仏印方面及び蘭印方面はそれぞれ第一南遣艦隊、第二南遣艦隊が南西方面艦隊の指揮下で作戦を担当していたが、アメリカ軍のフィリピン侵攻により南西方面艦隊司令部がフィリピンに孤立してしまい、取り残された二個南遣艦隊を南西方面艦隊から分離し、蘭印の防空を担当していた第十三航空艦隊とあわせて指揮するために編成された。
法印方面及兰印方面分别为第一南遣舰队、第二南遣舰队和南西方面舰队指挥下进行作战，但美军进攻菲律宾使南西方面舰队司令部孤立于菲律宾，将残余的二个南遣舰队由南西方面舰队分离，和担任兰印防空的第十三航空舰队编成一同指挥。