南京攻略戦の敗退後、万治2年（1659年）冬に復明運動を諦め日本の長崎へ亡命を希望するが、通事所から在留許可の返事が遅れたことから一旦帰国する。
南京攻略战失败之后，朱舜水作为郑成功的使者向实行锁国政策的日本求援，万治2年（1659年）冬来到日本长崎。