Datasets:

ncbi_disease

like 38

[ "Since", "a", "mutation", "at", "cDNA", "nucleotide", "2302", "(", "2302insC", ")", "had", "been", "previously", "described", ",", "this", "region", "of", "the", "ATP7B", "gene", "may", "be", "susceptible", "to", "gene", "rearrangements", "causing", "Wilson", "disease", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0 ]

[ "Disruption", "of", "splicing", "regulated", "by", "a", "CUG", "-", "binding", "protein", "in", "myotonic", "dystrophy", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0 ]

[ "Myotonic", "dystrophy", "(", "DM", ")", "is", "caused", "by", "a", "CTG", "expansion", "in", "the", "3", "untranslated", "region", "of", "the", "DM", "gene", "." ]

[ 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0 ]

[ "One", "model", "of", "DM", "pathogenesis", "suggests", "that", "RNAs", "from", "the", "expanded", "allele", "create", "a", "gain", "-", "of", "-", "function", "mutation", "by", "the", "inappropriate", "binding", "of", "proteins", "to", "the", "CUG", "repeats", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Data", "presented", "here", "indicate", "that", "the", "conserved", "heterogeneous", "nuclear", "ribonucleoprotein", ",", "CUG", "-", "binding", "protein", "(", "CUG", "-", "BP", ")", ",", "may", "mediate", "the", "trans", "-", "dominant", "effect", "of", "the", "RNA", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "CUG", "-", "BP", "was", "found", "to", "bind", "to", "the", "human", "cardiac", "troponin", "T", "(", "cTNT", ")", "pre", "-", "messenger", "RNA", "and", "regulate", "its", "alternative", "splicing", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Splicing", "of", "cTNT", "was", "disrupted", "in", "DM", "striated", "muscle", "and", "in", "normal", "cells", "expressing", "transcripts", "that", "contain", "CUG", "repeats", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Altered", "expression", "of", "genes", "regulated", "posttranscriptionally", "by", "CUG", "-", "BP", "therefore", "may", "contribute", "to", "DM", "pathogenesis", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0 ]

[ "Identification", "of", "a", "novel", "nonsense", "mutation", "and", "a", "missense", "substitution", "in", "the", "vasopressin", "-", "neurophysin", "II", "gene", "in", "two", "Spanish", "kindreds", "with", "familial", "neurohypophyseal", "diabetes", "insipidus", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0 ]

[ "Familial", "neurohypophyseal", "diabetes", "insipidus", "(", "FNDI", ")", "is", "an", "autosomal", "dominant", "disease", "caused", "by", "deficiency", "in", "the", "antidiuretic", "hormone", "arginine", "vasopressin", "(", "AVP", ")", "encoded", "by", "the", "AVP", "-", "neurophysin", "II", "(", "AVP", "-", "NPII", ")", "gene", "on", "chromosome", "20p13", "." ]

[ 1, 2, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "this", "study", ",", "we", "analyzed", "two", "families", "with", "FNDI", "using", "direct", "automated", "fluorescent", ",", "solid", "phase", ",", "single", "-", "stranded", "DNA", "sequencing", "of", "PCR", "-", "amplified", "AVP", "-", "NPII", "DNA", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "one", "of", "the", "families", ",", "affected", "individuals", "presented", "a", "novel", "nonsense", "mutation", "in", "exon", "3", "of", "the", "gene", ",", "consisting", "in", "a", "G", "to", "T", "transition", "at", "nucleotide", "2101", ",", "which", "produces", "a", "stop", "signal", "in", "codon", "82", "(", "Glu", ")", "of", "NPII", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "premature", "termination", "eliminates", "part", "of", "the", "C", "-", "terminal", "domain", "of", "NPII", ",", "including", "a", "cysteine", "residue", "in", "position", "85", ",", "which", "could", "be", "involved", "in", "the", "correct", "folding", "of", "the", "prohormone", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "the", "second", "family", ",", "a", "G279A", "substitution", "at", "position", "-", "1", "of", "the", "signal", "peptide", "was", "observed", "in", "all", "affected", "individuals", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "This", "missense", "mutation", ",", "which", "replaces", "Ala", "with", "Thr", ",", "is", "frequent", "among", "FNDI", "patients", "and", "is", "thought", "to", "reduce", "the", "efficiency", "of", "cleavage", "by", "signal", "peptidases", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Genetic", "heterogeneity", "of", "Saethre", "-", "Chotzen", "syndrome", ",", "due", "to", "TWIST", "and", "FGFR", "mutations", "." ]

