第二次征討の失敗によって、幕府の武力が張子の虎であることが知れわたると同時に、長州藩と薩摩藩への干渉能力がほぼ無くなる結果を招いた。
第二次长州征讨的失败使得幕府的实力不再的事实广为所知，同时幕府对长州藩以及萨摩藩的影响、干涉能力丧失殆尽。