局長の下に防衛省と外務省出身の内閣官房副長官補が兼任する2名の局次長と、同省出身の3名の審議官が配置される。
局长下辖防卫省与外务省出身、由内阁官房副长官补（日语：内阁官房副长官补）兼任的2名局次长，以及同省出身的3名审议官。