[ 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Thirty", "-", "two", "unrelated", "patients", "with", "features", "of", "Saethre", "-", "Chotzen", "syndrome", ",", "a", "common", "autosomal", "dominant", "condition", "of", "craniosynostosis", "and", "limb", "anomalies", ",", "were", "screened", "for", "mutations", "in", "TWIST", ",", "FGFR2", ",", "and", "FGFR3", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Nine", "novel", "and", "three", "recurrent", "TWIST", "mutations", "were", "found", "in", "12", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Seven", "families", "were", "found", "to", "have", "the", "FGFR3", "P250R", "mutation", ",", "and", "one", "individual", "was", "found", "to", "have", "an", "FGFR2", "VV269", "-", "270", "deletion", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "To", "date", ",", "our", "detection", "rate", "for", "TWIST", "or", "FGFR", "mutations", "is", "68", "%", "in", "our", "Saethre", "-", "Chotzen", "syndrome", "patients", ",", "including", "our", "five", "patients", "elsewhere", "reported", "with", "TWIST", "mutations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "More", "than", "35", "different", "TWIST", "mutations", "are", "now", "known", "in", "the", "literature", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "most", "common", "phenotypic", "features", ",", "present", "in", "more", "than", "a", "third", "of", "our", "patients", "with", "TWIST", "mutations", ",", "are", "coronal", "synostosis", ",", "brachycephaly", ",", "low", "frontal", "hairline", ",", "facial", "asymmetry", ",", "ptosis", ",", "hypertelorism", ",", "broad", "great", "toes", ",", "and", "clinodactyly", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 1, 0 ]

[ "Significant", "intra", "-", "and", "interfamilial", "phenotypic", "variability", "is", "present", "for", "either", "TWIST", "mutations", "or", "FGFR", "mutations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "overlap", "in", "clinical", "features", "and", "the", "presence", ",", "in", "the", "same", "genes", ",", "of", "mutations", "for", "more", "than", "one", "craniosynostotic", "condition", "-", "such", "as", "Saethre", "-", "Chotzen", ",", "Crouzon", ",", "and", "Pfeiffer", "syndromes", "-", "support", "the", "hypothesis", "that", "TWIST", "and", "FGFRs", "are", "components", "of", "the", "same", "molecular", "pathway", "involved", "in", "the", "modulation", "of", "craniofacial", "and", "limb", "development", "in", "humans", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Mutation", "analysis", "of", "UBE3A", "in", "Angelman", "syndrome", "patients", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0 ]

[ "Angelman", "syndrome", "(", "AS", ")", "is", "caused", "by", "chromosome", "15q11", "-", "q13", "deletions", "of", "maternal", "origin", ",", "by", "paternal", "uniparental", "disomy", "(", "UPD", ")", "15", ",", "by", "imprinting", "defects", ",", "and", "by", "mutations", "in", "the", "UBE3A", "gene", "." ]

