哈利·波特与凤凰社

鳳凰會

本書故事開頭哈利波特正在德思禮家為了某些事情憂慮。在和姨丈及阿姨吵了一架之後，哈利溜出門在小惠因區閒晃，卻見他表哥達力·德思禮。兩人一回家時，催狂魔卻現身並且攻擊他們。哈利召喚護法擊退催狂魔，雖然成功，但是達力還是呈現失去意識的狀態。所幸他們的鄰居阿拉貝拉·費及時趕到幫忙。費太太一直遵照鄧不利多的命令照顧哈利。
哈利和達力回家後，威農姨丈和佩妮阿姨看到達力的情況，狠狠責怪哈利。哈利試圖解釋催狂魔的威脅，但威農姨丈仍舊要哈利滾出去，同一時間，哈利因為違法在校外用魔咒，收到學校來信，要將他從霍格華茲開除，但是哈利又隨即收到好幾封信，警告哈利絕對不要離開屋子。新的信件取消了對哈利的開除處分，但是要求他必須出席魔法部的聽證會。最後一封信則是咆哮信，怒吼著說出「記住我最後的，佩妮」。一聽到這句話，佩妮阿姨改口堅持哈利必須留下來。
被鎖在房間幾天後，一群巫師（鳳凰會成員）把哈利接走。他們把哈利帶到古里某街12號天狼星家族的房子——這棟房子使用了很多魔法把自己隱藏起來，是最理想的鳳凰會總部。衛斯理一家、妙麗·格蘭傑和天狼星都已經在那裏了。天狼星不能離開那棟房子，因爲魔法部仍然在搜捕他（參考哈利波特—阿茲卡班的逃犯）。哈利在古里某街十二號的人在一起感到既憤怒又暴躁，雖然哈利那麼信任他們，但是他們並沒有真誠對待自己。他非常失望榮恩和妙麗當選了級長，而他沒有。所有人都堅持鄧不利多教授交待的絕對的守口如瓶，這就是爲什麽哈利對發生的事情一無所知。雖然如此，哈利還是成功探聽到了關於上個學年結束之後的最新進展情況。
雖然哈利和鄧不利多教授都告訴世人佛地魔已經回來了。不過，自以為是的魔法部，為避免公眾恐慌，和他們兩個分道揚鑣，通過預言家日報聲稱哈利和鄧不利多教授是散布謊言的瘋子。鄧不利多的支持者，重新召集了在上次佛地魔失去魔力前的黑暗時期就已經成立的鳳凰會。不少人加入了鳳凰會，努力把人們從佛地魔的捲土重來和食死人的威脅下拯救出來。

哈利受審

哈利是否應該被霍格華茲學校開除的聽證會臨近，哈利發現他要面對的是整個巫審加碼的正式審判。雖然他們試圖嚇唬哈利以及避免鄧不利多教授出席聽證會，但是他還是來了。阿拉貝拉·費也出庭作證，證實催狂魔是真實的，而不是哈利的想像或者謊言，其後哈利獲判無罪。但是，有些事情很奇怪——鄧不利多教授幾乎沒有看哈利。

