しかし1906年（明治39年）10月1日に鉄道国有法により甲武鉄道は国有化され、御茶ノ水駅は国有鉄道の駅となるとともに、御茶ノ水駅より東への延長工事も国鉄へ引き継がれた。
但1906年（明治39年）10月1日，甲武铁道依据铁道国有法（日语：铁道国有法）国有化，御茶之水站成为国有铁道车站，御茶之水站东延工程也由国铁接手。