父方の祖父は初代サマセット伯ジョン・ボーフォートであり、マーガレットはランカスター公ジョン・オブ・ゴーントとその愛人であったキャサリン・スウィンフォードの曾孫にあたる。
玛格丽特是第一代萨默塞特伯爵约翰·博福特的孙女，第一代兰开斯特公爵冈特的约翰和情妇凯瑟琳·斯温福德的曾孙女，爱德华三世国王的玄孙女。