編成記号は、JR東海所有の16両編成がX、N700Aの16両編成がG、JR西日本所属車は16両編成がK、N700Aの16両編成がF、8両編成がS、JR九州所属車（8両編成）がRで、車両番号はX編成が2000番台、G編成が1000番台、K編成が5000番台、F編成が4000番台、S編成が7000番台、R編成が8000番台に区分されている。
编组符号方面，JR东海拥有16辆编组的Z编组、X编组，和N700A的G编组，JR西日本拥有16辆编组的N编组、K编组，N700A的F编组和8辆编组的S编组，JR九州拥有8辆编组的R编组，车辆番台划分为0番台（Z编组）（改造后的编组为X编组2000番台）、1000番台（G编组）、3000番台（N编组）（改造后的编组为K编组5000番台）、4000番台（F编组）、7000番台（S编组）、8000番台（R编组）。