ナンキョクオキアミの分布は南氷洋に限られており、南氷洋における優先種であるが、北大西洋ではNorthernkrill（Meganyctiphanesnorvegica）が、太平洋ではツノナシオキアミ（E.pacifica）が優先種となっている。
南极磷虾只生活在南冰洋，但是在北大西洋及太平洋，主要分别是由北方磷虾（英语：Northernkrill）及太平洋磷虾（英语：Euphausiapacifica）所支配的。