lanceerde Loathsom een aanval op de hoofdstad. Als reactie op de aanval leidde Kenobi en Skywalker de tegenaanval met hun clones. Uitgeput in middelen, bevolen de twee jedi de vloot voorraden te gaan halen en dus zich terug te trekken uit het systeem.

Een helse strijd was het op het oppervlak, maar de separatisten waren in veel grotere aantallen dus versterking was nodig voor de Republiek en Skywalker en Kenobi begonnen al snel spijt te krijgen dat ze de vloot hadden weggestuurd voor voorraden waardoor ze niet om versterkingen konden vragen omwille van de communicatie black-out. Gelukkig konden de AV-7 kanonnen van de Republiek het tij keren en Loathsom liet als gevolg daarvan zijn leger terugtrekken en het deflector shield aan zetten.

Dan zagen de jedi een republikeins schip in de atmosfeer. De aanwezigheid van het schip hield dus in dat de vloot terug was en dat ze dus versterkingen konden gaan oproepen. Echter niet voorraden, maar een boodschapper, dat de padawan Ahsoka Tano bleek te zijn, kwam uit het schip en informeerde hen over hun nieuwe missie en dat ze moesten terugkeren naar de tempel. Maar de jedi hadden op Christophsis nog hun handen vol en wouden de Republiek om versterkingen vragen, maar dat was vanwege de black-out  en de afwezigheid van de vloot niet mogelijk. Om de tempel te laten weten van de huidige situatie op de planeet en dat ze dus niet in staat waren te vertrekken voor een nieuwe missie konden ze contact maken met de vloot, die net terug was maar al terug ging vertrekken om de voorraden voor de jedi op te halen, die hen met de jedi temple liet doorverbinden. Verbinding kon gemaakt worden en Kenobi legde Yoda uit dat ze niet in staat waren om weg te gaan van Christophsis en de planeet aan de separatisten over te laten en wees op de nood aan versterkingen. Yoda beloofde hen versterkingen, maar dan viel de verbinding weg.

Ook de vloot rond Christopshis werd overrompeld door een nieuw gevormde blokkade en werden genoodzaakt de baan rond Christophsis te verlaten om te hergroeperen en voorraden te gaan halen. Na de transmissie bleek het dat padawan Tano de nieuwe padawan zou worden van Skywalker ondanks hij er niet om één had gevraagd en Kenobi wel.

Na het terugtrekken van Loathsom’s leger bereidden de separatisten een nieuwe aanval voor; Met het energieschild aan zouden ze in de stad oprukken en de Republiek terugdrijven. Het enigste wat de separatissten van een oveerwinning in de weg stond, was het zwaar geschut. Bij de Republiek wisten ze dat het uitschakelen van het schild noodzakelijk was om überhaupt een kans te maken. De kanonnen haalden niets uit tegen het energieschild en de separatistische troepen naderden het zwaar geschut en overrompelden de clones. Kenbi beval Rex en zijn mannen terug te trekken naar het zwaar geschut en deze koste wat kost te verdedigen, terwijl hij de troepen zou vertragen hopend dat het schild dra uitgeschakeld zou worden. Kenobi werd in de minderheid gejaagd en gaf zich over aan Loathsom. Terwijl Loatshom Kenobi beval zijn troepen te laten overgeven, probeerde Kenobi in zijn overgave tijd te rekken. Dat bleek een goed plan te zijn toen Skywalker en Tano op inventieve wijze het schidgenerator konden uitschakelen. De verwarde Loathsom werd toen verrast door Kenobi, die hem gijzelde. Het uitschakelen van het schild keerde helemaal het tij in de strijd in het voordeel van de Republiek. En ook in de ruimte wist de vloot, die terug was met de gevraagde versterkingen waaronder meester Yoda zelf, de blokkade  te doorbreken en de separatistische schepen te laten terugtrekken. Met Loathsom’s overgave en de versterkingen die meehielpen in het vernietigen van het leger, was de overwinning voor de Republiek en het volk van Christophsis een feit.

#### Battle of Teth

Skywalker’s samenwerking met Tano en haar tactieken in de strijd bleken meer dan goed waarna Skywalker na de strijd besloot om Tano als padawan te houden. Yoda legde dan uit over Jabba’s situatie: Jabba's zoon werd ontvoerd en om gebruik te kunnen maken van de Hyperspace routes in Hutt Space, moest de Republiek Jabba's zoon terugbrengen. Hij droeg Skywalker op om met Tano naar Teth te gaan, waar scouts premiejagers van Jabba hadden gevolgd, om Jabba’s zoon te redden, terwijl hij Kenobi beval een verdrag te tekenen met Jabba dat inhield dat ze de hyperspace lanes in Hutt Space mochten gebruiken in ruil voor Jabba’s zoon.

Boven Teth werd Skywalker door de scouts geïnformeerd over hun bevindingen op Teth dat de huttlet vermoedelijk in een klooster gehouden werd dat door battle droids bewaakt werd. Later werd Skywalker door Kenobi gecontacteerd die hem informeerde dat ze één rotatie hadden om de huttlet naar Jabba terug te brengen en dat hij na zijn onderhandelingen naar Teth ging om Skywalker te helpen.

Bij aankomst op Teth werden Skywalker en co meteen door battle droids onder vuur genomen die het klooster bewaakten. De Republiek besloot beneden te landen en zich van daaruit een weg te banen richting het klooster dat hoog op een berg gelegen. Onder leiding van Skywalker raakten de Republikeinse troepen boven en konden ze de overige bataljons battle droids verdrijven en het klooster overnemen. De aanwezigheid van het groot aantal battle droids, deed Skywalker vermoeden dat Dooku en zijn separatisten hier voor iets tussen zitten. Terwijl een squad met Skywalker, Tano en Rex het klooster binnentraden om Jabba’s zoon te vinden, stonden de Republic gunships in positie voor mogelijke aanvallen.

Skywalker’s groep stuitten dan op een protocoldroide, die beweerde de kloosterbewaarder van het klooster te zijn en onthulde dat de battle droids Jabba’s zoon vasthielden op het detentieniveau. Terwijl Skywalker en Ahsoka naar het detentieniveau gingen, bleef de rest van de groep onder leiding van Rex achter bij de ingang om het klooster verder veilig te stellen van mogelijke battle droids. Skywalker en Tano bemerkten door de aanwezige battledroids op het detentieniveau dat het om een separatistische val ging. Met de force vond Skywalker de huttlet in één van de kerkers.

Tano merkte dat de Huttlet er slecht aan toe was. Skywalker stak hem in een rugzak om hem naar zijn kruiser te brengen waar hij behandeld kon worden. Maar onwetend bij Skywalker liet Ventress via haar protocoldroid opnemen hoe Skywalker en Tano de huttlet in een rugzak stopten, precies alsof het leek dat ze hem hadden gekidnapt. Ventress verbond de opname door naar Dooku, die op Tatooine was en hem liet zien aan Jabba. Ventress moest nu de huttlet terug in handen te krijgen en hem te brengen naar Jabba zodat Ventress en de separatisten de ware redders van Jabba zouden zijn. Alles was dus door de separatisten opgezet om de Republiek en de machtige Hutts tegen elkaar op te zetten. Even later kwamen enkele separatistische aircrafts aan op Teth in een poging de huttlet van de Republiek terug te krijgen. Opnieuw brak er een helse strijd los en Skywalker beval zijn padawan met de huttlet naar binnen te gaan en deze in veiligheid te brengen. De separatistische troepen waren met teveel en Skywalker en zijn troepen trokken zich terug in het klooster waar Skywalker uitlegde dat ze hier gingen wachten tot Kenobi’s versterkingen aankwamen. Maar Tano wees haar meester op het feit dat ze weinig tijd hebben totdat de huttlet mogelijk zou sterven. Skywalker gaf Tano gelijk en beval Rex en zijn mannen zo lang mogelijk de separatisten tegen te houden, terwijl Skywalker Tano’s plan ging volgen. Tano liet R2 via een terminal van het klooster verbinden om een andere uitweg te vinden. Bleek dat er nog een verlaten achtergelegen landingsplatform was. De jedi besloten naar daar te gaan en daar een republikeins schip op te roepen.

Skywalker zag dat Kenobi was aangekomen en contacteerde hem om een medisch schip naar zijn locatie te brengen. Echter, zijn aanvraag kwam niet door omdat de separatisten de communicatie lieten verstoren. Skywalker besloot dan Rex te contacteren, die met zijn mannen gevangen was genomen. Skywalker’s oproep zorgde voor tumult waardoor Rex zich van de separatisten kon ontdoen. Skywalker hoorde dat Rex zijn handen vol had en besloot zijn kapitein te vriend bij te staan. Maar toen kwam Ventress aan. Skywalker liet de poort van het platform sluiten, maar Ventress kon er door met haar lightsabers. Tano zag dan plots aan de overkant een ander landingsplatform met een schip weleenswaar. Via lokale vogels konden ze aan Ventress ontkomen en naar het afgelegen platform vliegen.

Skywalker kon het oude schip op het platform laten opstarten. Skywalker wou het schip gebruiken om de clones in de strijd te ondersteunen, maar Tano wees erop dat ze de huttlet naar de dokters op de kruiser moesten brengen.  Skywalker gaf haar padawan gelijk en contacteerde Rex dat ze hem niet konden gaan bijstaan. Het schip waar Skywalker in zat was natuurlijk geen Republikeins schip waardoor de kruiser het zag als een vijandelijk schip en erop vuurde. Na zich geïdentificeerd te hebben aan de kruiser, deed de kruiser zijn schilden uit in de achterste hangar zodat Skywalker kon boarden. Voor ze konden boarden, vernietigden separatistische vulture droids de hangar waardoor Skywalker zelf met het roestschip Tatooine moest zien te halen.

#### Opnieuw naar Tatooine

Skywalker wist te ontsnappen naar Tatooine en gelukkig lagen er nog medische spullen in het schip dat de huttlet beter maakte. Skywalker, die er niet op stond te springen om terug naar Tatooine te gaan, werd dan langs achteren aangevallen door Dooku’s Magnaguards. Skywalker rekende af met de twee aanvalsschepen, maar omdat de achterste schilden het niet deden, werd het schip zwaar beschadigd en werd Skywalker genoodzaakt een crash-landing te maken. Omwille van Skywalker’s buitengewone vliegcapaciteiten, kon hij veilig landen, terwijl Kenobi op Teth de separatisten verdreef.

Het was een lange tocht door de woestijn voor Skywalker en Tano. Na een lange dag wandelen voelden Skywalker en Tano plots de aanwezigheid van de Dark Side. Skywalker besloot op te splitsen en droeg Tano op de huttlet naar Jabba te brengen, terwijl hij achterbleef om Dooku te misleiden. Skywalker trof die nacht Dooku aan, die aankwam met zijn speeder. Dooku beval hem de huttlet over te geven om vervolgens de jedi aan te vallen met Force Lightning. Skywalker had, in tegenstelling tot in Geonosis, nu zijn les wel geleerd en pareerde de bliksem nadat een duel vervolgens uitbrak. Skywalker bood deze keer veel meer weerstand en maakte met de force een zandstorm om hem naar Dooku te gooien. Dooku kaatste de storm met een hogere snelheid terug waardoor Skywalker zijn evenwicht verloor. Dooku nam de overhand en kon de rugzak waar de huttlet in lag door midden snijden, waarna Skywalkers list duidelijk werd voor Dooku. Dooku had echter magnaguards voor het paleis ter plaatse gelaten. Tano moest dus voorbij de drie magnaguards als ze de huttlet tot bij Jabba kon brengen.

