弟の高吉とは仲が悪く、父も弟に家督を譲ろうとしたため、大永3年（1523年）、父に反発した浅見貞則や浅井亮政、堀元積ら近江国人衆に擁立され、父と弟を尾張に追い落とし、京極氏当主となった。
与弟弟高吉的关系恶劣，而父亲高清亦打算把家督让予高吉，于是在大永3年（1523年）反抗高清，被浅见贞则和浅井亮政、堀元积等近江国人众拥立，令父亲和弟弟逃到尾张国，自身成为京极氏当主，不过实权被浅见贞则掌握。