ゲーム機にプログラムされていないデジモン・ブイドラモンを育てた主人公・八神太一はホーリーエンジェル城の主・ホーリーエンジェモンによってデジタルワールドのフォルダ大陸へと召喚されてしまう。
培育没有被游戏机程序化的数码宝贝V龙兽·零丸的八神太一因为神圣天使城的城主神圣天使兽而被召唤到了数码世界中的文件夹大陆。