組み替え頻度を基に遺伝地図を作る場合は、染色体上の位置に関係なく交差が無作為に同じ確率で起こり、遺伝子間距離と組み替え頻度が比例すると仮定しているが、DNAの塩基配列を基に作成された遺伝地図と比較すると違いがある。
在遗传学中，以互换率判定不同基因在染色体间的位置，是判定基因的连锁群与测定基因舆图（英语：Genemap）的重要方式，但许多真菌因不能进行有性生殖而使无法使用此方法，此时即可以准性生殖判定基因间的连锁群，即判定哪些基因位于同一条染色体上，因有丝分裂互换的发生率很低，通常不影响连锁群的判断，也可以利用紫外线照射增加有丝分裂互换的频率，使其高到足以用来判定基因间的距离。