オガサワラトカゲはアジア、太平洋、インド洋地域に広く分布するブートンヘビメトカゲの一亜種であるとされてきたが、最近の研究では独立種とされることもある。
不过小笠原蜥蜴在亚洲、太平洋、印度洋区块被认为是布顿蛇蜥的亚种，最近学者认为是独立种。