最高裁判所は再審請求を棄却したが、「再審制度においても『疑わしきは被告人の利益に』という刑事裁判の鉄則が適用される」と判断し、後年「白鳥決定」と通称されている。
尽管村上的再审请求被驳回，但最高裁判所在决定中做出了如下表述“即使在再审制度中，也适用“存在疑点时其利益归被告人”的刑事诉讼基本原则”（通称为“白鸟决定”）。