特に、ヒトMHCのクラスI（英語版）遺伝子およびクラスII（英語版）遺伝子はどちらも他の多座遺伝子ファミリーに比べて高いHERV要素密度を持つ。
与MHC2类分子（英语：MHCclassII）不同，MHC1类分子在哺乳动物的大部分细胞中都有分布。