これらの諸問題を解決するために、2000年から当駅を中心とした本線4.7km（平和島-六郷土手間）と空港線1.3km（京急蒲田-大鳥居間）の合計6kmを連続立体交差化（高架化）する工事を施工し、当駅ではそれに併せて本線・空港線での平面交差の解消や当駅での緩急接続などを目的に、駅舎の建て替えと線路の移設工事が行われることになった。
为了解决诸多问题，2000年起以本站为中心进行本线4.7公里（平和岛-六乡土手间）与机场线1.3公里（京急蒲田-大鸟居间）合计6公里的交通立体化（高架化）工程，本站也配合进行站房改建与线路移动工程。