一方で、1987年の分割民営化当初に承継した3,191億円の長期債務に加え、1991年に新幹線鉄道保有機構から買い取った5兆900億円の債務返済が重要な経営課題となっている。
在1987年分割民营化初期时日本国铁所留下的3,191亿日圆长期债务，以及在1991年所承担的新干线铁道保有机构5兆900亿日圆的债务偿还，是JR东海在营运上需要解决的重要课题。