その後、研究対象を広げ、1980年代初期には農民史に集中し、80年代後期からは古代商品経済史と比較経済史をはじめとする経済史の研究を始めた。
1978年，作为文革之后首届研究生，秦晖的研究方向主要是“土地制度与农民战争史”，主要关注的年代在明清，之后，秦晖的视野逐渐扩展，80年代初主要集中在农民史方面，80年代后期，秦晖开始研究经济史，主要为古代商品经济史及中外比较经济史。