副作用は多くの場合一過性であるが、過量投与で稀に重篤な昏睡、低血圧、呼吸不全を起こし死に至る可能性がある。
亚硒酸有很高毒性，中毒症状可能延迟数小时，包括昏迷、恶心、低血压，严重时可能致死。