総務課農村政策部農村計画課地域振興課都市農村交流課鳥獣対策・農村環境課整備部設計課土地改良企画課水資源課農地資源課地域整備課防災課政策統括官参事官農産部:重要な政策の企画及び立案農産企画課穀物課貿易業務課地域作物課農業資材審議会（法律第6条第1項）食料・農業・農村政策審議会（食料・農業・農村基本法、法律第6条第2項）獣医事審議会（獣医師法、法律第6条第2項）農漁業保険審査会（農業災害補償法、法律第6条第2項）農林物資規格調査会（政令第85条）国立研究開発法人審議会（政令第85条）農林水産省の施設等機関には以下の6区分がある。
总务课农村政策部农村计划课地域振兴课都市农村交流课鸟兽对策·农村环境课整备部设计课土地改良企划课水资源课农地资源课地域整备课防灾课政策统括官参事官农产部：重要政策的企划及立案农产企划课谷物课贸易业务课地域作物课农业资材审议会（法律第6条第1项）食物・农业・农村政策审议会（食料・农业・农村基本法（日语：食料・农业・农村基本法）、法律第6条第2项）兽医事审议会（兽医师法（日语：獣医师法）、法律第6条第2项）农林渔业保险审查会（农业灾害补偿法（日语：农业灾害补偿法）、法律第6条第2项）农林物资规格调查会（政令第85条）国立研究开发法人审议会（政令第85条）农林水产省的设施等机关分为以下六种。