1858年、シュレーゲルがその下で33年間仕事をしてきた初代館長のテミンクが亡くなると、彼はその後を継いでライデン自然史博物館第二代館長となった。
1858年，特明克去世，在特明克旁待了33年的施莱格尔随之接任成为莱顿自然史博物馆的馆长。