しかし、もとの暫定首都であったボンに対する配慮から、1994年に「ベルリン・ボン法（「ドイツ統一のための1991年6月20日の連邦議会の決議」実施に関する法律)」が定められ、ボンは連邦首都(Bundeshauptstadt)であるベルリンと並んで国家の中枢機能を保持する「連邦市(Bundesstadt)」であると規定された。
根据1994年《柏林-波恩法案（英语：Berlin/BonnAct）》，柏林重新成为统一德国首都，而波恩则获得“联邦城市”（Bundesstadt）这一独有地位，保有一些联邦机关。