日本犬の各犬種を遺伝子レベルで比較研究した知見によれば、「北海道犬（アイヌ犬）」は琉球犬とともに共通の祖先縄文犬の特徴を伝える犬とされる。
而根据对日本犬各犬种的遗传因子程度的比较研究所得到的看法，“北海道犬（爱奴犬）”跟琉球犬一样是继承共通祖先绳文犬之特征的狗。