[ 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "UBE3A", "encodes", "a", "ubiquitin", "-", "protein", "ligase", "and", "shows", "brain", "-", "specific", "imprinting", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Here", "we", "describe", "UBE3A", "coding", "-", "region", "mutations", "detected", "by", "SSCP", "analysis", "in", "13", "AS", "individuals", "or", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Two", "identical", "de", "novo", "5", "-", "bp", "duplications", "in", "exon", "16", "were", "found", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Among", "the", "other", "11", "unique", "mutations", ",", "8", "were", "small", "deletions", "or", "insertions", "predicted", "to", "cause", "frameshifts", ",", "1", "was", "a", "mutation", "to", "a", "stop", "codon", ",", "1", "was", "a", "missense", "mutation", ",", "and", "1", "was", "predicted", "to", "cause", "insertion", "of", "an", "isoleucine", "in", "the", "hect", "domain", "of", "the", "UBE3A", "protein", ",", "which", "functions", "in", "E2", "binding", "and", "ubiquitin", "transfer", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Eight", "of", "the", "cases", "were", "familial", ",", "and", "five", "were", "sporadic", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "two", "familial", "cases", "and", "one", "sporadic", "case", ",", "mosaicism", "for", "UBE3A", "mutations", "was", "detected", "in", "the", "mother", "of", "three", "AS", "sons", ",", "in", "the", "maternal", "grandfather", "of", "two", "AS", "first", "cousins", ",", "and", "in", "the", "mother", "of", "an", "AS", "daughter", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0 ]

[ "The", "frequencies", "with", "which", "we", "detected", "mutations", "were", "5", "(", "14", "%", ")", "of", "35", "in", "sporadic", "cases", "and", "8", "(", "80", "%", ")", "of", "10", "in", "familial", "cases", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "hemochromatosis", "845", "G", "-", "-", ">", "A", "and", "187", "C", "-", "-", ">", "G", "mutations", ":", "prevalence", "in", "non", "-", "Caucasian", "populations", "." ]

[ 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Hemochromatosis", ",", "the", "inherited", "disorder", "of", "iron", "metabolism", ",", "leads", ",", "if", "untreated", ",", "to", "progressive", "iron", "overload", "and", "premature", "death", "." ]

[ 1, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0 ]

[ "The", "hemochromatosis", "gene", ",", "HFE", ",", "recently", "has", "been", "identified", ",", "and", "characterization", "of", "this", "gene", "has", "shown", "that", "it", "contains", "two", "mutations", "that", "result", "in", "amino", "acid", "substitutions", "-", "cDNA", "nucleotides", "845", "G", "-", "-", ">", "A", "(", "C282Y", ")", "and", "187", "C", "-", "-", ">", "G", "(", "H63D", ")", "." ]

[ 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Although", "hemochromatosis", "is", "common", "in", "Caucasians", ",", "affecting", ">", "=", "1", "/", "300", "individuals", "of", "northern", "European", "origin", ",", "it", "has", "not", "been", "recognized", "in", "other", "populations", "." ]

[ 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "present", "study", "used", "PCR", "and", "restriction", "-", "enzyme", "digestion", "to", "analyze", "the", "frequency", "of", "the", "845", "G", "-", "-", ">", "A", "and", "187", "C", "-", "-", ">", "G", "mutations", "in", "HLA", "-", "typed", "samples", "from", "non", "-", "Caucasian", "populations", ",", "comprising", "Australian", "Aboriginal", ",", "Chinese", ",", "and", "Pacific", "Islanders", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Results", "showed", "that", "the", "845", "G", "-", "-", ">", "A", "mutation", "was", "present", "in", "these", "populations", "(", "allele", "frequency", "0", ".", "32", "%", ")", ",", "and", ",", "furthermore", ",", "it", "was", "always", "seen", "in", "conjunction", "with", "HLA", "haplotypes", "common", "in", "Caucasians", ",", "suggesting", "that", "845", "G", "-", "-", ">", "A", "may", "have", "been", "introduced", "into", "these", "populations", "by", "Caucasian", "admixture", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "187", "C", "-", "-", ">", "G", "was", "present", "at", "an", "allele", "frequency", "of", "2", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "68", "%", "in", "the", "two", "populations", "analyzed", "(", "Australian", "Aboriginal", "and", "Chinese", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "the", "Australian", "Aboriginal", "samples", ",", "187", "C", "-", "-", ">", "G", "was", "found", "to", "be", "associated", "with", "HLA", "haplotypes", "common", "in", "Caucasians", ",", "suggesting", "that", "it", "was", "introduced", "by", "recent", "admixture", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "the", "Chinese", "samples", "analyzed", ",", "187", "C", "-", "-", ">", "G", "was", "present", "in", "association", "with", "a", "wide", "variety", "of", "HLA", "haplotypes", ",", "showing", "this", "mutation", "to", "be", "widespread", "and", "likely", "to", "predate", "the", "more", "genetically", "restricted", "845", "G", "-", "-", ">", "A", "mutation", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Genotype", "-", "phenotype", "correlations", "in", "attenuated", "adenomatous", "polyposis", "coli", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0 ]

