2階の常設展示室は「根」、「清海鎮の成り立ち」、「海上帝国」、「航海」などテーマ別に4つの区域に区分されており、各区域ごとにテーマに合った遺物が展示されている。
二层常设展览厅分为“根”、“清海镇的建立”、“海上帝国”及“航海”四个主题区域，各区域分别展示了与主题相符的各种文物。