1913年の京阪の駅開設時、駅の西北西にある京都六地蔵（京の六地蔵めぐり）の一つでもある大善寺が古くから「六地蔵さん」と呼ばれ親しまれていることから、この駅名が付けられた。
1913年京阪车站开设时，车站西北偏西有京都六地藏（日语：京都六地蔵）之一的大善寺（日语：大善寺(京都市)），以较旧的名称“六地藏”而得名。