臺灣海峽兩岸關係史

歷史分期

關於海峽兩岸關係的起始時間或歷史分期無公認的標準。中南財經政法大學臺灣研究所副所長張春英教授在《海峽兩岸關係史》書中將兩岸關係的歷史分為四個階段：第一階段是從史前時期到17世紀20年代荷蘭人占領臺灣；第二階段為荷西、明鄭、清朝、日本統治臺灣到1945年中華民國接管臺灣；第三階段為1949年中華民國中央政府撤離中國大陸後形成的兩岸軍事對峙階段；第四階段是80年代以來兩岸結束軍事對峙，關係緩和發展的階段。中國文化大學中山與中國大陸研究所邵宗海教授則是將1949年後兩岸關係史劃分為軍事對峙、法統爭執、交流緩和、意識對立、互惠協商五個時期。

三國時期

中國史書《三國志·吳志》記載黃龍二年（230年）春正月，吳國曾派將軍衛溫、諸葛直率領將士萬人，從臨海郡的章安出發，渡海尋找夷洲，有數千人登陸夷洲後返還。此外，孫吳丹陽太守沈瑩所著的《臨海水土志》記載，夷州在臨海郡東南二千里，「土地無霜雪，草木不死；四面是山，眾山夷所居」。有學者認為夷洲（或夷州）指的是臺灣，但存在爭議。

隋唐時期

《隋書·流求傳》記載，流求國位於海島上，在建安郡以東，坐船五日可到達。其中還有隋煬帝派兵攻打流求國的記載，前後一共三次。第一次是607年，因為語言不通，所以只「掠一人而返」。次年，朱寬第二次進擊，但也僅「取其布甲而還」。第三次則是在610年，由陳稜和張鎮州領軍，「虜其男女數千人」而返。有學者認為《隋書》中記載的流求國就是今天的臺灣，但也有學者認為流求國指的是琉球群島。
唐開元年間，福建泉州東石的林鑾，經商到臺灣定居，乃臺灣林姓入臺第一人。而在唐憲宗時，有浙江進士施肩吾率領家族遷居澎湖。廈大歷史系林其泉教授認為，唐代以前中國大陸漢人到臺灣人數不多，他們到臺地或從事農業活動或同土著民族進行交易，主要是季節性的，春去秋回。

宋元時期

南宋孝宗乾道七年（1171年）汪大猷任泉州知州，轄區內「有海島曰澎湖」，有不少漢人居住，經常被夷人上岸來搶掠東西，殺擄人口。為防止騷擾，每年南風起時，汪大猷便派兵去防守，耗費軍資，但還是防不勝防。於是造屋200間，派遣將士駐守。關於宋元時期的兩岸貿易的文史記載很少，從出土的大量宋元時期的陶瓷器來看，澎湖應是當時中國大陸外貿的一個重要中途站。據記載，宋元時期，鐵在臺灣屬於高價商品，臺灣原住民常常要等來自中國大陸的商船靠岸，用食物向船上的人換取鐵。清朱景英在《海東札記》中說，曾在嘉義港口得數百宋錢。
元世祖至元十八年（1281年）元師伐日本，遭颱風襲擊，軍艦大部分沉沒，殘部漂至臺灣西岸及澎湖，遂設澎湖寨巡檢司，隸屬於福建泉州路，與琉求（臺灣）相鄰。1292年，元世祖遣使宣撫流求，但到達後跟當地人語言不通，無功而返。元成宗元貞三年（1297年），福建省平章政事高興遣省都鎮撫張浩、福州新軍萬戶張進赴琉求國，生擒130餘人而返。第二年正月，又將所俘琉求人放回，要他們歸順元朝，此後不了了之。元明宗至順元年（1330年）及元統五年（1337年），汪大淵兩度由泉州出發到各國貿易，他在《島夷志略》中記載澎湖屬泉州晉江縣，而琉球為海外諸國之一。

