名称は、中国側窓口機関海峡両岸関係協会と台湾側窓口機関海峡交流基金会が1992年に香港で行った協議に由来し、2000年4月に台湾の行政院大陸委員会主任委員蘇起が名付けて公表した。
此前，中华民国政府和大陆的中华人民共和国政府分别授权的非官方组织海峡交流基金会、海峡两岸关系协会在1992年举行香港会谈。