萎縮により、胸腺の容積と活性は著しく減少し、胸腺の大部分は脂肪により置換される。
青春期之后，胸腺开始逐渐萎缩，皮质和髓质细胞都明显减少，且大部分的胸腺组织会被脂肪组织与结缔组织所取代。