一部の3DS本体にて、Ver.5.0.0-11Jに更新中にエラーメッセージが表示され、その後『本体設定』・『ニンテンドーeショップ』・『ゲームメモ』が起動できなくなる不具合が修正される。
2013年4月5日系统更新，版本编号是“5.1.0-11J型”，主要更新如下：修正上一次系统更新之后少部分主机无法登录“任天堂电子商店”以及无法进入系统设定等错误。