脳マラリアやアメーバ性髄膜炎(Naegleriafowleri等の自然界の水源に存在するアメーバ感染による髄膜炎)も報告されている。
脑膜炎可能还会伴随脑疟疾（感染脑部的的疟疾）或福氏内格里阿米巴脑膜脑炎（如经由淡水水源而感染的福氏耐格里变形虫）发生。