設立当時は下部組織として「承政庁」、「普通教育司」、「専門教育司」及び「社会教育司」が設置され、国内皇位国関する事務を担当した。
中华民国成立之初，即将清朝的“学部”改名为“教育部”，当时底下有“承政厅”、“普通教育司”、“专门教育司”及“社会教育司”，从事国内教育兴革相关工作。