以後順調に発展して内容も多岐にわたるようになったため、1887年からは物理学・数学・工学分野を収録する『PhilosophicalTransactionsoftheRoyalSocietyA:Physical』と生命科学分野を収録する『PhilosophicalTransactionsoftheRoyalSocietyB:BiologicalSciences』の2誌に分けられた。
该期刊于1887年扩展为两个单独的期刊，一个期刊主要关于物理科学（《自然科学会报A（英语：PhilosophicalTransactionsoftheRoyalSocietyA）：数学、物理及工程科学》，PhilosophicalTransactionsoftheRoyalSocietyA:Mathematical,PhysicalandEngineeringSciences），另一个期刊主要关于生命科学（《自然科学会报B（英语：PhilosophicalTransactionsoftheRoyalSocietyB）：生物学》，PhilosophicalTransactionsoftheRoyalSocietyB:BiologicalSciences）。