ミナミトリシマヤモリは日本国内では南鳥島に生息が確認されており、国外ではミクロネシアに分布している。
南鸟岛壁虎在日本国内的南鸟岛生活作息已被确认，在国外密克罗尼西亚的周围也分布着其生活作息。