中華民國護照

北洋政府時期

目前可查證最早貼照片的中國護照，為1919年9月中華民國北洋政府駐滬辦事處所發放。1922年4月，經過長時間研究查核後，北洋政府外交總長顧維鈞組織「全權代表辦事處」，聲明為中國唯一外事統籌機構，並同時訂定具有照片的正式中國護照發放規格與章程，並由該辦事處首度發放包含顧維鈞、馮玉祥（總理）等官員的多本正式護照，同時且與各國談判中國護照的發放權力。

國民政府時期

中華民國護照與中華民國《國籍法》釐定有相當大關係，經過兩度修改後，以國民政府委員會為主體的國民政府或中華民國政府於1929年定調中華民國國籍法方向與護照發放基礎原則。（該國籍法多數條文今仍於中華民國自由地區適用）
1929年，在允許雙重國籍及出籍從嚴、復籍從寬的原則下，國民政府公布了《護照條例》和辦理華僑登記。此兩措施，皆為將中華民國護照法制化之準備。其相關條例有《外交部編製外交統計圖表規則》，利用統計數字，來控管「出洋護照」數量，同年12月30日又陸續公布《外交部頒發出國護照暫行辦法》和《外交部駐外使領館發給回國護照及簽證外人來華護照暫行條例》。其中，《外交部頒發出國護照暫行辦法》將出國護照分為「外交護照」、「官員護照」和「普通護照」3種。其中，以華僑、留學生適用的普通護照，最為普遍通行。規定有需出具2間商家保証且到達國外目的地後須向當地中華民國使領館呈驗護照以便登記、1年期滿後，需向當地中華民國使領館呈銷舊照換新照的規定。1930年，該辦法再度放寬，除了放寬國籍限制外，也將1年護照驗證期限延至3～5年，甚至視護照種類大幅度放寬（華僑護照即可放寬至10年）。
1930年，國民政府致力廢除不平等條約，逐漸收回在中華民國的各國護照發放權力，首度真正將出、入國的護照相關規範一致化，並將辦法及護照格式登載於海外各地華文報紙或印成通告發布。早年因為條件極為寬鬆，1933年，中華民國華僑持的中華民國護照雖只有12萬6千本，不過據統計，當時有條件申請中華民國護照者，達1000萬人。
1940～1950年，國民政府雖面對中日戰爭與國共戰爭等干擾，仍致力於護照制度正常化。1944年7月22日，位於重慶的中華民國政府頒發公布《出國護照條例》，條例中規定護照之申請、核發、制定及管理，由中華民國外交部負責，並加入國際慣例的不得扣留、護照種類（外交護照、公務護照及普通護照）等規定。另外，發放機關制定上，中華民國外交護照及公務護照，由中華民國外交部核發，普通護照，由中華民國外交部或駐外大使館、領事館及其他外交部授權機構核發。此項達17條的條文，已是相當完備的護照基礎規範。

政府在臺時期

1972年，日本與中華民國斷交後，持中華民國護照前往日本前，需申請「渡航證明書」，與一般直接印於護照內頁的簽證不同，此證明書是浮貼於護照內頁，出入境章都蓋在渡航證明書上，並於出境日本時收回，當時日本政府僅對於中華民國護照及朝鮮民主主義人民共和國護照使用此證明書。直到1998年4月，日本眾議院方立法恢復承認中華民國護照，不再使用渡航證明書。
1982年起，澳門政府單方面給予中華民國護照持有人免簽證待遇，得入境澳門30天。
2005年9月開始，日本政府對中華民國實施免簽證措施。
2008年12月29日起，外交部領事事務局在北、中、南、東部辦事處開始發行晶片護照（生物特徵護照）。該新版晶片護照最大特色在於底頁左上方植入一枚非接觸式晶片，用來儲存資料頁登載資料及持照人照片影像，資料一經寫入無法更改，並藉由無線射頻辨識（Radio Frequency Identification，RFID）讀取晶片中儲存的資料，並透過電子憑證機制驗證護照真偽。新版晶片護照外觀維持不變，僅於封面加印世界通用之專屬晶片護照標誌，內頁之圖案則全部更新，以臺灣由北到南景點地標及風土民情為圖案主題。護照晶片儲存內容並無指紋、虹膜等項目，個人隱私可獲保障。該晶片有效讀取距離僅數厘米，在正常使用情形下，須先打開護照本，並以緊密接觸方式掃讀資料頁下方的機器判讀區資料，才能透過無線射頻讀取晶片資訊。另外，護照閉合時無法讀取晶片，可以阻絕外界的側錄或盜讀，有效保障國人隱私。
2010年11月11日，歐洲議會通過對臺灣民眾的免簽證待遇
；同月26日，經由歐盟部長理事會通過，12月22日歐盟公報發布，於2011年1月11日起，臺灣民眾可於歐洲28國免簽證旅遊；2012年10月2日，美國國土安全部宣布，自11月1日開始，符合資格的中華民國護照持有人，行前在ESTA登記並獲准者，將可享赴美九十天免簽證的待遇。
2011年7月1日起，首次申辦中華民國護照必須辨認申請人身分，如果申請人不能到外交部領事事務局，也必須到戶政事務所辦理人別確認，才能委託辦理。
2017年12月18日，中華民國外交部宣布將現有的晶片護照改版為第二代，除護照內頁圖案設計大幅度更新外，還增加「持照人第三影像」、「金屬化表面凸起」等防偽設計，於12月25日啟用。2017年12月25日，外交部領事事務局開放民眾換發第二代護照，但其中一張內頁照片誤植為華盛頓杜勒斯機場。

普通護照

表皮為墨綠色。中華民國普通護照之適用對象為具有中華民國國籍者；兩岸分治後，排除大陸地區人民申請資格。
另在新式晶片護照中，晶片植入護照封皮底與內襯裏頁左上角之間，儲存護照資料頁基本資料及臉部影像。