[ "Germ", "-", "line", "mutations", "of", "the", "tumor", "suppressor", "APC", "are", "implicated", "in", "attenuated", "adenomatous", "polyposis", "coli", "(", "AAPC", ")", ",", "a", "variant", "of", "familial", "adenomatous", "polyposis", "(", "FAP", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 0, 0 ]

[ "AAPC", "is", "recognized", "by", "the", "occurrence", "of", "<", "100", "colonic", "adenomas", "and", "a", "later", "onset", "of", "colorectal", "cancer", "(", "age", ">", "40", "years", ")", "." ]

[ 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "aim", "of", "this", "study", "was", "to", "assess", "genotype", "-", "phenotype", "correlations", "in", "AAPC", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0 ]

[ "By", "protein", "-", "truncation", "test", "(", "PTT", ")", "assay", ",", "the", "entire", "coding", "region", "of", "the", "APC", "gene", "was", "screened", "in", "affected", "individuals", "from", "11", "AAPC", "kindreds", ",", "and", "their", "phenotypic", "differences", "were", "examined", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Five", "novel", "germ", "-", "line", "APC", "mutations", "were", "identified", "in", "seven", "kindreds", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Mutations", "were", "located", "in", "three", "different", "regions", "of", "the", "APC", "gene", "(", "1", ")", "at", "the", "5", "end", "spanning", "exons", "4", "and", "5", ",", "(", "2", ")", "within", "exon", "9", ",", "and", "(", "3", ")", "at", "the", "3", "distal", "end", "of", "the", "gene", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Variability", "in", "the", "number", "of", "colorectal", "adenomas", "was", "most", "apparent", "in", "individuals", "with", "mutations", "in", "region", "1", ",", "and", "upper", "-", "gastrointestinal", "manifestations", "were", "more", "severe", "in", "them", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "individuals", "with", "mutations", "in", "either", "region", "2", "or", "region", "3", ",", "the", "average", "number", "of", "adenomas", "tended", "to", "be", "lower", "than", "those", "in", "individuals", "with", "mutations", "in", "region", "1", ",", "although", "age", "at", "diagnosis", "was", "similar", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "all", "AAPC", "kindreds", ",", "a", "predominance", "of", "right", "-", "sided", "colorectal", "adenomas", "and", "rectal", "polyp", "sparing", "was", "observed", "." ]

[ 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0 ]

[ "No", "desmoid", "tumors", "were", "found", "in", "these", "kindreds", "." ]

[ 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Our", "data", "suggest", "that", ",", "in", "AAPC", "families", ",", "the", "location", "of", "the", "APC", "mutation", "may", "partially", "predict", "specific", "phenotypic", "expression", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "This", "should", "help", "in", "the", "design", "of", "tailored", "clinical", "-", "management", "protocols", "in", "this", "subset", "of", "FAP", "patients", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0 ]