Skywalker kon van Dooku vluchten en zijn speeder nemen om Tano bij te staan in het veiligbrengen van de huttlet. Skywalker kwam aan bij het paleis, maar had niet door dat Tano wat verderop haar handen vol had met Dooku’s guards. In het paleis nam Skywalker aan dat Tano nooit gearriveerd was en dat Jabba dacht dat hij hier was om hem te doden. Tano kon uiteindelijk de magnaguards vernietigen en liep naar het paleis waar Jabba zag dat zijn zoon toch nog leefde. Toch beval hij de executie van de jedi, maar net op tijd voor de jedi werd Jabba gecontacteerd door zijn neef Ziro. Niet Ziro, maar Amidala was het aan de andere kant van de lijn. Amidala stelde Ziro’s plot bloot dat hij samenwerkte met Dooku om zijn zoon te stelen en de jedi de schuld ervan te geven in een poging Jabba’s plek als leider van de Hutt Clan over te nemen. Ziro gaf het allemaal toe in de hoop voor clementie van de Republiek. Amidala vroeg dan Jabba of de Republiek gebruik mocht maken van de Hutt hyperpace routes zodat de Republiek de separatisten konden gaan stoppen en Dooku voor het gerecht kon brengen. Jabba stemde toe en een verdrag zou getekend worden hopend dat de Republiek Dooku, die zijn eigenste zoon had ontvoerd, voor het gerecht zou brengen.

#### Reddingsmissie naar Abregado

Skywalker was later met zijn vloot gestationeerd in het Byth System om te assisteren in het beschermen en escorteren van republikeinse voorraadkonvooien naar het rendez-vous punt. Skywalker werd daar gecontacteerd door general Koon, die in het Abregado System het nieuwe wapen van de separatisten had opgespoord, de *Malevolence*: een enorm slagschip uitgerust met een ionenkannon dat de energie van omringende schepen kon neutraliseren zodat deze gedestabiliseerde schepen weerloos werden voor een meedogenloze aanval van de *Malevolence*. Koon vroeg om versterkingen in een poging de *Malevolence* voorgoed te vernietigen, maar de comunicatie werd door toedoen van de *Malevolence* verbroken.

Skywalker contacteerde de raad en lichtte hij hen in over Koon's situatie en dat de communicatie uitval waarschijnlijk inhield dat Koon's vloot vernietigd werd. Skywalker vroeg of hij een reddingsmissie mocht starten, maar Skywalker's aanvraag werd geweigerd en werd samen met andere republikeinse vloten toegewezen om de voorraadkonvooien te escorteren en te beschermen. Skywalker besloot tegen de orders van de raad toch naar het Abregado System te gaan en vertrok met de Twilight, zodat zijn vloot wel in formatie bleef als escorte voor de konvooien.

Aangekomen in het systeem liet Skywalker R2 het schip scannen op overlevenden, maar wanneer hij door kanselier Palpatine zelf gecontacteerd werd, die via Obi-Wan die op zijn beurt via Skywalker te weten was gekomen dat hij toch een reddingsmissie was gestart en zo zijn post verliet en het zo in gevaar brengen van anderen waanra hij hem opdroeg terug te keren, besloot Skywalker om te vertrekken totdat Tano Koon met de force had gevoled en de besturing van de Twilight van Skywalker overnam en Koon vond. Skywalker en Tano konden Koon en co redden, die hem op de Twilight vertelde dat het ionkannon van het betreffende schip de energie opzuigt waarna het hen volkomen weerloos maakt. Koon zette meteen alle energiesystemen uit zodat ze niet door de *Malevolence* gedetecteerd konden worden. Koon was echter, de medische droid, die de clones aan het genezen was, vergeten af te zetten waardoor de *Malevolence* hen toch kon opsporen. Skywalker was echter net in staat in hyperpace te springen voor het ionkannon hen had geabsorbeerd.

#### De *Malevolence* Uitschakelen

Terug met de vloot herenigd bracht Skywalker verslag aan de raad en werd hij toegewezen om de *Malevolence* en zijn commandant general Grievous te vernietigen, in de hoop een snel eind te maken aan deze oorlog. Omdat grote kruisers geen greep kregen op de *Malevolence* was Skywalker van plan om met zijn Shadow Squadron van bommenwerpers het ion-kannon met hoge snelheid te omzeilen om dan de brug van het schip samen met Grievous te vernietigen.

Skywalker kreeg te horen dat de *Malevolence* een medisch konvooi had belaagd ter hoogte van Ryndellia. Skywalker bemerkte dat Ryndellia dicht bij Naboo gelegen lag, waar de Republiek het Outer Rim Medical Station voor gewonde clones had gestationeerd en leidde af dat dat station vast het volgende doelwit ging zijn van Grievous. Maar door de aanwezigheid van het Kaliida Nebula moest de *Malevolence* om de nevel heen door hyperspace reizen om het station te bereiken. Om ervoor te zorgen dat zij eerst het Medische station bereikten om het van de *Malevolence* te beschermen, plande Skywalker om een binnenweg te nemen en door de nevel heen te reizen.

Terwijl het squadron onder leiding van Skywalker en vergezeld door Plo Koon de binnenweg gingen nemen door de nevel heen, ging Kenobi en zijn vloot Skywalker vergezellen in het helpen vernietigen van het schip en het evacueren van het station. Het squadron slaagde erin door de nevel heen het station te bereiken, maar net dan arriveerde de Malevolence. Grievous stuurde fighters om het squadron uit te schakelen, terwijl hij het ionenkannon liet prepareren om op vluchtende transportschepen vol geëvacueerden te vuren. Dan beval hij het ionenkannon te richten op het eskader, ook al wad dat dan ook gericht op de separatistische jagers. Het eskader probeerde met volle snelheid net boven de rand te vliegen, maar een deel werd verlamd door het ionkannon. Het eskader naderde met snelheid de brug, maar verliezen werden geleden en op aandringen van Tano wijzigde Skywalker zijn tactiek; niet meer de brug was het doelwit, maar het ion kanon zelf, dat zich prepareerde om nu het medisch station te vernietigen. Skywalker en zijn mannen slaagde erin het ionkannon te verhitten en daardoor ook de hyperdrive te beschadigen.

De beschadigde Malevolence was op de vlucht van de Republikeinse vloot, maar door de beschadigde hyperdrive konden ze niet de sprong maken. Maar door de enorme omvang van het schip was de republikeinse vloot niet in staat het schip om te brengen, dus vroegen ze naar versterkingen bij de nabije general Unduli, maar zij was zelf bezig met het uitschakelen van een separatistische vloot.

De republikeinse vloot stopte echter met vuren toen ze een schip van Naboo hadden opgepikt recht naast de Malevolence. Na contact te leggen met het schip bleek het senator Amidala te zijn, die

Amidala’s schip werd echter door de tractor beam in de Malevoence getrokken. Amidala kwam dan door te hebben dat het allemaal een valstrik was.

Skywalker stond erop Amidala te redden en was van plan om achter de Malevolence te sluipen en te koppelen aan een airlock. Hij was ervan overtuigd dat ze niet opgemerkt zouden worden omdat de zware schade aan de Malevolence ervoor had gezorgd dat de sensoren te beschadigd waren om hen op te pikken en daarbij zouden ze niet bezig zijn met het oppikken van schepen, maar met het repareren van hun schip.

Amidala kon contact leggen met de vloot, die Amidala meteen doorverbond met de comms van Anakin. Via hun signalen konden ze bij de vloot Skywalker, Kenobi en Amidala laten weten hoe ze mekaar konden vinden op het schip. Tussen hen in was er een grote open ruimte waar alle verdiepen samenkwamen. Amidala Skywalker en Kenobi maakten hun weg naar het open centrum om mekaar tegemoet te komen. In het open centrum van het schip, namen Skywalker en Kenobi Amidala waar. Amidala werd door battle droids teruggedrongen. Amidala werd van 3PO gescheiden, maar Skywalker kwam haar ter redding, terwijl Kenobi achter 3PO ging. Amidala vertelde Skywalker dat ze daarstraks Grievous kon afluisteren en te eten komen dat de hyperdrive bijna gefikst was. Ontsnappen was dus geen optie, want zij waren de enige die de hyperdrive nog konden tegenhouden van werking. Kenobi raakte 3PO kwijt en besloot de hyperdrive offline te houden, terwijl Skywalker via R2 3PO liet opsporen.

Anakin en Padmé maakte hun weg naar de brug om de hyperdrive te saboteren en het te laten lijken alsof er niks aan de hand was. Toen Skywalker klaar was en met Padmé vertrok, kwam een groep battle droids binnen en zagen ze dat de brug er netjes uit zag alsook de hyperdrive waardoor ze dachten dat alles gerepareerd waren. Ze hadden de hyperdrive aangezet om te ontsnappen aan de vloot.

Uiteindelijk kwamen Kenobi, Padmé & Anakin en 3PO & R2 allemaal samen voor de Twilight en wisten ze zich te ontkoppelen van het schip. Grievous nam zijn starfighter en achtervolgde de Twilight geescorteerd met vulture droids. De Twilight werd stevig belaagd door Grievous, maar mede door toedoen van Amidala wisten ze zich van Grievous te ontdoen, die de Malevolence de opdracht gaf in hyperspace te springen nu de hyperdrive zogezegd gefikst was. Grievous zag snel dat de hyperdrive gesaboteerd was en dat de navi-computer ingesteld was naar de nabije maan. De Malevolence explodeerde op ramkoers met de maan.

#### Rishi

Na weken intensief bezig te zijn met het opsporen van Grievous, bleef de enige lead op de cyborg in het Balmorra System, maar dat was al van weken geleden. Ondertussen werden Skywalker’s en Kenobi’s clone commanders de opdracht gegeven om het gehele netwerk van luister -en trackingposten te inspecteren in het kwadrant van Kamino. Deze posten monitoren en onderscheppen transmissies en bewegingen in het kwadrant zodat de Republiek altijd op de hoogte was van een mogelijke aanval op het kostbare Kamino. Nadat Cody en Rex het station op Pastil hadden geïnspecteerd, gingen ze vervolgens naar de post in het Rishi System.

Echter, Skywalker en Kenobi vonden het vreemd dat Cody en Rex zich nog steeds niet gerapporteerd hadden. Maar deze anomalie kreeg al rap context, toen ze bij de vloot melding kregen dat het code veilig-signaal van het station was stopgezet. Skywalker en Kenobi dachten meteen dat het Grievous was, die het station wou innemen om zo een verrassingsaanval te lanceren op Kamino. Skywalker en Kenobi vertrokken meteen met hun vloot naar Rishi en lieten het invasiealarm afgaan zodat de troepen op Kamino op de hoogte waren. Aangekomen bij Rishi, namen Skywalker en Kenobi zoals verwacht de separatistenvloot van Grievous waar. Realiserend dat hij in de minderheid was, trok Grievous meteen terug. Op de vloot liet Skywalker de overlevende clones, Fives en Echo, op Rishi promoveren en inwijden tot het 501ste.

