初代院長蔡元培の任期内に中研院は南京、上海などに研究所10ヶ所を設置、理化実業、社会科学、歴史語言の3研究所及び地質調査所、気象台及び自然歴史博物館が活発な活動を行なった。
在首任院长蔡元培任内，中央研究院陆续在南京、上海等地设立十个研究所，系由理化实业研究所、社会科学研究所、历史语言研究所、地质调查所、观象台与自然历史博物馆演展而来。