義務的予防接種の反対者は、政府は個人が自分自身または自分の子供に対する医療上の決定を行う自由を侵害すべきでないという主張を行う。
有些人反对强制性疫苗接种的原因是认为政府不能侵犯个人选择医疗方式的自由，即使这种选择自由可能增加本人及其他人的风险时也不例外。