かつてはこの地が出水郡出水郷武本村の中心地だったことや、開業当初の所在地が出水町武本地区だった事から「武本駅」と命名された。
此地曾经是出水郡出水乡武本村的中心地带，因此以开业初时的所在地出水町武本地区命名为“武本站”。