中華民國與菲律賓關係

外交

1947年4月18日，簽署《中華民國菲律賓共和國友好條約》，建立公使級外交關係。於首都馬尼拉設立中華民國駐菲律賓共和國公使館，並派駐公使。
1949年7月10日，中華民國總統蔣中正應邀由臺灣扺菲律賓訪問，與菲律賓總統季里諾在碧瑤會談，並發表聯合聲明，號召東亞各國組織「太平洋聯盟」，以扼制共產主義之威脅。8月3日，公使館升格為中華民國駐菲律賓共和國大使館，並派駐大使。
1950年1月，當中華民國政府剛遷至臺灣後，蔣中正在臺灣恢復行使總統職權前夕，以中國國民黨總裁的身份再度訪問菲律賓，和總統季里諾會晤。
1960年，菲律賓總統賈西亞抵臺訪問並與蔣中正晤談。
1961年1月17日，外交部長沈昌煥赴菲律賓，參加中華民國、菲律賓、大韓民國、越南共和國四國外長會議；1月18日，會議於馬尼拉舉行，協商團結，應付共黨。
1963年3月20日，副總統陳誠代表蔣中正訪問菲律賓，23日，發表聯合公報，加強經濟技術合作與文化交流。。
1966年3月25日，總統蔣中正與菲律賓總統馬可仕分別宣布：1966年為「中、菲友誼年」。8月7日，菲律賓外交部長羅慕斯（Narciso Ramos）訪臺；8月9日返國前提出亞洲和平運動主要步驟三項。
1968年8月29日，駐菲律賓大使杭立武與菲外長羅慕斯為處理逾期華僑問題達成協議，並簽署聯合聲明。
1970年5月2日，菲律賓副總統羅培士（Fernando Lopez）訪臺；5月6日，簽訂《中、菲農技協定協議備忘錄》。。
1971年7月29日，原由中華民國控制的中業島遭菲律賓併吞，菲方並將島嶼改名為「派格阿薩島」（Pag-Asa）。 中華民國海軍曾打算抵抗，但因當時接獲中華民國政府急電：不挑戰，故並未作出抵抗。同年10月25日，菲律賓投票支持中華民國續留聯合國，即《聯合國大會2758號決議》。
1975年6月9日，兩國斷交。
獲准到美國就醫的反對黨領袖班尼格諾·艾奎諾經長期協調抗爭後，在時任總統馬可仕保證其安全的情況下在1983年獲准回菲律賓參加國會選舉，並於8月21日經中正機場搭乘中華航空公司班機回馬尼拉，卻於步下飛機階梯時遭人開槍擊中頭部身亡，雖然機場警察隨即槍斃兇手，並拘捕了數名疑兇，但一般認為該謀殺為馬可仕政府暗中策劃。馬可仕政府立即中止與中華民國間的航約，約一個月後恢復。艾奎諾遺孀柯拉蓉·艾奎諾於1986年領導「人民力量革命」就任總統，推翻馬可仕政權。
1987年10月13日，菲律賓最高法院首席大法官鄭建祥夫婦抵臺訪問。期間會見司法院長林洋港、外交部長丁懋時及其他政府官員，並接受輔仁大學頒贈榮譽博士學位。
1993年6月，甫卸任總統的艾奎諾夫人抵臺訪問，主持菲律賓駐臺辦事處揭幕典禮，並與臺北市長黃大洲和總統李登輝會晤。
1994年，總統李登輝於春節期間訪問菲律賓，會晤總統羅慕斯。1994、1995年，菲律賓連續兩屆在聯合國大會的總辯論中，提出「會籍普遍化原則」，間接呼應中華民國參與聯合國。在羅慕斯主政時代，兩國進行官方交往甚具彈性，可視為臺菲關係最為友好密切的時期。羅慕斯亦曾於卸任總統後訪問中華民國。
1996年11月，亞太經濟合作會議領導人非正式會議在菲律賓蘇比克灣舉行，總統府資政、海峽交流基金會董事長辜振甫代表總統李登輝出席會議。
2003年5月，菲律賓參、眾議院無異議通過決議案，支持臺灣參與世界衛生大會及成為世界衛生大會觀察員。2004年5月，菲律賓在世界衛生大會全會中，對於「邀請臺灣以觀察員身分參與世界衛生大會」的提案表決，投下棄權票。
菲律賓衛生部長法蘭西斯科·杜克原訂2006年12月3日抵臺參加「全球衛生領袖論壇」，並見證簽署《臺菲衛生合作瞭解備忘錄》儀式。但中華人民共和國獲悉後全力向菲律賓總統府施壓成功，總統亞羅育令其取消訪臺行程。
臺灣與菲律賓對於巴士海峽的經濟海域劃分尚未協商，因此常發生菲律賓軍隊扣押甚至槍殺臺灣漁民的事件，引發雙方外交上的衝突。2013年5月9日，臺灣屏東縣琉球鄉籍漁船在巴士海峽上遭菲國公務船用機槍掃射，造成船長之父中彈喪命，引起雙邊關係緊張。總統馬英九召開國安高層會議，決議自15日起，終止菲律賓勞工入臺申請、召回駐菲律賓代表、要求菲律賓駐臺代表返菲等三項反制措施。民間也引發相當程度的反彈聲浪。
2016年5月，達沃市市長羅德里戈·杜特蒂於2016年菲律賓總統選舉中勝出，中華民國駐菲律賓代表林松煥立即祝賀，他表示臺灣是第一個向他祝賀的國家。而先前杜特蒂也在2016年1月造訪臺灣時，向於2016年中華民國總統選舉中勝出的民進黨主席蔡英文祝賀，並表示未來臺菲兩國會在教育、農漁業、製造業方面有更進一步的交流合作。
2017年11月10日，總統府資政宋楚瑜代表總統蔡英文率團前往越南峴港參加亞太經濟合作會議領導人非正式會議，並與菲律賓總統杜特蒂握手寒暄。
2019年8月15日，菲律賓丹轆級船塢登陸艦南納卯號開啟自動識別系統由北向南通過臺灣海峽。中華民國國防部指出，此為自由航行，依規定監偵掌握並無異狀。

