1990年代に軍事情報部長やラミーロ・デ・レオン・カルピオ大統領の首席補佐官、グアテマラ和平協定の軍首席代表を務めた。
1990年代，佩雷斯担任军事情报局局长，在总统拉米罗·德莱昂·卡皮奥领导下，作为首席军事代表签署危地马拉和平协定，结束了长达30年的内战。