海軍省における最高位の軍人は海軍作戦総長と海兵隊総司令官で、大統領及び海軍長官の海軍に関する主要な顧問であり、軍政に関する指揮監督を行う。
该部的最高军事首长为海军作战部长以及海军陆战队司令，他们均为总统和海军部长的重要海军事务顾问。