#### Battle of Bothawui

Nadat de jedi-raad vernomen had dat het volgende doelwit van Grievous de strategische planeet Bothawui ging zijn, dat intressant was om haar hyperspace routes en daarnaast was het ook een vitale planeet voor Republic Intelligence, aangezien de Bothans bekend stonden als geweldige informanten van de Republiek, werd Skywalker er met zijn vloot gestuurd om de planeet en de sector te beschermen van de komende separatisten en om Grievous op te pakken.

Onderweg naar Bothawui werd Skywalker’s vloot echter verrast door Grievous en zijn manschappen. Skywalker wist te ontkomen en Grievous besloot naar Falleen te trekken om de republikeinse planeet aan te vallen vooraleer naar Bothawui te reizen. Geassisteerd door Dooku en Ventress was Grievous in staat de Republikeinse vloot te vernietigen waarna Falleen in handen van de separatisten viel.

Grievous trok vervolgens met zijn vloot naar Bothawui, waar de republikeinse vloot van Skywalker hem stond op te wachten. Via zijn spionnen wist Grievous dat de Republiek er ging staan en opdat de Republiek niet in het voordeel zou komen, beval hij door het asteroidenveld te gaan om de vloot aan te vallen. Deze tactiek had Skywalker verwacht dus had hij hierop geanticipeerd; hij liet tal van AT-TE’s op de asteroïden positioneren onder leiding van Rex zodat ze de separatisten langs achter konden aanvallen, waar de separatisten kwetsbaar waren aangezien ze al hun energie aan de voorste schilden gaven om door het asteroïdenveld te komen. Skywalker leidde zijn gold squadron in strijd.

Hoewel Grievous in het begin aan de winnende hand was, nam de Republiek over toen Rex en zijn mannen zich in de strijd begonnen te mengen. Grievous besloot in zijn starfighter te ontsnappen, maar werd achtervolgd door Skywalker. In het proces raakte Skywalker’s starfighter beschadigd en Grievous ontsnapte. Skywalker werd gered door Rex, maar R2 was verloren geraakt. Skywalker had R2’s geheugen niet gewist waardoor alle tactieken en bases van de Republiek nog in zijn geheugen stonden. Kenobi beval Skywalker zijn droid te vinden om te voorkomen dat deze in separatistische handen terecht zou komen.

#### Skytop Station Vernietigen

Skywalker's zoektocht had geen succes en ondertussen had intelligence bevestigd dat Grievous op één of andere manier de transmissies van de Republiek kon onderscheppen, wat dus de recente overwinningen van de cyborg verklaarde. Kenobi vermoedde een afluisterpost en droeg Skywalker nu op die post te lokaliseren en R2 te laten voor wat het was. Terwijl Skywalker de Outer Rim ging doorzoeken, gingen Tano en Rex en zijn mannen in het centrum zoeken naar de post. Maar R2’s vervanger deed alles verkeerd en had per ongeluk het opsporingsbaken aangezet, waardoor Grievous Skywalker kon lokaliseren en met zijn vloot Skywalker bekampte. Gelukkig kwamen Tano en Rex ter redding, die omwille van het opsporingsbaken dachten dat Skywalker in de problemen was.

Echter, een signaal van R2 kwam binnen in de Twilight en droeg rex op het signaal te traceren, ook al was zijn missie niet het redden van R2, maar het opsporen van een separatistische luisterpost. Skywalker bedacht misschien dat R2 op de luisterpost zou kunnen zitten.

Het signaal leidde Skywalker naar de maan Ruusan 2, waar een afgelegen station gelegen lag. Skywalker merkte al snel dat het om de luisterpost ging genaamd Skytop Station, dat de Republiek veel verliezen deed leden en droeg Tano op om met Rex en zijn mannen naar de reactorkamer van het station te gaan om de boel op te blazen, terwijl hij R2 ging zoeken. Grievous was echter op het station en had een scavenger ingehuurd R2 in Bothawui's puinveld te zoeken en hem op Ruusan 2 af te leveren in de hoop dat hij uit het geheugen van R2 vitale informatie kon vinden voor de separatisten. Grievous liet R2 uit elkaar halen en nadat bleek dat er veel nuttige info in de droid zat, liet hij R2 door magnaguards naar zijn schip brengen, maar deze werden onderschept door Skywalker. Skywalker elimineerde alle magnaguards en kon R2 recupereren. Ondertussen hadden Tano en Rex bezoek gekregen van Grievous. Terwijl Tano Rex en zijn mannen beviel door te gaan met het opblazen van het station, duelleerde zij met Grievous om hem af te leiden van Rex.

Rex en zijn mannen hadden intussen de springstof geplaatst en rendezvousde met Skywalker aan de hanger bij de Twilight. Daar werd duidelijk voor Skywalker dat R3 een spion was, toen ze de hangardeuren liet sluiten en vultredroids lanceerde. Skywalker beval Rex de ontsteker te drukken, ook al waren ze nog in het station. Vertrouwend op Skywalker’s instincten liet Rex de boel opblazen en hield hij met Skywalker en later Tano, die ternauwernood van Grievous kon ontsnappen, de separatistische weerstand af. Door toedoen van R2 gingen de hangardeuren terug open en konden ze ontsnappen voordat het station verwoest werd. Grievous was bewust van de dreiging en maakte ook zijn ontsnapping, het station en R2 verliezend.

#### Gunray's Arrestatie

Later werd Skywalker's padawan Ahsoka samen met meester Luminara Unduli toegewezen om beduidende separatistenleider en viceroy van de Trade Federation Nute Gunray van Rodia, waar hij door senator Amidala en Farr gearresteerd werd, naar Coruscant te escorteren en te beveiligen van een mogelijke separatistische reddingsmissie; Gunray was één van de leiders van de separatisten en had dus ongetwijfeld veel nuttige info voor de Republiek. Daarom bedachte de Republiekdat de separatisten weleens Gunray zouden redden om ervoor te zorgen dat hij niet zou praten. En inderdaad, een separatistisch contingent onder leiding van Asajj Ventress ondernam een reddingspoging. Tano en Unduli konden uiteindelijk niet verhinderen dat Gunray kon ontsnappen met Ventress.

Skywalker werd door Tano geinformeerd over Gunray's ontsnapping, maar wel in een republikeins schip. Dat stelde de Republiek in staat het schip te traceren via het republikeins baken op het schip. Het baken was ondertussen gesignaleerd nabij meester Kit Fisto’s vloot en werd hem gevraagd het baken te volgen. Uiteindelijk bleek het een val van Dooku te zijn. Hij liet de jedi naar het baken lokken, maar Gunray was allang weg van het baken en veilig. In de plaats van Gunray was het baken geplaatst in Grievous schuilplaats. Dooku wou omwille van Grievous' recente nederlagen hem laten testen tegen de jedi om zijn waarde te bewijzen om het droidenleger te leiden. Toen Grievous later aankwam wed hij zoals Dooku plande belaagd door de jedi. Fisto overleefde en ontsnapte, maar zijn voormalige padawan Nahdar Vebb, die mee was, werd door Grievous gedood.

#### Spoor van Dooku

De Republiek kreeg een lead van Dooku’s locatie op een separatisten fregat. De Republiek plande om Skywalker naar dat fregat te sturen en zich daar te laten gevangennemen zodat Skywalker op die manier kon achterhalen of Dooku daar wel degelijk was. Hij vertrok zonder lightsaber zodat zijn gevangenname geloofwaardig leek. Dan zou meester Kenobi Skywalker’s laatst bekende locatie volgen om er Skywalker te bevrijden en samen Dooku te grijpen samen met de assistentie van Skywalker’s vloot dat mee naar de locatie zou gaan.

Skywalker kwam te weten dat Dooku wel degelijk in het schip was voordat hij volgens plan werd gevangengenomen. Kenobi infiltreerde dan volgens het plan schip en nahef bevrijden van Skywalker, vonden ze een mediterende Dooku. Dooku leek omsingeld met de twee jedi voor hem en Skywalker’s kruiser dat was aangekomen en zijn fregat aan diggelen schoot. Dooku ontsnapte echter via een schacht onder hem dat met zijn meditatiestoel wasverbonden naar zijn solar sailer. Skywalker en Kenobi achtervolgden Dooku tot aan de hangar waar ze Dooku met een separatistische shuttle probeerden achter na te gaan. Zowel Dooku’s schip als Skywalker’s shuttle werden in de achtervolging beschadigd waarna beide schepen neerstortten op de nabije planeet Vanqor.

Op Vanqor zag Skywalker dat Dooku op zijn schip een homing beacon had geplaatst zodat versterkingen hem van deze planeet konden helpen. Skywalker vernietigde dit om dat te verhinderen alvorens door Dooku zelf ingesloten te worden in een grot met Gundarks. Net op tijd werden Skywalker en Kenobi door Tano en co gered waarna ze de opdracht hadden gekregen om naar het nabije Florrum te gaan om na te gaan of een piratenbende onder leidng van Hondo Ohnaka Dooku vasthield. De Republiek was van plan Dooku in te ruilen voor een fikse som credits met de piraten in de hoop de oorlog te beeindigen met Dooku's arrestatie.

#### Gevangen op Florrum

Aangekomen op Florrum werden ze door Ohnaka verwelkomt, die hen Dooku liet zien in een cel. Dooku was er degelijk in levende lijve en de jedi contacteerden Palpatine om hem te laten weten dat Dooku hier wel degelijk zat. Palpatine stuurde twee republikeinse afgevaardigden met het losgeld naar Florrum om de ruil vredevol te voltooien. Voordat Skywalker en Kenobi terug konden vertrekken, stond Ohnaka erop dat ze het feestmaal zouden bijwonen. Hoewel de jedi het niet vertrouwden, hadden ze geen keus en woonden ze het banket bij. Kenobi’s argwaan bleek terecht, want de piraten hadden hen gedrogeerd en waren van plan hen ook voor losgeld te verkopen. De jedi werden vastgeketend aan Dooku in afwachting van de republikeinse afgevaardigden onder leiding van senator Kharrus en Binks met het losgeld.

Skywalker en Kenobi met Dooku porbeerden samen te werken om te ontsnappen, maar tevergeefs. En wanneer Ohnaka te horen had gekregen dat de Republiek hem volgens zijn aanhanger zogenaamd had verraden liet hij tanks om de republikeinse delegatie aan te vallen, terwijl hij wraak op de jedi nam door hen te folteren. Het tij keerde toen de republikeinse delegatie de stroom had uitgeschakeld waardoor Skywalker Ohnaka kon gijzelen, maar net dan kwam de delegatie met Binks en clones, Kharrus was echter omgekomen, die na het verraad van de piraten de ruil nog steeds wouden voltooien. Echter, Dooku was in de chaos eigenhandig ontsnapt van Florrum. Kenobi besloot Hondo niet te arresteren in de hoop dat de piraten de Republiek daardoor niet lastig zouden vallen en Kenobi waarschuwde dat de separatisten en Dooku zijn locatie nu kenden en misschien wel wraak zouden nemen op het gevangennemen van Dooku.

Wanneer Windu een gebrek aan communicatie op de planeet Ridlay ging onderzoeken, contacteerde Skywalker Windu in verband met zijn missie. Omdat hij niet ver was kon hij met Ahsoka Windu assisteren in zijn missie, maar dat was niet nodig volgens Windu.