G類護照

因中華民國國際處境特殊，所核發之外交護照或公務護照常有使用不便或拒絕入境的情形。故中華民國外交部核發G類護照給部分駐外人員。G類護照外觀與普通護照相同，差別為護照號碼為G開頭（普通護照為九碼數字無字母）。

加持第二本護照

中華民國官員或駐外人員因公務需要或趕辦簽證可申請加持第二本護照。但由於近年來臺灣出國者眾多，遂自2009年10月26日起，外交部參照美國以及澳大利亞等國家方式，有條件開放臺灣地區有戶籍國民申請加持第二本普通護照，有效期間一年，自2013年3月31日起，效期放寬為1年6個月。其正當理由包括商務需要、國際政治問題、緊急事由或其他不可抗力原因 。而根據規定，加持第二本普通護照期滿或遺失時，繼續加持要重新申請，不能直接換發或補發。

護照外觀

在2003年9月，陳水扁政府決定在封面國徽和「護照」二字之間加入「TAIWAN」字樣，目的在於顯示中華民國與中華人民共和國的不同，使臺灣旅客在國外時不致被誤認為中華人民共和國籍，以免被錯認為不適用免簽證待遇致登機受阻，使持護照的中華民國國民能清楚地向各國海關說明自己是來自臺灣而非中國大陸，以避免遭到禁止入境或於國外時因遭誤認為中華人民共和國人民而惹來麻煩困擾。政府稱措施目的在於便民，但引來泛藍陣營強力批判，同時也導致抵制預算審查。立法委員周錫瑋質疑，加註「臺灣」字眼將引發意識形態對立，同時勢必會讓對岸視為是一種不友善的舉動；立法委員馮滬祥批評説，此舉無異不顧臺灣安危，將害死臺灣；並呼籲在野聯盟應群起抗議，並以行動否決此案。以美國為基地的臺灣獨立運動團體「正綠社」的陳姓顧問更抨擊，此舉非但不是走向臺灣獨立，反而是走回20世紀初期「殖民地護照」的老路；他還質問，如果此舉如此重要，長年在外的外交使節持有的外交護照是否應該更早完成更換。但最後仍如期實施。
自2008年12月29日起新發行之中華民國晶片護照之封面及封底為墨綠色，圖案和文字皆用燙金方式製作。封面中央印有中華民國國徽，並有印出中英文的「中華民國 REPUBLIC OF CHINA」、「TAIWAN」、「護照 PASSPORT」字樣，以及正下方印有「電子旅行證件」的標誌。

護照內頁

以下為2008年起發行的第一代生物晶片護照，2017年起發行的第二代生物晶片護照全面更新內頁圖案。

申請

申請時，必須提出具有中華民國國籍的證明文件，例如在中華民國政府核發的戶籍謄本、國民身分證、戶口名簿、舊護照、國籍證明書、華僑登記證、華僑身分證明書、父或母之一方具有中華民國國籍證明加上申請人本人出生證明或者其他經中華民國內政部認定的證明文件。

臺灣國護照貼紙

2015年設計者陳致豪表示護照封面上的「Republic of China」字樣，經常讓外國海關把臺灣人誤認為來自中華人民共和國，臺灣人因而經常必須多費唇舌解釋，有時甚至因此造成真正「無法順利通關」的窘境。實際使用當中，有部分使用者順利通關；也有部分使用者被護照查驗官以「變造護照」為由阻攔，需撕掉貼紙方可過關。

護照底圖錯用美國機場圖片

2017年12月25日，第二代晶片護照開始發行。隨後有網友發現護照內頁「注意事項」頁底圖中，原應為桃園機場第一航廈及塔臺的照片，疑似誤植為美國美國華盛頓杜勒斯機場，諷刺「臺灣成為美國第51州」。對此外交部12月26日由副發言人歐江安回應予以否認，稱圖片絕對為桃園機場。然而有桃園機場員工指稱護照內頁圖片並非桃園機場，而且之前就曾有兩座機場圖片誤用的情況。
之後《蘋果日報》網站報導，外交部領務局工作人員已經私下向不具名的民進黨立委承認照片誤用，並將「回去想想辦法」等同於承認發言人公開說謊。
12月26日晚，外交部召開記者會，承認用錯圖片並向公眾道歉，同時聯繫中央印製廠重新印製，並延後簽發新版護照。至於已簽發的護照，外交部會聯繫民眾免費更換。27日外交部領事事務局長陳華玉自請處分，降為外交部參事但後續又將前任領務局長龔中誠（已經在一年多前轉任駐加拿大代表）調職，其喊冤說早就離開職務一年多，連新護照都沒看過，造成有媒體質疑是民進黨藉機搞政治鬥爭清除不同立場的公務員。
2018年1月24日，外交部宣布將用貼防偽貼紙的方式，蓋住護照內頁「注意事項」頁原本誤植的杜勒斯機場主建築，並在該頁加注過去護照上未曾印製過的旅遊安全宣導事項，而該貼紙預計1月底到2月初正式發行。外交部還表示「加貼貼紙不影響護照效力，民眾出國不會有疑慮」，但嚴格來說，世界各地出入境機關審查護照標準不一，出入境工作人員可能不承認這一防偽貼紙，因此臺灣民眾憑貼有防偽貼紙的護照進入其他國家或地區，可能會遭到入境受阻。而今後印刷的護照的第4、5頁，則使用桃園機場的照片。

禁入聯合國及其附屬組織

由於「一個中國」原則，目前聯合國及其附屬組織不承認中華民國護照，因此不得以中華民國護照作為證件進入聯合國及其附屬組織參觀或出席會議。