2004年5月に盧に対する弾劾訴追が憲法裁判所（朝鮮語版）に棄却されると、市民社会首席として青瓦台に復帰、2007年には大統領秘書室長となるなど、盧武鉉大統領の側近として活躍した。
曾荫权就任行政长官后，林郑月娥被调回香港，于2006年3月起出任民政事务局常任秘书长，2006年9月晋升为首长级甲一级政务官。