その後、同年11月に石垣市と竹富町は任意協議会を設置し、12月には法定協議会移行を議会に諮ったが、竹富町議会では法定協議会設置案を3度にわたり否決し、2005年2月28日に4度目の審議でようやく可決して法定協議会が設置された。
同年11月石垣市和竹富町规划重新设置新的合并协议会，经竹富町议会三度否决后，于2005年2月28日第四度审议时通过，合并协议会终于成立。