1967年9月3日にスイスのリュシュリコンにて開かれた第2回旗章学国際学会において暫定的に設立され、1969年9月7日第3回旗章学国際学会において正式に発足した。
旗帜学协会国际联盟最早在1967年9月30日于瑞士吕施利孔第二届旗帜学国际会议时暂时成立，1969年9月7日在波士顿的第三届旗帜学国际会议上正式成立。