明朝前期

1384年，明朝廢除澎湖巡檢司，又於1563年復設澎湖巡檢司派兵駐守。《東番記》記載永樂初年鄭和下西洋時曾到臺灣，當時東番夷族（臺灣原住民）躲了起來不願意順從約束，於是鄭和給每家一個銅鈴，讓他們繫在頸上。銅鈴被他們當做寶物。宣德年間鄭和船隊曾到臺灣西定坊大井頭汲水，還曾投藥於水給當地土番醫病。嘉靖四十二年（1563年），泉州籍海盜林道乾聚眾反明，被明朝都督俞大猷追剿，經澎湖逃到臺灣雞籠定居。他率領數百名隨從，奴役臺灣原住民。原住民非常憤恨，商議殺死林道乾，卻走漏消息，被林道乾夜襲殺害。繼林道乾之後，潮州籍海盜首領林鳳於萬曆二年（1574年）被明朝總兵胡守仁追擊，逃竄至澎湖，然後又到臺灣魍港（八掌溪口）作為其根據地。胡守仁傳諭番人夾攻，林鳳等人逃散。

倭寇侵擾與明朝海防

據明海防將領沈有容在《閩海贈言》中記載，自己曾「三入東蕃，殲倭驅荷」。萬曆三十年（1602年）七月，倭寇流動劫掠廣東、福建、浙江等沿海地區後，竄入東番以為巢穴。福建泉州守將沈有容都司一方面派人偵察敵情，了解氣候、風向、海流情況，另一方面造船、練兵、儲糧。同年冬，福建巡撫朱運昌發密札令「剿東番倭」，沈有容率24艘軍艦渡海前往臺灣，大破倭寇。焚沉倭寇船隻6艘，斬首15級，奪回被擄男女370餘人。沈有容在大員駐紮二十多天，隨行的陳第根據臺灣當時的原住民風土民情寫成《東番記》一文。

荷、西、漢人在臺灣

1604年，荷蘭人韋麻郎佔領澎湖，明浯嶼都司沈有容率兵船五十艘（約兩千人）到澎湖，要求韋麻郎離開。由於雙方兵力亦相差懸殊，韋麻郎於12月15日離開澎湖，轉往臺灣尋找據點。此事在澎湖天后宮內的沈有容諭退紅毛番碑上有記載。1622年，荷蘭東印度公司在印尼的總督柯恩派雷約生到澎湖，並建立風櫃尾城堡作為貿易據點。1624年明將俞咨皋率軍包圍荷蘭人，經過八個月激戰，荷蘭人撤離澎湖，轉進至臺灣大員設立熱蘭遮城作為據點。荷蘭東印度公司招募中國福建沿海及澎湖的漢人入臺耕作，其中許多人後來定居臺灣。在《安平顏氏族譜》、《東石汾陽郭氏族譜》中都有遷家入臺的記載。
相傳1621年，漳州籍顏思齊由日本長崎到臺灣，在諸羅山一帶安寮設寨，從事耕獵和貿易活動。消息傳回大陸後，吸引了漳州、泉州大批貧民渡海前來投奔，人數多達3000人。1625年顏思齊病死，鄭芝龍（鄭成功之父）繼承其事業。1628年（崇禎元年）九月，鄭芝龍受明廷招安，率部眾3萬餘人，船隻千餘艘回大陸，任「五虎游擊將軍」，駐安海。福建發生災荒時，鄭芝龍曾送數萬饑民到臺灣謀生，相關費用再以租稅的形式還給鄭芝龍。此外，鄭芝龍打破官方的海禁，幾乎壟斷了中國大陸沿海與臺灣、澳門、日本、菲律賓之間的貿易。
1626年，西班牙人伐爾得斯率領艦隊從菲律賓馬尼拉出發，沿者臺灣東海岸來到雞籠灣內的雞籠島上建立聖薩爾瓦多城作為統治中心。雖然西班牙人不被允許和明朝展開正式貿易，但卻以免關稅、免貨物稅，甚至免入關查驗的方式，吸引走私商到雞籠作生意。
1633年（崇禎六年）荷蘭東印度公司以臺灣為基地對大陸福建沿海進行封鎖、掠劫，明朝水師在鄭芝龍率領下擊敗荷蘭東印度公司與海盜聯軍，史稱崇禎明荷海戰。在臺灣的漢人也曾反抗荷蘭統治，較知名的是1652年郭懷一事件。當時有四五千漢人參與，約為臺灣漢人總數的四分之一，歷時12天後被鎮壓，三四千名漢人死亡。
清張廷玉所修《明史》中描述的臺灣疆域是，「其地，北自雞籠，南至浪嶠，可一千餘里；東自多羅滿，西至王城，可九百餘里」。值得注意的是，雞籠與琉球、呂宋、婆羅等同被寫入「列傳第二百一十一外國四」篇，不在明朝版圖之內。

