一方で北海道旅客鉄道（JR北海道）、四国旅客鉄道（JR四国）と同様、経営基盤が弱いことから、独立行政法人鉄道建設・運輸施設整備支援機構国鉄清算事業本部（発足当初は日本国有鉄道清算事業団）が全株式を保有しており、現在までのところ株式上場の目途は立っていない。
但是和北海道旅客铁道（JR北海道）、四国旅客铁道（JR四国）、九州旅客铁道（JR九州）一样，经营基底比较薄弱，所以成为政府机关的独立行政法人“铁道建设・运输施设整备支援机构”国铁清算事业本部（成立当初称为“日本国有铁道清算事业团”）持有所有股票的特殊公司、股份公司形态的特殊法人，直到现在没有计划股票上市。