オクタフルオロキセノン酸イオンの分子構造は反四角柱形で、Xe-F結合長はそれぞれ1.971Å、1.946Å、1.958Å、2.052Å、2.099Åとなっている。
其中XeF82−离子为方形反棱柱分子构型，Xe-F键长分别为1.971Å、1.946Å、1.958Å、2.052Å和2.099Å。