1992年5月末、ユーゴスラビア連邦軍がボスニア・ヘルツェゴビナから撤退すると、連邦軍第二軍管区の大部分はスルプスカ共和国軍に編入された。
1991年12月底俄罗斯联邦独立后，苏联边防军的大部分机关、院校和部队被编入新组建的俄罗斯边防军。