過去に新宿駅南側の甲州街道跨線橋架け替えに伴う配線変更工事で全列車が各駅停車で運転した場合は、発着方面に関係なく下りは1番線、上りは2番線が当駅折り返し、5番線が三鷹方面からの電車となっていた（東西線は中央線との直通運転を中止し、すべて当駅3・4番線で折り返し）。
过去因应新宿站南侧甲州街道天桥更换与配线变更工程而将全列车改为各站停车的时候，下行全部停靠1号线，上行全部停靠2号线，5号线停靠来自三鹰方向的电车（东西线与中央线中止直通运转，全部在3、4号线折返）。