代表機構

1975年6月9日，兩國斷交，7月28日，中華民國於菲律賓首都設立具大使館性質的太平洋經濟文化中心駐馬尼拉辦事處，1990年3月7日，更名為駐菲律賓臺北經濟文化辦事處（Taipei Economic and Cultural Office in the Philippines）。然而館處的招牌中文則是使用中華民國駐菲律賓代表處，英文在TAIPEI ECONOMIC & CULTURAL OFFICE 後方加註 REPUBLIC OF CHINA (TAIWAN)。
1976年3月16日，菲律賓於臺北設立同等性質的亞洲交易中心，1989年12月20日，更名為馬尼拉經濟文化辦事處 （Manila Economic and Cultural Office）。另於高雄、臺中設立具領事館性質的分處。
於1992年至1998年擔任菲律賓總統的菲德爾·羅慕斯之父在卸任外交部長後擔任駐臺灣代表。

簽證

持有中華民國護照的中華民國公民可於線上申請「電子旅遊憑證」（Electronic Travel Authorization，ETA），列印後持憑證入境菲律賓，停留最多30天。除前者外，也可向駐臺北的馬尼拉經濟文化辦事處申請短期停留簽證，此類簽證可從事觀光、探親、商務或醫療等活動，停留最多59天，若有延期需要，應至菲律賓移民局辦理。經菲律賓轉機，非免簽證地區之旅客須持有72小時過境簽證。
持有菲律賓護照的菲律賓公民可以免簽證的方式入境中華民國，停留最多14天，期限至2020年7月31日。
中華民國外交部的國外旅遊警示分級表將菲律賓按地區歸類為灰色警示：提醒注意、黃色警示：特別注意旅遊安全並檢討應否前往、橙色警示：避免非必要旅行，與紅色警示：不宜前往，宜儘速離境（以上截至2019年1月31日）；衛生福利部的國際旅遊疫情建議等級表將菲律賓按疾病歸類為第一級注意：提醒遵守當地的一般預防措施，與第二級警示：對當地採取加強防護（以上截至2019年3月7日）。

