これにより毛利元就の九州侵攻も始まり、永禄11年（1568年）には立花鑑載が大友氏に反旗を翻すなど、一時は反大友勢力が優勢だったが、7月23日に立花山城が大友軍によって陥落され、永禄12年（1569年）5月28日に毛利軍も多々良浜の戦いで大友軍に敗れたため、8月に種実は大友宗麟に降伏した。
此后，毛利元就开始攻打九州，永禄11年（1568年）、立花鉴载反叛大友氏，一时之间反大友势力居于优势；7月23日、大友军攻陷立花山城，永禄12年（1569年）5月28日、毛利军在多多良滨之战为大友军所败，8月、种实降伏于大友宗麟。