#### Battle of Quell

Later werd op de planeet Quell een helse battle uitgevochten tussen de separatisten en een republikeinse vloot onder leiding van jedi generaal Secura. Skywalker kreeg te horen dat Secura zware verliezen leed en besloot om met zijn kruiser de *Resolute* naar Quell te gaan om Secura te assisteren. Toen Skywalker aankwam bleef enkel nog de leidinggevende kruiser van Secura’s vloot de *Liberty* over. Skywalker realiseerde dat de nederlaag een feit was en dat het enige wat hij nog kon doen was Secura en haar mannen redden. Met republic gunships enterden Skywalker en zijn troepen de zwaar beschadigde kruiser *Liberty.* Skywalker beval één van de consulaire schepen van de *Resolute* te laten dokken aan de *Liberty* waaruit ze konden wegkomen.

Skywalker was in staat Secura, haar first-in-dommand clone commander Bly en enkele troopers aan boord te brengen, maar werd daarbij wel zwaar gewond. Toen ze dan op hun beurt het schip probeerden te dokken aan de *Resolute* om te ontsnappen werd het schip zwaar geraakt wat ervoor zorgde dat de hyperdrive was geactiveerd. Het schip kon de *Resolute* ontwijken waarna het schip met een zwaargewonde Skywalker in hyperspace sprong.

Echter, de coordinaten die werden ingegeven in de navicomputer als gevolg van het treffen waren gepland op een ster. Om dit te voorkomen moesten ze alle stroom van het schip uitschakelen zodat ze de navicomputer konden resetten en de  coordinaten konden heringeven. Dat zorgde er wel voor dat de helende Skywalker van alle medische hulp tijdelijk werd ontdaan door de stroomuitval en in zijn toestand kon dat wel eens levensgevaarlijk worden

#### Maridun

De groep slaagde er daardoor wel in de ster te ontwijken en het beschadigde schip te crash-landen op de nabije planeet Maridun. Skywalker leefde nog en bleef onder bewaking van Rex achter, terwijl de rest op zoek ging naar medische hulp voor Skywalker op de verlaten planeet. Uiteindelijk vonden ze een nederzetting van Lurmen. Hoewel deze tegen de oorlogsvoering van de clone war waren en tegen het feit dat de jedi zich bestempelden als vredesbewaarders terwijl ze heel de tijd zitten te vechten, stuurden ze een heler mee om Anakin te genezen.

Op Maridun namen Skywalker en co plots een separatist air craft waar. wat vreemd was aangezien de separatisten geen benul hadden dat zij hier waren. Ze waren hier dus voor een andere reden. Op zoek naar de doelen van de separatisten op deze neutrale wereld vonden Skywalker en co later een separatistische basis verderop waar ze zagen dat de separatisten een nieuw wapen aan het testen waren dat al het organische binnen het bereik van het wapen vernietigde, dat terwijl het anorganische zoals machines en droids ongeschonden bleef. De separatisten beseften dat dit wapen wel eens beslissend zou kunnen zijn voor het winnen van de oorlog. De leidinggevende was generaal Lok Durd, die het wapen had ontworpen en deze planeet had gekozen om het te testen.

Durd contacteerde Dooku en vertelde dat het wapen operationeel en effectief was. Dooku vroeg het nu te testen op levende organismen waarna Durd richting de kolonisten ging om het op hun te testen. Om dat te voorkomen infiltreerden de jedi en Rex en Bly de basis om een shuttle te stelen zodat ze op tijd de kolonisten konden waarschuwen en verdedigen. De jedi konden succesvol de base infiltreren en een shuttle stelen en daarbij nog twee shildgenratoren stelen die weleens van pas zouden kunnen komen. Aangekomen bij de kolonisten stonden zij niet toe dat ze zich zouden verdedigen tegen de separatisten omdat het strijdig was met hun filosofie en hun geloof. Skywalker besefte dat hij de kolonisten niet kon dwingen, maar was wel van plan zichzelf te verdedigen en daarbij ‘onrechtsreeks’ de kolonisten. De schildgeneratoren verhinderde dat het nieuwe wapen hen had verwoest en toen Durd plots jedi waarnam bij de kolonisten stuurde hij  zijn battle droids erop af. Skywalker en co konden de eerste golf de baas, maar dan begonnen de battle droids hen te overrompelen. De droids doordrongen de schilden en vernietigde het; de kolonisten waren nu kwetsbaar. Terwijl Skywalker het wapen onschadelijk ging maken, trok de rest zich terug om de kolonisten te verdedigden. Skywalker slaagde erin het wapen net op tijd onschadelijk te maken vooraleer ze het konnden vuren op de kolonisten. Skywalker arresteerde Durd en werd toch bedankt door de kolonisten.

#### Orto Plutonia

De maan Pantora in het Pantora System was de enige bewoonde beschaving in het systeem en had als gevolg hiervan de soevereiniteit niet over Pantora enkel maar over heel het systeem. Op verzoek van de leider van Pantora werd een republikeinse veiligheidspost opgericht op de verlaten planeet Orto Plutonia in het systeem om mogelijke separatistische dreiging in de clone war tegen te gaan. Wanneer de Republiek het contact verloor met deze veiligheidspost begonnen de pantorans ongerust te worden. Een republikeins team onder leiding van Kenobi  en Skywalker, vergezeld door leider van Pantora Chi Cho en senator van Pantora Riyo Chuchi, reizen naar Orto Plutonia om de windstilte post te inspecteren.

Wanneer scouts een droidenpost hadden ontdekt, snelden Skywalker en Kenobi er naartoe, waar ze zagen dat deze post ook verlaten was met dezelfde sporen als de republikeinse post. Kenobi zag een opname waar droids werden aangevallen door mysterieuze wezens.

Rex kon in het log zien dat deze droids de zuidkant onderzochten. In de hoop meer te weten over de situatie reisden Kenobi en Skywalker naar de zuidkant, terwijl Rex en zijn mannen terug naar de base gingen om Cho en Chuchi te beschermen. Daar vonden de jedi een nederzetting van wezens, de Talz, die de jedi zeiden dat de droids hen hadden aangevallen. Kenobi regelde een meeting met Cho en Chuchi om te onderhandelen over de situatie. Terug in de base vertelden Skywalker en Kenobi dat er een volk woonden, en dat het hoogstwaarschijnlijk de inheemse soort was aangezien te primitief waren voor ruimtevaart. Hoewel Cho er eerst niets wou van geloven, bleef hij erop staan dat de planeet onder zijn rechtsmacht viel ondanks de aanwezigheid van de Talz. Chuchi waarschuwde Cho dat als het volk wist te communiceren met de jedi dat ze misschien wel beschaafd zijn waardoor hun status onzeker was.

De groep vertrok naar het ontmoetingspunt met de Talz om het over de situatie op Orto Plutonica te hebben. De leider van de Talz Shi-Ten zei Cho dat hij in orde wou zijn met de pantorans, maar dat ze hun planeet wel zouden verlaten. Cho was razend en riep tegen Shi-Ten dat hij de macht heeft over Orto Plutonia en zelf bepaalt wie hier verblijft. Dit resulteerde tot een oorlogsverklaring tussen beide partijen. Skywalker droeg Rex op koste wat kost Cho te beschermen, terwijl hij met Kenobi een vredevolle oplossing ging zoeken. De jedi beseften dat een preventieve aanval van Chuchi op de Talz illegaal was, omdat de Talz een beschaafd en inheems volk was van de planeet, maar doordat Cho deze zaak tot een interne zaak had verkondigd konden de jedi niet ingrijpen. Ze

vroegen Chuchi of zij Cho niet kon stoppen, maar daar had ze de bevoegdheid niet voor. De enige optie om oorlog te stoppen was om contact te maken met het Pantoran Assembly en hen de situatie op Orto Plutonica uit te leggen in de hoop dat Chuchi de volmacht zou krijgen om de oorlog te stoppen en een vredesakkoord te regelen. Ondertussen werd Chuchi, beschermd door Rex en zijn mannen, belaagd door de Talz. De Talz waren in de meerderheid en de clones werden in het nauw gedreven. Cho raakte gewond, maar Rex kon hem beschermen tot het einde waar het nu leek dat de nederlaag voor Cho een feit was. Maar in de tussentijd legde Chuchi het Pantoran Assembly de hele situatie uit op Orto Plutonia, waarna de raad Cho’s handelingen onbekwaam verklaarde en Chuchi de bevoegdheid gaf om tussen te komen en vrede te onderhandelen. Cho was stervende toen CHuchi haar benaderde en hem vertelde dat ze de bevoegdheid had om vrede te stichten. Cho stierf uiteindelijk waarna Chuchi met Shi-Ten onderhandelde. Chuchi erkende de Talz als een volwaardig volk en verklaarde hen de soevereiniteit over Orto Plutonica en vrede was gesticht.

#### Blue Shadow Virus

Nadat een squad battle droids gesignaleerd werd op Naboo, werden, op verzoek van Amidala, Skywalker en Kenobi naar Naboo gestuurd om dit te onderzoeken. Aangekomen in Theed werden ze opgewacht door captain Typho, die de jedi inlichtte over de situatie en over de recent gevormde ontwikkelingen dat de beruchte dokter Vindi, in verbond met de CIS, in een ondergronds labo op Naboo het Blue Shadow Virus nieuw leven liet inblazen en van plan was deze met bommen te verspreiden over republikeinse werelden zodat de separatisten de oorlog naar zich toe konden trekken. De jedi beraamde een afleiding om het geheime labo binnen te kunnen dringen. Terwijl Anakin op zoek ging naar de dokter, ging Kenobi met een squad clone bombers naar de bommenkamer om ze onschadelijk te maken. Skywalker vond Vindi, maar moest hem laten gaan zodat hij Padmé’s leven kon redden, die voorafgaand op onderzoek was gegaan. Na Padmé gered te hebben zetten Skywalker de achtervolging in op Vindi, die ondertussen de bommen op afstand had geactiveerd. Na een helse achtervolging, wist Skywalker Vindi te arresteren en net daarna werden alle bommen net op tijd gedeactiveerd door de clone bombers.

Het separatisten plan verijdeld, maakten Skywalker en Kenobi zich klaar on Vindi voor het gerecht te brengen in Coruscant. Echter, één van Vindi’s technische droiden had nog één staaltje van het virus bij zich en was in staat het aan een bom te koppelen en het te laten ontploffen waardoor het virus vrij kwam in het labo. Rex en Tano konden gelukkig op tijd het labo hermetisch afsluiten en zelf de veilige kamer bereiken. Ondertussen ondervroegen Skywalker en Kenobi Vindi over een tegengif zodat ze Amidala en co konden redden uit het labo, maar Vindi had geen tegengif. Terug in de hoofdstad informeerde Typho de jedi over een mogelijk tegengif; een substract van reeksa wortel enkel te vinden op Iego.

