1953年9月30日廃止宇佐駅：大分交通宇佐参宮線-1965年8月21日廃止杵築駅：大分交通国東線-1966年4月1日廃止亀川駅：大分交通別大線…亀川駅前電停-1972年4月5日廃止別府駅：大分交通別大線別府駅前支線…別府駅前電停-1956年10月19日廃止東別府駅：大分交通別大線…東別府駅前電停-1972年4月5日廃止西大分駅：大分交通別大線…西大分電停-1972年4月5日廃止大分駅：大分交通別大線…大分駅前電停-1972年4月5日廃止幸崎駅：日本鉱業佐賀関鉄道…日鉱幸崎駅-1963年5月15日廃止延岡駅：高千穂鉄道高千穂線-2005年9月6日休止、2007年9月6日廃止日向住吉駅：住吉村営人車軌道日向市駅：細島線-1972年2月1日旅客営業廃止（日豊本線貨物支線に編入。
1953年9月30日废除宇佐站：大分交通宇佐参宫线（日语：大分交通宇佐参宫线）-1965年8月21日废除杵筑站：大分交通国东线（日语：大分交通国东线）-1966年4月1日废除龟川站：大分交通别大线（日语：大分交通别大线）…龟川站前电停-1972年4月5日废除别府站：大分交通别大线别府站前支线…别府站前电停-1956年10月19日废除东别府站：大分交通别大线…东别府站前电停-1972年4月5日废除西大分站：大分交通别大线…西大分电停-1972年4月5日废除大分站：大分交通别大线…大分站前电停-1972年4月5日废除幸崎站：日本矿业（日语：ジャパンエナジー）佐贺关铁道（日语：日本鉱业佐贺関铁道）…日矿幸崎站-1963年5月15日废除延冈站：高千穗铁道高千穗线-2005年9月6日休止，2007年9月6日废除日向住吉站：住吉村营人车轨道（日语：住吉村営人车轨道）日向市站：细岛线（日语：细岛线）-1972年2月1日停止旅客营业（编入日丰本线货物支线。