[ "Wilms", "'", "tumor", "1", "and", "Dax", "-", "1", "modulate", "the", "orphan", "nuclear", "receptor", "SF", "-", "1", "in", "sex", "-", "specific", "gene", "expression", "." ]

[ 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Products", "of", "steroidogenic", "factor", "1", "(", "SF", "-", "1", ")", "and", "Wilms", "tumor", "1", "(", "WT1", ")", "genes", "are", "essential", "for", "mammalian", "gonadogenesis", "prior", "to", "sexual", "differentiation", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "males", ",", "SF", "-", "1", "participates", "in", "sexual", "development", "by", "regulating", "expression", "of", "the", "polypeptide", "hormone", "Mullerian", "inhibiting", "substance", "(", "MIS", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Here", ",", "we", "show", "that", "WT1", "-", "KTS", "isoforms", "associate", "and", "synergize", "with", "SF", "-", "1", "to", "promote", "MIS", "expression", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "In", "contrast", ",", "WT1", "missense", "mutations", ",", "associated", "with", "male", "pseudohermaphroditism", "in", "Denys", "-", "Drash", "syndrome", ",", "fail", "to", "synergize", "with", "SF", "-", "1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Additionally", ",", "the", "X", "-", "linked", ",", "candidate", "dosage", "-", "sensitive", "sex", "-", "reversal", "gene", ",", "Dax", "-", "1", ",", "antagonizes", "synergy", "between", "SF", "-", "1", "and", "WT1", ",", "most", "likely", "through", "a", "direct", "interaction", "with", "SF", "-", "1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "propose", "that", "WT1", "and", "Dax", "-", "1", "functionally", "oppose", "each", "other", "in", "testis", "development", "by", "modulating", "SF", "-", "1", "-", "mediated", "transactivation", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "A", "mouse", "model", "for", "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "imprinting", "-", "centre", "mutations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Imprinting", "in", "the", "15q11", "-", "q13", "region", "involves", "an", "imprinting", "centre", "(", "IC", ")", ",", "mapping", "in", "part", "to", "the", "promoter", "and", "first", "exon", "of", "SNRPN", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Deletion", "of", "this", "IC", "abolishes", "local", "paternally", "derived", "gene", "expression", "and", "results", "in", "Prader", "-", "Willi", "syndrome", "(", "PWS", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 1, 0, 0 ]

[ "We", "have", "created", "two", "deletion", "mutations", "in", "mice", "to", "understand", "PWS", "and", "the", "mechanism", "of", "this", "IC", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Mice", "harbouring", "an", "intragenic", "deletion", "in", "Snrpn", "are", "phenotypically", "normal", ",", "suggesting", "that", "mutations", "of", "SNRPN", "are", "not", "sufficient", "to", "induce", "PWS", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0 ]

[ "Mice", "with", "a", "larger", "deletion", "involving", "both", "Snrpn", "and", "the", "putative", "PWS", "-", "IC", "lack", "expression", "of", "the", "imprinted", "genes", "Zfp127", "(", "mouse", "homologue", "of", "ZNF127", ")", ",", "Ndn", "and", "Ipw", ",", "and", "manifest", "several", "phenotypes", "common", "to", "PWS", "infants", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0 ]

[ "These", "data", "demonstrate", "that", "both", "the", "position", "of", "the", "IC", "and", "its", "role", "in", "the", "coordinate", "expression", "of", "genes", "is", "conserved", "between", "mouse", "and", "human", ",", "and", "indicate", "that", "the", "mouse", "is", "a", "suitable", "model", "system", "in", "which", "to", "investigate", "the", "molecular", "mechanisms", "of", "imprinting", "in", "this", "region", "of", "the", "genome", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Mutations", "of", "the", "ATM", "gene", "detected", "in", "Japanese", "ataxia", "-", "telangiectasia", "patients", ":", "possible", "preponderance", "of", "the", "two", "founder", "mutations", "4612del165", "and", "7883del5", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "ATM", "(", "A", "-", "T", ",", "mutated", ")", "gene", "on", "human", "chromosome", "11q22", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "3", "has", "recently", "been", "identified", "as", "the", "gene", "responsible", "for", "the", "human", "recessive", "disease", "ataxia", "-", "telangiectasia", "(", "A", "-", "T", ")", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 2, 2, 0, 1, 2, 2, 0, 0 ]