Skywalker en Kenobi slaagden er uiteindelijk in reeksa wortel te vinden op Iego, maar voor ze terug vertrokken, werden ze door de inwoners van Iego gewaarschuwd dat het onmogelijk was Iego levend te verlaten wegens de aanwezigheid van de “spookheerser”. Niet aangedaan door de waarschuwing vertrokken de twee jedi, maar kwamen al snel terug nadat ze een energieveld vol met lasers lieten activeren. Terug op Iego sprak Kenobi over de lasers en dacht aan een separatistisch veiligheidssysteem met als doel te verhinderen dat mensen Iego zouden kunnen verlaten. Skywalker en Kenobi kwamen te weten dat de engelen die op Iego’s manen leven, door de separatisten verdreven werden op de maan van Millius Prime. De jedi leidden hieruit af dat de primaire koppeling van het energieveld vast gelegen is in Millius Prime. De jedi kwamen af met een tactisch plan om met heractiveerde vulture droids het energieveld te doorbreken en Iego te bevrijden. Skywalker en Kenobi snelden terug naar Naboo om het tegengif in te zetten in het labo. Skywalker was in staat Amidala, Tano en de clones te redden voordat ze stierven.

#### Battle of Ryloth

Het volk van Ryloth raakte andermaal verhongerd en omwille van de passiviteit binnen de senaat werd er pas maanden later een Republikiense vloot gestuurd naar het Ryloth System om de planeet te bevrijden. De vloot onder leiding van Skywalker moest de blokkade zien te doorbreken zodat Kenobi met zijn grondtroepen het oppervlak kon bereiken en  Ryloth te bevrijden van separatistische bezetting.  Skywalker gaf Ahsoka voor het eerst  het bevel over een eskader. Echter Skywalker’s vloot was sterk in de minderheid; twee eskaders, waarvan één onder Tano’s commando, waren zo goed als vernietigd en daarnaast waren de republikeinse kruisers zwaar beschadigd of vernietigd, met uitzondering van Skywalker’s Resolute.

Skywalker bracht verslag uit aan Windu en Kenobi van de jedi-raad. Hoewel er haast niets meer van Skywalker’s vloot overbleef, was het niet mogelijk om versterkingen te krijgen aangezien de republikeinse troepen te verspreid waren door de separatisten waardoor versterkingen onbeschikbaar waren.

Skywalker wist dat hij het anders moest aanpakken en dat hij vooral inventief te werk moest gaan. Hij kwam op het idee om de beschadigde kruiser Defender te laten evacueren zodat er geen bemanning was. Skywalker wou de Defender op ramkoers laten gaan met het separatistisch vlaggenschip van de blokkade waar de leidinggevende van de blokkade kapitein Muuk opereerde. Skywalker was overtuigd dat de vernietiging van hun vlaggenschip voor chaos zou zorgen bij de separatisten, die dan zonder leiderschap zouden zitten en enkel met zielloos droids. Skywalker droeg het bevel over aan Tano om in de chaos met de restant van de vloot de separatistische schepen aan te vallen en zo de blokkade te doorbreken. Skywalker zou net voor inslag met het vlaggenschip ontsnappen met een reddingspod.

Skywalker vloog met de Defender richting Muuk en maakte contact met hem en beweerde de kapitein dat hij opdracht had gekregen zich samen met zijn bemanning aan hem over te geven in ruil voor voedselvoorraden naar het volk van Ryloth zodat hij dicht genoeg bij het vlaggenschip kon komen zonder aangevallen te worden. Muuk had te laat door dat het een list was en kon niet verhinderen dat Skywalker zijn kruiser kon rammen tegen zijn vlaggenschip. Intussen had Ahsoka een plan bedacht om de Resolute met de romp naar de blokkade te keren zodat de brug en de hangars met de bemanning relatief beschermd bleven. Ashoka hoopte de vijandelijke schepen te lokken naar de Resolute waar ze dan bommenwerpers kon lanceren, die veel sneller en wendbaarder waren dat de grote schepen van de separatisten om de schepen ferm te beschadigen. De bommenwerpers onder leiding van Tano zelf verraste de separatistische schepen en konden ze beschadigen waardoor een opening gemaakt werd naar het oppervlak. De vloot met Kenobi en Windu kwam op het goede moment aan nu er een opening in de blokkade was zodat ze hun vloot op het oppervlak konden laten landen en van daaruit de planeet proberen te bevrijden. Skywalker keek ondertussen op veilige en onbemerkte afstand toe hoe zijn plan perfect tot uiting kwam. Skywalker werd met een shuttle door Rex opgehaald.

Skywalker bleef de strijd aan gaan in de ruimte en was in staat de overige separatistische kruisers te vernietigen of te laten vluchten. Teon Skywalker te horen kreeg dat de separatisten de dorpen van Ryloth begonnen te bombarderen, zakte Skywalker met zijn eskader naar de atmosfeer om de bommenwerpers te vernietigen.

#### Battle of Felucia

Om controle te hebben over de planeet Felicia, strategisch voor haar locatie op de Peremian Trade Route en voor de productie van nysillin, een kruid met helende eigenschappen, woedde er een helse strijd op de planeet tussen de separatisten en de Republiek, onder leiding van jedi generaals Kenobi en Skywalker op het land en jedi generaal Koon in de ruimte. De Republikiense troepen werd. De separatisten slaagden erin de Republikeinse troepen in te sluiten en terug te drijven. De Republiek was gedwongen te evacueren, maar door de blokkade was er geen uitweg. Het was aan Koon en de republikeinse vloot om de blokkade te doorbreken en met reddingschepen de troepen aan grond te evacueren. Uiteindelijk slaagde Koon’s squadron erin een gat in de blokkade te schieten en het oppervalk te bereiken. Skywalker en Kenobi ondernamen de evacuatie, maar Skywalker’s padawan was het niet eens met de Republiek om te evacueren en bleef strijden tot ze opgehaald werd door Skywalker. Tano’s roekeloze acties werden gestraft en Tano werd tijdelijk uit het slagveld gezet.

#### Holocron-Overval

Na hun nederlaag op Felucia brachten Kenobi en Skywalker verslag uit aan de raad en werd Ahsoka ontboden om het te hebben over haar roekeloze en tegenstribbelend gedrag tijdens de strijd. Skywalker nam de verantwoordelijkheid op zich, maar de raad besliste dat het tijdelijk voor Ahsoka beter was om van de strijd weg te blijven. In de plaats werd ze aangewezen als bewaker van de archieven.

Wanneer Yoda een verstoring in de force voelde dat er indringers de tempel waren binnengedrongen, gingen Skywalker en Kenobi meteen op onderzoek uit. De jedi dachten dat de indringers op zoek waren naar de jedi data transmitters om tactische strijdplannen te stelen en zo de oorlog naar de separatistische zijde toe te trekken. Bleek echter dat de indringers achter een holocron zaten en er succesvol één wisten te stelen. Ahsoka wist één van de indringers te ontmaskeren en op te pakken. De indringer onthulde dat het doelwit van Bane ene Bola Ropal was. Dit was de jedi die de houder van het kubeer crystal was, een lijst van force-gevoelige kinderen dat enkel te openen was met een holocron.

Skywalker ging met Tano naar het Devaron System waar Ropal gestationeerd was. Maar Cad Bane vergezeld met een bataljon van separatistische battle droids, hadden Devaron al bereikt en de republikeinse outpost aangevallen en Ropal gevangen genomen.

Skywalker slaagde erin aan boord van het schip te komen waar Bane zat enkel om een dode Ropal aan te treffen. Skywalker en Tano wisten Bane later op te sporen, maar na een tumult kon Bane Tano in de val lokken. Bane gijzelde Tano en dwong Skywalker het holocron te openen omdat Ropal weigerde. Skywalker had geen keus en deed het holocron open om vervolgens Bane  proberen aan te pakken. Echter, Bane was bij de pinken en kon ontsnappen. Skywalker en de overigen reisden in hun shuttle terug naar de Resolute waarna ze beseften dat Bane zich als clone had vermomd en mee in de shuttle was gereisd als een uitweg van het beschadigde separatisten fregat. Opnieuw kon Bane net van Skywalker ontkomen.

Skywalker meldde de tegenslag later aan de raad, die nu geen enkele spoor meer hadden op de Duros premiejager. Yoda stelde voor te mediteren in de force om door de force aanwijzingen te vinden naar Bane. Samen met Kenobi, Yoda en Windu mediteerde Skywalker en voorzagen dat Bane onderweg naar Naboo was. Skywalker was op Naboo  deze keer wel in staat Bane te grijpen, die later werd ondervraagd. De jedi vroegen Bane wie zijn werkgever was en wat hij had gedaan met de kinderen die hij al had ontvoerd, maar de Duros loste niet. Enkel na een collectieve force mind overtake lukte het de jedi Bane te overheersen. De Duros beloofde hem naar de kinderen te brengen. Skywalker ging verslag brengen aan kanselier, ook al was het een interne jedi-aangelegenheid.Kenobi en Windu gingen met Bane naar de locatie waar hij de kinderen had meegenomen. Hoewel Kenobi en Windu een val bemerkten volgde ze toch Bane’s instructies. Uiteindelijk was het een val waarin Bane kon ontsnappen en de jedi wel het holocron terughadden, maar geen kinderen.

Skywalker wou niet bij de pakken blijven zitten en onderzocht Bane’s starfighter. Hoewel het navigatie logboek was gewist, was dat niet het geval bij de brandstofcomputer waaruit Skywalker kon afleiden dat Bane op Mustafa was geweest. Skywalker en Tano vertrokken naar Mustafar om er later de force-gevoelige kinderen te vinden die in handen waren van mysterieuze medische droiden. Na af te vragen wie hier nu allemaal achter zat, wisten Skywalker en Tano de kinderen te redden. De twee keerden terug naar Coruscant om hun bevindingen te delen en het feit dat ze niet konden achterhalen wie er nu achter deze actie zat.

#### Terugkeer naar Felucia

Nadat het contact met een republikeinse medisch station nabij Felicia verloren raakte, werd Skywalker met Tano en Kenobi op onderzoek gestuurd. Aangekomen bij de coordinaten was er geen station meer te zien, enkel nog een vulture droid deployeert station. Het was dus duidelijk geworden dat de separatisten het station hadden vernietigd. De vulture droids konden Skywalkers schip beschadigen, waardoor Skywalker gedwongen was een noodlanding te maken op Felucia. Het trio overleefde het maar het schip niet. Op Felucia kwamen de jedi midden in schermutseling te staan tussen feluciaanse boeren en Hondo Ohnaka’s piratenbende. Hondo eisten de boeren hun oogst van het kostbare nysillin af te staan aan hun, anders zouden ze hen aanvallen en overvallen. De boeren huurden een bende premiejagers in om zich tegen de piraten te beschermen. Kenobi vroeg Ohnaka voor een lift tegen een fikse betaling, maar Ohnaka weigerde. Na te horen te krijgen van de heelsituatie besloten de jedi de feluciaanse boeren bij te staan. Met de hulp van de jedi werden Ohnaka’s piraten uiteindelijk van de planeet verdreven. De jedi werden door de boeren en de premiejagers bedankt en kregen een lift van één van de premiejagers naar een Reublikeinse buitenpost in de buurt.

#### Campagne op Malastare

Later bereikte de oorlog de republikeinse planeet Malastare. Malastare was een interessant doelwit voor de separatisten omwille van haar grote brandstofreserve die men op Malastare kon ginnen.De CIS kwam af met een groot leger om de planeet te veroveren en zo  met de talrijke brandstofvoorraden te claimen voor de separatisten. Als reactie had de Republiek ook tal van clone-bataljons ingezet, onder leiding van jedi general Windu en Skywalker, om de Republikeinse wereld te verdedigden van de wrede separatistenaanvallen. Daarnaast probeerde de Republiek met de Dug Council een verdrag te onderhandelen dat de Republiek toestond gebruik te maken van Malastare’s brandstof als ze de separatisten konden verdrijven.

