戊辰戦争が一段落した後、新政府が設置した江戸鎮台においては長官の下の6人の判事の1人として会計局判事に任命され、民政や会計、財政、都市問題などを担当する。
戊辰战争告一段落后，新政府设置江户镇台，江藤被任命为长官之下的6名判事中的会计局判事，负责处理民政、会计，财政及都市事务。