中央省庁再編後2001年1月の省庁再編を機に、原子力安全委員会は総理府から内閣府に移管され、また、法律に基づく事務局が設置された。
2001年1月，由于中央省厅再编，总理府改组为内阁府，外务省专任该基金会的主管机关。