アルジェ合意から6年も経たない1980年、イラク新大統領のサッダーム・フセインはアルジェ合意を撤廃する宣言を出し、イラン領内に侵入した（当時イランはイスラム革命で政変が起きたとはいえ、国際法上、二国間あるいは多国間の条約は、どのような場合であれ一方の意志では撤廃できない）。
到1978年，时任伊拉克副总统的萨达姆·侯赛因向霍梅尼表示他应该要离开（伊朗与伊拉克两国在这两人得势的一年后随即爆发了长达八年的战争），霍梅尼被迫离开。