ただしメモリースティック自体に複数のタイプが登場し、またATRAC3plusは遅れて2003年に採用されたことなどから、初期の製品との互換性には一部問題が生じている。
但MemoryStick本身推出了太多种格式，且ATRAC3plus迟至2003年才被采用，因此早期产品彼此间的相容性不太完整。