その後、5月15日に弁天台場が降伏、16日には千代ヶ岱陣屋が陥落し、新政府軍から五稜郭へ総攻撃開始が通知され、衆議により5月18日に榎本らが降伏して五稜郭は新政府軍に引き渡された。
5月15日，辩天台场的部队投降后，千代岱阵屋（日语：千代ヶ岱阵屋）在5月16日亦被攻占，其后新政府军通知五棱郭将会发动总攻击，经过城内众人商议后，榎本等人在5月18日投降，将五棱郭交予新政府军。