種小名sanjuanensisは化石の発見地であるサンファン郡(SanJuan)に由来する。
阿拉摩龙目前只有一个种，模式种圣胡安阿拉摩龙（A.sanjuanensis），种名是以化石发现地的新墨西哥州圣胡安县为名。