駅（所在地・新宿三丁目3-2）の大部分は新宿三丁目にあるが、ホームの西端と一部の出入口(C7・8)は新宿二丁目にある。
车站（所在地、新宿三丁目3-2）大部分位于新宿三丁目，月台西端与部分出入口（C7与C8）位于新宿二丁目。