震度6弱を記録し、多数の長距離を飛行し燃料残量が少ない国際線の航空機が向かっていた成田国際空港（千葉県）や、震度5強を記録した東京国際空港（羽田空港）は安全確認のために地震発生直後に全ての離着陸を中止、空港を閉鎖したため両空港に向かっていた航空機86機が降りられなくなり、中部国際空港（愛知県）や関西国際空港（大阪府）、新千歳空港（北海道）や横田基地（東京都）へ代替着陸した。
而在成田国际机场（千叶县）测得6下震度，在羽田国际机场（东京都）测得5上震度，在确认安全后两机场同时停止了飞机起降，而前往两个机场的86架班机被紧急安排到中部国际机场（爱知县）、关西国际机场（大阪府）、新千岁机场（千岁市）、横田飞行场（东京都）代替着陆（日语：ダイバート）。