1955年に新疆ウイグル自治区が成立すると、初代自治区政府主席、自治区共産党委員会書記となり、一級解放勲章を受章、中将に任官した。
1955年，新疆维吾尔族自治区成立后，吕剑人出任自治区党委书记处书记、兼监委书记，自治区第一届政协副主席、党组第二书记；1961年，升任自治区党委常务书记，主持日常工作。