鄭成功擊退荷蘭人

1644年明朝滅亡，而明朝宗室福王、魯王、唐王先後成立南明政權。其中唐王朱聿鍵由鄭芝龍、鄭鴻逵兄弟於1645年在福州擁戴稱帝。1646年，清軍入福建，鄭芝龍降清，鄭成功出走金門。1647年，鄭成功正式以「忠孝伯招討大將軍罪臣國姓」之名誓師反清，轉戰大陸東南沿海十餘年，並多次幫助明朝宗室與民眾渡海定居臺灣，被永曆帝封為延平王。由於荷蘭人常劫奪漢人商船，鄭成功於永曆十年（1656年）到十四年（1660年）期間兩次警告荷蘭人停止劫奪商船，否則將不與其貿易。
1661年4月，鄭成功以「大明招討大將軍」的名義，率兩萬五千名將士及數百艘戰艦進軍臺灣，經熱蘭遮城之戰，迫使荷蘭東印度公司在1662年2月1日簽約投降。鄭成功在臺灣設承天府，試圖反清復明，但不久即去世。鄭經繼位後由於擔心統治的正當性不足，於1663年從金門迎大明寧靖王朱術桂到臺灣，並將臺灣改稱為東寧，仍奉明朝為正朔，並於1665年在臺南設孔廟。
1674年4月21日，清朝靖南王耿精忠起兵反清，隔海邀請鄭經西征。鄭經渡海後，向耿精忠索取漳州與泉州，被拒後出兵佔領海澄與同安，雙方開始交惡。然而，泉州、漳州以及潮州陸續投靠鄭經，耿精忠見情勢不對便出兵進攻泉州，但卻被劉國軒擊退。1675年，耿精忠與鄭經談判，雙方以楓亭為界，北屬耿氏、南屬鄭氏，平息戰鬥。1676年，鄭經擊敗平南王尚之信，佔領惠州。鄭經擁有漳、泉、潮、惠四座州府後，又攻下汀州，腹背受敵的耿精忠只好降清。耿精忠降清後，獨自面對清朝軍隊的鄭經節節敗退，最後退回廈門。
1677年清朝再度與鄭經展開和談，清朝康親王傑書許諾，若鄭經從中國沿海的島嶼撤退，就答應比照朝鮮，讓東寧成為清朝藩屬，並與東寧通商，永無猜嫌。1678年清朝將領賴塔給鄭經的書信中聲稱，如果鄭軍肯退守臺灣，則鄭氏可永據臺灣，與朝鮮、日本地位相同，不必剃髮易衣冠、稱臣納貢全憑自願。但鄭經索要海澄為互市，導致談判破裂。1680年，鄭經戰敗，從廈門撤守臺灣。從此，鄭經意志消沉，將國政全權交予監國世子鄭克𡒉與諮議參軍陳永華。1681年3月17日，鄭經去世，要員馮錫範殺死鄭克𡒉，立其弟鄭克塽，導致國政日劣，人心渙散。

清朝納臺灣入版圖

1683年（康熙二十二年）7月10日，清康熙帝派施琅率領水陸官兵兩萬餘人、戰船200餘艘攻打臺灣。經過7天激戰，鄭軍精銳被全殲。7月20日，寧靖王朱術桂自殺殉國，鄭克塽則於9月17日正式遞交降書，10月3日清軍進入臺灣受降。次年，臺灣設臺灣府，轄臺灣、鳳山、諸羅三縣，隸屬於福建省臺廈道，並公布「臺灣編查流寓則例」，嚴格控制大陸漢人渡臺人數。臺灣建府初期，清廷即授權福建巡撫從閩省內地與臺地的官員互調。因此，清代臺灣的官吏多是福州人。
1721年，朱一貴在臺灣自立為王，定國號為「大明」，但很快被清軍剿滅。1731年（清雍正九年）年末，臺灣原住民道卡斯族於大甲西社發動武裝抗官行動。當時署理福建總督郝玉麟派臺灣總兵王郡親往督征，並先後從中國大陸本土徵調官兵六千多名來臺征討。事件歷經七個月，最終臺灣各酋長率眾投降，林武力等十三名酋長依清律判決斬決梟示，沙轆土官被判成立唆謀罪名而杖斃。
清廷治理臺灣後，臺灣與大陸的貿易更加興盛。當時臺灣主要的出口物品為稻米、鹿皮與蔗糖，進口物品為紡織品、藥材及其他日用品，最主要的貿易港口為府城（今臺南安平）、鹿港（今彰化鹿港）、艋舺（今臺北萬華）三地。俗稱的「一府二鹿三艋舺」，就是形容此時期最興盛的貿易港口。清朝中期，大量移民來臺，先來後到的族群之間存在諸多利益衝突。如福建的鶴佬人和廣東的客家人、潮州人之間發生閩粵械鬥；來自福建的泉州人與漳州人之間發生泉漳械鬥；以及戲曲門派之間的西皮福祿械鬥等。不過，這時期臺灣各族群間除分類械鬥外亦有合作。例如1796年，吳沙在拓墾蛤仔難時，有漳籍、泉籍與客籍人士共同入墾。

