Jmol

Το Jmol είναι μια αναπαράσταση ανοιχτού λογισμικού Java για χημικές δομές σε τρισδιάστατη απεικόνιση (3D),
που δεν απαιτεί πρόσθετα 3D επιτάχυνσης.
Το Jmol επιστρέφει μια τρισδιάστατη αναπαράσταση ενός μορίου που μπορεί να χρησιμοποιηθεί ως διδακτικό εργαλείο ή για έρευνα π.χ. στη χημεία και τη βιοχημεία.
Είναι λογισμικό ελεύθερου και ανοικτού κώδικα, γραμμένο σε Java και έτσι εκτελείται σε Windows, Mac OS X, Linux και συστήματα Unix.
Υπάρχει μια αυτόνομη εφαρμογή και ένα πακέτο ανάπτυξης που μπορεί να ενσωματωθεί σε άλλες εφαρμογές Java, όπως Bioclipse και Taverna workbench.

Ένα δημοφιλές γνώρισμα είναι μια μικροεφαρμογή που μπορεί να ενσωματωθεί σε ιστοσελίδες για να εμφανίσει μόρια με διάφορους τρόπους.
Για παράδειγμα, τα μόρια μπορούν να εμφανιστούν ως πρότυπα "σφαίρες και ράβδοι", "πλήρωσης χώρου", "κορδέλας" κλπ.
Το Jmol υποστηρίζει ευρεία περιοχή Μοριακών μορφών αρχείων, που συμπεριλαμβάνουν Τράπεζα δεδομένων πρωτεϊνών (pdb), Κρυσταλλογραφικά αρχεία πληροφοριών (cif), MDL Molfile (mol) και χημική γλώσσα επισήμανσης (CML).

Η μικροεφαρμογή Jmol, μεταξύ των άλλων, προσφέρει μια εναλλακτική λύση στο πρόσθετο MDL Chime, που δεν αναπτύσσεται πλέον. Ενώ το Jmol έχει πολλά χαρακτηριστικά που δεν είναι διαθέσιμα στο Chime, δεν έχει πρόβλημα αναπαραγωγής όλων των λειτουργιών του Chime (κυρίως της κατάστασης Sculpt του Chime). Το Chime απαιτεί εγκατάσταση προσθέτου και Internet Explorer 6.0 ή Firefox 2.0 σε Microsoft Windows, ή Netscape Communicator 4.8 σε MacintoshOS9. Το Jmol απαιτεί εγκατάσταση της Java και λειτουργεί σε μεγάλο εύρος λειτουργικών συστημάτων. Για παράδειγμα, το Jmol είναι πλήρως λειτουργικό σε Mozilla Firefox, Internet Explorer, Opera, Google Chrome και Safari.



Στιγμιότυπα

Δείτε επίσης

 Κατάλογος μοριακών συστημάτων γραφικών
 Κατάλογος λογισμικού για μοριακά πρότυπα μηχανικής
 Πακέτο ανάπτυξης χημείας (CDK)
 Μοριακά γραφικά
 Proteopedia
 PyMOL
 Jmol extension for MediaWiki

Παραπομπές

Εξωτερικοί σύνδεσμοι
 
 

 Wiki με καταλόγους των ιστοσελίδων, wikis και moodles

Ελεύθερο λογισμικό
Λογισμικό χημείας