萬福寺の住職の地位にあったのは3年間で、寛文4年（1664年）9月に後席は弟子の木庵性瑫に移譲し、松隠堂に退いた。
隐元担任万福寺住持3年后，于宽文四年（1664年）9月将住持之位让给了弟子木庵，自己退隐到了松隐堂。