高架ホーム1-12番線（山手線・京浜東北線・宇都宮線・高崎線・常磐線・上野東京ライン）緩斜面に建設された一部高架の島式ホーム4面8線（1-8番線）、切欠きホームと櫛形ホームが一体化した2面4線（9-12番線、平面で行き来可能）、合わせて6面12線で構成されている。
高架月台1～12号月台（山手线、京滨东北线、宇都宫线、高崎线、常磐线、上野东京线）位于平缓斜坡的部分高架式岛式月台4面8线（1～8号月台）、缺口式月台与港湾式月台一体化2面4线（9～12号月台，可通往平面)、合计共6面12线。