2014年10月7日、早稲田大学は調査委員会による学位の取り消し規定には該当しないとの結論を受け入れず、小保方の博士号を取り消すと決定した。
2014年7月17日，早稻田大学宣布，尽管小保方的博士论文“未达博士标准”，但鉴于有关规定“不取消小保方的博士学位”。