行政府の長である行政院長や風害を所管する内政部、水害を所管する経済部、土石流災害を所管する農業委員会、陸上交通を所管する交通部などの省庁の長などは、三軍を指揮する権能を持ち合わせていない。
行政院长、主管风灾的内政部、主管水灾的经济部、主管土石流灾的农委会、和主管陆上交通事故的交通部等相关部会首长均无权指挥全国陆海空军。