同レベルの認定は、全国の大学病院で、京都大学医学部附属病院に次いで2番目である。
排行榜的专科排名中，复旦大学附属儿科医院在小儿内科领域始终位居全国第一位，在小儿外科领域仅次于首都医科大学附属北京儿童医院，长期位于全国第二位。