大乘非佛說論諍

對《楞嚴經》的批評

大乘《楞嚴經》記載有辟支佛去聽佛說法，《增壹阿含經》記載佛說因為「世無二佛之號」「一佛境界無二尊號」所以在釋迦牟尼佛的佛教時期不會有其它佛和辟支佛存在，所有辟支佛早就在釋迦牟尼菩薩最後一世成佛前就先取滅度了。《楞嚴經》的說法和《增壹阿含經》不合。

對禁止吃肉的批評

大乘《大般涅槃經》、《楞伽經》、《楞嚴經》記載佛禁止弟子吃肉說法
跟漢傳佛教律藏、上座部佛教經藏及漢傳佛教史不合，在佛教《第一次結集》經典中佛教內主張推行吃素不吃肉的人只有破和合僧的提婆達多和其信徒。《根本說一切有部毘奈耶破僧事》記載佛和佛弟子吃肉，提婆達多批判佛和佛弟子吃肉是殺生並因此禁止弟子吃肉。《十誦律》記載提婆達多破和合僧時在佛教僧團推行不吃肉，佛言：「癡人。我聽噉三種淨肉。」佛拒絕提婆達多禁止吃肉的戒律，之後提婆達多召開破和合僧布薩有504比丘追隨提婆達多捉籌成立不吃肉的新僧團。《摩訶僧祇律》記載世尊涅槃後佛教僧團並沒有禁止吃肉的戒律。
上座部佛教《臭穢經》(葷腥經)記載吃素外道批評佛食肉是臭穢，於是佛回應吃素外道貪瞋癡才是臭穢食肉不是臭穢。
上座部佛教《本生經》二四六油教訓本生譚記載佛吃了師子將軍供養的三淨肉後被吃素苦行裸體外道耆那教尼乾子非難，於是佛解說釋迦牟尼佛前世被燃燈佛授記未來成佛當了菩薩後修菩薩道時一樣吃肉被尼乾子非難，佛說菩薩吃肉「不為罪污染」，漢傳佛教大乘梵網經菩薩戒記載佛禁止菩薩吃肉的說法和上座部佛教本生經說法不合，釋迦牟尼過去修菩薩道走向成佛時並沒有遵守不吃肉戒律。

對「十方諸佛」的批評

上座部佛教認為不存在十方諸佛，只承認娑婆世界三世佛，並提出過去二十八佛的概念。

對質疑「淨土」的回應

大乘佛教淨土宗認為，淨土是依照佛陀的本願力形成的、相對於穢土而言的佛土之類別，它不同於穢土，而無有淫慾、無有惡道、無有苦音聲、有的淨土還無有女人，生於彼處的眾生是化生的，淨土內處處莊嚴美麗、七寶所成，修行人一念之間就得上妙飲食現前，不用操心生活的瑣碎事，只需一心專修，故是適合修行之清淨地，如極樂世界即是如此，只要眾生發願往生極樂世界，信願行具足，便能夠承藉阿彌陀佛的大願得以往生。在淨土中，生老病死並非完全免除，但因可以親聞佛陀講法，決定得到解脫；而在極樂世界中，甚至還能憑藉阿彌陀佛的大願，因信願行的不同，往生後位列相應的品位，而得到四向四果乃至大菩薩的果位。
在淨土宗看來，只要信心具足地稱念阿彌陀佛的佛號就能夠「帶業往生」入極樂世界，這是一種針對末法時代眾生提出的方便法、普適根機的妙法；阿彌陀佛的壽命極長，又稱「無量壽佛」，根據大願，往生彼國的聖者也能得到如同其一般長的壽命，但並非永生，因為阿彌陀佛亦會在未來入滅，由觀世音菩薩次補成佛；極樂世界中的境界是「極樂無為涅槃界」，但這種涅槃是「涅槃而不住涅槃」的大乘境界，是已具備自在生死的涅槃能力，但隨願恆常在虛空法界渡化眾生的境界，故不能等同於常見、天堂。

對「一方世界多尊佛」質疑的回應

大乘佛弟子則認為，「一世界無二佛」是指一方國土上同時只能成就一尊佛陀，且只有他作為教主，但一佛出世、千佛擁護，他方世界的佛陀是可以現身短暫存在的，如要長期留存說法，則會現聲聞身、在家人身，如僧團裡的觀世音菩薩等是古佛再來。因此實際上並不存在「一方世界同時多佛出世」。辟支佛前來聽法也是相同的道理，其可能爲化身。

