地名の由来には2説あり、一つは大学士沈光文が筆禍のため僧侶に扮してこの地に逃れて来た際、多くの地元の子弟に学問を講義したことでこの地が学問の中心となり、「横経講学鴻博之士」が逃れた地ということで「羅漢門」と称されるようになったというものであり、第二が平埔族が烏山山脈から楠梓仙渓以東の地を「Rohan」と称したことから「羅漢門」と訳出されたというものである。
内门区原为原住民平埔族马卡道族大杰癫社故地，旧称“罗汉门”或“罗汉内门”，其地名由来有两种说法：一是说大学士沈光文因作诗讽刺郑经，几遭不测，便乔装为僧侣逃到此地，并搭起茅寮招收生徒，在经过他的讲学后，此地成为一个人文荟萃之地，由于当时追随沈光文者多为鸿儒，后人便将“横经讲学鸿博之士”所避居之地，取名为“罗汉门”；二是当时平埔族将乌山山脉到楠梓仙溪以东的地区称为“Rohan”，而二层行溪上游地形险峻，如同罗汉把守两侧，汉人移民因而将“Rohan”附会为“罗汉门”。