成鳥の唯一知られる天敵はハクトウワシであり、大型のサメやアザラシは海でカツオドリをまず捕らえたりはしない。
鲨鱼和湾鳄算是玳瑁的天敌，章鱼和某些海洋表层鱼类也会捕食成年玳瑁。