1943年（昭和18年）4月、警備府は高雄に移転し、高雄警備府を設置、旧馬公警備府を馬公特別根拠地隊に改編した。
1943年（昭和18年）4月，警备府转移至高雄，设置高雄警备府，原马公警备府改编成马公方面特别根据地队。