ロシア勢力の南下が進む中、清朝は1683年（康熙22年）12月13日に黒竜江左岸旧璦琿城に黒竜江将軍衙門を設置、1685年（康熙24年）に黒竜江右岸新璦琿城（現在の愛輝鎮）に移転、更に1690年（康熙29年）には墨爾根（メルゲン、現在の嫩江県）に移転、璦琿副都統留守が璦琿新城に設置され、現在の黒河市全域を管轄していた。
1858年清朝和俄罗斯帝国签定《瑷珲条约》，在俄罗斯势力南下前进中，清康熙22年（1683年）12月13日，黑龙江左岸瑷珲旧城设置黑龙江将军衙门，康熙24年（1685年）在黑龙江右岸新设瑷珲城，康熙29年（1690年）在墨尔根（现在的嫩江县）设置瑷珲新城，管辖著现在的黑河市整个地区。