回到霍格華茲

最後，哈利和他的同學回到學校。當他們來到霍格華玆時他們發現了一個意外的新聞：魯霸·海格因為還沒有完成鄧不利多教授交給他的任務，所以還沒能及時回到學校; 而他們的新黑魔法防禦術教授是桃樂絲·恩不里居，一位魔法部政務次長。恩不里居竟然不准學生上課時使用魔法，原來，魔法部通過法令把她安排在霍格華玆內部，以阻止鄧不利多教授的意願，並且令魔法部的勢力進入校園。 
在開學時，一切向著危險的方向行進。這一年要考普等巫測（O.W.Ls.），但由於恩不里居沒有教授課業上的任何知識，她在學校的影響越來越大，通過魔法部頒布的一連串的法令, 她被指定為霍格華茲魔法學校的最高決策人，並向所有學生和教師們實施了強威逼性監察。榮恩成為魁地奇葛來分多隊的看守手後，接到哥哥派西的信，建議榮恩與哈利「劃清界線」，除此之外，他還提到這一年也許是鄧不利多教授在霍格華玆學校的最後一年。
由於恩不里居拒絕教授有用的黑魔法防禦術，妙麗說服哈利開班授課，吸取一些想要學習黑魔法防禦術的學生，他很不情願的答應了，隨後他們簽訂了一份協議：永不向恩不里居告密。海格回學校後，和占卜學的崔老妮教授都被列入觀察審核為不稱職的教師；恩不里居尤對海格，混血的半巨人反感。作為學校督察長，恩不里居私下通過更多禁令，只要在學校內成群結隊都是不被允許的，史萊哲林的球隊幾乎是立即就申請通過，但葛來分多隊一直申請許可都被恩不里居回絕；麥教授直接向鄧不利多校長申請而恢復原狀。但是在一場跟史萊哲林魁地奇比賽中，史萊哲林不斷大唱「衛斯理是我們的王」來諷刺榮恩差勁的守門；但哈利仍舊在那場比賽中先抓到金探子且獲勝。然而，馬份因為不甘心，因此不斷諷刺衛斯理一家，喬治與哈利都撲上去揍馬份，弗雷因為被抓著所以沒有。但也因為這樣，哈利他們被恩不里居下令「終身禁賽」，並被沒收了飛天掃帚。

鄧不利多的軍隊

由哈利、榮恩和妙麗組成了一個秘密的學習小組，稱為「鄧不利多的軍隊」，簡稱為「D.A.」（Dumbledore's Army）。這個名字表達了學生們對魔法部部長康尼留斯·夫子的蔑視，此人擔心的就是鄧不利多組織自己的隊伍對抗魔法部。
一直以來，哈利晚上都作著奇怪的夢，在大多數的這些夢裡面，他自己在魔法部的走廊裡面奔跑著，並嘗試打開其中一扇門。在其中的一個夢裡面，哈利夢見自己化身成為一條蛇，襲擊榮恩在魔法部工作的父親亞瑟·衛斯理。醒來以後，哈利警覺起來，果然衛斯理真的被毒蛇咬傷，住院後已經康復。這件事使哈利一行人聖誕在鳳凰社總部中渡過，並曾去醫院探望亞瑟·衛斯理。
從亞瑟·衛斯理被襲擊這件事上，哈利開始懷疑他可能當時真被佛地魔施法去襲擊榮恩的父親，不久後，鄧不利多要求哈利接受石內卜所教授的鎖心術，一種防止自己的思想被人窺視的技能。 
妙麗已經連絡新聞記者麗塔·史譏，而且威脅麗塔除非她寫關於佛地魔返回的事實並讓她接見哈利，否則公開她是未經登記的化獸師（詳見《哈利波特—火盃的考驗》），未登記的化獸師一罪可令麗塔關到阿茲卡班去)。麗塔就哈利的訪問寫了一篇文章。而露娜的父親正是《謬論家》的編輯，他欣然接受這篇文章。當這篇報導刊出後，造成轟動。恩不里居非常生氣，她禁止哈利去活米村，而且禁止在校內閱讀《謬論家》。這反而造成了學生們對於該報導的誘惑。很快的，這個消息迅速在校園內擴散開來，而一些誤解哈利的人，亦漸漸開始醒覺並向哈利道歉。
不久後，崔老妮被恩不里居開除，崔老妮在大廳中不斷哭喊，而鄧不利多此時出現了，他說崔老妮可以留下來先住在塔裡，因為他已經為大家找來了新的占卜學老師－人馬 翡冷翠，他相信翡冷翠會比較喜歡住在森林（由地牢裝飾成的森林）。翡冷翠也因為替鄧不利多工作而被其他人馬族群排擠，無法再回去禁忌森林。

