この大学は、慈善家として知られる石油王ジョン・ロックフェラーが1901年に設立した「ロックフェラー医学研究センター」を前身とする。
前身为洛克菲勒医学研究所（RockefellerInstituteforMedicalResearch），于1901年由石油巨人约翰·D·洛克菲勒创立，1965年改为现名。