これらの遺伝子から合成されるHHタンパク質相同体の中で、SHHは発生において最も重要なモルフォゲンとして、四肢や、脳脊髄正中線構造などの、多くの器官系のデザインを形成する役割がある。
而音猬因子则是刺猬信号传导途径中研究最透彻的配体，这种因子作为重要的形态发生素（Morphogen），在调节脊椎动物器官发育中起关键作用，比如它决定四肢以及脑脊髓正中线的形成。