寺伝によれば、弘仁9年（818年）にこの地を訪れた空海（弘法大師）が蔓延する疫病に苦しむ人々のために津島牛頭天王社(現在の津島神社）の隣に堂を設けて薬師如来像を奉って祈祷したものが始まりとされる。
根据寺传，在弘仁9年（818年）拜访此地的空海（弘法大师）为了受传染病蔓延之苦的人们，在津岛牛头天王社（现在的津岛神社）旁边，建设了奉祀祭拜药师佛的建筑为起源。