なお、本銃の狙撃銃型として、九九式狙撃銃（九九式小銃ベース）と九九式短狙撃銃（九九式短小銃ベース）が存在するが、これらも制式において「小銃（狙撃銃）」と「短小銃（短狙撃銃）」は区別されている。
九九式有四种衍生型：标准的九九式短步枪、九九式长步枪（限量生产的衍生型）、二式伞兵步枪，以及九九式狙击步枪。