金刀比羅本教は神社本庁に属さない独立した包括宗教法人であるが、金刀比羅宮自体は神社本庁の被包括法人であり、別表神社に指定されている。
虽然金刀比罗本教作为“包括宗教法人”，不归属神社本厅（日语：神社本庁）管辖，金刀比罗宫本身是神社本厅的被包括宗教法人，有别表神社的地位。