1991年にウクライナが独立するとふたたび自治共和国の地位を得たが、2014年クリミア危機でロシア連邦がクリミア編入をウクライナ国内法を無視する形で一方的に宣言し、両国による領有権をめぐる対立が続いている。
乌克兰独立后，乌克兰的原克里米亚州成立克里米亚自治共和国，但在2014年克里米亚归属公投后克里米亚自治共和国单方面宣布建立克里米亚共和国并脱乌入俄。