中立進化説では、突然変異の大部分が、表現型に影響せず、生物にとって有利でも不利でもない中立的な変化であるという事実に注目する。
这个理论认为在分子遗传学的层次上，基因的变化大多数是中性突变（英语：neutralmutation），也就是对生物个体的生殖与生存既没有好处也没有坏处的突变。