人員の大部分は、海上保安大学校や海上保安学校で専門教育を受け卒業した生え抜きの職員であるが、長官や次長、一部の管区海上保安本部長等は、国土交通省や他省庁のキャリア官僚が海上保安庁の職員として就くことが多い。
职员大部分是从海上保安大学校与海上保安学校（日语：海上保安学校）毕业，不过长官（日语：海上保安庁长官）与次长、部分管区海上保安本部长等，有许多是由国土交通省与其他省厅特考组官僚出任。