いずれの編成も新宿線乗入対応の30番台に改造・改番されて空いた番号を埋める形で附番され、サハ6550形の一部と6719編成の一部を除き2代目の車両番号となった。
不论哪一编组都被改造为新宿线直通运行对应30番台，并以填补空番号的形式赋予了番号，除了サハ6550型与6719编组的一部分以外都变成了该番号的第2代车辆。