国の特別史跡に指定され、「五稜郭と箱館戦争の遺構」として北海道遺産に選定されている。
五棱郭获日本政府指定为特别史迹，并且作为“五棱郭与箱馆战争的遗构”而入选北海道遗产（日语：北海道遗产）。