農林水産省は、食料安定供給特別会計と国有林野事業債務管理特別会計（林野庁）の2つの特別会計を所管する。
农林水产省管理食料安定供给特别会计（日语：食料安定供给特别会计）与国有林野事业债务管理特别会计（林野厅）两组特别会计。