モルガンはアメリカ自然史博物館の後援者でもあるほか、上述のメトロポリタン美術館、グロトン・スクール（GrotonSchool）、ハーバード大学（とくにハーバード・メディカルスクール）、トリニティ・カレッジ、ニューヨークの産科医院、ニューヨークの職業訓練学校などの後援者でもあった。
摩根是许多机构的赞助人，包括美国自然史博物馆，纽约大都会艺术博物馆，格罗顿学校，哈佛大学（特别是医学院），三一学院，纽约市产妇医院，纽约贸易学校。