当初の案では、参加国はEUの理事会をモデルとした、議長国を輪番制とする常設の理事会を設置し、エネルギー、安全保障、カウンターテロリズム、移民、貿易を扱う場とすることになっていた。
按照原本的组织架构，地中海联盟将仿效欧盟设有轮值主席，负责统合能源、保安、反恐、移民及贸易等事务。