清朝後期治理臺灣

1860年第二次鴉片戰爭後，清政府同意開放臺灣安平、淡水通商，不久又開放打狗和雞籠二港。1874年，日本出兵臺灣製造牡丹社事件。1875年，清政府派沈葆楨為欽差大臣赴臺灣巡閱，並調駐防徐州的淮軍唐定奎部6500人前往臺灣駐守。最終，以中日簽訂《北京專約》暫告平息。這次外交事件，促使清廷取消中國大陸人民渡臺耕墾禁令，臺灣全面開放。
1884年中法戰爭期間，法國海軍將領孤拔佔領基隆，進攻淡水，封鎖臺灣海峽，並騷擾中國沿海各省。1885年（光緒十一年）7月29日，左宗棠在《臺防緊要請移福建巡撫駐臺鎮攝折》中說明臺灣必須迅速改建行省的理由。同年10月，清廷設福建臺灣省，管轄原福建省的臺灣府和臺北府，原福建巡撫劉銘傳改任臺灣巡撫，臺灣建省經費主要由福建財政承擔。劉銘傳在臺灣巡撫任內，擴大撫番，增設郡縣，並推動一系列洋務改革，將臺灣建設成了當時大清帝國近代化程度最高的行省。

清朝割讓臺灣予日本

大清在甲午戰爭中被日本打敗，於1895年4月17日簽署馬關條約，割讓臺灣及澎湖予日本。消息傳至臺灣，時任臺灣巡撫唐景崧在5月25日發表《臺灣民主國獨立宣言》，但仍奉清朝為宗主國。6月2日，清日雙方完成臺灣交接，日軍於10月21日進入臺南滅掉臺灣民主國政權。臺灣成為日本殖民地，也是日本侵略中國大陸的基地。臺灣總督府作為日本帝國實施南進政策的前鋒，專門針對福建制訂了政策，通過在大陸創辦學校、設置醫院、興建神壇和經營報社等方式進行文化滲透，對近代福建社會的發展產生了深遠的影響。
1896年前後，時任日本臺灣總督兒玉源太郎派時任臺灣宜蘭蘭陽寺住持故加蘇廣法師到廈門布教。其後，東本願寺僧人水谷魁曜等建立「廈門東本願寺布教所」。1900年8月24日，該布教所被燒毀。25日，日本臺灣總督派遣陸軍渡海，準備占領廈門。西方列強反應強烈，英、德、美、俄都將戰艦開進了廈門港，英軍陸戰隊登陸英租界，日軍被迫撤軍。史稱「廈門事件」。
1912年中華民國成立後，臺灣蔣渭水、杜聰明、翁俊明等人相繼加入中國同盟會臺灣分會，還曾發電報至國際聯盟控訴日本妨礙中國統一。1928年臺灣共產黨在上海法國租界成立，由中國共產黨指導，主張推翻日本在臺灣的統治，建立臺灣共和國。1931年9月後，因大批黨員被捕入獄，臺共停止運作。1934年和1936年，福建省政府曾兩次組團赴臺灣考察。1895年日本開始統治臺灣時，臺灣的經濟規模尚不及福建。但臺灣經過日本人近40年的經營，已遠遠超過福建。因此，《臺灣考察報告》中建議福建學習臺灣的經濟模式。
1937年中日戰爭全面爆發後，旅居中國的臺灣民間人士在李友邦的領導下成立臺灣義勇隊進行抗日活動。1938年2月23日，蘇聯航空志願隊以中華民國空軍第一大隊的名義轟炸臺北松山飛行基地。1941年12月9日中華民國國民政府正式對日宣戰，並宣布對日一切條約無效。1943年11月25日，美國陸軍航空軍駐華的第十四航空隊和中美空軍混合團第一大隊共出動14架B-25轟炸機從中國江西遂川起飛，轟炸了新竹日軍的飛行基地，毀損日本軍機共52架。1943年12月，中、英、美聯合發表開羅宣言，明訂「日本竊自中國之一切領土，例如滿洲、臺灣、澎湖群島等應歸還中華民國」。1945年7月，中、英、美發表波茨坦公告，明確「《開羅宣言》之條款必須實施」為日本投降的必須條件之一。9月2日，日本正式接受波茨坦公告之條款，向盟邦投降。

