Χημικές οντότητες βιολογικού ενδιαφέροντος

Οι Χημικές οντότητες βιολογικού ενδιαφέροντος (Chemical Entities of Biological Interest), γνωστές επίσης ως ChEBI, είναι μια βάση δεδομένων και οντολογίας των μοριακών οντοτήτων (molecular entities) εστιασμένη σε 'μικρές' χημικές ενώσεις, που είναι μέρος της προσπάθειας των ανοικτών βιοϊατρικών οντολογιών ([Open Biomedical Ontologies). Ο όρος "μοριακή οντότητα (molecular entity)" αναφέρεται σε οποιοδήποτε "δομικά ή ισοτοπικά διακριτό άτομο, μόριο, ιόν, ζεύγος ιόντων (ion pair), χημική ρίζα, ριζικό ιόν (radical ion), σύμπλοκο (complex), διαμορφομερές (conformer), κλπ., που αναγνωρίζεται ως μια ξεχωριστή αναγνωρίσιμη οντότητα". Οι εξεταζόμενες μοριακές οντότητες είναι είτε φυσικά, είτε συνθετικά προϊόντα, που έχουν  ενδεχόμενη βιολογική δράση. Μόρια που κωδικοποιούνται άμεσα από το γονιδίωμα, όπως τα νουκλεϊκά οξέα, οι πρωτεΐνες και τα πεπτίδια που παράγονται από πρωτεΐνες με πρωτεολυτική διάσπαση (proteolytic cleavage), δεν περιλαμβάνονται -κατά κανόνα-στο ChEBI.

Το ChEBI χρησιμοποιεί την ονοματολογία, συμβολισμό και ορολογία της IUPAC και της επιτροπής ονοματολογίας της Διεθνούς Ένωσης Βιοχημείας και Μοριακής Βιολογίας (NC-IUBMB).

Σκοπός και πρόσβαση
Όλα τα δεδομένα της βάσης δεδομένων είναι μη ιδιοταγή ή παράγονται από μη ιδιοταγή πηγή. Είναι συνεπώς ελεύθερα προσπελάσιμα και διαθέσιμα στον καθέναν. Επιπλέον, κάθε στοιχείο δεδομένου είναι πλήρως ανιχνεύσιμο και αναφέρεται ρητά στην αρχική πηγή.

Τα δεδομένα ChEBI είναι διαθέσιμα μέσω μιας δημόσιας διεπαφής ιστού, υπηρεσίας ιστού και μεταφορτώσεων.

Παραπομπές

Εξωτερικοί σύνδεσμοι

http://www.ebi.ac.uk/chebi/
ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/chebi/

Χημικές βάσεις δεδομένων
Βιολογικές βάσεις δεδομένων
Χημική ονοματολογία