貿易

中華民國對外貿易發展協會（外貿協會）於菲律賓首都設立馬尼拉臺灣貿易中心。經濟部國際貿易局也在馬尼拉設立駐菲律賓代表處經濟組。
2013年，中華民國是菲律賓第4大進口夥伴、第9大出口夥伴。
2018年，菲律賓是中華民國第11大貿易夥伴、第21大進口夥伴、第9大出口夥伴。出口至菲律賓的金額為89億4,277萬5,242美元，年減6.781%；自菲律賓進口的金額為24億9,289萬3,997美元，年增4.816%。貿易呈現出超（盈餘）64億4,988萬1,245美元，年減10.603%。2017年，菲律賓是中華民國第10大貿易夥伴、第22大進口夥伴、第9大出口夥伴。

投資

截至2017年，臺商在菲律賓投資設廠約500－600家，總投資金額約25億美元。臺商的投資行業廣泛，包括汽車（裕隆）、機車（光陽）、衛浴設備（和成）、便利商店（7-Eleven）、速食麵（統一企業）、紡織品成衣、農業與漁業（農友種苗公司）、電子與電器產品、房地產與營建、金屬與非金屬產品、機械、紙漿與紙製品、橡膠與塑膠、化學工業、食品、金融與保險（中國信託商業銀行、兆豐國際商業銀行、合作金庫商業銀行、富邦保險）、航運（中華航空、長榮航空、萬海航運、陽明海運、長榮海運）等。

會議

較重要的有：臺菲部長級經濟合作會議（自1995年起）、臺菲經濟聯席會議（1983年2月於馬尼拉簽約召開）。

臺商組織

目前已成立的有：菲律賓臺商總會、菲律賓臺灣工商總會、菲律賓南線臺商會、菲律賓北線臺商會、菲律賓蘇比克灣臺商會、旅菲加美地臺商協會、菲律賓棉蘭佬臺灣商會、菲律賓宿霧臺灣協會，以及菲律賓臺灣同鄉會、菲律賓臺灣客家聯誼會等團體。

臺資銀行

目前已經設立的有：兆豐國際商業銀行馬尼拉分行、中國信託（菲律賓）商業銀行、合作金庫商業銀行馬尼拉分行、國泰世華銀行馬尼拉分行等。

學術

1967年4月21日，漁業考察團訪問菲律賓，為雙方漁業合作奠定基礎。
2012年，在亞太經濟合作會議（APEC）架構下，雙方共同成立「APEC颱風與社會研究中心」（ACTS），以整合APEC各經濟體颱風資訊及研究成果，有助於加強因應天然災害之能力。
2015年，舉辦臺菲高速電腦、資料同化技術、數值模式後處理技術等教育訓練，提升菲律賓在颱風等劇烈降水天氣系統處理技術能力。
中華民國政府每年提供固定名額的獎學金給予菲律賓學生赴臺就讀中文及攻讀碩、博士學位；臺灣學生在菲律賓進修者尚屬少數。

援助

1990年7月16日，菲律賓呂宋島發生強烈地震後，中華民國政府自「國際災難人道基金」中撥款20萬美元協助賑災救難工作。
1991年6月，菲律賓皮納土波火山爆發造成呂宋島慘重災情，中華民國政府捐贈20萬美元及避難用帳篷200頂。11月，菲律賓遭受熱帶風暴賽洛瑪侵襲，造成數千人死亡，中華民國政府再撥款20萬美元。
2013年11月，強烈颱風海燕襲擊菲律賓中部省分，導致災情、死傷慘重。中華民國政府除第一時間宣布捐贈菲律賓政府20萬美元協助賑災外，外交部也積極洽請社會各界踴躍捐輸，在10日內即募得680公噸賑災物資，並協調由國防部分別派遣空軍18架次C-130運輸機及海軍中和艦裝載物資馳援。至2014年2月，政府及社會各界捐款及捐獻物資合計約1,270萬美元。

