局内は6班からなり、総括や国家安全保障会議の事務を行う「総括・調整班」、アメリカ合衆国、ヨーロッパ諸国、ASEANなどを担当する「政策第1班」、北東アジアとロシアを担当する「政策第2班」、中東、アフリカ、中南米を担当する「政策第3班」、防衛計画の大綱や国家安全保障戦略など中長期的な安全保障政策を担当する「戦略企画班」、機密情報を扱う関係省庁など政府内での連絡調整を行う「情報班」に分かれている。
局内分为6班，包含负责综合事务与国家安全保障会议事务的“总括・调整班”、负责美国、欧洲各国、ASEAN等的“政策第1班”、负责东北亚与俄罗斯的“政策第2班”、负责中东、非洲、中南美的“政策第3班”、负责防卫计划大纲与国家安全保障战略等中长期安全保障政策的“战略企划班”、负责机密情报相关省厅等政府内联系的“情报班”。