中華民國接管臺灣

1945年8月29日，蔣中正任命時任福建省主席的陳儀為臺灣省行政長官。10月15日，國民政府軍在基隆港登陸。10月25日，中華民國正式接管臺灣、澎湖，列該日為臺灣光復節，惟此光復論點存在爭議。1946年1月12日，中華民國行政院宣布「原有我國國籍」之臺灣人民於1945年10月25日起恢復中華民國國籍，但此舉因戰後的和平條約尚未締結而遭到美國、英國、荷蘭、日本政府反對。1947年2月底，臺灣各地接連發生軍民衝突，陳儀請求蔣中正從中國大陸調派軍隊進行鎮壓，史稱二二八事件。
1948年起，由於中華民國國軍在第二次國共內戰中接連失利，蔣中正開始遷移國民政府、軍隊、軍眷、故宮文物、國庫資產與相關檔案等到臺灣。1945年至1950年，中國大陸各地有近200萬軍民遷入臺灣。這些大陸移民在臺灣被稱為外省人，以區別較早移民臺灣的本省人。

軍事對峙

1949年3月15日，新華社發表題為《中國人民一定要解放臺灣》的社論，第一次提出「解放臺灣」的口號。中華民國政府中樞於國共內戰失利遷往臺北後，則提出「反攻大陸」、「消滅共匪」、「解救同胞」等口號，並頒布《戡亂時期檢肅匪諜條例》，嚴格限制臺灣民眾與大陸人民交往聯繫。中華人民共和國成立後，海峽兩岸歷經了1949年金門古寧頭戰役、1953年東山島戰役、1954年第一次金門砲戰、1955年1月一江山戰役、1955年2月大陳戰役，直到1958年八二三砲戰，雙方互有勝負。
其間，韓戰爆發，美軍進駐臺灣，同時指出臺灣地位未定。於是，中華人民共和國向聯合國安理會控訴臺灣遭受武裝侵犯，同時抗議聯合國把中華人民共和國排除在外，但該案最終被否決。在《舊金山和約》中，日本放棄對臺灣及澎湖等島嶼的一切權利、權利名義與要求，但中華民國和中華人民共和國均未參與和約簽署。隨後中華民國與日本於1952年簽署《中日和約》。1954年《中美共同防禦條約》的簽署，也令解放軍有所忌憚。1955年4月，中華人民共和國國務院總理兼外交部部長周恩來到印尼參加萬隆會議，並發表聲明：「中國政府願意同美國政府談判，爭取用和平方式解放臺灣。」李宗仁在美國獲悉後，於同年8月發表《關於臺灣問題的建議》作為回應，中華民國政府則封鎖此文發表之消息。
1958年10月初，解放軍宣布放棄封鎖金門，後來改為「單打雙不打」逐漸減少攻勢，兩岸角力轉而以法統爭執為主，爭奪國際社會上中國的代表權。1963年周恩來將共產黨的對臺政策歸納為一綱四目。1971年，中華人民共和國取代中華民國成為聯合國安理會常任理事國；1972年尼克森訪華簽署了《上海公報》，同年9月中日建交；1979年1月1日美國與中華人民共和國建交，同時與中華民國斷交，以《臺灣關係法》取代《中美共同防禦條約》，並從臺灣撤軍。兩岸外交形勢逆轉。1979年1月1日，中華人民共和國國防部部長徐向前發表《國防部關於停止對大金門等島嶼炮擊的聲明》正式對歷時21年的金門炮戰劃上了句號。

