現在、組織工学が直面している大きな課題は、移植を目的とした実験室で育てる組織に、より複雑な機能や、生体力学的な安定性をもたせ、血管を新生させることである。
而组织工程目前所遇到的困难主要是如何稳定培养更具复杂性的组织以及如何有效利用实验室培养出的组织进行移植以及新生组织在生物力学稳定性。