天正6年（1578年）に上杉謙信が没し御館の乱が勃発すると、輝宗は対相馬戦を叔父・亘理元宗に一任し、北条との同盟に基づいて蘆名盛氏と共に上杉景虎方として参戦したが、乱は上杉景勝方の勝利に終わり、蘆名・伊達軍は新発田長敦・重家兄弟の奮闘に阻まれて得るところが無かった。
在天正6年（1578年）因为上杉谦信死去而引发的御馆之乱中，辉宗把东南方对相马家的战争总指挥全权一并交给叔父亘理元宗，并基于北条的同盟而与芦名盛氏一同支援景虎方参战，不过御馆之乱最终由景胜方得到胜利，芦名、伊达军没能够阻止新发田长敦、重家兄弟的奋斗。