平安時代に入ると、蔵人など後宮出入りの職権を持つ官職が登場するようになると、後宮十二司の役割が低下し、10世紀の中頃には内侍司に他の11司の機能が吸収・統合される形で後宮の機構改革が行われながら摂関政治期を迎えることになった。
10世纪中期以后，十二司中的内侍司，吸收了其于十一司的工作机能，十二司的规制在此改革下因此消失，转而由承袭过去十二司而来的内侍司，继续维持后宫的运作，并更加紧密配合了往后摄关政治的运作。