また長年のハゼの分類学的研究に対する貢献を称え、新種のハゼの一種の命名に、1992年（平成4年）にはPlatygobiopsisakihitoと、2005年（平成17年）にはExyriasakihito、2007年（平成19年）にはハゼの新属にアキヒト属(Akihito)と、彼の名を織り込んだ献名がなされた。
另外，𫚥虎亚目的两个新物种分别于1992年和2005年被命名为Platygobiopsisakihito（西班牙语：Platygobiopsisakihito）和Exyriasakihito（Akihito即“明仁”的罗马字转写），2007年还有研究者将虾虎鱼科的一个新属命名为明仁𫚥虎鱼属（Akihito），以表彰他在𫚥虎亚目上所做的研究贡献。