天正2年（1574年）、秀吉が越前一向一揆と対峙して出陣できなかったため、秀吉の代理人として長島一向一揆討伐に出陣する（『信長公記』）。
天正2年（1574年），秀吉前往讨伐越前国一向一揆，秀长以兄长秀吉的代理身份出征长岛一向一揆。