被逮捕的災難

鄧不利多的軍隊集會時，有人説恩不里居已經發現了他們的秘密，恩不里居正趕來逮捕他們，最後，只有哈利一個人被逮到，並被帶到鄧不利多的辦公室。哈利發現張秋的朋友毛莉是告密者，被妙麗施咒而嚴重變形。鄧不利多為了保護學生，說組織鄧不利多的軍隊是他的主意，是為了罷免魔法部長康尼留斯·夫子，正中了他的偏執想像。鄧不利多逃脫後，恩不里居成為霍格華茲的新校長，但學校的全體教職員對恩不里居大為反感，故意對新校長疲於應付各種事端視而不見。  
衛斯理雙胞胎利用他們惡作劇的天分在學校四處惹是生非，以他們最後的把戲掩護哈利通過恩不里居辦公室的壁爐—唯一一個未被監視的壁爐—與天狼星討論；被抓住後，衛斯理雙胞胎決定以引人注目的方式離開霍格華茲。他們在學校里留下了一片魔法沼澤，並用哈利贈與的三巫鬥法大賽的獎金開辦了他們的惡作劇商店「衛氏巫師法寶店」。

天狼星遇難

正當普等巫測的天文學考試在夜晚舉行時，哈利及其他學生目擊了一群人試圖趁夜襲擊海格。麥教授前往阻止，反遭昏擊咒擊中。經過一場混戰後，海格毫髮無傷揹著牙牙逃走，麥教授卻被送往醫院廂房。隔天，在最後一堂魔法史考試中，哈利卻恍惚的進入詭譎的夢境。在夢中，哈利再次化身為佛地魔，在神祕部門內對天狼星施展酷刑咒。
哈利和鄧不利多的軍隊成員於是奮不顧身的試圖透過恩不里居辦公室的火爐與天狼星連繫，然而布萊克家的家庭小精靈怪角卻存心欺騙哈利，使他相信天狼星的失蹤（事實上他正在房裡照顧鷹馬巴嘴）。更慘的是恩不里居及督察小組的人趕到，並當場逮到哈利一夥人，並叫石內卜準備吐真劑以便使哈利說出實話，然而石內卜並未照辦。恩不里居決定以惡咒逼迫哈利誠實招來。幸好妙麗及時捏造了一個故事哄騙恩不里居，說他們是要與鄧不利多連絡，並告訴鄧不利多他們已經準備好對抗魔法部的武器。然後妙麗告訴恩不里居，她可以和哈利一起帶她去看。恩不里居告訴哈利是她派催狂魔攻擊他。

飛往倫敦

妙麗知道傲慢的人馬因為其中一個同類為人類服務而狂怒不已，因此對所有成年巫師都恨之入骨。她引誘恩不里居跟隨她和哈利進入黑暗森林，讓人馬將恩不里居挾走。當人馬轉而要攻擊哈利與妙麗時，海格同母異父的兄弟—一個海格夏天尋訪巨人時帶回的名叫「呱拉」的小巨人—出現並吸引了人馬的注意。榮恩、金妮、露娜與奈威到達，他們決定乘著「騎士墜鬼馬」（一種只有親眼見過死亡的人才能看到的馬）前往魔法部拯救天狼星。
之後他們抵達了神秘部門，和經過一個轉變為錯誤的數字，他們一行人抵達哈利夢中的背景，他們找不到佛地魔與天狼星，出現了一批食死人，當中包括跩哥·馬份的父親魯休思·馬份，魔法部的劊子手麥奈、阿茲卡班的逃犯們、前神秘部門員工羅伍得和阿茲卡班的逃犯貝拉．雷思壯－天狼星的遠親、虐待奈威·隆巴頓的雙親的人。佛地魔利用了哈利與他之間心靈上的連結，進入哈利的內心，讓哈利看到幻覺，以為天狼星被佛地魔捉到神秘部門且正受到酷刑，並以此誘惑哈利到魔法部，利用哈利去取得水晶球。預言是在哈利的出生前在神秘部門被紀錄下的，明顯地有關佛地魔與哈利，且只有與該預言有關的人才能拿起該水晶預言球,佛地魔不想冒著被發現的危險去取得水晶球，因此他誘惑哈利為他進入取得水晶球。 佛地魔在哈利未出生時，就已經得知預言的前半段是「擁有消滅黑魔王能力的人將出生」因此，在哈利還是嬰兒的時候，佛地魔就為了前半段的預言而企圖謀殺哈利但失敗，而這也促使佛地魔垮台的原因，因此佛地魔決定去聽聽整個預言，希望理解如何殺死哈利。

