その後は西三河平定戦、永禄6年（1563年）の三河一向一揆の鎮圧戦で土呂本宗寺を平定し、特に一向一揆鎮圧においては、一揆鎮圧後に仏像や経典の保護に努めて散逸を防ぎ、寺社を元通りに戻したので､領民からは｢仏高力｣の異名をつけられた。
其后，清长在西三河平定战和永禄6年（1563年）的三河一向一揆镇压战中先后立下军功，然而他在政治上的贡献比军事上更胜一筹，他在平定一向一揆后保护佛像和典籍，努力避免这些古物失传，又将寺社改回原状等措施款为人称道。