アミノ酸配列には短い残基の繰り返しがしばしば見られ、またコラーゲンの三重らせんのような珍しい二次構造を取ることがある。
硬蛋白的肽序列通常只有有限的重复残基；后者可以构造出不同寻常的二级结构，例如胶原螺旋。