元朝の宮廷はチベット仏教を公認の宗教としていたものの、一般的なモンゴル人の大部分、特にモンゴル本土に住み続けた者は、シャーマニズムを固守。
明末清初，生活于蒙古高原的蒙古人已全民信仰藏传佛教，而生活于中国西北地区信仰伊斯兰教的蒙古人即是蒙古回回。