近縁の西部ウマ脳炎ウイルス、ベネズエラウマ脳炎ウイルスも同様の感染症を起こすが、東部ウマ脳炎ウイルスが最も重篤な症状を示す。
中东冠状病毒和严重急性呼吸系统综合症冠状病毒同隶属于冠状病毒家族；前者所导致的人类病死率比后者更高，但传染性较低。