かつては、仏教の末寺と同様に、支配・被支配関係を持つ神社同士の関係も存在したが、近代以降は、全ての神社が独立した組織となり、原則として本末関係は存在しない。
在过去曾存在着与佛教的末寺情形相同，彼此间具有支配与被支配关系的神社，然而到了近代以后，所有的神社都变成了独立的组织，故原则上神社之间已经没有本末之分的支配关系（但还是有例外）。