1954年9月、中華人民共和国憲法制定による政府機構の再編が行われ、最高国家行政機関として国務院が発足し、その構成部門として国防部が設置された。
1954年11月，中华人民共和国国务院成立时，设立国务院宗教事务局，作为国务院直属机构之一。