低重心化を図るため、空調装置は床下に設置されており、その結果、屋根高さはE5系・H5系と同じ3650mmとなり、E3系と比べて430mm低くなっている。
为降低列车重心，车载空调乃装于地板下，故其车顶高度与E5系一样为3650毫米，比E3系的4300毫米为矮。