既存の調査船や潜水船などに加え、2004年の独立行政法人化の際に東京大学海洋研究所から移管された調査船を用いて、海洋、大陸棚、深海などを観測研究する。
除了现有的调查船及潜水船等之外，2004年独立行政法人化时，又移管了东京大学海洋研究所的调查船，进行海洋、大陆架、深海的观测研究。