日本においては、有明海の他、瀬戸内海、東京湾、伊勢湾、大阪湾などの内湾部で赤潮の発生が多く報告されている。
在日本，甚至有渔民在东京湾、三河湾、伊势湾、濑户内海等海域建立养殖场。