西暦2059年、銀河中心へ向けて長い旅を続けるマクロス・フロンティア船団は、昆虫のような宇宙生物バジュラとの戦争に突入する。
西历2059年，向着银河中心进发的MacrossFrontier移民船团与宇宙生物Vajra的“Vajra战役”持续进行中。