しかし、明応3年（1494年）に定正が陣中で急死した後、家督を継承した上杉朝良が駿河国の今川氏親や伊勢宗瑞（北条早雲）らの支援を得る一方で、今度は顕定が第2代古河公方となった政氏らの支援を得て再度対陣し、永正元年（1504年）武蔵立河原で扇谷勢が大勝したにも関わらず、永正2年に山内勢が朝良の本拠河越城を攻撃すると、朝良は顕定に和睦を申し出て乱が終結した。
然而在明应3年（1494年），定正突然在阵中死去，继承家督之位的上杉朝良（日语：上杉朝良）得到骏河国的今川氏亲和伊势宗瑞（后来的北条早云）等的支援，古河公方便转而支持显定，虽然在永正元年（1504年）武藏立河原（日语：立河原の戦い）大破扇谷上杉氏，但是在永正2年山内上杉氏进攻朝良的根据地河越城时，朝良和显定和解，使长享之乱结束。