慶応3年（1867年）、近藤はじめ新選組全員が幕臣取り立てとなったその年の10月、移転したばかりの牛込廿騎組屋敷（現新宿区二十騎町）にて病死した。
庆应三年十月廿八日（1867年11月23日），在近藤第一次代表新撰组全体取得幕臣职位后的十月，近藤周斋移往牛込廿骑组屋舍后病死。