1919年（民国8年）、匯文大学、華北協和女子大学及び通州協和大学が合併し燕京大学が設立され、南京で金陵神学院で司教を務めていたジョン・スチュワート（en）が校長に任命された。
1920年，汇文大学、华北协和女子大学和通州协和大学合并，在南京金陵神学院任教的司徒雷登被任命为新成立的燕京大学的校长。