河口で繁殖する雲林莞草は生活排水などを吸収し、水質を浄化するだけでなく、底生生物の生息に必要な有機物質を供給していることで、干潟のトビハゼや高濃度の塩分の水域で生息するミナミコメツキガニに淡水を供給したり、魚群を引き寄せることで渡り鳥の生息環境を整えたり、保護区内で唯一開放されている漁民の活動が当地の漁業収入をもたらすなどの恩恵がある。
由于云林莞草在潮溪注入之处与接近海堤的泥滩地大量繁殖生长，吸收了来自周遭排水沟挟带营养盐的污水，不仅净化水质，提供底栖生物所需的有机物质，如：活跃于有淡水注入泥滩地的弹涂鱼，以及大量和尚蟹在深具盐分的潮间带上行军，也吸引鱼群前来，造就冬候鸟与夏候鸟的栖息环境，但也是当地渔民倚重的生计，因此保护区的管制仅开放渔民进出。