成立年代ははっきりとは分かっていないが、上表文を根拠とした弘仁９年（818）説や、承和元年（834）に東大寺南院で作成されたという説が古来伝承されるが共に確証はない。
该庙相传建于清光绪年间，但是光绪廿年（1894年）《凤山县采访册》与日昭和十三年（1938年）《台湾宗教与迷信陋习》（曾景来着）并未记载飞凤宫的记录。