鎮守府司令長官（海軍大将・中将）は、軍政に関して海軍大臣、作戦計画に関して海軍軍令部長（軍令部総長）、からそれぞれ指示を受けた。
镇守府司令长官（大、中将）在军政方面受海军大臣的指示，作战计划方面则受海军军令部长（军令部総长）的指挥。