緩和交流

1979年1月1日，大陸全國人民代表大會常務委員會發出《告臺灣同胞書》，以「和平統一、一國兩制」取代原來的「解放臺灣」，對臺灣的態度從強硬趨向緩和。對此蔣經國於4月4日提出「不接觸、不談判、不妥協」的三不政策作為回應。5月29日臺灣海峽復航。1980年6月9日，蔣經國提出「三民主義統一中國」。1981年第一家臺資企業在福州落戶，福建開放4個口岸為臺船停泊點和臺胞接待站，開創了改革開放後兩岸貿易和人員往來之先河。1981年10月1日，中華人民共和國全國人大常委會委員長葉劍英提出有關和平統一臺灣的九條方針政策，表示「國家實現統一後，臺灣可作為特別行政區，享有高度的自治權，並可保留軍隊。中央政府（指北京）不干預臺灣地方事務。」1982年7月24日，中共中央統戰部部長廖承志致信給蔣經國總統，呼籲兩岸展開和談，「相逢一笑泯恩仇」，中華民國政府未回應。
1987年臺灣開放民眾到大陸探親，兩岸民間經貿活動迅速升溫。1988年8月中華民國行政院大陸工作會報成立，協調兩岸經貿交流。1989年6月，臺灣地區正式開放大陸地區物品間接輸入。此後兩岸經貿往來中，臺灣對大陸享有巨額順差，對大陸經濟的依存度也逐年攀升。1990年10月7日，中華民國時任總統李登輝宣布成立國家統一委員會，並於1991年2月23日通過了國家統一綱領，主張依據「民主、自由、均富」的原則推動中國統一。憲法增修條文將中華民國分成「大陸地區」與「自由地區」。《兩岸人民關係條例》中將「大陸地區」定義為「臺灣地區以外之中華民國領土」。
1991年，臺灣海基會與大陸海協會相繼投入運作，1992年在香港進行會談，但無成果。1993年4月，兩岸在九二共識的基礎上舉行汪辜會談。1995年1月，時任中共中央總書記的江澤民，提出發展兩岸關係、推進中國和平統一進程的八項主張。對此，李登輝總統於4月8日提出六項建議作為回應，被稱為李六條。

意識對立

1990年閩平漁事件和1994年千島湖事件的發生，引發了兩岸民眾的不滿情緒。1995年6月，時任中華民國總統的李登輝以私人名義訪問康乃爾大學，提出了中華民國在臺灣的國家定位，引發臺灣海峽飛彈危機。1996年8月，中國大陸開放福州、廈門兩港作為兩岸直航港口，不過臺灣僅僅開放高雄為境外營運中心作為回應，並採取不進貨、不通關的措施阻礙兩岸三通。1996年9月14日，中華民國總統李登輝在臺灣經營者大會上提出「戒急用忍」的主張，限制臺灣企業界對中國大陸的投資。1997年，福建建立「海峽兩岸（福州）農業合作試驗區」和「海峽兩岸（漳州）農業合作試驗區」。1999年5月，民進黨全代會通過了《臺灣前途決議文》。同年7月，李登輝總統提出兩國論，主張臺灣和中國大陸的關係是「國家與國家」，「至少是特殊的國與國的關係」。
2000年民進黨首次擔任中華民國的執政黨，陳水扁在就職典禮上提出四不一沒有，即「只要中共無意對臺動武，本人保證在任期之內，不會宣布獨立，不會更改國號，不會推動兩國論入憲，不會推動改變現狀的統獨公投，也沒有廢除國統綱領與國統會的問題」。他在任內推進一系列「去中國化」、「去蔣化」等臺灣本土化運動。2001年，馬祖、金門和馬尾、廈門之間實現了通商、通航和通郵。2001年5月，陳水扁出訪瓜地馬拉時拋出了關於兩岸關係的「新五不政策」。2002年8月2日，陳水扁在「世界臺灣同鄉會」上透過視訊會議提出「一邊一國」，指臺灣、中國不屬同一國家。2004年2月22日陳水扁稱，大陸以496顆飛彈對準臺灣，每6天還增加一顆。因此，臺灣舉辦228百萬人手牽手護臺灣活動，反對中國大陸部署針對臺灣的飛彈設施。
2005年3月，陳水扁總統對歐洲議會議員及新聞媒體表示，做不到把中華民國國號改為臺灣共和國。中共中央總書記胡錦濤則發表了對臺工作的四個「絕不」，隨後全國人民代表大會通過了《反分裂國家法》。3月26日，臺灣民進黨、臺聯等組織遊行表達抗議。然而在4月至7月，國民黨主席連戰、親民黨主席宋楚瑜、新黨主席郁慕明相繼訪問大陸，緩和了兩岸關係。2005年8月2日，陳水扁提出了四階段論，即「中華民國在大陸，中華民國到臺灣，中華民國在臺灣，中華民國是臺灣」。四天後，又提出了一個原則、三個堅持、五個反對作為處理兩岸事務的準則。2006年陳水扁宣布《國家統一綱領》「終止適用」，並於2007年提出了「四要一沒有」，即：臺灣要獨立，臺灣要正名，臺灣要新憲，臺灣要發展；臺灣沒有左右路線，只有統獨的問題。不過，這並未引起中美的強烈反應，兩岸經貿往來仍持續發展。2008年全年，「小三通」旅客運量達97.4萬人次。

