この都市はインカの王パチャクティ（Pachacuti）の時代の1440年頃に建設が着手され、1532年にスペイン人により征服されるまでの約80年間、人々の生活が続いていた。
人们认为马丘比丘是印加统治者帕查库蒂于1440年左右建立的，直到1532年西班牙征服秘鲁时都有人居住。