2000Hの運転士は、事故発生を知らずに運転を続け、事故現場の近くに接近したところで、線路上を南千住方向に歩く乗客を確認し、非常ブレーキを掛けたが間に合わず、乗客をはねながら、2117Hの1両目に激突した。
上行2000H次客运列车因地震影响晚2分自南千住站发车，恰好同时南千住站接受到三河岛站的事故告知并将号志转为红灯，但2000H次已通过号志机而不知前方有事故发生，接近事故现场时发现自2117H次离开避难往南千住站方向步行之乘客并采取紧急刹车，仍撞击2117H次1辆车厢，2000H次第1车严重损毁，第2车以下脱轨翻覆至高架桥下的仓库。