對「成佛後再成佛」質疑的回應

釋迦佛如成佛後再來示現成佛之行為是為教化眾生故的示現，如觀世音菩薩以前早已成佛，而示現到極樂佛國中將再次成佛。成佛者當然三業清淨，無有妄念，但爲教化眾生故當可以示現。佛的境界是唯佛了之，不應該以凡夫的境界去妄自測度。

對「禁止食肉」質疑的回應

在《涅槃經》、《楞嚴經》等大乘經典中都有禁止食肉的內容，並開示了起初聽許食三淨肉而今不聽許食肉的因緣。不過，遮止食肉的條文仍主要集中於菩薩戒法。
在梁武帝發表《斷酒肉文》前漢傳佛教「律中無有斷肉法」。在歷史上，漢傳佛教出家人和在家人均可食凈肉（不見殺、不聞殺、不為我殺），但受梵網菩薩戒者因戒律禁止，應禁斷食肉，在家人如果發心不食肉者亦可以禁斷食肉。梁武帝發表《斷酒肉文》後漢傳佛教僧團才開始普遍遵守梵網經菩薩戒，即使未受戒者，也完全禁止吃肉，以朝廷的力量推行素食，在長久的影響下漢地有了素食的習慣。
然而，大乘禁斷食肉亦並非絕對。如果條件不允許，原則上可食鍋邊肉（俗稱花素，即在帶有肉食的菜餚中只食蔬菜），而在俗弟子未受不食肉戒者，均可以食用三淨肉；甚至傳說禪宗六祖慧能在躲避紛爭，隱居山林與獵人一起生活時，獵人食肉，惠能從未禁止獵人食肉，而是食用鍋中的蔬菜，此即「鍋邊肉」的來由。在日本漢傳佛教中，又因為「肉食妻帶」的政令要求，日本佛教僧侶只受居士五戒，允許食肉甚至結婚生子。在藏傳佛教中，菩薩戒仍要求不食肉，但有些偏遠地區因為食物來源單一，獲取困難，因此亦有部分開遮允許食牛羊肉的情況。

南傳菩薩道

傳統佛教《第一次結集》經典本來就有記載完整的菩薩成佛之道，不管是要成為佛、辟支佛、佛的阿羅漢弟子都必須修四念處如實覺知五蘊的剎那生滅及無常、苦、無我才有辦法證悟四道、四果、涅槃、斷除所有煩惱脫離輪迴成為佛、成為辟支佛、成為佛的阿羅漢弟子，不修四念處就無法證悟四道、四果、涅槃、斷除所有煩惱脫離輪迴，不修四念處就無法成為佛、辟支佛、佛的阿羅漢弟子。
佛陀出現於世間的目的乃是為了幫助其他眾生增加智慧、解脫煩惱、止息輪迴、走向涅槃，佛、辟支佛和佛的阿羅漢弟子已經走到佛教最終目的——涅槃，佛、辟支佛、阿羅漢弟子的解脫沒有差別，辟支佛和佛的阿羅漢弟子不需要再繼續成佛。佛說過辟支佛和佛的阿羅漢弟子已經「永無來生」，因此辟支佛和佛的阿羅漢弟子不可能繼續輪迴在來生成佛。
佛陀的定義就是佛陀必須自師自悟然後幫助聲聞弟子覺悟證阿羅漢果結束輪迴，少量的佛就可以帶領大量阿羅漢弟子斷除所有煩惱結束輪迴進入無餘涅槃，在無佛教的時代也有辟支佛可以靠自己無師自悟斷除所有煩惱結束輪迴進入無餘涅槃，不需要所有眾生都成佛就能讓所有眾生達到佛教最終目的——涅槃。《相應部》47相應14經記載佛說所有的佛都必須有兩個像舍利弗、目犍連一樣的上首弟子，《長阿含經》記載所有的佛都必須有像阿難一樣的給侍弟子，這就說明了不可能所有眾生都成佛，大乘經典中「每個眾生都必須追求成佛」的說法違背佛教第一次結集經典。
根據佛教第一次結集經典，佛沒有說「每個眾生都必須追求成佛」，上座部佛教的佛弟子可以自由選擇自己想成為佛或成為辟支佛或成為佛的阿羅漢弟子。上座部佛教《南傳菩薩道》說明修菩薩道必須必須發願成為佛，修行修到被佛授記未來成佛才能成為菩薩，菩薩必須累積十波羅蜜修行最少四大阿僧祇加上十萬大劫才能成佛，菩薩成佛所需時間不可能比四大阿僧祇加上十萬大劫更短。
佛說過所有的佛都是人在人間以人身成佛，不可能在三界外的佛土成佛也不可能中陰身成佛。

