そのため、一部の漫画著作者の中には、漫画喫茶について、中古漫画書籍の流通と同様に新刊漫画の売れ行きに悪影響を及ぼし、漫画の著作権が正しく保護されていないと主張する団体も現れている（2001年5月、「21世紀のコミック作家の著作権を考える会」）。
近年来由于漫画咖啡店的藏书量开始增加，而前者的机能也日渐强大为此，一部分的漫画作者认为漫画咖啡店提供二手漫画阅览服务会对新刊漫画的发售造成负面的影响，故开始出现了主张保护漫画著作权的团体（2001年5月，“21世纪のコミック作家の著作権を考える会”）。