[ "In", "order", "to", "define", "the", "types", "of", "disease", "-", "causing", "ATM", "mutations", "in", "Japanese", "A", "-", "T", "patients", "as", "well", "as", "to", "look", "for", "possible", "mutational", "hotspots", ",", "reverse", "-", "transcribed", "RNA", "derived", "from", "ten", "patients", "belonging", "to", "eight", "unrelated", "Japanese", "A", "-", "T", "families", "was", "analyzed", "for", "mutations", "by", "the", "restriction", "endonuclease", "fingerprinting", "method", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "As", "has", "been", "reported", "by", "others", ",", "mutations", "that", "lead", "to", "exon", "skipping", "or", "premature", "protein", "truncation", "were", "also", "predominant", "in", "our", "mutants", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Six", "different", "mutations", "were", "identified", "on", "12", "of", "the", "16", "alleles", "examined", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Four", "were", "deletions", "involving", "a", "loss", "of", "a", "single", "exon", "exon", "7", ",", "exon", "16", ",", "exon", "33", "or", "exon", "35", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "others", "were", "minute", "deletions", ",", "4649delA", "in", "exon", "33", "and", "7883del5", "in", "exon", "55", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "mutations", "4612del165", "and", "7883del5", "were", "found", "in", "more", "than", "two", "unrelated", "families", ";", "44", "%", "(", "7", "of", "16", ")", "of", "the", "mutant", "alleles", "had", "one", "of", "the", "two", "mutations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "4612del165", "mutations", "in", "three", "different", "families", "were", "all", "ascribed", "to", "the", "same", "T", "-", "-", ">", "A", "substitution", "at", "the", "splice", "donor", "site", "in", "intron", "33", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Microsatellite", "genotyping", "around", "the", "ATM", "locus", "also", "indicated", "that", "a", "common", "haplotype", "was", "shared", "by", "the", "mutant", "alleles", "in", "both", "mutations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "This", "suggests", "that", "these", "two", "founder", "mutations", "may", "be", "predominant", "among", "Japanese", "ATM", "mutant", "alleles", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "W474C", "amino", "acid", "substitution", "affects", "early", "processing", "of", "the", "alpha", "-", "subunit", "of", "beta", "-", "hexosaminidase", "A", "and", "is", "associated", "with", "subacute", "G", "(", "M2", ")", "gangliosidosis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0 ]

[ "Mutations", "in", "the", "HEXA", "gene", ",", "encoding", "the", "alpha", "-", "subunit", "of", "beta", "-", "hexosaminidase", "A", "(", "Hex", "A", ")", ",", "that", "abolish", "Hex", "A", "enzyme", "activity", "cause", "Tay", "-", "Sachs", "disease", "(", "TSD", ")", ",", "the", "fatal", "infantile", "form", "of", "G", "(", "M2", ")", "gangliosidosis", ",", "Type", "1", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 2, 0 ]

[ "Less", "severe", ",", "subacute", "(", "juvenile", "-", "onset", ")", "and", "chronic", "(", "adult", "-", "onset", ")", "variants", "are", "characterized", "by", "a", "broad", "spectrum", "of", "clinical", "manifestations", "and", "are", "associated", "with", "residual", "levels", "of", "Hex", "A", "enzyme", "activity", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "identified", "a", "1422", "G", "-", "-", ">", "C", "(", "amino", "acid", "W474C", ")", "substitution", "in", "the", "first", "position", "of", "exon", "13", "of", "HEXA", "of", "a", "non", "-", "Jewish", "proband", "who", "manifested", "a", "subacute", "variant", "of", "G", "(", "M2", ")", "gangliosidosis", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 2, 0 ]

