財務局財務支局（法律第14条）財務事務所（法律第15条）出張所税関支署（法律第17条）出張所監視署沖縄地区税関支署（法律第17条）出張所監視署北海道財務局（政令第80条）東北財務局関東財務局北陸財務局東海財務局近畿財務局中国財務局四国財務局九州財務局福岡財務支局函館税関（政令第84条）東京税関横浜税関名古屋税関大阪税関神戸税関門司税関長崎税関国税庁（国家行政組織法、法律第18条）国税審議会（法律第21条）国税不服審判所（法律第22条）国税局（法律第23条第1項）沖縄国税事務所（法律第23条第2項）財務省が主管する独立行政法人は2017年4月1日現在、独立行政法人酒類総合研究所、独立行政法人造幣局及び独立行政法人国立印刷局の3法人である。
财务局财务支局（法律第14条）财务事务所（法律第15条）出张所税关支署（法律第17条）出张所监视署冲绳地区税关支署（法律第17条）出张所监视署北海道财务局（政令第80条）东北财务局关东财务局北陆财务局东海财务局近畿财务局中国财务局四国财务局九州财务局福冈财务支局函馆税关（政令第84条）东京税关横滨税关名古屋税关大阪税关神户税关门司税关长崎税关国税厅（日语：国税庁）（国家行政组织法、法律第18条）国税审议会（法律第21条）国税不服审判所（日语：国税不服审判所）（法律第22条）国税局（日语：国税局）（法律第23条第1项）冲绳国税事务所（日语：冲縄国税事务所）（法律第23条第2项）2017年4月1日财务省主管之独立行政法人有独立行政法人酒类综合研究所（日语：酒类総合研究所）、独立行政法人造币局及独立行政法人国立印刷局三法人，另与农林水产省共管独立行政法人农林渔业信用基金（日语：农林渔业信用基金），与国土交通省共管独立行政法人住宅金融支援机构（日语：住宅金融支援机构），与外务省共管国际协力机构。