朝廷の威信は文字どおり地に落ち、幕府は朝廷監視のために六波羅探題を置き、朝廷に対する支配力を強めることとなる。
伊势平氏灭亡之后，源赖朝建立镰仓幕府，派遣六波罗探题入居此馆，以监视朝廷公家。