さらに後藤が満鉄総裁に転じると、明治40年（1907年）、京都帝大在任のまま同社理事に任じられた（この時後藤は文部省・京都帝大の反対を押し切ったとされる）。
之后再进入后藤担任总裁的满铁，明治40年（1907年）担任京都帝大的理事（这时后藤反对文部省・京都帝大对他赋予超负荷重担）。