凯法利尼亚岛大屠杀

交戰

談判陷入僵局，德軍遂準備武力解決，向意軍下達最後通牒，期限為9月15日14時。
9月15日上午，德國空軍開始用Ju 87俯衝轟炸機轟炸意軍陣地。地面上意軍最初占優，俘虜約400德軍。然而，9月17日，德軍由哈拉爾德·馮·赫希菲爾德少校指揮的「赫希菲爾德作戰小組」投入戰鬥。該小組由德國國防軍第1山地師98團3營、第54山地營和第104獵兵師724團1營組成。其中第98山地獵兵團，在該次屠殺前幾個月內，已犯下了針對伊庇魯斯地區平民的數次暴行。

與此同時，德軍開始散發傳單，呼籲意軍投降。傳單上書（譯文）：
「義大利的戰友們、士兵們、軍官們，你們為什麼要與德國為戰？你們的領袖早已背棄了你們！……放下武器！！你們的德國戰友將為你們開闢一條返鄉之路。」
甘丁不斷向布林迪西戰爭部求援，但未獲任何答覆。他還派了國際紅十字的一名大使到戰爭部去，但其在普利亞大區海岸受阻，三天後終於抵達位於布林迪西的意軍最高司令部，但為時已晚。此外，萊切有300架效忠巴多格里奧的飛機，可飛抵凱法利尼亞島，已準備參加戰鬥。但盟軍禁止其飛離，因為盟軍擔心他們可能會叛逃至德軍一方。還有兩艘義大利魚雷艇已在駛往凱法利尼亞島途中，盟軍因同種原因勒令其回港。
包括希臘人民解放軍凱法利尼亞島分隊在內的當地居民都為意軍提供了援助，但由於德軍擁有絕對的空中優勢和豐富的戰鬥經驗，阿古伊師根本不是德軍的對手。此外，甘丁把部隊從卡爾扎卡塔山撤出，更給了德軍戰略優勢。幾天戰鬥後，9月22日11時，最後一批意軍遵照甘丁命令投降。意軍彈藥用盡，有1315人陣亡。據德國方面消息，戰鬥造成300德軍和1200意軍喪生。另有15名希臘游擊隊員死亡。

屠殺

屠殺始於9月21日，持續一周。義大利投降後，阿道夫·希特勒發布命令，允許德軍以「叛國罪」處決任何反抗德軍的意軍軍官。9月18日，德國國防軍最高統帥部發布命令，指「鑑於意軍在凱法利尼亞島的背信棄義，德國將不俘虜任何意軍」，意即就地處決之。山地獵兵開始把意軍四至十人分批次處決。德軍首先用機槍殺死了投降的意軍。軍中有一群巴伐利亞士兵反對這種做法，德軍便威脅要將他們草率處決。隨後，德軍把餘下士兵押送到聖泰奧多羅市政廳，八人一批處決。甘丁及其下屬137名高級軍官於9月24日被送上軍事法庭後處決，拋屍海上。
羅穆阿爾多·福爾馬托（Romualdo Formato）是阿古伊師七名隨行神職人員之一，也是屠殺的少數倖存者之一。軍官們把自己的東西交給福爾馬托，讓他帶回義大利給他們家人。然而，德軍沒收了這些物品，福爾馬托進而無法給出被殺軍官的確切人數。
在處決意軍軍官時，有一德國軍官前來，宣布說只要意軍能夠證明自己來自博爾扎諾便可獲死緩，因為9月8日，該地區已被德國吞併。藉此機會，福爾馬托乞求該德軍軍官停止殺戮，救下剩下的少數軍官。德國軍官回答道，他會和指揮官商量的。半小時後，該軍官回來告訴福爾馬托他們將停止殺戮。包括福爾馬托在內意軍軍官共倖存37人。德軍隨後向他們表示祝賀，並給他們煙抽。但事情遠未結束。之後，德軍強迫20名義大利水手把先前被處決的軍官的屍體裝到筏子上，開到海上之後，德軍便把筏子連同筏子上的水手炸掉。
奧地利人阿爾弗雷德·里希特（Alfred Richter）曾參與屠殺，他講過一件事，說有一個士兵在當地小酒館給德國人唱詠嘆調，他被逼著在戰友被處決的時候唱歌。這名士兵是生是死不得而知。
據里希特所說，義大利士兵在向德軍第98團投降後便被殺害，皆為頭部中彈，屍體隨後被堆起來。第98團士兵還把他們的靴子脫下來給自己穿。里希特另提到有一群義大利人被帶到弗拉格卡塔（Φραγκάτα）村附近的採石場和圍牆圍起來的花園裡用機槍射殺。屠殺持續兩小時。
約5000具屍體後被以各種方式處理掉。屍體有的扔在柴堆上燒掉，有的裝到船上沉入海底。據倖存者之一阿莫斯·潘巴洛尼稱，其他人於1943年9月23日在阿爾戈斯托利被當眾處決，屍體就地腐爛。也有屍體綁上石頭以後扔進海里。此外，德軍還不讓阿古伊師的士兵埋葬死者。有一名牧師出去找屍體，發現遍地都是骨頭。
存活下來的少數士兵得到了當地人民和希臘人民解放軍的援助。有一重傷的倖存者被一名計程車司機載到凱法利尼亞一位女士家中，活過戰爭，後定居於科莫湖。另有三千名倖存者被德國用「辛夫拉」號和「阿爾德納」號（Ardena）押往戰俘營，因船隻途中在亞得里亞海沉沒而溺斃。這些人員的死亡，與意軍十二群島駐軍的死亡類似，都是德國政策造成的結果，因為希特勒指示德國指揮官在押送戰俘期間，無論會造成何種損失，都應放棄一切安保措施。