Echter, naarmate de verslag vorderde, trokken de separatisten de strijd steeds meer naar zich toe. Om het tij in de veldslag te keren, heeft kanselier Palpatine het gebruik van het nieuwe en omstreden wapen van de Republiek, de Electro-Proton Bomb, toegestaan. Dit wapen was in principe in staat grote aantallen droidentroepen uit te schakelen door het creëren van een elektromagnetisch veld, maar er was geen garantie dat dit ook effectief het geval zou zijn waardoor dit wapen als omstreden werd beschouwd.

Wanneer het erop leek dat de separatisten op het punt stonden de planeet te veroveren, liet Skywalker de bom in gereedheid brengen; republikeinse bombers transporteerden de bom over het enorme separatistenleger om het daarna op los te laten. Hoewel alle battle droids uitgeschakeld werden en de rest ongeschonden bleef, creëerde de bom een gigantische krater dat vele republikeinse troepen opslorpte. Meer nog de krater liet een eeuwenoud beest terug vrijkommen, het Zillo Beest. Dit wezen werd geloofd uitgestorven te zijn. De Dugs herkende het beest vanwege de geschiedenis ervan met hun voorouders. De Dugs wisten het potentieel gevaar van het beest en waren bezig hem doden, maar Windu verzette hier zich tegen aangezien het tegen de jedi-zeden was, vooral omdat het de laatste van zijn soort zou zijn. Dug leider Nakha Urus dreigde ermee het verdrag niet te tekenen als de jedi hem in de weg zouden staan om het  beest te doden. Skywalker herinnerde Windu aan het belang van het verdrag en was in staat om het Zillo Beest daar eventueel voor op te offeren, maar Windu bleef vasthangen aan de Jedi-principes die niet doorbroken kunnen worden.

Skywalker en Windu informeerde Palpatine over de nieuwe ontwikkelingen op Malastare. Palpatine  stelde voor mee te werken met de Dugs zodat het verdrag niet in gevaar zou komen te staan, maar Windu kon dat niet toestaan. Uiteindelijk kwamen ze tot de conclusie om het beest te verdoven en de Dugs te laten denken dat ie dood was om het vervolgens mee te nemen voor onderzoek. Het beest had namelijk zo een ondoordringbare schubben dat het idee bij de Republiek  op kwam om die schubben te gebruiken als ondoordringbaar pantser voor de clones en voor de republikeinse schepen om zo een gigantisch voordeel op de separatisten te krijgen. Na veel moeite slaagden Skywalker en Windu erin het beest te verdoven en op het transport te plaatsen. De Dugs geloofden dat het dood was en ondertekenden het verdrag.

#### Het Zillo Beast Incident

Vervolgens contacteerde Palpatine de twee jedi om hen te zeggen dat het Zillo Beest door de beste wetenschappers zal onderzocht worden op Coruscant. Windu en Skywalker waren niet zeker of het wel een goed plan was om zo’n gevaarlijk beest naar de hoofdstad van de Republiek te brengen.

Op Coruscant werd het Zillo Beest nauw onderzocht in de hoop de samenstelling van zijn ondoordringbare schubben te achterhalen. Echter, hiervoor, moesten de schubben van het beest verwijderd worden wat extreem moeilijk, pijnlijk en gevaarlijk was. Hoewel het niet etisch was, stelde Palpatine toch voor om het beest te doden om het proces te vergemakkelijken. De manipulatieve kanselier voegde eraan toe dat de geheimen van het beest zijn schubben ervoor zou kunnen zorgen dat veel meer levens voorkomen zouden worden in plaats van dat van één beest en dat dat de morele plicht was van de Republiek.

Skywalker werd benaderd door Amidala, die op de hoogte was van het Zillo Beast en vroeg Skywalker of hij de kanselier kon beïnvloeden in zijn beslissing het beest te doden. Palpatine kreeg dus later bezoek van Skywalker en Amidala in zijn kantoor, die over het Zillo Beest begonnen. Palpatine hield deze kwestie bij de meeste geheim om reacties als die van Amidala te voorkomen. Amidala deelde haar ongenoegen dat het beest gedood zou worden. Palpatine begon terug over de morele kwestie om het beest op te offeren zodat veel meer en veel belangrijkere levens gered zouden worden. Niet veel later sloeg het beest echter los van haar klauwen en dwaalde rond Coruscant. Amidala liet haar staf evacueren om dan te realiseren dat het beest hun kant opging. Het beest bereikte het senaatsgebouw waarna Amidala, Skywalker en Palpatine met een schip hun ontsnapping maakte. De jedi en de clones probeerden het beest te elimineren en Coruscant te beschermen, maar zonder veel resultaat. Het beest was echter in staat Palpatine’s schip in zijn klauwen te nemen, maar de inventieve Skywalker wist Palpatine en Amidala uit deze gevaarlijke situatie te brengen. Uiteindelijk bezweek het beest aan de wapens van de Republiek gecombineerd met het malesteriaanse brandstof. Hoewel de jedi rouwde om de dood van het beest, verzekerde Palpatine dat haar offer niet tevergeefs zou zijn.

#### Terug naar Cato Neimmodia

Na veel oorlogscampagnes kan Skywalker eindelijk nog eens terugkeren naar Coruscant en naar zijn vrouw Padmé. Het leek erop dat Amidala eindelijk een hele avond met Skywalker kon spenderen totdat Skywalker bericht kreeg dat hij zich bij de jedi raad moest melden. Yoda en Windu vroegen Skywalker of hij Amidala kon overtuigen om senator Clovis te spioneren, de senator van de IBC die ervan verdacht wordt samen te werken met de separatisten. De jedi konden moeilijk zonder enig bewijs senator Clovis zomaar konden ondervragen en omdat Amidala niet verdacht zou worden door Clovis gezien hun gemeenschappelijk verleden, leek zij de geschikte persoon. Echter, hoewel Skywalker toestemde met zijn opdracht, zag hij het niet zitten dat Amidala een mogelijke separatist zou bespioneren wegens het gevaar voor haar.

De volgende dag benaderde Skywalker Amidala in het senaatsgebouw om het te hebben over Clovis. Wanneer Skywalker aan Amidala onthulde dat Clovis mogelijk betrokken was met de separatisten, viel Amidala uit de lucht. Amidala zou nooit geloven dat Clovis samen zou werken met de separatisten en in het belang van de Republiek vond ze het haar plicht om de waarheid hieromtrent te achterhalen. Amidala was bereid om Clovis te spioneren, ook al vond Anakin dat te gevaarlijk.

Amidala's spionage leidde haar naar Cato Neimodia. Skywalker, vermomd als Naboo guard, vergezelde Clovis en Amidala naar Cato Neimodia om Amidala bij te staan in geval van nood. Op Cato Neimodia kwam Amidala uiteindelijk te weten dat Clovis en de IBS met de CIS samenwerkten in het financieren van een reusachtige droidenfabriek op Geonosis. Nadat Amidala de gegevens verzamelde op een datastick, gaf ze Skywalker het signaal om te komen. Amidala kon de stick op ongemerkte wijze aan Skywalker doorgeven. Daarna viel Amidala echter flauw; ze was vergiftigd door Dod één van de aandeelhouders in de fabriek om Clovis onder druk te zetten om hem meer winsten te beloven. Clovis confronteerde Amidala nadat hij leerde dat Amidala de datastick had gestolen, maar Skywalker kwam tot haar bescherming. Skywalker kreeg te horen dat Amidala vergiftigd werd en stelde voor Amidala naar de artsen op Coruscant te brengen. Clovis realiseerde dat daar geen tijd voor was en verzekerde dat hij een tegengif bij Dod kon regelen in ruil voor de holodisk. Skywalker weigerde en wou liever zelf onderhandelen met Dod. Uit liefde voor Amidala hield Clovis Dod onder schot en dwong hem het tegengif te overhandigen. Amidala werd gered en Clovis vroeg in ruil zijn holodisk, maar Skywalker hield het natuurlijk bij, Clovis achterlatend.

#### Battle of Dorin

Skywalker reisde direct erna met zijn padawan naar Dorin nadat Grievous daar had aangevallen. Onwetend bij Skywalker had Grievous deze aanval gelanceerd in een poging om Republikeinse troepen weg te houden van Geonosis, nadat de Republiek te weten was gekomen over de investering van de IBC in een reusachtige droidenfabriek op Geonosis bestemd voor de CIS. Skywalker en Tano waren in staat de separatisten van Dorin te verdrijven. Na zijn succes op Dorin, kwam Skywalker aan in het Geonosis System om deel uit te maken van de Republikeinse strijdmacht om Geonosis te veroveren.

#### Second Battle of Geonosis

Na de informatie van Amidala over Clovis en de separatisten, begon de Republiek een enorme invasie op Geonosis te plannen om de fabriek te vernietigen en om Poggle the Lesser te arresteren zodat de geonosians niet meer in opstand zouden komen in de toekomst. Geonosis was namelijk één van de separatistische planeten waarvan de Republiek dacht veiliggesteld te hebben dat terug in opstand kwam tegen de Republiek.

Tijdens de briefing bespraken de Jedi-generaals, Skywalker, Kenobi, Mundi en Unduli, hun strijdplan. De droidenfabriek was omsloten door een reusachtig rayshield dat uitgeschakeld moest worden om de fabriek uit te kunnen schakelen. Naar alle waarschijnlijkheid vertoefde Poggle the Lesser in de fabriek. Het eerste deel van het strijdplan was om door de defensie en het geschut van de geonosians heen te komen en samen te komen op het rendez-vous punt voor het ray shield. Skywalker zou vanuit het zuiden het geonosiaans verzet uit de weg ruimen, terwijl Kenobi en Mundi respectievelijk door het centrum en door het noorden de weerstand zouden uitschakelen in hun weg naar het rendez-vous punt.

Echter, het zware geschut op Geonosis en de enorme defensie van de Geonosians maakte het  voor de Jedi-generaals haast onmogelijk om te landen op het oppervlak. Skywalker’s gunship werd zelfs zwaar geraakt waardoor het ship op het oppervlak crashte. Skywalker, Tano, Rex en de meeste clones overleefden de crash wel en konden hun aanval verder zetten op het oppervlak in de richting van het ontmoetingspunt. Skywalker had echter niet meer genoeg mankrachten over en vroeg Kenobi via Rex om versterkingen, maar tevergeefs.

Skywalker en co bereikten ondertussen een viaduct met kanonnen. Battle droids stonden op het viaduct en namen Skywalker en co hevig onder vuur. Skywalker en Tano wisten het viaduct en de battle droids op inventieve wijze te vernietigen en maakten hun weg voort naar het rendez-vous punt, waar Kenobi ondertussen als enige gearriveerd was, maar omsingeld leen te worden zonder luchtsteun en zonder de grondsteun van Skywalker en Mundi, die nog steeds niet gearriveerd waren.

