京都行きは棚倉駅（一部は上狛駅）で2分ほど運転停車して奈良行きのみやこ路快速と行き違うため、下りと上りとで所要時間に若干差があり、標準所要時間は京都駅から奈良駅へが約44分、奈良駅から京都駅へが約47分である。
然而，奈良线仍以单线区间为主，因此开往京都站的列车需要在棚仓站（部分于上狛站）运转停车，等待南行列车通过，从而南北双向运行时间出现差异，所以京都开往奈良只需约44分钟，由奈良开往京都则需时47分钟。