ただし、脳内に占拠性病変(脳腫瘍や膿瘍など)があるか頭蓋内圧(ICP)が高値を示す場合、脳ヘルニアの恐れがあるため腰椎穿刺は禁忌である。
然而，如果脑部有肿块（肿瘤或脓肿）或颅内压增高时，则无法使用腰椎穿刺，因为它可能导致脑疝（英语：Brainherniation）。