觀光／勞務

2017年，臺灣遊客前往菲律賓有23萬6,000人次；菲律賓旅客赴臺則約29萬人次，比起2016年的17萬人次有大幅成長。
近年，臺灣前往菲律賓經商、應聘或投資入境的技術、工商等從業人員約6,000人；2017年，在臺灣的菲籍勞工約15萬人。

犯罪事件

2010年12月27日，菲律賓警方破獲跨國詐騙集團，共逮捕14名中華民國國民（以下簡稱臺灣籍），被害人多為中華人民共和國國民（以下簡稱中國大陸籍）。為此，菲律賓應中華人民共和國（以下簡稱對岸）要求，於2011年2月7日，將臺灣籍嫌犯也一併移送至對岸，此舉讓中華民國政府深表不滿，臺菲關係一度緊張，其後菲律賓也派特使抵臺說明。8日，勞工委員會主任委員王如玄宣布，對菲律賓勞工入臺新申請案一律提高審核層級，審查時間延長為4個月。王如玄在22日於立法院受訪時表示，臺嫌遣陸案如果談判不如預期，將採取嚴厲制裁措施，不排除全面凍結引進菲律賓勞工。直到2011年7月，刑事警察局派遣勤務人員赴對岸，辦理相關程序移交人物證後，才將14名犯嫌押解回臺。
2016年11月21日，菲律賓國家調查局人員根據刑事警察局提供的情資破獲位於菲律賓第2大城宿霧的電信詐騙基地，共逮捕24人，其中19人為臺灣籍，另外5人為中國大陸籍，後送至宿霧市地檢署審理。
2018年1月，菲律賓執法人員根據對岸公安情資，逮補從事電信詐騙的73名中國大陸籍與78名臺灣籍嫌犯。4月4日，菲律賓將臺灣籍嫌犯遣送至對岸的天津。行政院大陸委員會與中華民國外交部分別向對岸與菲律賓表達嚴正關切，並希望將臺灣籍涉案人遣返回臺灣接受司法調查。
2018年8月21日，加拿大籍男子顏柏萊（Ryan）在臺灣遭殺害分屍，美國與以色列雙重國籍主嫌孫武生（Oren Shlomo Mayer）潛逃至菲律賓，後經臺菲警方合作將其逮捕，於9月17日押返臺灣。
因涉及2009年中華職棒假球事件的前臺南縣議會議長吳健保，於2014年被判刑5年5個月，入監執行前逃至菲律賓而遭到通緝。刑事警察局請求菲律賓警方協助，於2019年1月16日將其逮捕，2月6日遣返回臺灣，押送至新北地方檢察署歸案。
菲律賓警方於2018年10月根據對岸提供的情資，逮補25名嫌犯，其中13名為臺灣籍。2019年2月12日，菲律賓將7名臺灣人遣送至對岸，另外6名因涉及毒品與其他案件，需等結清菲律賓所有法律程序後才能遣送。

航空

因航權爭議，以致兩國定期航線於1999年10月1日停航，後經數次協商，於2000年1月28日簽署復航換函，31日復航。9月26日，在臺北修訂《臺菲航權協定》。
兩國有直航班機，雙邊航班來往的城市如下（截至2019年5月28日）：

駕車

持有中華民國護照及中華民國汽車駕駛執照正、影本可至外交部領事事務局申請駕照英譯，再向菲律賓交通暨通訊部陸地運輸辦公室申請換發菲律賓駕駛執照。