北傳菩薩道

一般來說，行菩薩道包括的德目有四攝、六度萬行和四弘誓願。經五位（資糧位，加行位，通達位，修習位，究竟位）十地的階段而圓滿十波羅蜜，在此過程中積聚福德（puṇya）與智慧（jñāna）二種資糧，逐步斷除煩惱障和所知障，最後入首楞嚴三昧得金剛喻定，斷盡最極微細之煩惱而成佛。
簡要來說，可將其歸納為《小品般若經》中所用的四階段：1. 初發心 (初發意、新發意，初發菩提心); 2. 久發心 (久修習，行六波羅蜜); 3. 不退轉 (阿惟越致、阿鞞跋致，入無生法忍 ); 4. 一生補處 (阿惟顏、一生所繫)。其中，六渡法與南傳菩薩道大體一致又稍有區別。
又或者將其開展為《楞嚴經》中的「五十五位菩提路」，從乾慧地、十信位、十住位、十行位、十迴向位、四加行、十地，再至等覺菩薩也是最後身菩薩，乃至妙覺菩薩也就是佛地。按法相宗說法，此十信至十迴向皆攝屬「資糧位」，四加行為「加行位」，十地屬「修習位」，妙覺菩薩為「究竟位」。藏傳佛教同樣在「修習位」中安立「十地」。大乘菩薩道認為菩薩不同於凡夫而不離於凡夫，與南傳菩薩道認為的「在成佛前菩薩都是凡夫」有所不同；根據判教理論，阿羅漢「已作地」果位等同於圓教中的菩薩七信地，已經出輪迴，而菩薩以慈悲心故不住涅槃，再入塵世間繼續渡化眾生，便可繼續圓滿，直至成佛。

學術界

現代的佛教研究學者，以歷史及語言學研究為根據，將印度佛教史可依思想分為幾個時期，以平川彰的《印度佛教史》為例，分別是初期佛教(原始佛教)、部派佛教、大乘佛教初期、大乘佛教晚期和秘密佛教(金剛乘)，目前學界普遍認為大乘佛教是從原始佛教演變而來的，並非一開始就出現在釋迦牟尼佛時代，也非從大眾部演變而來。

日本德川時代末期

距今一百八十多年左右(德川時代末期)，是西方佛學研究的濫觴時期。西方利用梵語、巴利文和其本身語言關係的密切。能輕易解讀巴利語系的南傳佛教和當時尼泊爾新發現的梵語佛教文獻。於是英、美、德、法、俄各國都開始對佛教的文獻、歷史、教理和文化進行了研究。為何和傳統大乘佛學的研究認知不同?現代日本佛教學者水野弘元在其著作《佛教的真髓》（仏教の真髄）中指出：研究佛學的方法可略分為明治以前的傳統方式和明治以後西式的科學研究方法兩種。後者主要是希望正確地找出佛教中的事實。而自古以來傳統的方法，則是找出佛教所據有的價值，進而去體驗和實修。現代的佛教研究者的研究方法自然是取自明治以後西式的科學研究方法。著重於研究分析大乘佛教與小乘各部派，與傳統印度教《奧義書》思想、甚至與基督教信仰之間的淵源與關係。「大乘非佛說」之所以有被重提的感覺，是因為現代研究結果和「上座部佛教」對於大乘佛教的舊說法是相近的。而其實這個議題在大乘佛教出現以來，就一直是一個被熱烈討論的議題。而探討「大乘非佛說」就必須探討「大乘佛教的起源」，此爭論點也因此轉移到大乘佛教的起源處和起源時間點上。

類似爭議

在金剛乘興起後，大乘中對於金剛乘的看法不一。在藏傳佛教文獻中，記錄了大乘佛教信徒曾提出金剛乘非佛說或密續非佛說的爭議。