互惠協商

2008年3月22日，馬英九贏得中華民國總統選舉，5月20日中國國民黨重新執政，主張不統、不獨、不武，即「在馬英九任內，保證不推動兩岸統一，也不會宣布臺灣獨立，兩岸之間不進行軍事戰爭」。同年10月、11月海協會副會長張銘清、會長陳雲林訪臺，被臺灣民眾襲擊、圍攻。同年12月31日，中共中央總書記胡錦濤在《告臺灣同胞書》發表三十周年紀念會上提出「胡六點」。兩岸關係在「九二共識」的基礎上不斷發展，海基會和海協會共進行了十一次「領導人會晤」，兩岸陸續簽署了二十三項協議及兩項共同聲明，其中包括海峽兩岸經濟合作架構協議（ECFA）、兩岸定期班機直航啟動、兩岸共同打擊犯罪合作等。
2014年臺灣太陽花學運遏制了兩岸經濟一體化的勢頭。同年6月，民進黨籍臺南市長賴清德訪問中國大陸時表示：「臺灣的前途由2300萬人民共同決定」。國臺辦則回應稱「任何涉及中國主權和領土完整的問題，必須由包括臺灣同胞在內的全中國人民共同決定」，並且強調反對臺獨的立場不變。同月，國臺辦主任張志軍訪問臺灣與陸委會主委王郁琦會面，引發島內一連串爭議和衝突。9月，中共中央臺辦邀請20多個臺灣統派團體訪問北京，中共中央總書記習近平重申「和平統一、一國兩制」是大陸解決臺灣問題的基本方針。對此，行政院長江宜樺表示，「中華民國從來不接受一國兩制的政策，我們的主張就是在中華民國的憲法架構下，維持現狀」。中國大陸則繼續推出新的統戰策略。2015年11月7日，海峽兩岸最高領導人馬英九與習近平在新加坡舉行會面，這是海峽兩岸自1949年政治分立以來66年間，雙方最高領導人的首次會晤，雙方就推進兩岸關係和平發展交換了意見。

臺海現狀

2016年5月20日民主進步黨籍的蔡英文就任中華民國總統以來，主張維持現狀，但同時不承認九二共識，並於2016年底成功與美國候任總統川普通電話。中國大陸不斷給蔡英文政府施壓，企盼蔡英文能重回九二共識的軌道上。蔡英文則在臺灣民進黨創黨30周年之際，發表公開信表示要力抗中國大陸的壓力，發展與其他國家的關係，擺脫對中國的依賴。多數臺灣民眾一方面不滿中國大陸的外交打壓，另一方面不滿蔡英文處理兩岸關係的表現。
中國共產黨中央委員會總書記習近平在2019年1月2日的「《告臺灣同胞書》發表40周年紀念會」時，於北京人民大會堂發表《習五條》。習近平針對臺灣問題，重申「海峽兩岸同屬一個中國，共同努力謀求國家統一的九二共識」。同日下午，中華民國總統蔡英文召開臨時記者會表示：「始終未接受九二共識」，「堅決反對一國兩制」。