列車名称の普悠瑪はプユマ語で「集合・団結」を表すとともに、プユマ族の英文表記の「Puyuma」と原住民集落の南王部落/普悠瑪部落（卑南郷に所在。
列车的名称普悠玛源自卑南语，原指卑南族部落大首领所在地，亦有集合团结的意思；英文名译为“Puyuma”，同时这也是卑南乡以及台东市南王部落的称呼。