ケッペンの気候区分では大半が温帯（温暖湿潤気候、ただし山間部の一部では西岸海洋性気候）、標高の高い山は亜寒帯、火山列島・南鳥島・沖ノ鳥島は熱帯と3種類の気候が存在する。
依据柯本气候分类法，大部分属温带（温暖湿润气候，但一部分山区为西岸海洋性气候）地势较高的山属亚寒带气候，火山列岛、南鸟岛、冲之鸟岛为热带气候。