魔法部裡的混戰

學生們和食死人之間於是開始了一場混戰。大部份的學生被食死人傷得很重，但是當他們快要撐不住時，鳳凰會的五個人出現並幫助他們，包括天狼星。在戰鬥的時候，擁有預言的水晶球被打碎。一個幽靈的影像宣告了預言內容，但是可惜的是沒有人能在戰鬥當中聽到這預言。同時，天狼星被他堂妹貝拉用咒語殺死。
哈利憤怒的追趕貝拉，要為天狼星報仇，很快便追到了魔法部大廳。接著佛地魔親自出現在大廳內，跟鄧不利多展開了決鬥，經過一番戲劇性的較量後，佛地魔入侵了哈利的心智，以誘使鄧不利多殺掉哈利。然而最後還是無法得逞，只好帶著貝拉逃之夭夭。敏感的魔法部員工及時趕到並且看到了那個人，康尼留斯·夫子也在其中。他終於接受了佛地魔回來了的事實，也相信鄧不利多和哈利曾經說過的話。最後，預言家日報改變了先前對鄧不利多和哈利仇視的態度，恢復了他們的名望且警告魔法世界：「不能說的那個人回來了！」

失去的預言

在故事的最後，鄧不利多向哈利解釋了種種的事情。這一年他之所以與哈利保持距離是因為他能感覺到佛地魔的力量逐漸增強中。哈利的確不止一次地感受到，也渴望告訴鄧不利多。鄧不利多後悔沒親自教哈利鎖心術並且重新覆述了預言。時間回到了16年前，鄧不利多前往「豬頭酒吧」面試申請占卜學教授職位的西碧·崔老妮時所聽到的預言內容：
擁有消滅黑魔王力量之人將降臨
出身於曾三次抵禦他之父母
出生於第七個月份消失之時
黑魔王將標記他為己之同等
然他將擁有黑魔王所未知的力量
兩者必將死於另一人之手
因兩者無法同存於世
擁有消滅黑魔王力量之人嫄出生於第七個月份消失之時......
這可解釋佛地魔將殺害哈利或奈威·隆巴頓，父母也都抵禦過佛地魔三次。這兩個男孩都同時出生在那一年的七月底。佛地魔在聽到這個預言前半段後攻擊尚在襁褓中的哈利，但卻讓預言的後半段實現：哈利將擁有黑魔王所未知的力量，兩者必將死於另一人之手，而非奈威。佛地魔選擇哈利波特的原因是因為他認為「混種」比「純種」更具威脅，所以在哈利身上留下閃電形狀的疤痕。
「混種」：身上沒有巫師血液卻與巫師結婚所出之子女，稱為混種。相反詞：純種
這是崔老妮對鄧不利多所說的第二個實現的預言，第一個在《哈利波特—阿茲卡班的逃犯》中已實現了。
鄧不利多也告訴了哈利他必須每個暑假待在德思禮家的緣由：在哈利的媽媽為了救他而犧牲後，她在哈利的身上施了一種佛地魔想都沒想過的永恆保護，至今仍留在哈利的血中，只有佩妮阿姨可以提供這個血緣的庇護。這也是鄧不利多在一開始寄咆哮信提醒她的原因。
最後，哈利又回到了德思禮家，但不外乎威農姨丈和佩妮阿姨開始對數個巫師的指令（包含一個瘋眼穆敵的指令）展開一場嚴肅的討論，許多考驗正醞釀在巫師世界裡，確實如此，書的最後一章標題即為「又要開戰啦！」。