内部マケドニア革命組織はまたギリシャ領マケドニア（エーゲ・マケドニア）における軍事組織の結成のためにも動き、ギリシャの王党派、共産主義派の武装勢力と対決した。
为了保护希腊马其顿人和希腊的利益，希腊派遣人员训练游击队并组织民兵（被称为makedonomahi，即马其顿战士），以对抗保加利亚。