国立科学博物館は「自然史に関する科学その他の自然科学及びその応用に関する調査及び研究並びにこれらに関する資料の収集、保管（育成を含む）及び公衆への供覧等を行うことにより、自然科学及び社会教育の振興を図る」ことを目的とした博物館である（独立行政法人国立科学博物館法：第3条）。
国立科学博物馆的设立目的，是“通过关于自然史的科学及其他自然科学及其有关应用的调查、研究及有关这方面资料的收集、保管（包括育成）以及公众的公开阅览”等活动，以达到普及自然科学及社会教育之目的（独立行政法人国立科学博物馆法第3条）。