その後伊勢から畿内へ移り、永禄12年（1569年）1月には三好三人衆と結託し、信長が擁立した室町幕府第15代将軍・足利義昭を攻め殺そうとしたが、敗退している（本圀寺の変、六条合戦）。
永禄12年（1569年）1月，与三好三人众连结，打算攻杀信长拥立的室町幕府第15代将军足利义昭，但是最后败退（本圀寺之变、六条合战）。