Onderweg troffen ze Mundi’s groep, die gedwongen was een omweg te maken langs een grot en daardoor tijdelijk niet in staat was te communiceren met de rest. In de verte zagen Skywalker en Mundi dat het er zeer slecht aan toe ging bij het ontmoetingspunt. Skywalker vroeg Yularen om een eskader van fighters om Kenobi te versterken. Gelukkig voor Skywalker was er in de tussentijd één eskader beschikbaar gekomen, dat Yularen naar het rendez-vous punt liet sturen.

De luchtsteun keerde het tij en Skywalker en Mundi kwamen aan bij Kenobi. Met hun gebundelde krachten zouden ze nu in staat zijn om het schildgenerator uit te schakelen. De generaals planden een aanval om de generator uit te schakelen. Hierbij ging Skywalker met een paar van zijn mannen door het schild in een poging om het geschut dat de generator verdedigde uit te schakelen zodat Mundi en Kenobi met de zware tanks ongestoord op de generator konden vuren. Skywalker slaagde uiteindelijk in zijn opzet waarna de tanks vrije baan hadden om de generator uit te schakelen. Nadat het schild uitgeschakeld werd, mobiliseerde Mundi de rest van de clones bij Skywalker en dichter bij de droidenfabriek. De rust keerde voor even terug in de strijd waarna Mundi en Kenobi zich gingen laten genezen, terwijl Skywalker de aanval zou verder zetten op de fabriek.

Nu was het zaak voor de Republiek om de fabriek te vernietigen. General Unduli en haar padawan werden met hun clone troepen naar Geonosis gestuurd om Skywalker te helpen in het vernietigen van de fabriek. Het plan bestond uit een afleiding van Skywalker en Unduli onder de vorm van een clone-optocht zonder dekking naar de fabriek toe om zo veel mogelijke vijandige troepen uit de zwaarbewaakte fabriek te lokken, terwijl Tano en Unduli’s padawan Barriss Offee ondergronds via de catacomben de fabriek van binnenuit zouden binnendringen om de reactor op te blazen met springstof. Offee had namelijk al de catacomben en haar kruisingen gememoriseerd en wist precies hoe men via de catacomben naar de hoofdreactor van de fabriek kon gaan.

De afleiding werkte waarna tal van battle droids de fabriek verlieten om de opmarcherende clones uit te schakelen. Echter, Skywalker en de clones werden zelf in de val gelokt toen ze van achteruit plots door geonsians onder vuur werden genomen. Toch konden de clones en de jedi goed standhouden wat Poggle ertoe leidde om hun nieuwe tanks in te zetten voorzien van een rayshield.

De tanks richtte veel schade aan bij de Republiek als tal van AT-TE’s in een snel tempo werden vernietigd. Skywalker en Unduli lieten al hun mannen terugtrekken weg van de brug en plaatsten springstof onder de brug in een poging om de tanks over de brug lokken zodat hij de brug op het perfecte moment kon opblazen zodat al de tanks naar beneden donderden. Skywalker en Unduli slaagden hierin.

Skywalker zag dat de fabriek plots werd opgeblazen, maar Tano was echter nog niet teruggekeerd. Skywalker geloofde niet dat haar padawan mee onder ging en was daardoor vastberaden haar te redden. Hij liet Rex via gunships de puin opruimen in de hoop Tano en Offee te vinden. Maar toen plots Skywalker een signaal van Ahsoka’s domlink oppikte, liet hij de clones opgraven op de plek van het signaal. Tano en Offee leefden nog en werden gered.

Hoewel de Republiek de strijd had gewonnen op Geonosis, was er nog geen spoor van Poggle the Lesser. Terwijl de Republiek aan een cleanup van de planeet begint, leidden Jedi generaals Kenobi en Unduli de zoektocht naar de separatistenleider. Tal van clone squadrons doorzoeken het betrokken gebied, maar nog geen spoor was te bekennen van Poggle totdat Unduli een munitiecontainer trof in de buurt van de Progate Temple. Unduli volgde het spoor tot aan de Progate Temple waar ze haar ontdekkingen met Kenobi, Mundi en Skywalker deelde, maar werd dan verrast en gevangengenomen door Poggle. Skywalker en Kenobi begaven zich naar de tempel om Unduli te redden en Poggle te grijpen.

Na de tempel bereikt te hebben, troffen Skywalker en Kenobi Unduli uiteindelijk aan in de catacomben. Ze werd er vastgehouden voor Poggle en de geheime koningin van Geonosis tezamen met geonosian zombies, waarvan hun geest via parasietenwormen door de koningin gecontroleerd werd. Kenobi zag in dat de koningin ook van plan was om Unduli’s geest te controleren via zo’n worm, maar verhinderde dit door de koningin en de zombies te verassen met fel licht. In het tumult konden Skywalker en Kenobi Unduli bevrijden en Poggle in de boeien slaan. De groep verdedigden zich tegen de onsterfelijke zombies en de koningin door op de pilaren van de tempel te schieten en de zombies levend te begraven. Skywalker en co konden op tijd de tempel ontsnappen voor het neerstortte.

Terwijl enkele clone-eenheden ter plekke bleven om te voorkomen dat Geonosis weer uit republikeinse handen zou vallen, waren Skywalker en de andere jedi klaar om te vertrekken naar Coruscant om Poggle voor het gerecht te brengen. Echter, Skywalker, Kenobi en Unduli werden onderbroken door Mundi die een noodsignaal van generaal Windu opving op Dantooine. Windu vroeg de Republiek achter medische voorraden voor zijn troepen op Dantooine om het tij in de slag om Dantooine te keren. Mundi stelde voor om Windu te helpen en naar het medisch station van Ord Cestus te gaan om zich daar te bevoorraden met de medische spullen om ze daarna naar Windu te brengen op Dantooine. Skywalker vond dit echter een slecht idee aangezien ze een andere en belangrijkere taak hadden; ze moesten Poggle zo snel mogelijk naar Coruscant brengen voor ondervraging en berechting en Ord Cestus was een veel te grote omweg voor hun. Skywalker stelde daarom voor om padawans Tano en Offee met een medisch fregat naar Ord Cestus te laten gaan en de bevoorrading van Windu te voltooien.

Onderweg naar Coruscant, hielden Skywalker, Kenobi, Mundi en Unduli zich bezig met de ondervraging op Poggle, maar de geonosiaanse separatistenleider werkte niet echt mee met de jedi. Intussen hadden Tano en Offe zich nog steeds niet bij Skywalker’s vloot gemeld. Uiteindelijk nam Tano toch contact op met Skywalker’s vloot. Ze legde uit dat de clones aan boord bij haar besmet werden door de parasietwormen van op Geonosis. Skywalker ging terug naar Poggle en force-chokete hem waarna Poggle eindelijk begon te praten. Hij legde uit dat men de parasieten kon neutraliseren door de kou aan hen bloot te stellen. Wanneer Skywalker deze info via de comlinck deelde aan zijn padawan, slaagde ze er na een tijd in de clones en Offee, die ook besmet raakte, te ontdoen van de parasieten door het koelingssysteem van het fregat aan te zetten.

Nadat Poggle op Coruscant werd overgedragen, reisde Skywalker naar het Ord Cestus station om zich met Tano te vervoegen. Tano was zelf zwaar getroffen door de kou van het koelingssysteem en werd op het station behandeld. generaal Fisto, die gestationeerd was op de medische post, analyseerde één van de dode parasieten en concludeerde dat het inderdaad de parasieten waren afkomstig uit Geonosis. Skywalker vond dat ze de clone troepen op Geonosis hiervan op de hoogte moesten brengen zodat ze zelf niet besmet zouden raken. Skywalker geloofde zelf dat het misschien de parasieten waren die ervoor zorgden dat de geonosians Geonosis konden heroveren van de Republiek.

#### Mandalore

Skywalker werd later met een clone-eenheid naar Mandalore gestuurd voor escortedienst. Na enkele geruchten werd de leider van Mandalore hertogin Satine Kryze ervan verdacht dat ze samenwerkte met de separatisten, ondanks ze haar neutraliteit verklaarde tijdens de oorlog. Skywalker’s voorgaande meester Obi-Wan Kenobi werd door de jedi-raad naar Mandalore gestuurd om de waarheid ervan te achterhalen.

Wanneer Satine plande om naar Coruscant te gaan om de senaat toe te spreken om haar neutraliteit te bewijzen, werd Skywalker en zijn clone-unit belast met het beschermen van hertogin Satine tijdens haar reis van Mandalore naar Coruscant. Hoewel Satine niet om deze republikeinse bescherming had gevraagd wegen haar neutraliteit, werd deze bescherming bevolen door het hof van Satine die geloofde dat Satine in groot gevaar verkeerde na meerdere aanvallen op haar en op Mandalore van de Death Watch, een terroristengroep die Satine's regering wenste omver te werpen en meer dan waarschijnlijk geallieerd was met de separatisten om dat te verwezenlijken.

Skywalker ontdekte dat in het laadruim van het schip de inhoud van één van de kisten plots was verdwenen om vervolgens aangevallen te worden door separatistische spider droids. Skywalker contacteerde Kenobi die boven bij de hertogin was om hem over de situatie in te lichten. Hoewel Skywalker en de clones de meeste droids konden uitschakelen, wist er één droid te ontsnappen naar de lift op weg naar hertogin Satine. Skywalker vond de inventarisdroide en vroeg hem achter het scheepslogboek waaarop hij vernam dat de lading werd goedgekeurd via een senaatstempel. Dit hield in dat één van de vier senatoren die mee op het schip zaten verantwoordelijk was voor deze gevaarlijke lading en samenwerkte met de Death Watch om Satine uit de weg te ruimen voor ze de senaat bereikte om haar pleidooi te houden. Skywalker informeerde Kenobi over dit verontrustend feit en terwijl Skywalker de overige spider droids uit de weg kon ruimen, ontdekte Kenobi later op inventieve wijze dat senator Tal Merrik Satine had verraden en verantwoordelijk was voor de spider-lading. Echter, Merrik kon de hertogin gijzelen en contacteerde de Death Watch om versterkingen zodat hij met Satine kon ontsnappen. Skywalker kwam via Kenobi te weten over de situatie en liet de escape pods bewaken zodat Merrik niet zou kunnen ontnsappen met Satine. Skywalker en zijn troepen hadden hun handen vol met die versterkingen, dat separatistische super battle droids waren, die met enterschepen het schip konden binnendringen. Toch slaagde Skywalker en zijn troepen erin de droids te vernietigen. Skywalker vond Merrik, niet meer satine gijzelend maar de bemanning van het hele schip door een afstandsbediening dat het gehele schip kon vernietigen, en doodde hem langs achter voordat hij het schip kon vernietigen met zijn afstandsbediening. Satine kwam als gevolg daarvan veilig aan op Coruscant waar ze de senaat ging toespreken.

#### Vast op Vanqor

Tijdens een zeldzaam rustmoment in de hevige clone-oorlogen, ontmoet Skywalker met Windu aan boord van Windu’s kruiser *Endurance* een groep jonge clones van de Clone Youth Brigade als deel van hun opleiding waar de kadetten zullen leren hoe een republikeinse kruiser functioneert en hoe ze moeten dienen naast een jedi. Echter, een explosie in Windu’s kwartier op het schip verstoorde de opleiding van de kadetten. Overtuigd dat dit geen accident was en aangezien geen vijandige schepen in de nabijheid waren, was het duidelijk dat er een saboteur aan boord van de *Endurance* zat. Na het halve schip doorzocht te hebben zonder spoor, raakte de hoofdreactor plots oververhit waardoor het schip op neerstorten zat. Skywalker sprong in zijn starfighter en kreeg te horen dat één van de reddingspods van de kadetten gesaboteerd was. In een poging de kadetten te redden en een spoor van de saboteur te vinden redden Skywalker en Windu de beschadigde pod.

