便数の割に行先・出発地は多彩で、木風発便は矢峰・大野車庫・桜木行きと基本としながらも、始発は数少ないおし分行き、朝に大野経由相浦桟橋行き1本と天久保行き2本、夕方に比良町経由日野峠行き1本が出る。
仙后座号平常是以两天内往返各一趟的方式运行于上野与札幌两个终点站之间，因此除了少数旺季与假日班次比较密集之外，它通常都是在每周日、二、五的傍晚由上野车站发车，迎著夕阳往北方前进，穿过星空之下，于隔日上午抵达札幌车站，再于当天傍晚由札幌出发，于第三天的上午回到东京上野。