翌8月の八月十八日の政変に際した御所警固にも山南は出動し、その2日後に京都に潜伏する長州系浪士を土方らと斬っている。
之后8月18日发生“八一八禁门之变”，山南在事发2天后与土方一起斩杀掉潜伏于京都的长州系浪人。