1880年（明治13年）に廃校となるが、1882年（明治15年）に海軍医務局学舎として芝に再興され、1889年（明治22年）に海軍軍医学校と改称された。
1880年（明治13年）废校，1882年（明治15年）海军医务局学舍在芝重新创立，1889年（明治22年）改称海军军医学校。