越後湯沢駅-ガーラ湯沢駅間は上越新幹線と一体化した運行体系であるが、法律上は在来線である上越線の支線となっており（ガーラ湯沢駅自体は新幹線鉄道における列車運行の安全を妨げる行為の処罰に関する特例法が適用される）、新幹線車両が直接乗り入れる在来線の特急列車という扱いで、運賃（140円）のほか在来線の特急券（100円）が必要なだけの合計240円（モバイルSuica特急券利用時は運賃相当額100円＋特急料金相当額100円の合計200円）で乗車できる。
博多南线虽然被划分为在来线等级，但因为实际上的硬件设备包含车辆与铁路线，全都是使用新干线等级的配置，因此所有行驶于博多南线上的列车都被规划为全禁烟自由席特急列车，票价上除了标准运费之外尚须加上特定特急料金（以成人全票而言，博多-博多南之间原票价200日圆，加上100日圆特急料金而成为300日圆的价格）。