慶長14年（1609年）徳川家康によって、清須から名古屋への遷府が指令されると、慶長15年（1610年）より清須城下町は名古屋城下に移転され（清洲越し）、清須城も名古屋城築城の際の資材として利用され、特に、名古屋城御深井丸西北隅櫓は清須城天守の資材を転用して作られたため「清須櫓」とも呼ばれる。
庆长14年（1609年），德川家康下令将清洲藩的本城从清州改迁到名古屋，庆长15年（1610年），清州城的城下町被迁移到名古屋城下，清洲城亦被作名古屋城的筑城材料。