社伝によれば、景行天皇14年、武内宿禰が稲葉山北西の椿原（現在の岐阜公園内の丸山）に五十瓊敷入彦命を祀ったのに始まるとされる。
景行天皇14年（84年），命武内宿祢在稻叶山（现金华山）西北的椿原（现岐阜公园里的丸山）祭祀五十琼敷入彦命，即为伊奈波神社之始。