しかし、営業運転開始直後の3月11日の東北地方太平洋沖地震（東日本大震災）発生に伴い、東北新幹線が全線復旧する前日の4月28日までE5系は営業運転を中止。
然而，商业化运营开始后不到一周时间（3月11日）就发生了东北地方太平洋近海地震，距离东北新干线全线恢复前一天的4月28日E5系运营暂时停止。