丸ノ内線は地上2階に相対式ホーム2面2線を有する高架駅で、駅ビル「メトロ・エム後楽園」の中を貫通するように線路とホームが設けられている。
丸之内线属相对式月台2面2线的高架车站，月台与线路位于车站大厦（MetroM后乐园）2楼。