鎌倉時代末期から南北朝時代になると、僧侶による神道説に対する反動から、逆に、神こそが本地であり仏は仮の姿であるとする神本仏迹説を唱える伊勢神道や唯一神道が現れ、江戸時代には儒学の理論により両派を統合した垂加神道が誕生した。
从镰仓时代末期，到南北朝时代，僧侣开始对神道说反动，相反的，倡导神是本地，佛是假姿的神本佛迹说的伊势神道与唯一神道也出现了，江戸时代时，朱子学的理论使得两派统合，而诞生出垂加神道。