八重山諸島では、沖縄県との協定により、海上保安庁石垣航空基地所属機に急患搬送が任されており、海上保安庁が八重山諸島の救急体制の一翼を担っている。
此外，由于石垣市厚生局（日语：厚生局(琉球政府)）设有医疗航空事务所，因此石垣航空基地负上了冲绳县的直升机救护之责，进行对八重山群岛地区紧急伤患运送之任务。