駅所在地が「北多摩郡千歳村大字下祖師ヶ谷」と「北多摩郡砧村大字大蔵」に挟まれるようにあったことから「祖師ヶ谷大蔵」となる。
由于车站位于“北多摩郡千岁村大字下祖师谷”与“北多摩郡砧村大字大藏”之间，因而命名为“祖师谷大藏”。