関ヶ原の戦いの翌年・慶長6年（1601年）徳川家康は寺院諸法度を定め、寺院の序列を決める本末制度によって仏教勢力の武力を抑制し、寺社支配の体制を整えた。
1601年（庆长6年）以降，透过寺院诸法度，制定各宗派寺院的本山・末寺关系，统制各宗派。