Vervolgens gingen Skywalker en Windu naar de crashsite om eventuele overlevenden te redden, zoals admiraal Killian en commandant Ponds die moedig aan boord waren gebleven om hun schip nog te redden. Op weg naar de brug vonden Skywalker en Windu hoofdzakelijk clones die niet waren omgekomen door de crash, maar gedood werden met een blaster. Dan vond Skywalker een onbeschadigd mandaloriaanse helm. Vreemd dat die helm daar was, onderzocht Skywalker de helm, maar werd teruggeroepen door Windu die plots verbanden begon te leggen; De helm herkende hij als die van Jango Fett, de premiejager die Windu doodde tijdens de First Battle of Geonosis. Windu herinnerde dat Fett’s zoon Boba toezag hoe Windu hem doodde. Die Boba herkende hij eerder bij de clone kadetten op de *Endurance*, maar het besef drong pas door na het zien van Jango’s helm. Windu bemerkte dat Boba Windu wou doden uit wraak voor het vermoorden van zijn vader en bijgevolg de saboteur was die ze zochten en dat hij verantwoordelijk was voor het doden van de clones op zoek naar Windu’s lichaam om er zeker van te zijn dat hij dood was. Maar omdat Boba Windu’s dode lichaam nooit kon gevonden hebben aangezien Windu nog leeft wist Windu dat de helm een val was om hem te doden en kon Skywalker net op tijd behoeden, voor de helm ontplofte. Door de ontploffing raakte Skywalker en Windu vast te zitten in de brokstukken van het schip. Skywalker stuurde zijn astromech R2 terug naar de strafighters om de jedi-tempel te contacteren om hulp. Maar onwetend bij R2 werd de communicatie op de hele planeet verstoord door Boba Fett en zijn team, die inzagen dat Windu nog leefde en de communicatie verstoorde zodat de jedi geen hulp kon vragen. R2 moest dus zelf naar de tempel gaan om de jedi van de situatie te informeren. Echter, R2 werd achtervolgd door Boba’s schip de *Slave I*, voormalig schip van Jango, maar wist te ontkomen van hem en de tempel te bereiken. jedi-generaal Koon en Skywalker’s padawan reisde naar Vanqor en konden Skywalker en Windu uit het puin halen. De twee jedi waren ernstig gewond en werden naar de medische faciliteiten van de jedi tempel gebracht.

Nu dat Fett twee aanslagen op Windu’s leven pleegde, vroeg Skywalker Windu om het joch op te sporen en voor het gerecht te brengen, maar Windu plande dit niet te doen omdat er grotere bezorgdheden waren voor de jedi, namelijk het winnen van de oorlog. Dan kwamen Koon en Tano binnen die een bericht lieten zien dat ze van Fett hadden ontvangen Daarin was te zien dat hij onder ander samenwerkte met beruchte premiejager Aurra Sing en Bossk en dat de premiejagers republikeinse gijzelaars hadden met onder meer Ponds en Killian. Ze eisden Windu naar hun toe te komen of anders zouden ze gedood worden. Om Windu onder druk te zetten om te komen, doodde Sing commander Ponds koelbloedig. Maar omdat Windu nog te gewond was om te reizen, vertrokken Koon en Tano in de plaats en wisten ze Sing en Fett later op te sporen op Florrum. Na een confrontatie slaagden Koon en Tano erin de gijzelaars te redden alsook Fett en Bossk te grijpen, Sing wist echter wel te vluchten van republikeinse hechtenis.

#### Balith Civil War

Later bracht Skywalker Tano naar Mandalore, die door de jedi-raad de opdracht kreeg om de corruptie mee te onderzoeken op Mandalore door undercover les te geven aan de Academy of Government. Skywalker herinnerde Tano aan het mede-belang om de mandaloriaanse kadetten te onderwijzen over corruptie zodat de toekomstige leiders van Mandalore zouden kunnen anticiperen op corruptie op Mandalore in de toekomst. Na Tano afgezet te hebben vertrok Skywalker meteen terug naar de relaliteit van de clone wars en vervoegde hij zich bij meester Fisto in de strijd.

Skywalker en Tano kwamen terug aan op Coruscant waar ze verwacht werden bij de jedi-raad. Tano werd door de raad gefeliciteerd om haar succes op Mandalore, terwijl Skywalker van de raad naar Balith moest gaan, waar momenteel een grootschalige burgeroorlog woedt. Nadat Balith de republiek om hulp had gevraagd, stelde de raad voor om Skywalker te laten gaan met het Third Legion en de leiding te nemen. Tano moest in de tempel blijven om een volledig verslag te maken over haar missie op Mandalore.

Na zijn interventie op Balith, keerde Skywalker terug op Coruscant waar hij samen met Yoda Amidala, Organa en Tano ontving na hun vluchtelingenconferentie op Alderaan. Tano had Amidala vergezeld naar Alderaan om haar te beschermen nadat ze te maken kreeg met visioenen waarin ze zag dat premiejager Aurra Sing uit was op Amidala’s dood. Tano’s visioenen bleken werkelijkheid te zijn, maar Tano verijdelde Sing’s moordpoging succesvol. In een poging te achterhalen wie Sing had ingehuurd, liet Yoda Tano haar verbeterde capaciteiten van Precognitie gebruiken. Met behulp van Tano’s vooruitziendheid en Amidala’s kennis kon geconcludeerd worden dat Ziro the Hutt Sing had ingehuurd. Skywalker en Tano gingen naar het Judiciary Detention Center waar Ziro opgesloten zat om de hutt te ondervragen. Na manipulatie van Tano, had Ziro zich versproken dat hij Sing had ingehuurd. Met de antwoorden die ze zochten keerden de twee jedi terug naar de tempel.

#### Battle of Kamino

Later onderschepte Skywalker’s kruiser een separatistisch bericht waar te horen was dat Grievous en Ventress hun aanval op Kamino niet hadden opgegeven en een nieuw plan bespraken om Kamino aan te vallen. Om de potentiële aanval te pareren vertrokken Kenobi en Skywalker met zijn 501st naar Kamino om generaal Shaak Ti en het lokale garnizoen te assisteren in het verdedigen van Kamino.

Een separatistische vloot onder leiding van Grievous arriveerde effectief bij Kamino en begon de republikeinse blokkade aan te vallen. Terwijl Skywalker met zijn Shadow Squadron de blokkade onder leiding van admiraal Yularen ging assisteren in het vernietigen van de separatistenvloot, coördineerde en analyseerde Kenobi met Shaak Ti de space battle in het commandocentrum van Tipoca City. Kenobi bemerkte Grievous’ vreemde tactiek om met een opvallend kleine vloot Kamino aan te vallen en om al zijn transportschepen te laten opofferen voor de veiligheid van zijn vlaggenschip en vermoedde dat de separatisten opzettelijk hun vloot lieten beschadigen zodat brokstukken het wateroppervlak van Kamino bereikte. Kenobi deed onderzoek bij de brokstukken waar hij zoals hij dacht constateerde dat de separatisten hun vloot opzettelijk lieten beschadigen om troepen via schepen verborgen onder de brokstukken van de transportschepen op Kamino te krijgen. Kenobi zag vervolgens hoe deze schepen Tipoca City begonnen aan te vallen en de faciliteiten sterk begonnen te beschadigen. Skywalker werd ingelicht door Kenobi over de situatie en begaf zich terug naar het oppervlak waar de echte aanval begonnen was.

In de veldslag op het oppervalk ondervond Kenobi dat er te weinig separatistische droids op Kamino waren om Tipoca over te nemen en al de faciliteiten te vernietigen, en vermoedde opnieuw een afleding van de separatisten, die volgens Kenobi vast op zoek zouden gaan naar de DNA sample om de productie van nieuwe clones te stoppen. Kenobi stuurde Skywalker naar de DNA-kamer om het DNA veilig te stellen. Wanneer Skywalker aankwam bij de DNA-kamer, klopte Kenobi’s vermoeden toen Skywalker Ventress daar aantrof die de DNA-sample probeerde te stelen. De twee duelleerden met elkaar, terwijl Grievous ondertussen de aanval doordrukte weg van de DNA-kamer richting de barakken waar hij Kenobi trof. Ook zij begonnen te duelleren. Skywalker ondervond veel moeit met Ventress, die duidelijker machtiger was geworden. De clones waren duidelijk in de meerderheid en begonnen op alle fronten de separatistische troepen terug te dringen. Grievous raakte ondertussen af van Kenobi en met zijn taak vervuld sprong hij in zijn schip. Skywalker nam uiteindelijk de overhand en kon de DNA-sample van Ventress terugnemen. Ventress vocht moedig terug, maar wanneer ze omsingeld werd door de clones, vluchtte de nightsister in Grievous’ schip, die haar had opgehaald.

#### xx

Skywalker leerde Tano vervolgens duelleren met twee lichtzwaarden. Maar tijdens de sessie worstelde Tano met deze nieuwe stijl totdat Yoda een bezoek kwam brengen, die benieuwd was naar Ahsoka’s vooruitgang. Yoda’s advies hielp Ahsoka en ze begon de nieuwe stijl onder controle te krijgen.

Amidala werd later vergezeld door Skywalker voor een missie naar Alderaan. Skywalker had er alles aan gedaan om mee te gaan op de missie zodat hij weer wat tijd kon spenderen met Amidala. Echter, toen ze op het punt stonden te vertrekken, arriveerde Tano, die door Kenobi gestuurd werd om te assisteren in de missie. Skywalker zag zijn trip met Amidala in rook op gaan en als gevolg daarvan wou hij de missie zo snel mogelijk klaar hebben en wijzigde hij daarom de vluchtroute naar een snellere route. Deze routewijziging deed het trio wel belanden in separatistische ruimte. Maar het trio kon ontkomen en kwam later aan op Alderaan.

Om haar sterke progressie en haar toenemende maturiteit te feliciteren, hield Yoda een ceremonie voor Skywalker’s parawan met Skywalker erbij. Hoewel ze te laat was, werd ze toch gefeliciteerd.

Wanneer het jaarlijks Festival of Light, het festival dat de toetreding van Naboo tot de Republiek viert, werd gehouden op Naboo in het theater van Tomarian, reisde Amidala naar Naboo om het festival bij te wonen. Amidala werd begroet door Tomarian en verrassend genoeg ook door Skywalker. Tomarian had namelijk om een jedi gevraagd als veiligheidsmaatregel en Skywalker bood zich vrijwillig aan om die taak op zich te nemen. Verrast, maar blij om Skywalker weer te zien gingen ze het theater binnen. Maar terwijl Amidala zich in de toiletten aan het opfrissen was, werd de zaal plots in beslag genomen door een gewapende crew. Tomarian stond namelijk in de schulden bij deze crew. Uiteindelijk slaagden Skywalker en Amidala erin de benarde situatie om te keren en de gewapende crew te stoppen.