審判

哈拉爾德·馮·赫希菲爾德少校從未因大屠殺而受審。赫希菲爾德後來於1944年12月成為德意志國防軍最年輕的將軍，1945年因杜克拉山口之戰死於波蘭杜克拉山口。只有赫希菲爾德的上級指揮官胡貝特·蘭茨將軍在紐倫堡審判時因此次屠殺以及在希臘犯下的其它罪行被判處12年監禁。他於1951年獲釋，1982年去世。大屠殺發生時巴格上校不在島上。後來他因在克里特的表現被授予騎士鐵十字勳章，於2000年去世。
蘭茨之所以被從輕判罰，是因為紐倫堡法院被偽證誤導，儘管就在審判前一年，即1946年，福爾馬托已出版了一本關於此次大屠殺的書，但法院仍不相信大屠殺真的發生過。由於各個命令的具體下達者存疑，蘭茨只被指控殺害甘丁及其軍官。蘭茨在庭上撒謊說，他拒絕服從希特勒殺死囚犯的命令，因為這使他十分反感。他聲稱，提交給E軍團的報告裡說有5000名士兵被殺，只是用來欺騙陸軍司令部，目的是掩蓋他違反希特勒命令的事實。他補充說，被殺的軍官不到12名，其餘的人都經由帕特雷運往比雷埃夫斯。
還有別的德國人幫蘭茨作偽證，比如希特勒的隨身侍從馮·布特拉（von Butlar）將軍，他曾參與阿德阿提涅大屠殺。1943年9月，這些德國人都發誓稱凱法利尼亞島大屠殺從未發生過。此外，由於某種不得而知的原因，義大利方面從未當庭出示證據證明發生過大屠殺。據推測，可能由於停戰協定相關條款對義大利極為不利，義大利遂拒絕配合審判。最終，法院遂接受蘭茨所述，認為他阻止了屠殺的發生。因此，蘭茨比在南斯拉夫犯下罪行的洛塔爾·倫杜利克將軍受到的刑罰要輕。他只被關了三年，於1951年底就被釋放。
蘭茨的辯護律師強調，義大利沒有提供證實大屠殺的證據，並且沒有證據可以證明布林迪西的意軍總部曾指示甘丁及其部隊作戰。因此，甘丁和他的手下是叛軍或非正規作戰人員，不適用日內瓦公約戰俘相關條款。
1964年多特蒙德州檢察官約翰內斯·奧布盧達（Johannes Obluda）試圖重審此案，但失敗了，因為當時德國的政治氣氛更傾向於放下戰爭。2002年，多特蒙德檢察官烏爾特里希·馬阿奧斯（Ultrich Maaos）試圖重新對某些應對大屠殺負責的人提起訴訟。馬阿奧斯的辦公室里有一張世界地圖，還有一張凱法利尼亞島地圖，上面標有處決日期、地點，屠殺遭難者姓名。然而其調查最終並未導致相關人員被起訴或逮捕。在仍然活著的300人中，已有10名前第1山地師的人員受到調查。

紀念

20世紀50年代，包括189名軍官在內約3000名士兵的遺骸被挖掘出，運回義大利，埋葬在巴里的義大利戰爭公墓。甘丁將軍的遺體一直未得到確認。
此次屠殺很大程度上被義大利媒體和教育機構所忽視。直到1980年，曾參加過義大利抵抗運動游擊隊的總統亞歷山德羅·佩爾蒂尼在凱法利尼亞島為罹難者紀念碑揭幕，這一情況才得到改善。然而，直到2001年3月，才又有一名義大利總統（即卡洛·阿澤利奧·錢皮）前來瞻仰紀念碑。而當時他很可能是受到即將上映的好萊塢電影《戰地情人》的影響才去參觀的。由於今天的這些活動，義大利有許多街道被命名為「阿古伊師」。
錢皮在紀念儀式上提及阿古伊師的士兵時表示，他們勇於為祖國戰鬥和犧牲，他們的作為，是義大利擺脫法西斯主義後的首次抵抗行動。此次屠殺現今不斷被人們研究，被視為二戰期間義大利抵抗運動的一個典型例子。
2002年，義大利郵政發行了紀念郵票「阿古伊師大屠殺」（Eccidio della Divisione Aqui）。
希意兩國總統定期在凱法利尼亞島阿古伊師紀念碑下開展紀念儀式。2007年3月2日至3日，義大利帕爾馬召開了一次關於此次屠殺的學術研討會。
凱法利尼亞島的希意社團曾在阿爾戈斯托利的天主教堂旁舉辦過一次「地中海展覽會」，展出了有關大屠殺的照片、報紙文章和文件。