ただし、歴史的にはマレー鉄道とタイ国鉄南線はマレー半島縦断鉄道という構想のもとに計画されたものではない上に、現地でもマレー鉄道の名称は専らマレーシアの鉄道を指す語としてのみ使用されている。
值得注意的是，虽然新加坡并非属于马来西亚的一部分，但新加坡不仅是马来亚铁路网的最南端，兀兰关卡更是马来亚铁路唯一一个在新加坡境内的车站，新加坡与马来西亚之间的国际列车服务亦是由马来亚铁路营运。