[ "On", "the", "second", "maternally", "inherited", "allele", ",", "we", "identified", "the", "common", "infantile", "disease", "-", "causing", "4", "-", "bp", "insertion", ",", "+", "TATC", "1278", ",", "in", "exon", "11", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Pulse", "-", "chase", "analysis", "using", "proband", "fibroblasts", "revealed", "that", "the", "W474C", "-", "containing", "alpha", "-", "subunit", "precursor", "was", "normally", "synthesized", ",", "but", "not", "phosphorylated", "or", "secreted", ",", "and", "the", "mature", "lysosomal", "alpha", "-", "subunit", "was", "not", "detected", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "When", "the", "W474C", "-", "containing", "alpha", "-", "subunit", "was", "transiently", "co", "-", "expressed", "with", "the", "beta", "-", "subunit", "to", "produce", "Hex", "A", "(", "alphabeta", ")", "in", "COS", "-", "7", "cells", ",", "the", "mature", "alpha", "-", "subunit", "was", "present", ",", "but", "its", "level", "was", "much", "lower", "than", "that", "from", "normal", "alpha", "-", "subunit", "transfections", ",", "although", "higher", "than", "in", "those", "cells", "transfected", "with", "an", "alpha", "-", "subunit", "associated", "with", "infantile", "TSD", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0 ]

[ "Furthermore", ",", "the", "precursor", "level", "of", "the", "W474C", "alpha", "-", "subunit", "was", "found", "to", "accumulate", "in", "comparison", "to", "the", "normal", "alpha", "-", "subunit", "precursor", "levels", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "conclude", "that", "the", "1422", "G", "-", "-", ">", "C", "mutation", "is", "the", "cause", "of", "Hex", "A", "enzyme", "deficiency", "in", "the", "proband", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 2, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "resulting", "W474C", "substitution", "clearly", "interferes", "with", "alpha", "-", "subunit", "processing", ",", "but", "because", "the", "base", "substitution", "falls", "at", "the", "first", "position", "of", "exon", "13", ",", "aberrant", "splicing", "may", "also", "contribute", "to", "Hex", "A", "deficiency", "in", "this", "proband", ".", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Two", "frequent", "missense", "mutations", "in", "Pendred", "syndrome", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0 ]

[ "Pendred", "syndrome", "is", "an", "autosomal", "recessive", "disorder", "characterized", "by", "early", "childhood", "deafness", "and", "goiter", "." ]

[ 1, 2, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0 ]

[ "A", "century", "after", "its", "recognition", "as", "a", "syndrome", "by", "Vaughan", "Pendred", ",", "the", "disease", "gene", "(", "PDS", ")", "was", "mapped", "to", "chromosome", "7q22", "-", "q31", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "1", "and", ",", "recently", ",", "found", "to", "encode", "a", "putative", "sulfate", "transporter", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "We", "performed", "mutation", "analysis", "of", "the", "PDS", "gene", "in", "patients", "from", "14", "Pendred", "families", "originating", "from", "seven", "countries", "and", "identified", "all", "mutations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "The", "mutations", "include", "three", "single", "base", "deletions", ",", "one", "splice", "site", "mutation", "and", "10", "missense", "mutations", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "One", "missense", "mutation", "(", "L236P", ")", "was", "found", "in", "a", "homozygous", "state", "in", "two", "consanguineous", "families", "and", "in", "a", "heterozygous", "state", "in", "five", "additional", "non", "-", "consanguineous", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]

[ "Another", "missense", "mutation", "(", "T416P", ")", "was", "found", "in", "a", "homozygous", "state", "in", "one", "family", "and", "in", "a", "heterozygous", "state", "in", "four", "families", "." ]

[ 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0 ]